The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
58
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
MHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEAYGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAQGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
HEMOGLOBIN
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| publication title |
Modulation of ligand binding in engineered human hemoglobin distal pocket.
pubmed doi rcsb |
| source organism |
Homo sapiens
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| total genus |
58
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1999-06-07 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1MWC A; 1HCO B; 2ZS0 D; 1ECD A; 1VXB A; 5KER B; 3D17 B; 1C7B A; 1HBB B; 3S66 B; 3WCU C; 1Y4P A; 3PIA A; 1DXT B; 2GTL D; 2BLI A; 2ZS1 A; 4HSW A; 1S5X A; 1GZX A; 1RSE A; 1G0A A; 2KSC A; 3O89 A; 1UFP A; 1O16 A; 3EOK B; 3HEN A; 3WCP B; 1FCS A; 5CHQ A; 3UH5 A; 1HDS A; 1Y01 B; 2VYW A; 1ABY B; 1Y8I B; 1YZI B; 3IC0 B; 1NQP B; 3G4R A; 1V4X A; 1J3Y B; 1XXT A; 1HJT A; 1LHT A; 2E2Y A; 2ZSX A; 1C7C A; 1J41 A; 2ZLW B; 1G08 B; 4JAC A; 4IRO B; 1CQX A; 2HCO A; 1HDA B; 4KN3 A; 2R4Y A; 4FWZ A; 4X0L B; 2HBF B; 1YHU D; 2OIF A; 1FDH G; 1LH1 A; 1AJ9 A; 3HYU B; 1MLN A; 1XY0 A; 1A6G A; 1YHE A; 2OH8 A; 1IWH B; 2CMM A; 4F68 A; 4F6D A; 1O1P A; 3WCU B; 1SDL B; 3PT7 A; 2O5O X; 2HHD A; 3MJP A; 5KDQ B; 3M3A A; 4AVE A; 1OUU A; 1GCV A; 1Y5F A; 2G0V A; 2ZT3 A; 1ASH A; 3D7O B; 5ILP A; 4IT8 A; 1BZ1 B; 1X9F D; 3LB3 A; 3A0G B; 3GQG A; 3UHX A; 2JHO A; 4ESA A; 1MBD A; 4AVD A; 3PI3 A; 1RTX A; 3ED9 A; 1MLS A; 2GNW A; 3ARK A; 1DLW A; 1GLI A; 2IN4 A; 3S1I A; 1MNH A; 1JL7 A; 1O1L B; 1NPF A; 1V4U A; 2DHB B; 1YEQ B; 1HAB B; 1YVQ A; 2ZS0 A; 1MTK A; 2RI4 B; 1LFV A; 2HBD B; 3UBC A; 3BJ2 B; 4M4A A; 1VXD A; 4U8U B; 1WVP A; 2GTL A; 109M A; 1CPW A; 1ITH A; 2SPL A; 5CNG A; 3UHR A; 4N8T A; 3E55 A; 1BAB B; 1Y31 B; 1L2K A; 3GK9 A; 4TYX A; 3ZJH A; 4MQK B; 2R80 A; 4MQG A; 1FN3 B; 1Y0C B; 1Y4R A; 2D60 B; 3QJE B; 1F5O A; 3LQD A; 5HLX A; 5CNB A; 1NS6 A; 1Y09 A; 1A3O B; 1SHR B; 3OK5 A; 1BZR A; 1YIH A; 4XDI A; 3QJC A; 4MU5 A; 4ODC B; 3LB4 A; 3D4X A; 1QI8 B; 4DWT A; 5EET A; 1PBX B; 2D2M B; 2BMM A; 1OFK A; 2G0R A; 1HBA A; 1YHU A; 3A59 A; 4F6F