1QTZA

D20c mutant of t4 lysozyme
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKCTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords PROTEIN (T4 LYSOZYME)
publication title Structural basis of the conversion of T4 lysozyme into a transglycosidase by reengineering the active site.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-06-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1qtzA00
2RBOA 224LA 3EMLA 4E97A 1L23A 229LA 1LI3A 1P64A 189LA 1L76A 1CX6A 1L70A 1L13A 1L03A 1P2LA 145LA 1LWGA 1T6HA 251LA 3C83A 1EPYA 123LA 240LA 4I7MA 3C8SA 1L29A 3HTDA 130LA 185LA 1L32A 2HULA 192LA 1L06A 1L51A 160LA 3SB6A 245LA 1L41A 3OE0A 1L11A 4EKSA 3FA0A 1L12A 1L30A 1QS5A 1C6CA 1QT7A 244LA 1LI6A 3V2WA 1L98A 1D9WA 1L49A 1L24A 1L93A 150LA 1G0PA 247LA 1C6JA 115LA 1L82A 1QTDA 1LW9A 3C80A 1CV4A 2F32A 1L96A 126LA 3HH4A 1C6BA 113LA 1P3NA 1CU6A 3HH6A 3HH3A 5LZMA 1L73A 110LA 1QT3A 152LA 4I7NA 1L95A 1PQJA 1L80A 1G1VA 235LA 1C6PA 1CV6A 1P2RA 146LA 1PQDA 2OU8A 3SB7A 1C68A 3CDQA 4ARQA 3HU8A 2LC9A 4ARMA 178LA 3DNAA 1D2WA 1P56A 2O79A 210LA 4LDEA 1L36A 242LA 3DMVA 1L48A 1JTNA 1CVKA 1SWYA 114LA 2Z6BA 1CV5A 243LA 238LA 1L58A 1QTBA 3FI5A 1DYCA 147LA 259LA 2OEAX 1QTHA 3DN6A 3FADA 4YX7C 230LA 1T8GA 166LA 1L83A 180LA 3SB5A 3ODUA 172LA 225LA 177LA 3V2YA 2ANXA 2RBQA 1L37A 1L59A 4ZPUA 1C6LA 2Q9DA 184LA 4W58A 1SX7A 1L34A 1L05A 155LA 1L90A 219LA 3L64A 1L22A 173LA 3L2XA 254LA 1L08A 255LA 257LA 144LA 1ZYTA 4I7QA 1L10A 1C6EA 1T97A 4ARJA 236LA 1L44A 4I7TA 4W54A 3OE9A 3RZEA 216LA 1OWYA 157LA 3SBAA 253LA 1L99A 1QTVA 1C62A 3C7WA 1L86A 250LA 1KY0A 170LA 1CV0A 1XEPA 1ZURA 1LYHA 2B6ZA 2IGCA 1L18A 1L55A 1I6SA 1L65A 2CUUA 1L71A 129LA 1DYAA 1QUHA 3G3XA 1C69A 1LGXA 1C6AA 3C8QA 2OU0X 1G0MA 1L89A 190LA 1L07A 1T8AA 1C6GA 1G1WA 3HUQA 1L68A 1C66A 151LA 4EJ4A 1L16A 1PQKA 1QS9A 4EKPA 1QTZA 1CV3A 1D2YA 1L0KA 2B73A 3C7YA 256LA 131LA 125LA 260LA 3GUMA 2OE4X 1TLAA 4OO9A 102LA 2L78A 1L33A 227LA 2QARC 127LA 1C63A 4W52A 1LGUA 1L02A 217LA 213LA 3SN6R 1DYEA 1CU3A 2B7XA 212LA 1L79A 3HT8A 1L31A 1L0JA 1C6DA 3C8RA 199LA 4I7SA 3CDRA 1QUGA 119LA 1L75A 1WTHA 3LZMA 1L77A 1CU5A 4I7KA 1C6MA 3PDSA 2B75A 2O7AA 1KW7A 223LA 187LA 1LYIA 1QSBA 4GBRB 4I7LA 1L38A 156LA 1B6IA 1L67A 1L57A 104LA 2B72A 205LA 2RBRA 182LA 4LDOA 2NTHA 2B74A 197LA 1CV1A 1P6YA 1QT6A 261LA 4EXMA 