1QUSA

1.7 a resolution structure of the soluble lytic transglycosylase slt35 from escherichia coli
Total Genus 110
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
110
sequence length
322
structure length
312
Chain Sequence
MVEPQHNVMQMGGDFANNPNAQQFIDKMVNKHGFDRQQLQEILSQAKRLDSVLRLMDNQGPNGAWLRYRKKFITPDNVQNGVVFWNQYEDALNRAWQVYGVPPEIIVGIIGVETRWGRVMGKTRILDALATLSFNYPRRAEYFSGELETFLLMARDEQDDPLNLKGSFAGAMGYGQFMPSSYKQYAVDFSGDGHINLWDPVDAIGSVANYFKAHGWVKGDQVAVMANGQAPGLPNGFKTKYSISQLAAAGLTPQQPLGNHQQASLLRLDVGTGYQYWYGLPNFYTITRYNHSTHYAMAVWQLGQAVALARVQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE B
publication title Crystal structure of Escherichia coli lytic transglycosylase Slt35 reveals a lysozyme-like catalytic domain with an EF-hand.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 110
structure length 312
sequence length 322
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 1999-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13406 SLT_2 Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.8.350 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Helicase, Ruva Protein; domain 3 Bacterial muramidase 1qusA01
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1qusA02
1HEPA 1UCOA 1UIGA 2DQJY 2GV0A 2MEEA 2BQOA 1F10A 3W6FA 1T3PA 5A3ZA 5IELA 135LA 1IWTA 5B07A 1AKIA 1GE4A 4NGZA 2BQNA 1YAQA 3T6UA 1XSFA 4Z41A 1EQEA 1YAMA 1AT5A 4XN6A 1FDLY 1MELL 1TAYA 4GN3A 4I8SA 4DD9A 1C46A 3B6LA 4QEQA 1DKKA 2BQGA 1VAUA 4NGYA 1LSFA 5APEA 4H9CA 4AGAA 1I1ZA 4HV1A 1OUGA 2Z2FA 1GWDA 1YL1X 4FJRA 1IOQA 4DYGA 4N8ZA 1FKQA 3WU8A 5KXPA 4DWXA 5KXWA 1GFUA 1BVKC 1LJIA 4B4JA 1QTKA 1HSWA 1GE0A 2Z39A 3CSZA 1LSGA 1TEWA 3LYZA 2HUBA 2X0AA 1FLYA 1REXA 5DM9A 3TMWA 4GN5C 1YROA 1LZ6A 1YANA 1P2CC 2MECA 4MCKA 2A7FA 1GF4A 1A4VA 4WM6A 1B7PA 1GAYA 1GFRA 1HELA 1LZRA 5LVJA 5LYTA 1KXWA 1UICA 3TXIA 3LZTA 4NSGA 4RLMA 4LYBA 3OJPA 1G7LC 2DQDY 1AM7A 1LZ8A 2XBSA 1G7IC 4II8A 4B49A 1JHLA 4EOFA 2Z2EA 2CDSA 1REZA 3A92A 3AW7A 4PPOA 1QQYA 4H91A 