1QQ2A

Crystal structure of a mammalian 2-cys peroxiredoxin, hbp23.
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
173
structure length
173
Chain Sequence
b'SGNAKIGHPAPSFKATAVMPDGQFKDISLSDYKGKYVVFFFYPLDFTFVCPTEIIAFSDRAEEFKKLNCQVIGASVDSHFSHLAWINTPKKQGGLGPMNIPLVSDPKRTIAQDYGVLKADEGISFRGLFIIDDKGILRQITINDLPVGRSVDEILRLVQAFQFTDKHGEVCPA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of a multifunctional 2-Cys peroxiredoxin heme-binding protein 23 kDa/proliferation-associated gene product.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN PEROXIDASE 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Oxidoreductase
total genus 51
structure length 173
sequence length 173
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 1.11.1.15: Peroxiredoxin.
pdb deposition date 1999-06-10

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00578 AhpC-TSA AhpC/TSA family
A PF10417 1-cysPrx_C C-terminal domain of 1-Cys peroxiredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1qq2A00
1J08A 2AB6A 3J7Yk 4WETA 1XVWA 4JEDA 1X5EA 4EL1A 3UEMA 1TRWA 4FYUA 1HD2A 1TKDB 1E2YA 1GSQA 4GQCA 3HYPA 1H4OA 2VD0A 5C00A 1SKSB 1JHBA 2VLUA 3F6FA 4J56E 2FNOA 2GTUA 1A2LA 3E3EA 4BVXA 2O87A 1F2EA 4MJBA 4DEJA 1X5DA 5ECPB 4DVCA 3APOA 2H19A 1BG5A 3GH9A 2IL3A 1AC1A 3LXZA 4TXVA 5H5QA 1ZYEA 2YWMA 1RQMA 2OE3A 5FHIA 2YV7A 4JRRA 1K3LA 5ECQB 1T8EB 1SYXA 2MZCA 5HQPA 2L6DA 1ON4A 3CSHA 1XVQA 2LKUA 2GQMA 3HA9A 2R3XA 3I9V2 1HYUA 5ELAA 4F0BA 3VI7A 4IW9A 4HU9A 3TRPA 2F3MA 3KMNA 1XWCA 3J7Yb 3ZYWA 1YKCA 2DJ3A 5D8IA 2A2SA 3IK7A 4KUNA 2YP6A 2J23A 1ZCPA 3U5RE 3F3RA 4KCAA 1VF2A 3F8UA 3KMOA 5DALA 3G7IA 4XRAA 4PX1A 2WGRA 4N0ZA 3QR6A 4JBBA 2AYTA 2TIRA 2L59A 1S3AA 2GSQA 1SL2B 4PURA 4FO5A 1Z6MA 3ZL5A 