1QT6A

E11h mutant of t4 lysozyme
Total Genus 60
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
60
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDHGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords PROTEIN (T4 LYSOZYME)
publication title Structural basis of the conversion of T4 lysozyme into a transglycosidase by reengineering the active site.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 60
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1qt6A00
1P5CA 1D2WA 3OE8A 2LC9A 1L25A 2A4TA 1D3JA 1L55A 1LYFA 1T8FA 3DMXA 3HTDA 1L52A 1OVJA 1KW7A 2OU9A 169LA 1LW9A 2Z6BA 1G0GA 1L62A 227LA 4DJHA 1L72A 1TLAA 1CU0A 3GUPA 1C6DA 1T8GA 1PQIA 3HT8A 4I7JA 2CUUA 3D4SA 4I7PA 4ARJA 1QS5A 246LA 1L06A 2F32A 1L51A 1L64A 1DYEA 1L83A 3GUOA 4W55A 1CU6A 1C6FA 1KY0A 1QTZA 1C67A 1C6LA 1L84A 165LA 3HU8A 180LA 4LDOA 229LA 1L21A 2RAZX 3FA0A 2HUKA 199LA 187LA 1P64A 1L76A 1L40A 242LA 1G0KA 159LA 1L48A 236LA 3SB7A 163LA 1LWKA 1CU3A 1L20A 233LA 211LA 1LGXA 255LA 1QS9A 1LPYA 226LA 1CV5A 181LA 1L77A 1OVKA 1QSBA 172LA 1L15A 143LA 1C6HA 1PQKA 129LA 1QT7A 149LA 155LA 1LYDA 1CVKA 104LA 1SSYA 3RZEA 1G1VA 3GULA 1PQDA 2OU8A 3HTFA 1CV3A 1CV0A 249LA 130LA 184LA 1LYIA 1KNIA 2O7AA 2RBNA 1L30A 1C69A 1QTCA 1L14A 1L11A 1L65A 232LA 1L66A 3F9LA 1QTVA 1C6PA 4PK0A 113LA 3DN0A 1L18A 4EKQA 1OVHA 1QUGA 2HULA 1NHBA 2Q9DA 3HU9A 1L46A 4PJZA 176LA 1C68A 4W54A 3DN2A 170LA 198LA 1P3NA 4EPIA 3JR6A 2RB1X 1L45A 4OO9A 205LA 178LA 3CDQA 252LA 1C65A 3HWLA 126LA 238LA 221LA 1L67A 4I7KA 2RBRA 3C7ZA 1L95A 1CX6A 1L47A 141LA 1L61A 162LA 1P36A 2O4WA 4ARLA 2NTGA 109LA 3HT7A 1L38A 2RH1A 1C6BA 225LA 3C83A 164LA 3EMLA 2OEAX 1L35A 239LA 3HH6A 171LA 3OE0A 1B6IA 1D9WA 1PQOA 1L04A 2ANVA 3SN6R 1L49A 1P2RA 156LA 186LA 224LA 240LA 4W58A 1DYAA 139LA 3HH3A 1T97A 166LA 2NTHA 2IGCA 248LA 3HUAA 1OV7A 4W59A 1C61A 188LA 250LA 257LA 2B7XA 112LA 1LI2A 1T8AA 4ARQA 1JTNA 3C8QA 3HDEA 108LA 3C7YA 1LYHA 4ARMA 1P7SA 3OE6A 1G07A 103LA 1L32A 218LA 4EKRA 185LA 1L27A 217LA 1QT8A 1JQUA 160LA 1L69A 3C82A 1QUOA 4W56A 3CDOA 1L23A 230LA 261LA 1L94A 2B6ZA 3NY9A 1G0PA 3GUJA 177LA 3HTBA 4W52A 3QAKA 1L60A 1L0JA 262LA 115LA 1L58A 128LA 2B6YA 3DMVA 