The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
|
sequence length |
95
|
structure length |
95
|
Chain Sequence |
b'PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3G71 Q; 1KC8 R; 1VQ5 Q; 3CCM Q; 3CCJ Q; 1VQ7 Q; 3CCE Q; 1NJI R; 1S72 Q; 1K9M R; 1YIT Q; 2QA4 Q; 3CCQ Q; 3CXC P; 1VQK Q; 1VQM Q; 3CCR Q; 3CC4 Q; 1Q81 R; 3CC2 Q; 1Q82 R; 1YJ9 Q; 1VQ6 Q; 3CCU Q; 2QEX Q; 3OW2 P; 3CCV Q; 1N8R R; 1QVG P; 3CPW P; 1KQS P; 1KD1 R; 1VQP Q; 3G4S Q; 1K73 R; 3CMA Q; 1W2B P; 1VQO Q; 1QVF P; 3CCS Q; 3I56 Q; 1Q86 R; 3CCL Q; 1K8A R; 1Q7Y R; 1YHQ Q; 1VQ8 Q; 2OTL Q; 3CME Q; 1VQN Q; 3G6E Q; 1VQL Q; 1VQ4 Q; 3CD6 Q; 3CC7 Q; 1JJ2 P; 1YI2 Q; 1YJN Q; 3I55 Q; 1YJW Q; 1VQ9 Q; 1M1K R; 2OTJ Q; 1M90 R; 1YIJ Q; #chains in the Genus database with same CATH topology 2VV5 A; 1Y0M A; 2C0I A; 2HZY A; 5LJ5 f; 2XI9 A; 4OF1 A; 1VYU A; 3CC2 Q; 2EYZ A; 4OMN A; 4EIK A; 1LPL A; 1QVG A; 2ZCF B; 3OSS C; 3I56 Q; 5L8R E; 4X9C A; 4CC7 A; 4HCB A; 1VQM A; 4QW2 A; 4MZP A; 4FM4 B; 3VS5 A; 2EYQ A; 4NL3 A; 1JJ2 S; 3M0T A; 1QW1 A; 2PQW A; 1MHN A; 2JS2 A; 3NFC A; 2DTI A; 2EYX A; 1OZ3 A; 4M78 F; 3VRY A; 4IKF A; 2LCS A; 1H8K A; 5LJ5 e; 1FMW A; 5DLO A; 2X3W D; 4M7A C; 3OMC A; 3JV3 A; 2NUT A; 3L2R A; 3GIB A; 2JVV A; 4D8D A; 2PU9 B; 7AT1 B; 4L59 A; 4M7D G; 2RM4 A; 3OS5 A; 4C8Q B; 3VS7 A; 3LGL A; 2CUD A; 2IPO B; 1U5S A; 2KMT A; 3VJP A; 4PJO A; 2OX7 A; 1PSE A; 3E1S A; 2J6F A; 2VGN A; 2P4R A; 4YTL A; 2VC8 A; 2RNA A; 1N5Z A; 2MMP A; 4J6X A; 3OMG A; 1PG5 B; 2MF2 A; 2HD0 A; 8AT1 B; 1RLP C; 4AFU C; 1NE8 A; 3SWN B; 1I1J A; 2NUP A; 3I5R A; 2DL7 A; 5C0M A; 1YJW Q; 3BDU A; 4F7U A; 2ENM A; 3A98 A; 2YWW A; 1Y96 B; 2RJD A; 3CCM Q; 2A0F B; 5GAN d; 1CSK A; 1RI9 A; 3CC4 Q; 2DRK A; 2FRW A; 3MEA A; 4EDU A; 4J9B A; 3CCU Q; 2KQW A; 3X26 B; 4C92 A; 5FW9 A; 1C0M A; 1RI0 A; 1QVG S; 4OMM A; 2DNU A; 2DZ9 A; 3MJX A; 2J6O A; 3NPF A; 2LQK A; 1UTI A; 2CZ6 B; 4JUV A; 3CMA A; 4M7A E; 1VQO A; 2DYB