1QT4A

T26q mutant of t4 lysozyme
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYQIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords PROTEIN (T4 LYSOZYME)
publication title Structural basis of the conversion of T4 lysozyme into a transglycosidase by reengineering the active site.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1qt4A00
3HTFA 1G0GA 1QS5A 4W58A 247LA 2OE9X 3HH6A 1L60A 1TLAA 3LZMA 1SX2A 1OVHA 1DYDA 104LA 3DMZA 1JTNA 4YX7C 3GUJA 3CDQA 3F9LA 260LA 1D3MA 4ARLA 223LA 158LA 3HTGA 1L90A 140LA 199LA 1CV4A 1KY0A 1G06A 3HDEA 1L95A 114LA 1C60A 230LA 128LA 1JTMA 1L23A 2RBQA 1P37A 233LA 2ANVA 4I7LA 4DKLA 2RB0X 1L21A 3C8SA 3HT6A 2HUKA 110LA 1C6GA 1L45A 1P5CA 3HU9A 2O7AA 3HH3A 1L43A 2RBOA 249LA 1SX7A 1L48A 4I7JA 1L25A 1G1WA 1LI3A 1C6HA 1QTHA 1QT8A 1QSBA 1L33A 1C6EA 1L40A 244LA 145LA 1P2LA 1G0QA 1L96A 1DYBA 1L42A 3HWLA 217LA 4I7RA 3OE8A 259LA 220LA 1G0JA 1SWYA 1XJTA 1DYEA 4ARPA 1QTZA 1CU3A 1DYAA 160LA 1P64A 1L13A 183LA 1G1VA 1C6TA 1OWZA 4LDOA 3PDSA 243LA 1L19A 1L80A 1L50A 242LA 1L65A 1ZURA 4OO9A 1G0MA 155LA 1L44A 1QTVA 1KW7A 1C6QA 1L32A 1JQUA 240LA 1L09A 3DN6A 1C64A 171LA 1L82A 2B6XA 1LYHA 1CU6A 4W52A 4ARQB 108LA 3C83A 4W53A 1LYFA 1L47A 228LA 113LA 4K5YA 192LA 1L83A 1L85A 250LA 236LA 3JR6A 255LA 1LYDA 172LA 4W54A 3OE6A 4W57A 1L24A 1LI6A 1L58A 256LA 1LLHA 1L0JA 188LA 139LA 157LA 4DJHA 184LA 3DMXA 1L28A 1L68A 257LA 111LA 2Z6BA 3FI5A 4ARMA 1C6BA 1L86A 173LA 4EPIA 1CV5A 107LA 181LA 1KW5A 1C6JA 1P46A 1L02A 225LA 1L31A 1PQIA 232LA 3SBAA 115LA 1L41A 2RH1A 1P6YA 1L0KA 1L51A 1C66A 3HUAA 1QS9A 1L18A 3DN3A 4EKPA 3SB9A 3NYAA 137LA 238LA 3SB7A 168LA 1C68A 103LA 1NHBA 5LZMA 178LA 1PQJA 4W56A 1LWGA 248LA 2F47A 164LA 2OTYX 1CTWA 141LA 205LA 3CDOA 1C67A 235LA 5I14A 2RBPA 3V2YA 1OV7A 1L69A 2A4TA 1L67A 1L61A 2RB2X 1I6SA 4I7QA 1XEPA 1L63A 4I7NA 229LA 4I7MA 3K2RA 1L46A 1G0KA 222LA 254LA 4I7TA 2QB0B 1P56A 189LA 1PQOA 169LA 1L81A 