1QT8A

T26h mutant of t4 lysozyme
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYHIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords PROTEIN (T4 LYSOZYME)
publication title Structural basis of the conversion of T4 lysozyme into a transglycosidase by reengineering the active site.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-06-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1qt8A00
2O4WA 160LA 1LGUA 1ZWNA 1NHBA 1CU6A 1PQOA 3D4SA 2QB0B 1G0QA 182LA 1L04A 195LA 1L45A 119LA 1SX7A 176LA 1C6PA 2LCBA 3SB6A 4I7NA 148LE 3L64A 2F47A 1T8GA 1D9WA 1L44A 138LA 1L06A 1SX2A 249LA 1L98A 2B6XA 2QARC 113LA 174LA 4I7LA 4ARPA 1LYGA 178LA 4EJ4A 4E97A 228LA 180LA 4W53A 1CV4A 197LA 1L25A 1LW9A 1CV5A 1KW5A 128LA 1T8FA 3GUOA 3C80A 4GRVA 1CV6A 1L22A 1C6EA 1L46A 1PQIA 4ARJA 211LA 1L89A 1L65A 1L43A 1C69A 190LA 1C6CA 3DN3A 1L27A 1C6MA 4W55A 246LA 4K5YA 1L17A 1L07A 250LA 1L12A 1L92A 3F8VA 201LA 1PQJA 4W59A 2A4TA 3HH3A 3FADA 1L93A 256LA 1L31A 2OE4X 1G07A 1DYEA 3GULA 1L58A 1SWYA 254LA 1L68A 196LA 1L81A 3HDEA 1L74A 1L11A 1OVHA 1PQDA 1DYCA 255LA 4ARMB 2NTHA 1D2YA 1L34A 1CV0A 1P36A 146LA 1C6GA 1LYEA 1QT6A 187LA 1L52A 1QTBA 1P2RA 2LZMA 2RBSA 242LA 1L41A 142LA 1QT5A 1C6QA 3NY9A 215LA 4W56A 125LA 4ARQA 4I7TA 3CDTA 1L62A 3K2RA 4EPFA 130LA 1LYIA 1L94A 1L26A 3DMVA 1C66A 3HH5A 4YX7C 222LA 1OYUA 234LA 3QAKA 1QTHA 1L19A 206LA 1CTWA 143LA 4ZPUA 184LA 1C6IA 1LYHA 1P3NA 1L0JA 1L79A 4LDEA 1CUPA 171LA 2B6ZA 1OV5A 3HTFA 1C6BA 252LA 2Z6BA 145LA 230LA 4EKPA 1P64A 226LA 1L69A 3C81A 258LA 1T6HA 2B6YA 147LA 1CU5A 1QT8A 3SBAA 1L85A 209LA 3C8QA 1C61A 2O7AA 1DYFA 1DYDA 1QS9A 1TLAA 1L49A 1L61A 1T97A 1XJTA 140LA 1P6YA 1L29A 1DYGA 3CDOA 161LA 110LA 1CU0A 1L05A 1C6DA 1C62A 4S0WA 3HT7A 1OVKA 1G0LA 1QT3A 1G0PA 1SSWA 3CDQA 2B74A 3DN1A 1QSBA 1ZYTA 235LA 114LA 261LA 3PDSA 168LA 188LA 241LA 2B73A 1LWGA 1QTDA 257LA 3ODUA 2ANVA 2OU8A 102LA 237LA 1L00A 3C82A 4PJZA 240LA 1LWKA 3HTBA 1C67A 