A; 3M56 A; 5KYX B; 3JCM c; 2QDL A; 3M59 A; 1YI2 A; 1YJN A; 5DM7 R; 1U8R A; 1EFN A; 4M78 G; 1VQ5 A; 2YHT A; 2E64 A; 4HKE A; 3MHX A; 5HK3 A; 4FYV B; 1KG1 A; 4DA4 A; 3FDR A; 2OTL Q; 2CP6 A; 3KUF A; 2FL7 A; 3KFV A; 3PT9 A; 1ZSZ C; 3FJP A; 1YJ9 T; 2BE9 B; 2COW A; 1M90 R; 2K7A A; 2RO0 A; 1YIT Q; 2WSC E; 2F2W A; 2CUB A; 5GAN f; 3VRZ A; 2H3E B; 4ATO A; 1RAC B; 2C06 A; 3I55 T; 3ZBD A; 3TQ7 P; 4C5G A; 2V26 A; 2YUQ A; 1GCQ A; 2EAY A; 1ZA1 B; 2XDB A; 2LC4 A; 1JU5 C; 2KDS A; 1NEB A; 3M4Y A; 5KYU B; 4RTW A; 3V8K A; 2M16 A; 2MOX A; 4A4F A; 1X6O A; 3EGD B; 2K5L A; 3PIO A; 1X2K A; 3MO8 A; 1M1F A; 1AWW A; 1LVK A; 3MPU B; 2MIO A; 2PVO B; 5GAN e; 4RG8 A; 1IGU A; 1M27 C; 1MMD A; 2RHU A; 1BI3 A; 4EMH A; 4PNO A; 1SEM A; 1EX4 A; 2LX9 A; 3QG1 A; 2DXC A; 3E9G A; 1G5V A; 4RCC A; 3VV0 A; 3LW5 E; 1NJI C; 4M7D C; 3OYD A; 2RHX A; 2OI3 A; 3L2Q A; 1VQK Q; 2J7I A; 1E6H A; 3V7S A; 2A7Y A; 1RUW A; 2KYB A; 2P0K A; 2CP2 A; 2QK0 A; 2HQX A; 1KHC A; 2LVM A; 1M9S A; 2VUB A; 3TSZ A; 4JS4 A; 3OY9 A; 2L0A A; 3EAE A; 3CME A; 3TVT A; 2L3S A; 2YLB A; 2DVJ A; 4JJN K; 1K73 C; 3OQ5 A; 1GL5 A; 2L3P A; 3JCM h; 1TUD A; 2M0Y A; 2OTJ T; 1W2B P; 1M90 U; 5J26 A; 4FCY A; 3G71 T; 3PGG A; 4KRT A; 1S72 T; 4IUP A; 3BFM A; 1TTH B; 2LDM A; 1FX7 A; 2X9H A; 1PSF A; 2L2P A; 5AT1 B; 2D0Q B; 3CCS T; 3CPF A; 2M0O A; 2X4W A; 1YHQ T; 2JS0 A; 3BE3 A; 4MZM A; 2QQB A; 1VQ6 Q; 2KRN A; 3I35 A; 4M7D E; 4IUV A; 2Y4X A; 2EKH A; 1VQ7 A; 4M78 C; 2XG8 D; 2RF0 A; 2E1H A; 2COY A; 4KGZ B; 4CC3 A; 1SKU B; 2JTE A; 4FT2 A; 5GAM h; 4LD6 A; 3SD4 A; 2RJC A; 4C0Z A; 2O4X B; 2EW3 A; 2QQA A; 4CC2 A; 5IHI A; 1WJQ A; 2BUD A; 2K4Y A; 3CCQ Q; 2KBT A; 1Q82 R; 3PIP A; 4BY6 C; 3EG3 A; 4LXC A; 4BAC A; 1X6B A; 1QVF P; 2DRM A; 1MND A; 4PJO G; 2AT1 B; 1KFZ A; 1QCO A; 2IIM A; 5CKB A; 3QWY A; 3LH5 A; 5CCA A; 2HQH A; 2RQW A; 5EC7 A; 3CCE Q; 2AZS A; 1WXT A; 1K8A U; 5KYY B; 3CXC P; 2HSP A; 3HL8 A; 1SHF A; 4F7U G; 2RHZ A; 1M1G