1QW0A

Crystal structure of haemophilus influenzae n175l mutant holo ferric ion-binding protein a
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
308
structure length
308
Chain Sequence
DITVYNGQHKEAATAVAKAFEQETGIKVTLNSGKSEQLAGQLKEEGDKTPADVFYTEQTATFADLSEAGLLAPISEQTIQQTAQKGVPLAPKKDWIALSGRSRVVVYDHTKLSEKDMEKSVLDYATPKWKGKIGYVSTSGAFLEQVVALSKMKGDKVALNWLKGLKENGKLYAKLSVALQAVENGEVPAALINNYYWYNLAKEKGVENLKSRLYFVRHQDPGALVSYSGAAVLKASKNQAEAQKFVDFLASKKGQEALVAARAEYPLRADVVSPFNLEPYEKLEAPVVSATTAQDKEHAIKLIEEAGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Presence of ferric hydroxide clusters in mutants of Haemophilus influenzae ferric ion-binding protein A
pubmed doi rcsb
molecule tags Metal binding protein
source organism Haemophilus influenzae
molecule keywords Iron-utilization periplasmic protein
total genus 109
structure length 308
sequence length 308
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-08-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1qw0A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1qw0A01
4NEDA 2DWIA 4NF6B 5IKBA 4ISUA 1MS7A 3S9EA 5K2XA 2A5TB 1OMPA 3O29A 3RTWB 4DZ1A 1N7WA 2OCUA 1ZKBA 3L6GA 4QSDA 4G8MA 4YKPA 3HHFA 4ND9A 3T96B 4ZEKA 3V8XB 4U2RA 3GXAA 5JK4A 2XX8A 1MXVA 1NH8A 5H8FB 1IXIA 3TUSA 4F22A 1I69A 3K01A 3IB1A 3IO4A 3SEWA 3FJMA 4FORA 1ANFA 2RINA 1A8FA 4R73A 4K3FA 5ITOA 4HW8A 1MM7A 1MPDA 4FATA 2Y84A 3VXBA 1NL5A 2F6GA 4MLVA 3FVKA 3T66A 4JWYA 1PDAA 3FUZA 1PBPA 3FXQA 2I6EA 4DCXA 2Q9TA 1XOCA 1P1UA 1B51A 2DE3A 3KSXA 4YU0A 4BDQA 2GHBA 4H5FA 4O3BA 3TTLA 4KYSA 4LVQA 1J1NA 3T9HB 2DSFA 2FYIA 2CMOA 1US4A 3LR1A 4KCCA 4YB7A 5ISUA 4EQBA 4X1DA 1QKAA 4E0WA 1ZJLA 4QFNA 1H45A 3A3UA 2V25A 1XT8A 3IB2A 1MY1A 5KDTA 3TQWA 4EXKA 3ZSFA 3E3KA 3G3GA 3FJ7A 1FQAA 4P0GA 2YLNA 4N07A 2Z8FA 3QIMA 3FXUA 1NMUA 4QHQA 4Q5TA 2G29A 3SEXA 4QSEA 