3F4RA 1Y25A 3GIXA 2VUPA 3L9VA 4DSSB 2D2ZA 4HZ4A 1IYIA 4RQXA 4ZL7A 5J5NA 1WWJA 4XS6A 2LNTA 3UBKA 4K7OA 2LJKA 1NSWA 3LYPA 5JCUA 3IDVA 5COHA 2CVDA 1YY7A 1PA3A 1MTCA 4V1Ap 4MABA 3UJ1A 4KAEA 2I1UA 5D93A 1QXHA 2GVPA 2XPEA 2GT6A 5DJMA 1AQXA 2AV4A 3TOTA 2IJYA 2MBTA 4EF0A 3P2AA 1OYJA 4KDXA 2HNLA 2F8AA 2CVKA 3F9UA 2ON5A 1U3IA 1B4PA 1SK2A 5F06A 3DMLA 4ZBBA 1TTZA 4IS0A 1N8JA 4V2LA 1MEKA 5GSTA 3EINA 2GLRA 3GX0A 2O85A 20GSA 2OJLA 4V2NA 1XXUA 5B8BA 1KEBA 4HDEA 1GNEA 1GTBA 3H1NA 3GKMA 3L0HA 1AUCA 2IMEA 5LCZA 2F51A 2E0QA 1MD4A 1LBKA 3CBUA 5ID2B 1VF1A 4I5QA 1SU9A 4PGTA 4MH3A 3EYTA 5C04A 3IOSA 4IQ1A 4WF4A 2JU5A 5IMDA 4BWQA 1B4QA 2MMNA 3M0FA 3FR6A 1M99A 2C0EA 5IPHA 4WEYA 2L57A 4TXOB 4ML1A 1N2AA 1G0TA 3WGXA 2HRFA 4GWRA 2PWJA 2X64A 3VWXA 3OR5A 2P5QA 3L4NA 5D9VA 5DCHA 1EEJA 3CTGA 5KEJA 3RPNA 2PBJA 4BPYA 2CVBA 3KEBA 3HDCA 3TCOA 3KGKA 2GZYA 4TVEA 3A5WA 4PXOA 4ZBAA 2L4CA 4OMVA 1I9DA 5CAXA 3M9JA 3KZQA 2H30A 3Q6OA 4ULXA 3SBCA 4WF5A 4IP6A 1F6MC 3VFIA 2PMTA 2XBIA 3CYNA 2YV9A 4TR1B 1NHYA 1NM3A 1OAZA 3EURA 2LRCA 2LSTA 3A2WA 3G7JA 4MF5A 4DSSA 5ECLB 1EOGA 1QFNA 5ECIB 1TRSA 3E9JB 3GH6A 1OC9B 5D96A 2GZZA 4OFTA 3CMIA 1ZGNA 5J41A 1TP9A 4GXZA 1AQWA 1WP0A 2FA8A 3IPZA 4E8HA 1BYEA 3KP8A 5CRWA 3W6GA 1OKDA 1QQ2A 3HVVA 5CO3A 5B7CA 1PX7A 3M1GA 3NIVA 4XTSA 3D4MA 2VOCA 2E2MA 3UMAA 3H79A 2C3NA 2GSRA 3RHBA 2HRNA 5L71A 2V1MA 2H75A 4RI6A 3NOFA 3HY2A 2DSAA 4TR3A 4WR4A 1ACVA 2H72A 5IO0A 5F05A 4K8MA 1EEMA 2CAQA 2YJHA 4FYCA 2VCQA 1B48A 2OBIA 5IMAA 1XWAA 19GSA 1K3YA 3GKXA 4WKWA 1JZRA 1PL2A 4KA0A 1O81A 3G7YA 3I43A 3DVXA 2PPTA 5F0GA 2GSSA 3DYRA 2OACA 2C0FA 2RUEA 2PERA 4EE0A 2KLXA 3QPMA 3FEUA 3DVWA 4TXOA 2CZ2A 1BAYA 4OCEA 5DAKB 1F37A 1T1VA 2H71A 2O7KA 2OBKA 4ACSA 4KCEA 1JZOA 1R7HA 3TGZA 4AJ6A 3D0ZA 2OE0A 4PUAA 