3QAKA 4GRVA 168LA 1LPYA 3SB8A 4W55A 2Q9EA 1XJUA 233LA 4PJZA 1L61A 4EKRA 1QT4A 1LWKA 3PBLA 1K28A 3GUOA 118LA 1D3NA 1L01A 3NYAA 5I14A 3DN4A 148LE 1CTWA 161LA 3DN8A 1L19A 1L42A 4I7OA 206LA 195LA 2O4WA 3HH5A 1SX2A 1L53A 237LA 3DKEX 2LCBA 4W57A 1L66A 108LA 103LA 3GUPA 3G3WA 262LA 1OVHA 1JQUA 258LA 164LA 1C6HA 4IAPA 252LA 4PK0A 1L62A 3K2RA 1C6NA 1P5CA 228LA 1L81A 3UONA 1L52A 1QT8A 165LA 3HTFA 139LA 1L26A 1L21A 1P36A 1L39A 1L92A 2OTZX 1KNIA 3C82A 3HUKA 1ZWNA 1G0QA 3RUNA 241LA 1LYEA 1OVJA 111LA 1OVKA 162LA 3DN0A 140LA 176LA 1DYDA 1L20A 1PQOA 1LYFA 1QT5A 3GUJA 159LA 3F9LA 234LA 4I7PA 1OV7A 1OWZA 4W59A 7LZMA 169LA 2RH1A 1CX7A 1L25A 1L35A 1P37A 1L17A 4DJHA 232LA 3JR6A 4ARPA 3NY9A 3VW7A 2RB1X 142LA 3OE8A 1C61A 1L87A 181LA 1KY1A 1L88A 3DN2A 1SSWA 2B6WA 1DYGA 226LA 2HUKA 1L27A 3CDTA 1G0GA 1D3FA 2B6XA 188LA 1NHBA 2ANVA 2A4TA 2NTGA 4LDLA 107LA 2RBPA 3HDEA 1D3MA 1L91A 4DAJA 3DN1A 1JTMA 1PQIA 122LA 3C7ZA 4S0WA 4W56A 201LA 218LA 1G0LA 1C6QA 2B6YA 4EPIA 4W51A 1P7SA 3DMZA 1LYDA 1L74A 174LA 1L97A 3HWLA 183LA 1SSYA 2QB0B 4LZMA 1L64A 2OE9X 2F47A 3OE6A 214LA 175LA 1D3JA 1XJTA 239LA 137LA 1KW5A 3C81A 246LA 1C6IA 198LA 1C6KA 1L09A 2RB0X 186LA 1L00A 1CU0A 1LI2A 248LA 3GULA 2OU9A 200LA 149LA 1G06A 2LZMA 128LA 1G07A 1L56A 1CU2A 1L84A 1CUQA 1C6FA 1L46A 2B6TA 4YXCA 209LA 3GUIA 3HTGA 1L40A 211LA 171LA 112LA 1C65A 2RAZX 231LA 3HTBA 1LLHA 4K5YA 1P46A 1DYFA 1L04A 1L47A 4DKLA 4AQNA 2B70A 1PQMA 4EKQA 2RAYX 109LA 1L50A 1QUOA 158LA 191LA 1C64A 1L45A 1LGWA 1L54A 1QUDA 1T8FA 3HUAA 3NY8A 1L14A 249LA 3HT6A 4EPFA 3HDFA 3GUNA 3SB9A 4I7RA 1OYUA 3G3VA 221LA 2RBSA 1G0KA 1L28A 222LA 3DN3A 3DMXA 1L94A 2OTYX 1C67A 2RBNA 2F2QA 143LA 1CUPA 1L15A 2RB2X 3CDOA 196LA 1DYBA 138LA 120LA 1QSQA 1OV5A 2HUMA 1KS3A 1LYJA 1L85A 4ARQB 215LA 1G0JA 1L63A 4ARMB 1SWZA 1L43A 3SBBC 141LA 3HT9A 4I7JA 220LA 167LA 2OE7X 3HT7A 1L69A 3CDVA 4YXAC 3HU9A 6LZMA 3F8VA 1QTCA 1L60A 163LA 1LYGA 1C6TA 1C60A 4W53A 3GUKA 3D4SA 4ARLA 1L72A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1REZA 224LA 1LSCA 2DQIY 3AZ7A 2ZQ3A 189LA 2IHLA 3A91A 2BAAA 1I1ZA 1L03A 145LA 2NWDX 1IY4A 4I7MA 3C8SA 1L29A 4QEQA 3A96A 1GFEA 3OE0A 5B06A 4FDYA 1KIRC 1AZFA 1QT7A 4GCFA 244LA 5KXXA 1IEEA 1D9WA 1L93A 1G0PA 247LA 1C6JA 1LZ8A 1EQEA 1CV4A 1LSZA 1C6BA 5F9UA 1XGTC 3HH3A 4G4BA 2YBMA 3B0OA 1CKDA 3AB6A 4H8ZA 152LA 