2V84A 2HFBA 2DXYA 3TCHA 1B52A 4N13A 3T9VA 3C4MA 4OERA 1AH5A 4U4XA 1T0KA 4OEUA 4I8CA 3IOVA 2GHAA 3PD9A 4IY5A 1NNKA 2XXUA 2HEUA 5I2NB 1MQIA 2O69A 5AA1A 3F11A 2BJJX 1N04A 5FTIA 4IO6A 2VD2A 3G3JA 4QRZA 2H98A 3UORA 2R71A 4OEVA 4F31B 3MP6A 2I3WA 1AIVA 4KQPA 2CZLA 3KN7A 2OWSA 1LAGE 3QAXA 3OSRA 5CI5A 3U92A 2RC7A 4P0IA 1EZOA 4YKJA 2ZYKA 1MXZA 3HO7A 4DIGA 3O66A 1UTHA 4H0WA 1LBCA 3TCFA 4RPOA 2DWJA 4ONYA 4Z7EA 2OJTA 3PV0E 3Q26A 4PETA 2NVUB 1LFIA 4G68B 3V89B 1SD3A 4H8JA 5I59A 1FQEA 3UGWA 5H8SA 5HM4B 3OEMA 5DVIA 1P1NA 4DXCA 4DLDA 2GH9A 3MP1A 5DT6A 4WEDA 1TXFA 5I58A 1MXXA 1IQ7A 1GR2A 2ALUA 2RCBA 1Y3NA 3MZ1A 3CI8A 2UXAA 4OXVA 2QRYA 4FJPA 2NWJA 3IX1A 3OENA 4NF5B 4OQOA 3MZBA 4YMAA 1VR5A 3TZAA 3MUQA 1P1OA 2AIXA 3E13X 3RPWA 3RTFB 5I2KA 5HBCA 2I4BA 4F3GA 4O3CA 1MPCA 4Q0CA 4F19A 4AB5A 3R26A 1I6BA 4GL0A 1D4NA 3M3FA 3PMXA 2WKYA 1FTOA 1MDP1 2X7PA 4G8HA 4Q8RA 1QUIA 2RF1A 1VSOA 1HSEA 1JVYA 1MQHA 5CM6A 3PUWE 2DP8A 3HCQA 4NMYA 4UACA 2B3FA 3IB0A 4FECA 1JEVA 5I56A 4GOTA 4WXJA 3G3IA 1JNFA 3U94A 4R6KA 3KOSA 5CMKA 2Z8EA 5DVFA 1ZTYA 4ZEIA 5ICTA 2FA7A 4R72A 3C9HA 2FNCA 3PPOA 4O3AA 3KN8A 1MH4A 1BP5A 1F9BA 1LB8A 5F7VA 2ZNTA 4KHZE 4M4GA 3USDA 3VLWA 3EF7A 4M1VA 1JQFA 3RLFE 3RN8A 3O6GA 4PE5B 3TTNA 3PD8A 5KZTA 1ZLQA 1B7UA 1NFTA 4KFQA 4RXLA 1B3FA 3QXMA 3K2DA 3ODBA 1DPEA 3DP8A 1LLSA 4YMBA 1Z7ME 3N94A 4X48A 1JW1A 4FAJA 1MXYA 5B7DA 4XTCQ 4F39A 1MY3A 3O2AA 3U72A 5AA3A 4H5GA 3ZKKA 5I57A 5B70A 4RYAA 4R2BA 5DVJA 1DMBA 1IXHA 2QMXA 4U1OA 1B9JA 1H76A 1A55A 3ONMA 2PT2A 5KDTB 2Z8DA 3UP9A 4TOZA 3VXCA 4NF8A 3H7MA 1B7ZA 1R1NA 2DOJA 3RQTA 3U8QA 3K1NA 4YB6A 2QS1A 3JV9A 4ELRA 5EHSA 2R9JA 3C34A 2M8CA 2NUVA 5LOMA 3FGSA 2VOZA 4H6DA 1Z7NE 1DTGA 2Y7RA 3Q25A 3PUZE 1Y20A 2F35A 4YKKA 4G2ZA 4F3SA 4GL8A 1XVYA 3H6WA 1N84A 2OBGA 2XXYA 1N3XA 5TPAA 1S50A 3IL1B 5DEXA 4EUOA 5FHNA 5H8HA 3MC2A 1SI0A 3PPQA 3PUVE 