1L51A 3HTGA 1B6IA 1L50A 2B7XA 1L63A 3FI5A 229LA 1SSYA 3DMXA 1L14A 3SB9A 236LA 1C6FA 6LZMA 1QUGA 3EMLA 212LA 3RUNA 4I7MA 1KS3A 223LA 152LA 1D2WA 1L54A 4W57A 3HT6A 4DJHA 221LA 3HU9A 1LGXA 131LA 1LI3A 126LA 1D3FA 1T8AA 2HUMA 239LA 4EKRA 1QUOA 162LA 1OWYA 2RB2X 1G1WA 1L40A 4W54A 189LA 1LYDA 199LA 3DKEX 3GUJA 1L0KA 118LA 1LPYA 3V2WA 156LA 3GUIA 1CU2A 4I7JA 1L77A 1XEPA 1C64A 2RH1A 3DN2A 2OTYX 4LDOA 1L53A 4I7OA 1JQUA 139LA 2CUUA 4LZMA 1G0JA 3RZEA 4GBRB 1L99A 1L82A 3OE9A 4I7PA 2OU9A 1L48A 1CX6A 1L01A 1L28A 111LA 3GUKA 3PBLA 3HDFA 1L86A 123LA 3NYAA 4DKLA 2HUKA 167LA 1QTCA 1XJUA 151LA 1EPYA 3HH4A 1DYAA 219LA 3HH6A 3HUKA 4EKSA 158LA 112LA 149LA 165LA 1G0GA 1QUDA 1C6LA 1L15A 4YXAC 1L23A 2NTGA 1WTHA 1L91A 1L76A 1LYJA 4IAPA 1L55A 122LA 1C6JA 1CU3A 3G3XA 4W52A 1QTZA 4EKQA 7LZMA 1OV7A 1L64A 1P37A 159LA 3GUMA 1QT4A 214LA 1C68A 2O79A 3C7YA 4I7QA 2RAZX 1OVJA 181LA 3SB5A 155LA 259LA 108LA 2IGCA 3DNAA 3HUAA 2B72A 1C6TA 1L08A 3HWLA 1L73A 3NY8A 2Q9EA 1L60A 1OWZA 233LA 251LA 4EPIA 1KW7A 3FA0A 216LA 1CV1A 1L13A 3SB8A 1L88A 232LA 4W51A 5LZMA 3C7WA 163LA 1QUHA 1C65A 2ANXA 177LA 166LA 1KY0A 3DN8A 1L35A 1P46A 109LA 3VW7A 1L67A 1L75A 1QS5A 141LA 2RBPA 4LDLA 173LA 2OEAX 3GUPA 1L20A 2OU0X 3HU8A 1JTMA 1L83A 150LA 3OE6A 1L56A 1P56A 4OO9A 191LA 1JTNA 1CUQA 3DN4A 169LA 1KY1A 1QSQA 3HT8A 4AQNA 1L47A 2RBOA 205LA 217LA 2OE7X 1L24A 1C63A 3OE0A 1L10A 210LA 5I14A 1L18A 3GUNA 170LA 220LA 127LA 107LA 253LA 1G0MA 3UONA 2Q9DA 115LA 4ARMA 164LA 1D3JA 262LA 157LA 200LA 1P2LA 1LLHA 1P5CA 1PQKA 1L32A 3G3WA 4EXMA 1L37A 1L38A 4I7KA 1LI2A 1L03A 3C8RA 1CVKA 3SB7A 1L87A 1K28A 3SBBC 1D3NA 2B75A 2B6WA 3V2YA 2OTZX 1DYBA 218LA 3DMZA 3DN0A 4ARLA 1L16A 1L90A 3C7ZA 1LYFA 1C6AA 1QTVA 1SWZA 213LA 2RB0X 172LA 1L09A 3HTDA 104LA 3HUQA 4YXCA 260LA 1L84A 1G0KA 2HULA 2RB1X 1PQMA 2RBQA 1C6HA 2OE9X 1C6NA 1L30A 1L57A 185LA 192LA 244LA 1L80A 1L96A 231LA 3F9LA 3SN6R 247LA 1L02A 1L36A 1ZURA 1L21A 3JR6A 1L72A 4PK0A 4I7SA 