1QFEA

The structure of type i 3-dehydroquinate dehydratase from salmonella typhi
Total Genus 89
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
89
sequence length
252
structure length
252
Chain Sequence
MKTVTVKNLIIGEGMPKIIVSLMGRDINSVKAEALAYREATFDILEWRVDHFMDIASTQSVLTAARVIRDAMPDIPLLFTFRSAKEGGEQTITTQHYLTLNRAAIDSGLVDMIDLELFTGDADVKATVDYAHAHNVYVVMSNHDFHQTPSAEEMVSRLRKMQALGADIPKIAVMPQSKHDVLTLLTATLEMQQHYADRPVITMSMAKEGVISRLAGEVFGSAATFGAVKQASAPGQIAVNDLRSVLMILHNA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags Lyase
publication title The two types of 3-dehydroquinase have distinct structures but catalyze the same overall reaction.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (3-DEHYDROQUINATE DEHYDRATASE)
total genus 89
structure length 252
sequence length 252
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 4.2.1.10: 3-dehydroquinate dehydratase.
pdb deposition date 1999-04-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01487 DHquinase_I Type I 3-dehydroquinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1qfeA00
3T55A 4OV9A 3ABRA 3IVSA 4JDBA 1WYIA 5E93A 3S5NA 2A6NA 4EOUA 1XBVA 3IIXA 3UQNA 4RXFA 4IXHA 2NUXA 5LHEA 1ZJIA 3QF0A 2DU2A 3TMLA 1WBJA 2E6DA 1SSDA 3LHWA 4O0ZA 3W1NA 3GKAA 5AHLA 1N8FA 4JX6A 4DXVA 3O1NA 3LXAA 3G1FA 3IVTA 3WFAA 1OFOA 4XTDA 4N02A 5CZSA 1GG1A 1O5KA 1FCBA 1QAPA 3KVMA 5D2XA 3TU9A 1FUYA 4LV4A 1YXYA 3W9ZA 3LHUA 4JXCA 1XBZA 1KM3A 3M1ZA 1YADA 3NQDA 3GYEA 4MIMA 2VOMA 2ZRVA 1OF8A 1R2RA 2R8WA 3A24A 3I65A 3QQ1A 3UPWA 2NLIA 1TIMA 3G0UA 1K8YA 4LC6A 5AHIA 3W2NA 3GNNA 3QC3A 4LU0A 2A2IA 2GPTA 3Q94A 2A7RA 1KW1A 1EX5A 4Z0JA 1LOLA 3EWXA 3FKRA 1KLYA 2TRSA 1KM1A 3W1PA 3IIVA 4N9DA 4NUWA 3IIZA 3N19B 4DEFA 3FFSA 4ORMA 1ME9A 1JUEA 4NNBA 2OX1A 1KM0A 1OX4A 3UZJA 4JTEA 1T99A 4FNRA 1J5TA 2C0AA 3NPXA 1HFBA 5C54A 5I3IA 3FJ6A 2J9ZA 1MXSA 1EUNA 1NF0A 2FJKA 5AHEA 1VJIA 1ICQA 3LOTA 4UTUA 3S1UA 2ZZ6A 4Q4KA 4TMCA 3P80A 2OCZA 3O07A 2EPHA 3JS3A 4QAIA 3W2UA 1SO6A 1I45A 1LCOA 1E51A 4ADUA 3LI1A 1JCMP 2YDAA 5H91A 3W84A 4XUGA 3C3NA 2Z0IA 3KRUA 1D3GA 1FDYA 3KVJA 1XUUA 2CLOA 2BX7A 3G22A 1Q45A 5U4NA 