1QNOA

The 3-d structure of a trichoderma reesei b-mannanase from glycoside hydrolase family 5
Total Genus 146
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
146
sequence length
344
structure length
344
Chain Sequence
ASSFVTISGTQFNIDGKVGYFAGTNCYWCSFLTNHADVDSTFSHISSSGLKVVRVWGFNDVNTQPSPGQIWFQKLSATGSTINTGADGLQTLDYVVQSAEQHNLKLIIPFVNNWSDYGGINAYVNAFGGNATTWYTNTAAQTQYRKYVQAVVSRYANSTAIFAWELGNEPRCNGCSTDVIVQWATSVSQYVKSLDSNHLVTLGDEGLGLSTGDGAYPYTYGEGTDFAKNVQIKSLDFGTFHLYPDSWGTNYTWGNGWIQTHAAACLAAGKPCVFEEYGAQQNPCTNEAPWQTTSLTTRGMGGDMFWQWGDTFANGAQSNSDPYTVWYNSSNWQCLVKNHVDAIN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title The Three-Dimensional Structure of a Trichoderma Reesei Beta-Mannanase from Glycoside Hydrolase Family 5.
pubmed doi rcsb
molecule keywords ENDO-1,4-B-D-MANNANASE
molecule tags Hydrolase
source organism Trichoderma reesei
total genus 146
structure length 344
sequence length 344
ec nomenclature ec 3.2.1.78: Mannan endo-1,4-beta-mannosidase.
pdb deposition date 1999-10-20

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00150 Cellulase Cellulase (glycosyl hydrolase family 5)
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1qnoA00
1QI0A 4AZCB 4B3KA 4AZ7A 4PMYA 3N12A 4W7UA 1WDQA 1V3JA 2VQTA 4ZENA 3AICA 2VOTA 2V38A 3ZSSA 3AIEA 1E15A 1PPIA 2A3HA 2WKGA 4DWSD 3MSGA 5A95A 1V3HA 2JF6A 3VGFA 3VIJA 3SCQA 1QHPA 4PYSA 1E1EA 1E56A 3CUHA 1JYWA 5CQ1A 4YN5A 2VT0A 2D0GA 2ZWYA 3B9EA 3THCA 1EH9A 4XZWA 1LJYA 5AC4A 3EDJA 3VMNA 5A6KA 2DIJA 1HX0A 4UQ9A 3DYMA 3T2OA 3WUFA 1EGZA 2OWCA 3WD3A 4CD5A 5LYRA 3VGHA 1QI2A 1NP2A 2NT0A 4JFVA 3A4XA 1BVZA 1CWYA 1WDSA 1KGUA 1G0CA 1E43A 3CIVA 4QDMA 3WQ4A 1JAEA 3AI0A 1G1YA 4D6DA 1VF8A 5E6YA 3N1AA 2G3JA 1HL9A 2D20A 2NT1A 4D6GA 2ZUSA 3WY1A 4FK9A 3I3EA 5I79A 3VIHA 3WNPA 1VFFA 2CESA 3KE0A 3VU2A 4HOZA 2CBJA 4RE2A 2WHKA 1EA9C 3WNNA 2VR5A 5D4YA 4HA1A 5IFTA 5GNXA 3EBVA 4R27A 2X0YA 1KBKA 2DT2A 4RE4A 3SCUA 