The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
|
sequence length |
95
|
structure length |
95
|
Chain Sequence |
PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2QA4 Q; 1VQM Q; 1YIT Q; 1Q7Y R; 1YJW Q; 1YIJ Q; 1YJ9 Q; 3CCM Q; 1K73 R; 1K9M R; 1VQ4 Q; 3CC2 Q; 1QVF P; 1N8R R; 3I56 Q; 1K8A R; 1Q81 R; 1M1K R; 1VQ6 Q; 1VQN Q; 1VQP Q; 1VQK Q; 1S72 Q; 3CCE Q; 1YJN Q; 1YI2 Q; 1KD1 R; 1YHQ Q; 3CPW P; 3CC7 Q; 3I55 Q; 2OTL Q; 3CCU Q; 1W2B P; 1KC8 R; 1VQ8 Q; 1KQS P; 3CCL Q; 3CMA Q; 2QEX Q; 3CME Q; 3CCJ Q; 3CCQ Q; 3CXC P; 1VQO Q; 1VQ9 Q; 3G6E Q; 1NJI R; 3G4S Q; 1VQ5 Q; 3CD6 Q; 1VQL Q; 3G71 Q; 3CC4 Q; 3CCV Q; 1Q86 R; 3CCS Q; 1QVG P; 1JJ2 P; 3CCR Q; 2OTJ Q; 1M90 R; 1VQ7 Q; 3OW2 P; 1Q82 R; #chains in the Genus database with same CATH topology 4J83 A; 4ME7 A; 2RQV A; 4M7A E; 3OSS C; 1NJI C; 3CME T; 3L2Q A; 3RER A; 4FW2 A; 3OYB A; 2K2V A; 3QZ9 B; 2ROL A; 4M75 F; 3PVQ A; 1K0S A; 2IG0 A; 1OX9 A; 4KH0 B; 2MF2 A; 3OB9 A; 2HSP A; 1YJ9 A; 3I56 T; 4DBF A; 2DL3 A; 1GFD A; 1W2B A; 1YN8 A; 4C8Q C; 4LUD A; 1AZE A; 3OYG A; 2OTL T; 1H92 A; 1RAG B; 2ECZ A; 4DEY A; 5LJ5 d; 4C0D C; 4B9W A; 1I07 A; 3T9N A; 4M7A C; 3ER0 A; 3TU4 K; 3EFO B; 4FU6 A; 2EQU A; 3ULR B; 1YCS B; 5D6W A; 3DB3 A; 1VQO Q; 1QWF A; 1LOJ A; 4UC4 A; 4BY6 C; 3L42 A; 4J6Y A; 2CGH A; 3CC4 Q; 1R8O B; 2JN0 A; 3BDL A; 1VQN A; 2QTX A; 2Y4Y A; 2FG0 A; 4C92 D; 2HZY A; 2XKO C; 1MMN A; 1ARK A; 3TEE A; 2O31 A; 2X9H A; 2EAY A; 3FC3 A; 1LCK A; 2KRS A; 2K3X A; 3EHQ A; 3OW2 S; 2DBK A; 4EIK A; 1VQ8 Q; 2XDD A; 3G4S A; 5ECA A; 1M27 C; 2KXD A; 3TCJ A; 4V2S A; 1UTI A; 3Q1J A; 2M9U A; 3CD6 Q; 4L6V 5; 4C8Q A; 3AT1 B; 1ZA2 B; 1JU5 C; 1WHH A; 1NPP A; 2RJD A; 2RQT A; 3TSW A; 4M75 B; 2F2V A; 2V26 A; 3CC7 A; 3QJY A; 4KGZ B; 4M7A A; 2FVU A; 3JB9 D; 5CKF A; 2ED1 A; 1K76 A; 1WI7 A; 2XD0 A; 2BZY A; 2LQN A; 2EQM A; 2BZX A; 4CC2 A; 2PVG B; 2DD4 A; 4FCY A; 2EKH A; 1IZ6 A; 2DIG A; 2R5A A; 4IKF A; 3JCM d; 