1QUTA

The soluble lytic transglycosylase slt35 from escherichia coli in complex with n-acetylglucosamine
Total Genus 108
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
108
sequence length
322
structure length
312
Chain Sequence
MVEPQHNVMQMGGDFANNPNAQQFIDKMVNKHGFDRQQLQEILSQAKRLDSVLRLMDNQGPNGAWLRYRKKFITPDNVQNGVVFWNQYEDALNRAWQVYGVPPEIIVGIIGVETRWGRVMGKTRILDALATLSFNYPRRAEYFSGELETFLLMARDEQDDPLNLKGSFAGAMGYGQFMPSSYKQYAVDFSGDGHINLWDPVDAIGSVANYFKAHGWVKGDQVAVMANGQAPGLPNGFKTKYSISQLAAAGLTPQQPLGNHQQASLLRLDVGTGYQYWYGLPNFYTITRYNHSTHYAMAVWQLGQAVALARVQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
molecule keywords LYTIC MUREIN TRANSGLYCOSYLASE B
publication title Crystal structure of Escherichia coli lytic transglycosylase Slt35 reveals a lysozyme-like catalytic domain with an EF-hand.
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
total genus 108
structure length 312
sequence length 322
ec nomenclature ec 4.2.2.n1: Peptidoglycan lytic exotransglycosylase.
pdb deposition date 1999-07-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13406 SLT_2 Transglycosylase SLT domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.8.350 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Helicase, Ruva Protein; domain 3 Bacterial muramidase 1qutA01
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1qutA02
1HSXA 2MEGA 4NGWA 4HJZA 2Z12A 1C08C 1XGPC 3WXUA 3HBDA 1GXXA 2ZNWY 4LZTA 4E3UA 3RZ4A 4WLYA 4G4BA 1KXYA 5FHWA 1IOQA 1KIPC 2MEDA 3AGHA 3HBHA 4B49A 1HEQA 1UC0A 5LVHA 4HP0A 3LZ2A 5HQ1A 4M6DA 3CQLA 3A8ZA 1GWDA 1WVUA 5F14A 4OOOA 1CJ8A 5L3IA 3IJUA 1LOZA 1C7PA 5ILFA 1JKBA 1QTKA 3AZ6A 4NSJA 5J7CA 3A92A 1LSBA 3TXDA 4PJ2C 2BQKA 2LYOA 1GFUA 3CT1A 3A95A 1HELA 1LJNA 1LJ4A 3EMSA 1IP2A 4I0CA 4II8A 1INUA 4NGKA 4CFOA 1AZFA 1GE1A 3A3QA 