The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
19
|
sequence length |
95
|
structure length |
95
|
Chain Sequence |
b'PSSNGPLEGTRGKLKNKPRDRGTSPPQRAVEEFDDGEKVHLKIDPSVPNGRFHPRFDGQTGTVEGKQGDAYKVDIVDGGKEKTIIVTAAHLRRQE'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | Ribosomal protein L21 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1VQL Q; 1M1K R; 1K8A R; 1YHQ Q; 1VQ4 Q; 3CCE Q; 1VQ9 Q; 1VQ7 Q; 3OW2 P; 3CMA Q; 3I55 Q; 3CME Q; 1VQP Q; 1YIT Q; 3CCU Q; 2QA4 Q; 3CXC P; 1W2B P; 3CD6 Q; 1Q81 R; 3CCL Q; 1VQ6 Q; 2OTJ Q; 3CCJ Q; 1YJW Q; 1QVG P; 3CCS Q; 3CC7 Q; 3G4S Q; 3CCR Q; 1Q7Y R; 1QVF P; 3CCV Q; 1KQS P; 1YI2 Q; 1N8R R; 1VQ8 Q; 2OTL Q; 1Q82 R; 3CC4 Q; 3G71 Q; 3I56 Q; 1VQM Q; 1VQK Q; 1YJN Q; 3G6E Q; 1M90 R; 1VQN Q; 1YJ9 Q; 1YIJ Q; 3CCM Q; 3CCQ Q; 2QEX Q; 1KD1 R; 1VQO Q; 1JJ2 P; 1KC8 R; 1S72 Q; 1NJI R; 1Q86 R; 1K73 R; 1K9M R; 3CC2 Q; 3CPW P; 1VQ5 Q; #chains in the Genus database with same CATH topology 2LQN A; 1B34 B; 1V29 B; 2WSC E; 2CZ6 B; 1UTI A; 1X2K A; 1ZA1 B; 2KNB B; 1VQP A; 3CD6 Q; 2JTM A; 1B07 A; 3OYK A; 4KUI A; 3INZ A; 4HVW A; 3QJ6 A; 3HP9 A; 4ELZ C; 3P8H A; 2K7A A; 1QWF A; 2F2V A; 2XKO C; 1WZO A; 3DLM A; 2KRN A; 2YUQ A; 3V8K A; 2I2L A; 2AHJ B; 4KBM B; 1JJ2 A; 5GAN g; 1XOV A; 3OS5 A; 2O9V A; 2LCC A; 2KE9 A; 4OF1 A; 3FLG A; 3LWI A; 2D1X A; 3UF4 A; 2KT8 A; 2O2O A; 1AVZ C; 3CXC A; 1M3A A; 3ULR B; 3CCV T; 1VQO A; 4XTX A; 2DA9 A; 2DFU A; 3A8H B; 3L2W A; 3PT9 A; 4HCK A; 3AT1 B; 3CPF A; 4B9X A; 3M0R A; 5KYU B; 4XU1 A; 2QQ9 A; 1AOJ A; 1JQQ A; 1SSH A; 3DLL A; 4E7L A; 3M54 A; 1NYG A; 4C8Q C; 3EG1 A; 2W0Z A; 4FT2 A; 3I56 T; 2JZ2 A; 1BKB A; 2DXT A; 5GAN 3; 4JUV A; 4C8Q B; 1MUZ A; 1AWO A; 1YP5 A; 1WLP B; 2OAU A; 4DBQ A; 3M57 A; 2QA4 A; 3CCL Q; 1CKB A; 2OAW A; 1PKT A; 4C8Q E; 1QVG P; 1WYX A; 3ASK A; 3X25 B; 2D6F A; 2IPO B; 2R5M A; 3EFR A; 1H3H A; 1RI9 A; 2P4T A; 4JLG A; 5GMK e; 4LXC A; 4AT1 B; 3CCJ T; 3CCM A; 2KYB A; 2FPF A; 1B34 A; 3LW5 E; 