The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
|
sequence length |
95
|
structure length |
95
|
Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1K8A R; 1VQ6 Q; 1JJ2 P; 1NJI R; 3CCJ Q; 1VQ7 Q; 3CCQ Q; 1VQO Q; 3CCL Q; 1S72 Q; 3CCS Q; 1VQN Q; 1VQK Q; 1KQS P; 1VQ8 Q; 1QVF P; 3I56 Q; 3G71 Q; 1YHQ Q; 3CC2 Q; 1VQL Q; 3CCU Q; 1KD1 R; 1YIJ Q; 3CD6 Q; 2QEX Q; 1K73 R; 3I55 Q; 1VQ9 Q; 3G6E Q; 1Q7Y R; 1YI2 Q; 3CMA Q; 3CCR Q; 1Q81 R; 1YJW Q; 3CXC P; 1VQP Q; 3G4S Q; 3CCV Q; 2QA4 Q; 1Q86 R; 1N8R R; 1VQ5 Q; 3CME Q; 1YJN Q; 1Q82 R; 2OTL Q; 1M1K R; 1W2B P; 3CCE Q; 1QVG P; 1VQ4 Q; 1K9M R; 1YIT Q; 1VQM Q; 3CC7 Q; 2OTJ Q; 3CPW P; 3OW2 P; 3CC4 Q; 1M90 R; 1KC8 R; 3CCM Q; 1YJ9 Q; #chains in the Genus database with same CATH topology 1VQ7 T; 3WXM B; 1K4U S; 4ATO A; 1NLP C; 2LJ3 A; 3G71 T; 2QG9 B; 5GMK j; 3CD6 T; 2PUK B; 3MEU A; 3OYI A; 2CDT A; 3R6N A; 2J6F A; 4C0G A; 3G6E Q; 5GMK l; 2D8J A; 1RAG B; 2P4R A; 3QHS A; 3CCE A; 3M4Y A; 4AG2 C; 2BZY A; 3JB9 J; 2H3E B; 3JCM W; 2DXT A; 1K8A C; 1K8A R; 3M0U A; 2WSE E; 4QT7 A; 2QXF A; 1H3Z A; 1UGP B; 2DRK A; 2MMP A; 2DXC A; 3QZ9 B; 4M7D F; 3UAT A; 2G6F X; 2FEI A; 3SWN C; 3CCU Q; 3LH5 A; 4F7U E; 4BUG A; 3CXC P; 3G4S A; 4M78 A; 3A8G B; 2F69 A; 3S3N A; 3VS3 A; 4Y92 A; 2F2V A; 2CZ6 B; 5KYX B; 2X9H A; 1V76 A; 1JEG A; 2LNV A; 1VQP A; 2X35 A; 3JB9 F; 3O8V A; 2DFU A; 2L3S A; 3CBM A; 1HD3 A; 2E1H A; 2ZPF B; 3SDZ A; 1SRM A; 4IUR A; 1YIJ T; 2F1L A; 2JMC A; 2DLP A; 5FW9 A; 1M5Q 1; 5GMK e; 1WFW A; 3HP9 A; 1QMC A; 5LJ5 f; 3DLM A; 3LGL A; 2KQW A; 2RQU A; 4QQ6 A; 4EDU A; 2DEU A; 2OTJ Q; 2K3X A; 3J7A F; 1TG0 A; 4RTY A; 3HRU A; 1M1K U; 2ZCF B; 4LN2 A; 3DLL A; 2K4Y A; 2LCS A; 4C0Z A; 4GLK A; 1UJ0 A; 1VA7 A; 3VYG A; 1ZSZ C; 2P4T A; 3C4S A; 3V7S A; 3THK A; 3CMA T; 5CKF A; 1VUB A; 4M7D A; 2FG0 A; 1X43 A; 2EQI A; 3G1J A; 2W0Z A; 3JCM X; 1WHK A; 1G3T A; 2HQE A; 1UB4 A; 1GFD A; 4M7A B; 1IZ6 A; 4C8Q D; 4M77 