3H54A 4LVDA 3NM3A 3L21A 3OVPA 1DHPA 1ZALA 5LNVA 4FIQA 4UTWC 2RDUA 1S5VA 1DVJA 4WOZA 2HSAA 3FLUA 4R53A 3O15A 1SZFA 2H90A 3MP4A 2P10A 3QEZA 1JCNA 5G2HA 5HUPA 4GUHA 2WKJA 3QYQA 3BW4A 5K3VA 1DJNA 4ZQMA 1TRDA 5D04C 5LGXA 1TPC1 2YZRA 2PURA 3BW3A 2DP3A 4NX0A 4MLJA 1ML1A 4UTKA 1UCWA 3TSMA 3BGGA 1T8XA 1OVDA 2YSWA 1QPOA 3EB2A 2XFWA 5L6UA 3DU0A 1HG3A 1K02A 4JTUA 1PL9A 4X22A 3BV4A 2ALDA 4YCPA 1KTBA 3W2KA 2QCDA 3TFXA 5HWNA 4UTIA 2C13A 4I7VA 3L67A 1S5WA 5U7SA 3W7OA 2ABAA 1H60A 4GBUA 4LUIA 5LZLA 4NZFA 2WV8A 4O8RA 1VYSX 1Q3NA 3L68A 1LDCA 2ZTKA 1SO4A 1P1XA 3B04A 1TREA 4GC4A 1H1YA 4UR8A 2I1OA 3MP3A 3W71A 4PL1A 4ZQOA 2VEMA 4S1FA 1QWGA 3E0IA 2PE4A 1OFRA 1I2NA 3TH6A 5IBXC 4A2SA 5LNUA 3DXIA 3FYPA 3UYCA 3SECA 5LNWA 1KFJA 3LI0A 3T40A 3OBKA 1TO3A 4RV8A 5CSSA 3A23A 3WK1A 3CT7A 2ZA1A 3EWWA 1VLIA 1NEYA 5I3HA 3UWQA 3MP5A 4C1LA 1FWWA 3QH2A 3QPYA 4XKYA 4WX2A 4AAJA 5C55A 3GAKA 1QPQA 3SSJA 1EA0A 3TKFA 1H63A 3LCWA 2H6RA 5AYZA 1RZMA 3QMRA 3WJSA 3INPA 3NEVA 2XN2A 1SFLA 2Q8ZA 3TA6A 2J9YA 2NWSA 3O6YX 4MY8A 3VE9A 1KBJA 4RXGA 3DH7A 4AHPA 2Y7DA 3CB8A 1WXJA 2AAMA 1SZGA 3N9SA 4MOZA 5G1YA 2J24A 1SU5A 1TTPA 3OIXA 3KRZA 3RMJA 1DJQA 4IMCA 3UWUA 1XM3A 3KRSA 1IGSA 4EIVA 4RJEA 4FIRA 2ATSA 3HOJA 2C19A 2JGQA 1FXQA 1THFD 4QIUA 4FB7A 1FWTA 3DKLA 3PUDA 3I68A 3F4WA 1SQ7A 1P0KA 2BWGA 1J2WA 2BLEA 3CIXA 3W7DA 2OT1A 4O14A 4RZ5A 2BXVA 4MKNA 4UTTA 4CLMA 2QCNA 2QDGA 1EB3A 1MO0A 1KV8A 2QUUA 1HUVA 4PCFA 3STFA 3UNDA 1B4EA 3W72A 5DY3A 4N2YA 1GPWA 2NX9A 4OU1A 1F6PA 1TTJA 4HPXA 5CZTA 4IX0A 1TMHA 3GDTA 5CPLA 4YMZA 3ZFHA 1KV5A 4WQ6A 3OVRA 5CZJA 5DLCA 1XI3A 4O13A 1JRBA 3GR8A 1RPXA 2Q3RA 5LNSA 3FEMA 4MZYA 3BO9A 4QSHA 2H8ZA 3W1XA 5LGZA 2YW3A 4MFDA 2EF9A 2Y62A 3C2RA 4WY0B 1PE1A 4PC8A 1KTCA 2CZDA 4TMBA 5CPNA 1W5OA 3PC0A 3B0PA 3TMQA 1GVOA 4O52A 2Y63A 2DZPA 4K8EA 4MVAA 3M41A 4AH7A 2ZRYA 3GDLA 3I6RA 1TPFA 5D33A 2E6AA 3UWZA 5D02A 4NZJA 1ONRA 1H61A 2CWNA 1YTKA 2QUTA 3MHFA 2Z6IA 3C52A 4OWGA 2VELA 4MPQA 3Q2DA 1GTEA 3V1PA 5FF4A 1L6YA 1KTNA 4Z1BA 2V5LA 3LRLA 1OABA 3LHVA 3PULA 4HT3A 3SY5A 1K7XA 3LRKA 3W87A 1OFAA 4JTFA 3MUXA 4GUIA 4AB4A 3ZR4A 3C6CA 1U83A 2RHGA 2YX0A 2ZZ3A 1A5CA 2VEPA 