1QUOA

L99a/e108v mutant of t4 lysozyme
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAAINMVFQMGVTGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Structural analysis of a non-contiguous second-site revertant in T4 lysozyme shows that increasing the rigidity of a protein can enhance its stability.
pubmed doi rcsb
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
total genus 59
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1quoA00
125LA 1C6NA 157LA 242LA 1L31A 3LZMA 2B6ZA 3GUNA 1C6PA 252LA 221LA 2OU8A 1L63A 1L75A 2OU9A 183LA 112LA 1P46A 1G1VA 1L40A 1L15A 1L27A 1L45A 1T8FA 3HH3A 1DYFA 1L70A 237LA 3SB5A 1EPYA 4I7NA 199LA 1C6CA 3G3VA 1QTHA 4W51A 192LA 167LA 1L54A 1CX7A 3L2XA 197LA 1C64A 1L80A 1CX6A 4W59A 2LZMA 1DYCA 1KW5A 1L85A 3SB9A 4I7RA 2QARC 1L53A 231LA 172LA 165LA 1L04A 1L01A 1L0KA 3C7WA 1LPYA 1QTCA 174LA 245LA 4IAPA 126LA 4EPIA 1P36A 1L06A 1QTZA 1LI6A 3DN8A 182LA 4I7JA 1XJTA 1K28A 1L68A 1QTDA 1CV5A 137LA 1C62A 1L94A 1ZWNA 4EJ4A 229LA 198LA 178LA 1L08A 1L46A 1L35A 140LA 2O4WA 4W52A 1P56A 129LA 2RBPA 1KY0A 2L78A 219LA 239LA 1DYBA 1C6GA 1P3NA 1QSQA 188LA 232LA 156LA 1KNIA 260LA 206LA 1CU0A 3CDRA 1QUOA 2Q9EA 1L37A 255LA 2RBSA 1C6IA 1L92A 3RZEA 2RAZX 109LA 3HUAA 1L21A 1PQOA 251LA 4DAJA 256LA 3V2WA 3VW7A 1L59A 1D2YA 261LA 3PDSA 1LLHA 195LA 225LA 3OE6A 108LA 1L99A 4EKPA 230LA 250LA 3DN6A 257LA 3PBLA 2B6WA 4I7QA 1L58A 1SX7A 3HT8A 1L81A 1D3NA 253LA 2QB0B 1P7SA 1OYUA 1C6LA 4I7SA 180LA 1L51A 4W56A 3NY8A 3HUQA 1QTBA 131LA 4OO9A 2OEAX 1QT6A 1L26A 168LA 2F2QA 2RB1X 1LGUA 1QT3A 1CUQA 243LA 4YX7C 145LA 4LDEA 4ARQA 1LYIA 158LA 2B6XA 1L83A 3C82A 4AQNA 163LA 4W55A 1OWYA 1G0JA 1OWZA 1OVKA 2HUMA 227LA 1C6JA 1TLAA 1T6HA 1L29A 1CU6A 4W54A 1LYDA 103LA 1DYDA 3QAKA 3HWLA 1C61A 4YXAC 191LA 4I7LA 138LA 3OE8A 1OV7A 1QUDA 1QT5A 1C60A 1C66A 184LA 1C6QA 1L90A 223LA 1D3MA 1L74A 2B72A 1P2LA 2HUKA 6LZMA 3C80A 1XJUA 1G0MA 2B73A 1LI3A 1XEPA 228LA 1L42A 3DN3A 2RB0X 3OE9A 4ARLA 1LWKA 1P6YA 1D9WA 3CDOA 1ZYTA 1L67A 249LA 1WTHA 3HDEA 190LA 3SB7A 159LA 5LZMA 128LA 3HH4A 216LA 220LA 1I6SA 1L82A 1LYHA 114LA 1L49A 1L71A 259LA 217LA 1L86A 144LA 3DKEX 1QUHA 1QSBA 