1QQOA

E175s mutant of bovine 70 kilodalton heat shock protein
Total Genus 120
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
120
sequence length
378
structure length
378
Chain Sequence
GPAVGIDLGTTYSCVGVFQHGKVEIIANDQGNRTTPSYVAFTDTERLIGDAAKNQVAMNPTNTVFDAKRLIGRRFDDAVVQSDMKHWPFMVVNDAGRPKVQVEYKGETKSFYPEEVSSMVLTKMKEIAEAYLGATVTNAVVTVPAYFNDSQRQATKDAGTIAGLNVLRIINSPTAAAIAYGLDKAVGAERNVLIFDLGGGTFDVSILTIEDGIFEVKSTAGDTHLGGEDFDNRMVNHFIAEFKRKHKKDISENKRAVRRLRTACERAKRTLSSSTQASIEIDSLYEGIDFYTSITRARFEELNADLFRGTLDPVEKALRDAKLDKSQIHDIVLVGGSTRIPKIQKLLQDFFNGKELNKSINPDEAVAYGAAVQAAILS
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Mapping the role of active site residues for transducing an ATP-induced conformational change in the bovine 70-kDa heat shock cognate protein.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HYDROLASE (ACTING ON ACID ANHYDRIDES)
source organism Bos taurus
molecule tags Hydrolase
total genus 120
structure length 378
sequence length 378
ec nomenclature
pdb deposition date 1999-06-07
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.30.30 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Defensin A-like Defensin A-like 1qqoA02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1qqoA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1qqoA03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1qqoA04
4XH4A 2P9IA 3KHYA 5AQGA 3WEEA 4BRKA 2ZGYA 2A41A 1NGCA 1TYQB 3BUZB 3VGMA 3M3ZA 5AQRA 2E1YA 5AQJA 4CJ7A 2ZGZA 5JMVA 3C0BA 5BN8A 1GLJO 2CGLA 3GDQA 3UKRA 2ASPA 3OHRA 4M7XA 3A0IX 3EZWA 3A5MC 3EKSA 2A3ZA 4PL8A 4YDUA 3O1WA 4BGAA 4BRFA 4H0XB 1T6DA 1XQSC 4MLEA 3ZX3A 3R8EA 3BF3A 4BRLA 3BEXA 4M7YA 5JLHA 1NGDA 3CJ1A 4BR2A 4E1JA 2QWMA 3KZBA 3TU5A 2D0OA 1NMDA 3O8MA 5AQTA 2P9LB 1NGIA 2E1ZA 3QBXA 4Y0WA 1TYQA 3VEYA 1X3MA 2ASMA 4AM6A 5FPDA 4CZKA 4BRNA 2H3GX 4BR9A 3HM8A 1BWFO 5AQMA 5AQOA 1K8KB 2NZTA 3DJCA 3MK6A 3VGLA 3WQUA 4BQZA 3I33A 1Z6RA 3CJ9A 4A2BA 2FLOA 2EWSA 1ATNA 3BF1A 4RTFD 