1QT7A

E11n mutant of t4 lysozyme
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDNGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords PROTEIN (T4 LYSOZYME)
publication title Structural basis of the conversion of T4 lysozyme into a transglycosidase by reengineering the active site.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1qt7A00
249LA 1QT4A 1G0LA 1SWZA 1C6IA 1D3JA 2OTYX 1C65A 4GRVA 1C6KA 2RBSA 2O4WA 1L28A 1L65A 198LA 212LA 3C8RA 1L44A 2RAYX 1L11A 3SB9A 3EMLA 2F2QA 2B6XA 2O79A 1L58A 6LZMA 1DYFA 188LA 119LA 1L08A 1QSBA 1T8FA 2Q9DA 4W53A 191LA 2OE4X 4W56A 3HUKA 1G07A 113LA 2OE9X 1KY0A 130LA 1QT7A 1L95A 1QTZA 1QTCA 4I7JA 4EKPA 256LA 3HU8A 1L96A 3SBAA 173LA 1I6SA 1T6HA 1L32A 1JTNA 1DYBA 1L26A 214LA 4W51A 156LA 1L43A 2OU9A 3OE8A 2L78A 1L0KA 4ARMB 1L50A 1L25A 3DN8A 1L86A 4LDLA 1C64A 1QT5A 1KNIA 3FA0A 1L68A 219LA 1G0PA 1C6LA 2CUUA 3HH5A 1L17A 199LA 1OWZA 4EJ4A 1CTWA 1C6EA 1L53A 2B70A 3NYAA 2RB0X 157LA 4GBRB 4LDEA 4ARQB 1L34A 1CU3A 1C68A 1L00A 3CDQA 1XEPA 231LA 1CV6A 4K5YA 1C6NA 1D3MA 4ARLA 1QTHA 218LA 210LA 2LC9A 158LA 165LA 3L2XA 217LA 104LA 1ZYTA 1L09A 1L60A 200LA 163LA 3K2RA 4I7KA 1CU0A 1L36A 1SX2A 185LA 1L82A 3HT9A 1LPYA 2LCBA 190LA 1L07A 2Q9EA 4ZPUA 1C6AA 1L15A 3DMVA 181LA 1L79A 1L51A 1LI6A 1OVHA 1LWKA 228LA 1JTMA 4I7TA 170LA 1QUDA 1L01A 2B6YA 1C62A 1L57A 1L85A 245LA 4EPIA 3HTFA 1P56A 3L64A 1C6FA 1C6CA 180LA 1QTDA 114LA 4EKQA 3HDFA 222LA 2B6TA 5I14A 1L61A 1L89A 1CVKA 1L06A 1DYCA 1L20A 1L37A 4AQNA 1L97A 183LA 4DAJA 1PQMA 1QS9A 4EPFA 2OU8A 1C6JA 4ARMA 102LA 1SX7A 3GUNA 251LA 159LA 1L81A 4I7MA 236LA 229LA 3CDVA 1LGWA 112LA 257LA 3HTBA 3PDSA 1G0KA 3G3XA 1L70A 4ARQA 3HT8A 3C81A 186LA 253LA 1T8GA 1PQIA 1OYUA 3V2WA 176LA 1L30A 3PBLA 138LA 4PJZA 3VW7A 107LA 141LA 111LA 3GUKA 2HUMA 1L76A 1OV5A 167LA 1D2WA 3C8QA 1G0GA 1L40A 2LZMA 2RBNA 110LA 3F8VA 3CDOA 148LE 1L99A 1LWGA 3G3WA 1DYEA 1C61A 1ZURA 2HULA 1DYGA 172LA 1KW7A 