1QUOA

L99a/e108v mutant of t4 lysozyme
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
162
structure length
162
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGYYTIGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAAAINMVFQMGVTGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords PROTEIN (LYSOZYME)
publication title Structural analysis of a non-contiguous second-site revertant in T4 lysozyme shows that increasing the rigidity of a protein can enhance its stability.
pubmed doi rcsb
source organism Enterobacteria phage t4
total genus 59
structure length 162
sequence length 162
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1999-07-01

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1quoA00
1L03A 1L21A 2OTZX 1C6QA 245LA 1L89A 1LWGA 1D3NA 3HH6A 1G0QA 3G3VA 2B6YA 1L04A 1LYGA 1L38A 1WTHA 1L93A 3GULA 3SB5A 4ARMB 249LA 1ZWNA 3GUMA 219LA 3C8QA 145LA 2F32A 244LA 174LA 4I7LA 2B6ZA 200LA 2RBSA 175LA 3DKEX 1CV1A 4I7PA 1G0LA 3NY9A 262LA 139LA 110LA 1C65A 1SX7A 4EXMA 191LA 4I7RA 1G0JA 246LA 4I7KA 187LA 2B75A 1L62A 2A4TA 168LA 141LA 261LA 248LA 1LI6A 235LA 3DN4A 257LA 4LZMA 213LA 3CDVA 237LA 4ARLA 1L53A 1L35A 1P37A 3DN0A 1D3MA 2B7XA 231LA 234LA 183LA 1G1VA 3GUPA 1C61A 1T8AA 159LA 229LA 1P7SA 167LA 1L24A 3GUNA 119LA 1L25A 1LGWA 3PDSA 3HDEA 3CDOA 1QTHA 197LA 123LA 3FI5A 3SBAA 1CVKA 140LA 1C6BA 1L34A 1LYFA 3HH5A 1L61A 1L69A 1L90A 1L55A 2RBNA 1QTVA 2O79A 209LA 4EKRA 2HULA 1QT5A 186LA 1L81A 1OYUA 3SBBC 1L07A 137LA 4W58A 3NY8A 4LDLA 2RB1X 4W52A 1QUDA 1L11A 1C66A 1L80A 3EMLA 1L86A 1DYDA 1I6SA 4IAPA 1LWKA 1CV5A 1L73A 1C67A 3HTGA 3HH3A 3FADA 3K2RA 1L88A 1L51A 2B73A 1PQKA 113LA 2HUKA 3C7WA 2Q9DA 1QUOA 3C82A 1D3FA 5LZMA 4LDOA 1G0MA 2B72A 1L29A 1L71A 1OWZA 4W51A 212LA 184LA 226LA 205LA 2RAYX 4E97A 1C6HA 1L10A 1G0KA 3HU9A 220LA 1C6AA 3C8RA 2ANVA 4EKPA 1OV5A 1C68A 1PQMA 4W56A 120LA 1L43A 216LA 1L63A 2RAZX 3DN3A 206LA 3L2XA 3DMVA 3DMZA 1L33A 1DYAA 195LA 1KS3A 4I7TA 1L64A 1CX7A 128LA 146LA 3HU8A 155LA 180LA 1L46A 171LA 1LYJA 1CUPA 126LA 4GBRB 3SN6R 1QT4A 1L20A 210LA 4YXAC 3GUKA 3HUQA 3SB8A 1XEPA 3DN1A 138LA 1L98A 230LA 1QT3A 3HTDA 1CX6A 238LA 1L45A 1CTWA 1L65A 151LA 201LA 1LGUA 1LI3A 256LA 1JQUA 1D9WA 4ZPUA 