F; 1N8R U; 3UA6 A; 2GCX A; 5GAN 2; 4MZM A; 5DY9 A; 5D6W A; 3EH2 A; 4FT4 A; 3OSV A; 2BZ8 A; 2IIM A; 1P92 A; 4JRP A; 2RF0 A; 2HBW A; 3QZ5 B; 1YJN Q; 1UDL A; 1K73 U; 2LP5 A; 2DET A; 4Q5W A; 3OW2 P; 5GAO r; 2XDD A; 4XTV A; 5LJ5 h; 1YJ9 A; 2FYK A; 3MHX A; 1CKB A; 3JCM f; 1S72 Q; 3LLR A; 4CI0 C; 4BE0 A; 1KQS P; 1Y07 A; 4J9H A; 5KYW B; 3TRE A; 2LCC A; 3V7C A; 2QQ9 A; 2K6D A; 2QA4 T; 2KSS A; 2KI7 A; 2KK4 A; 4IUU A; 1WQW A; 3H0F A; 2AZV A; 2EYX A; 1VQ6 T; 4LUD A; 2RQT A; 1OPK A; 1VQN T; 3CCL A; 5CKE A; 2ROL A; 1W6X A; 1VQ8 Q; 4C5H A; 3V8J A; 4M77 A; 4HT8 A; 2DO3 A; 2ABL A; 4HVV A; 3M9Q A; 3SB2 A; 2JTE A; 2LCL A; 3QBY A; 4JZ4 A; 3CCV A; 4E2F B; 5IHK A; 5LJ5 j; 4RMO A; 4FIB A; 4B6M A; 3INZ A; 1SSF A; 2GNC A; 1NJI R; 4J9F A; 3OYD A; 1WDX A; 3EGD B; 2DM1 A; 4C92 D; 1AWX A; 2AIR B; 1PSF A; 1W2B S; 3QJ6 A; 1QVG S; 4C8Q G; 2JOY A; 1T3L A; 2KRO A; 4Z02 A; 2CZ7 B; 4Y91 A; 4M75 F; 3PVL A; 3JCM h; 5LJ5 d; 5DLQ E; 1GCQ A; 3E2U A; 2EYZ A; 4A4F A; 4L6V 5; 4XTX A; 3HRS A; 3HTR A; 1D0Z A; 3I56 T; 1VQK T; 3C95 A; 5LJ5 g; 2E70 A; 1NEG A; 3A8O B; 3GOX A; 3M53 A; 3O5Z A; 1ZUU A; 1XTD A; 4R55 A; 5IHN A; 1F1B B; 3I35 A; 3Q1J A; 2MOX A; 1RI9 A; 5I2S A; 3CC7 A; 1R0C B; 1SF9 A; 3CCQ T; 1UEC A; 4RKU E; 4F7U A; 2IG0 A; 1C6V X; 4CC2 A; 1M3A A; 2E64 A; 2DVE A; 3QII A; 4FM4 B; 1ZA2 B; 2V8I A; 2VGN A; 3QXE B; 1SHF A; 2XHC A; 1VIF A; 4J7I A; 3CCE T; 5GJW B; 1K9M C; 1K9M R; 1N9S A; 3X28 B; 2HSP A; 1JU5 C; 4NL3 A; 3PMT A; 1M90 C; 1M90 R; 1QCN A; 1QVF P; 1BI2 A; 3JCM d; 4PJO B; 3CBO A; 4HA8 A; 1ABQ A; 1OU9 A; 1J3T A; 4C92 E; 1GFC A; 2XID A; 1PKS A; 5GAO p; 1YJW Q; 4M7A C; 2VWF A; 2RMO A; 2KBT A; 3G4S T; 1EFN A; 4JRK A; 1VQ5 A; 4DBR A; 2DD5 A; 2RQV A; 1RLP C; 1WX6 A; 1VQP T; 2EYY A; 2EGA A; 2C0T A; 2HKN A; 9ATC B; 3FB9 A; 1I1J A; 1Y71 A; 1Y96 B; 2YHT A; 1TSF A; 1PD1 A; 4ESR A; 1MV0 B; 2J6O A; 4GLM A; 5FRO A; 2COZ A; 3EFO A; 2DMO A; 2KEA A; 2FL7 A; 2KYB A; 