2ZWBA 1IWYA 1YKXX 1IP4A 1CJ9A 3D9AC 5M1YA 154LA 2HTXA 3W3EA 2GV0A 5FEKA 132LA 1A4VA 3LYOA 4MSTA 4W94A 3CSZA 1LSZA 1OUAA 3TMWA 4O34A 5LVKA 4NGZA 1GF6A 5C6JA 3AW7A 1QSAA 5LA5A 2W1LA 1G7IC 1BGIA 1GBSA 1VDQA 1B5XA 1GBOA 4WM5A 2C8OA 1LZ9A 2ZYCA 4L41A 1ZV5L 4RDSA 1IP7A 3EO5A 4XJFA 4OWAA 1LMOA 1IWXA 3B72A 5KKJA 2XJWA 4LT3A 1Z55A 5F9XA 5KXYA 1ZVYB 3N9EA 1OUFA 2CGIA 4NGJA 3RU5A 1HENA 1UIHA 1JHLA 1LZGA 1WTMA 2EQLA 4NGLA 4MCKA 1PS5A 5K7OA 4WL7A 3TXJA 1DI4A 4DD2A 3D3DA 1UA6Y 3OK0A 1KIQC 4XJBA 5C6IA 4Z3MA 4W96A 1GFHA 1LZSA 1UACY 3IWRA 4NFVA 2D91A 1D0KA 4NIJA 2DQJY 4B0DA 2FBBA 2LYZA 1AKIA 3A94A 1B5YA 5FDJA 4ETEA 4NHQA 1I56A 4D9ZA 1FLUA 1CKGA 3CT5A 2DQFC 2I26L 1YQVY 1CKCA 4G49A 4WLXA 1KIRC 4DT3A 3LYTA 1LSGA 5I53A 1LSFA 2G4PA 4H9AA 3VWOA 1RCMA 1J1XY 1HMKA 4QDNA 4GN3A 4WM6A 4TSBA 1AM7A 3FI7A 4H9BA 4KXIA 3EBAB 4NWHA 1BHZA 1FKQA 2HU1A 4TUNA 3CSQA 4H1PA 3TXIA 1IWWA 4PGJB 1A2YC 4IATA 5FSTA 5FELA 4ETDA 4G4CA 1UIBA 4QY9A 2BQBA 1JWRA 1LYOA 1FN5A 1OUGA 3F6ZA 1B7SA 193LA 1IWUA 1UBZA 4WG7A 3SP3A 1REXA 1HHLA 1IP6A 1IOTA 3A93A 3WMKA 1WQQA 1IWVA 4LYCA 1LKRA 4XJGA 4RLMA 1YKZX 2BQCA 5LA8A 1V7SA 1B5UA 2FYDA 5KXTA 3M3UA 2N5ZA 4H94A 5HLLA 1RFPA 1BQLY 1QUTA 1JTTL 4AXTA 1JJ0A 1KXXA 4UWNA 2Q0MX 1TEWA 1HC0A 2MEAA 4LT1A 1B5VA 1OUJA 1UIFA 4ETCA 5KXMA 1YAQA 2C8PA 2MEFA 1LZ1A 1B7PA 2W1MA 1LAAA 5KXPA 1J1OY 4HTKA 3T36A 1GB6A 1GBWA 1JTPL 1CJ7A 2ZNXY 4HTQA 1TAYA 1OUBA 4HV1A 1BWHA 4I8SA 6LYZA 4GCCA 1KXWA 5I5QA 1JUGA 4NHIA 5L9JA 3CSRA 4TSCA 1UIDA 1IOCA 4G9SA 2MEBA 2LZ2A 1WQPA 5KXOA 1QSWA 4DC4A 1C46A 2YBLA 3ZEKA 4H91A 5F16A 1CNSA 4OW1A 5LXWA 1GF4A 1XGTC 2DQIY 4XN6A 207LA 4H90A 1WQRA 2H9KA 4NGIA 4B4JA 2HEBA 2LYMA 3W6CA 1JKDA 1GE3A 3K3TA 5IHGA 3M18B 2XBSA 4WM4A 1GBXA 1LZTA 2BQOA 194LA 1G7JC 5F81A 2WARA 1LSCA 4WG1A 1LZRA 3P65A 4NGVA 5KXRA 2YBHA 4NGOA 1LJGA 1G7MC 1D6QA 4NHTA 