A; 4BDY A; 1GFC A; 1UDL A; 4UC4 A; 1TXQ A; 1X43 A; 1IB8 A; 4C92 G; 1U3O A; 3LWH A; 3VS0 A; 1UEC A; 4Y28 E; 1K4U S; 1N8R U; 2DXB A; 4Y91 A; 2DYI A; 4JRK A; 3OS2 A; 3CC7 A; 3CXC A; 1KD1 C; 4XTW A; 1I4K 1; 1RAF B; 2JN0 A; 2A37 A; 1W2B S; 5IHK A; 1I5O B; 1T3L A; 1FMK A; 1RL2 A; 3M58 A; 1TS9 A; 2DET A; 4OMO A; 5D6X A; 2A3L A; 3EGX B; 1NEG A; 3V7C A; 3VS6 A; 4FW2 A; 3VS1 A; 5GAN 5; 2KSS A; 3OYE A; 4J9H A; 3MET A; 4M77 E; 2RPN A; 5LJ3 j; 4AFZ C; 3PMT A; 5LJ3 g; 1JQQ A; 1VA7 A; 5KH6 A; 1M1K C; 3HRT A; 2QI2 A; 4HCK A; 5EG2 A; 2JMA A; 4BI4 A; 2OTJ Q; 2GFA A; 2DLP A; 1C1A A; 3MEV A; 1Y96 A; 2HKQ B; 2DD4 A; 4ORZ A; 1VQN A; 1S72 Q; 1FMV A; 2CZ1 B; 2RQR A; 3CD6 A; 2CH4 W; 4M7A F; 2QQS A; 2W0Z A; 2X51 A; 1E7O A; 3E19 A; 1AHJ B; 1KQS P; 1VQ9 T; 2DEU A; 2KK4 A; 5D6W A; 3M55 A; 4XTU A; 5GMK h; 1KQ2 A; 1QVF S; 2L5Q A; 3HHT B; 4B6M A; 3LWI A; 1M2O A; 2HBP A; 3QSU A; 1PHT A; 2PNI A; 1X75 C; 4N0A A; 2XU8 A; 2EYW A; 3FJ5 A; 2E3I A; 5J3B A; 4E7S A; 5LJ5 j; 2FVU A; 5LJ5 g; 5KYX A; 2P84 A; 2KRM A; 4A4K A; 3CXC S; 3VYH B; 3E2U A; 4EMK A; 3CCJ A; 3KXT A; 2F2X A; 4XQ3 A; 3A8H B; 1ZHI A; 3VS4 A; 3HKS A; 2JNG A; 3M57 A; 4PJO C; 2EGC A; 4PJL A; 2HCK A; 4J83 A; 5FU6 C; 3JCM f; 3UAT A; 4LUE A; 3CC2 T; 2EQK A; 3TEE A; 1YP5 A; 1K76 A; 2HKN A; 4PJN A; 2O88 A; 1F1B B; 3I56 T; 4NL2 A; 3OYJ A; 3BY7 A; 2Z0W A; 1BKB A; 3TCJ A; 2JTF A; 1QCF A; 1QVP A; 2F1L A; 2GTJ A; 3EHQ A; 1I5L A; 5KCH A; 1VQP Q; 2F69 A; 4M7A D; 1PKS A; 4HVW A; 2QGF B; 1WXB A; 2LJ1 A; 3JCM e; 4C92 C; 2CP5 A; 2CSI A; 5A0L A; 1I81 A; 4XTY A; 3A5Z B; 5GAO l; 2VGM A; 4DBQ A; 1VQ8 A; 1QKX A; 5GAM f; 2PTK A; 3EFS A; 3EFO A; 2DM1 A; 2ZPG B; 1MMN A; 4JJB A; 3UWN A; 1Z9Z A; 1O9S A; 2FEI A; 1UG1 A; 4N4H A; 1CKB A; 2VXE A; 1B07 A; 2COZ A; 3RR6 A; 2XHC A; 2YRV A; 5HKC A; 2HL5 C; 4ZTJ A; 5FWB A; 5KE3 A; 1WHJ A; 2HBW A; 3C94 A; 3M0P A; 3PE0 A; 1BU1 A; 5FU7 C; 1NJI R; 4PJO E; 3RKW A; 1W4S A; 4A4H A; 2FPD