2F2QA 1L20A 165LA 187LA 127LA 1PQKA 1L70A 1D3JA 1LYIA 2ANXA 3C81A 1CV6A 3GUPA 1L16A 2B72A 166LA 3HTDA 2RAYX 1KY1A 3C82A 195LA 253LA 2O4WA 2B6WA 4S0WA 4EXMA 1D2YA 1L30A 1L91A 201LA 1T6HA 1C6NA 156LA 1QT3A 1L11A 1C6FA 1C63A 2RBNA 1C6IA 3HU8A 210LA 1L04A 1L79A 1SSWA 3SBBC 3GULA 4LZMA 3NY8A 226LA 1QT6A 3NY9A 2OU9A 1L56A 4EJ4A 149LA 4I7KA 1T8AA 209LA 1C6DA 1L64A 4DAJA 3OE9A 1L49A 2CUUA 1C61A 4ARMB 218LA 1L76A 1D9WA 4W59A 3SB5A 1L77A 196LA 3V2WA 1L94A 216LA 1ZWNA 4PK0A 2B6YA 1OV5A 211LA 252LA 120LA 2Q9EA 174LA 1DYFA 3C8QA 143LA 1T8GA 1L87A 2IGCA 2OEAX 1G0LA 112LA 1C69A 1LI2A 1QUHA 3RZEA 3HH4A 3UONA 246LA 2HUMA 3DN8A 130LA 1WTHA 1CU0A 170LA 151LA 3L64A 1L08A 1D2WA 1L54A 3HDFA 213LA 3HUKA 1KS3A 2LCBA 2OTZX 3QAKA 2RBRA 1G07A 1PQDA 4W55A 1LPYA 3HTBA 3DNAA 144LA 4EKQA 3G3XA 3VW7A 1P2RA 1LYGA 3C7WA 1D3NA 3ODUA 146LA 2O79A 1L93A 3F8VA 219LA 1ZYTA 3CDTA 4ZPUA 1P3NA 1C65A 1K28A 152LA 1L00A 1QUOA 3GUNA 190LA 3OE0A 123LA 1L01A 3GUMA 1L34A 4ARJA 1L59A 1L72A 2LC9A 2RBSA 1LWKA 1QT5A 1L62A 1C6KA 2HULA 4EKRA 1L03A 2NTHA 4IAPA 3D4SA 241LA 2OU8A 1L99A 1L22A 227LA 3DKEX 176LA 3GUOA 2QARC 180LA 1QUDA 1CX7A 3SB6A 2RB1X 1L52A 239LA 2B6TA 3SN6R 119LA 2OU0X 1EPYA 1QT7A 182LA 3HUQA 3GUIA 258LA 3HT7A 1LGWA 161LA 1QTCA 4PJZA 1L15A 2B74A 3FADA 4EPFA 1C6PA 175LA 1L14A 1CUPA 1L55A 1L75A 2B7XA 167LA 1C6CA 1L35A 4AQNA 185LA 2L78A 1DYCA 2B6ZA 215LA 4W51A 224LA 1QUGA 1P36A 212LA 1QTDA 1L12A 3C8RA 1L06A 1L38A 6LZMA 1L73A 3FA0A 1C6MA 234LA 1PQMA 186LA 1L37A 102LA 1L66A 2RAZX 1C62A 1KNIA 1OWYA 3DN0A 1CUQA 1LYEA 1L27A 4E97A 3SB8A 118LA 3C7YA 138LA 1QTBA 221LA 2F32A 1L53A 4LDLA 1L10A 1L71A 162LA 1CV1A 1D3FA 198LA 3L2XA 1L74A 3DN1A 3G3VA 4I7OA 129LA 1L17A 1OYUA 1CX6A 251LA 122LA 1LYJA 1L26A 1L84A 1DYGA 1OVKA 2B73A 3DN2A 1L88A 1CVKA 2LZMA 4YXAC 4GBRB 1T8FA 2OE7X 1CV3A 147LA 191LA 3C7ZA 1OVJA 1L97A 142LA 261LA 2OE4X 2B70A 3CDVA 125LA 1C6LA 4YXCA 214LA 1CU2A 131LA 197LA 