2RK2 A; 2BZ8 A; 1N8R U; 1M2O A; 2PNI A; 4M77 D; 2CZ0 B; 2YT6 A; 4C92 F; 4CI0 C; 2E3H A; 3MP6 A; 4RTU A; 4JJN K; 3LWH A; 3H41 A; 3QSU A; 4R0K A; 1AD5 A; 2L5Q A; 3VRZ A; 1T3L A; 3PE0 A; 2KBT A; 1U8R A; 3RBB B; 4KH0 B; 1K8A U; 1NJI R; 3MJX A; 3OYA A; 5J26 A; 1KK7 A; 5IAY A; 2DL7 A; 1Y0M A; 5IN1 A; 2NUT A; 2BZY A; 4RUG A; 1VQP Q; 3TRE A; 1N27 A; 4PJO G; 3NGP A; 3TVT A; 1Q81 C; 2LQW A; 2BE9 B; 1GCQ A; 8AT1 B; 5GAM h; 3M4Y A; 2ZPI B; 4MZT A; 5EG2 A; 4ATO A; 1BI1 A; 1R77 A; 1KQ2 A; 5HKC A; 4ME7 A; 3SB2 A; 3VS1 A; 3OW2 P; 3H0I A; 2RNA A; 5KYU A; 2VVK A; 1YIT A; 1WQ7 A; 1ZBJ A; 1KJW A; 1PC0 A; 3HPW A; 5D7U A; 1EX4 A; 2COY A; 1ZX6 A; 4TVR A; 1Q82 C; 1PCX A; 1K73 U; 3X28 B; 1VQO Q; 2CZ1 B; 2L8D A; 4IIO A; 4J6W A; 1YI2 T; 2COW A; 4C8Q A; 2CZ7 B; 4IUT A; 2DL8 A; 1KG1 A; 1ZSZ B; 4RMO A; 2YUN A; 1LVK A; 2LT4 A; 2OI3 A; 2RF0 A; 1OPL A; 3C4S A; 3DKM A; 3MKD A; 1NYF A; 3DB3 A; 5CKB A; 3PTA A; 1D09 B; 1Z9Q A; 1BCM A; 2LCS A; 1IRX A; 1PWT A; 2JMA A; 3E19 A; 5HK3 A; 1YIJ Q; 4M75 F; 1IGQ A; 3QDR B; 5ECA A; 5J39 A; 4ZTF A; 3M4G A; 3NPF A; 3CQT A; 1K0X A; 2QK0 A; 2K3B A; 1PNJ A; 2V8I A; 2DXC A; 2ZAE A; 5LJ5 g; 2QA4 Q; 2F1L A; 2RHZ A; 3OS1 A; 4JDS A; 3I55 T; 3CCU T; 2RB6 A; 1OX8 A; 2M0O A; 4IIM A; 2OTL A; 1Q86 U; 2EYQ A; 2EVR A; 3CCM Q; 3MET A; 1H8K A; 4OMP A; 5CO7 A; 2D0N A; 2LJ0 A; 3F70 A; 1KQS A; 1I5L A; 4JZ4 A; 4EMK A; 2CP2 A; 1M1G A; 3SFM A; 2F69 A; 2HBP A; 3PVL A; 3TEE A; 1U1S A; 1ZQ1 A; 1Y71 A; 2DXU A; 4A53 A; 5I11 A; 2E10 A; 5CKD A; 1N6A A; 1MGQ A; 1FMK A; 3OYY A; 3L2Z A; 1E6G A; 3QPH A; 1IGU A; 2Z0W A; 8ATC B; 2VXE A; 1LCK A; 1MV3 A; 1VQK T; 3RKW A; 4CC3 A; 1SRL A; 5LJ3 g; 2KXD A; 2J6K A; 4E7K A; 3L2R A; 3JB9 D; 2HQE A; 3OB9 A; 3QJY A; 3M56 A; 3JCM X; 1ACM B; 1NBE B; 2CDT A; 2QAS A; 2J7I A; 4D8K A; 2OTJ T; 1VQN A; 1QCN A; 3I35 A; 1U06 A; 4JRP A; 2HQH A; 3EG0 A; 2L2P A; 2XDP A; 1IHW A; 2LVM A; 3HTR A; 1G2B A; 1GBR A; 5GMK l; 3H6Z A; 3X26 B; 1YIT Q; 4QQD A; 4AG2 C; 1OPK