1AVAA 3BAWA 3U5YA 1GQLA 2J7EA 3U7BA 1QOXA 2BY3A 4JHOA 1UR0A 2Y5EA 5ABEA 1LWHA 1OINA 4OJYA 4OKDA 5A6AA 2G3IA 2J8GA 2Z1KA 5ABGA 1HP5A 3WDQA 4IUGA 2JF7A 1MW1A 2W63A 1BG4A 3W28A 5FIPA 1HL8A 3EMCA 1GCYA 1V0KA 3VDAA 2XSAA 2ZE0A 4UNIA 1EO7A 3GXFA 4HPHA 4OOUA 2VCCA 3VGDA 1HIZA 1UD4A 2V3EA 1VRXA 1B3VA 4OBRA 2WC7A 4ZFMA 2D1ZA 8A3HA 1ODZA 1V6WA 4KWUA 4UFIA 1X6NA 3SCPA 4JFTA 1ISVA 4UZSA 1HT6A 4PN2A 4EANA 3WQVA 1OD8A 4JCLA 4M56A 3O6AA 2EPLX 3AQUA 1J9YA 3ZT7A 3MU7A 2DH2A 1TR1A 1HP4A 3WD4A 4LPCA 4PSRA 4CGTA 5A6LA 4HU0A 1FH7A 4XUYA 5CLWA 3JUGA 4AY1A 3BH4A 4W86A 1KWKA 3BC9A 3W24A 1TUXA 2VRKA 3NSMA 3WDJA 3ZR6A 3L4TA 2WAGA 3VIOA 5CPTA 1SR0A 1W9PA 2PBGA 1H09A 3K8LA 1VEMA 4CD6A 4L4OA 1NQ6A 5HOSA 1ZBCA 2ZX9A 3IANA 5JUVA 5CGTA 4MAVA 5KZ6A 4HZ7A 4S3JA 1HJXA 1EHAA 3BSHA 1M7XA 4DUWA 2OSXA 3EMQA 4J3UA 4B15A 4P8UA 3A4AA 3FAXA 3OLGA 5M3WA 2W62A 4AD4A 4KGLA 2CETA 4E2OA 4MNLA 4YHGA 3RILA 2CYGA 4Q22A 4P8WA 1WDPA 3AISA 2YBUA 2WMFA 4HMDA 4JCMA 3TTQA 4Z2HA 2VX7A 4UZUA 3AOFA 3AYRA 1NWUA 3FAWA 4DUXA 4U2ZA 2WHLA 4OBSA 3SUWA 1QI5A 1DWGM 1MXGA 1WNOA 2WYSA 5A69A 4DM2A 1H41A 1UYQA 3CPUA 1TMQA 2Y2WA 4XV0A 5BXTA 1HF6A 5CG0A 2A3AA 3W53A 4AYSA 2YBTA 4MNJA 2WWDA 3CUGA 1US3A 3NJ3A 3F5JA 1WZMA 3VO0A 2PI6A 4J3VA 4RL3A 1KB3A 4WSJA 4J27A 1J11A 4PMRA 4UOQA 5A2CA 1V3IA 3N17A 1CGVA 1JZ5A 2ZXBA 3K4DA 3WMSA 2UY5A 4PMOA 3OGRA 4Z2KA 2QLYA 3VGEA 4P8VA 1JXJA 5A8NA 4AIOA 1JDDA 4WKHA 1JYXA 4R5EA 4NRRA 4HP5A 1EQCA 1TA3B 4C7DA 1KFWA 3OZOA 1XRVA 3ZOAA 3GNPA 1DWJM 3T08A 2BHUA 2CEQA 4GINA 3IAQA 4TUFA 2ZX6A 1PBGA 1DWFM 5M03A 2FH8A 4ACZA 4DWSB 2YDRA 3CZKA 3MANA 4D1IA 5A1AA 3FN9A 1XCXA 1J0KA 2WMGA 3PZIA 2VRJA 3K8KA 5D9MA 3EMZA 3VDHA 4PMXA 2VX5A 2Y4SA 4GXPA 2CNCA 4D1JA 1XYZA 4GZEA 4U33A 1E6XM 1GOQA 4LYQA 3ZM8A 1UWUA 1OD0A 1W9VA 1G9HA 3PN8A 2PF0A 3WDRA 1BAGA 2E40A 2GK1B 5EB8A 2ZX7A 1E6ZA 1G01A 3FXYA 2XYLA 4BS0A 4P7QA 3SEPA 2WMIA 2WMHA 3WQ6A 3GBDA 1H3GA 1MXDA 2ZXAA 1XD1A 1BYAA 4U2YA 5A6MA 4E4PA 2AAAA 