1QT5A

D20e mutant structure of t4 lysozyme
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKETEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords PROTEIN (T4 LYSOZYME)
publication title Structural basis of the conversion of T4 lysozyme into a transglycosidase by reengineering the active site.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1qt5A00
3VW7A 119LA 157LA 1C6AA 169LA 2OU8A 2B6TA 4PK0A 1LLHA 1DYCA 1G0KA 4YXAC 1L84A 1L38A 1L04A 1D3NA 214LA 4ZPUA 1LYHA 1P36A 3FADA 3DN3A 3HT9A 2RBOA 1L75A 140LA 1L51A 4IAPA 1L33A 2RB2X 240LA 1L90A 1L85A 4EJ4A 195LA 1CV3A 3DN2A 1LGXA 1QT3A 1XJUA 3HT6A 1DYFA 1L0KA 226LA 3DMZA 4EKQA 3GULA 239LA 1WTHA 118LA 150LA 256LA 3D4SA 161LA 125LA 1L91A 196LA 2CUUA 1L11A 1L32A 167LA 144LA 4GRVA 1L93A 2RB1X 1L46A 4LDOA 1L35A 2L78A 1CU5A 1L26A 188LA 242LA 1JTNA 113LA 1G1WA 1C61A 3OE9A 2RB0X 2OE7X 1P3NA 1LYGA 182LA 1DYAA 4E97A 260LA 1L01A 245LA 2B74A 215LA 1C6CA 1T97A 3DN1A 3OE8A 4LZMA 1LI2A 3HH5A 1C69A 1L40A 1QTDA 237LA 4S0WA 3HDFA 4W59A 4DAJA 1QTCA 3G3VA 3NYAA 1P46A 2B75A 222LA 247LA 1PQOA 4ARMB 4I7OA 1P2LA 1L24A 212LA 149LA 1D3FA 2OTZX 2O7AA 3DNAA 152LA 1DYGA 3SBBC 1L31A 129LA 1P37A 3FA0A 1SX2A 216LA 171LA 1G0LA 255LA 1QTBA 2RBRA 1L56A 2HUMA 181LA 2NTGA 1P6YA 3GUOA 3GUMA 145LA 1L30A 1LYDA 1C6DA 1L94A 1C63A 2B7XA 3V2WA 4LDLA 2LZMA 2IGCA 4YXCA 104LA 223LA 2LC9A 2B73A 2RH1A 2RAYX 1L41A 1CU2A 165LA 3SB5A 1CX7A 1QUDA 3HWLA 1G06A 4W56A 1QUGA 1L66A 3L64A 168LA 1CUQA 3PDSA 243LA 1KW7A 139LA 1L10A 3SB8A 2OE4X 250LA 1NHBA 122LA 1D9WA 236LA 1L53A 1L73A 1OVJA 1C66A 1CTWA 1L08A 1L0JA 1L89A 191LA 1C6NA 1L87A 1KNIA 3GUKA 2RBSA 3F9LA 1T8FA 3GUIA 1QT5A 251LA 128LA 4I7QA 1G0PA 3HTFA 227LA 148LE 160LA 1OV5A 2B6YA 2B70A 6LZMA 1L99A 1L17A 189LA 1L19A 1SX7A 1C67A 1QUOA 3C8RA 3C8QA 1L36A 3HH4A 1L27A 158LA 1L16A 1D2YA 138LA 1L05A 1L21A 1XEPA 1C6TA 3GUNA 1CUPA 1L79A 3DMVA 1CU0A 110LA 4PJZA 4W55A 4ARLA 244LA 219LA 143LA 2OE9X 3HUQA 1L06A 175LA 1L48A 1L88A 228LA 2A4TA 4ARQA 137LA 1P64A 4DJHA 211LA 233LA 1L59A 3C7YA 231LA 3DN6A 1L77A 1L98A 3DKEX 2RBQA 1L28A 1C60A 1QT6A 2RBNA 1C6MA 3LZMA 3DN8A 3NY8A 2B6ZA 3RZEA 