A; 2E70 A; 3G6E T; 5GAM e; 2BTT A; 2EYY A; 1JRI A; 1YJW T; 2JW4 A; 1I8F A; 2KRS A; 2NYS A; 1KQS S; 1WJR A; 2XDD A; 3CCM T; 4HCC A; 4TVR A; 2GQI A; 5A0G A; 4E7K A; 4MML A; 4L6V 5; 4F7U E; 3CC4 T; 5GAN h; 5HY6 A; 3CCU T; 2RQU A; 1K0S A; 2V8J A; 1QKW A; 1GCQ C; 4E7Z A; 1D1A A; 1AZG B; 4V2S A; 1ABQ A; 4FSX A; 4Z89 A; 5GAN 8; 4C92 E; 3OYK A; 1X2Q A; 1K73 R; 5DLQ E; 2R57 A; 4M7D F; 1Z9Q A; 1IZ6 A; 2P0P A; 2LQ8 A; 4PLI A; 3G4S A; 1G3W A; 3OA6 A; 4M7A B; 2E6N A; 1PNJ A; 3PTA A; 6AT1 B; 3URG A; 2RA2 A; 2BE7 D; 1KSW A; 3X25 B; 2OTL T; 3QZ5 B; 5A2Q E; 4WCI A; 3L2V A; 4ANJ A; 2E3H A; 3C0C A; 2CGH A; 1YIT T; 2KEA A; 4OGE A; 2DO3 A; 2VB6 A; 1UFF A; 3LX7 A; 3WVE B; 5KYW B; 2DZC A; 2O4X A; 3FB9 A; 4GBQ A; 1VOM A; 1WHH A; 3VUB A; 1JO8 A; 1M8M A; 4ZNX A; 5L23 A; 4IUR A; 2JM9 A; 5CKF A; 5CVI A; 3QBY A; 5KCO A; 2DJQ A; 3QHS A; 3ULR B; 1SRM A; 2RK2 A; 1X01 A; 1ZSG A; 5M9O A; 1NYG A; 2R5A A; 2VAS A; 3RUX A; 4LDV A; 4M7D D; 1UGS B; 3M5A A; 2W10 A; 2MCN A; 4E7I A; 1M3B A; 4F14 A; 5GMK l; 4CRI A; 5CO7 A; 4QKU A; 3CCV Q; 2PVG B; 3OSV A; 1MUZ A; 1OU9 A; 2LNH B; 3RES A; 1H92 A; 4X1V A; 4RMO A; 1KK7 A; 4OB1 B; 4QT7 A; 2QA4 T; 1XQH A; 2FZG B; 1VQK T; 3S3M A; 4RCB A; 2RK1 A; 1U06 A; 1ZBJ A; 5GMK e; 1H64 1; 4PJM A; 1ACM B; 5J39 A; 3OS0 A; 4QVD A; 1AEY A; 3E9F A; 1T0H A; 2H8H A; 1VQL T; 4CC4 B; 2JJ9 A; 3SEM A; 1ZSZ B; 1VIF A; 1WHM A; 1KD1 R; 1UHF A; 4C0D C; 2Y90 A; 3RNJ A; 1KC8 U; 1QP2 A; 3OB9 A; 2DBM A; 4LD9 K; 3G6E Q; 3V8L A; 1R0C B; 2PVD B; 4M77 F; 1OPL A; 1YIJ Q; 2FYK A; 3F70 A; 2D6F A; 3HP9 A; 1ABO A; 4RTT A; 4J9E A; 1IRX A; 1XJW B; 3BW1 A; 2AK5 A; 3M0U A; 4M78 D; 2RB6 A; 5GAN 3; 3NMZ C; 2LCL A; 1WQ7 A; 3DKM A; 4A54 A; 1VQ6 T; 4XTX A; 1M1K R; 5FLX E; 1NPP A; 2V1R A; 1B34 B; 1FYN A; 4RTU A; 5FWC A; 2O2O A; 3CCR Q; 4E7J A; 2RI3 A; 4M7D B; 4AFS C; 4HT9 A; 4D8K A; 1S1N A; 4LDX A; 1D1C A; 2YDL A; 2PUK B; 1MV3 A; 1M2V B; 1VQ4 Q; 2EWN A; 3RIR A; 3REB