A; 1CMY A; 1O1I A; 1G9V B; 1XZ5 B; 1KR7 A; 2EKT A; 1A9W E; 3GYS B; 2XKH A; 1Y5K A; 2MGF A; 1J7S A; 3IC2 B; 3NL7 A; 2MYD A; 2SPM A; 1QSI B; 5C6E B; 1D8U A; 1H97 A; 3AQ8 A; 5HY8 A; 1YEU B; 2AA1 A; 3FS4 A; 1QPW B; 1UX8 A; 1DXU B; 3SZK A; 1X9F A; 1LH6 A; 5CN6 A; 2Z6T A; 3MJU A; 3TM9 A; 2VEB A; 1XZ4 A; 1MNJ A; 3R5I A; 4YU4 B; 5JDO E; 1BIN A; 2MGB A; 5JOM A; 1EBC A; 4ILZ A; 1MLH A; 3D1A A; 4HBI A; 1Y7G A; 1A0Z B; 4NI0 B; 1Y35 A; 1Y4G B; 2QLS A; 1MNK A; 1HGC A; 1MOD A; 1QXE A; 1Y7Z A; 2YRS A; 1U7S A; 4YU3 B; 1UVX A; 2GRZ A; 3GQR B; 1MTI A; 3FH9 B; 3WCW D; 1Y7C B; 1Y8H A; 111M A; 1J7Y B; 3TLD A; 3R0G A; 1V4W A; 1IRC A; 1H1X A; 3UHY A; 2FRJ X; 1Y0W A; 3GKT A; 2W72 A; 1NZ5 A; 1GBV A; 3RJN B; 1YMB A; 3ZJO A; 1YGD B; 3HXN A; 5D1V A; 3EDB A; 2MGJ A; 3MYM A; 2G3H A; 2BW9 M; 112M A; 1V75 B; 4MQI A; 1BZZ A; 1BBB A; 4NXA A; 2QSP A; 1MZ0 A; 1THB B; 4ROL A; 1HBH A; 2R1H B; 4NK1 A; 3QM6 A; 1HBS A; 1JZK A; 5CND A; 2PEG B; 4M4B A; 1YHR B; 1MLM A; 2FAL A; 3IXF A; 3MKB A; 1S69 A; 3DHR A; 3ZJQ A; 1K0Y B; 1SPE A; 1IBE A; 2ZSR A; 1DKE A; 2ZT1 A; 1DWR A; 1K1K B; 1HDB A; 2HZ2 A; 2ZST A; 3DHT B; 1YIE A; 3QJB B; 1HLM A; 3QQR A; 3E5O A; 2ZLU B; 1A4F A; 1A00 B; 3NG6 B; 1DLY A; 2ZFB B; 4FC3 A; 1QXD B; 4F4O B; 1N9F A; 1JWN A; 3QZZ A; 1Y5J A; 4F6G A; 1YEO A; 3OVU C; 1JY7 B; 1MYT A; 1N9I A; 1SDK B; 3MYN A; 3UHK A; 103M A; 2D5X A; 3ZJM A; 4NXC A; 1SPG A; 1GBU A; 3ARJ A; 5EYJ A; 1JEB A; 2G0S A; 2O5S X; 4O1T A; 4KMW A; 1JP9 A; 3K8B B; 2Z6N B; 1TU9 A; 4N7O B; 4HRR B; 102M A; 3WCW A; 1LH3 A; 4SDH A; 5SW7 B; 2H8F B; 4MQH B; 2AUO A; 1XZ2 B; 1CBL A; 1A6M A; 3PT8 A; 1DTM A; 2RAO B; 1RQ3 B; 3UHD A; 1AZI A; 3O7N A; 3QJD A; 1JF3 A; 3BCQ A; 2W6Y A; 2MHB B; 3UGY A; 2IG3 A; 2XYK A; 1JF4 A; 1CO8 A; 1R1Y A; 1MLK A; 3BOM B; 1FDH A; 3S66 A; 2V1H A; 1HV4 A; 5CHR A; 6HBW B; 2H8D A; 4NI1 A; 3AG0 A; 1O1N B; 5EV5 A; 3EOK A; 3WCP A; 1S56 A; 1DTI A; 1DXD A; 1YMC A; 2WTG A; 2GKN A; 2G10 A; 1YZI A; 1LJW B; 1J7W A; 2DN1 B; 2QMB B; 2O5M X; 5JDO C; 3OO4 A; 5EE4 C; 1G08 A; 3DUT A; 3ONZ B; 1UIW B; 1S6A A; 3V2V A; 1BUW B; 1S5Y A; 3UH7 A; 1W92 A; 3G53 A; 4G51 B; 4DC7 A; 1Y45 B; 1FAW B; 1XQ5 B; 5EU2 A; 4PQ6 A; 2EKU A; 3ODQ B; 1Y8W A; 1MWB A; 2WTH A; 3HEP A; 4DC8 A; 3GDJ B; 1CLS B; 3D1K B; 1DXV A; 1JZL A; 1MYI A; 1YEN