1C6FA 1L56A 2B7XA 3HT7A 173LA 1ZURA 1D3JA 4GBRB 1L79A 1L09A 4EKRA 3GUPA 119LA 1L89A 1OV5A 1P2RA 2ANVA 222LA 3DN2A 1L65A 4ARQB 3GUKA 3RUNA 1CU3A 1KY1A 123LA 2RBRA 1LGXA 1SWYA 3HT6A 4ARPA 1PQJA 3CDTA 4I7TA 4DJHA 3DMVA 1LYEA 1QT7A 233LA 2LC9A 149LA 2CUUA 1CV6A 1PQMA 1CV3A 104LA 3FADA 4PJZA 3SB6A 196LA 175LA 1CVKA 1LGWA 4LDOA 122LA 3ODUA 4ARMA 3C83A 3EMLA 3G3XA 3HH5A 1DYGA 3CDVA 201LA 1L52A 1L10A 3DMZA 102LA 169LA 226LA 4ZPUA 3L64A 161LA 1CU2A 3SN6R 4EKQA 1L48A 118LA 1CV4A 4K5YA 1L30A 1L43A 2RBQA 150LA 3GULA 4W58A 238LA 4E97A 1D3FA 4ARJA 1L88A 5I14A 1C68A 1L16A 3HU9A 1L95A 213LA 1C6BA 110LA 3FI5A 3HH6A 3GUIA 1G0PA 3JR6A 1G06A 1L60A 3HTGA 185LA 3C81A 1P5CA 244LA 1L03A 107LA 4GRVA 1L77A 4I7PA 1LW9A 1LYJA 1G0LA 4I7OA 1JTMA 4LZMA 3GUMA 7LZMA 210LA 1B6IA 1L20A 4W53A 2NTHA 1T8AA 151LA 1QS9A 181LA 1QUGA 1L64A 3HT9A 1G0GA 1T97A 4YXCA 176LA 186LA 205LA 2RBOA 166LA 1L34A 1L24A 1SX2A 3K2RA 1C6EA 1LYFA 1QS5A 3FA0A 1P37A 2F47A 1C65A 2OE9X 240LA 248LA 1L38A 1JQUA 170LA 1T8GA 2Q9DA 1L23A 1OVHA 4EPFA 1C6TA 1L12A 1LI2A 187LA 146LA 246LA 4ARMB 1L66A 3HTFA 1PQIA 214LA 130LA 1SSYA 3NY9A 3C8RA 1L73A 139LA 3SB8A 241LA 1CV1A 1C6MA 1PQDA 1CUPA 1L41A 1NHBA 2RB2X 4I7MA 1L62A 1L0JA 1L69A 235LA 1L36A 1C69A 2OTZX 4W57A 3UONA 212LA 2OU0X 152LA 3C7YA 3GUOA 3C8QA 215LA 115LA 211LA 1L87A 2RBNA 1CTWA 1L39A 1L61A 1L84A 1L32A 1L96A 2OE7X 4DKLA 189LA 1L72A 1L14A 2F32A 3DMXA 2B74A 1L50A 262LA 224LA 2B70A 4PK0A 2Z6BA 1G07A 3V2YA 2B75A 234LA 1L19A 1L98A 2B6YA 1L47A 1QTVA 1CU5A 1P64A 1L55A 141LA 1QT4A 3G3WA 4EKSA 120LA 1L22A 1LYGA 147LA 2O79A 3C8SA 177LA 4I7KA 3DN4A 113LA 247LA 3F9LA 1L25A 258LA 1L91A 1L07A 3OE0A 1L93A 3CDQA 1JTNA 1L02A 164LA 1G0KA 1L18A 127LA 143LA 1D2WA 4LDLA 1L13A 3D4SA 1KW7A 160LA 1DYAA 1C67A 3DN1A 1LWGA 254LA 1L05A 4EXMA 1QT8A 2LCBA 2O7AA 2B6TA 1L57A 3DNAA 2A4TA 218LA 2OTYX 3HTBA 2ANXA 1KS3A 2RH1A 3C7ZA 1L44A 2OE4X 1PQKA 1L76A 162LA 3DN0A 171LA 3HTDA 1C6HA 1G0QA 236LA 1CV0A 3HDFA 3GUJA 3SBBC 2NTGA 3HUKA 2RAYX 200LA 1C6KA 1SSWA 3SBAA 3HU8A 1SWZA 1L97A 1L17A 4S0WA 1C6AA 111LA 1L11A 1DYEA 2HULA 2IGCA 1OVJA 3NYAA 1G1WA 1C6DA 3F8VA 155LA 1L33A 1C63A 1L28A 148LE 142LA 1L00A 209LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