A; 2G6F X; 1HD3 A; 5FLX E; 2V8K A; 1UHC A; 2H3E B; 6AT1 B; 1QVF S; 2A3L A; 4DEX A; 2HBW A; 1U5S A; 2VXF A; 3CC7 T; 4JLI A; 2QDL A; 3OYM A; 4XTW A; 3H8Z A; 1UGP B; 2CGH A; 2AKL A; 3ZL7 C; 3EHQ A; 4QQ6 A; 3CXC P; 3C95 A; 1UGR B; 3FRN A; 2MIO A; 1YJW A; 4DBH A; 5CK9 A; 4M78 C; 4PJO B; 5GMK m; 4MML A; 2Y4X A; 2YRV A; 2F2X A; 3M0P A; 3G6E T; 4PJO E; 3LH0 A; 1R8O B; 4J9E A; 5FWB A; 1M4Z A; 2RA2 A; 3OYH A; 1QQJ A; 3VYG A; 1XQH A; 4FU6 A; 2HMA A; 4EMH A; 3JCM h; 1PRM C; 2OTL Q; 2E70 A; 2RPN A; 4C0D C; 4OB2 B; 3QUI A; 3O5Z A; 1M90 C; 2QEX A; 1M9S A; 1AHJ B; 2D8H A; 4C0D B; 1P92 A; 2O31 A; 4C5H A; 1T3S A; 5LJ3 j; 2DEQ A; 3FJP A; 5GAO m; 1YBY A; 2XID A; 2HKN A; 3OYC A; 3G4S A; 4J83 A; 5GAM f; 3J80 E; 2DPP B; 2ZCF B; 3SD4 A; 1LOJ A; 2FYK A; 3TSW A; 3E9F A; 2CP5 A; 3MEU A; 2DZ9 A; 1X2Q A; 1D1B A; 2CUB A; 1WJQ A; 3G71 T; 1YJ9 T; 2C0I A; 3PMI A; 1K9M C; 1I0C A; 2E41 A; 3E9G A; 1VQL A; 2WSE E; 3OBY A; 1Q7Y U; 1VQ7 A; 2CT3 A; 1ZSG A; 3SWN B; 1VQ5 T; 2HNI A; 4PFO A; 3BFM A; 3CCE T; 4DOW A; 2GQI A; 1VQ4 T; 3CME T; 3UA7 A; 1SHG A; 1VQN Q; 2A37 A; 9ATC B; 1U3O A; 2DE0 X; 2ATC B; 3M0S A; 1AWW A; 2KRO A; 1X43 A; 3Q1J A; 3RDV A; 5DLQ E; 2XK0 A; 4C0Z A; 3CBM A; 2J05 A; 1QKW A; 2MWP A; 4M7D D; 2AT1 B; 1QKX A; 2EKH A; 3EFO A; 2EQM A; 4JJD A; 2F5T X; 4C5E A; 3GOX A; 2MMP A; 1AZE A; 4J8O A; 3RMS A; 3JB9 J; 4KGZ B; 1VQM A; 3CCR T; 4M78 A; 4C8Q G; 4BI4 A; 1RLP C; 4OGC A; 3VU3 C; 1IB8 A; 1UJY A; 2ZZD A; 3EG9 B; 1S72 T; 2ZPG B; 4A4G A; 2VB6 A; 1ZHI A; 1XJW B; 3VS2 A; 4RTW A; 2ZPB B; 1YJW Q; 4FYV B; 1N9R A; 3CCS A; 3JCM e; 1RUW A; 5IXB A; 4LD9 K; 3CBP A; 3GIB A; 4C92 C; 2K5F A; 5DLO A; 2R5A A; 4C92 B; 1M3C A; 3VJP A; 3A8O B; 4HKE A; 4X1V A; 4XTU A; 2K57 A; 2VGM A; 1Q81 R; 4C92 E; 1W2B S; 4ANJ A; 4J9H A; 4PKC C; 2RQR A; 2VWF A; 4OMO A; 3H0F A; 3VUB A; 3EGX A; 2FZG B; 3LGL A; 2DTI A; 2QEX Q; 2HQX A; 1NZ9 A; 1W4S A; 1PM3 A; 4P5N A; 2YUO A; 4FCY A; 1GL5 A; 1MV0 B; 4C0F A; 5GAN h; 3JB9 