1L71A 2RBNA 4ARQB 3CDVA 248LA 1L97A 2F2QA 1CX7A 225LA 1I6SA 3LZMA 103LA 1CV3A 1L95A 186LA 2RAYX 137LA 2B6TA 1KNIA 1QT7A 3L2XA 129LA 1L33A 1LI6A 2LC9A 224LA 245LA 175LA 3CDRA 144LA 3C83A 1LGWA 2RBRA 183LA 4W58A 1L70A 2B70A 2L78A 3G3VA 1L66A 1L39A 120LA 1G1VA 1D3MA 3OE8A 1L59A 238LA 3HT9A 1L42A 1C60A 4I7RA 1G06A 198LA 1C6KA 3DN6A 4DAJA 3C8SA 227LA 243LA 2F32A 1P7SA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4EOFA 160LA 1JTOL 1PQOA 4TSBA 1OUEA 4EMNA 2YSSC 1JKBA 1L45A 2LCBA 176LA 5LINA 3A3RX 3AGGG 1YAMA 3SP3A 3B6LA 1L06A 2QARC 2B6XA 1XEJA 1BB5A 1B7OA 1CNSA 1LYGA 1EQ4A 1JTPL 2EQLA 197LA 1L25A 1LW9A 4DT3A 1LMQA 5I4WA 1KW5A 128LA 1T8FA 2FBBA 1QQYA 1LCNA 1JKAA 1LHKA 1CV6A 1L22A 4G4HA 1GE2A 2BLXA 1LSPA 3A67Y 4NG1A 1L89A 1JJ3A 1C69A 3LHMA 4PRUA 1C6CA 4W55A 2NWDX 4GCEA 1LMAA 1L92A 201LA 1DI5A 1BB6A 1L93A 1L58A 254LA 196LA 1L74A 4HJVA 4ARMB 1WQPA 2NTHA 1L34A 3P4ZA 3M18B 1YL1X 4H9FA 3RW8A 5KKIA 5KXMA 5KXWA 1QTBA 2LZMA 1HHLA 2RBSA 242LA 5D5CA 1L41A 3NY9A 5LXWA 1L62A 1AT5A 4EPFA 130LA 1LYIA 1VEDA 1L94A 3WULA 4O34A 1YKYX 1BHZA 2Z19A 222LA 1OYUA 234LA 4CGEA 1CTWA 3IJVA 143LA 4ZPUA 4UWUA 4W96A 1LYHA 4PHIA 2Z6BA 1CKGA 4NEBA 230LA 4EKPA 226LA 1GE4A 3A93A 147LA 2H9JA 4XJGA 1CU5A 1LSMA 5L3HA 4N5RA 4XADA 4NGKA 1Z55A 1QS9A 1TLAA 1LMNA 1L49A 1T97A 1P6YA 5E9RA 3G3BB 3WPLA 2FYDA 1C6DA 1C62A 4S0WA 1C10A 3HT7A 1IVMA 1QT3A 1IO5A 1G0PA 2W1MA 5APDA 2B74A 3LN2A 5I5QA 1B0DA 4HTQA 4YOPA 241LA 2BQCA 4WLYA 1IEEA 1JUGA 3ODUA 1RE2A 1YAQA 2OU8A 237LA 3C82A 5AMYA 1I1ZA 240LA 1LWKA 1C67A 1XFPL 1LZAA 1LZNA 1PS5A 2B7XA 3FI5A 229LA 4H1PA 1D6QA 236LA 1J1XY 6LZMA 4MCKA 212LA 4N9RA 1I56A 4G49A 4ETEA 4HTKA 5I4XA 152LA 3HT6A 3HU9A 3LYOA 1MELL 1GE0A 3VWOA 239LA 3WW6A 4EKRA 4NSIA 4KPMA 2EKSC 1JIYA 3WYHA 5KXOA 4W54A 3GUJA 5A3ZA 3BKHA 118LA 6LYTA 1OUGA 4NHQA 5APEA 3W6CA 1LYSA 4LDOA 1UIHA 4I7OA 1JQUA 139LA 2CUUA 1G0JA 1L99A 2EPEA 2OU9A 4WO9A 2MEFA 1CX6A 1IR7A 4PPOA 3W3EA 111LA 4QY9A 1IOTA 