1ME8A 2OZ0A 1F05A 3HGOA 5EBUA 4AMAA 4JTHA 1L2UA 3PM6A 4O53A 3NQFA 3ELFA 1CW2A 5HQEA 3S0CA 4FO4A 1LP6A 5EYWA 4M6PA 4CQ9A 1B4KA 2RFGA 3L65A 1H7OA 3PR2A 4TIMA 5LNRA 1FWSA 2H3BA 4DO6A 1JJKA 1HO4A 2OJPA 4JEQA 2B0MA 2YYTA 1A50A 4S2BA 1HO1A 5LHFA 4LVAA 2BTMA 4RR4A 3O06A 3W85A 2GVLA 5D03A 2DZTA 3GK0A 3TK7A 4LS2A 2ZRUA 3QM3A 3QQ0A 3LHZA 2R91A 2PC4A 1VRDA 1L6WA 2HMCA 2JK2A 4UFMA 1VYRA 1MEIA 4ORIA 3LXBA 3LDVA 3HPZA 3SI9A 1Y0EA 4A29A 4RCXA 1SW7A 4K38A 2J27A 2A0NA 2A6LA 4Z1CA 1YYAA 4PH6A 7TIMA 2C15A 4FEZA 3UY8A 2V81A 4O4VA 1EPXA 4E0CA 2GQAA 4JTIA 1GJPA 3L2IA 3HG5A 2ZRZA 2HS8A 5DN1A 1RD5A 1GWJA 4GUJA 3W7CA 5A5WA 1H7RA 4FNTA 5D05A 2NUWA 4HNTA 1AW5A 2ZYFA 2QUVA 3NL3A 4IMFA 2VXNA 5FF0A 3DGRA 3R8RA 4C1KA 3CM4A 3WK0A 1QDSA 1DKWA 2FQIA 1WQ5A 2Y89A 3HG4A 3HPXA 3P8IA 1NAL1 1AW1A 3F4NA 4K7VA 2IQTA 5CPMA 3GXPA 3NQVA 2V8ZA 3TR2A 4HIBA 4QJ1A 1S5TA 2WNNA 3NNTA 4LC8A 1D3HA 3LCIA 1Q6LA 4BR1A 3N73A 3OEXA 5J5DA 4MYAA 5K4ZA 4ONVA 2WSQA 3V75A 3TQ0A 4I9AA 1KM2A 4JTGA 1SO5A 1P4CA 4OGZA 3B8DA 3G0SA 4JDYA 1FDJA 3IIOA 3GKFA 3UXAA 2NXGA 1W3IA 1AK5A 2C6QA 5H2ZA 1JQXA 4G1KA 1TRIA 3W1RA 3TAOA 3HJZA 3WJWA 3WJZA 4H3DA 4GRSA 5BOOA 1YPFA 1GQNA 5AHNA 3LCLA 4HSNA 5HINA 5HR7A 5AHFA 3PG9A 1FCVA 5AC7A 5HUOA 4BI5A 4H4IA 3BARA 1PS9A 4IX2A 3EWBX 2ATMA 3W7HA 1I8JA 2CLIA 2QR6A 4A3UA 2CLMA 3C56A 3E96A 4WXYA 2AGKA 1ME7A 4O50A 4DBDA 1V5XA 5KMYA 4UFHA 4LOCA 3FOKA 4PFMA 2QCLA 3NR0A 3TW6A 1JUBA 1K7FA 2W79A 1EP1A 5D2YA 5F2MA 2CZ5A 3M5VA 2D73A 5DBUA 1XUZA 2NV2A 1KFCA 4OBTA 3GXNA 2QCHA 4QQ3A 4NX5A 1TCDA 3PB2A 3PAJA 5I3KA 4PL2A 1EWEA 4GWEA 5AOUA 5FEPA 1MEWA 4R7JA 3DENA 3LCGA 3W83A 2E5CA 4YXGA 4IUOA 1XFBA 4EWND 5KINA 1OX6A 1R2SA 3DHFA 2WNQA 1VQTA 1G4PA 3NL5A 2DZSA 1ZAJA 2A4AA 3NQ2A 4R34A 3TJLA 5CPOA 4A2RA 4K8HA 2YPIA 4A22A 1G69A 5EMUA 3M47A 3BLEA 1YDOA 2ZTJA 1R47A 1VHCA 1OF6A 4GJ1A 1UJPA 3PUOA 3M16A 4KFPA 4W9TA 1BEUA 3W88A 1LBMA 3P67A 2WSRA 3LHYA 4JTSA 2CLKA 4MY9A 1QNVA 1F6KA 4Y96A 2CLHA 3SIZA 1PCWA 1GG0A 3JR2A 1T96A 4JYDA 3R13A 1BWLA 5G5IA 1LM1A 4CCDA 3P84A 5AYYA 3IV3A 3BGJA 3LCFA 1GVRA 2E6YA 2FTPA 1KA9F 3DFTA 3FS2A 2DORA 1VZWA 3MBFA 5AC6A 1WAUA 1JRCA 4R33A 3I7SA 