1QW0A

Crystal structure of haemophilus influenzae n175l mutant holo ferric ion-binding protein a
Total Genus 109
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
109
sequence length
308
structure length
308
Chain Sequence
DITVYNGQHKEAATAVAKAFEQETGIKVTLNSGKSEQLAGQLKEEGDKTPADVFYTEQTATFADLSEAGLLAPISEQTIQQTAQKGVPLAPKKDWIALSGRSRVVVYDHTKLSEKDMEKSVLDYATPKWKGKIGYVSTSGAFLEQVVALSKMKGDKVALNWLKGLKENGKLYAKLSVALQAVENGEVPAALINNYYWYNLAKEKGVENLKSRLYFVRHQDPGALVSYSGAAVLKASKNQAEAQKFVDFLASKKGQEALVAARAEYPLRADVVSPFNLEPYEKLEAPVVSATTAQDKEHAIKLIEEAGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Presence of ferric hydroxide clusters in mutants of Haemophilus influenzae ferric ion-binding protein A
pubmed doi rcsb
molecule keywords Iron-utilization periplasmic protein
source organism Haemophilus influenzae
molecule tags Metal binding protein
total genus 109
structure length 308
sequence length 308
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-08-29

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1qw0A02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1qw0A01
1M5BA 2DYXA 4OFLA 4LVQA 1YPNA 4I8CA 4OTEA 3O29A 2Z8EA 2ZXTA 5I57A 1M5DA 1LB8A 5DEXB 2XD3A 1AL3A 4KYSA 2XD2A 1UTHA 5TP9A 4YMBA 1MXYA 4HS7A 4HTGA 4KCCA 4MBPA 4P11A 2VD3A 3C9HA 4GL0A 1QVSA 2H9BA 5CMKA 3W15C 3P7IA 4ELRA 1US4A 3PD8A 1SW2A 2RC7A 2QS3A 4LZ8A 1CE2A 4LQ5A 4IO2A 3OSQA 5CMCA 4MFIA 4ONYA 4GVOA 4KQPA 3R6UA 1A99A 1FTLA 1MDP1 4YKKA 3MJNA 3GLBA 3KZGA 5I59A 3OD7A 4IGTA 4ZEKA 5B70A 1TXFA 1ZJLA 4UA8A 4EF2A 4WXJA 4R72A 3TCGA 4QSCA 3MP1A 3TCHA 5H8QA 1OVTA 2G29A 1OMPA 5I59B 4F2QA 2W7YA 1H44A 3R7XA 3VXBA 1S9TA 4H8JA 5H8QB 3TUSA 4H67A 3CI8A 4OMBA 4DDDA 2H4IA 2XXPA 2OWTA 2RKMA 4N13A 4H6DA 3HHGA 1RKMA 2AL4A 2DS9A 2O7UA 3MPLA 2GH9A 1Y4TA 3B6TA 1PB8A 2XXRA 3QXMA 1ZLQA 1FCKA 4QF9A 4YB5A 2DP8A 3T9HB 2VGQA 4EXLA 1SI0A 4JWOA 4ELPA 2O7IA 1HSEA 3EHSA 4LUBA 1Y1MA 5ICQA 1NFTA 4X1DA 2D21A 3GZGA 3U92A 4FEBA 1M5EA 1IZ1A 3N94A 3T66A 3B6WA 1NKXA 5H8FA 3G3HA 4RPNA 4JBZA 1LAGE 3VFJA 3IORA 3H4ZA 4FJPA 5EHMA 4F3SA 3GBBA 