3W6BA 2HEEA 5HNCA 1C10A 3A8ZA 3EO5A 1IWXA 3W3EA 3LN2A 3AGIA 2YBIA 1QUTA 5T3FA 1IVMA 1D0KA 1UA6Y 1B5ZA 1JEFA 1IP1A 1T6VL 3RZ4A 1N4FA 4J1BA 4R6CA 4GCBA 1TCYA 4TUNA 1GFHA 4XENA 5LVHA 1IOCA 4G49A 5FDJA 5HLLA 4GCEA 3GXRA 2CGIA 2BQHA 2BQMA 2D4KA 2LYZA 5F14A 3WPLA 4EMNA 2Y8PA 4LYCA 3AZ4A 4Z3MA 1PS5A 1LMCA 1OQMA 1UUZC 4H93A 1AZFA 4L41A 1A2YC 2BPUA 4CJ2A 1LZDA 4ML7A 2I26L 5LINA 2DQEY 2FYCA 3A34A 3AW6A 4H8YA 4LFPA 4WM3A 4X3BA 134LA 1IY3A 1B5XA 1INUA 1H6MA 4G9SA 5KXSA 5I54A 1WQQA 1IP2A 2FBBA 3RT5X 4AXTA 1YL0X 1RE2A 2G4PA 3WU9A 5A3EA 4NHTA 2LZ2A 5LVIA 1NDGC 1VFBC 1IP7A 1GPQC 3LYTA 4TTDA 2MEGA 3RW8A 2VB1A 3B72A 1WQRA 4WM2A 1F0WA 1LKSA 4XADA 2HEFA 4ET8A 1OUBA 4C3WA 2ZYPA 4I0CA 1HFYA 2ZWBA 1JKCA 1LCNA 1HFXA 3QNGA 1HHLA 1B7QA 1SQ2L 3IJUA 1IORA 4CGEA 3TXKA 1JTOL 1LSCA 4YEMA 194LA 3AB6A 4GCCA 4J1AA 1HSXA 1UIHA 1JJ0A 2BQBA 1O23A 1ZV5L 4OWAA 1CJ8A 1OUAA 4YM8A 1JKAA 1D6PA 1LZSA 2EPEA 3N9EA 1GEZA 2D4IA 1HMLA 2HECA 1OUIA 4LYMA 4WM4A 5E4PA 5KKJA 4LT3A 2MEFA 1RCMA 3IJVA 4LYZA 4DD0A 5II3A 4NGJA 5I4XA 2BQDA 3IWRA 4H90A 1BB7A 4OOOA 1QDRA 5HMJA 5L9JA 4RW2A 4YF2A 4NHIA 4OWCA 193LA 2DBTA 4UWNA 1IC7Y 1FBIX 4HJVA 2BLYA 4KL7A 2ZNXY 1LYOA 1GD6A 5APDA 1ZMYL 3W6DA 132LA 2A7DA 3WYHA 3A3RX 2I25L 1GAZA 2F2NA 4H9HA 1LTMA 3ULRA 3WW5A 1JJ1A 1J1PY 4NWEA 5D5CA 3TXFA 1HEQA 5F9XA 1LZTA 3MGWA 3N9AA 5KXTA 1FLQA 2RSCA 1IY4A 1IP4A 1YQVY 4N1CC 3WULA 3EMSA 4NY5A 1LHHA 4R0FA 1G7HC 1LOZA 1D6QA 1JWRA 4HTNA 1I56A 1YKYX 1LYYA 1CJ6A 3WW6A 5B05A 5AMYA 4NGVA 4ANRA 1OUCA 2HU3A 3G3AB 4ZEEA 2YSSC 1LZ1A 1HNLA 1LMQA 1LJ4A 1C7PA 2DKVA 2H9KA 4MR1A 4HTKA 1B2KA 1LMAA 4H9AA 1UACY 4BS7A 2ZQ3A 2H5ZA 1IX0A 1NHEA 2ZIJA 4NGLA 4WM5A 4NGOA 4WL6A 5APCA 3G3BB 5C6IA 5ILCA 2ZILA 1D0MA 1EQ4A 4RLNA 1LZNA 2D91A 4HP0A 4NGWA 3EXDA 3HBHA 4WG1A 4GN4A 9LYZA 1G7JC 1DQJC 1PZYA 2MEDA 5B06A 3OK0A 1UIEA 1LMNA 4NWHA 5J7CA 5LVGA 2MEIA 1VDPA 4H9FA 4XJDA 1YKXX 2G4QA 3FI7A 4PJ2C 1GXXA 4XJHA 1OUEA 1OUFA 3ATOA 1EL1A 4M4OA 1LZ5A 1LSBA 1B5WA 1IR7A 2DQHY 1IO5A 3CQLA 4FDYA 4HSFA 2N5ZA 1XGUC 4KPMA 