F; 1JBM A; 2L0A A; 2HEQ A; 1QLY A; 2YLB A; 2ZPH B; 5A0L A; 1RL2 A; 4CC7 A; 3OYG A; 2DET A; 1WDX A; 3A5Z B; 3G4S Q; 3CCL A; 5GAO q; 2XG8 D; 2DVE A; 1BIB A; 1KQ1 A; 3OSS C; 4X9D A; 2MCN A; 1UEC A; 2KQW A; 4OMN A; 1Q82 R; 2RN8 A; 1FMV A; 2XI9 A; 2VKN A; 4J7I A; 4DBR A; 4O6J A; 1VQL Q; 4MZM A; 1HK9 A; 2MWO A; 5KYN A; 1VQ7 Q; 4AFS C; 2MK5 A; 4M78 F; 3JCM J; 1QP3 A; 3EH1 A; 2CT4 A; 3JCM V; 3L42 A; 1OOT A; 1Y57 A; 2FL7 A; 1JXO A; 1UFF A; 4BDZ A; 1MND A; 5GMK h; 3GPL A; 2X4Y A; 2CYZ B; 1NM7 A; 3EG9 A; 4M75 C; 2PUO B; 1K8A C; 1BCO A; 1TXQ A; 3DB4 A; 4F7U E; 3UAT A; 4M75 B; 4J9F A; 4JS4 A; 2EJ9 A; 2HL5 C; 1VQM Q; 2V1R A; 4M75 E; 1YCS B; 2GFA A; 4CRI A; 2RI2 A; 2W10 A; 3MHX A; 4C92 A; 3CC4 T; 4CC2 A; 4GLM A; 1YHQ A; 2PZ1 A; 1UGQ B; 2KRM A; 2NUT B; 3BW1 A; 1GCQ C; 2DM1 A; 2CSI A; 3CCS Q; 3CD6 T; 2CRE A; 4RCB A; 5L23 A; 4XTZ A; 2O4X B; 1NEB A; 2M1H A; 1BI3 A; 1PKS A; 2HSE B; 4IUP A; 1GRI A; 2IIM A; 3CC2 A; 1K73 C; 3OYE A; 4KT0 E; 5GAN e; 2KK4 A; 4KUD K; 3M9Q A; 1BB9 A; 4LN2 A; 4XU2 A; 1UEB A; 2QG9 B; 2EKO A; 2JT4 A; 4C8Q D; 4B9W A; 3ME9 A; 2DIG A; 4X9C A; 3IQL A; 4LDW A; 5KE2 A; 3OYL A; 1YIJ A; 4ESR A; 2A36 A; 1WHL A; 2NLU A; 1OZ3 A; 3OY9 A; 1D1A A; 2XD0 A; 3S6W A; 1M2V B; 1MMD A; 1QCO A; 1M1K C; 3NFC A; 4OP0 A; 2JVV A; 2L89 A; 1CSK A; 1I8F A; 1PSF A; 3CCJ Q; 2DK3 A; 1EZZ B; 3GBQ A; 1I5O B; 2CH4 W; 2L3P A; 4BE2 A; 2EBP A; 3L2Q A; 2LNV A; 4F7U A; 3JCM W; 5J3B A; 4Z8A A; 3WVD B; 1Q86 C; 2DJZ A; 4FIB A; 3URG A; 3BY7 A; 3H0H A; 1VQ9 A; 2XU8 A; 1UB4 A; 2E64 A; 4M75 A; 3EGD B; 4PFZ A; 1A0N B; 1H64 1; 1Y7X A; 3NHN A; 2KVQ G; 5GAO p; 4RTT A; 2PTK A; 1SPK A; 3FIF A; 2FZC B; 4M7A D; 1AZG B; 4V2S A; 1M1F A; 1HSQ A; 4EMK C; 1QVF A; 2E65 A; 3P8B B; 2EYW A; 2YWW A; 4XU0 A; 1FWZ A; 2HAX A; 4IUV A; 5LJ5 h; 4EMK B; 2KY9 A; 4JRI A; 2FZK B; 1WXU A; 2RD1 A; 2EJG A; 2V26 A; 4OGE A; 1LPL A; 1W1F A; 3TQ7 P; 4M78 G; 1M90 R; 2YUP A; 1UGS B; 2O4X A; 1EIF A; 2LT1 A; 4E7I A; 1G3T A; 4BI3 A; 