4RA1A 4ZZAA 4BDRA 4QF9A 3IJOB 3S9NC 4NE4A 2O1LA 3OEKA 1SDXA 1URSA 2XXXA 5A5XB 5TP9A 4OTEA 3MQ9A 1IEJA 4U22A 4GF8A 4WEPA 1Y3PA 3OELA 2G93A 3B6WA 1O63A 3MPKA 3TTRA 3LC8A 4L17A 4XKRA 4DE8A 3OO7A 3ZS6A 5JTYB 3S9MC 2H99A 3T9XB 3EHSA 3H3GA 1LB9A 1QUKA 4TQUQ 5DYHA 1QUJA 3RY3A 5AE4A 3SKPA 1HSLA 1A54A 3N5LA 5I59B 4H1XA 1B4ZA 4BDNA 2Q2AA 2UVHA 4OESA 1MY2A 3TDJA 1B46A 1A99A 2Z23A 4GQOA 2Y7PA 4EXLA 5L9SA 3IAZA 1OIBA 5L9OA 3VVEA 3CFZA 1EZPA 5FTHA 1BLFA 5I58B 2F34A 4IB2A 4ZE8A 1B5IA 2PVUA 1FTMA 3CG1A 3S4UA 4BLAA 3IOTA 5H8NA 3DP6A 2Q2CA 4OWDA 1TT1A 3O6IA 4RK9A 2ANJA 4IY6A 1PBQA 3VLUA 4DXBA 1AOVA 4GIZA 2HAUA 1M5CA 1SYIA 2PMSA 1NKXA 4R6YA 2O84X 1GGGA 1B3LA 4GRKA 1IZ1A 3I5OA 4OENA 4OETA 2OZZA 3CFLA 1D9VA 1MY4A 3LSLA 3TAJA 3H6UA 4Q30B 3FV1A 5AA2D 1YPNA 1EU8A 1P1QA 3CG3A 3QUFA 2XXRA 3TCGA 2XX7A 2I4CA 3HV1A 4MF3A 4RNSA 4XKQA 1TFAA 4E0XA 4OHNA 4PFYA 4KYDA 1AMFA 4OYVA 3MBPA 3MPLA 4I62A 2I0BA 1LAFE 3TTKA 4U21A 2XXWA 1FCKA 2B3BA 3V5AA 3O6HA 3SEVA 1I6AA 1H43A 3GZGA 3H6TA 4PQJA 3CIJA 1A7LA 1GTKA 1B1HA 3M8UA 4GFRA 4KCDA 4XXUA 1A8EA 1B5HA 3DM0A 3T93B 4FEDA 1CB6A 5K2YA 3RUMA 2O1MA 1EZ9A 3GBBA 3SESA 3N26A 2QMWA 4LQ5A 4NF6A 1CE2A 2A5TA 1TFDA 1JVXA 3OMBA 4ESXA 1VFEA 1MM6A 3HHGA 5CMMA 3K6VA 3KG2A 1IUDA 5I57B 4PFUA 1B3EA 1JW5A 5L9MA 2UYEA 3MVWA 3MW0A 5JEIA 3FXRA 4F29A 5ICQA 3P7IA 3PUXE 4OMBA 5H8FA 3KSJA 4KYEA 3CSBA 2X7QA 4GXSB 1ATGA 1RYOA 2THIA 5ELVA 3DP4A 1D3KA 3Q28A 4HCYA 2XXHA 1DPPA 1FQCA 4F3BA 3FVNA 3QSLA 1OLAA 4GD5A 1MPBA 3K0VA 1VFDA 4XIGQ 1B05A 2DQVA 1OVBA 2XD2A 1SBPA 3T22A 3TKDA 3MVYA 3H06B 3OOAA 3LBSA 3O97A 1B40A 1UQWA 1SVXB 1MY0A 2I3VA 2ONSA 4YZZA 4GLIA 1WVJA 3KBRA 3RT6B 2DXRA 3FVOA 4G68C 2XHDA 1B0HA 1H44A 2YJPA 3A3CA 1MQGA 4H8IA 2H5YA 5AA4B 1UIUA 1LAXA 4YKIA 4GVOA 1FW0A 5H8HB 3TEPA 3KGCA 1B3HA 1QKBA 2H25A 3L6HA 4EQ7A 1JETA 4IO2A 3W9WA 5FHMA 3WAFA 1A40A 5HPQA 2GRVA 