2QB0B 1C6NA 4I7JA 1B6IA 1EPYA 1C64A 150LA 2RBOA 1L59A 252LA 2NTHA 1L12A 1PQJA 1L14A 142LA 4I7OA 4W53A 1L22A 2NTGA 1LYDA 3HDFA 1LLHA 1CV0A 131LA 3OE0A 1L87A 127LA 242LA 4YXCA 1L70A 1K28A 1C6EA 1KNIA 3CDRA 1L44A 1QS9A 1LYIA 1TLAA 2OU8A 5I14A 3GUJA 1QS5A 3QAKA 1C6TA 1L58A 4I7QA 1L57A 192LA 1KY1A 4EJ4A 3D4SA 225LA 149LA 1LGXA 241LA 3GUOA 176LA 3L64A 103LA 3VW7A 3DN8A 102LA 1C6PA 1CU6A 221LA 1C6IA 2RB0X 107LA 1OV7A 4ARJA 1QTBA 178LA 3F9LA 1L47A 259LA 1L99A 2OE4X 3CDQA 4YX7C 1QT7A 1L37A 260LA 4I7MA 2OU9A 4S0WA 2IGCA 3GUIA 1L17A 1L39A 2L78A 1L40A 1L60A 4I7NA 1L92A 1QT6A 177LA 4K5YA 1T8FA 251LA 3DN6A 1L08A 1L82A 1P5CA 1QSBA 118LA 1XJUA 158LA 1L79A 4EKQA 3OE9A 1JTNA 1DYGA 1L01A 258LA 1KW5A 147LA 2B6XA 2CUUA 255LA 228LA 3UONA 2QARC 2F47A 1C6KA 2RBPA 1L23A 1G0PA 1P46A 1CU3A 1T97A 1L30A 1SX2A 7LZMA 1L76A 182LA 1P64A 1L72A 1L0JA 1QT8A 1L97A 3LZMA 4ARPA 2O4WA 3SB6A 1L09A 108LA 2RB2X 4DJHA 4EPIA 2OE7X 4DKLA 3JR6A 1L26A 4I7SA 1L67A 1T8GA 1C6MA 3G3WA 3DN2A 243LA 4PK0A 3HUAA 170LA 1C6CA 166LA 3V2WA 1OWYA 165LA 2Z6BA 215LA 3C81A 148LE 2RBQA 185LA 3C7YA 1SWYA 1L75A 1L02A 2B74A 4W59A 1L96A 164LA 1CV6A 254LA 2B6WA 1P36A 1DYFA 1LI2A 1C6DA 1LW9A 1PQDA 1NHBA 1QUGA 3HT6A 3RZEA 2OE9X 109LA 3RUNA 2B70A 3HT8A 1D3JA 144LA 3SB9A 162LA 223LA 1KY0A 1L84A 1D2WA 1G07A 160LA 4W54A 227LA 232LA 1L42A 130LA 2OTYX 4EKSA 3HWLA 233LA 1CV4A 196LA 247LA 1DYEA 2OU0X 1L06A 217LA 3HH4A 1L0KA 1L85A 1L32A 1C6LA 3C80A 122LA 1L31A 198LA 152LA 2LZMA 115LA 4EPFA 189LA 236LA 3C7ZA 214LA 240LA 3C83A 1L50A 3PBLA 1C6GA 143LA 1L52A 104LA 1L27A 1L48A 1QTDA 3F8VA 125LA 1L41A 1L68A 1L91A 1L83A 1L16A 1C60A 1DYBA 181LA 1OVKA 3FA0A 1JTMA 1P3NA 1SWZA 4OO9A 172LA 2LC9A 1QUHA 2F2QA 3HUKA 1ZURA 3DNAA 2HUMA 1LPYA 1G0GA 1L36A 1XJTA 2B6TA 1G06A 1C6FA 1PQOA 1L18A 1SSWA 3NYAA 1T6HA 250LA 1PQIA 1LYEA 1P2LA 111LA 4W55A 1L15A 224LA 114LA 1QTCA 4W57A 1L95A 4ARQA 188LA 1CV3A 1KW7A 211LA 1CU0A 3C8SA 112LA 253LA 3HTBA 1L66A 239LA 3ODUA 1QSQA 156LA 173LA 1C63A 2OEAX 4DAJA 2RH1A 222LA 2Q9EA 4PJZA 1QTZA 1L74A 1D2YA 1L94A 1CU2A 1OVHA 2LCBA 218LA 169LA 129LA 1SSYA 3CDTA 1P2RA 3G3XA 3HT9A 3SB7A 1C62A 4AQNA 157LA 1OVJA 4GRVA 1L28A 3V2YA 1L13A 1DYCA 1L77A 1ZYTA 3OE6A 4LDEA 4ARQB 4ARMA 3OE8A 6LZMA 