4DSQA 5D73A 1G6WA 2B1KA 1ZMAA 12GSA 3I69A 2HI7A 5DALB 2CZ3A 4MZCA 1V57A 2DIYA 4F03A 3D6IA 1XWBA 2IMIA 2HFDA 2IMFA 3ZMKA 1U87A 2GDRA 2LRNA 5G5EA 2M72A 2MMAA 5CNWA 4JR4A 4XS4A 4I97A 5DVBA 1QGVA 1M7TA 1AW9A 3KD0A 1ML6A 3A3TA 2IPAA 2BTOT 4KX4A 1YF1A 2H76A 4ZL8A 2XHFA 3HXSA 4KH7A 1A24A 2KP2A 3GNJA 4BL7A 4K6XA 2VL2C 1XOBA 3P7XA 4KDYA 2R4VA 1CQHA 3S9FA 1FB6A 2MMOA 2YCDA 2AHEA 5J9CA 3GKNA 5H5RA 3LSZA 1GUKA 4MK3A 2VL9A 2H0GA 3VWUA 16GSA 1OVNA 2R37A 3GMFA 5EL8A 1SK1A 4PNGA 3QMXA 1USBA 3GYKA 1CQGA 2XPDA 3KM6A 4I8BA 1PD21 1QUWA 4HJMA 3W8SA 3HCZA 4XHMA 2B7KA 5J3RA 3GA4A 5IMFA 2NDOA 2LV3A 4ZB6A 1R26A 1GNWA 3LEFA 2YOIA 4MA9A 3FZ5A 1KNGA 2EIOA 1G7EA 5CYYA 4MPFA 1VRSD 3A2VA 1SD8A 1EOHA 5IOWA 4I6XA 4BWSA 1GTIA 3VWVA 3O76A 3QFBC 3TKSA 2B3SA 3GHAA 5IIZA 4QQ7A 1U88A 4EUYA 4POLA 4L5LA 4OCFA 2C0GA 2QGVA 1SL0B 2CX3A 5ECMB 3Q74A 1XW5A 2ES7A 4OO4A 4AF2A 4GTUA 2LEGA 2VLVA 2V6OA 5E59A 4HQZA 1FO5A 3GURA 8GSSA 2IN3A 4GSSA 4IBPA 1DUGA 2LQQA 3C7MA 2K9FA 5DAKA 3ZMLA 3BD2A 5ENUA 1TW9A 2IFQB 4Q5RA 3ZZXA 1YEPA 1YF0A 4IJ3A 2JZTA 4RI7A 4IN0A 3ME8A 3O6TA 1JFUA 1QK8A 5IMZA 5AN1A 2HE3A 5CRGA 3DWVA 4WBJA 1WJKA 1PRXA 1O8WA 2ZNMA 5HFIA 3KTLA 3PINA 3QCPA 3EC3A 2CX4A 4IHUA 1A8YA 4L0UA 2DLXA 3HZ4A 4ZXGA 3UAPA 1H75A 5AIVA 3Q19A 4MZBA 3C8EA 1AAZA 1GH2A 1FAAA 4F0CA 1WOUA 1OE7A 1YJ6A 10GSA 1EV4A 3QD9A 4LMVA 1UVZA 3GX8A 2VL3A 2PVOC 5A4UA 2LJAA 2YJ7A 3BBYA 3CTFA 5INYA 5HR3A 3TJBA 2VCTA 4NHZA 5B8AA 2LUSA 6GSUA 3LJRA 5DDLA 4LLRA 2X8GA 1Q98A 3UVTA 3HD5A 4RUVA 2RLIA 1ST9A 1M2AA 4I2TA 4D73A 3EWLA 4QL7A 4L0WA 1PGTA 1UC7A 4ID0A 2JSZA 1FB0A 3P8WA 1SJZA 1M9AA 2AAWA 3TJFA 3LORA 1VGLA 1AXDA 5CREA 4X0XA 2TRXA 1GSDA 3RPPA 5IM9A 2HZEA 11GSA 4ECIA 1SKWB 4MJCA 2DIZA 2KOKA 3DRNA 6GSTA 3TKPA 1Z9HA 2V41A 3FKFA 3GL5A 