1L54A 1JTMA 108LA 1L63A 1L00A 3HUAA 229LA 3K2RA 4W57A 241LA 4EKPA 2OTYX 1QSBA 1ZWNA 1C6QA 248LA 254LA 4W58A 162LA 1L47A 4I7LA 156LA 1LPYA 1QTHA 1L82A 115LA 2OU9A 1CVKA 1P2RA 262LA 218LA 2ANXA 4EPIA 4W51A 3HU8A 1OV7A 2RAZX 3SB9A 166LA 174LA 1G0MA 1XJTA 3V2YA 177LA 3UONA 4I7JA 1L52A 213LA 3HT8A 3GUPA 3C7ZA 200LA 1DYEA 1L14A 224LA 3OE0A 4I7NA 1L55A 1L25A 1G0JA 1T6HA 252LA 141LA 4I7RA 3DN0A 217LA 1QT4A 2B72A 130LA 1P5CA 225LA 1CU6A 1G07A 1L18A 3G3WA 1KW5A 2QB0B 1L20A 3G3XA 147LA 1LYFA 4I7MA 3HTBA 1L57A 4ARQB 206LA 1DYDA 1L13A 1L42A 1L62A 1L34A 176LA 4I7SA 1L49A 1L58A 131LA 246LA 1PQKA 1C64A 3RUNA 4EKRA 1C6PA 1CU3A 1L76A 232LA 185LA 1C6KA 1SSWA 2NTHA 198LA 1L61A 1L95A 253LA 3GUJA 2Z6BA 1L64A 1QT7A 3CDVA 170LA 201LA 1C6JA 1LW9A 120LA 1L50A 146LA 3HT7A 2OU0X 180LA 183LA 103LA 4ARJA 1L70A 1L96A 1C6GA 1PQJA 1DYBA 230LA 2O4WA 1LWGA 1LYIA 1T8GA 4I7KA 1L02A 1L09A 1PQMA 1CV4A 1G0QA 1L68A 1TLAA 1P56A 1G0GA 249LA 259LA 1D2WA 199LA 1C65A 4EXMA 1OVHA 1SWYA 1L60A 2ANVA 3SBAA 1L12A 1QT8A 2F32A 209LA 2F2QA 220LA 1LWKA 3HH3A 1OWZA 2HUKA 107LA 4OO9A 3F8VA 3DMXA 1P7SA 1LGWA 123LA 172LA 192LA 1ZURA 3HTDA 1L03A 1CV1A 1CV5A 3C7WA 5I14A 1I6SA 3PBLA 1CV0A 187LA 3EMLA 2Q9EA 3SB7A 127LA 1L71A 4EKSA 1L80A 3HU9A 3C82A 1EPYA 1C6IA 4I7PA 2HULA 3SB6A 1PQDA 1ZYTA 2O79A 1L29A 1PQIA 1OWYA 184LA 109LA 238LA 1L81A 1C6EA 3ODUA 155LA 1JQUA 1L67A 4YX7C 1OVKA 2B6XA 1L83A 235LA 164LA 151LA 1KS3A 3FI5A 1QSQA 111LA 3CDRA 1K28A 1C6LA 1C68A 3HTGA 221LA 2LCBA 1L74A 1QTZA 186LA 1L86A 2Q9DA 1L97A 1L22A 1L15A 2B6WA 1C6HA 190LA 3QAKA 1D3JA 1L39A 178LA 3SN6R 7LZMA 3L2XA 234LA 2RBPA 4AQNA 4W52A 159LA 1LYJA 197LA 4W53A 258LA 1KY0A 1L37A 4I7TA 2OEAX 3C81A 4GBRB 1L72A 1LI3A 1SWZA 126LA 3CDQA 1LI6A 5LZMA 3CDOA 1L45A 173LA 1L69A 1L65A 261LA 112LA 4ARPA 3HH6A 114LA 3C83A 2QARC 1CV6A 4EPFA 1L92A 1L44A 3C8SA 205LA 142LA 3OE6A 1KY1A 1B6IA 1C62A 1QTVA 3HDEA 1CX6A 1L43A 3DN4A 102LA 1T8AA 3C80A 1L07A 3HUKA 2F47A 3JR6A 1QS9A 1LYEA 210LA 1D3MA 3NY9A 1C6FA 1QUHA 4DKLA 1G1VA 4LDEA 1C6BA 4ARMA 4K5YA 4W54A 1OYUA 1QS5A 1LGUA 1L23A 257LA 3CDTA 163LA 1SSYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IOCA 