2EGC A; 2RK2 A; 5GAN 8; 4M78 D; 2F2X A; 1W2B A; 1QVG A; 4XTY A; 4CC4 B; 4KH1 B; 1VQ7 A; 3V7R A; 1VQO A; 3MPU B; 1U1T A; 1RAA B; 2ZPE B; 5CKD A; 3MP6 A; 2QEX A; 1B34 B; 1KJW A; 4EMH A; 1NYG A; 3VS5 A; 5KYU A; 1Z9Z A; 2OI3 A; 1VQM Q; 2RQW A; 4OMM A; 2B8A A; 1QWE A; 3CXC S; 3VU3 C; 1E6G A; 4ORZ A; 5GAN 4; 2HBP A; 2HL3 A; 3NTH A; 2ED1 A; 2XU8 A; 3CCR A; 3BFM A; 3SEM A; 1AT1 B; 3UDC A; 4M7D D; 3BDL A; 2FPF A; 2XDP A; 3TSZ A; 1DJ7 B; 1TWB A; 1YJ9 T; 5LJ3 g; 2AK5 A; 2EJG A; 2JNG A; 2DA9 A; 1YWO A; 4HCC A; 2ZPH B; 1BI0 A; 4R56 A; 4DA4 A; 3E19 A; 1WLP B; 3PIP A; 3VS2 A; 1D0Y A; 3I55 Q; 3JCM b; 1YN8 A; 1B07 A; 5AT1 B; 3NTK A; 1MMG A; 1TU0 B; 3JB9 D; 1OZ3 A; 3HRT A; 4QKU A; 2XMF A; 2LNH B; 1MNE A; 2OAW A; 1VQL Q; 4EMK A; 2L8D A; 2PNI A; 1M2V B; 3OYG A; 4OMN A; 1NYF A; 4M78 G; 1M3B A; 5HK3 A; 1SHG A; 2GBQ A; 1VQ9 T; 2MI6 A; 4FYX B; 5D6X A; 4JLI A; 1IRX A; 4C92 F; 3CMA A; 1UG1 A; 1X2Q A; 3QPH A; 4A4E A; 2EGE A; 3SWN B; 1KD1 U; 1BB9 A; 2DBM A; 2ED0 A; 1YIT Q; 2I0N A; 3MCA B; 2O4X A; 3H41 A; 4RTX A; 3RKY A; 1RAD B; 1RAC B; 3VKI A; 5J39 A; 1YHQ T; 4OB3 B; 2OAU A; 4KUD K; 1ZX6 A; 3S3M A; 4J9B A; 4ME7 A; 2V1Q A; 4M77 D; 2EIF A; 4UC4 A; 1YNZ A; 1R8O B; 4XAX B; 2FB7 A; 1I5L A; 5FU7 C; 3JCM J; 3CPW P; 3PGG A; 1Q81 U; 3HHT B; 4M7D E; 2DAQ A; 4M7D G; 1M27 C; 1WA7 A; 2E3H A; 3CCS A; 1OV3 A; 3M5A A; 4F04 B; 1W1F A; 2LTO A; 2YSQ A; 1QKW A; 2DVJ A; 4JRI A; 3OYK A; 3EG9 A; 1WYX A; 2LDM A; 1ZSZ B; 5I2M A; 3KUF A; 2PTK A; 3EG2 A; 3P8B B; 4C92 A; 1KHC A; 1KG1 A; 2JM9 A; 3CCM A; 3JB9 G; 4ELY C; 2E6N A; 2BUD A; 1BYM A; 3VS7 A; 2KMT A; 1W70 A; 3CC2 Q; 2P84 A; 5I21 A; 2EKH A; 1YP5 A; 3NGP A; 3C94 A; 2DTI A; 1WI7 A; 5GMK m; 2JMA A; 2FZG B; 1M1K R; 3EGX A; 3OYY A; 1X69 A; 2OTJ A; 3LYI A; 2RM4 A; 1EIF A; 3OYJ A; 2IPO B; 3EG3 A; 3TSW A; 1TXQ A; 4D6W A; 2E4H A; 2D6F A; 2ZPB B; 4J83 A; 1GCP A; 2YWW A; 3QYH B; 4F16 A; 2DIQ A; 1AWO A; 2LT1 A; 2D0N A; 1C1A