1LHKA 235LA 1P2RA 2BQAA 1FN5A 4H1PA 4WM1A 1LHIA 3HU8A 3B72A 1QQYA 1D2WA 1AT5A 1GEVA 3DMVA 1JTNA 1CVKA 1L58A 5KXTA 2OEAX 1B5WA 1QTHA 3DN6A 5LVKA 1GB2A 1L83A 2ANXA 2RBQA 2Q9DA 184LA 1OUFA 2F4GA 207LA 1LJFA 2FYDA 1J1PY 155LA 1GE0A 5LVIA 1BGIA 1L22A 1B7LA 2Q0MX 1ZYTA 4I7QA 1NWGA 3TMXA 2BQLA 1UUZC 3LHMA 1RJCB 4W54A 4X3BA 2YBJA 157LA 3SBAA 4M4OA 4LFPA 4DQ5A 1KXWA 4LGKA 1KY0A 170LA 1XEPA 2B6ZA 4NHTA 1L18A 1I6SA 4NG1A 2CUUA 4NGZA 1DZBX 1LGXA 1C6AA 3AZ6A 1OUDA 1L07A 1T8AA 1G1WA 1C6GA 1FLQA 1LZYA 1F6RA 151LA 1YANA 1PQKA 2YSSC 1GF9A 4DWXA 2B73A 4YF2A 4OO9A 4HPEA 4HTKA 2QARC 127LA 1YAOA 5DN4A 4W52A 1L02A 217LA 4H9EA 4XENA 3TXFA 212LA 1L79A 193LA 2EQLA 1L0JA 4CGEA 4DD2A 4GN5C 3AGGG 1XGQC 1NMMA 1YKYX 4WM6A 4YEOA 4I7KA 1C6MA 3ULRA 1YQVY 3WPJA 1KW7A 187LA 4I7LA 3WU7A 1P6YA 4DD0A 2EIZC 4H94A 1VDPA 5LA5A 3A8ZA 3SB8A 1GHLA 1KXYA 1GF5A 4PJZA 1L61A 1QT4A 1DI5A 3WW6A 1REMA 4N0JA 5I14A 4OWCA 3WU8A 2F4AA 1PS5A 1L53A 237LA 2Z38A 2HECA 2LCBA 2CJLA 262LA 1IP5A 1INUA 258LA 1LJJA 1D0KA 3LZTA 3IJUA 252LA 1LZSA 5KXMA 228LA 1P5CA 1JSEA 1WVVA 4H9AA 1LZDA 1ALCA 4H9FA 3HTFA 4NGJA 3HBEX 1IX0A 1P36A 2ZIJA 2D91A 1ZWNA 1B5UA 3A67Y 241LA 1QIOA 111LA 2YVBA 4Z41A 1FLYA 1DI3A 1LYFA 1JKBA 4H90A 4I7PA 4DDBA 169LA 1GEZA 3WVXA 4N1EI 5ILFA 2AUBA 4NHPA 3VW7A 1L87A 3DN2A 5L3IA 4M6DA 1AM7A 1DYGA 4LT1A 4FJRA 2RSCA 5A3EA 1B7QA 1L27A 3M3UA 1IO5A 2B6XA 4J0LA 2A4TA 2NTGA 1WVUA 1C08C 1LJ3A 4DAJA 5E4PA 3A34A 1JTMA 5AMYA 1PQIA 153LA 1YKZX 4NGKA 201LA 1C6QA 4W51A 1NF5A 1HNLA 1L74A 2Z12A 4N5RA 3HWLA 5LAFA 183LA 1YAMA 1UIDA 4H91A 4OOOA 1QDTA 1TAYA 2BLXA 2F47A 3OE6A 4PRUA 5F81A 4PPOA 1WQMA 1KW5A 246LA 4OWBA 2N5ZA 1JKCA 2RB0X 5JENB 3CQLA 1CU0A 1LHHA 248LA 1IR8A 1G06A 1L56A 1L84A 1CUQA 1L46A 1LJHA 3WPLA 4YXCA 1IWTA 1ZVHL 5IHGA 3HTGA 3P65A 2CDSA 1LLHA 1NQIA 1HFZA 1L04A 3MGWA 4DKLA 1QDRA 1LZ5A 2B70A 1GB8A 3AJNA 158LA 191LA 1C64A 1LGWA 4AXTA 4WOAA 3HT6A 3CSRA 2I25L 5HQ1A 3HDFA 3SB9A 2DQFC 3G3VA 3EBAB 222LA 4OW1A 5F14A 3TXBA 3A3QA 132LA 2F2QA 4H9BA 3CDOA 1F0WA 196LA 1DYBA 138LA 3EMSA 1LZNA 1QSQA 5KXZA 1OUEA 1OUIA 4ETAA 3TXHA 4ARMB 4PHIA 141LA 4I7JA 1B5XA 1YL0X 4U3XB 3WMKA 1L60A 2H9KA 4H8YA 1C60A 1IP1A 1JSFA 3D4SA 3IWRA 4ETBA 3OE8A 1L72A 2RBOA 1GF8A 3EMLA 2Z2EA 1LJ4A 4E97A 2W1YA 4AGAA 4G4HA 1L70A 1L13A 1IY3A 1P2LA 4CFOA 5LA8A 3AW7A 251LA 3C83A 1EPYA 123LA 3HTDA 2A7DA 