1GLLO 4BROA 3FFKB 2YHXA 4BRHA 3QMLA 1V4SA 2E2PA 3O5BA 5AQXA 4CI6A 4BRQA 3ZEUB 3QFUA 1BUPA 3LM9A 5EOYA 1E4GT 1BA0A 3MN5A 1SQKA 4HTLA 3VENA 3O80A 4B1WB 1MWKA 1QQOA 3GOIA 5AQZA 4CZLA 4H0OA 1NLVA 5TKYA 3EKUA 4XH1A 5AQSA 1RGIA 3D2EB 2HF4A 4CZGA 3HZ6A 3CQXA 3MN7A 3FZLA 1T6CA 2DPNA 2GTDA 3P4IA 3H1QA 3H6EA 3WUHA 2I7NA 1C0GA 1QQNA 1K8KA 1YXQA 4K43A 1NGBA 3ID8A 2Q31A 2CH5A 2VYPA 1LCUA 4H0TB 3CERA 3WXLA 4IXCA 3L0QA 4CD3A 1XC3A 4IJNA 2E20A 3ZEUA 3LDLA 1LOTB 2GWKA 4CD1A 4PL7A 4NO7A 5BRDA 3WXJA 3M6GA 3EL2A 3VEWA 3WT0A 4IO8A 2IVNA 4QS7A 3VF4A 3EO3A 1HKCA 2Q0RA 2KHOA 1HKBA 2IVPA 3D2EA 3VETA 3VF6A 4CBXA 4B1VA 5AQFA 5AQYA 3VEOA 2F9WA 5EX5A 2J4RA 3SMSA 4GY2B 3WQTA 4IWVA 1HUXA 3LM2A 2BUPA 3A8YA 4J8FA 1WOQA 5LJVA 1DKGD 1GLAG 3GG4A 2W40A 3I8BA 3JXUA 5AQPA 3HTVA 5KQ8A 1BA1A 1JCFA 4A2AA 4BC3A 3FZMA 3WXKA 2QWRA 2FF3B 2E2QA 3ENHA 1U2VA 5EY4A 4CZMA 5E26A 1IJJA 1OKJA 2Q0UA 3AAQA 2QWQA 3L6QA 4M63C 4B1YB 1X3NA 1HLUA 4H5WA 4CZEA 3GBTA 3U4LA 4EHUA 5BPLA 1X9JA 1YUWA 1ZXOA 5AZIB 4JNEA 4BG9A 3W3DA 1RDWX 2PBDA 3AARA 3ATVA 2QWPA 2QWNA 4MO4A 4GNIA 4PKHA 4BC2A 3GL1A 2GUPA 3CJCA 5AFUA 3A5NC 4FWPA 5ADXA 1BG3A 4CZHA 4BRAA 5BRHA 1GLBG 3B8AX 1U6ZA 3SLCA 1TUYA 3A5OC 1Q18A 3O4WA 3MN9A 3GE1A 2P9UB 3CHWA 2ZF5O 3DWLA 3H3NO 3FGUA 3A5LC 5AZJB 3CIPA 4K41A 4BQLA 4ISFA 1MDUB 2Q97A 2CGJA 1HX1A 2P9NB 5FPMA 5AZIA 4CBWA 1QHAA 4JAXA 4H0VB 3D2FB 4EAHD 1NGEA 1DGKN 3VEZA 5AQKA 4CZFA 3FZKA 3RSEB 4WQ4C 4MLHA 4QS9A 2FF6A 1KAXA 4C23A 5AQLA 4BVOA 2P9LA 2E88A 4QS8A 3SJHA 5AQVA 5AQWA 4BC5A 3U9DA 4F9OA 5EVZA 1NGHA 2FSKA 3AAPA 4BR7A 2YHWA 1KXPA 3L4IA 1GLCG 1D4XA 1DEJA 2P9UA 3VGKA 4DB3A 2FSJA 1ESVA 1YVNA 3VEVA 1NGGA 1HPMA 5KPZA 3CJBA 3UKUB 5KQDA 2PAVA 3VF2A 2Q36A 4WYBA 4PKGA 3QICA 2NLXA 3CI5A 2P9NA 1GLEG 3F9MA 2D0PA 4FWOA 4JD2B 1NGAA 3VESA 2QWLA 5BR9A 2P9SB 4H5VA 3UB5A 3H46O 3RSEA 2P9PB 4O8KA 4XH5A 3CQYA 5B8HA 1Z05A 2E2OA 3LDNA 3C7NB 4ISEA 1KAZA 3SK3A 1TUUA 4BRMA 4FO0A 3VEXA 4A61A 5AFUH 4EHTA 4FOEA 3H45C 1QQMA 5ADXH 2A40A 1MWMA 3KVGA 5EXWA 3U9ZA 1ATRA 4FWNA 