1L66A 1C6HA 4YX7C 1L24A 1L87A 1LI3A 1PQKA 240LA 3HT6A 164LA 2B72A 1EPYA 246LA 1CX7A 4PK0A 2ANVA 1OVKA 1CV0A 1K28A 1L77A 1QT8A 248LA 3RZEA 211LA 2RAZX 128LA 1CUPA 2QB0B 5LZMA 223LA 1L04A 152LA 3UONA 1L39A 131LA 109LA 1L41A 1L35A 3DN0A 1LYEA 3QAKA 1L74A 118LA 3HH3A 1B6IA 155LA 1G0QA 3SB8A 1L10A 4I7QA 1L80A 224LA 1L46A 3C82A 1LYHA 3RUNA 1P5CA 1T97A 1L64A 2F32A 3F9LA 1L21A 3GUOA 1L02A 3HDEA 235LA 255LA 2NTHA 3DN6A 2A4TA 1L55A 1L90A 1C6TA 126LA 3FI5A 1L38A 1L84A 2HUKA 1L14A 3LZMA 1L29A 230LA 3DNAA 1LYIA 1LGUA 1P3NA 1QT3A 1L0JA 3GULA 1L59A 2OEAX 1P36A 3CDTA 127LA 1C6DA 1QT6A 234LA 1D9WA 3DN4A 4W55A 1L69A 3GUJA 149LA 4W57A 3NY9A 205LA 226LA 2B75A 3DN1A 1L91A 147LA 1QUHA 4ARJA 1L71A 1L13A 195LA 2OTZX 3SBBC 1G06A 4W54A 196LA 239LA 233LA 1C69A 227LA 221LA 241LA 3GUPA 1L49A 143LA 175LA 1CU6A 2RBRA 4I7OA 2Z6BA 1C66A 197LA 4EKRA 189LA 1LYFA 4W58A 2NTGA 1L67A 1CX6A 1QUGA 238LA 2OE7X 1QS5A 129LA 146LA 1C63A 262LA 3NY8A 3HUAA 1L92A 3V2YA 4DKLA 182LA 4I7PA 209LA 2OU0X 243LA 1CV5A 220LA 1JQUA 4IAPA 108LA 3DMZA 184LA 216LA 3HTGA 3SB5A 1LYDA 2O7AA 3DN2A 1L54A 1L19A 1XJTA 3OE0A 1G1VA 3HT7A 1L16A 3SB6A 1L33A 160LA 1LYJA 1P2LA 4S0WA 1L73A 1PQJA 3G3VA 1L56A 1KW5A 3DKEX 1TLAA 3GUMA 4LZMA 3SN6R 261LA 142LA 1L45A 1L27A 1L98A 7LZMA 1XJUA 1C6MA 162LA 1L05A 2RBOA 1OVJA 1PQDA 1D2YA 1L31A 232LA 4W52A 177LA 1LLHA 192LA 4I7NA 140LA 171LA 4EXMA 225LA 3CDRA 1CUQA 1SSYA 1P64A 4YXAC 260LA 169LA 3HTDA 1D3NA 178LA 206LA 1CV4A 2RBQA 237LA 2B7XA 252LA 4LDOA 1L94A 4YXCA 258LA 1L52A 1L62A 2ANXA 1ZWNA 3C7ZA 115LA 1PQOA 1QSQA 1L75A 1LW9A 1DYDA 1SWYA 1L47A 1C6QA 1KS3A 4DJHA 3DN3A 3ODUA 247LA 1OWYA 244LA 254LA 3FADA 4I7LA 1L18A 1L03A 3D4SA 3C7YA 3C8SA 3GUIA 2B73A 1CU5A 2QARC 123LA 1G1WA 1L48A 1OV7A 213LA 1QTVA 125LA 242LA 2B6WA 3HWLA 259LA 137LA 1P7SA 161LA 3SB7A 2B74A 3HU9A 122LA 1CU2A 3DMXA 1P6YA 2B6ZA 1QUOA 2IGCA 2RB2X 1LI2A 4W59A 3C83A 1L88A 1L12A 2F47A 3JR6A 201LA 1NHBA 1SSWA 