1VEDA 3QY4A 2CWIA 4DDBA 5DLAA 5LAFA 1WQPA 2Z19A 5B1GA 1LYZA 3BKHA 5KXXA 3LHMA 4H9BA 1GBSA 1HFZA 3A3QA 4PRUA 1IWZA 4IASA 3TXGA 4HJYA 2DQIY 3P4ZA 4LT2A 1UIDA 1LHJA 1BVXA 3M3UA 4H94A 1NBYC 3WH1A 5L3HA 1XEJA 3A6CY 3T36A 1YILA 3P64A 3B0IA 1BHZA 5KXZA 2IFFY 1XGRC 4N9RA 3TXJA 1WTMA 1GBZA 4QDNA 1LJFA 3HBEX 5LVKA 1C08C 3CT5A 4N5RA 2MEHA 4PRQA 2BQKA 1HENA 4DT3A 2LZTA 3BKVA 1GB8A 5L3IA 8LYZA 1KIQC 2DQGY 4NGKA 5B1FA 5K7OA 1LMOA 1ZVHL 2ZQ4A 5F16A 4TX7A 2XJWA 2XTHA 5LA5A 3ZVQA 4A7DA 4LYTA 5KXNA 3A94A 2EKSC 2D6BA 1LZYA 4DC4A 1GEVA 5KXRA 1LZCA 1TBYA 1EQ5A 1V7TA 2DQAA 2MEAA 2BQFA 4WLTA 4PGJB 1LZEA 1LZ4A 2YVBA 3CT0A 4LFXA 5I4WA 2DQFC 1LSAA 2F30A 4B0DA 5DN4A 1GBYA 1IC5Y 1LPIA 4G4BA 2YBNA 3A96A 6LYTA 1LJHA 3K3TA 3HFMY 4O34A 1LZBA 5LAGA 4ETDA 1TDYA 4BAFA 3WUMA 2CJLA 2YDGA 3LYMA 4LGKA 1QIOA 3ZVQB 4RW1A 1H87A 1WQOA 1BGIA 4NIJA 4NHQA 1GB5A 2HTXA 4LT1A 3WU7A 5KXKA 1LHKA 3N9CA 1JJ3A 1GE2A 4NG8A 3SP3A 1REMA 3KAMA 4LYOA 4P2EA 3AYQA 3WVYA 7LYZA 3LZ2A 1XGTC 1LSZA 1LJ3A 1D9UA 1NMMA 2BLXA 1IP6A 1UBZA 4HJZA 1GBOA 4N1EI 2I6ZA 4W96A 4YEOA 3TXEA 1BB5A 5HMVA 1OUHA 1QSAA 2HU1A 1GFAA 1LJKA 3AZ6A 4WG7A 1LSDA 3CSRA 154LA 1LSNA 2BQAA 4ET9A 5KXMA 1RI8B 1JISA 1GF8A 1GDWA 2WARA 2EQLA 1QUSA 1CKFA 4D9ZA 4NHSA 4ETEA 2YBMA 1W08A 1HEWA 5D5FA 2YBJA 5LA8A 1B7MA 3TXBA 1IR9A 1B7LA 1LJNA 1GB2A 1KXXA 4GLVA 4OWHA 5M1YA 3WXTA 4WO6A 1WQMA 4ETBA 4WLXA 153LA 1GF0A 1HEMA 2W1MA 1KXYA 4QGZA 1DKJA 3A90A 4YOPA 5FHWA 4B4IA 5IHGA 2BQIA 4J7VA 1XEKA 4NEBA 1FN5A 1GFEA 1JUGA 1C43A 2H9JA 3E3DA 1G7MC 4XJGA 5I53A 4DD7A 1J1XY 1LAAA 1RFPA 1LMTA 1GBWA 2BAAA 3GXKA 3TXHA 5FCPA 3WMKA 4WM1A 4HTQA 1HF4A 1JSEA 4XJIA 1JKBA 3CSQA 1BB4A 1GDXA 1JPOA 2BQLA 1F6RA 2W1XA 4GCFA 1DI5A 1B5VA 1CJ7A 1GFTA 4H8ZA 3TMVA 2BQJA 4CFPA 4ZIXA 1WVVA 4B1AA 1GB3A 5LXWA 1CKCA 1XGQC 1GFJA 3AZ7A 1J1OY 1IC4Y 1FKVA 1IWUA 1CKHA 1LSEA 1OUDA 1LJGA 4OW1A 3RU5A 3A91A 3J4GA 5HNLA 1GF3A 2DQCY 4IATA 4RDSA 5LYZA 4J0LA 2XBRA 1CKDA 4TSCA 4CHXA 1CNSA 4WOAA 3HBDA 1BB3A 2EIZC 4DDAA 4DDCA 1JITA 1LZ9A 1JTPL 1XFPL 1DI3A 