1LYHA 3DMXA 163LA 190LA 199LA 1P6YA 2RBRA 3HT7A 1G1WA 161LA 1P56A 1L54A 1L19A 2ANXA 1C69A 1L56A 1C6JA 1CU5A 1CUQA 1L49A 2O7AA 1L05A 1L00A 3HTFA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1DKJA 245LA 3WUAA 1OUBA 3G3VA 3N9CA 2B6YA 1LSNA 1NMMA 1GFGA 1YL1X 1LSYA 3SB5A 1LSEA 1LKRA 4NG1A 4GLAA 3AZ6A 1QTEA 1AM7A 2F32A 1GPQC 1JKCA 1IWWA 3EBAB 4HTNA 4NGWA 1QSAA 1JTOL 110LA 4AGAA 4EXMA 3P68A 2HU3A 4DDAA 1LZNA 3WVYA 1L62A 1OUEA 168LA 1LI6A 4G4CA 235LA 1JKAA 257LA 5B1FA 4H9BA 4LZMA 213LA 3W6AA 1C46A 1L53A 1L35A 1BVXA 4H93A 4Z41A 1D3MA 2B7XA 231LA 234LA 135LA 1PS5A 1C61A 229LA 1P7SA 4YEMA 2CGIA 3TXDA 1LGWA 3PDSA 1GFRA 3SBAA 1LYFA 2EKSC 1L69A 1W08A 4QDNA 2O79A 1B5ZA 1B5XA 2BLXA 1REMA 1VATA 4EKRA 1C7PA 1GB7A 1IEEA 4HV2A 2X0AA 137LA 4W52A 4NHSA 1QUDA 1C66A 4IJ4A 3WH1A 1L80A 3TXFA 1LWKA 1D6PA 3HH3A 1YILA 1LZ9A 113LA 1XGPC 1GFHA 5D5FA 5I5QA 5LZMA 1WQRA 1L71A 2PC2A 1LZRA 4W51A 212LA 3A93A 1GFTA 4NGYA 4ET9A 1C6HA 1VDQA 1IP1A 1LKSA 1G7JC 1CKDA 4DD0A 5LXWA 3AW6A 2DQAA 1PQMA 120LA 3L2XA 3DMVA 1HNLA 5FSTA 5HQ1A 195LA 1KS3A 1MLCE 1L64A 146LA 3ATOA 3HU8A 1L46A 1LYJA 1UIGA 4C5FA 4GN3A 126LA 1LZGA 1QT4A 1GE3A 4YXAC 3TXIA 3DN1A 138LA 1L98A 4XYYA 1LSCA 3TXEA 151LA 1KIPC 5FELA 1IOSA 2ZWBA 1OUHA 1LI3A 1LJJA 1JQUA 1NQIA 2QB0B 1C6NA 4HTQA 4I7JA 1EPYA 150LA 2NTHA 3CSZA 4HV1A 2D4KA 4OWAA 3F6ZA 2MEFA 4GLVA 1J1XY 2CJLA 3HDFA 3OE0A 3CSRA 4C3WA 1IR7A 4OWCA 3KAMA 5L3IA 1L70A 5KXSA 1UIHA 1KNIA 1QS9A 2W1LA 4PRQA 2OU8A 3GUJA 5KXTA 1XEKA 3W6EA 3D4SA 4H8ZA 5LA5A 2BQDA 3ATNA 3DN8A 221LA 3TMVA 4CFPA 4DQJA 3RZ4A 2RB0X 4N5RA 5KKIA 1IWZA 3CDQA 4LT3A 1B7RA 4I7MA 3TXHA 1FKVA 1YQVY 1L40A 4NGOA 3CQLA 1A2YC 1IOQA 2XBRA 4I7NA 4NGLA 177LA 1T8FA 1B5YA 1LJEA 4X3BA 3DN6A 1TDYA 1P5CA 4GN4A 1XJUA 4EKQA 1GBWA 1JTNA 1DYGA 1GFUA 2QARC 5ILCA 2RBPA 1G0PA 1P46A 4M4OA 1T97A 1L30A 132LA 2W1XA 1IY3A 182LA 1L72A 1QT8A 1L97A 5JENB 2RSCA 5DLAA 1OUGA 1GF8A 3HBDA 3SB6A 1JEFA 3WU9A 2OE7X 4MCKA 4GCBA 2LYOA 2DQFC 4PK0A 3A92A 3LYTA 3V2WA 5E9RA 1OWYA 2DQCY 2Z6BA 4DT3A 4DQ7A 148LE 2ZYCA 3ZVQB 3C7YA 1SWYA 2B74A 4W59A 1TEWA 2B6WA 3LYZA 193LA 1IIZA 109LA 3RUNA 3HT8A 5KXMA 3WXTA 1C08C 1G07A 1INUA 1UIDA 4XADA 1XGUC 160LA 1L42A 2FBDA 4EKSA 2D4IA 1TAYA 2OU0X 1SQ2L 4NIJA 4KXIA 4YF2A 198LA 