1BB4A 1LJHA 4PRUA 1IR7A 4IASA 1LHLA 1BB5A 4HPEA 4ML7A 1GAZA 1LHIA 1FDLY 1GB5A 6LYTA 1BB7A 1H6MA 3OJPA 5LYTA 1JISA 2Z2FA 3AJNA 4RLNA 1OUCA 1DZBX 1GDXA 2Z19A 4P2EA 4NWEA 3ZVQA 4M4OA 4ET9A 1D6PA 1B5WA 4YM8A 5A3EA 2D6BA 4N0JA 2HEAA 1B5ZA 1WQMA 3WUMA 4ANRA 1OQMA 4NY5A 3LYZA 3A67Y 2I25L 3T6UA 4DWXA 1JSFA 1NBYC 2YBNA 2Z18A 3WXTA 1SQ2L 3QY4A 5APCA 2BQDA 4WO9A 4Z46A 2X0AA 1D0MA 2BQAA 1JJ1A 1LMCA 1LMQA 4OWCA 1LKSA 1IVMA 1DI5A 2CJLA 5B1GA 2BQEA 3WVXA 1IEEA 3QE8A 5E4PA 1G7LC 2W1YA 4PRQA 4DD7A 1REYA 1LSEA 1MLCE 1CKHA 1LHJA 4ETAA 1B7LA 1ZMYL 2XTHA 4OWBA 4YF2A 1RE2A 1EL1A 1LZAA 1LZ6A 1NMMA 3LYMA 5A3ZA 1XEJA 4KT3A 1DPWA 3AYQA 5APFA 4YEMA 1J1PY 3A96A 1GFGA 4DD3A 4DD9A 4CGEA 1UCOA 4KPMA 1YIKA 5T3FA 1F0WA 4TX7A 3LZTA 5DLAA 1XEIA 2MEIA 1LSAA 1T3PA 4NHPA 1NKHA 4OOTA 5F9UA 2HEFA 1JKAA 5KXWA 4IJ4A 1H87A 3J6KA 3TXGA 4OWHA 1LZ8A 4XENA 2DBTA 5I4YA 1LZ4A 1CKFA 4XADA 1XGRC 2ZILA 5KXXA 1NHEA 4DDAA 4ETBA 4J1BA 153LA 3P66A 1JPOA 3A6BY 4H8ZA 1LTMA 2BQMA 1NQIA 1BB6A 1GE2A 1LZYA 3AZ4A 3LHMA 5KXZA 4C3WA 4X3BA 1VDPA 4H8YA 5KJ9A 4LYMA 1LJEA 2BAAA 134LA 3B6LA 1IC7Y 3HBEX 5DM9A 1YILA 1NDMC 4DDBA 5I54A 1FLQA 2BQJA 4U3XB 1F6SA 1TBYA 2XBRA 3AGGG 3RW8A 4J7VA 3W6EA 3WH1A 3TXKA 4PPOA 1LZ5A 1VDTA 4WMGA 1DI3A 1FLWA 2I6ZA 4LGKA 1VAUA 2BPUA 4HPIA 5DN5A 3WPJA 1B2KA 3WULA 4LYBA 1UIAA 4NSHA 135LA 4DYGA 1NBZC 3WL2A 4ZEEA 4HJVA 4LT2A 1HNLA 3TXHA 1GF9A 5APDA 2Z38A 2DQAA 1UIEA 4DD0A 2BQLA 4WO6A 5D5CA 1DQJC 1GF3A 1OP9B 1WVVA 1MELL 2ZYPA 3N9AA 2DKVA 5DN4A 3N9CA 1RJCB 3WPLA 4Z41A 1EQEA 4UWVA 4B1AA 4WM3A 4Z98A 1OUHA 1YL0X 1IP3A 3CT0A 1HEWA 4GCDA 1BWIA 1JSEA 1LMAA 4RW2A 5LVGA 1WQNA 2CWIA 1B7OA 3J4GA 5LAGA 4AGAA 1IP5A 1B7NA 3ATNA 1GB7A 3GXKA 2EPEA 4NGYA 1GFKA 4YOPA 2DQHY 1UIGA 4KL7A 4TTDA 1QDTA 3EXDA 3W6BA 1HF4A 1DXJA 1LSNA 3ZVQB 1GXV2 1EQ5A 4NEBA 4CJ2A 1B7MA 4GCBA 3ULRA 1D0LA 