A; 1IRD B; 1Y46 B; 1Y4F B; 2C0K A; 3UHZ A; 4XS0 B; 1LFL A; 1FHJ A; 4WJG 1; 1LFZ B; 4FH7 A; 1VXC A; 1XZV B; 1HHO B; 1O1J A; 2DXM B; 1MCY A; 4F69 A; 1NIH A; 1HBR B; 3M39 A; 3AT6 B; 1BZ0 B; 1O1L A; 5CN7 A; 1C7D B; 104M A; 5HAV A; 2MGD A; 1LFT B; 5E83 A; 2G0X A; 2RI4 A; 3UHV A; 1YCB A; 3WFX A; 3BJ2 A; 1UFJ A; 3G4Y A; 3GOU B; 4MXK A; 3MVC A; 5E29 A; 1Y2Z B; 2DN3 B; 4BJA A; 2HHB B; 1DXC A; 2MGG A; 2HBS B; 2FAM A; 1NZ2 A; 2O5T X; 1NWN A; 1XZ7 B; 1MKO B; 3OGB A; 4H2L A; 1YDZ B; 1Y0T B; 3UHQ A; 1S0H B; 3ZHW A; 1EBT A; 2MB5 A; 1LUE A; 1Y83 A; 2MYC A; 1BVC A; 1YOH A; 1ECO A; 1DO4 A; 1KD2 B; 1YVT A; 5CN5 A; 3S65 A; 4HHB B; 1YE2 B; 3P5Q B; 3WFT A; 1BJE A; 4ROM B; 1C40 A; 3ZOL A; 3IC2 A; 1I3E A; 2H35 B; 3SDH A; 4N7P B; 1Y0A A; 2W6W A; 4U8U C; 2LH2 A; 3WCV C; 3H57 A; 2D6C A; 3CIU A; 1HBI A; 2AUQ A; 2ZLX B; 1RQ4 B; 1MBA A; 1Y0D B; 3HF4 B; 5E6E B; 1M9P B; 5HLQ A; 3AQ6 A; 1DO1 A; 3V2Z A; 3KUN A; 3GQP A; 3PI9 B; 5ILR A; 1HGB B; 1RVW A; 1SI4 B; 3WR1 B; 2QSS B; 2D5Z A; 5AZQ A; 1HAC B; 3AT5 A; 1LH5 A; 1F63 A; 1RQA B; 1SWM A; 1NEJ B; 1CG8 A; 3BJ3 B; 2D2M C; 2AUP A; 1LTW A; 1MGN A; 1VHB A; 1VXH A; 1MWD A; 4NI0 A; 5HU6 A; 2LH6 A; 1LA6 A; 1MOH A; 4MQJ A; 3VRG B; 3WHM A; 1Y7C A; 3ZH0 A; 1J7Y A; 1IT3 A; 1CP0 A; 1J3Z B; 1YCA A; 3MOU A; 1LH7 A; 5C6Y A; 4O4T A; 1CQ2 A; 2PGH A; 1R1X A; 3WCV B; 4PQB A; 2NSR A; 1A0U A; 2EB9 A; 3SDN A; 2AV0 A; 2OLP A; 3UHN A; 1YGD A; 2V1J A; 1Y4P B; 3LR7 A; 3PIA B; 3VRF A; 1XCH A; 4VHB A; 2ZS1 B; 1V75 A; 2BWH A; 1S5X B; 1G0A B; 1YGF A; 2M6Z A; 3BJ1 A; 1MLQ A; 1DWT A; 2B7H A; 1Y85 A; 1HDS B; 1PMB A; 1YEV A; 4B3W A; 1Y22 B; 1V4X B; 1V5H A; 1JP8 A; 1XXT B; 3E4N A; 1C7C B; 1J41 B; 1Y8K A; 2MYB A; 1CBM A; 4C44 A; 1CG5 A; 1T1N A; 1DO7 A; 2HCO B; 2XKI A; 3H58 A; 1Y7D A; 2ZSQ A; 1B86 A; 4N7N A; 2R4Z A; 3DHT A; 1AJ9 B; 1XY0 B; 1CH5 A; 2OH9 A; 5HBI A; 1ABW A; 4WJG A; 2MYE A; 4MQC B; 2HBE A; 2ZLT A; 5IKS A; 2WY4 A; 2BLH A; 4F6B A; 1O1P B; 1CH2 A; 5JGG A; 2GTL C; 1Q1F A; 3UHS A; 3UHG A; 3HHB A; 2HHD B; 1RTE A; 4O2G A; 1YE0 B; 1OUU B; 3HRW A; 1GCV B; 1Y5F B; 2NRM A; 1CIO A; 5EOH A; 2MGI A; 1XYE A; 2HHE B; 3UHI A; 2EVP A; 2MYA A; 2SPO A; 3QZX A; 1J40 A; 1BZ6 A; 1DO3 A; 2V1F A; 1LFY B; 4ESA B; 2Z6N A; 4HRR A; 2VEE A; 2MBW A; 1QSH A; 5JDO D; 2O5B X; 2H8F A; 