152LA 4CFOA 236LA 3T6UA 3TXJA 214LA 2XQOA 4NSJA 1BHZA 3PBLA 143LA 104LA 1QTDA 3F8VA 2Z37A 5KJ9A 1HHLA 1L68A 4WO6A 3AGIA 1KIRC 6LYZA 181LA 4LYZA 1SWZA 4G9SA 1QUHA 4LFXA 1G0GA 1XJTA 1PQOA 1FBIX 2XJWA 1IOCA 1L18A 2AUBA 1T6HA 1IWYA 3FI7A 4KL7A 1IORA 4TSBA 4OOOA 114LA 1VDTA 1L95A 4ARQA 4DD1A 3IJUA 1CU0A 3C8SA 3SP3A 1WVVA 2H9KA 3HTBA 5AMYA 3W6CA 1QSQA 156LA 173LA 1C63A 1LSPA 2OEAX 2B5ZA 1IO5A 222LA 2Q9EA 4LYOA 1CU2A 5J7CA 3LZTA 4GCEA 3CDTA 1P2RA 1GF6A 3SB7A 1HEPA 1L13A 5B59A 3OE6A 4IASA 3OE8A 4NSGA 1LYHA 6LZMA 3DMXA 1P6YA 2RBRA 1GEVA 1JITA 3HT7A 1LZYA 2MEDA 1L54A 2IFFY 1T6VL 1UIBA 2FYDA 1L49A 2O7AA 1L03A 1C6QA 1D3NA 5HMVA 3WPKA 1GE0A 3CT5A 4HJZA 1JUGA 249LA 3C8QA 145LA 5LVHA 3A96A 4WG1A 1REXA 1GB0A 1LSDA 3EXDA 4H9EA 2BPUA 1LMCA 3WYHA 3P4ZA 3NY9A 1DI4A 1DQJC 1RI8B 2F2NA 1IP5A 1B2KA 191LA 4I7RA 1IP2A 3MGWA 1JTTL 4I7KA 1IWUA 1XSFA 1I20A 2A4TA 4WM4A 4XJDA 4WMGA 4CHXA 2D4JA 1OP9B 3CDVA 1B5VA 1KXYA 4ARLA 4LYTA 2BQKA 4KT3A 4WM1A 4DD3A 1T8AA 1L24A 4WM3A 3HDEA 1YROA 4NHIA 3A3QA 2YBNA 1LZEA 2F4GA 1L34A 3HH5A 2N5ZA 1L55A 4DQ5A 2XBSA 209LA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1DKJ A;  245L A;  3WUA A;  1OUB A;  3G3V A;  3N9C A;  2B6Y A;  1LSN A;  1NMM A;  1GFG A;  1YL1 X;  1LSY A;  3SB5 A;  1LSE A;  1LKR A;  4NG1 A;  4GLA A;  3AZ6 A;  1QTE A;  1AM7 A;  2F32 A;  1GPQ C;  1JKC A;  1IWW A;  3EBA B;  4HTN A;  4NGW A;  1QSA A;  1JTO L;  110L A;  4AGA A;  4EXM A;  3P68 A;  2HU3 A;  4DDA A;  1LZN A;  3WVY A;  1L62 A;  1OUE A;  168L A;  1LI6 A;  4G4C A;  235L A;  1JKA A;  257L A;  5B1F A;  4H9B A;  4LZM A;  213L A;  3W6A A;  1C46 A;  1L53 A;  1L35 A;  1BVX A;  4H93 A;  4Z41 A;  1D3M A;  2B7X A;  231L A;  234L A;  135L A;  1PS5 A;  1C61 A;  229L A;  1P7S A;  4YEM A;  2CGI A;  3TXD A;  1LGW A;  3PDS A;  1GFR A;  3SBA A;  1LYF A;  2EKS C;  1L69 A;  1W08 A;  4QDN A;  2O79 A;  1B5Z A;  1B5X A;  2BLX A;  1REM A;  1VAT A;  4EKR A;  1C7P A;  1GB7 A;  1IEE A;  4HV2 A;  2X0A A;  137L A;  4W52 A;  4NHS A;  1QUD A;  1C66 A;  4IJ4 A;  3WH1 A;  1L80 A;  3TXF A;  1LWK A;  1D6P A;  3HH3 A;  1YIL A;  1LZ9 A;  113L A;  1XGP C;  1GFH A;  5D5F A;  5I5Q A;  5LZM A;  1WQR A;  1L71 A;  2PC2 A; 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