3ED3A 1T7PB 3VURA 5GZZB 5IMVA 1YQ1A 1FVJA 4MJAA 2JSYA 2RIIA 3ISOA 3IRAA 4O7HA 2M46A 1TXXA 2E7PA 1DSBA 2B5EA 3EE2A 1B9YC 4NV2A 2H1GA 3IAS2 3A2XA 3CSJA 1NHOA 1PQNA 3C1SA 4K0GA 5HFGA 2JACA 2VO4A 1YDKA 2F9SA 4ECJA 3QFAC 5EVOA 4J2FA 13GSA 3GSTA 2GSTA 2IFQA 1TI1A 4GQFA 3C73A 1ERTA 1ZZYA 2N5FA 4MF6A 4J57E 1G7OA 3TJKA 3L9UA 5AISA 4POKA 3M8NA 5D9WA 2I9HA 2N5AA 1AIUA 5B6NA 3JCML 5A4WA 3QAWA 3FR3A 1G6YA 2LNSA 3L9SA 3NZNA 3TRXA 2FLSA 1VF3A 4TR4A 1EZKA 5D9TA 1GL8A 3PR8A 3TJGA 3F0IA 4XRDA 2DBCA 3MWHA 5G1LA 4MP4A 1O85A 3DKSA 4OD7A 2L4QA 3LG6A 4YQMA 2KUCA 1M9BA 1GSSA 1LJRA 3EVIA 4XS4B 5JWQB 1EGRA 1GRXA 3LXTA 2H1DA 2LJRA 3IV4A 1EV9A 4IQAA 2JADA 1B9XC 5J4UA 3UARA 2HT9A 1TK0B 2XC2A 3G9BA 5JCGA 3UOMA 1DE1A 3DXBA 3FZ4A 5LD0A 3HJOA 4YAPA 3LQ7A 4G9HA 2MYGA 2VCZA 3BJ5A 2H70A 3PH9A 3FZ9A 2FWHA 3WGDA 3FYGA 3WD6A 1TRUA 2IWTA 4H86A 2VD1A 3D4TA 2ZCTA 2WRTA 3GTUA 2F8FA 1Z7RA 2O8VB 6GSYA 3C71A 2H73A 4POMA 3RDWA 3Q18A 4NV5A 2YWNA 2EC4A 3ZIVA 4NWYA 1R4WA 2E2GA 5HR1A 1URMA 3GUSA 4CDOA 3KP9A 1X9SB 1LU4A 1TK8B 4Q5QA 4HQSA 2NTOA 2IMKA 1X9WB 1GSFA 1J9BA 3GFKA 2VM2A 5DJLA 3RHCA 1UN2A 2YANA 3UBLA 3ZTLA 3SWLA 1SKRB 5GSSA 3F6DA 3U6VA 1UA5A 3ZVJA 1DBYA 1XW9A 1OKTA 2K6VA 1WRYA 4FH8A 4L5OA 1JZDA 4HS1A 5KN1A 1XW6A 2R5GA 2C80A 3ZVJD 1Z3EA 2BMXA 2H0HA 4V2MA 2AJQB 1S3CA 2C8UA 1M2DA 4HZ2A 3QAGA 3FZAA 4ZB8A 3F63A 2FCHA 3KXOA 4IJIA 1XFLA 3FY7A 3LYKA 1ZL9A 1TI3A 2GZPA 1MDJA 2C3TA 2OE1A 4GLTA 1SD9A 3TDGA 3VPTA 2O89A 5D9XA 2C0DA 5CRDA 3I6AA 2L6CA 3QAVA 3H4KA 2ZUPA 3R2QA 4POBA 1GLPA 4BA7A 5ECOB 1F3BA 3IK9A 6GSWA 3HJPA 3UL3A 2DJJA 4N30A 2C3QA 1QMVA 1JLVA 3ZLPA 4O5RA 3UVHA 1IYHA 2CQ9A 1K0DA 2A4VA 1XZOA 4X1UA 3FW2A 4AGSA 4IP1A 5KN3A 2H1AA 1FG4A 5DBQA 4TKYA 2VL2A 1HNBA 1OC3A 3ZITA 2VIMA 1DE2A 3FR9A 4YQVA 2K8VA 