3HSTA 4H5FA 1ELJA 4HCYA 4NF6A 1Z7NE 3K6XA 4XKPA 1LAFE 3MZBA 2E1SA 3U8QA 3O2AA 2Y7WA 1EU8A 2DE3A 1NMUA 3IB2A 2P1SA 1IIWA 1NNTA 2F7CA 2PT1A 3PPPA 2XXHA 3KN7A 3MZ1A 5L9OA 3VVDA 5CMMA 2X7PA 2RF1A 3RQTA 1BTJA 1EH3A 1QUJA 4ZS9A 4EQ9A 4G8HA 5ITPA 4FAJA 4G8NA 2ONRA 4RNSA 3OOAA 3PMXA 4OENA 1WDNA 3PMVA 4XKRA 3VDFA 2NUVA 3Q27A 3FIRA 2XX9A 1LCFA 2HXWA 4QRZA 3RUMA 1F9BA 2YJPA 1B0HA 1DPPA 4ZEIA 3G3FA 3E13X 3RT6B 3JYRA 3OO9A 3FJ7A 4R2FA 3IO4A 4GXSB 4P0GA 2F78A 1CB6A 4TLLB 4DIGA 1MQGA 5I2KB 5IKBA 3PGFA 1D4NA 1B4HA 5AA2D 3SEWA 3WAEA 4OZ9A 3DP6A 1VSOA 4OEUA 2Z8DA 4XKNA 2F7AA 1JW5A 3G7WA 4XKQA 3H6TA 1S7YA 4POXA 4KYDA 1YTVA 1B9JA 3SEVA 3FVKA 5H8NA 4ZDMA 1JVYA 1JQFA 2NOOA 1MXZA 1PEBA 2V25A 4RJZA 4JWXA 3IOTA 1PC3A 3IK6B 3ZS6A 4GQOA 3N6UA 1N3XA 3FVOA 2ZNUA 2H98A 4EDPA 3DP8A 4U22A 4F3PA 3MBPA 4THIA 2PYYA 1J1NA 2GHAA 3MZ9A 1QKBA 1ZTYA 3IR1A 3U1OA 5CRYA 4BDOA 2F7BA 2B65A 1ZIUA 3QUFA 1IQ7A 1SD3A 2XXWA 3PUVE 4OERA 4RXLA 4NF5A 5AE4A 1FQCA 1TFDA 4U23A 3QK6A 4PFWA 3CSBA 3Q25A 5F1QA 1T0KA 4NF8B 4DXUA 3C34A 1Q35A 2QSXA 2Y7PA 3O28A 1H76A 5AA2A 2H5YA 4M4GA 1PB7A 1DSNA 3A3CA 2XXUA 4F1YA 3QAXA 5FHMA 5K2XA 2F34A 1OLAA 3CFZA 3KEIA 5AA3A 3S9MC 4JSOA 2GHBA 4O3AA 1IEJA 2NVUB 1IXCA 4E0WA 2Y7KA 3B7DA 3IO6A 3LSFB 1PB9A 5JK4A 3TEPA 3C31A 1GR2A 2V84A 4YU0A 2FYIA 4MF3A 3E9XA 2RINA 1JEVA 4GWOA 1BLFA 2DE2A 3TCFA 2A5TB 1ZBMA 5KZTA 5I2NA 4G4PA 1MY1A 2R71A 3HHFA 1MDQA 4Q8RA 4QFKA 5B7DA 3K1PA 4PETA 1MQDA 4WEPA 1SVXB 2ZYKA 1B3EA 4GXAA 3OEKA 2I58A 2V3TA 4JWYA 3T9VA 3MC2A 3BBRA 2B3FA 2CZLA 3RT8A 3O6IA 1XC1A 2WKYA 1PDAA 5I56A 3VLWA 3CG3A 2IEEA 2O51A 2QMWA 1JETA 3QYTA 1JW4A 2REGA 4QFLA 3BKIB 2RCAA 3DM0A 4LONB 4U1ZA 1B52A 1LB9A 4BDNA 5HPQA 5I58A 3MUQA 3M3FA 3ZSFA 3AXFA 2O1LA 3I6VA 4NMYA 3DELB 3TTNA 2X26A 3K2DA 3IOUA 2Q89A 3FGSA 3K00A 3MVYA 2QL3A 1URSA 5I57B 2Q88A 3H6WA 1MXVA 4O3BA 5J1DA 1UTHB 5TP9B 3TPAA 3OO7A 4MLQA 4YKPA 4GF8A 2B3BA 4YKJA 4KR5A 4ZZAA 1BIYA 1Y1ZA 1AMFA 1QW0A 1SYIA 3EF7A 2DWIA 2UXAA 1DPEA 4IY5A 1JNFA 2QS4A 3W9WA 1LFGA 3H06B 1IXGA 4R73A 4H1XA 3ZKLA 3KGCA 4GL8A 1SW4A 3O6GA 2XXQA 1B58A 3VLVA 4O3CA 