167LA 4Z3MA 3CSZA 3A3QA 3HH4A 1DYAA 3HH6A 4EKSA 5LIOA 112LA 2BQDA 4ETBA 1QUDA 1TAYA 4J1AA 1L23A 1L91A 1UIEA 1YIKA 153LA 1JITA 4EKQA 4WMGA 1L64A 5F9UA 1QT4A 2IFFY 2BQLA 4J1BA 3W6FA 1OVJA 4LT3A 155LA 108LA 2MEDA 5I53A 2B72A 1L08A 1LZBA 1L60A 251LA 2XBSA 1IWYA 1L13A 5LAGA 1TEWA 232LA 5LZMA 5FDJA 4XJBA 163LA 5LYZA 4M6DA 1NWGA 4WM3A 4YENA 3A8ZA 1WTNA 1A2YC 2BQGA 2HEAA 3VW7A 4NGVA 1B7NA 1QS5A 3N9AA 3LZTA 173LA 3GUPA 1IWWA 2W1XA 2OU0X 4UWNA 1DQJC 1L83A 1UIAA 1L56A 1LZSA 1P56A 1JEFA 4W94A 3HT8A 4AQNA 1HFZA 1REZA 4C3WA 2RBOA 217LA 3LZ2A 5HQ1A 210LA 132LA 1XGTC 1NKHA 2ZQ3A 4B4JA 1IORA 2C8PA 1CJ7A 8LYZA 4G9SA 157LA 200LA 4YEOA 4QGZA 4DD1A 1L32A 4M4OA 4EXMA 1L37A 4OOOA 1XSFA 4UWVA 1LJNA 2Z12A 3C8RA 5F9XA 4BADA 1OUFA 1WQMA 2B6WA 4DD7A 4HV2A 2W1LA 1B7RA 1GFTA 1KIPC 1C6AA 213LA 2RB0X 4OWBA 104LA 4YXCA 260LA 3E3DA 4OOTA 2HULA 4NWEA 4BAPA 1C6NA 1L30A 3KAMA 1LHMA 1L96A 231LA 4LYCA 1GE1A 4L41A 1L02A 1LTMA 3JR6A 4PK0A 2RBNA 3TMUA 1LJKA 2F2QA 1GB5A 5B06A 1B7MA 1CV3A 1C45A 137LA 1T3PA 2B6TA 4PRQA 1GDXA 1L33A 2LC9A 5C6IA 175LA 3CDRA 144LA 3WPKA 3LYTA 183LA 1DKKA 4W58A 5IELA 1L70A 2B70A 3ZEKA 3CSQA 1IWXA 1G1VA 1L59A 1L42A 4I7RA 4OWHA 1GAYA 4BS7A 2HECA 198LA 1YROA 1QIOA 4DAJA 3TXHA 2YBHA 3HBHA 3P66A 3TXBA 1ZMYL 5HNLA 2O4WA 3QNGA 4Z46A 1I20A 1ZWNA 4NGJA 4ETCA 2LYMA 2QB0B 1G0QA 1CKFA 5KXYA 1L04A 4NHSA 4YEMA 1C6PA 2B5ZA 1T8GA 4WLTA 1IR8A 1L44A 249LA 2FYCA 1GPQC 1GB8A 3OJPA 4EJ4A 4E97A 228LA 180LA 1CV4A 2BQFA 1IIZA 3C80A 2LZ2A 5LAFA 3B72A 4GRVA 1LMPA 4ARJA 1L65A 4GCFA 1IP7A 1L43A 1UC0A 3DN3A 1YANA 1DPWA 5LA8A 246LA 4K5YA 3FI7A 1L07A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 4EOF A;  160L A;  1JTO L;  1PQO A;  4TSB A;  1OUE A;  4EMN A;  2YSS C;  1JKB A;  1L45 A;  2LCB A;  176L A;  5LIN A;  3A3R X;  3AGG G;  1YAM A;  3SP3 A;  3B6L A;  1L06 A;  2QAR C;  2B6X A;  1XEJ A;  1BB5 A;  1B7O A;  1CNS A;  1LYG A;  1EQ4 A;  1JTP L;  2EQL A;  197L A;  1L25 A;  1LW9 A;  4DT3 