2QQA A; 1RLQ C; 5GAM g; 5HY6 A; 2QAS A; 2XIC A; 2NUZ A; 5GAN d; 1KQS S; 2QQR A; 2GFU A; 2EYZ A; 4XAX B; 5GAM h; 2RHU A; 5GJW B; 2XU8 A; 1XQH A; 3CXC P; 1AWO A; 1WFW A; 1Y7X A; 3JB9 H; 2EWN A; 1ZHI A; 4NL2 A; 5KYU B; 3NTK A; 1CKB A; 1BYM A; 3MKD A; 5CVI A; 1TG0 A; 1Q82 R; 2OAU A; 2LJ0 A; 4M78 G; 2X4W A; 4FYW B; 3DLM A; 2SEM A; 3JRZ A; 4RG8 A; 1X43 A; 3KUF A; 5A0G A; 4XU2 A; 2MWO A; 3LH5 A; 1ZSG A; 4E47 A; 4R0K A; 5A0L A; 4JLG A; 1GRI A; 1X27 A; 1VQ9 Q; 2J7I A; 2PTK A; 2EKO A; 1Y0M A; 2RHI A; 4LUE A; 2EQI A; 3UDC A; 4BD3 A; 4M7D C; 2I0N A; 5D6X A; 3ZFJ A; 3X25 B; 2RK2 A; 4FYV B; 1YJN A; 2IVW A; 5LJ3 g; 4C5G A; 3QBY A; 4II1 A; 2Y4X A; 4JPB W; 3CPW P; 5FRO A; 3RDV A; 5LJ3 h; 1W2B P; 4XQ3 A; 3VS3 A; 3GBQ A; 3EFR A; 2R58 A; 4M78 F; 4HXJ A; 4DBH A; 2X3X D; 3GOX A; 5C6S A; 1WJR A; 4HA8 A; 5GAN 2; 2FEI A; 2MWP A; 2VC8 A; 1UB4 A; 2JTM A; 2K7A A; 4RTW A; 4PJO G; 2GQI A; 2RMO A; 5GAM e; 2O2O A; 1VQM Q; 2K57 A; 1BI0 A; 1YIT Q; 1QQJ A; 2D8J A; 2GF7 A; 1M4Z A; 4HCZ A; 3DB4 A; 4IUT A; 4MDX A; 5J26 A; 3M0S A; 2DTO A; 2KYM A; 3QSU A; 1JO8 A; 4M7D A; 3EGD A; 4HT9 A; 3M0R A; 2LTO A; 2XDB A; 1NE8 A; 2C0T A; 1NEB A; 1NPR A; 1VQ6 T; 2YUQ A; 3V7R A; 1M2V B; 1VQK A; 4O5V A; 3GF5 A; 2X4J A; 1VYU A; 4PL6 A; 1AD5 A; 1G3T A; 2CYZ B; 1S1N A; 1IXD A; 1M2O A; 1BCM A; 2RQW A; 5DM7 R; 2HSE B; 4PJO F; 2DTI A; 1V1C A; 1HK9 A; 5GAN 4; 5CKE A; 4J9I A; 3PIO A; 1GL5 A; 1QP3 A; 4BDY A; 1U3O A; 2RQR A; 1VQ4 A; 5LJ3 e; 2ZPH B; 4LDV A; 4M78 B; 1ZA1 B; 3MHX A; 1I5O B; 1WPY A; 1VQP Q; 1NEG A; 2LJ1 A; 3CCJ A; 1M90 C; 1HSQ A; 5IN1 A; 4C8Q D; 2RH2 A; 1M90 U; 4JLI A; 2DYB A; 2LRQ A; 1FX7 A; 2FB7 A; 4M7A D; 1JEG A; 1VOM A; 2JM8 A; 1D3B A; 1JB0 E; 2E5K A; 2RHY A; 2ABL A; 3NGP A; 1WGS A; 1QW1 A; 2DIL A; 1KG1 A; 1PC0 A; 1K9A A; 2NYS A; 2K3Y A; 4KT0 E; 3E9G A; 5GMK h; 1M1K C; 1M1F A; 2AZS A; 2K5F A; 2X3W D; 3M56 A; 3CC2 A; 2R57 A; 1GBR A; 2ZPE B; 4RKU E; 1M1K U; 4GBQ A; 2JS0 A; 3PMT A; 4M75 E; 4PJO B; 2KYB A; 2BUD A; 1YI2 T; 5IHI A; 1C0M A; 5I21 A; 2QA4 Q; 3CCU T; 2JMC A; 2V1R A; 3CCL T; 4BAC A; 4DOV A; 5GMK m; 2KAF A; 4OMO A; 3NMZ C; 2H3E B; 1W4S A; 4B6M A; 1KHC A; 3G71 A; 3HSB A; 1ZUY A; 1G8X A; 3A1P A; 4Z02 A; 2C06 A; 1X01 A; 4C5H A; 2KVQ G; 3JB9 J; 3M57 A; 2L0A A; 4XTY A; 1NLO C; 2VUB A; 4GLM A; 1UGQ B; 2C0O A; 2ZPG B; 2CT3 A; 2PVD B; 2KT8 A; 3TVT A; 3DKM A; 2O01 E; 1AEY A; 4M75 C; 1ZLM A; 2EGA A; 4IUV A; 1N9R A; 3CCV T; 4J9D A; 4N0A C; 4DBQ A; 3J80 E; 5EC7 A; 2JZ2 A; 2P4T A; 4MDW A; 2DVJ A; 1WNL A; 2DL4 A; 4LE9 A; 4JZ4 A; 2KK4 A; 3CCR Q; 3JB9 I; 3UAT A; 1S72 T; 4GLK A; 5LJ5 j; 3RNJ A; 4PKC C; 3RES A; 1VUB A; 3VS0 A; 4R55 A; 2KR3 A; 3GNG A; 1UHC A; 4J7I A; 1YHQ Q; 3CPF A; 1VQO A; 3QDR B; 1MHN A; 2ROT A; 5GAN 6; 3CC4 A; 1RAD B; 2L3S A; 1TSF A; 1QCO A; 4PJN A; 2AKK A; 2L3R A; 4ZN1 A; 1YIJ T; 4BI3 A; 1R0B G; 2CP2 A; 4M75 A; 2QQS A; 2EVR A; 5A0D A; 2F5T X; 3M4G A; 2EIF A; 3QWY A; 1M3C A; 5GAM f; 1VQ8 A; 3QXE B; 1C1A A; 4N0A A; 3LH0 A; 1D0X A; 1ZBJ A; 2KQW A; 4ZN3 A; 4M7D D; 4ANJ A; 5I22 A; 3EG1 A; 1M8V A; 2COW A; 2X35 A; 2YRV A; 7AT1 B; 1MMD A; 5L8R E; 3TRE A; 3L2U A; 2KY9 A; 2KXC A; 2GNC A; 1E6H A; 4L59 A; 2A0F B; 4PK4 A; 3X24 B; 3G6E T; 3M4Y A; 2CSI A; 2EJ9 A; 4ATO A; 5KYX B; 3CMA Q; 5KE2 A; 2HQE A; 5GAN 8; 3R6O A; 3O5Z A; 4J6W A; 3ZBD A; 5KYU A; 5I2M A; 1J3T A; 2CP6 A; 4M4Z A; 4AFU C; 3SWN B; 1WIE A; 1P92 A; 1QKW A; 1WQ7 A; 2LC4 A; 4HCB A; 2VYT A; 4MZM A; 2X4X A; 1G3S A; 2RI2 A; 2KSS A; 4EPC A; 1I8F A; 3OS5 A; 5FU6 B; 4WF2 A; 5LJ3 f; 2HKN A; 2M0Y A; 1SHF A; 1Y71 A; 2MYS A; 5EG2 A; 2O88 A; 1BCO A; 2DRK A; 4OML A; 2QEX Q; 2L3P A; 4LD6 A; 3PNW C; 4RMO A; 2D9T A; 2LP5 A; 1WA7 A; 2J06 A; 2K6D A; 3ASK A; 2RI5 A; 2LQK A; 1UUE A; 1D0Z A; 1M3A A; 3S3M A; 4M78 E; 4KGX B; 5GMK i; 4A63 B; 2CP3 A; 4RTZ A; 2DXT A; 3C95 A; 2DXU A; 2RJC A; 3I55 Q; 3JCM P; 2FRY A; 4OB0 B; 4Z8A A; 3FIF A; 1FMW