1OUDA 1IR9A 1C45A 2D4JA 1LPIA 1G7HC 3QNGA 1YROA 3AZ7A 1LJ3A 9LYZA 1XEKA 1ZVHL 3B0OA 1HMLA 5EBHA 1XGUC 4PHIA 5C6LA 5HMVA 1GB0A 1GB3A 1JITA 1GFAA 133LA 1LZEA 3P64A 1IOSA 5LAFA 3WUAA 1HFZA 3WU9A 4RW1A 1LJFA 4BAFA 1F6RA 1HEPA 4H9CA 5B05A 1UICA 2G4NA 1B7QA 3IJVA 4ZFPA 1NDGC 1FKVA 1XGQC 2Y8PA 4EMNA 1YL1X 4UWUA 1QQYA 1GPQC 1IC5Y 1YAOA 1LYSA 2HEDA 3A91A 4G4HA 5DL9A 5LYZA 4HTNA 4LT0A 1T6VL 4NG1A 1LJKA 5LVJA 4HJYA 5APEA 1O23A 3HFMY 2BQIA 208LA 1LJJA 1YANA 4N9RA 4LYZA 3MGWA 3AZ5A 5KXLA 5HMJA 1N4FA 1LSMA 3TMVA 1OUIA 1B7RA 5LVIA 1XSFA 2D4IA 3G3BB 5LIOA 4B4EA 1GF8A 3TXBA 1UUZC 2G4QA 3WW5A 2F30A 4H9FA 1VATA 2ZQ4A 4WLDA 1LSYA 2A7DA 4ET8A 1TDYA 2HECA 2BLYA 1LHMA 4FJRA 3W6AA 2F4AA 1HERA 7LYZA 1VDSA 4QGZA 1LSDA 1C10A 4GLAA 2YDGA 1DPXA 3WUNA 1LMPA 4C5FA 1JEFA 2BQHA 1LZDA 5B59A 3WPKA 1IP1A 3KAMA 3A90A 2BLXA 3B0IA 2PC2A 2Z37A 4GLVA 1IR8A 1EQ4A 1GDWA 4H8XA 4XJHA 4XJDA 1D9UA 3AB6A 5B06A 5L3HA 1QUSA 1LZCA 1HFXA 5I4WA 1BVXA 1IY4A 1GFEA 2DQCY 1JTOL 3WYHA 4GN5C 4J1AA 4N1CC 1IY3A 3A3RX 3TXEA 4NHSA 2MEHA 4N8ZA 3P4ZA 4YEOA 4GCEA 4GN4A 5HNCA 1ALCA 1GAYA 1GF7A 1RI8B 1AT6A 1AT5A 1GEVA 1VEDA 1BB3A 3A6CY 1JIYA 2HU3A 1HEMA 4R6CA 5KXNA 4R0FA 3LN2A 4BAPA 1NF5A 4WL6A 4XJIA 2D4KA 5KXKA 1IIZA 1SLYA 1B9OA 1I20A 3TXFA 1LYZA 4ZIXA 1DKJA 1V7TA 2BQGA 1P2CC 2CDSA 2Z39A 4GCFA 2VB1A 4WM2A 5B07A 4WLTA 2YBMA 4H92A 1VFBC 4NSIA 2MEEA 3TMUA 1LCNA 5IELA 5ILCA 3ATOA 1GEZA 1DKKA 1LZBA 5I4XA 4H9HA 2ZIJA 3WU7A 1CJ6A 4LYTA 3GXRA 4LFXA 4XYYA 2YBIA 3E3DA 1GFJA 1REZA 4H9EA 3WVYA 3P68A 2BQNA 3FE0A 1HFYA 2HEEA 1QTEA 3BKHA 1WTNA 2BQFA 2DQDY 2IFFY 3TMXA 4MR1A 1BWJA 2HUBA 4H9IA 1JKCA 1GE4A 2H9JA 3BKVA 4WM1A 1IORA 4NSGA 1LMTA 5E9RA 8LYZA 5II3A 1LZNA 1OUEA 1TCYA 2Z2EA 5AMYA 1F10A 4QEQA 1B0DA 3W6FA 1GFVA 2ZIKA 1PZYA 2YSSC 4N1EI 3AW6A 1GB9A 1IWZA 1WQOA 3A34A 1LHKA 1C43A 2FYCA 1GHLA 1REMA 1LYYA 