A;  1LMQ A;  5I4W A;  1KW5 A;  128L A;  1T8F A;  2FBB A;  1QQY A;  1LCN A;  1JKA A;  1LHK A;  1CV6 A;  1L22 A;  4G4H A;  1GE2 A;  2BLX A;  1LSP A;  3A67 Y;  4NG1 A;  1L89 A;  1JJ3 A;  1C69 A;  3LHM A;  4PRU A;  1C6C A;  4W55 A;  2NWD X;  4GCE A;  1LMA A;  1L92 A;  201L A;  1DI5 A;  1BB6 A;  1L93 A;  1L58 A;  254L A;  196L A;  1L74 A;  4HJV A;  4ARM B;  1WQP A;  2NTH A;  1L34 A;  3P4Z A;  3M18 B;  1YL1 X;  4H9F A;  3RW8 A;  5KKI A;  5KXM A;  5KXW A;  1QTB A;  2LZM A;  1HHL A;  2RBS A;  242L A;  5D5C A;  1L41 A;  3NY9 A;  5LXW A;  1L62 A;  1AT5 A;  4EPF A;  130L A;  1LYI A;  1VED A;  1L94 A;  3WUL A;  4O34 A;  1YKY X;  1BHZ A;  2Z19 A;  222L A;  1OYU A;  234L A;  4CGE A;  1CTW A;  3IJV A;  143L A;  4ZPU A; 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 1NKH A;  2ZQ3 A;  4B4J A;  1IOR A;  2C8P A;  1CJ7 A;  8LYZ A;  4G9S A;  157L A;  200L A;  4YEO A;  4QGZ A;  4DD1 A;  1L32 A;  4M4O A;  4EXM A;  1L37 A;  4OOO A;  1XSF A;  4UWV A;  1LJN A;  2Z12 A;  3C8R A;  5F9X A;  4BAD A;  1OUF A;  1WQM A;  2B6W A;  4DD7 A;  4HV2 A;  2W1L A;  1B7R A;  1GFT A;  1KIP C;  1C6A A;  213L A;  2RB0 X;  4OWB A;  104L A;  4YXC A;  260L A;  3E3D A;  4OOT A;  2HUL A;  4NWE A;  4BAP A;  1C6N A;  1L30 A;  3KAM A;  1LHM A;  1L96 A;  231L A;  4LYC A;  1GE1 A;  4L41 A;  1L02 A;  1LTM A;  3JR6 A;  4PK0 A;  2RBN A;  3TMU A;  1LJK A;  2F2Q A;  1GB5 A;  5B06 A;  1B7M A;  1CV3 A;  1C45 A;  137L A;  1T3P A;  2B6T A;  4PRQ A;  1GDX A;  1L33 A;  2LC9 A;  5C6I A;  175L A;  3CDR A;  144L A;  3WPK A;  3LYT A;  183L A;  1DKK A;  4W58 A;  5IEL A;  1L70 A;  2B70 A;  3ZEK A;  3CSQ A;  1IWX A;  1G1V A;  1L59 A;  1L42 A;  4I7R A;  4OWH A;  1GAY A;  4BS7 A;  2HEC A;  198L A;  1YRO A;  1QIO A;  4DAJ A;  3TXH A;  2YBH A;  3HBH A;  3P66 A;  3TXB A;  1ZMY L;  5HNL A;  2O4W A;  3QNG A;  4Z46 A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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