The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
|
sequence length |
95
|
structure length |
95
|
Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3I55 Q; 2QEX Q; 3CCQ Q; 1N8R R; 1S72 Q; 1M1K R; 3CD6 Q; 3G6E Q; 3CCE Q; 1K9M R; 1Q81 R; 3CCV Q; 1VQ5 Q; 1K8A R; 1VQO Q; 1VQ4 Q; 1KD1 R; 1VQP Q; 1NJI R; 1K73 R; 3CCM Q; 3CCR Q; 1KQS P; 1VQ7 Q; 1YJ9 Q; 1M90 R; 1Q82 R; 1QVF P; 1YJN Q; 1VQ9 Q; 3CCU Q; 3CC4 Q; 1Q86 R; 2QA4 Q; 1YIT Q; 1VQK Q; 3G4S Q; 3I56 Q; 3CCJ Q; 1Q7Y R; 1QVG P; 3G71 Q; 3CPW P; 1YI2 Q; 1JJ2 P; 3CCS Q; 1YJW Q; 2OTJ Q; 3CXC P; 1VQM Q; 1YIJ Q; 3OW2 P; 2OTL Q; 1KC8 R; 1W2B P; 3CC2 Q; 3CMA Q; 1VQL Q; 3CC7 Q; 3CCL Q; 1VQ6 Q; 1VQN Q; 1VQ8 Q; 1YHQ Q; 3CME Q; #chains in the Genus database with same CATH topology 2VUB A; 2XG8 D; 1OOT A; 4J6X A; 4M77 B; 4BI8 B; 2CGH A; 5IHK A; 3OYC A; 2AT1 B; 1M3A A; 2YRC A; 4X1V A; 1X27 A; 2HQH A; 3RKX A; 5CQY A; 2FPF A; 4M7D F; 2PU9 B; 1D1C A; 1UGV A; 1ZSZ A; 2CP3 A; 2QTV A; 4D8K A; 1Q7Y C; 2XHC A; 4BUG A; 3QWX X; 4TVR A; 1M90 U; 2DJZ A; 3JB9 H; 2DZ9 A; 4C92 F; 3M4G A; 1BB9 A; 1PM3 A; 3NHN A; 4N4H A; 2MWP A; 2EYQ A; 1Q81 U; 4KGV B; 2JW4 A; 3N5B B; 2YHT A; 4QQG A; 3OSV A; 1M2O A; 1R0B G; 5KYY A; 2RK2 A; 7AT1 B; 2L3Q A; 1BKB A; 1UEB A; 5GAO m; 2K3X A; 3OYE A; 1NEG A; 1IGU A; 1VQ4 T; 1Q86 C; 2F69 A; 3OYY A; 5IXB A; 1WNL A; 5LL6 S; 1MMN A; 5FU7 B; 2PVD B; 5CKB A; 3MEU A; 3CCS Q; 4PJL A; 2FRY A; 1KC8 R; 2MYS A; 5LJ3 h; 2M1H A; 2VXE A; 5EG2 A; 2C0T A; 2A36 A; 1YHQ Q; 1PWT A; 4LDU A; 1UG1 A; 2JNG A; 5FRN A; 1RLQ C; 1X43 A; 4GY5 A; 2L0A A; 4Z02 A; 4AMC A; 5IN1 A; 2ED1 A; 5GAM g; 1YJW T; 2V1Q A; 4Z89 A; 3EH1 A; 1M3C A; 2ABL A; 3PMI A; 9ATC B; 2KK4 A; 1TXQ A; 2LJ3 A; 2YRV A; 3OYK A; 2KAF A; 3OS1 A; 3A1P A; 3EG9 B; 4AFZ C; 4M75 B; 1VYT A; 1WHL A; 2LX9 A; 3FEO A; 3CD6 T; 4J9F A; 5I11 A; 2DPP B; 3OS5 A; 3CCQ A; 2EYY A; 2I2L A; 2W10 A; 2GBQ A; 2I0N A; 3CPW P; 2COW A; 2KDS A; 2MK5 