1CV0A 1QSQA 237LA 3HT8A 3RUNA 1T97A 1B6IA 1L39A 1L89A 1SSYA 1LGXA 2B75A 1L98A 3G3WA 1L57A 1QT4A 1P7SA 4LDEA 3DMVA 2NTGA 3HT9A 231LA 126LA 4EKSA 262LA 1C6AA 109LA 1L36A 1CU5A 200LA 1G0PA 4ARQA 163LA 1L92A 3EMLA 1L05A 1XJUA 3PBLA 3DN4A 245LA 1LGUA 3HH5A 1L07A 148LE 3C80A 3GUKA 1SWZA 4GRVA 159LA 1LW9A 206LA 177LA 4I7SA 7LZMA 2Q9DA 1L29A 150LA 3CDRA 4I7PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1HHLA 1RJCB 2OE9X 3LZMA 1OVHA 104LA 3GXRA 3CDQA 4H9EA 4ARLA 3HTGA 199LA 1G06A 1L95A 114LA 5T3FA 128LA 5JENB 2RB0X 4QDNA 4DDBA 1LMPA 2DQIY 3RT5X 3WW6A 4DD3A 1L43A 1IP3A 3A92A 2ZIJA 5DN5A 1SX7A 4I7JA 3IJUA 1FN5A 2IHLA 1L33A 1CKGA 4AGAA 4H90A 1DYBA 1JWRA 217LA 3OE8A 4H9FA 5L3HA 4N0JA 4WL6A 1IOTA 1CU3A 2D4KA 2DKVA 1HEMA 183LA 5KJ9A 1C6TA 1HNLA 4DWXA 1J1XY 1F10A 243LA 3TXHA 242LA 1G0MA 1B5VA 1KXWA 2YVBA 3P65A 1JJ1A 1L82A 1V7SA 1LYHA 1CU6A 1IORA 1UIBA 5ILFA 108LA 5KXTA 1LYFA 3TXFA 5KXXA 1GE3A 3LN2A 3MGWA 4K5YA 1REMA 2YBIA 5A3ZA 1LJNA 2F4AA 5KXPA 3RW8A 1JKBA 4UWNA 1GFAA 1LSFA 1DI4A 157LA 4NGZA 1L28A 207LA 1C6BA 2HEAA 2BQKA 1CJ8A 1C6JA 1E8LA 1L02A 1L31A 2RH1A 1P6YA 1QS9A 2LYOA 137LA 4KL7A 103LA 178LA 4B0DA 4W56A 4J7VA 1WQOA 1IR8A 1JKCA 4GN3A 2OTYX 1LSAA 1NKHA 1L69A 2W1MA 3M3UA 3QY4A 1L63A 229LA 1B7LA 4I7MA 1L46A 1UIGA 1WQMA 1B5ZA 2QB0B 5IHGA 1WVUA 2MEAA 169LA 2F2QA 165LA 4DT3A 1L70A 3HBHA 2A7DA 3C81A 1L16A 2B72A 3C82A 3J4GA 4IJ4A 2O4WA 4R6CA 4ET8A 5LXWA 1T6HA 1C6NA 156LA 4UWVA 1L11A 1C6FA 1DPXA 3G3AB 1HSWA 1C6IA 3HU8A 4HP0A 3GULA 5LVKA 2BQLA 2YBLA 1JPOA 226LA 1QT6A 1L56A 1GFHA 1LHLA 4NSGA 1UIFA 1HELA 3WPJA 3CQLA 1T8AA 1DI5A 1C6DA 4DQ5A 1B7SA 4DAJA 3WMKA 4DD1A 4WO6A 3TXBA 1C61A 218LA 4NGIA 1ALCA 1INUA 1ZV5L 1WTNA 3CSQA 1UUZC 4PK0A 1G7HC 211LA 2HU1A 1EQ4A 4KPMA 2Q9EA 1F0WA 1AZFA 143LA 5B05A 4NSHA 3AYQA 2IGCA 2OEAX 1G0LA 112LA 1LI2A 3RU5A 5L3IA 2HTXA 3DN8A 3TMXA 151LA 3TXEA 1RFPA 3L64A 1HSXA 1JISA 1L08A 2HECA 1D2WA 1YQVY 3HDFA 5LA8A 