103LA 1LGXA 1P2RA 1T8AA 4OO9A 1DYAA 250LA 1CV3A 4E97A 2RB1X 3C7WA 1P37A 1L72A 3OE9A 4I7RA 166LA 1L22A 1WTHA 4EKSA 1G0MA 1C60A 1C6GA 1L23A 1KY1A 1G0JA 215LA 1C67A 1C6PA 1D3FA 1QTBA 4ARPA 1L63A 3HH6A 151LA 2RBPA 187LA 3HUQA 120LA 3OE6A 3HH4A 1L42A 150LA 174LA 2RH1A 4I7SA 139LA 1C6BA 144LA 1CV1A 1LYGA 3C80A 1L83A 1L93A 168LA 1P46A 145LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1QT4A 4QEQA 1IP1A 3TXIA 1D3JA 1NF5A 3RW8A 4BAFA 4GRVA 1YKXX 1CKCA 4ETDA 2O4WA 1LHIA 3AW6A 1BQLY 4H9HA 1BGIA 3EMLA 2F2QA 2O79A 1L58A 1L08A 2MEGA 4W53A 1IR9A 3B0IA 5LA5A 1HFXA 4HTNA 1XFPL 3J4GA 2DQFC 4EKPA 4PHIA 3HU8A 4GCCA 2DKVA 5IELA 1DKJA 2FYDA 1L32A 1JTNA 1G7IC 3CB7A 3WVXA 2OU9A 3OE8A 2RSCA 4N8ZA 4QGZA 1FKVA 1BVKC 1L25A 1CJ6A 1L86A 4H9AA 3W6BA 2H9KA 1LJJA 1BHZA 3FA0A 1G0PA 1OUGA 4DD0A 1LSFA 1NDMC 5FEKA 5KXYA 1L17A 3LYTA 199LA 1D6PA 1OWZA 4GBRB 1L53A 3NYAA 1CU3A 4B1AA 3CDQA 1D3MA 1QTHA 218LA 3OJPA 5I5QA 2LC9A 165LA 5DN5A 104LA 2XTHA 3HBEX 1LSPA 1WQOA 4I7KA 4NWEA 2IFFY 1SX2A 4LT0A 3HT9A 4W96A 1F10A 2LCBA 3CSZA 4ZPUA 1LHMA 1GBSA 1YL0X 1LJKA 2LHMA 1QUDA 1VATA 194LA 1C62A 1GFRA 245LA 3WYHA 4EPIA 1P56A 3P65A 2LYMA 2I25L 3ATOA 2F30A 2NWDX 5L9JA 1OUBA 2B6TA 2ZNWY 1ZV5L 4NG8A 1C46A 1L37A 1L97A 4DAJA 1A2YC 4DWXA 1C6JA 1SX7A 1KIPC 4U3XB 1HSWA 4YOPA 1B5YA 229LA 3CDVA 1LGWA 2BQMA 1JKDA 3PDSA 4WLXA 1LSYA 4LFPA 4R0FA 3C81A 253LA 1LAAA 1PQIA 1B5VA 5HMJA 176LA 107LA 3GUKA 4DC4A 5ILFA 1IOCA 2CWIA 4WL6A 1LJEA 4X3BA 2Z18A 3CT1A 4KPMA 3TXDA 3C8QA 1G0GA 1F6RA 3A6CY 4TX7A 2B5ZA 3D3DA 1REMA 2DQHY 5APEA 1LWGA 1DYEA 1IP7A 2MEHA 4DDAA 3EBAB 1C61A 1DYGA 4OWCA 1L87A 4NGZA 5LYMA 1FLWA 1HEMA 1EPYA 4PK0A 1K28A 5LA8A 3RZEA 2D6BA 211LA 2F4AA 2W1XA 4WM5A 128LA 1NMMA 1XGUC 1JSEA 3EO5A 1GFUA 152LA 3CSQA 131LA 109LA 1L35A 1LYEA 4TTDA 3P68A 1L74A 4NSHA 2I6ZA 1BWIA 1G0QA 3SB8A 2MEEA 4I7QA 2Y8PA 1LYHA 1T97A 3ZVQB 1B5ZA 2G4PA 1OUHA 1L21A 3HDEA 1IP2A 1OUDA 2BPUA 126LA 4OOTA 1L38A 2C8PA 230LA 