A; 4F7U F; 1G5V A; 2PUO B; 4JJC A; 4JRI A; 1YJ9 A; 2VKN A; 4J5Y A; 5GAO n; 2OI3 A; 3VRZ A; 4OB3 B; 3HRS A; 4D6W A; 4LUD A; 3CCQ Q; 3CD6 Q; 2CP0 A; 3MEV A; 2XDB A; 4M7A B; 2XU8 A; 2V8K A; 1M1K U; 4RG2 A; 4E7L A; 3EGU A; 1TG0 A; 1YIT Q; 5IT9 E; 1TUC A; 2JMC A; 2HKN A; 2AHJ B; 4DQ2 A; 1WXB A; 3OW2 P; 2CH4 W; 4BI4 A; 2KT8 A; 2QEX Q; 2EQI A; 1BCO A; 4ZNX A; 3VUZ A; 2RHI A; 3FJP A; 5C0M A; 1XTD A; 3UAT A; 3FLG A; 4ZGJ B; 3QG1 A; 2OAW A; 1YJN A; 5GMK h; 3H8Z A; 1R0C B; 1UGR B; 3OB9 A; 3OYJ A; 2HL5 C; 3QJY A; 2LCC A; 3EGD A; 1RAH B; 5GJV B; 1N9S A; 3JCM X; 4KBM B; 1NLP C; 1SPK A; 2EQU A; 2X4J A; 1A0N B; 4XK8 E; 3CCR T; 1GCQ C; 2LZ6 B; 4R55 A; 1OX9 A; 4C92 G; 1VIF A; 4EMK A; 4FYW B; 4PJO C; 3HSB A; 4J6W A; 4C92 A; 4IIO A; 2X3X D; 2AZS A; 1AWX A; 1GBR A; 1I07 A; 1WHJ A; 2DJQ A; 1MUZ A; 2FEI A; 2RHU A; 1K9M R; 5KYU A; 4JJN K; 1W4S A; 1H64 1; 5HKC A; 1SKU B; 2MCN A; 1OV3 A; 1QVF P; 2K3Y A; 2DYB A; 3CCU Q; 3VS6 A; 3BW1 A; 2FZC B; 2R57 A; 4IUP A; 5CIU A; 2EYW A; 3G71 Q; 4ELY C; 1CKB A; 3OA6 A; 1W2B A; 2D0N A; 1RI9 A; 1M30 A; 4FW1 A; 1WPY A; 1IRE B; 3KFV A; 2L5Q A; 1PSF A; 4C5I A; 4QQ6 A; 3QSU A; 2CZ0 B; 5CVI A; 3I9Q A; 2CZ1 B; 3NMZ C; 3VS0 A; 2PZ1 A; 3F70 A; 1X75 C; 4MZT A; 3I5S A; 3HRU A; 5CR2 A; 2OJ2 A; 5GMK j; 3MP8 A; 1NJI C; 2BE9 B; 3QZ5 B; 1V76 A; 3ZBD A; 4J9D A; 3EG3 A; 1B34 B; 4FT4 A; 3OYB A; 3CMA A; 4J9B A; 1ZBX A; 2DXB A; 5I2M A; 3CC4 T; 3FC3 A; 1K0S A; 4F7U G; 1ZLM A; 5ECA A; 1OPK A; 2PUK B; 1KK7 A; 1X2Q A; 1JU5 C; 2RQW A; 2EGC A; 1ABO A; 4DOV A; 4CC4 B; 1VQ6 A; 1RAA B; 1NM7 A; 4KRT A; 4OB1 B; 1AWO A; 2EKO A; 1ZSG A; 4V2S A; 1Z9Q A; 2CRE A; 1VQK Q; 2YLB A; 4XTZ A; 1RI0 A; 4RTW A; 3CCE A; 2EJF A; 2EKH A; 1BCM A; 2CSQ A; 2QGG A; 1NBE B; 2NLU A; 1FX7 A; 4DBH A; 2EVR A; 2A0F B; 3TRE A; 1SF9 A; 1ZUY A; 1KG1 A; 2VYT A; 4ZGE B; 1WI7 A; 1M90 R; 1TUG B; 1LVK A; 3QO3 A; 4F04 B; 5I22 A; 4A4K A; 2DZC A; 2JUF A; 1KC8 C; 1ACM B; 