A; 2Y90 A; 3C12 A; 4F7U G; 4QQG A; 1Q7Y U; 4PFP A; 3F70 A; 1SRL A; 3JCM V; 1AWX A; 2FRW A; 2VB6 A; 2QYZ A; 4M77 F; 1KIK A; 3SFM A; 1UEC A; 1JQQ A; 2K4Y A; 4M78 C; 3EG2 A; 4OGE A; 2NUP B; 5HK0 A; 1WLP B; 4BDZ A; 1MMA A; 3OBY A; 2OTJ T; 2CUB A; 5I2S A; 2DBM A; 3RIR A; 1UEB A; 3OSV A; 1YIT A; 3VS6 A; 3PVL A; 1M2V A; 3LGF A; 1YJW A; 4HT8 A; 4PJO E; 2M16 A; 4O6J A; 1PG5 B; 3MEU A; 2L8D A; 2KI7 A; 2RJF A; 1VQ6 Q; 4F7U F; 2YLC A; 2K9G A; 5I11 A; 1PRL C; 3A8M B; 3M53 A; 1I4K 1; 2V1Q A; 2PZ1 A; 3UPU A; 2HCK A; 4B9X A; 1GCQ C; 3PGG A; 3CCQ Q; 3J7A F; 3OYJ A; 1KFZ A; 3CCM A; 1M90 R; 2GFA A; 4M78 A; 1JRI A; 2M1H A; 2DRM A; 2M02 A; 4PJO C; 1LVK A; 2HQX A; 1M8M A; 3CXC A; 4ZTF A; 1T0H A; 2PQW A; 4J9E A; 4ZGE B; 1QWE A; 3CBP A; 1I0C A; 2QK0 A; 4M77 B; 2EPD A; 3HFN A; 3CCS A; 3L2V A; 4M75 D; 1YJ9 T; 1O75 A; 4FT2 A; 4AFZ C; 2QG9 B; 2V8K A; 1JJ2 P; 3CXC S; 3H0H A; 2XDP A; 1M1K R; 3JCM Q; 3C94 A; 1GCQ A; 1SPK A; 2V8J A; 3NFC A; 4X9D A; 4DA4 A; 2COY A; 3RR6 A; 3L1A A; 4F7U B; 4KRT A; 1VQL Q; 1VQN T; 1XNI A; 4PJO A; 3LLR A; 3CPW A; 2YUO A; 1X6O A; 4LDX A; 2ZPF B; 2E4H A; 1KD1 U; 2V8I A; 2W0Z A; 2DEQ A; 1X6B A; 1RAE B; 2VXE A; 1YI2 Q; 1JBM A; 1G3W A; 3CCU Q; 3G4S T; 3M0U A; 5LJ5 e; 1PHT A; 2RK1 A; 3L2Z A; 2MCN A; 1M5Q 1; 3CPW S; 1BIB A; 2YXY A; 2MI6 A; 5GAN 7; 3HRS A; 1W2B S; 2QA4 A; 3A5Z B; 2LNH B; 1PD0 A; 3QHS A; 4AG2 C; 3UA6 A; 3CC7 T; 3A98 A; 3H0F A; 2VKN A; 2KGT A; 1UGV A; 3VRZ A; 2CSQ A; 2H3J A; 4JS4 A; 3HHT B; 3EG3 A; 4GY5 A; 3GIB A; 1D09 B; 1RAF B; 3HFO A; 3RUX A; 1KQ2 A; 2DZ9 A; 4KH1 B; 4EMH A; 1QP2 A; 2D8H A; 1OU9 A; 2HBW A; 5CQX A; 2E1H A; 1I81 A; 5GAO p; 2P0K A; 1KC8 U; 3A8O B; 3I35 A; 1UGP B; 4RG2 A; 2XG8 D; 2BE7 D; 3GPL A; 3CCR A; 2KMT A; 4C92 F; 2DET A; 2FPE A; 4E2F B; 5CR2 A; 1OX8 A; 2VWF A; 3SWN C; 1BI3 A; 2K79 A; 2NUT B; 1YHQ A; 3V8L A; 1YIJ Q; 5FU6 C; 3V7S A; 3MEW A; 1FWZ A; 2HQH A; 3EHR A; 3JCM e; 2ZGW A; 2JTE A; 4A4E