A; 4FYW B; 4PJL A; 2A7Y A; 1G2B A; 2KR3 A; 2LMJ A; 1JJ2 S; 4OB0 B; 1N8R C; 1N8R R; 1VQ5 T; 5FU6 B; 2O31 A; 3KFV A; 1HK9 A; 3WVE B; 4M77 G; 4JJD A; 4M75 D; 2KYM A; 2HDA A; 2GTJ A; 2D9T A; 2HL5 C; 3I56 A; 3QO3 A; 1K73 C; 1ZUK A; 1K73 R; 1VIE A; 4Z89 A; 2NUT B; 1JXM A; 4J9E A; 1OUL A; 3OA6 A; 2HQH A; 3URG A; 4FYV B; 1SPK A; 1M1G A; 4FSS A; 5FRM A; 1HJD A; 1VQO T; 3FJ5 A; 3CCQ A; 1RAB B; 2KVQ G; 1D1C A; 2EYQ A; 3HL8 A; 5HK0 A; 2QEX T; 1QVF S; 1B3Q A; 2DRM A; 4IUQ A; 3TU4 K; 2F2W A; 5DM7 R; 2AKK A; 4FCY A; 2LVM A; 5IN1 A; 3EGU A; 1OZ2 A; 2WAC A; 3EH1 A; 4C8Q C; 4DOW A; 1MV3 A; 4AFU C; 2QDY B; 2RHZ A; 3H0H A; 3QUI A; 5CKB A; 3GNG A; 3CCR T; 5CK9 A; 1MND A; 4RTZ A; 1I0C A; 4BDY A; 4F7U G; 4BAC A; 4M7A F; 1S1N A; 1QP2 A; 1G3S A; 4XK8 E; 3MP8 A; 4D8K A; 2EJF A; 3OS0 A; 2BE7 D; 3X24 B; 1X6O A; 2DD4 A; 4M78 B; 1WHH A; 3UF4 A; 4M75 E; 4M75 G; 5FWC A; 1YI2 Q; 1ZHI A; 4QVC A; 1G3W A; 3S3O A; 1VQ4 A; 2GFU A; 2KRN A; 2QGG A; 3M0S A; 1D09 B; 2RQR A; 4PJO E; 4X9C A; 2DJQ A; 3JB9 H; 4J7F A; 1N27 A; 1VQN Q; 3OYH A; 2A28 A; 4EPC A; 3JCM V; 1H3H A; 2C0I A; 1JJ2 A; 1BI1 A; 3J81 E; 2KGT A; 2QQR A; 4J6W A; 4ELZ C; 2M0O A; 2DEQ A; 4QVZ A; 1QW1 A; 1RAI B; 4N0A A; 2DZ9 A; 2ECZ A; 2KNB B; 4LDX A; 2J05 A; 3M54 A; 3TQ7 P; 1I8F A; 3DKM A; 1I5O B; 4F14 A; 2KE9 A; 3LH0 A; 2DL4 A; 3U23 A; 1X6G A; 2RN8 A; 2YRD A; 2DIG A; 4OB2 B; 2XIC A; 3GPL A; 1UHF A; 2R5M A; 3EG1 A; 1M3C A; 4C0F A; 4QW2 A; 2FVU A; 4FL6 A; 3VRZ A; 1WHM A; 3ER0 A; 2X4W A; 3VRY A; 2K79 A; 3FDR A; 2EPD A; 3TEE A; 3OYB A; 3KBG A; 2DXB A; 1WXT A; 3CCS T; 1QVF A; 1VQK Q; 5KYY B; 5FU6 C; 4QQG A; 3HFO A; 3QG1 A; 3OSS C; 1GBQ A; 3UT1 A; 2CP2 A; 2CUB A; 4OP0 A; 3L2Q A; 1OQK A; 3CCM T; 1TUC A; 2MAM A; 1Q82 U; 2ZGW A; 5KE2 A; 2PVG B; 3HPW A; 2BIV A; 1AWJ A; 1VQ9 A; 2M16 A; 2L2P A; 2DBK A; 2HCK A; 4C5G A; 1W4S A; 3CCE Q; 4ANJ A; 4PJJ A; 2OTJ T; 4ZNX A; 2XDB A; 2IVW A; 3X20 B; 1NJI C; 4M77 B; 