1GB7A 3QAKA 5E4PA 1OUBA 1QTEA 4W55A 3HTBA 144LA 1GE2A 1LSCA 1HERA 146LA 2O79A 1GB9A 5DL9A 190LA 123LA 1OUCA 1L34A 3GUMA 2YBHA 1L72A 1H6MA 1LSGA 1OP9B 2YBJA 3WUAA 4YM8A 2X0AA 4EKRA 1QTKA 4GN4A 2OU8A 227LA 176LA 3GUOA 2QARC 4LGKA 4NGVA 1RCMA 5M1YA 3D9AC 1HFZA 1MLCE 5LINA 2RB1X 4LYZA 1L52A 239LA 3SN6R 119LA 1BVKC 1EPYA 1IWTA 1QT7A 1OUAA 3A8ZA 3GUIA 1JJ3A 1FBIX 161LA 2FYDA 167LA 1C6CA 5LVJA 4WL7A 4OWAA 5HQ1A 1JSFA 5F16A 1W08A 185LA 2LYMA 3OJPA 3WL2A 1UACY 4OOTA 4WLTA 1P36A 1VDQA 1QTDA 1L12A 1L38A 2YDGA 1VATA 234LA 1PQMA 1RE2A 154LA 5EBHA 1OWYA 3DN0A 4NY5A 1WTMA 5D5FA 1LZNA 134LA 4H9IA 3AB6A 2AUBA 5K7OA 1L53A 3A95A 1JTOL 2MEHA 1CV1A 2XQOA 132LA 1D3FA 1HF4A 1OUIA 1L17A 1LYJA 2LYZA 1HENA 3DN2A 4HJVA 4YXAC 1UA6Y 9LYZA 4H9BA 4E3UA 147LA 191LA 1HMKA 4R0FA 3WXTA 1OVJA 3CDVA 2BPUA 1C6LA 1B6IA 1LJHA 2DQAA 2B75A 1D6PA 1L57A 3ULRA 3CT5A 4NEBA 262LA 4ARQA 1L92A 5I5QA 1YILA 1XJUA 2BAAA 1GB8A 5KKIA 3HH5A 2HEBA 1L07A 1VDSA 4LT0A 4MR1A 5LAFA 5FSTA 177LA 3WW5A 2HEFA 150LA 2XJWA 1IP2A 1XGTC 1GB0A 1G0GA 4NSJA 1QUTA 1IC4Y 3HH6A 4OWCA 1L60A 1Z55A 1B7QA 1DYDA 1LZTA 1JTNA 4YX7C 4TSBA 3A67Y 1D3MA 4GLAA 4NGKA 1EQEA 1GWDA 3HDEA 1GEZA 4DD2A 1LMAA 2RBQA 1P37A 2Z38A 233LA 3AZ6A 4DKLA 4QGZA 4FDYA 1L21A 3C8SA 4CJ2A 2HUKA 110LA 3HU9A 3HH3A 3OK0A 1GF6A 1GDXA 4ANRA 1L48A 2W1XA 1VAUA 4NHSA 1LI3A 1MELL 1C6HA 2BQNA 145LA 2D6BA 1P2LA 1G0QA 2Q0MX 4XENA 259LA 2C8PA 1XJTA 4ARPA 1DYAA 2N5ZA 4H8ZA 1YL0X 3WPLA 1L13A 1G1VA 2BQFA 4LDOA 4LZTA 3PDSA 1CKHA 1YANA 1HC0A 1L44A 3LYOA 1B7NA 1KW7A 1C6QA 1L32A 2C8OA 240LA 1L09A 1C64A 5KXMA 2ZQ3A 5IELA 1UIDA 4PJ2C 3WULA 2BQCA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1HHL A;  1RJC B;  2OE9 X;  3LZM A;  1OVH A;  104L A;  3GXR A;  3CDQ A;  4H9E A;  4ARL A;  3HTG A;  199L A;  1G06 A;  1L95 A;  114L A;  5T3F A;  128L A;  5JEN B;  2RB0 X;  4QDN A;  4DDB A;  1LMP A;  2DQI Y;  3RT5 X;  3WW6 A;  4DD3 A;  1L43 A;  1IP3 A;  3A92 A;  