3WQ8A 4CU6A 1UWRA 4UQEA 5ABFB 4H8HA 3CZJA 3WQ5A 2J74A 1E9LA 1EDTA 6CGTA 3CO4A 1BPLB 2OWXA 4CCCA 4H7VA 5CGMA 3VD3A 4OUEA 1QNSA 5F7UA 3WL0A 2TAAA 1GZJA 1U30A 2D2OA 4UFLA 3CZLA 5CZKA 4AWEA 3SUTA 1HKIA 1UH4A 3OLDA 4N0RA 2QV4A 2W91A 1M53A 1JYVA 1ITCA 1GOOA 4ZE4A 3WUGA 3QHOA 5JIWA 1BHGA 1L8NA 3W82A 1QPKA 2WLZA 3BAKA 2VC9A 2VO5A 3N18A 1SYTA 4IPLA 1UKTA 3WD0A 1J0IA 3TA9A 3VPLA 1MQRA 1FHLA 2DSWA 3MO4A 4M81A 4NF7A 3G6MA 1C7TA 4AD5A 4W8BA 4FMVA 4YPJA 1H2JA 3IJ8A 1ISZA 1GQJA 3VIPA 3VUPA 4PMNA 4Q7NA 4JKMA 4BQ3A 1B1YA 1MFVA 2PWFA 1X6LA 1CXEA 3AZSA 2EEXA 2ZUTA 1CENA 2O9RA 3WIJA 1C92A 3AS3A 4BQ2A 5I3DA 3UG3A 4PMQA 4W8AA 5A94A 3CZ8A 2EO7A 2DPEA 1EHNA 1PIFA 1QNOA 3BAIA 3PZ9A 1Q6EA 4GI8A 2NW0A 1JDAA 3TTOA 2DSZA 2ZIDA 2WWCA 1DP0A 3L4ZA 3N9KA 3VMPA 1VFUA 1J0JA 4HA4A 2V3FA 1ITXA 1H5VA 3WH7A 4PTMA 1DTUA 4W93A 3SURA 3FY1A 2VR4A 3WQWA 4UQAA 2VZUA 1PEZA 3W4RA 4JL1A 5I2UA 2WVVB 1V03A 2WBGA 2YOCA 5EFDA 4UOJA 1GOMA 2VURA 1UZ1A 1O7AA 1AMYA 4D6HA 4NRSA 5BYWA 1FH8A 2OSWA 2YDSA 3MMUA 3CUFA 3WFZA 3CGTA 3MSDA 1JZ4A 4PMZA 4Z2JA 3VKKA 1EOMA 5AC5A 1OGBA 3L4XA 3PTKA 4P8XA 4P7LA 4MADA 2JFEX 1GOWA 3N15A 1UWIA 4CCEA 1F4HA 2CBUA 1A3HA 1MWOA 4JFWA 1UR2A 4AC1X 3THDA 1JZ7A 4AD0A 4HU8A 3U57A 1JIBA 4J3SA 4AISA 2WC4A 1GPFA 5D8WA 1C91A 1CEOA 3ARQA 3ECQA 2QMJA 1W1PA 3AIWA 5HNNA 3CHFA 3UG5A 4BA0A 4AZCA 2X2YA 2WCSA 2X09A 1CPUA 1WZAA 1N82A 2ZUVA 3SCTA 2UY4A 1HJWA 3U7VA 2ZUNA 3B8SA 4CD4A 2BV9A 1QNRA 3N13A 1CIUA 2QPUA 3HMCA 4TVCA 3VGBA 1CECA 2EPMX 2JE8A 1PIGA 2QMKA 1TFVA 4JZ5A 4Z2LA 2W66A 1GORA 2DSVA 1IZJA 1XSKA 1ZBVA 1O6IA 5A6BD 2BY2A 1E4NA 2EBNA 4TTUA 2J7HA 2WZIA 4GI6A 1HVXA 2WXDM 3QGVA 2YL5A 1PX3A 3OGSA 4B9ZA 3ZR5A 3CBWA 3OG2A 3AJ7A 3RM4A 1IT0A 1D3CA 3WBEA 2BFGA 3UERA 3AIRA 1GVIA 1JNDA 1Q6GA 2E9BA 4B9YA 3ARTA 4Y7EA 1JF5A 1JI1A 1CGWA 3VD5A 4MB4A 4B3LA 4AZ5A 3HN3A 3TTYA 4JL2A 3MUZ1 4PSPA 4GIAA 1GW1A 2WVSA 4MNMA 3TP4A 1V3KA 1QBBA 1FH9A 3W25A 1W32A 1HXJA 3VIFA 5CPSA 3ARVA 1BYBA 1BYDA 