1LHLA 1IP3A 4CFOA 1IWYA 1LSPA 2YBLA 2W1YA 1UIFA 1NF5A 4N0JA 1IIZA 1RJCB 2LYOA 4XJBA 4GCDA 4KXIA 208LA 5KXYA 3WPJA 4WO9A 5APFA 1NWGA 1NKHA 4NSIA 1IEEA 1REYA 4UWUA 4WLDA 1B7OA 1JTTL 4Z98A 3TMXA 1OP9B 4XJFA 4WL7A 1LHMA 5FELA 5DN5A 3W6AA 5DL9A 5F9UA 5I4YA 5C6JA 1ALCA 1BQLY 1YIKA 1VDSA 3AGHA 2FYDA 4ETCA 3A93A 4DD1A 1B9OA 3WL2A 1QDTA 1GF6A 2Z37A 1GB7A 4M6DA 2Z18A 4NHPA 5LYMA 4IJ4A 4G4HA 4YENA 5C6LA 4PHIA 2Z12A 1Z55A 2AUBA 4H9IA 1WVUA 4GLAA 4NFVA 1GHLA 1LHIA 1BWIA 2FBDA 1MLCE 3CB7A 1CKGA 2LYMA 1D0LA 6LYZA 1B7SA 1F6SA 1BB6A 1IWWA 2ZIKA 3A95A 4KT3A 2NWDX 4QY9A 1V7SA 1WTNA 5F81A 3WXUA 4H1PA 1KIPC 1AT6A 4H92A 2D4JA 3RNXA 4U3XB 1NDMC 3ATNA 1FLWA 4TSBA 1ZVYB 2BQEA 1DPWA 1YAOA 3A67Y 1JIYA 4OWEA 1IP5A 1B5UA 2C8OA 5FSTA 1LZAA 4E3UA 1HC0A 3VWOA 4ETAA 1E8LA 1QSWA 2YBHA 4UWVA 1GFVA 3F6ZA 1GXV2 1B5YA 1GF5A 1IOTA 2F4GA 1YAPA 1BWJA 3WPKA 5KY1A 1GE3A 2Q0MX 3QE8A 1BWHA 1XGPC 4WMGA 1I20A 1VDQA 5B59A 1FLUA 5HQ1A 4MSTA 3M18B 1QTEA 2B5ZA 3AJNA 1SLYA 1DXJA 1HMKA 2ZNWY 4C5FA 4LZTA 4WLYA 1B7NA 2IHLA 1NQIA 1OUJA 4NG1A 133LA 5JENB 1LJEA 4H9EA 1LMPA 1GBXA 4B4EA 1IOSA 2LHMA 1JSFA 4LT0A 5KXLA 5I5QA 3CT1A 2F4AA 3D3DA 1B0DA 3D9AC 4DD3A 2ZYCA 3AZ5A 4W94A 1LJJA 3AGGG 3WVXA 1DZBX 1KIRC 5LIOA 3W6CA 2BQCA 5EBHA 1LYSA 5E9RA 1VATA 1HERA 1UIAA 1DI4A 1UIBA 3TMUA 3WUAA 1LKRA 1VDTA 4Z46A 2W1LA 2Z38A 1C45A 1HEOA 1DPXA 4OOTA 3B0KA 3P66A 4XYYA 4H8XA 3LYOA 3W6EA 5ILFA 5KJ9A 3J6KA 4TWSA 5IDDA 4NSHA 5KKIA 1JKDA 1CJ9A 3P65A 4HPEA 4ZFPA 1GE1A 1GF9A 4BAPA 1B7RA 4NSJA 1LZGA 3B0OA 1WQNA 4HV2A 1LSMA 4HPIA 3A6BY 1GB9A 1GFGA 4G4CA 5KXOA 3WUNA 2G4NA 4BADA 1IR8A 3FE0A 3ZEKA 1W6ZA 4OWBA 2HEAA 2HEBA 5FEKA 3TXDA 4NGIA 1GF7A 1GB0A 1NBZC 2HEDA 3P68A 1UC0A 3EBAB 2PC2A 1XEIA 1GB6A 1IWVA 207LA 1LSYA 2MEBA 1GFKA 1YKZX 4DD2A 2C8PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2LVOC 1HEPA 1QAMA 3FYDA 4GH9A 1T3PA 3JR4A 2Z4RA 3U5ZA 3V76A 3KS8A 1HT2E 4NGZA 2BQNA 3SAUA 1AT5A 211LA 1KSFX 4XN6A 1DYDA 1MELL 218LA 2OE9X 4DD9A 4QNRA 3M7GA 2Z2FA 1YL1X 1L45A 2UXDM 4DBGB 