3O3TA 2FWEA 3TKRA 2WFCA 1WIKA 1S3DA 4KW6A 2P5RA 3UIWA 3HHVA 4D73B 3TJJA 4G2EA 3M9KA 5KN0A 4AJ7A 4JZQA 1XIYA 1XPVA 2FWGA 4K7NA 3ZIJA 3IC4A 2V32A 2VCXA 2B5XA 1M2BA 7GSSA 1BQ7A 4ZB9A 2HSHA 1TJDA 3HZ8A 5JWOB 2A2RA 3MSZA 2HZEB 4LL1B 1K0AA 3IXRA 2FA4A 2FWFA 3GL3A 2DJ0A 2R6KA 1PX6A 3F3QA 1KTEA 2P0GA 1ZOFA 4GSTA 1SL1B 2HLSA 1YEXA 5G1KA 1XOAA 2PGTA 5B6MA 3DGQA 4L8EA 5FWGA 4NHWA 2P31A 3TB2A 3TKSC 9GSSA 3TUEA 3KCMA 4EDZA 2H66A 4NMUA 2VLTA 5F8BA 3TKSE 3VPQA 4HI7A 4JE1A 1C72A 2EIRA 3P90A 4HOJA 4PQ1A 3IHQA 3BOAA 14GSA 2TRCP 3N9JA 2YZUA 4ZBDA 3KTBA 4K1FA 5HFKA 2PN8A 2WCIA 5AGYA 1ERUA 3TRQA 2JZSA 3L78A 5ECNB 2DJ2A 4G19A 1GULA 5ECHB 2PVQA 5KN2A 3GV1A 1SJ6A 1X0RA 2I4AA 1PKZA 2C1YA 4ISDA 1V2AA 4WXTA 2X99A 5G5FA 4CW9A 4MPGA 4N10A 2L5LA 1SYRA 4MJEA 3IE3A 3WT1A 2WB9A 3H93A 1OC8A 1WE0A 2QSIA 2CAIA 2WS2A 5FT3A 4ECCA 1HNAA 2H0IA 1PMTA 2JL4A 2C4JA 4LL4B 2HSYA 4DSRA 4N0VA 1TDIA 2YWIA 1Z6NA 3ZRDA 3IAM2 2LTKA 3FK8A 1U3AA 1GSYA 5J9BA 3D5JA 1MD3A 1J0FA 5HR0A 6GSVA 4WR5A 2NPBA 4IVFA 3VLNA 3LFLA 1KBNA 2K18A 1MDKA 5ABRA 2LQOA 2FHEA 2VCWA 1EP8A 4LMWA 4KE3A 5A5KA 2OKAA 4EXJA 2X8HA 2MBSA 3N5OA 4MZWA 4Q5NA 2CV4A 2OA7A 4NXIA 4MF7A 1BJXA 4K9ZA 3BCKA 4BVYA 2V6KA 1TK5B 1PKWA 5ELGA 1FHEA 3KH9A 4P3YB 4K7IA 4N11A 4QL9A 1PN9A 1X5CA 3VK9A 4ML6A 3C1RA 2YZHA 3GTUB 1T3BA 2MMZA 2ALBA 2KP1A 2H6YA 3QOUA 4RQRA 2WDUA 1R5AA 4JR6A 4KB3A 3HJMA 3W8JA 3FHKA 3BCIA 4I2UA 3KH7A 3KJYA 3PGTA 2WZ9A 4KDUA 3CXGA 2ON7A 2REMA 3US3A 2V2GA 4NAXA 3MNGA 2I81A 1A8LA 1SENA 2WULA 2B1LA 2CA8A 4FYBA 3LWAA 5ECRB 2WJUA 4KSOA 5DQSA 5CP1A 2LS5A 4WBRD 3WGEA 5HR2A 1X9MB 2M80A 3GN3A 4CHSA 1I5GA 2FGXA 4HEA2 4IKHA 1M0UA 4G10A 1ABAA 1O73A 5E4WA 1FVKA 4TW5A 4X43A 2DJKA 3ERFA 1SJIA 1V9WA 4F82A 2B5YA 2G0FA 2GS3A 3V1WA 3RBTA 2H8LA 2DMMA 4F2IA 