1NH6A 3O2LA 3W26A 3RJXA 2Z1SA 3GNOA 2X05A 4ACYA 3GTNA 1B9ZA 5I77A 2BNJA 4ZE5A 4WF7A 5DEZA 1RP9A 2J79A 3PHAA 4WJXA 1FA2A 5GNYA 2W61A 2HISA 2VX6A 3AS2A 1UQYA 2RGMA 4TXEA 2XVPA 1KQYA 2XWDA 4PTWA 1W3HA 1H0IA 3SIMA 3KL0A 1KR0A 3WD2A 3GDBA 3DC0A 5A8MA 1W1TA 3QHMA 4X0VA 1TCMA 3AHYA 3AXIA 3UESA 1TE1A 1R7AA 1CZ1A 4MDPA 3F5KA 3WNOA 1ZS2A 5AYIA 4M8UA 2WMJA 2A3BA 2E8ZA 1TG7A 2QF8A 3CZEA 3WFLA 2VVNA 1ZL1A 2UY3A 3K46A 3WNMA 1CXKA 2PBOA 1E4LA 3KZSA 1JYNA 4PMDA 4URIA 2AOSA 4FLOA 1M04A 3W27A 2DH3A 2XFRA 3MMDA 2XFFA 2WZEA 3E1F1 2J7BA 5IHSA 1ZB5A 1HKJA 2VNCA 1EXPA 5IXEA 2XGIA 2BVYA 3GXDA 3RDKA 3UCQA 1V6UA 1J0YA 3ARZA 3ZMRA 1XSIA 1B30A 3KL5A 4UTFA 1C93A 3AIUA 3ZQ9A 3W37A 2J7GA 4CVWA 3WNLA 4JAWA 4MNKA 1B2YA 3PZOA 1UD2A 4A3HA 4DUVA 3NYDA 3OA5A 2YL6A 4CD7A 1I1XA 3BLKA 1ISYA 2GDVA 3NDZA 2XVNA 2WSPA 1KGWA 1E55A 1B31A 4D6FA 4DM1A 1B3YA 3LPPA 2Y8VA 2CPUA 4OZOA 2RGLA 3BAXA 5D9NA 1CXLA 1WB0A 3GH5A 1KXHA 4EAMA 4U5IA 4V28A 4Z2IA 3FHAA 5HPCA 4MB1A 2EXOA 4H41A 3N04A 1A47A 9CGTA 1UOKA 2YJQA 3VVGA 3GXIA 2CHOA 2GUYA 1JL8A 1Q6FA 2VI0A 1GHRA 3VD4A 5E70A 4UQCA 2G8ZA 1W3LA 1GJUA 4AD2A 1KWGA 2WSKA 2VQUA 1LL6A 2BHZA 3FW6A 4WLCA 3BGAA 3N11A 5A2AA 4ATLA 4BQ5A 1WKYA 1Q6DA 1E3ZA 2W92A 3W0KA 1J18A 2PWGA 3ZT6A 1UD5A 1EIBA 4D6EA 8CGTA 2A3EA 2VUYA 3AIQA 1WZKA 2FGLA 4UFKA 3CHDA 2WKLA 1BGGA 3BLPX 4OOZA 1MVYA 4P7OA 1E72M 4OIFA 2J8FA 1GONA 1MFUA 2EPNA 4W87A 2D3NA 2UWFA 2YLLA 1QI4A 1VEOA 3F4VA 1QVBA 2OYLA 2MANA 1E73M 3BAJA 4GO9A 2F61A 3DHUA 1LWJA 1KCLA 1GOKA 1W1VA 2CXGA 3ARPA 3UR8A 2D0FA 4PUDA 4F9DA 1TA3A 5GNZA 1D2KA 4AD3A 3FNDA 3SCNA 3WN6A 4WKFA 2ZUUA 3ARSA 4X9YA 4EKJA 4M82A 4N42A 4C7FA 4KRTA 1BSIA 3EYPA 5A6BA 4DWSA 4CD8A 4MTVA 1IZKA 2D22A 2YA0A 2ZUMA 2WLYA 2JEQA 1WPCA 4W89A 3WH6A 5IHRA 1XCWA 2V5CA 1KR1A 3AHXA 1FP8A 2EQDA 3AHVA 5C8BB 4E8CA 3QHNA 2W67A 2WVUA 3DYPA 2JIEA 3SCSA 4HOXA 1HVQA 3ZJ8A 5CPQA 1KXVA 3U5UA 2XM1A 1VENA 3RM8A 1CGUA 2A3CA 2E4TA 1W3JA 1E6NA 2EPKX 4PMUA 2GK1A 3ALGA 5JBEA 