1B7LA 3AGGG 5K7OA 157LA 4O34A 1AT6A 2OU8A 4P2EA 4PK0A 1C10A 1D3NA 4ZPUA 2YBJA 1GE2A 5F81A 4WMGA 1QT3A 1LMPA 1GB6A 1LHKA 2BQJA 1UIHA 4DDBA 1L0KA 2Z38A 1LZBA 2HU3A 239LA 3WMKA 3D4SA 125LA 1YAPA 4DD0A 1L32A 144LA 2BQIA 3W6AA 1L93A 1L35A 3WW6A 188LA 4IATA 3HBEX 1IC5Y 1OUIA 4NEBA 1G1WA 1LYGA 1DYAA 1T6VL 3GXKA 260LA 2B74A 3FE0A 1T97A 4LZMA 3AGHA 1LI2A 1C69A 1L40A 4NFVA 1GF3A 4S0WA 1EQ5A 4DAJA 3G3VA 1LSAA 4ARMB 4I7OA 4N5RA 3A3QA 4PJ2C 4DQ5A 3J6KA 1D3FA 4BS7A 1B0DA 1OUJA 1JWRA 152LA 1GPQC 1DYGA 1NF5A 3EMSA 1IR9A 4BAFA 216LA 1G0LA 2RBRA 4J1AA 4ZIXA 2BQFA 1HEQA 1DI5A 1CKFA 1LMNA 1WTMA 4DQ7A 1XGPC 3SP3A 4LDLA 2LZMA 1KXYA 4OWEA 2DBTA 1PS5A 1VDPA 1HNLA 1YILA 2RH1A 4ML7A 4XENA 1CU2A 3SB5A 1CX7A 1LJIA 1QUDA 1QUGA 1L66A 1KW7A 139LA 1LJGA 2A7DA 2I6ZA 250LA 1D9WA 1GFHA 1GB9A 1L53A 1L73A 4NY5A 1OVJA 2MEGA 1L08A 1CTWA 1L0JA 191LA 1C6NA 6LYTA 1YKYX 4X3BA 2LHMA 1YAMA 1JITA 1QT5A 3CSZA 3GUIA 3W3EA 1GFGA 1LSBA 3TXFA 3HTFA 3ZVQA 1QDTA 5B07A 148LE 2B6YA 1TAYA 3EO5A 1L99A 4NWHA 2A7FA 189LA 1F0WA 4WLYA 1L36A 1L27A 3AW6A 3G3AB 1D2YA 138LA 1L21A 1C6TA 4HPEA 1LZ6A 3A3RX 4OOTA 1FKQA 1L06A 4NHIA 4ARQA 2HEDA 5FHWA 3AZ5A 233LA 1L59A 2Z12A 231LA 1GF8A 4NSJA 2RBQA 1XEIA 3LZMA 2B6ZA 4MSTA 2BQNA 1WQQA 229LA 1HENA 1FKVA 241LA 3A67Y 4EKPA 2OTYX 1DPWA 5LVIA 1C6QA 3A95A 3D9AC 5HLLA 4W58A 156LA 3WULA 1LHJA 2OU9A 1P2RA 218LA 1SQ2L 2ANXA 1GF4A 4NGWA 4W51A 1IWUA 3A96A 166LA 1G0MA 1XJTA 2YBMA 3GUPA 4NG1A 4DD3A 4PRUA 1BB5A 1DYEA 1L14A 224LA 2BQHA 1L25A 1G0JA 2VB1A 4CGEA 1HFYA 3TMXA 4XN6A 2B72A 130LA 1I56A 225LA 2HECA 2YVBA 2BQBA 1YROA 3G3XA 4I7MA 3P65A 1L57A 1FLYA 1JSEA 4H92A 1PQKA 3RUNA 4EKRA 1C6PA 4GN5C 185LA 1GB5A 1LYOA 1C6KA 5L3HA 1BB4A 3GUJA 2Z6BA 4LT2A 3CDVA 5DN5A 4XYYA 4LYTA 5LINA 1L70A 1B5ZA 2O4WA 4NHPA 1LWGA 2YBIA 1T8GA 4I7KA 1L09A 1IOQA 4H9EA 1G0QA 1L68A 4LT3A 4HV2A 199LA 5FCPA 4HJYA 3RT5X 5IELA 1ZV5L 4B49A 2Z2EA 4DYGA 2NWDX 209LA 4GLAA 1LHIA 1UIGA 1D9UA 192LA 1L03A 4NGYA 5I14A 3PBLA 4GLVA 3HBHA 1LMQA 4EKSA 1JKAA 1LZ1A 1LZSA 3A91A 3ULRA 2H5ZA 1EPYA 2DQDY 4Z3MA 1VFBC 2HEBA 4N9RA 1ZYTA 3SB6A 1GEVA 1GB2A 1GB7A 5KXSA 1C6EA 1T3PA 155LA 1CJ9A 3CSQA 