1QT3A

T26d mutant of t4 lysozyme
Total Genus 58
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
58
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYDIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords PROTEIN (T4 Lysozyme)
publication title Structural basis of the conversion of T4 lysozyme into a transglycosidase by reengineering the active site.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 58
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1qt3A00
2RH1A 247LA 2O79A 229LA 1C62A 1L02A 2Z6BA 249LA 1L22A 1PQJA 1G0GA 1CTWA 2B6ZA 127LA 4ARMA 3L64A 1SSWA 255LA 3C83A 228LA 1SX2A 2RB2X 3OE9A 1L13A 4ARJA 258LA 1T8FA 3SBBC 1XEPA 1LGWA 238LA 2OU9A 3DNAA 2QARC 1KY0A 1CX6A 1C68A 1QTVA 2OTYX 187LA 1G0PA 192LA 1QTBA 219LA 1L40A 4I7KA 3VW7A 1DYFA 3HUAA 4EXMA 3SN6R 126LA 4GRVA 230LA 3CDRA 181LA 1P6YA 4LDEA 242LA 1QT6A 1LYGA 120LA 4IAPA 1D3JA 5LZMA 1G0QA 1OYUA 159LA 1LI3A 1DYGA 1LYDA 2QB0B 3HTBA 2B6TA 115LA 3GUKA 224LA 3HT8A 174LA 3GUPA 1QTCA 217LA 259LA 1L32A 2Q9DA 239LA 1QSQA 1L15A 1L79A 1CV6A 1DYBA 1L55A 3DN8A 176LA 197LA 171LA 2F47A 4W53A 1KW7A 246LA 3G3XA 252LA 1L19A 3FA0A 156LA 1DYEA 1L58A 1L94A 240LA 1L89A 1PQDA 256LA 1C6HA 151LA 114LA 1LWKA 3C8RA 199LA 1G06A 3OE6A 143LA 1PQIA 123LA 1QT7A 3C7WA 2RBNA 188LA 3UONA 1C6EA 3SBAA 1L16A 137LA 215LA 2F2QA 1LYHA 222LA 1L28A 3SB9A 7LZMA 1L17A 3HWLA 1L0KA 1L59A 4ARQA 1L21A 155LA 149LA 1C6QA 2B6YA 168LA 1L44A 1L07A 1C67A 1JTMA 1L18A 3SB5A 1PQKA 1C61A 141LA 1L31A 1QTZA 3CDTA 3HUQA 1L57A 3HU9A 4YX7C 1CV5A 231LA 3LZMA 1L82A 1CU3A 4DKLA 103LA 111LA 172LA 1QT5A 1QTHA 1L71A 4I7JA 3DN4A 1L43A 1QTDA 3C7ZA 1L90A 1L87A 1C6FA 104LA 218LA 201LA 2RB0X 1L98A 261LA 161LA 1L50A 1L72A 227LA 3RUNA 1P7SA 3FI5A 3SB8A 4E97A 1TLAA 1KS3A 1B6IA 1QT3A 3C7YA 3V2WA 2B6WA 163LA 1L26A 1OVHA 1OWZA 196LA 1L27A 1L85A 4PK0A 1ZURA 1L24A 2B72A 1OWYA 185LA 1P36A 1QUGA 2OU8A 2OEAX 1QUOA 1SX7A 1L60A 2RBRA 245LA 1OV5A 3NYAA 235LA 1L35A 3HT9A 1CU5A 139LA 1LYEA 1L97A 4PJZA 166LA 1L52A 1CU6A 177LA 3FADA 3EMLA 3PBLA 1T8GA 1L30A 1L00A 257LA 1L33A 4W58A 1C63A 1L96A 225LA 1L08A 3DKEX 3OE8A 169LA 1L54A 152LA 1LLHA 3G3WA 3C81A 3F8VA 3PDSA 1L42A 4EKQA 