1LJIA 4BS7A 3CB7A 4J0LA 4HV2A 5KKIA 2A7FA 4H93A 1IO5A 2F4GA 5JENB 1FBIX 2DQGY 1XFPL 4EOFA 2LHMA 1GF0A 5KY1A 2IHLA 2H5ZA 5HNLA 3B0KA 1GE0A 5FCPA 1GFTA 3W6DA 1W6ZA 2RSCA 4DD1A 1I1ZA 1GD6A 2EIZC 4HSFA 1GB8A 1LMNA 2AUBA 5IDDA 1GB2A 1LHHA 4BADA 1GBYA 5LYMA 1YAPA 5KXSA 3RT5X 4A7DA 4NG8A 2B5ZA 3RNXA 2YBJA 4B4IA 1GFRA 1NWGA 4TWSA 1IWTA 1CKDA 1FLYA 4OWEA 1HSWA 2DQEY 4CFPA 2YVBA 2ZQ3A 1LSPA 1YAMA 2W1XA 1QIOA 4DDCA 5D5FA 4FDYA 4LYOA 1HEOA 2F2NA 2NWDX 1W08A 4LFPA 4YENA 1QDRA 2LZTA 4N5RA 3WU8A 2EKSC 2MECA 5LINA 1GBZA 2FBDA 1YKYX 3G3AB 3AGIA 4CHXA 1JJ3A 1GF5A 5B1FA 1E8LA 1BVKC 1IX0A 4WOAA 1IC4Y 3WW6A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4NGWA 4E97A 3C7ZA 4LF4M 1C08C 3W0LB 1C6HA 142LA 4ARLA 3RZ4A 4E3UA 4WLYA 4G4BA 1ZAEA 1KXYA 3HBHA 3AOEC 4CISA 1UC0A 1TR8A 2Q2EB 3LZ2A 4M6DA 1GWDA 1DYCA 4MH0E 1L88A 5L3IA 3IJUA 5KPTA 1JKBA 3GPYA 4I7LA 3AZ6A 2RKOA 1T8AA 1IY0A 229LA 2YNMD 4PJ2C 2LYOA 1L73A 4XBOA 1IP2A 2JY6B 1GVNA 5DNYA 1GE1A 1YKXX 3K92A 1D3JA 1A4VA 218LA 3GPUA 3LYOA 1UM8A 3VDPA 4W94A 3SBAA 150LA 3DNAA 3TMWA 4RF1A 3OE8A 4O34A 172LA 5C6JA 1QSAA 5LA5A 1G7IC 1BGIA 225LA 185LA 1R2YA 2ZYCA 1ZV5L 1IP7A 3EO5A 1L33A 1NHWC 1L13A 1LMOA 1DYDA 2CP8A 5KKJA 3LVVA 170LA 2YFQA 2CGIA 107LA 4G4OA 1UIHA 1PQJA 2HKJA 3J7AS 1QUDA 2B70A 1L2CA 1DGGA 4IJEA 2FS1A 2Y20A 199LA 4MGIE 4A3VB 1DI4A 1L56A 3OK0A 5C6IA 1LZSA 4NFVA 3UONA 4L78A 2I7NA 2F5NA 4B0DA 1AKIA 4LDLA 4NHQA 1FLUA 4LZZA 4WLXA 2I26L 1CKCA 3B9PA 1KIRC 4AKGA 3ZH9B 1LSGA 3KW6A 3AOGA 1RCMA 4QDNA 4WM6A 4OVZB 4H9BA 4KXIA 3G3VA 1FNNA 1BHZA 2F5OA 1PQOA 4GHLA 1A2YC 4IATA 5H37D 4G4CA 1I6SA 1OUGA 3HY5A 1B7SA 1IWUA 1LYJA 1L23A 1ZYTA 3WMKA 4XK8F 1LKRA 3KDSE 4RLMA 1TDHA 5KXTA 4GITA 1RFPA 2M60A 1CX6A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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