2W10 A; 1QVP A; 2HSE B; 5GAN f; 1K0S A; 3FJP A; 3ME9 A; 5GAO q; 2NLU A; 3EGD A; 1YHQ A; 1K8A U; 4OVA A; 1UGV A; 1YBY A; 4CC3 A; 2YUO A; 5GAO l; 4L5G A; 2P0P A; 3G4S Q; 1X6B A; 1OPL A; 3NPF A; 2K5I A; 4CC7 A; 3QWY A; 4NL2 A; 2FRY A; 1AZG B; 1UGR B; 2BTT A; 5FRN A; 1VQP Q; 1D3B B; 2M51 A; 2FZC B; 5D6Y A; 4PJO F; 1D0X A; 2MWP A; 2RJD A; 3CCJ A; 3LW5 E; 2ZAE A; 4WF2 A; 1ARK A; 4AFZ C; 1TUG B; 5LJ3 f; 2RK1 A; 3TVT A; 2NUP A; 3VJP A; 3QDR B; 3DB3 A; 4OF1 A; 4XQ3 A; 1PM3 A; 1WJS A; 1M30 A; 2A3L A; 2CH4 W; 2JUF A; 4BD3 A; 1G5V A; 5CVI A; 1SSH A; 5CQY A; 3PFS A; 1VYT A; 2JN0 A; 4M78 C; 3RDV A; 5LJ5 e; 3I9Q A; 2J06 A; 2K2V A; 4C5E A; 2V1R A; 2Y4X A; 5KCH A; 2V26 A; 2K5L A; 5IAY A; 1RAH B; 4LE9 A; 3P8D A; 5GAN h; 3VS6 A; 4F7U B; 2VC8 A; 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1WGS A; 1ZA1 B; 3HSB A; 3EFS A; 1AEY A; 1R0B G; 3VS1 A; 4M77 C; 1WXB A; 1NPR A; 1NM7 A; 2O88 A; 2DER A; 2KXD A; 4J9C A; 2JJ9 A; 1RAF B; 4LNP A; 3OYC A; 1JQQ A; 1WNL A; 2L89 A; 2COY A; 5L23 A; 4E7S A; 2RH2 A; 3BY7 A; 5I11 A; 5IT9 E; 4M7A D; 2GGR A; 3RMQ A; 2YUQ A; 4LD6 A; 4JJC A; 3JSC A; 3OS1 A; 2LT4 A; 5GAM h; 1RUW A; 4KBM B; 3JRZ A; 1U5S A; 3CC7 Q; 2EAY A; 2D0Q B; 2GFA A; 2VXF A; 1GCQ C; 3VV0 A; 1QKX A; 1K0X A; 3ASK A; 3UPU A; 1U3O A; 2A36 A; 1KHI A; 1ACM B; 1MGQ A; 4JJB A; 5GAN 3; 4C8Q B; 1M8V A; 2DNU A; 2RHX A; 2QAS A; 4XU0 A; 4J6X A; 1Q86 C; 1Q86 R; 3ZL7 C; 2HAX A; 4MDX A; 3PE0 A; 5L8R E; 2LZ6 B; 1KSW A; 4PNO A; 2FO0 A; 3CC4 Q; 1BI3 A; 4FU6 A; 3OY9 A; 1EX4 A; 3SWN A; 1M1F A; 2CKK A; 2XKO C; 1VOM A; 2CT4 A; 2DIL A; 4KUI A; 4E7I A; 1X27 A; 4ZGD B; 1JRI A; 3OW2 S; 1PKT A; 3G6E A; 5GAM j; 2C06 A; 4IKF A; 2O4X B; 2RJC A; 3M0R A; 4KUL A; 3VS4 A; 1VQ5 Q; 2I2L A; 4DBQ A; 3M58 A; 2D1X A; 1KQS S; 1OEB A; 1KQ2 A; 5IHI A; 3OYN A; 4RTW A; 4KGX B; 2HQX A; 3CCJ T; 1E7O A; 2CP6 A; 3NTI A; 2L0A A; 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