4DJHA 3DMZA 2LCBA 1C64A 3F9LA 1L63A 109LA 2F32A 2IGCA 1LW9A 3HH3A 1L25A 3C8QA 2ANVA 3HTGA 234LA 1LI2A 1LWGA 2HUKA 157LA 1LYFA 1CU0A 1L09A 3ODUA 3HT6A 232LA 1SWZA 2OE9X 1L34A 118LA 4S0WA 2OE4X 3DMVA 2HULA 158LA 1L29A 113LA 3NY9A 1G0KA 4I7NA 2OTZX 1L95A 221LA 1C6KA 1LYIA 1L93A 165LA 4I7TA 4YXAC 2RB1X 248LA 1D3NA 1L73A 1CUQA 138LA 3DN3A 4EJ4A 1DYDA 173LA 3DMXA 3OE0A 1D9WA 214LA 1ZWNA 1C6MA 3HT7A 1C6DA 4AQNA 1WTHA 1QUDA 1L61A 4YXCA 1L39A 190LA 3HH5A 4K5YA 4EKPA 108LA 2ANXA 1L10A 250LA 253LA 1L68A 1QSBA 1JTNA 3DN0A 2LC9A 3GUNA 2L78A 191LA 1L47A 160LA 262LA 198LA 1PQOA 4I7PA 4W52A 2CUUA 3GUOA 1G0LA 1L45A 1L84A 1T6HA 3DN1A 3CDQA 4W51A 4ARQB 144LA 119LA 3HTDA 1C6GA 3HDFA 3HUKA 2RAZX 1L03A 4LDOA 3GUMA 1L05A 1L65A 2O4WA 1C6LA 1D2WA 1EPYA 1L06A 2RAYX 129LA 2RBQA 1CV0A 1P5CA 4I7SA 3HU8A 1L37A 1C69A 3L2XA 2NTHA 3HTFA 1I6SA 3D4SA 180LA 1C60A 1P64A 4ARPA 3C8SA 1SWYA 4W57A 4W56A 1G07A 150LA 4GBRB 1P56A 122LA 1G0JA 130LA 102LA 1P46A 1C6NA 184LA 2OU0X 3RZEA 1L80A 1G1WA 220LA 213LA 140LA 210LA 162LA 1L74A 200LA 2A4TA 4OO9A 4W55A 1L92A 2B6XA 2HUMA 3GUJA 110LA 1CX7A 1DYAA 4ARMB 1L70A 1CV1A 1C65A 1SSYA 186LA 1L77A 2Q9EA 1L14A 233LA 2RBOA 1XJTA 1XJUA 1D3FA 244LA 4I7RA 1L04A 211LA 6LZMA 1QT8A 1L01A 1T97A 1LPYA 3SB7A 1L66A 1P2RA 1L56A 236LA 1LGXA 1NHBA 1KY1A 145LA 1PQMA 112LA 1L88A 167LA 254LA 1L91A 183LA 1L36A 2NTGA 1CV3A 3SB6A 1L38A 146LA 4ARLA 3C80A 182LA 2LZMA 1DYCA 1C6CA 260LA 189LA 2B7XA 1L46A 1LGUA 1LI6A 209LA 1L64A 1ZYTA 1D3MA 1L0JA 1C6BA 4EKRA 3CDVA 3NY8A 4W59A 2RBSA 1CV4A 1QUHA 170LA 1OV7A 3DN2A 206LA 1D2YA 2B75A 1C6TA 3V2YA 1L86A 164LA 3GUIA 1L69A 3CDOA 1L23A 1C6PA 216LA 3DN6A 223LA 1L99A 1QS5A 125LA 241LA 1L48A 3C82A 212LA 1OVJA 251LA 3K2RA 1C66A 5I14A 195LA 1P2LA 1C6JA 1L51A 1L62A 1C6IA 3JR6A 1KW5A 1L83A 1C6AA 4DAJA 1L12A 1L20A 4I7OA 1T8AA 1L67A 4EKSA 4EPFA 243LA 3HH6A 3HH4A 1L75A 1L81A 1JQUA 1L41A 1P37A 1LYJA 142LA 1P3NA 205LA 128LA 4EPIA 2B73A 226LA 1L76A 3QAKA 1L53A 2O7AA 4LDLA 1CUPA 1CVKA 4I7MA 4ZPUA 1G0MA 1OVKA 3G3VA 4LZMA 2B74A 4W54A 175LA 1K28A 2B70A 1CU2A 1L49A 147LA 2RBPA 1G1VA 1KNIA 1QS9A 1QT4A 107LA 178LA 4I7LA 148LE 1L11A 4I7QA 237LA 131LA 2OE7X 3HDEA 3GULA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