3EKLA 4MY1A 2YR1A 3HO8A 1BWKA 5CG7A 1TPWA 1LLZA 3IGUA 3N34A 1O4UA 4CCCA 1XDMA 2NV1A 3ABQA 5EA9A 3EX6A 4UMBA 3D0CA 1I4NA 3L0NA 3C2EA 3PVFA 3UY7A 4IXXA 3LX9A 3LLDA 4NXKA 3OA3A 1OK4A 3M5ZA 4LTSA 1W56A 5K9DA 3TQVA 2TSYA 3CHVA 4UXDA 3RK8A 2ZA3A 4JYEA 3W70A 5D37A 3W7LA 1NF7A 1QOPA 4QITA 3AJXA 1TPUA 1UASA 5FF7A 3GLCA 5FEXA 4O57A 1VS1A 3O05A 4GXMA 1ICSA 2H8XA 4NJIA 1W5MA 4QISA 5BNKA 3FJLA 3O6CA 4EF9A 2DZXA 1OFBA 5D2TA 3NQAA 3OHIA 3W7RA 2BZNA 3P8JA 1C29A 4O1BA 2V2CA 3R89A 4WY0F 6TIMA 1G67A 2G96A 3KFTA 4RKAA 4N9CA 4UC5A 4O18A 1KM5A 4TR9A 5EY5A 3ATYA 5TQLA 3USBA 3G3MA 2QAPA 2B4GA 4CNOA 1EUAA 1RQEA 3DHDA 3T44A 4JD4A 3L0KA 1Q6RA 3W2JA 1O60A 4NVTA 2NWRA 3LM7A 4BK9A 2QCEA 2NX3A 1WBHA 4N4PA 1M5WA 3LXCA 3LGEA 4CCEA 1FCQA 1W5NA 1W5QA 3Q58A 4ZQPA 2B7OA 3TSDA 1K8ZA 1SW0A 2Y85A 4Y8FA 1OX4B 4UTHA 5DCEA 2E09A 3IIPA 1FWNA 3C4UA 3NDOA 4HNNA 3S1WA 2P0OA 2NXHA 1SW3A 5C5YA 5HMSA 4MYXA 2F7FA 3MW7A 4TO8A 2C14A 4KKXA 5HJLA 4NQ1A 1OYAA 2E1DA 5D2WA 1EP3A 1KFBA 4N4QA 4NT0A 1FDZA 2V0TA 4FNUA 5MHBA 4UNLA 1ZCOA 1W54A 1G7VA 3P82A 4UTWA 3P7YA 3CQ0A 3PBVA 4LW7A 1OFQA 1ADOA 4TU1A 1ZAHA 3PBWA 1YXDA 3F1QA 3IEBA 3NQEA 4JTTA 1AL8A 3NQ7A 5DBTA 2Q3OA 1KM4A 2QAFA 4AWTA 4I7WA 2ABBA 4WJEA 1DOSA 3NA8A 1GTHA 2X16A 1RQBA 4BI6A 1I2RA 4XWUA 3DFOA 3G1DA 4JY8A 3S5YA 1S3HA 2E68A 3LBCA 1Z41A 4X3ZA 1A5SA 4DO4A 4RZ4A 4M6VA 3TROA 1OHLA 1TPVA 3QZEA 3T7VA 3DI0A 3O16A 2CW6A 3CTLA 1TJRA 3U2OA 1VCVA 1KM6A 1OK6A 3GB6A 1OYCA 1RV8A 3VCRA 3AO0A 1LRQA 4IPJA 1K03A 4HNUA 1ALDA 5AFDA 4FNPA 2C16A 2VFFA 3N9RA 1XL9A 1MEHA 1OG0A 1WOBA 1IXOA 5D32A 3P61A 1SUXA 2RDWA 2ZZ2A 4WXZA 2GQ8A 4LWWA 2QCDB 2QJGA 3GXTA 3VNDA 1GZGA 4FX6M 4HKPA 3IRDA 1KFLA 1JCYA 3HQ1A 5IBXA 2A1YA 1VCFA 4JTJA 2VFGA 2CZFA 4DF1A 3A22A 5C6MA 5EPDA 2VEIA 3RF9A 3G8EA 2P1FA 1VR6A 1AG1O 4K39A 4KFOA 3W75A 3W22A 2GVJA 5K9CA 5HNRA 1QPRA 1JCXA 3DZ1A 4UUIA 2VEKA 3H55A 3S5ZA 4LRSA 1JCJA 3B4UA 3G1HA 4JS3A 4Z08A 1PV8A 3N2MA 4MUZA 3CC1A 3KAOA 3JRKA 4UMAA 2V9DA 4GUFA 3PUEA 4UFKA 5G2WA 1C8VA 4PA8A 3W86A 4YCOA 4ALDA 3DFSA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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