130LA 185LA 1L32A 4PGJB 1B7OA 5I54A 1L51A 245LA 1LYOA 1A2YC 1L11A 1REXA 3FA0A 1L12A 4HTNA 1L30A 5LYMA 5EBHA 4BAFA 4HJZA 5DL9A 1L24A 150LA 1LZAA 1LJKA 3E3DA 1HERA 1LW9A 5KXSA 2F32A 3WUAA 3HH4A 1LSBA 1CU6A 1P3NA 4UWNA 5LZMA 4PRQA 110LA 3RW8A 2ZWBA 1PQJA 1G1VA 2BQOA 1C6PA 3ZEKA 2D4KA 1LJGA 1UIBA 3SB7A 1V7TA 3A93A 4HPIA 2LC9A 4ARMA 178LA 1CJ6A 2O79A 5HMVA 1JKAA 242LA 3A94A 1VAUA 4YM8A 114LA 1UC0A 3FI5A 1D0LA 259LA 1B7NA 5FEKA 1QSWA 3FADA 2HU3A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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 2RBS A;  1G0K A;  1L28 A;  222L A;  3DN3 A;  3DMX A;  1L94 A;  2OTY X;  1C67 A;  2RBN A;  2F2Q A;  143L A;  1CUP A;  1L15 A;  2RB2 X;  3CDO A;  196L A;  1DYB A;  138L A;  120L A;  1QSQ A;  1OV5 A;  2HUM A;  1KS3 A;  1LYJ A;  1L85 A;  4ARQ B;  215L A;  1G0J A;  1L63 A;  4ARM B;  1SWZ A;  1L43 A;  3SBB C;  141L A;  3HT9 A;  4I7J A;  220L A;  167L A;  2OE7 X;  3HT7 A;  1L69 A;  3CDV A;  4YXA C;  3HU9 A;  6LZM A;  3F8V A;  1QTC A;  1L60 A;  163L A;  1LYG A;  1C6T A;  1C60 A;  4W53 A;  3GUK A;  3D4S A;  4ARL A;  1L72 A; 
#chains in the Genus database with same CATH topology
 1REZ A;  224L A;  1LSC A;  2DQI Y;  3AZ7 A;  2ZQ3 A;  189L A;  2IHL A;  3A91 A;  2BAA A;  1I1Z A;  1L03 A;  145L A;  2NWD X;  1IY4 A;  4I7M A;  3C8S A;  1L29 A;  4QEQ A;  3A96 A;  1GFE A;  3OE0 A;  5B06 A;  4FDY A;  1KIR C;  1AZF A;  1QT7 A;  4GCF A;  244L A;  5KXX A;  1IEE A;  1D9W A;  1L93 A;  1G0P A;  247L A;  1C6J A;  1LZ8 A;  1EQE A;  1CV4 A;  1LSZ A;  1C6B A;  5F9U A;  1XGT C;  3HH3 A;  4G4B A;  2YBM A;  3B0O A;  1CKD A;  3AB6 A;  4H8Z A;  152L A;  1LHK A;  235L A;  1P2R A;  2BQA A;  1FN5 A;  4H1P A;  4WM1 A;  1LHI A;  3HU8 A;  3B72 A;  1QQY A;  1D2W A;  1AT5 A;  1GEV A;  3DMV A;  1JTN A;  1CVK A;  1L58 A;  5KXT A;  2OEA X;  1B5W A;  1QTH A;  3DN6 A;  5LVK A;  1GB2 A;  1L83 A;  2ANX A;  2RBQ A;  2Q9D A;  184L A;  1OUF A;  2F4G A;  207L A;  1LJF A;  2FYD A;  1J1P Y;  155L A;  1GE0 A;  5LVI A;  1BGI A;  1L22 A;  1B7L A;  2Q0M X;  1ZYT A;  4I7Q A;  1NWG A;  3TMX A;  2BQL A;  1UUZ C;  3LHM A;  1RJC B;  4W54 A;  4X3B A;  2YBJ A;  157L A;  3SBA A;  4M4O A;  4LFP A;  4DQ5 A;  1KXW A;  4LGK A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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