3RMQ A; 1BI3 A; 1T0H A; 1M2V A; 2L2P A; 5KE3 A; 1PKT A; 4M7D G; 3CCU A; 1QVF S; 3J81 E; 3PVQ A; 5CCA A; 3C95 A; 3LGF A; 1VQ4 Q; 5J3B A; 1JXO A; 4RUG A; 1U1T A; 3ZFJ A; 2X9H A; 2O9V A; 2DYI A; 3HTR A; 1QKW A; 4ORZ A; 4PFO A; 4C8Q D; 1MV3 A; 3CXC P; 5KYU B; 1OI1 A; 3V8L A; 1VQM T; 4LXC A; 1KQ2 A; 1U5S A; 3G1J A; 1VQ4 A; 4JRP A; 4M7A F; 2HMA A; 3I55 Q; 3PT9 A; 1ZUU A; 1KC8 U; 2P4T A; 5CKD A; 5FLX E; 2GGR A; 1I0C A; 2KMT A; 4PFZ A; 3VS3 A; 4XU0 A; 5L8R E; 1N27 A; 2HDA A; 4E7I A; 1PG5 B; 4C92 C; 4M7A D; 3G6E A; 5KYY B; 1TS9 A; 1UTI A; 2K6D A; 1MMG A; 2CP2 A; 4E2F B; 4JJD A; 3EHR A; 2E6Z A; 5IHN A; 4JZ4 A; 1VQ8 T; 3MKD A; 1Y7X A; 4C0Z A; 2O4X A; 2LCS A; 3G6E Q; 1GRI A; 2KEA A; 2X3W D; 2NUP B; 2VXF A; 2XMF A; 2DER A; 2VB6 A; 3LX7 A; 1MGQ A; 1FWZ A; 3OYG A; 3G4S A; 4LDY A; 3CMA T; 1UDL A; 2AZV A; 3QZ9 B; 5D6W A; 2LX7 A; 1VQ6 Q; 1VQL T; 2L3P A; 1Q7Y U; 3LLR A; 3QHS A; 2PVO B; 3UWN A; 3CCE Q; 2VAS A; 4Q5W A; 1YBY A; 5HY6 A; 3AT1 B; 5GAN 3; 1D0Z A; 4M4Z A; 1YWO A; 3EFR A; 1K9M C; 1MNE A; 4EIK A; 2QEX A; 3OSS C; 1NJI U; 2KYM A; 1G2B A; 1Q7Y R; 2LVM A; 1PRM C; 1QP3 A; 2RB6 A; 2LQK A; 1AVZ C; 4C0D C; 1M1F A; 1OZ2 A; 2FG0 A; 3SWN B; 1O9S A; 3MO8 A; 2ESW A; 2BTT A; 4PJN A; 4J83 A; 1KQ1 A; 4JS5 A; 1MMA A; 3M0R A; 2CUD A; 2DLP A; 2E3I A; 1YIT T; 3CC4 Q; 2LQN A; 2K5I A; 2DFU A; 2COY A; 3E1S A; 4OGE A; 4AG2 C; 2CKK A; 2OAU A; 3DLM A; 1WYX A; 1HK9 A; 3LH5 A; 3RKW A; 2GCX A; 1U1S A; 3G7Z A; 2JT4 A; 4J9H A; 3V7S A; 4HCK A; 4ATO A; 1BK2 A; 3I35 A; 3HPW A; 4MMK A; 3BDL A; 3PGG A; 1KIK A; 4HVV A; 3DLL A; 4MDX A; 3PNW C; 2BUD A; 1U06 A; 1VQL A; 4J7I A; 2RHZ A; 2D1X A; 1VQN T; 1M1K C; 4PK4 A; 4ZTJ A; 4ELZ C; 1G3W A; 2K4Y A; 2RJF A; 4DBR A; 3M59 A; 2OTL A; 1F1B B; 3WXM B; 2QDL A; 3V8J A; 1P92 A; 1H92 A; 5IH2 A; 3A8O B; 2DTI A; 3RDV A; 2DIL A; 2QXF A; 3I56 A; 3CBO A; 3ZEH A; 3I5R A; 1D3B A; 4KT0 E; 1ZUK A; 2OTL Q; 1QVP A; 3C0C A; 4BDY A; 5GAM