A; 1UHF A; 4Q5W A; 5GMK j; 5GAN e; 1VQ5 Q; 4FT4 A; 2DD5 A; 2ATC B; 3ZL7 C; 1YJN T; 8AT1 B; 1G3Y A; 2HDA A; 1OEB A; 2DE0 X; 2D0N A; 1H64 1; 1UGS B; 5KYX A; 3M9Q A; 2QDL A; 3MP1 A; 3FDR A; 5DLQ E; 3SWN A; 4M78 D; 2DVE A; 3VUB A; 4A4K A; 2QI2 A; 1K8A U; 2CZ1 B; 1WHK A; 2BTT A; 4OMF B; 1RL2 A; 1JXM A; 2DL5 A; 5CKB A; 5IH2 A; 4C92 B; 3BW1 A; 2RHZ A; 5DY9 A; 4YTL A; 3CBO A; 2DXB A; 3CMA A; 1LJO A; 1MGQ A; 3A8G B; 2HL5 C; 1IB8 A; 1Q86 U; 1AT1 B; 2O9S A; 4FYY B; 2LMJ A; 1M30 A; 1HJD A; 4EDU A; 2QQB A; 2QTV A; 4IIO A; 2A7Y A; 1VQK T; 2COZ A; 1Q7Y R; 4XK8 E; 2OX7 A; 4E7H A; 2QEX A; 4Z88 A; 3SHW A; 4M77 E; 4LDU A; 5GAM d; 2O9V A; 4PJO D; 4AG1 C; 5GMK l; 1TH7 A; 2D6F A; 2BKD N; 2DM1 A; 3ME9 A; 5FWB A; 3E1S A; 4PJM A; 5GAO n; 4JRQ A; 1VQ4 T; 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3LGL A; 1N8R U; 2DZC A; 1C6V X; 2A08 A; 3RKY A; 5GAN 5; 3QPH A; 2OI3 A; 3I56 Q; 2RF0 A; 1VQO T; 1UG1 A; 2OTL Q; 4NOY A; 3MP8 A; 2JTF A; 4OF1 A; 3CC4 T; 1VQL A; 3EFO A; 1T0J A; 1YWP A; 2LT1 A; 2YT6 A; 1FMV A; 3G4S Q; 1IHW A; 2DJQ A; 5CCA A; 3QUI A; 4XTV A; 2HAX A; 2QAZ A; 3M59 A; 4MZT A; 2LX7 A; 2LX9 A; 1VQ8 T; 2IPO B; 5IHN A; 5HK3 A; 1M3B A; 2AZV A; 2ED0 A; 3BFM A; 1JXO A; 3OA6 A; 2D0Q B; 1KC8 R; 3H6Z A; 4HKE A; 2KRO A; 1OI1 A; 4J9G A; 4LNP A; 3V8K A; 3H41 A; 3VS7 A; 2CH4 W; 4X34 A; 1EFN A; 3P8B B; 4RTU A; 2JXB A; 2KRN A; 2DXC A; 1EX4 A; 1ZX6 A; 1BIA A; 2LVM A; 1WHM A; 4C92 E; 2JS2 A; 3G1J A; 4J8O A; 3VYH B; 4BI8 B; 1RAH B; 2PUK B; 2EQJ A; 2JMA A; 3VS1 A; 3CD6 A; 2HNI A; 1SF9 A; 4RCC A; 2VXF A; 3S6W A; 2A3L A; 3QDF A; 1Y96 B; 1PSE A; 2QXF A; 2D1X A; 3MP6 A; 1NYG A; 4F04 B; 2NUT A; 4JDS A; 2FL7 A; 1WHG A; 4JJN K; 1ZUU A; 4HVW A; 5CK9 A; 4XTX A; 1M1G A; 3PTA A; 3RKW A; 2E70 A; 1JJ2 A; 4PFO A; 2GQV A; 3P8H A; 3MEV A; 1K73 C; 3MEA A; 2JW4 A; 4PJL A; 3I9Q A; 4OB3 B; 2LDM A; 1RAC B; 5FLX E; 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