5KXXA 4XJFA 157LA 1L31A 3GUNA 2OU8A 221LA 1IOSA 112LA 1B5WA 1L70A 1JUGA 1WQMA 4I7NA 2IFFY 1HFZA 1DXJA 1VDQA 1AT5A 1YQVY 3G3VA 4KL7A 2DQCY 4CGEA 1L54A 4G4BA 3L2XA 197LA 5L9JA 1LSCA 3MGWA 1MELL 4H9IA 1L0KA 3EMSA 1BGIA 4HTNA 4ETDA 3WW5A 5I53A 3W6CA 1P36A 1IP7A 3DN8A 5KXKA 4RW2A 182LA 1JKDA 1XJTA 1K28A 1D9UA 4HSFA 137LA 4HTQA 1WTNA 1GF6A 1C62A 1L94A 1ZWNA 4EJ4A 229LA 198LA 1L08A 1YAMA 4NGYA 1BB7A 4UWNA 219LA 4WL6A 4BADA 1JISA 1P3NA 1HERA 5L3IA 1UIAA 4H8YA 1GBYA 4XJHA 1D0MA 1VFBC 4Z98A 1WQRA 4ET8A 1L92A 2G4NA 3N9CA 3RZEA 1IWXA 251LA 3HBEX 4DDCA 4YOPA 3V2WA 2BQGA 1D2YA 4GCBA 4NEBA 2Z2EA 5LA5A 1IEEA 1A4VA 4PGJB 4IJ4A 4TWSA 1KXXA 1L81A 3M3UA 1GEZA 1IC5Y 3NY8A 4G49A 1UIGA 1SQ2L 1NDMC 4OO9A 2ZQ4A 1QT6A 2RB1X 1QT3A 1FKQA 1CUQA 4LYBA 1CKCA 145LA 4LDEA 4ARQA 5A3EA 2EPEA 5JENB 1VDPA 4DD3A 5J7CA 1LYIA 158LA 4G9SA 1L83A 3C82A 1P2CC 1LZ6A 4W55A 1OWYA 2MEIA 1OWZA 227LA 1T6HA 4NIJA 2HU1A 1LKRA 1LSAA 2D4JA 2I26L 3HBHA 1IY4A 2Z12A 1C61A 1GPQC 1OUJA 1B7OA 1H87A 1GB2A 1OV7A 4C3WA 1JEFA 4H9FA 3J4GA 1LZTA 5KKIA 1B7MA 1IP6A 223LA 1D3MA 3E3DA 1LI3A 4KT3A 228LA 2RB0X 1P6YA 2F30A 1ZYTA 3HDEA 1WTHA 5A3ZA 3P66A 1JIYA 1KIRC 1GBZA 1LSFA 216LA 132LA 1L49A 259LA 1IO5A 3DKEX 1W6ZA 1I20A 1VDTA 4N8ZA 2MECA 1DPXA 2D6BA 1LZ4A 2MEFA 5ILCA 1PS5A 3GUPA 3WW6A 1NDGC 4BAPA 1YL1X 3GUKA 4XJBA 5F14A 4DDBA 1C7PA 4I7TA 2LC9A 2HEDA 4TUNA 4DD1A 149LA 3AYQA 5FEKA 3FADA 1LZNA 2GV0A 1LZ1A 193LA 3C83A 3EMLA 5B07A 1REZA 1JSEA 1L10A 2BQBA 3A95A 3L64A 5HMVA 4H9HA 4NHPA 1GHLA 118LA 4K5YA 2XBSA 4NGIA 4CFOA 1BB4A 153LA 1JKBA 2W1YA 4GN3A 4H9CA 4E97A 1D6PA 5I14A 3W6FA 1L16A 2C8PA 2YBLA 1LSYA 4WLXA 2Z2FA 4DC4A 3GUIA 1IP1A 3HTGA 1G7MC 1P5CA 1IP3A 1REYA 3QE8A 1IIZA 1FBIX 1HNLA 4I7OA 3AJNA 3GUMA 4I8SA 2EQLA 1J1OY 1INUA 4W53A 151LA 181LA 2BQAA 3HT9A 2XTHA 4YXCA 176LA 1B9OA 4PHIA 1YAOA 1V7TA 1GB7A 3FA0A 5LA8A 240LA 5APDA 4ET9A 1L38A 2YBMA 2Q9DA 2BLYA 5FHWA 1C6TA 2LHMA 3WXTA 1JITA 1HC0A 1L66A 214LA 2X0AA 3C8RA 1L73A 1LSEA 2VB1A 3SB8A 241LA 1L41A 2RB2X 1L62A 2Z39A 4B49A 1FLYA 3C8QA 211LA 1JPOA 1MLCE 1WQPA 1QIOA 2F32A 4N0JA 262LA 133LA 2B70A 4GCFA 1FN5A 2B75A 