j; 4M78 D; 5CKE A; 4AT1 B; 1JBM A; 4MZP A; 3VS2 A; 2C0O A; 4CC2 A; 3CME Q; 2VGN A; 4M7A G; 2FHD A; 2RK1 A; 4J9I A; 2RI3 A; 1WX6 A; 4M78 E; 4PJO G; 1YN8 A; 1Q81 C; 4J9E A; 1HXD A; 2DK3 A; 8AT1 B; 5KYN A; 2EJG A; 2C06 A; 5A0L A; 1M9S A; 1N5Z A; 2KRS A; 3OMG A; 1UUE A; 3CMA Q; 2RD1 A; 4JRK A; 1PCX A; 3EG1 A; 2K3B A; 3ASK A; 4M7D B; 2GF7 A; 5CKF A; 1BBZ A; 4E7H A; 1YJW A; 1OX8 A; 1Q95 G; 2KVQ G; 1WHM A; 1UEC A; 2YUO A; 3VRY A; 2LC4 A; 1I4K 1; 1GXI E; 3CPW S; 3GPL A; 2K79 A; 4M77 E; 1AOJ A; 2SRC A; 1MND A; 1W1F A; 1NLO C; 1JO8 A; 3X25 B; 1PKS A; 3QII A; 5LJ5 d; 4FIB A; 1GL5 A; 1QKX A; 2RM4 A; 2D9T A; 1UB4 A; 2H3J A; 2D8H A; 3NGP A; 1KFZ A; 2ZPG B; 5GAM f; 1YIJ T; 1PHT A; 4C0F A; 2M9U A; 4RTV A; 3CCL T; 1S72 A; 2LQW A; 2XD0 A; 1RLP C; 2EGE A; 2EYX A; 2DF6 A; 4M75 E; 2HNI A; 5GAN 5; 2J6O A; 5FW9 A; 1LPL A; 2QI2 A; 1VQ7 T; 1VQN A; 2EQJ A; 2QAZ A; 2QDY B; 1TU0 B; 2L8D A; 1PNJ A; 2D8J A; 4B6M A; 3UA6 A; 2MPX C; 1KD1 C; 1AWJ A; 2E1H A; 1G3T A; 3HL8 A; 3REB B; 1RAI B; 1EX4 A; 2CZ6 B; 4N0A C; 3M54 A; 2RO0 A; 2DEQ A; 3M53 A; 3REA B; 3JCM Q; 1M8M A; 1VQN Q; 2LCL A; 2O88 A; 2JM8 A; 4L59 A; 2LDM A; 5CQX A; 4NL2 A; 5KYW A; 1SHF A; 2Y4Y A; 3TEE A; 2KYB A; 1G83 A; 4FSS A; 3QYH B; 1M1G A; 1JXM A; 3H9N A; 2ZPF B; 2J6K A; 1YIT A; 1Q86 R; 5GAN f; 3JB9 I; 4EMK C; 3VS7 A; 5CKH A; 1QLY A; 1V1C A; 3CC2 Q; 4C8Q C; 3CCR A; 2BZ8 A; 1J3T A; 2QK0 A; 3E9G A; 4PL6 A; 1S72 T; 4HA8 A; 3CBP A; 3RUX A; 2V8I A; 3KUF A; 4IKF A; 4AFU C; 5FWB A; 1EZZ B; 1K8A C; 1H8K A; 1CKA A; 2E5Q A; 2FYK A; 2VGM A; 1VA7 A; 1YJW Q; 3C94 A; 3A8H B; 4JLG A; 3OY9 A; 3PTA A; 3E2U A; 3V7C A; 5A2Q E; 5IXF A; 2DX1 A; 3LGL A; 4M78 B; 1EFN A; 1OZ3 A; 2AKK A; 2DXC A; 3QKJ A; 2LT4 A; 3NTK A; 2DMO A; 3ME9 A; 2YDL A; 3C12 A; 3FJ5 A; 4M77 C; 4RTT A; 2RJD A; 2JMA A; 4X9D A; 1B34 A; 4E7J A; 1SHG A; 1G8X A; 2BZY A; 4BD3 A; 4HCZ A; 3CCS T; 2HCK A; 5GAN d; 1GCP A; 2FPD A; 3OYH A; 3A5Z B; 