B; 3RMS A; 3CCQ T; 1SHG A; 1WX6 A; 4OGC A; 1D3B B; 4RKU E; 2KXD A; 2L89 A; 4ZN1 A; 4MZT A; 3SHW A; 3AHU A; 4B9W A; 4OMQ A; 1JXM A; 2CT4 A; 2FO0 A; 1KQ1 A; 4O6J A; 4A4E A; 1UHC A; 4XTZ A; 2DXT A; 4LDY A; 3EHR A; 3HPW A; 2YRC A; 3CCE T; 1YJ9 A; 1EZZ B; 4ME7 A; 3JB9 H; 2FPF A; 3Q1J A; 1MV0 B; 4QQG A; 2GBQ A; 1KD1 U; 2RD1 A; 4M77 G; 4XK8 E; 2RI5 A; 1ZUK A; 3LH0 A; 1SF9 A; 1Y57 A; 3TSW A; 3QO3 A; 1VQM Q; 3I55 A; 1NG2 A; 1BK2 A; 3RDV A; 3OYB A; 2KE9 A; 4B9X A; 3UA6 A; 1GRI A; 4JPB W; 2K2V A; 1ZUU A; 2FZK B; 4M78 B; 4HT8 A; 2JM8 A; 4M75 A; 2DXU A; 2ESW A; 2QA4 Q; 1Q81 R; 2KRO A; 3EFR A; 4JLG A; 4PJO F; 3FIF A; 1M1K U; 2MWO A; 1TG0 A; 2M51 A; 3MEU A; 3UT1 A; 1NPR A; 1VQL Q; 1K1Z A; 4JS5 A; 1PCX A; 4BY6 B; 4EMK C; 3V7R A; 2ZPH B; 1PD1 A; 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1SRL A; 2LZ6 B; 3FC3 A; 1FWZ A; 2VYT A; 4C5I A; 2XMF A; 2OJ2 A; 2KT1 A; 3JB9 I; 4LNP A; 1WJS A; 4L5G A; 4DEY A; 2AHJ B; 4JRQ A; 1R8O B; 1PRL C; 2RHI A; 2DF6 A; 3UPU A; 5GJW B; 4J6Y A; 2QTV A; 1IGQ A; 1PWT A; 4F17 A; 1U1T A; 1YBY A; 5IT9 E; 3THK A; 3H0I A; 2EBP A; 1PKT A; 2K79 A; 3ZL7 C; 1G3S A; 4FL6 A; 4C8Q A; 5KYN A; 4XU1 A; 1HD3 A; 1ZX6 A; 2GNC A; 4PJO B; 2ZPB B; 1GBR A; 4RTX A; 2L8D A; 2FHD A; 5FU6 B; 1ZSZ A; 2CH4 A; 2JMC A; 4IUQ A; 1UJY A; 4E7L A; 3JCM V; 2HSE B; 2LCC A; 1YFN A; 2G3R A; 2L3Q A; 3CME Q; 4LDU A; 5GMK i; 3SWN A; 2R58 A; 4BE0 A; 1Q82 U; 4X9D A; 2KNB B; 4F7U B; 2NUZ A; 3JCM J; 4C0G A; 1Y07 A; 4EPC A; 1QMC A; 4A53 A; 4OB0 B; 2H3J A; 3BDL A; 4C92 B; 3NTI A; 1WDX A; 3AT1 B; 1OPK A; 2L3R A; 1JXO A; 1SSH A; 4IUU A; 4BI3 A; 3M54 A; 2EQU A; 4RTY A; 1NLP C; 4JJC A; 1VQ7 Q; 1UE9 A; 2K3Y A; 1B34 A; 4KT0 E; 5GAO m; 3P8D A; 1VQ9 A; 1UGV A; 3S3O A; 3M0S A; 4GLM A; 2J06 A; 3MP6 A; 1KQS A; 4M75 G; 4XU3 A; 5FU7 B; 1M90 C; 2FG0 A; 5GMK j; 2HEQ A; 4JJD A; 3H9N A; 1WA7 A; 4PLL A; 1D3B A; 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