5BPNA 3H3OB 3UKUA 1R59O 3U8XA 5FPNA 4NB4A 3SMPA 4BRIA 4BRDA 1GLDG 4RCHA 3VERA 5JLFA 2YCHA 4B1XB 2QWOA 3FZHA 1BOTO 4JD2A 2P9SA 2Q1NA 3VOVA 3QDKA 2GELA 2P9PA 5AR0A 2ITMA 2D1KA 5BPMA 1NGJA 2CGKA 3CJAA 3HI0A 3C7NA 1KAYA 3O6WA 4FSVA 4B1UB 4B1ZA 4FL9A 2V7YA 4B9QA 3MCPA 4IJAA 4JN4A 3WXIA 4H0YB 2GWJA 2IIRA 2HF3A 1Y64A 3TPQA 4CBUA 2P9KB 1NWKA 5F0XA 1NGFA 2V7ZA 4CZIA 5JICA 5F2RA 4WQ5C 3QBWA 3BP8A 1QZ5A 3D7EO 3DXKB 5I9EB 3ZETB 3HBTA 3MDQA 4H5RA 2YHYA 4FWSA 2NRHA 2IVOA 2I7PA 5BREA 5KPTA 1IG8A 1BU6O 4BREA 1BO5O 3LL3A 2A42A 3QB0A 5BRFA 5CE3A 4K25A 1HJOA 3JS6A 1JCGA 2VCPA 4I6MB 5FPEA 3ULEB 3FZFA 2HMPA 4ISGA 4WQ4A 4RWTA 4L3QA 2A6AA 3QFPA 3FLCO 1EQYA 1H1VA 3W0LA 4XEIA 2P9KA 3MN6A 1QZ6A 2BTFA 4O5FA 2CH6A 5ELZA 3IUCA 2HOEA 1SZ2A 4BGBA 3DXKA 3CJ7A 4FPAA 3ZETA 2QXLA 5KPRA 4KBOA 3FE1A 4YDUC 1CZAN 4BR4A 4H5NA 5AQHA 2GEMA 1NBWA 2ASOA 2VWBA 2FSNA 3G25A 3O08A 4I6MA 4PKIA 3ULEA 1XUPO 2YI1A 2V51B 1V4TA 5LY3A 4AM7A 4DHYA 1E4FT 5AQNA 1WUAA 1GLFO 4JHDB 4BC4A 4CZJA 5BN9A 3O1BA 3AY9A 5AQQA 5AZJA 4FPBA 2A5XA 2Q2RA 1S3XA 4FWLA 4FOIA 1G99A 5LJWA 3H1VX 4A62A 1T44A 3R9PA 2QM1A 1ZC6A 1BDGA 2ZWHA 3M1FA 4BRPA 1NM1A 2D4WA 3D2FA 5F1XA 1ATSA 1ZBSA 3DXMB 3MMVA 3VPZA 1YAGA 4BRCA 3J8AA 3ZX2A 4LC9B 4EIAA 3DAWA 4BVPA 2F9TA 4MO5A 4BG8A 2YJEA 2WUSA 4Z94A 4DCHA 2OANA 1J6ZA 3ENOA 2AA4A 4JHDA 3LDOA 3IMXA 4BRGA 4H03B 4IZ9A 2YJFA 2P9IB 3HSCA 3LDQA 1HKGA 3R6MA 1SAZA 4BR0A 3WEEB 4FWMA 4EFHA 1U2VB 4DQ8A 3IDHA 1RFQA 4HWIA 4WQ5A 1MA9B 5AQUA 3DXMA 2AP1A 4H0PA 3UE5A 4BR5A 3CETA 3UKRB 4K42A 3IFRA 4FWQA 2E2NA 2UYTA 3ATUA 1JCEA 3FR0A 2FXUA 3LDPA 4H5TA 1P8ZA 5AQIA 3EN9A 4FWRA 2V52B 1C0FA 3S41A 2W41A 4FWKA 3ZX0A 2QW9A 5E84A 2E8AA 1S22A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DRPA 2P9IA 4DV6K 3CQ8A 1SKRA 4BRKA 1RT6A 4JI2K 3VGMA 3M3ZA 4ZHRA 3KTQA 1RT1A 3LPTA 4HVJA 2ZGZA 5BN8A 2KJAA 3PUFA 3A0IX 4JYAK 3VA3A 4DSEA 3EKSA 3WXMB 1Z26A 4BRFA 3QERA 4DMNA 4CJSA 1QS4A 1XC9A 2YNHA 4UAFE 3CC7N 3EY1A 4KREA 1S6QA 1RTIA 2MN5A 3CJ1A 4BR2A 3KKSA 4FJIA 4DV2K 