4M7A E; 2HD0 A; 1BIB A; 3MEA A; 4EDU A; 2O2O A; 2KBT A; 2QQS A; 2ZAE A; 1NEB A; 4M7A C; 2MIO A; 3UA7 A; 3JRZ A; 1JQQ A; 5A0D A; 1QCF A; 4EMG A; 2ZPH B; 4QKU A; 3G4S T; 3ULR B; 4BY6 C; 1YIJ A; 1VQL Q; 4PJO E; 5M9O A; 2DXU A; 2LT1 A; 5KYX B; 2DNU A; 5LJ5 j; 2J06 A; 1IXD A; 4A4E A; 1C0M A; 1D0Y A; 4BE0 A; 2VWF A; 5GAM h; 3J80 E; 4HCC A; 4MZM A; 1FMV A; 4FYV B; 1X2K A; 1VQ9 A; 4Z88 A; 2E70 A; 4O6J A; 3VYH B; 1UE9 A; 2AIR B; 1UJY A; 5DLO A; 4M75 A; 1TUD A; 4XTY A; 1DJ7 B; 2V26 A; 1U3O A; 2MMP A; 2JTE A; 1GFC A; 3EFO B; 3JCM h; 2CUB A; 1RAE B; 3CCR Q; 4J9G A; 2RQU A; 4N4G A; 3VKI A; 3V7R A; 1M5Q 1; 4N4I A; 3M5A A; 1MV0 B; 1Y96 B; 3CEY A; 2M0O A; 3SB2 A; 3OW2 A; 3P8D A; 3X26 B; 1M27 C; 1OQK A; 2DKG A; 2RHY A; 3S3M A; 4XTW A; 3A8L B; 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3MHX A; 2ROT A; 3RER A; 4ZGD B; 2CDT A; 4A4H A; 1D1A A; 3BE3 A; 2FVU A; 3JCM J; 4AG1 C; 2QEX T; 1WJR A; 2FZG B; 1WHG A; 3INZ A; 3M9Q A; 4C8Q A; 2NYS A; 3RIR A; 4PJM A; 1NJI R; 5LJ3 j; 1D1B A; 2P84 A; 2DVE A; 1YJN T; 4PNO A; 5FWC A; 4Y92 A; 3G4S Q; 3M0P A; 2JVV A; 2LJ1 A; 3GNG A; 2HSP A; 2HSE B; 3QPH A; 4RTX A; 3PVL A; 2MOX A; 1M1K R; 1WXU A; 3CME A; 3OYF A; 5DM7 R; 1KQS S; 2F5K A; 1K8A R; 2BE7 D; 1TTH B; 1Y96 A; 1XNI A; 2CT3 A; 5KE2 A; 2KRO A; 1IHW A; 4A4F A; 3OYI A; 1VQ9 T; 3WVD B; 3M57 A; 1U8R A; 4FU6 A; 3MJX A; 4OB0 B; 3QBY A; 2E12 A; 3MP6 A; 4F7U E; 2YWW A; 5GAN 2; 4R56 A; 5GMK l; 4C5G A; 1X6O A; 1WA7 A; 5LJ5 h; 2LNV A; 2YUN A; 2KE9 A; 2XDP A; 3M56 A; 3TVT A; 2MWO A; 1NE8 A; 3VV0 A; 4K11 A; 5J26 A; 4AFS C; 3M4Y A; 2A37 A; 3HFN A; 1YWP A; 3CPW A; 2RJC A; 1OPL A; 4M75 G; 1QW1 A; 3CCV Q; 4M7D A; 3OS0 A; 2XDD A; 4QQD A; 1E6G A; 3PFS A; 4M75 F; 2JTF A; 2W0Z A; 4BE1 A; 1K9A A; 4XTU A; 3E9F A; 3V8K A; 2EPD A; 2DIG A; 3CCV A; 2NUP A; 4OMN A; 2ECZ A; 3OBY A; 2M02 A; 1D09 B; 3UF4 A; 3R6N A; 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