206LA 1XJTA 2OE7X 1CV4A 1L08A 3V2WA 1PQMA 1LYGA 3GUKA 220LA 2RBSA 1DYBA 1C66A 1C6EA 214LA 1L16A 3NYAA 140LA 1L71A 1OWZA 2F47A 1QT3A 2Q9EA 1L81A 1K28A 5LZMA 2B73A 173LA 1L50A 4I7TA 2B6TA 1D3MA 1L54A 1C6GA 1L85A 2RAYX 1G06A 1CTWA 148LE 1L63A 4I7QA 201LA 1C6IA 174LA 4I7OA 228LA 3V2YA 158LA 1L93A 1D2YA 1L96A 1QTHA 3DMZA 4E97A 1DYGA 1QSQA 244LA 2B74A 4IAPA 1CX7A 2B72A 151LA 190LA 1L92A 6LZMA 167LA 1L87A 223LA 1LI6A 144LA 1LWGA 1OYUA 1L03A 3CDTA 3L2XA 3L64A 4GBRB 4I7RA 243LA 4EKSA 1C6QA 4EPFA 212LA 1L07A 1EPYA 1CV6A 2RBQA 1PQJA 3DN3A 1L41A 1LGWA 1KW5A 4EXMA 245LA 1L37A 1L82A 1L74A 1G0QA 1L70A 168LA 175LA 1L43A 1P2LA 3FI5A 2QARC 1ZWNA 4YX7C 3SB6A 1C6NA 3C8SA 1I6SA 4W57A 3VW7A 1C62A 1L73A 1L05A 1L89A 3F8VA 1SSWA 1XEPA 253LA 3HUQA 1CUPA 2L78A 2F2QA 2QB0B 1L24A 4I7NA 2OTZX 3SB9A 1P6YA 3LZMA 3G3WA 150LA 2RB2X 1L26A 3FADA 1KY1A 3DKEX 3K2RA 114LA 260LA 110LA 4S0WA 1L90A 2B75A 4YXAC 1C64A 102LA 241LA 2OTYX 4W51A 183LA 200LA 1L98A 1CU5A 3HUKA 4LDEA 3HT6A 2ANXA 1L75A 3DNAA 258LA 2HUMA 3OE9A 1L68A 1L17A 1L88A 197LA 1C6CA 3GUNA 1L97A 251LA 1L12A 4LZMA 1G0JA 1L00A 1C60A 3DN6A 118LA 1P56A 3RUNA 3HT9A 1QTDA 1L09A 1SWZA 3PDSA 1P37A 3C80A 1QT5A 3PBLA 4K5YA 222LA 3DN1A 1L31A 3HH4A 3HH5A 3SB5A 1L56A 1L29A 213LA 209LA 259LA 1DYFA 3SB8A 219LA 3HTGA 4I7MA 1C6KA 147LA 7LZMA 1L44A 107LA 138LA 1L36A 1SWYA 1LLHA 120LA 256LA 4EKPA 3GUIA 4DAJA 2LZMA 1L22A 210LA 4I7LA 3DN8A 142LA 1L86A 1L91A 1CU2A 2OE9X 1C63A 4DKLA 189LA 254LA 4W53A 1L39A 1T6HA 1P46A 4ARQB 157LA 2RBPA 111LA 1OWYA 196LA 4ARMB 1L80A 5I14A 1WTHA 1L59A 1QUDA 1L10A 1C6AA 1L34A 1QT6A 4GRVA 119LA 1ZURA 1SX2A 3C81A 1DYCA 216LA 3ODUA 2B6WA 1L53A 247LA 131LA 192LA 195LA 1DYDA 4ARPA 1L0KA 1CUQA 2B70A 235LA 231LA 1D3FA 1L57A 1C6JA 1L01A 237LA 1L42A 215LA 145LA 152LA 1XJUA 122LA 2O79A 2OE4X 4I7SA 182LA 1OV5A 4YXCA 1L19A 1LYJA 2RBOA 3HDFA 1LGUA 146LA 4AQNA 4ZPUA 1LI3A 1L79A 1JTMA 1C6TA 234LA 1QUHA 1KS3A 1LYEA 3SBBC 4EJ4A 3GUMA 3UONA 1CV1A 3DN4A 161LA 4LDLA 1G0LA 3SBAA 3NY8A 1L28A 3C7WA 1ZYTA 2OU0X 2LCBA 1D3NA 127LA 1G0MA 3G3XA 1L99A 137LA 123LA 1SX7A 1L13A 125LA 1G1WA 3C8RA 2RB0X 3CDRA 1L33A 1C6MA 3G3VA 2B6XA 1QTBA 1QT4A 191LA 1L02A 3CDVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3P68A 3TXFA 1D2WA 2W1MA 2A4TA 3DMXA 1L52A 4N1CC 1B5ZA 2MEGA 5FDJA 2Z6BA 2H9KA 1GAYA 3T6UA 1LSYA 1O23A 1CU0A 4B1AA 3D4SA 4WL6A 1LMPA 2LZ2A 1QS5A 1L06A 1CKCA 5II3A 4NHTA 4TSCA 2Z2EA 1L83A 4W55A 1QTZA 1C6LA 4ETEA 180LA 229LA 3FA0A 1UC0A 5HNLA 199LA 1L40A 242LA 4HTNA 5APDA 236LA 1LWKA 233LA 3WUMA 1LGXA 1QS9A 1GFAA 2LYZA 181LA 1OVKA 1L15A 4WOAA 1JKDA 149LA 2CGIA 3AYQA 4LYBA 1IR9A 5KY1A 1XSFA 104LA 1G1VA 3SP3A 1PQDA 5I4YA 2DQDY 3HTFA 5LAGA 2RBNA 1L30A 1QTCA 1QIOA 1JIYA 1L11A 1D0KA 4EOFA 2G4NA 4MCKA 4LZTA 1LZYA 5APFA 1HFXA 5KXKA 2I6ZA 4EKQA 3ATOA 5C6IA 1QUGA 1LZDA 4FDYA 2BQBA 2CJLA 1L46A 4PJZA 4WL7A 1GBSA 2YBHA 198LA 4NHPA 1B7SA 4BAPA 1L45A 1LZTA 4ZIXA 205LA 3A6BY 178LA 193LA 1IOQA 3AGHA 221LA 1L67A 1L95A 1D0MA 4LYZA 141LA 2BQEA 1IWVA 1L61A 4WLDA 3A90A 4NEBA 4CFOA 153LA 207LA 3HT7A 1G7MC 3CSZA 3OJPA 1UIDA 2FBDA 3C83A 4LT1A 1L35A 239LA 1LZ6A 1DZBX 4XJDA 3A8ZA 2NWDX 1B6IA 4NGIA 2Q0MX 1PQOA 3SN6R 5KKJA 5AMYA 1DI4A 224LA 1OP9B 1DYAA 2N5ZA 1IWTA 1D9UA 3N9AA 2NTHA 2IGCA 4IASA 4W59A 1WQQA 257LA 1HEMA 1T8AA 1LSGA 5M1YA 1HEOA 1L32A 4EKRA 1OUHA 1L27A 2W1YA 1JJ1A 3OK0A 4MR1A 1OUBA 2D4IA 2VB1A 3CDOA 135LA 1LHJA 2BQMA 5IDDA 1BQLY 3ULRA 1FKQA 5KXSA 3AZ7A 3HTBA 3RW8A 1L60A 4M6DA 262LA 115LA 4OW1A 2B6YA 5FSTA 2BQHA 1NBZC 3V2WA 1GF3A 3GUKA 4DDAA 4H9HA 3NYAA 1HEQA 4ET9A 3TXEA 5IELA 1QT3A 4NGKA 4PRQA 1L85A 2G4PA 1IX0A 2LHMA 2FYCA 1CTWA 148LE 1VAUA 174LA 4NHSA 1LPIA 1JSFA 1L93A 1DYGA 5LA5A 167LA 1LI6A 1OYUA 4FJRA 3EBAB 1L03A 3L64A 4I7RA 212LA 1WQMA 5KXOA 3DN3A 4OWAA 4G49A 1LYYA 2FYDA 1GBYA 4ETAA 2YBMA 3LYMA 5KXXA 3SB6A 1L05A 1A2YC 4Z98A 1LMNA 1GPQC 3F8VA 3CQLA 1FLYA 4DD0A 1SSWA 1LSMA 1HMKA 3HUQA 3A34A 1LZSA 2F2QA 2OTZX 1P6YA 3LZMA 3ZVQB 150LA 3DKEX 4I0CA 260LA 110LA 4S0WA 4XADA 4NSGA 2B75A 4YXAC 3WXTA 1LZAA 2BQJA 3P66A 2OTYX 4W51A 4HJYA 1LJHA 2BLYA 3HUKA 3HT6A 1UICA 1B7LA 2DQFC 1KIRC 3DNAA 3OE9A 1UIAA 1L88A 1C6CA 3GUNA 5B05A 4LZMA 2HUBA 1C60A 4G9SA 1GXXA 3RUNA 4CGEA 3WULA 1L09A 1P37A 2XBSA 222LA 3HH4A 3HH5A 1CJ6A 4B4EA 4DD7A 209LA 259LA 2CDSA 3W6FA 1F6SA 3TMWA 3HTGA 1C6KA 1D6QA 1XGRC 1YKYX 120LA 4EKPA 5B1FA 4C5FA 3GUIA 1HF4A 1JHLA 189LA 1BWIA 