1AT6A 1GWDA 1I20A 1QT3A 3GULA 3FI7A 3CDTA 127LA 1REZA 4RDSA 1JTPL 2DBTA 5LAFA 4CHXA 239LA 4LYTA 4NWHA 1BWHA 3D9AC 1LSZA 227LA 241LA 1B5WA 1XGTC 1WVVA 1GB7A 4LZTA 1D0LA 4WLYA 1LPIA 197LA 207LA 3B0KA 4HJVA 5I4XA 2NTGA 3P66A 4MSTA 129LA 146LA 262LA 1B7OA 1IEEA 5DN4A 5B1FA 2I26L 3V2YA 243LA 1HC0A 1CV5A 108LA 3DMZA 3ZVQA 216LA 1YAPA 1XJTA 1G1VA 4WOAA 2VB1A 3SB6A 1L33A 160LA 3AZ6A 1LYJA 1P2LA 4S0WA 1PQJA 1LMCA 3WPKA 1UIBA 1INUA 1GF3A 1L27A 1H87A 3TXGA 4ET9A 4DQ5A 1C6MA 1GF4A 1B5UA 1GXXA 4B0DA 1LZ4A 1ALCA 1JWRA 140LA 5I53A 4W94A 171LA 4GCFA 3A6BY 1CUQA 3SP3A 5HQ1A 1J1PY 2ZQ3A 1P64A 4YXAC 1B7MA 3WU9A 1UA6Y 3AZ4A 1CV4A 2RBQA 1L94A 3A93A 1L62A 1WQNA 1ZWNA 3LZ2A 4NHIA 3C7ZA 1LW9A 1L47A 1KS3A 1GE0A 1BB5A 1IOSA 1OWYA 4NGWA 2YDGA 3FADA 4Z46A 3F6ZA 2YBLA 4GN4A 4N1CC 1I1ZA 3RU5A 3C7YA 1C7PA 1Z55A 2W1YA 2BQLA 1HERA 1NKHA 4OW1A 1LYZA 1YKZX 3W3EA 1C45A 259LA 137LA 1G7JC 3AGIA 1JIYA 161LA 3WU7A 5B1GA 3SB7A 2B74A 5B05A 3HU9A 4B4EA 1MELL 5KXTA 2B6ZA 4DD3A 2IGCA 4DQ7A 3C83A 1OQMA 4NHPA 3M3UA 4HJZA 2F47A 3W6DA 1LMQA 1LSBA 3AGHA 1E8LA 1DYAA 4E97A 3C7WA 1CKHA 3OE9A 5I54A 4G4BA 1C60A 1C6GA 1FDLY 4G49A 153LA 1YL1X 1ZVYB 4ARPA 1GBOA 3N9CA 3HUQA 1L42A 150LA 174LA 4NSGA 3WPJA 1LZAA 4QY9A 144LA 4H8YA 2ZQ4A 252LA 1SWZA 1C6IA 5HNCA 1WQMA 2OTYX 1GFEA 1C6KA 1L65A 198LA 1REYA 1IR7A 212LA 4OWBA 2DQAA 1UICA 4XADA 1L44A 4C3WA 2B6XA 4XJDA 4NY5A 1DYFA 1LKRA 2Q9DA 1G07A 113LA 1QT7A 4CFOA 1GF6A 1VDSA 256LA 4GLAA 1RI8B 3SBAA 2HU1A 3AZ7A 2L78A 4ARMB 2H5ZA 1LZGA 1L50A 3LZTA 4DDBA 1C64A 1QT5A 2XJWA 3A95A 1JJ0A 1KNIA 4ETBA 1C6LA 1GFTA 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4NGIA 3A3RX 4W57A 3NY9A 1JHLA 3DN1A 147LA 1L13A 4WG7A 3B0OA 5F16A 195LA 2CDSA 1LZ5A 4H9EA 4W54A 4TUNA 3A8ZA 233LA 4XJFA 1BWJA 1ZMYL 3GUPA 1L49A 1IC7Y 2RBRA 2Z6BA 4EKRA 189LA 135LA 4H8XA 4L41A 1DXJA 2HEAA 4W58A 5APFA 1IR8A 1I56A 1LJFA 1QUGA 4A7DA 238LA 2HEDA 2OE7X 1QS5A 5LIOA 3NY8A 1GB0A 4DD9A 