7CGTA 3VIGA 1H49A 1MW3A 2E9LA 4PCSA 2ZXQA 3WDPP 1BFNA 3WUBA 4XZBA 2FGZA 4HOWA 4KGJA 4D72A 3ALFA 2EJ1A 1RPKA 3WF3A 3POHA 2XHYA 1XC6A 3BXWA 4JIEA 4UOZA 5ABFA 4JKLA 4LYPA 4GI9A 1OM0A 1W91A 4CCDA 3CZGA 3VIMA 1VEPA 5D9PA 4FF5A 4CU7A 3VDBA 5DMYA 1BG9A 1UR8A 2DT1A 5FL0A 4TX8A 1B3WA 1B90A 4LXFA 1V3LA 1L0PA 5CJ5A 2XGBA 1W9UA 2XIBA 3DHPA 4JFUA 1XH2A 1R87A 4J3WA 3AIBA 3HJEA 4J7RA 1FP9A 4PCTA 1QI3A 4TVUA 1CDGA 1OIFA 3TOPA 5BRPA 4RE3A 1LG2A 3VD7A 4J28A 4YHEA 4UQBA 1E6PA 4ZEPA 1UD3A 4E8DA 3WH5A 1G5AA 1J0ZA 1JD9A 1V6YA 5BXPA 4S3KA 2XVGA 1UQZA 2C0HA 4U5KA 2YIHA 2VCAA 5LA1A 2PWHA 1PJ9A 1J10A 1UKSA 3QOMA 1FOBA 2BS9A 4U3AA 2EPOA 3AMLA 1UKQA 2XJ7A 5I23A 2BXZA 5AYBA 2CHNA 2B31A 2V3GA 1VJSA 4U3CA 4F9JA 1FFQA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 1QI0 A;  4AZC B;  4B3K A;  4AZ7 A;  4PMY A;  3N12 A;  4W7U A;  1WDQ A;  1V3J A;  2VQT A;  4ZEN A;  3AIC A;  2VOT A;  2V38 A;  3ZSS A;  3AIE A;  1E15 A;  1PPI A;  2A3H A;  2WKG A;  4DWS D;  3MSG A;  5A95 A;  1V3H A;  2JF6 A;  3VGF A;  3VIJ A;  3SCQ A;  1QHP A;  4PYS A;  1E1E A;  1E56 A;  3CUH A;  1JYW A;  5CQ1 A;  4YN5 A;  2VT0 A;  2D0G A;  2ZWY A;  3B9E A;  3THC A;  1EH9 A;  4XZW A;  1LJY A;  5AC4 A;  3EDJ A;  3VMN A;  5A6K A;  2DIJ A;  1HX0 A;  4UQ9 A;  3DYM A;  3T2O A;  3WUF A;  1EGZ A;  2OWC A;  3WD3 A;  4CD5 A;  5LYR A;  3VGH A;  1QI2 A;  1NP2 A;  2NT0 A;  4JFV A;  3A4X A;  1BVZ A;  1CWY A;  1WDS A;  1KGU A;  1G0C A;  1E43 A;  3CIV A;  4QDM A;  3WQ4 A;  1JAE A;  3AI0 A;  1G1Y A;  4D6D A;  1VF8 A;  5E6Y A;  3N1A A;  2G3J A;  1HL9 A;  2D20 A;  2NT1 A;  4D6G A;  2ZUS A;  3WY1 A;  4FK9 A;  3I3E A;  5I79 A;  3VIH A;  3WNP A;  1VFF A;  2CES A;  3KE0 A;  3VU2 A;  4HOZ A;  2CBJ A;  4RE2 A;  2WHK A;  1EA9 C;  3WNN A;  2VR5 A;  5D4Y A;  4HA1 A;  5IFT A;  5GNX A;  3EBV A;  4R27 A;  2X0Y A;  1KBK A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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