2ZIJ A;  5DN5 A;  1SX7 A;  4I7J A;  3IJU A;  1FN5 A;  2IHL A;  1L33 A;  1CKG A;  4AGA A;  4H90 A;  1DYB A;  1JWR A;  217L A;  3OE8 A;  4H9F A;  5L3H A;  4N0J A;  4WL6 A;  1IOT A;  1CU3 A;  2D4K A;  2DKV A;  1HEM A;  183L A;  5KJ9 A;  1C6T A;  1HNL A;  4DWX A;  1J1X Y;  1F10 A;  243L A;  3TXH A;  242L A;  1G0M A;  1B5V A;  1KXW A;  2YVB A;  3P65 A;  1JJ1 A;  1L82 A;  1V7S A;  1LYH A;  1CU6 A;  1IOR A;  1UIB A;  5ILF A;  108L A;  5KXT A;  1LYF A;  3TXF A;  5KXX A;  1GE3 A;  3LN2 A;  3MGW A;  4K5Y A;  1REM A;  2YBI A;  5A3Z A;  1LJN A;  2F4A A;  5KXP A;  3RW8 A;  1JKB A;  4UWN A;  1GFA A;  1LSF A;  1DI4 A;  157L A;  4NGZ A;  1L28 A;  207L A;  1C6B A;  2HEA A;  2BQK A;  1CJ8 A;  1C6J A;  1E8L A;  1L02 A;  1L31 A;  2RH1 A;  1P6Y A;  1QS9 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1HHL A;  1RJC B;  2OE9 X;  3LZM A;  1OVH A;  104L A;  3GXR A;  3CDQ A;  4H9E A;  4ARL A;  3HTG A;  199L A;  1G06 A;  1L95 A;  114L A;  5T3F A;  128L A;  5JEN B;  2RB0 X;  4QDN A;  4DDB A;  1LMP A;  2DQI Y;  3RT5 X;  3WW6 A;  4DD3 A;  1L43 A;  1IP3 A;  3A92 A;  2ZIJ A;  5DN5 A;  1SX7 A;  4I7J A;  3IJU A;  1FN5 A;  2IHL A;  1L33 A;  1CKG A;  4AGA A;  4H90 A;  1DYB A;  1JWR A;  217L A;  3OE8 A;  4H9F A;  5L3H A;  4N0J A;  4WL6 A;  1IOT A;  1CU3 A;  2D4K A;  2DKV A;  1HEM A;  183L A;  5KJ9 A;  1C6T A;  1HNL A;  4DWX A;  1J1X Y;  1F10 A;  243L A;  3TXH A;  242L A;  1G0M A;  1B5V A;  1KXW A;  2YVB A;  3P65 A;  1JJ1 A;  1L82 A;  1V7S A;  1LYH A;  1CU6 A;  1IOR A;  1UIB A;  5ILF A;  108L A;  5KXT A;  1LYF A;  3TXF A;  5KXX A;  1GE3 A;  3LN2 A;  3MGW A;  4K5Y A;  1REM A;  2YBI A;  5A3Z A;  1LJN A;  2F4A A;  5KXP A;  3RW8 A;  1JKB A;  4UWN A;  1GFA A;  1LSF A;  1DI4 A;  157L A;  4NGZ A;  1L28 A;  207L A;  1C6B A;  2HEA A;  2BQK A;  1CJ8 A;  1C6J A;  1E8L A;  1L02 A;  1L31 A;  2RH1 A;  1P6Y A;  1QS9 A; 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