1GLI B; 1NXF A; 2G11 A; 4G1B A; 3MBA A; 3G46 A; 2VRY A; 2W6V A; 5EE4 D; 3U3E A; 2D2N D; 5AB8 A; 1UMO A; 4NK2 A; 4ZVB A; 2ZS0 B; 1YVQ B; 1NS9 A; 2MGM A; 1BIJ B; 2GRH A; 1M6C A; 1VWT B; 1X3K A; 1LFQ A; 2ZT2 A; 4M4A B; 3QM8 A; 2GTL B; 3PEL B; 1O1O A; 1WMU A; 3WCT C; 4N8T B; 1G0B B; 1GDI A; 1EWA A; 3A5A A; 3MN0 A; 2MGK A; 1X9F C; 2BK9 A; 2R80 B; 4MQG B; 3W4U B; 3TM3 A; 3UI0 A; 4L7Y B; 3LQD B; 3B75 A; 1NS6 B; 4HRT A; 1YG5 A; 1YIH B; 2HZ1 A; 3QJC B; 1O1K B; 3D4X B; 3WTG A; 4H07 A; 1HBA B; 3A59 B; 2FRI X; 1CMY B; 1O1I B; 5EYS A; 2ZSP A; 1COH A; 1BUW A; 1MNI A; 5CN9 A; 3EU1 B; 1Y45 A; 1Y4V B; 3G4W A; 1FAW A; 1J7S B; 1XQ5 A; 1A9W A; 2O5Q X; 2ZFO C; 3ASE A; 3GKV A; 3KMF C; 1MLO A; 1A01 A; 1RPS B; 3GDJ A; 3WCU D; 1GDL A; 3WCT B; 3D1K A; 1M6M A; 1Y4B A; 3G4V A; 5HY8 B; 2AA1 B; 3SZK B; 1X9F B; 1A3N A; 3MJU B; 1Y46 A; 1F65 A; 1XZ4 B; 4XS0 A; 1MYH A; 3R5I B; 3OZV A; 4MXL A; 3G4U A; 1LFZ A; 1BZP A; 2GNV A; 3OO5 B; 1VXE A; 1OBM A; 1XZU A; 2ZLV A; 3D1A B; 3UHB A; 4KJT A; 4FWX A; 4FH6 A; 1O1M A; 2D2N A; 1Y35 B; 3A2G A; 1GCW A; 2QLS B; 1HGC B; 1QXE B; 3BA2 A; 106M A; 2YRS B; 4OOD A; 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1YEQ A; 1HAB A; 1GJN A; 2HBD A; 3PT8 B; 1S61 A; 3VAU A; 3QM5 A; 4OF9 A; 3NMM B; 5MBN A; 1G09 B; 5ILM A; 4U8U A; 6HBI A; 5B85 A; 3QJD B; 3BCQ B; 3ORD A; 1R1Y B; 1BAB A; 1Y31 A; 1MDN A; 1MBS A; 1VXF A; 1HV4 B; 1GDK A; 4MQK A; 5CNF A; 1FN3 A; 1VRE A; 1Y0C A; 2H8D B; 1UC3 A; 4NI1 B; 2D60 A; 3QJE A; 3UHU A; 2LH7 A; 3VRE B; 1MYF A; 1A3O A; 1BVD A; 1V07 A; 1SHR A; 1N9H A; 4ODC A; 2DN2 B; 1B0B A; 1QI8 A; 3OZW A; 1JL6 A; 1PBX A; 2D2M A; 1J7W B; 1Y22 A; 3ZJS A; 2QU0 B; 1G9V A; 1XZ5 A; 4NS2 A; 3OO4 B; 4O4Z A; 5F0B A; 105M A; 3DUT B; 3GYS A; 1URY A; 1S5Y B; 3ECZ A; 3RJ6 A; 4GZG A; 3A5G A; 1QSI A; 5C6E A; 1JW8 A; 1MTJ A; 1Y8W B; 1CH4 A; 4MQC A; 5D5R A; 3QM9 A; 3AQ7 A; 1YEU A; 5CNC A; 1X46 A; 2ZS1 C; 1QPW A; 1DXU A; 2EVK A; 1CH1 A; 2MGC A; 3ECX A; 1DXV B; 3WCT D; 1NPG A; 1YE0 A; 2MGE A; 4YU4 A; 1YEN B; 3LB1 A; 2HHE A; 5CN8 A; 1LFL B; 1FHJ B; 3OZU A; 110M A; 1A0Z A; 1WLA A; 1MLF A; 1Y4G A; 1LFY A; 3K9Z A; 2VYY A; 4YU3 A; 1FLP A; 3GQR A; 3ZJR A; 1O1J B; 3FH9 A; 4NZI A; 1OUT B; 1NIH B; 2FRK X; 1YMA A; 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