4I7PA 4HSFA 209LA 5F9XA 1BB3A 2F4GA 1GAYA 3SB5A 4NGLA 1L19A 3OE0A 5DL9A 3TXBA 4WG1A 4NGVA 1TLAA 1JTOL 4PPOA 3SN6R 261LA 1L45A 3W6AA 4HP0A 1HEPA 4YENA 1LSNA 1OVJA 2BQDA 1L31A 2MECA 1LZSA 4W52A 1LJIA 1IP4A 1JJ1A 4NEBA 1GB3A 8LYZA 193LA 1GF7A 169LA 3HTDA 1D3NA 178LA 1IO5A 206LA 2LZTA 1KIQC 1HSXA 1LYYA 1IIZA 2BQCA 1HEWA 115LA 3TXFA 1NBZC 5LYZA 1YKYX 4KT3A 4NFVA 4DJHA 5KXNA 6LYTA 4M6DA 1LSAA 3ODUA 1CJ7A 4ZEEA 1L18A 1L03A 1CU5A 2QARC 1VFBC 213LA 1L48A 1OV7A 1B7PA 1IOTA 1QTVA 3A3QA 2B6WA 3IWRA 1B7LA 1UCOA 4WM4A 3EMSA 2BQHA 1CU2A 5D5FA 3W6CA 1QUOA 1UIAA 1L12A 1TCYA 3WW5A 4AXTA 3A92A 201LA 1B7NA 1TAYA 1YQVY 3FE0A 103LA 1DPXA 4WM1A 1LKSA 4DT3A 1T8AA 250LA 4YM8A 2D91A 2HTXA 1GFHA 4N5RA 166LA 1D0MA 5C6LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1QT4 A;  4QEQ A;  1IP1 A;  3TXI A;  1D3J A;  1NF5 A;  3RW8 A;  4BAF A;  4GRV A;  1YKX X;  1CKC A;  4ETD A;  2O4W A;  1LHI A;  3AW6 A;  1BQL Y;  4H9H A;  1BGI A;  3EML A;  2F2Q A;  2O79 A;  1L58 A;  1L08 A;  2MEG A;  4W53 A;  1IR9 A;  3B0I A;  5LA5 A;  1HFX A;  4HTN A;  1XFP L;  3J4G A;  2DQF C;  4EKP A;  4PHI A;  3HU8 A;  4GCC A;  2DKV A;  5IEL A;  1DKJ A;  2FYD A;  1L32 A;  1JTN A;  1G7I C;  3CB7 A;  3WVX A;  2OU9 A;  3OE8 A;  2RSC A;  4N8Z A;  4QGZ A;  1FKV A;  1BVK C;  1L25 A;  1CJ6 A;  1L86 A;  4H9A A;  3W6B A;  2H9K A;  1LJJ A;  1BHZ A;  3FA0 A;  1G0P A;  1OUG A;  4DD0 A;  1LSF A;  1NDM C;  5FEK A;  5KXY A;  1L17 A;  3LYT A;  199L A;  1D6P A;  1OWZ A;  4GBR B;  1L53 A;  3NYA A;  1CU3 A;  4B1A A;  3CDQ A;  1D3M A;  1QTH A;  218L A;  3OJP A;  5I5Q A;  2LC9 A;  165L A;  5DN5 A;  104L A;  2XTH A;  3HBE X;  1LSP A;  1WQO A;  4I7K A;  4NWE A;  2IFF Y;  1SX2 A;  4LT0 A;  3HT9 A;  4W96 A;  1F10 A;  2LCB A;  3CSZ A;  4ZPU A;  1LHM A;  1GBS A;  1YL0 X;  1LJK A;  2LHM A;  1QUD A;  1VAT A;  194L A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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