247LA 229LA 1C62A 1LMNA 2B6ZA 1LHJA 4G4HA 1SSWA 1GFKA 1VATA 1JKAA 3AGIA 1C10A 153LA 1L13A 1QSWA 4ARJA 1UIEA 3M3UA 1GFVA 1GB8A 5JENB 4UWVA 2QARC 1KY0A 1C68A 187LA 1G0PA 1QTBA 1L40A 1JHLA 126LA 3TXGA 230LA 1WTNA 3CDRA 1DPXA 1QT6A 1B7MA 1E8LA 1LYGA 120LA 1D3JA 4N5RA 1G0QA 159LA 4ANRA 1RJCB 2YBHA 2DQJY 4ETCA 3B0KA 4GCCA 5KJ9A 174LA 3GUPA 132LA 5E4PA 5HLLA 1GFTA 4RW1A 1SQ2L 4H9CA 1L79A 1CV6A 1GXV2 197LA 2I26L 4QEQA 1FLWA 1GWDA 1GDWA 1L19A 3TXFA 1REZA 1LJGA 1L89A 256LA 5I5QA 2WARA 114LA 5L3IA 2D6BA 3F6ZA 3WUAA 2LHMA 1QT7A 3AZ7A 2RBNA 188LA 137LA 215LA 1LYHA 2LZTA 2G4NA 5KXXA 4J7VA 5EBHA 155LA 4GCBA 4H9FA 1KIPC 2HEEA 1HC0A 1L44A 4L41A 1L07A 1BWJA 4H8XA 1L18A 1LKRA 2W1XA 1C61A 1PQKA 141LA 4FDYA 1P2CC 1B5XA 3HUQA 1GF9A 1HSWA 2F2NA 1XGQC 1TDYA 1XFPL 172LA 1QT5A 4PGJB 4GN3A 3C7ZA 3AZ5A 1L90A 1C6FA 104LA 5FEKA 4HTNA 227LA 1VDTA 1HFYA 5T3FA 3FI5A 1TLAA 1GB2A 3C7YA 163LA 1OVHA 1L27A 2BQKA 1LZ8A 2YBNA 1LCNA 1UUZC 1ZURA 4HJVA 185LA 1HEQA 1P36A 2OU8A 194LA 1B7PA 1CKGA 4TSBA 1L97A 1CU6A 3WPKA 2G4PA 3CSZA 3EMLA 1T8GA 1GDXA 4WOAA 1L33A 2BQEA 2BQHA 4GCEA 4AXTA 1PS5A 225LA 4WG7A 169LA 5KXLA 1UIHA 5ILFA 3F8VA 3P65A 2F4GA 4OOTA 4DJHA 1HEMA 2Z37A 3F9LA 4NWEA 234LA 4UWUA 2BQJA 1LWGA 1LYFA 2MEAA 1JSEA 1IP3A 4H94A 2MEDA 2OE4X 1LAAA 158LA 4HJZA 4NHSA 5LA8A 1G0KA 2ZIKA 1L95A 1WQOA 1IP6A 2HUBA 1CUQA 138LA 3DN3A 3AJNA 173LA 3DMXA 5FSTA 2DQIY 5HMVA 1ZWNA 1C6MA 3HT7A 1G7HC 1WVUA 1CKHA 3WUNA 4YXCA 3HH5A 1BB4A 2HEDA 5DLAA 1UIBA 4OWAA 2IHLA 4LYTA 4NGVA 5KXSA 198LA 3TMWA 5F14A 1ALCA 1PQOA 4I7PA 4LT0A 3GUOA 1LMPA 5APCA 2H9KA 119LA 4DD3A 3HTDA 3WXUA 4Z3MA 4TTDA 3HDFA 5M1YA 1IOCA 4H92A 1L03A 3GUMA 3QE8A 1BHZA 1GB9A 4BAPA 1NWGA 1QUSA 1DZBX 1P5CA 1GXXA 4I7SA 5A3ZA 1C69A 1UIDA 3HTFA 4KT3A 3D4SA 4NGJA 3C8SA 1JJ0A 3P4ZA 4NSIA 1LZNA 5LYTA 4GBRB 122LA 3RW8A 3HBDA 102LA 1LSDA 184LA 2BLYA 5KXRA 1B7QA 4YM8A 1NF5A 4XJHA 3T6UA 213LA 1BB7A 3A90A 1B7LA 162LA 200LA 4B4IA 3A6BY 1JKBA 4NHQA 2HUMA 1YKYX 4KPMA 1IOTA 1CX7A 2MEEA 1BVKC 4WLXA 1C65A 4YF2A 1CJ8A 193LA 3RNXA 233LA 2RBOA 3W6AA 4G4BA 1XJTA 1IWTA 1IC5Y 1UICA 4I7RA 3TMVA 1T97A 4X3BA 5F9XA 236LA 1BVXA 8LYZA 1L88A 167LA 