5F1QA 4F1VA 2ZNSA 3SERA 3MWBA 3W9VA 1Y1MA 5CMCA 1JW4A 2QS4A 3IOUA 1II5A 4R9GA 3IO6A 2V3UA 5M2VA 3S2VA 1S7YA 3IK6B 4FEBA 3T9UA 5H8QA 1ELJA 1Y9UA 2D5WA 2XXTA 1YTVA 1OQGA 1PC3A 4LONB 1RYXA 5I84A 2A5SA 1LCTA 1POTA 3HN0A 3C35A 2QPQA 1JEUA 3ECRA 1SW4A 2IEEA 3SEUA 4G4PA 3RGYA 4QFPA 3EHTA 3M3KA 4R6HA 4ZS9A 1PB9A 2QS3A 3O9PA 1GV8A 3OO9A 4IO4A 4IO3A 1TWYA 2VHAA 3E9XA 5EYFA 3V83A 1QJMA 4U4SA 5H8NB 3IOWA 1GVCA 1LBBA 4OFLA 1DOTA 1H3DA 3EHUA 2DWAA 3Q27A 4MBPA 3VVFA 1OQHA 2I48A 1SW5A 3B6QA 2Y7WA 3DELB 3JZJA 2ONKE 4PFWA 2Q88A 5IAIA 4G68A 3K1PA 4R9FA 1Y4TA 1QULA 1ZMGA 4DXUA 5TU0A 2HXWA 3LSWA 5AA2A 4BDLA 4BDOA 2NOOA 3U93A 3OO8A 3IORA 1ZIUA 2E1SA 4F1YA 4WKMA 3BFTA 3KN3A 1Q1KA 2QSXA 2Z22A 5CC2A 1NNPA 1XVXA 2HZKA 4DDDA 4F1UA 2PX1A 3AXFA 1XS5A 4ZE9A 1B4HA 3W15C 2XXQA 4ZEBA 4X9TA 4RPNA 1NNTA 3VFJA 3VVDA 1SW1A 1B6HA 2AYSA 4NF5A 1R9QA 2V3QA 3C32A 3TYHA 1M5BA 2D3IA 3U1OA 1R6ZA 1B32A 4LA9A 1B2HA 2ONRA 1P99A 5L8DA 1UTHB 1SW2A 3FV2A 1AL3A 2Y7KA 4POXA 2O51A 3VDFA 2XXIA 3G3FA 1UTBA 3K4UA 4ZEFA 3EN3A 1N7XA 5KCJA 4H67A 2OLBA 3THIA 1L5TA 2P2AA 3VE1B 2B65A 4QFLA 3MVZA 2OK2A 1PB7A 2KLFA 4MH5A 3MVXA 1WODA 1USYH 4JWOA 1PEBA 4Z0IA 2ESNA 1XHYA 4R75A 4HS7A 1QW0A 2RC9A 2XXPA 3HPIA 4JSDA 2F78A 2F8DA 2IA4A 3OO6A 4PFTA 4R74A 3C31A 4PP0A 3BFUA 1XC1A 3CRBA 4XKNA 1IIWA 2HZLA 2E0SA 3UIFA 1VE4A 2V93A 4IO5A 3I6VA 4POWA 5BUUA 2Y7IA 3M3LA 1B1XA 4EF2A 4LUBA 3KZGA 4TLLB 4ZDMA 2O7IA 2XXVA 4AB6A 5I2KB 4LZ7A 1B5JA 3G3HA 3MZ9A 2R6GE 4QFOA 2DYXA 2O68A 4LQ2A 2D21A 1O64A 4YICA 3MJNA 4GXAA 3LSFB 4YAHX 3D4CA 4HCWA 4G8NA 4QFKA 2LAOA 3LSXA 3DLNA 4OFJA 3WAEA 1B3GA 3CFXA 5I56B 1Y1ZA 3ZKLA 1I6QA 5H8QB 4LZ5A 1M5EA 1SYHA 1Y3QA 4JB7A 4G77A 3JYRA 3K00A 1MRPA 4IGTA 3VLVA 1POY1 4MLQA 4N6PA 3BKIB 4NF4A 2Q8JA 1FTKA 2X26A 1O7TA 1ZU0A 3FZVA 3TTMA 1N76A 1WDNA 3KFMA 3OSQA 1YCJA 2ZNUA 3TPAA 2QJEA 3PMVA 1HSJA 4C1TA 