3TCJ A; 1YHQ Q; 1M3B A; 3OYI A; 1H3Z A; 2HD0 A; 3RKX A; 4PNO A; 1VQP T; 2KI7 A; 2LJ3 A; 5C0M A; 2KDS A; 1WJS A; 1YI2 Q; 4EIK A; 2OJ2 A; 2ABL A; 3QZ5 B; 4F04 B; 1N9S A; 3CCQ A; 2RJC A; 1RAB B; 1BBZ A; 4L59 A; 3VS7 A; 2ENM A; 1M2V A; 3M0T A; 1TH7 A; 2HSP A; 5LJ3 h; 4ZTJ A; 1K9M R; 3CC2 Q; 4RTV A; 3OYJ A; 2AK5 A; 5GAN f; 1AT1 B; 3L2V A; 3PVQ A; 5GJW B; 3HHT B; 1OU8 A; 1TOV A; 4F7U F; 3RNJ A; 1OU9 A; 2PVG B; 5GAO r; 3I5S A; 2HDA A; 1M1K U; 2A0F B; 2DYI A; 2QQB A; 2SRC A; 2JM8 A; 1VQO T; 1PHT A; 4BB7 A; 3PIO A; 2DTH A; 1BU1 A; 3I55 Q; 3RER A; 3EGD A; 4DBF A; 2K3X A; 4K11 A; 1YWP A; 2E4H A; 4XTY A; 3QWY A; 1YJN A; 3I5R A; 1UUE A; 4N0A C; 2RJE A; 3M0Q A; 5FRO A; 4II1 A; 1XNI A; 1PD1 A; 1GXI E; 2EFI A; 4FSX A; 1VQ9 Q; 5D6W A; 2CP6 A; 1UDL A; 5DY9 A; 5LJ5 e; 1YNZ A; 3A8L B; 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4ZN1 A; 4CC4 B; 2M0Y A; 4M7A F; 5GAM j; 1YJN Q; 4F7U G; 5A2Q E; 5FU7 C; 4FSS A; 2JTF A; 2E5K A; 3LYI A; 4Y28 E; 3FC3 A; 2DRM A; 4J9C A; 2RMO A; 2QGF B; 5FU7 B; 1ZUU A; 4NS5 A; 3PIP A; 4M75 G; 3SDZ A; 3P8D A; 2PU9 B; 1VQ6 Q; 1XTD A; 2DXB A; 3MPU B; 2JXB A; 1HJD A; 4MZP A; 1VQ8 A; 2BZX A; 4EMG A; 3VS5 A; 4QQG A; 4E2F B; 5KYW A; 3EGX B; 2OTL T; 1G3W A; 2C0T A; 1K73 R; 2JW4 A; 2PUK B; 1VQ5 Q; 3S3M A; 3QII A; 3JAM E; 1PD0 A; 1QMC A; 2CUD A; 2MI6 A; 1VQ4 Q; 5GAN 8; 2FO0 A; 3R6O A; 1QVP A; 2WSF E; 1QVF P; 1O75 A; 3CMA T; 2C06 A; 4FYY B; 2X3W D; 3ZEH A; 2HCK A; 3EGU A; 1DJ7 B; 4HVU A; 1M1K R; 4N4I A; 3CPW S; 1M5Q 1; 2CKK A; 2EJF A; 3MEA A; 1OI1 A; 4E7S A; 2KAF A; 1RAC B; 2RHU A; 2QTV A; 4JJB A; 2LQ8 A; 1G8X A; 4XQ3 A; 4LNP A; 1ABQ A; 1FX7 A; 1KD1 U; 4Z02 A; 1NLO C; 3OSV A; 2V1Q A; 1OZ2 A; 4E7H A; 3VRY A; 2RQT A; 5M9O A; 4UC4 A; 1WHG A; 1VQN T; 1Q86 R; 4GLK A; 5IXF A; 1D0Y A; 2YHT A; 4FT4 A; 2RI5 A; 5CIU A; 5EC7 A; 5KCO A; 2AZS A; 3EFS A; 4J7F A; 4M7D C; 3V8J A; 3EHR A; 1SSF A; 3HFN A; 3THK A; 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