1AM7A 2NTGA 1YAPA 3A91A 2I6ZA 1YKXX 4XN6A 3SB6A 4KXIA 4LT1A 2LZMA 2Z19A 4H8YA 4NIJA 1L46A 5HMJA 1GBWA 5APDA 1LMAA 3WVXA 1B5YA 1C46A 1D0LA 1C6BA 1DI5A 1JJ3A 4P2EA 4GLAA 4EKRA 3NY8A 3J4GA 1TAYA 2RBSA 5LVGA 2CDSA 1GF4A 5FELA 2D4IA 3DN2A 3V2YA 1A2YC 4GN4A 3M18B 3CDOA 2XQOA 3DN6A 241LA 1F6RA 1L48A 5I14A 1C66A 1LPIA 2BQGA 3WPJA 2GV0A 4DD0A 1C6AA 4WLDA 243LA 1LZRA 1L41A 2O7AA 4OOOA 1IY4A 1CVKA 2G4QA 1FKVA 1G0MA 1OVKA 1OUFA 4W54A 1OQMA 1G1VA 1QT4A 4NSJA 1N4FA 2YBJA 107LA 4HTQA 3N9CA 1LOZA 2RH1A 4W94A 1AT5A 1GPQC 1L22A 3E3DA 3FE0A 255LA 3C83A 228LA 1BB5A 1NDMC 3CQLA 1WQQA 5HQ1A 3SBBC 1XEPA 1LGWA 3A3QA 238LA 4NHIA 2OU9A 3P68A 4HPEA 2OTYX 1CX6A 1QTVA 192LA 3SN6R 2BQFA 5FHWA 181LA 1P6YA 4LDEA 1YKZX 4IAPA 4B0DA 1BWHA 2Q0MX 3TXJA 3W6BA 2PC2A 1DYGA 2FBBA 3HTBA 3MGWA 3A96A 1GF0A 1FBIX 115LA 154LA 1QTCA 1AZFA 2XBSA 1REXA 3WYHA 4WM2A 1QSQA 1L15A 4RDSA 3DN8A 4W53A 1KW7A 1GFEA 4ET8A 252LA 3FA0A 4NGKA 156LA 1JEFA 3GXRA 1L58A 1L94A 4ZEEA 4WM3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 247L A;  229L A;  1C62 A;  1LMN A;  2B6Z A;  1LHJ A;  4G4H A;  1SSW A;  1GFK A;  1VAT A;  1JKA A;  3AGI A;  1C10 A;  153L A;  1L13 A;  1QSW A;  4ARJ A;  1UIE A;  3M3U A;  1GFV A;  1GB8 A;  5JEN B;  4UWV A;  2QAR C;  1KY0 A;  1C68 A;  187L A;  1G0P A;  1QTB A;  1L40 A;  1JHL A;  126L A;  3TXG A;  230L A;  1WTN A;  3CDR A;  1DPX A;  1QT6 A;  1B7M A;  1E8L A;  1LYG A;  120L A;  1D3J A;  4N5R A;  1G0Q A;  159L A;  4ANR A;  1RJC B;  2YBH A;  2DQJ Y;  4ETC A;  3B0K A;  4GCC A;  5KJ9 A;  174L A;  3GUP A;  132L A;  5E4P A;  5HLL A;  1GFT A;  4RW1 A;  1SQ2 L;  4H9C A;  1L79 A;  1CV6 A;  1GXV 2;  197L A;  2I26 L;  4QEQ A;  1FLW A;  1GWD A;  1GDW A;  1L19 A;  3TXF A;  1REZ A;  1LJG A;  1L89 A;  256L A;  5I5Q A;  2WAR A;  114L A;  5L3I A;  2D6B A;  3F6Z A;  3WUA A;  2LHM A;  1QT7 A;  3AZ7 A;  2RBN A;  188L A;  137L A;  215L A;  1LYH A;  2LZT A;  2G4N A;  5KXX A;  4J7V A;  5EBH A;  155L A;  4GCB A;  4H9F A;  1KIP C;  2HEE A;  1HC0 A;  1L44 A;  4L41 A;  1L07 A;  1BWJ A;  4H8X A;  1L18 A;  1LKR A;  2W1X A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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