2BJVA 4RF0A 4WW0A 246LA 3GLIB 5KXWA 5IWAM 1PQJA 174LA 171LA 1HSWA 2Z39A 1NY6A 3GO8A 2X0AA 1C6BA 1EFUB 1REXA 5DM9A 5EQTA 4NSRA 2EA0A 3TMWA 1P2CC 1R2YA 1SWZA 1GF4A 3TWMA 1A4VA 1B7PA 4CHTB 1SXJE 1UICA 1L27A 4GRIA 3TXIA 1L49A 4DV1M 4EPIA 4LGYA 1T97A 1G7LC 1CV6A 1IN4A 1C1KA 1G7IC 4B49A 4EOFA 1L0KA 1PQOA 1QQYA 1OWYA 1L60A 5EP3A 2HEEA 248LA 112LA 1CTWA 1Q3BA 1DGFA 1TR8A 2JY6B 1MX0A 4AZFA 200LA 3LN2A 1B5ZA 1OTRA 3RZ4A 1XWIA 2KNVA 2QARC 4J1BA 3IG8A 4LF4M 3VKHA 1L86A 1YSYA 5FDJA 4MH0E 3L2AA 2CGIA 2YR0A 4EMNA 2Y8PA 3AZ4A 4Z3MA 2X8AA 2CP8A 1OQMA 4L41A 4CJ2A 3C9PA 2BPUA 2BJWA 1LZDA 4ML7A 2DQEY 5EP4A 3HU8A 4WM3A 3QAKA 134LA 4RF1A 2C99A 5I54A 4AXTA 1YL0X 2G4PA 1B6IA 2VQFM 2LZ2A 4IIWA 1L95A 4X65M 3RW8A 3B72A 4ET8A 1LKSA 4C3WA 2CV0A 1C6MA 1HFYA 4LZMA 5EXTA 1B7QA 3IJUA 4IBBA 3TXKA 3W0LB 4J1AA 1L01A 1JJ0A 2BQBA 4K0KM 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
 1HEP A;  1T3P A;  4NGZ A;  2BQN A;  1AT5 A;  211L A;  4XN6 A;  1DYD A;  1MEL L;  218L A;  2OE9 X;  4DD9 A;  2Z2F A;  1YL1 X;  1L45 A;  246L A;  5KXW A;  1PQJ A;  174L A;  171L A;  1HSW A;  2Z39 A;  2X0A A;  1C6B A;  1REX A;  5DM9 A;  3TMW A;  1P2C C;  1SWZ A;  1GF4 A;  1A4V A;  1B7P A;  1UIC A;  1L27 A;  3TXI A;  1L49 A;  4EPI A;  1T97 A;  1G7L C;  1CV6 A;  1G7I C;  4B49 A;  4EOF A;  1L0K A;  1PQO A;  1QQY A;  1OWY A;  1L60 A;  2HEE A;  248L A;  112L A;  1CTW A;  3LN2 A;  200L A;  1B5Z A;  3RZ4 A;  2QAR C;  4J1B A;  1L86 A;  5FDJ A;  2CGI A;  4EMN A;  2Y8P A;  3AZ4 A;  4Z3M A;  1OQM A;  4L41 A;  4CJ2 A;  2BPU A;  1LZD A;  4ML7 A;  2DQE Y;  3HU8 A;  4WM3 A;  3QAK A;  134L A;  5I54 A;  4AXT A;  1YL0 X;  2G4P A;  1B6I A;  2LZ2 A;  1L95 A;  3RW8 A;  3B72 A;  4ET8 A;  1LKS A;  4C3W A;  1C6M A;  1HFY A;  4LZM A;  1B7Q A;  3IJU A;  3TXK A;  4J1A A;  1L01 A;  1JJ0 A;  2BQB A;  1O23 A;  172L A;  1OUA A;  1SX2 A;  1JKA A;  1D6P A;  158L A;  3N9E A;  185L A;  3LZM A;  1OUI A;  4LT3 A;  181L A;  1L76 A; 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