4IASA 1L47A 1TAYA 141LA 1EQEA 1QT4A 4J7VA 2YSSC 2DBTA 5LVGA 147LA 2O79A 154LA 4OOTA 3DN4A 3CSRA 2Z19A 3OE0A 3CDQA 1JTNA 1RJCB 1CJ8A 5DL9A 143LA 3IJVA 3P4ZA 3TMXA 4WM6A 1F0WA 1DYAA 3DN1A 4HJZA 254LA 5LVJA 4AXTA 1QT8A 1ALCA 2LCBA 1YANA 2A4TA 2ANXA 1KS3A 5F9XA 1JKAA 5KXTA 1PQKA 3TXJA 1L76A 1GFJA 1JJ0A 4I0CA 3HTDA 1IR9A 236LA 1LJ4A 3SBBC 1SLYA 1LKSA 5ILFA 1L97A 3A6BY 4S0WA 3D9AC 4G4CA 1DYEA 2IGCA 4H9AA 3FI7A 1GF8A 148LE 125LA 242LA 1GDXA 1LJFA 2B6ZA 4LYZA 2ZNWY 4OWEA 3GXRA 2LYOA 3TXBA 4YM8A 4XENA 1OUDA 1T8FA 1B5VA 2D4KA 1BHZA 237LA 3SB5A 1EPYA 1I1ZA 3A96A 192LA 167LA 1A2YC 1NF5A 4MCKA 5DN5A 1CX6A 4W59A 4NSJA 2LZMA 208LA 1G7HC 5KKJA 1F6RA 1V7SA 3N9EA 4HJYA 1QTCA 174LA 245LA 1B0DA 4DQ7A 4DQ5A 4IAPA 126LA 1FKVA 5C6LA 1L06A 4PRUA 1LI6A 4I7JA 4N5RA 1CKGA 4NSHA 1IVMA 2MEBA 1P56A 4B1AA 1OUHA 1RCMA 4WM1A 239LA 2MEDA 232LA 2W1LA 1KNIA 260LA 5APFA 206LA 4RDSA 4NGJA 5DN4A 1L37A 255LA 1HEQA 1LHMA 1Z55A 1B7QA 3WL2A 2Q0MX 1LZYA 2BQCA 4XJDA 3TXEA 1LMOA 3HUAA 3TXKA 1UUZC 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 5KXX A;  4XJF A;  157L A;  1L31 A;  3GUN A;  2OU8 A;  221L A;  1IOS A;  112L A;  1B5W A;  1L70 A;  1JUG A;  1WQM A;  4I7N A;  2IFF Y;  1HFZ A;  1DXJ A;  1VDQ A;  1AT5 A;  1YQV Y;  3G3V A;  4KL7 A;  2DQC Y;  4CGE A;  1L54 A;  4G4B A;  3L2X A;  197L A;  5L9J A;  1LSC A;  3MGW A;  1MEL L;  4H9I A;  1L0K A;  3EMS A;  1BGI A;  4HTN A;  4ETD A;  3WW5 A;  5I53 A;  3W6C A;  1P36 A;  1IP7 A;  3DN8 A;  5KXK A;  4RW2 A;  182L A;  1JKD A;  1XJT A;  1K28 A;  1D9U A;  4HSF A;  137L A;  4HTQ A;  1WTN A;  1GF6 A;  1C62 A;  1L94 A;  1ZWN A;  4EJ4 A;  229L A;  198L A;  1L08 A;  1YAM A;  4NGY A;  1BB7 A;  4UWN A;  219L A;  4WL6 A;  4BAD A;  1JIS A;  1P3N A;  1HER A;  5L3I A;  1UIA A;  4H8Y A;  1GBY A;  4XJH A;  1D0M A;  1VFB C;  4Z98 A;  1WQR A;  4ET8 A;  1L92 A;  2G4N A;  3N9C A;  3RZE A;  1IWX A;  251L A;  3HBE X;  4DDC A;  4YOP A;  3V2W A;  2BQG A;  1D2Y A;  4GCB A;  4NEB A;  2Z2E A;  5LA5 A;  1IEE A;  1A4V A;  4PGJ B;  4IJ4 A;  4TWS A;  1KXX A;  1L81 A;  3M3U A;  1GEZ A;  1IC5 Y;  3NY8 A;  4G49 A;  1UIG A; 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