1YZXA 3D21A 1BX9A 1EWXA 1V98A 1F3AA 1W89A 4EVMA 1EGOA 2RM5A 2Z9SA 3GKKA 3HVXA 4PQIA 4KNDA 1V58A 1GSUA 3FRCA 2YN1A 2IIYA 1AQVA 3EU4A 1YKAA 4MDCA 5JCWA 2FY6A 4OO5A 2XBQA 2YNXA 3F4SA 3TKQA 1OE8A 1EP7A 2HYXA 4TOPA 1T00A 2FD3A 4GF0A 1A2MA 4MCUA 1K3OA 2NBSA 22GSA 5CRHA 4EO3A 1V40A 1WMJA 3IR4A 3QDNA 1W4VA 1GTUA 1XWGA 2I3YA 2PUKC 3KIJA 1TU7A 1ERWA 3DD3A 3ZREA 2J9HA 3AY8A 5JWRB 5ECKB 4K2DA 2YPMA 1GSEA 2H74A 4MH2A 1XBSA 1Z7PA 3DIEA 2R2JA 1GWCA 4OFNA 5ECSA 2EIQA 4XIHA 4TR0A 4HU7A 4EC0A 1BEDA 4K0NA 3DEXA 1RW1A 5DQYA 3MDKA 4E8EA 2YWOA 5LNKe 4ZIJA 3ME7A 4ZILA 4OFMA 3CRUA 4TRXA 2QKEA 1WPIA 4PQHA 4Q5FA 4YH2A 2B6MA 3IBHA 2NVLA 2VAFA 2KHPA 1SK0A 1Y6EA 3IA1A 1K0CA 2H1BA 1FOVA 5AIXA 2GQKA 2BJXA 1A2JA 2LRTA 5F07A 1O7UA 4GSNA 4F9ZA 3APQA 5IPGA 5IQYA 1ILOA 2RM6A 4NPBA 1TU8A 1K0MA 2HXKA 1JZWA 1Q4JA 2JZRA 1K0OA 2N5BA 1GUMA 4JU5A 3TOUA 4HUAA 1F9MA 1K0NA 3K8NA 1A23A 3HKRA 2GQLA 3GSSA 4YQUA 5G30A 4IELA 1Z5YE 4GCIA 1FW1A 4FIWA 4EDYA 5ID2A 1O6JA 3EMPA 1NW2A 4ILFA 4HJ2A 1MDIA 3WYWA 1O8XA 5G31A 2GT5A 1A0RP 2OADA 17GSA 1A0FA 3VI5A 3D22A 2G2QA 2GGTA 4ECBA 4MMMA 3WT2A 1JLWA 4ZL9A 1THOA 5IO2A 4O92A 5IOXA 3HVSA 1ZYQB 4V1Ag 2HZFA 2H01A 2DJ1A 3E0UA 4YAVA 6GSSA 5EPFA 2B7JA 1THXA 2AUVA 3CSIA 5IMCA 1T4YA 2DMLA 1RK4A 1TOFA 4IGJA 2VM1A 3ERGA 4KGIA 1PL1A 4KSMA 3M3MA 5G2ZA 1B8XA 2IMDA 3VWWA 4Z7XA 1PSQA 3CRTA 1T4ZA 3ERWA 1K0BA 4LA1A 1R5PA 1E6BA 5H5SA 5GAPD 18GSA 3ZFLA 1HNCA 2QC7A 2FUG2 2DC5A 1GLQA 2L5OA 3MAKA 2H6XA 1U6TA 1ERVA 4PUFC 4TR1A 2CT6A 5EY6A 1HQOA 4OWYA 1GTAA 2RUFA 3ZFBA 4AJ8A 5GAND 3H8QA 1TRVA 4TN8A 6GSXA 3GRXA 1VF4A 4EKZA 4PNFA 1OC9A 4O32A 3APSA 1GP1A 3RAZA 5DCGA 1XCCA 4XCSA 3EMXA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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