4KYPA 2D0OA 2XO7A 1TVRA 3VQ5A 1NGIA 3R2VA 1IKYA 2E1ZA 3LWLA 3SBGA 4Y0WA 4CJEA 1BCOA 1C0TA 1FXXA 3NH1A 1NK5A 1ZVGA 3V1OA 4IOCL 2YHBA 1XHZA 2KLAA 4LF8K 2E3GA 2IAJA 2DFHA 4B9NA 2OZMA 5C2DA 1Z6RA 3CJ9A 2WFBA 5J2MA 2BH1A 4OVLA 3E66A 4CEOA 4AH9A 4E7HA 4DTJA 2E2PA 3A2FA 1GOCA 3K57A 3O9QA 1RDUA 3ALYA 3TSUA 1E4GT 4E1NA 4JEPA 3VENA 4DLEA 2YKMA 3NGZA 1N8RO 2Q3SA 1QQOA 1KQSM 5AQZA 4CZLA 4BACA 2HF4A 1FKPA 4UQGA 5HRRA 3M8SA 4BE1A 1T6CA 2BGGA 1OH6A 3PO4A 3P83D 4GV6A 3AA4A 2O8CB 1QQNA 5KRTA 2PZSA 3ZCMA 2Q31A 4DR7K 1ZYVA 2UUBK 3E9PA 3L2RA 1LCUA 4DTXA 4HHTA 4AILC 1JLEA 2B5JA 3J80O 2RF2A 3ZT0A 1WSEA 4NO7A 3WXJA 2KBJA 1X9MA 4IO8A 1YJNN 1RT4A 2F7TA 4AHRA 3N4PA 3O3HA 4CJKA 4CBXA 3HXMA 5AQFA 1L3SA 1WN7A 1RDDA 2F9WA 3MWPA 5EX5A 5M1KA 2O8FA 1EKEA 3WQTA 4JI8K 4IWVA 4C1NK 3RRHA 4KHNA 4I7FA 1HUXA 4LH5A 3P39A 3LM2A 3TI0A 5LJVA 3MEDA 4FJLA 2LI7A 3JXUA 4M42A 4M3TA 4DWIA 1KSPA 1FK9A 4OPAA 1FW6A 3MEGA 2O4GA 4JKAA 1UGLA 3ZT1A 4W5OA 2HHHK 4R5PA 4HCBA 2JLEA 5JVGL 2P51A 3U6FA 3U4LA 3CC2N 3AVJA 4JNEA 1VNBA 4BG9A 2NY8X 1RDWX 2PBDA 1W0HA 2QWPA 1P0AA 1ZBUA 2HHQA 4BC2A 1N6QA 5TKWA 4G1QA 2GUPA 1AHOA 3MX2A 1N32K 4LF6K 3LP2A 1BG3A 4ICLA 1WLJA 1QSLA 5BRHA 1GLBG 3AA2A 1IBLK 4A5BA 3GE1A 1WWNA 3OYEA 3DWLA 3A5LC 1ZFUA 3WNFA 3CIPA 3EZ5A 3QEVA 4BQLA 2OTLN 2Q97A 2QTDA 5AZIA 3ZT4A 1BMRA 3CCEN 3THXA 4Y1CA 4MDAA 1QHAA 3OYMA 2A7TA 4EAHD 1T7EA 1DGKN 4CZFA 4M3ZA 3RSEB 3AVKA 4MLHA 3L8BA 1KAXA 4C23A 4N5SA 2P9LA 2G2KA 1O13A 3DMJA 4JKGA 3U9DA 5EVZA 3KLIA 4CEEA 2NRZA 4MDBA 4OKEA 4DSLA 1ESVA 1YVNA 4KTZA 1C1BA 3HOSA 1LQIA 3CJBA 3NVMA 2Q36A 2ASCA 4GKJK 1UAXA 1KTQA 2P9NA 1OMYA 3V1QA 2D0PA 4O8UA 3OA9A 4FJHA 3SV4A 4JD2B 2GMOA 1NGAA 3AO5A 1YHQN 3H46O 2O8BA 5B8HA 1T7AA 4B3TK 2E2OA 3SUPA 1HMVA 5SWMA 4ISEA 3C7NB 3EE9A 3J81O 1TUUA 4BRMA 4C8NA 1NK9A 4A61A 4FJXA 3WNHA 1QQMA 1LWCA 3JAMO 3KVGA 3U9ZA 3H3OB 3UKUA 1R59O 5FPNA 1VSFA 4CF2A 2QKKA 4B1XB 3V4IA 3E1YA 5C42A 5HLFA 3K9KA 1FH3A 2VGNA 3SUOA 4F3OA 1YF5L 4DLGA 4LF7K 1WSJA 2OZSA 3THWA 1HNWK 1BCMA 1PTXA 2CGKA 