1OUCA 1L67A 3CQLA 2B6XA 1AT5A 3AZ4A 1CKHA 3FI5A 1QSQA 1C68A 2F30A 221LA 1HF4A 5KXLA 2MEFA 3B72A 3RZ4A 178LA 4AQNA 159LA 1LYJA 4W53A 258LA 2D4KA 4I7TA 3B0KA 1LZEA 2F4AA 1HEWA 1LHLA 2G4PA 7LYZA 1LI3A 1LZ5A 1SWZA 5FDJA 4G4HA 1BWHA 1LI6A 1IR8A 1LJ4A 3CDOA 1G7IC 1CKGA 4NGJA 1L44A 1UACY 205LA 142LA 5LVJA 4HP0A 1B6IA 1C62A 5KXZA 2LYMA 4H9HA 4NHTA 5HMJA 3VWOA 1WQOA 1VAUA 1GF7A 1HMKA 1YKXX 3C80A 3TXHA 3HUKA 1LYEA 1GF0A 1QUHA 2C8OA 4WM1A 1OUFA 4K5YA 257LA 1SSYA 1NBYC 3A94A 1GE4A 1FBIX 2B6TA 1LLHA 1L84A 4B4JA 214LA 4B4IA 1LYHA 4DT3A 4OWHA 2DQAA 1P36A 3FADA 4LYOA 1L51A 1IP7A 8LYZA 2RB2X 1L90A 5B05A 1L85A 5LYTA 4EJ4A 4CHXA 1LSPA 195LA 3A34A 4ETBA 1LGXA 2MEHA 1AM7A 3DMZA 4EKQA 2ZIJA 1NDGC 1WTHA 1GE3A 5D5FA 1L91A 4XJFA 2EIZC 1BVKC 4LDOA 1JTPL 2L78A 5KY1A 1LCNA 2IHLA 1C6CA 4GCBA 1JEFA 1GF6A 2ZYPA 3DN1A 5HNLA 1IX0A 2Z18A 1W6ZA 2B75A 2W1LA 1D6PA 1LKRA 1IWYA 1BWIA 1PQOA 5F9UA 4LYCA 1IWVA 2CWIA 2OTZX 2O7AA 1LHMA 5HMVA 3WH1A 129LA 1UIEA 3FA0A 1SX2A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1IOC A;  1B7L A;  3AGG G;  5K7O A;  157L A;  4O34 A;  1AT6 A;  2OU8 A;  4P2E A;  4PK0 A;  1C10 A;  1D3N A;  4ZPU A;  2YBJ A;  1GE2 A;  5F81 A;  4WMG A;  1QT3 A;  1LMP A;  1GB6 A;  1LHK A;  2BQJ A;  1UIH A;  4DDB A;  1L0K A;  2Z38 A;  1LZB A;  2HU3 A;  239L A;  3WMK A;  3D4S A;  125L A;  1YAP A;  4DD0 A;  1L32 A;  144L A;  2BQI A;  3W6A A;  1L93 A;  1L35 A;  3WW6 A;  188L A;  4IAT A;  3HBE X;  1IC5 Y;  1OUI A;  4NEB A;  1G1W A;  1LYG A;  1DYA A;  1T6V L;  3GXK A;  260L A;  2B74 A;  3FE0 A;  1T97 A;  4LZM A;  3AGH A;  1LI2 A;  1C69 A;  1L40 A;  4NFV A;  1GF3 A;  4S0W A;  1EQ5 A;  4DAJ A;  3G3V A;  1LSA A;  4ARM B;  4I7O A;  4N5R A;  3A3Q A;  4PJ2 C;  4DQ5 A;  3J6K A;  1D3F A;  4BS7 A;  1B0D A;  1OUJ A;  1JWR A;  152L A;  1GPQ C;  1DYG A;  1NF5 A;  3EMS A;  1IR9 A;  4BAF A;  216L A;  1G0L A;  2RBR A;  4J1A A;  4ZIX A;  2BQF A;  1HEQ A;  1DI5 A;  1CKF A;  1LMN A;  1WTM A;  4DQ7 A;  1XGP C;  3SP3 A;  4LDL A;  2LZM A;  1KXY A;  4OWE A;  2DBT A;  1PS5 A;  1VDP A;  1HNL A;  1YIL A;  2RH1 A;  4ML7 A; 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