2RC8A 4OZ9A 3TELA 4ESWA 3TMGA 2UYFA 5A5XA 2VP1A 3N6TA 3UN6A 1UIVA 1MH3A 4NWCA 2PT1A 3H6VA 1ZBMA 4YB5A 2DE4A 3C33A 2XD3A 2ZXTA 2PBWA 1NH7A 2YPNA 3D4GA 4TLMB 2I58A 2P0SA 5JTYA 3UA8A 4OVJA 3GBAA 4AQ4A 3O28A 3R6UA 1FQBA 3GLBA 2HQ0A 4F18A 3C36A 2DE2A 1Q35A 3SETA 2O7UA 4NF8B 4NTLA 3K6UA 1B58A 1BIYA 3PPPA 4EDPA 3K6WA 2AL5A 5AA2B 2H9BA 3PPNA 4RJZA 2PYYA 3Q29A 3TODA 2F5XA 4GWOA 3QUJA 4FIMA 4F2QA 4KD5A 3KEIA 1MDQA 3B6TA 4HTGA 4IGRA 2F7AA 2H4IA 1YAEA 2P1SA 2VD3A 3HSTA 5FHOA 2F7CA 3OXNA 1N0TA 3PMWA 3BBRA 1IITA 2DS9A 5ITPA 5TPAB 4UA8A 1URGA 5DEXB 3IR1A 1OVTA 1URDA 4LATA 4U23A 5EHMA 1MQJA 3PUYE 2HCAA 4U1ZA 1SQYA 1MXWA 4ECFA 4R2FA 4EQ9A 2QS2A 3E4RA 5TP9B 2ZYMA 1MXUA 1LFGA 4IO7A 3R7XA 3FD3A 3B7DA 4ELOA 5CRYA 2ZYOA 1NNFA 2RKMA 4C1UA 1FTLA 4OFOA 5DTBA 3MAMA 4JXIA 3LUYA 3SDFA 3TQLA 2ABHA 1UTBB 2DVCA 3OD7A 1B7HA 2UVGA 4P11A 4F2OA 5KCJB 4F3PA 3TFLA 4ZECA 1BTJA 2F97A 2F7BA 4QSCA 2REGA 3KJ7A 3KOTA 5I2NA 2GFEA 3FVGA 1MG1A 2UVJA 3QK6A 3N6UA 1LFHA 4I9DA 2REJA 2XX9A 3UK4A 4NWDA 2O6AA 3S9LC 2Q89A 4ELQA 3MP8A 1M5FA 3FJGA 1N3WA 3ILTB 2V3TA 1M5DA 1US5A 3G3KA 2HAVA 3K6XA 5J1DA 3CSGA 4JSOA 4MFIA 4DCYA 3EPEA 2F36A 4EF1A 4H65A 2DWHA 3PGFA 3VV5A 1SI1A 1LCFA 4KR5A 1IXGA 1KWHA 1B0LA 5CBSA 1LSTA 1QVSA 4RY1A 3FASA 1S9TA 2AL4A 3PPRA 4ZZEA 1D9YA 3A09A 4X1BA 3SEYA 3PU5A 1DSNA 4KI0E 1BKAA 1IXCA 3I3VA 3G7WA 5CMBA 4JWXA 2DVZA 4C0RA 2VGQA 1PB8A 2W7YA 3H03A 4BDMA 3K02A 3EQ1A 4ELPA 2QL3A 4THIA 1USYE 5CBRA 3CVGA 1DTZA 1FQDA 3CR9A 3FIRA 3RT8A 2UVIA 4KPTA 1LGBC 4FE8A 1OLCA 2I49A 1MQDA 3ILUB 1EH3A 2ZMBA 5BWJA 1R9LA 2F6PA 3RNNA 2OWTA 3H4ZA 2ZYNA 4I1DA 4JBZA 1RKMA 2I0CA 2RCAA 3KJTA 4ZEDA 4NF4B 5AA4A 1LAHE 1FTJA 4JDFA 3QYTA 1P1WA 2NXOA 1Y4CA 3K1MA 4LZ8A 4XKPA 4LP2B 1FQFA 4RK2A 3FATA 3IJXB
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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