4WM5A 1L39A 2LYOA 1HNLA 3TMVA 5E4PA 5DLAA 1OWYA 5F16A 4ARMB 1L80A 4GN5C 4J7VA 4OWEA 1C6AA 4YOPA 1E8LA 1HELA 1ZURA 1IP4A 1LJKA 1SX2A 3ODUA 131LA 4ARPA 2RSCA 2B70A 235LA 1WQPA 1L57A 1FBIX 2IFFY 1NKHA 1LJ3A 4H9EA 1QUSA 1XJUA 2O79A 4I7SA 1BWJA 1YAPA 1OV5A 1G7IC 2HEEA 1IP6A 146LA 5I53A 4ZPUA 1L79A 1JTMA 4WG7A 234LA 4WO9A 1IWYA 1QUHA 2C8OA 1LYEA 1GB7A 3DN4A 1HFYA 1OUCA 4XJGA 1RI8B 3WXUA 3C7WA 2OU0X 2LCBA 2DQEY 1G0MA 1CJ9A 3G3XA 137LA 4U3XB 1B5UA 5A3ZA 1L13A 1FLUA 125LA 4DDBA 3CDRA 1L33A 3GXRA 1L02A 1LMAA 1L55A 3HTDA 1EL1A 4N5RA 5APEA 1OVJA 2YDGA 2OU9A 1L62A 1TLAA 1C6DA 1T8GA 1LZGA 4DQ7A 2CUUA 4I7PA 246LA 4GCFA 1L51A 1LYZA 1CU6A 1C6FA 1JJ3A 1C67A 134LA 2RAZX 1VDSA 1XEKA 2C8PA 4UWVA 187LA 4RDSA 1P64A 3B72A 1G0KA 4YEOA 4NGVA 154LA 1LHMA 1CU3A 1GF9A 3TXDA 1YROA 1GE4A 1LPYA 1LZ4A 4G4HA 4X3BA 1L77A 1QSBA 143LA 1QT7A 155LA 2HU1A 1CVKA 4NGJA 1SSYA 2F4AA 4B49A 3RZEA 4H92A 2OU8A 1VATA 2BAAA 2BQNA 3P64A 2BQFA 1EQ5A 3TXHA 184LA 1GDXA 1B0DA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 3P68 A;  3TXF A;  1D2W A;  2W1M A;  2A4T A;  3DMX A;  1L52 A;  4N1C C;  1B5Z A;  2MEG A;  5FDJ A;  2Z6B A;  2H9K A;  1GAY A;  3T6U A;  1LSY A;  1O23 A;  1CU0 A;  4B1A A;  3D4S A;  4WL6 A;  1LMP A;  2LZ2 A;  1QS5 A;  1L06 A;  1CKC A;  5II3 A;  4NHT A;  4TSC A;  2Z2E A;  1L83 A;  4W55 A;  1QTZ A;  1C6L A;  4ETE A;  180L A;  229L A;  3FA0 A;  1UC0 A;  5HNL A;  199L A;  1L40 A;  242L A;  4HTN A;  5APD A;  236L A;  1LWK A;  233L A;  3WUM A;  1LGX A;  1QS9 A;  1GFA A;  2LYZ A;  181L A;  1OVK A;  1L15 A;  4WOA A;  1JKD A;  149L A;  2CGI A;  3AYQ A;  4LYB A;  1IR9 A;  5KY1 A;  1XSF A;  104L A;  1G1V A;  3SP3 A;  1PQD A;  5I4Y A;  2DQD Y;  3HTF A;  5LAG A;  2RBN A;  1L30 A;  1QTC A;  1QIO A;  1JIY A;  1L11 A;  1D0K A;  4EOF A;  2G4N A;  4MCK A;  4LZT A;  1LZY A;  5APF A;  1HFX A;  5KXK A;  2I6Z A;  4EKQ A;  3ATO A;  5C6I A;  1QUG A;  1LZD A;  4FDY A;  2BQB A;  2CJL A;  1L46 A;  4PJZ A;  4WL7 A;  1GBS A;  2YBH A;  198L A;  4NHP A;  1B7S A;  4BAP A;  1L45 A;  1LZT A;  4ZIX A;  205L A;  3A6B Y;  178L A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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