2IOCA 2ZQBA 4PY5A 1SV5A 2HBJA 2LY6A 3ZSOA 2WONA 2DTUA 2XY7A 4IDKA 4FJ7A 2LSNA 1YTAA 1VRTA 2GWJA 2IIRA 1CZ9A 4CBUA 3CM6A 4W5RA 4OKJA 5F0XA 4LFBK 1NGFA 4BDZA 1RBSA 3QBWA 4CHZA 3D7EO 4GKKK 4IG3A 4WFNL 5I9EB 2W6KA 2GV9A 3MDQA 4H5RA 4EP5A 5HRPA 1ZVEA 1RBVA 1VRUA 1IG8A 3B6PA 4BREA 4CJQA 1BO5O 3CCRN 4K25A 2OCEA 4BEBA 1JZAA 2VCPA 3NF9A 4KHSA 5FPEA 5GINA 1JKZA 5FRMA 4ISGA 4WQ4A 4RWTA 5HOOA 3QEXA 3AVAA 4AHVA 4JV5K 2XY5A 4CJVA 2O8EA 4XEIA 5DM7L 4ILHA 1HPZA 1B9DA 4JK8A 3PSMA 1HYSA 4O5FA 2CH6A 4OKKA 3NHGA 2HOEA 1I6FA 3DXKA 1XMOK 1C1CA 4DQPA 4FPAA 2G8HA 1QE1A 4O0IA 3ZSVA 4DUYK 2YBRC 1IBMK 4KB1A 5AQHA 4IOAL 3LP0A 3NVKA 2ASOA 4CF0A 3G25A 3TWHA 4K0KK 1JXBA 4PKIA 3ULEA 2V51B 3E9OA 1V4TA 5LY3A 3SQ2A 4KFBA 3J7YP 1KD1O 4DS4A 5AQQA 4ELUA 3TARA 4M3XA 2Q2RA 4CHPA 4AB0A 1YJWN 5SZTA 4FOIA 4KRFA 3SAHA 4N76A 4O0JA 1WBDA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3DRP A;  2P9I A;  4DV6 K;  3CQ8 A;  1SKR A;  4BRK A;  1RT6 A;  4JI2 K;  3VGM A;  3M3Z A;  4ZHR A;  3KTQ A;  1RT1 A;  3LPT A;  4HVJ A;  2ZGZ A;  5BN8 A;  2KJA A;  3PUF A;  3A0I X;  4JYA K;  3VA3 A;  4DSE A;  3EKS A;  3WXM B;  1Z26 A;  4BRF A;  3QER A;  4DMN A;  4CJS A;  1QS4 A;  1XC9 A;  2YNH A;  4UAF E;  3CC7 N;  3EY1 A;  4KRE A;  1S6Q A;  1RTI A;  2MN5 A;  3CJ1 A;  4BR2 A;  3KKS A;  4FJI A;  4DV2 K;  4KYP A;  2D0O A;  2XO7 A;  1TVR A;  3VQ5 A;  1NGI A;  3R2V A;  1IKY A;  2E1Z A;  3LWL A;  3SBG A;  4Y0W A;  4CJE A;  1BCO A;  1C0T A;  1FXX A;  3NH1 A;  1NK5 A;  1ZVG A;  3V1O A;  4IOC L;  2YHB A;  1XHZ A;  2KLA A;  4LF8 K;  2E3G A;  2IAJ A;  2DFH A;  4B9N A;  2OZM A;  5C2D A;  1Z6R A;  3CJ9 A;  2WFB A;  5J2M A;  2BH1 A;  4OVL A;  3E66 A;  4CEO A;  4AH9 A;  4E7H A;  4DTJ A;  2E2P A;  3A2F A;  1GOC A;  3K57 A;  3O9Q A;  1RDU A;  3ALY A;  3TSU A;  1E4G T;  4E1N A;  4JEP A;  3VEN A;  4DLE A;  2YKM A;  3NGZ A;  1N8R O;  2Q3S A;  1QQO A;  1KQS M;  5AQZ A;  4CZL A;  4BAC A;  2HF4 A;  1FKP A;  4UQG A; 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