5TU0A 1MY3A 1A55A 1XHYA 1MM6A 1POTA 3PUWE 4ZE9A 2DSFA 1B32A 2AL5A 5L9SA 1URDA 2I0BA 4LA9A 2DVZA 3K6UA 3H7MA 2I48A 4YB7A 1ZU0A 3KSXA 3DP4A 1ANFA 5KDTA 1R1NA 2DVCA 4G77A 5FHOA 4ZEFA 2V93A 3QSLA 1LAXA 4JB7A 4LATA 4E0XA 3N26A 1R9LA 2DXRA 3H6VA 1P1OA 3VXCA 3QIMA 2F8DA 5CBRA 1GVCA 1N7WA 2Q2CA 3CVGA 1B3GA 3TTRA 2NWJA 1M5CA 2Q9TA 1B7HA 1NH7A 2Z23A 1SI1A 4DZ1A 5ISUA 4PP0A 1TWYA 2ZYMA 1MH3A 3M3LA 3U94A 4F3BA 4H8IA 4F39A 3MPKA 1IXHA 4KCDA 4WEDA 1P99A 3IJXB 4QHQA 4YMAA 1XOCA 1B6HA 2P0SA 3ILTB 4GLIA 4FE8A 5H8FB 1FTMA 4OHNA 1AOVA 1TT1A 3I3VA 4KYEA 1LFIA 1POY1 4IGRA 3FJMA 4Z0IA 4DE8A 2I49A 1QULA 4F18A 2ABHA 2V3UA 3L6GA 3PPNA 3IAZA 4NF6B 4G68C 1LSTA 2HFBA 4F29A 4NWDA 2VOZA 3C32A 3G3IA 3TTMA 3MP8A 5KCJA 3CR9A 4ELQA 1N04A 3CRBA 4NE4A 4R9FA 1RYOA 3K1MA 3IX1A 4OYVA 4LP2B 5KCJB 2PX1A 1O63A 1N76A 2OWSA 1H45A 3S9LC 2YPNA 4U2RA 2QS1A 3IJOB 1XT8A 1SBPA 5AA4A 2IA4A 4OXVA 3LSXA 4R6HA 3OEMA 3PUXE 1MH4A 1MRPA 1US5A 2D5WA 4TOZA 1P1QA 2RC9A 3TMGA 4LZ7A 2R6GE 4IB2A 4DCYA 5M2VA 2HZKA 3PU5A 3KN8A 3V89B 4ECFA 5A5XA 2DWJA 4JSDA 2F97A 4XIGQ 2A5SA 1MQJA 1SDXA 5F7VA 2F6GA 3FJGA 1GV8A 2P2AA 3H6UA 4NEDA 2FNCA 4X9TA 2F5XA 1A40A 1OQGA 4ZEBA 4ELOA 2ZYNA 4PE5B 5TPAA 3LUYA 3MP6A 3N5LA 3VV5A 2I3WA 3GXAA 5FHNA 1FTKA 4GRKA 5H8NB 1YCJA 1B3HA 3I5OA 4ZECA 3RLFE 4C1UA 3TAJA 5DVJA 5EYFA 1D9YA 2I0CA 2YLNA 3VE1B 3E4RA 3SKPA 1N3WA 2HEUA 1SW5A 3PUYE 3Q29A 4NF4A 3D4GA 2XXTA 3LC8A 3O6HA 2NXOA 4RK9A 3K01A 3EHUA 4IO5A 3PV0E 1O64A 4JDFA 4AB6A 1B40A 1FTOA 1B05A 2DXYA 1URGA 3VVEA 1OLCA 2E0SA 1LCTA 1ZMGA 3M3KA 4R74A 2OJTA 5DT6A 2UVHA 4U21A 2DOJA 3SDFA 1OIBA 4G68A 3MWBA 2HCAA 2DWAA 3O97A 1UIVA 2OLBA 5CI5A 1BP5A 3V83A 2ONSA 4NF5B 2GRVA 4QFOA 4ND9A 2F36A 3LR1A 4OETA 2ZNSA 1FW0A 1QKAA 1RYXA 4C1TA 3T22A 5AA2B 1I6QA 3JZJA 4OFJA 3TQLA 2PVUA 4FATA 3IB1A 2BJJX 5H8HA 3THIA 2XXIA 3CIJA 1DTGA 2R9JA 2I4BA 2KLFA 4NWCA 4ZEDA 3OENA 3OMBA 4OQOA 4K3FA 2OK2A 1H43A 1B1XA 1MQHA 3T9XB 4JXIA 3PPRA 3K6WA 5H8HB 4FORA 3S9EA 1O7TA 1EZPA 4H65A 1P1WA 1A8FA 2Y7RA 4Q30B 3K02A 1MXWA 4U4SA 5JTYA 2XXYA 3SESA 2RCBA 3FXUA 3EHTA 1DTZA 2I6EA 5I2NB 3G3GA 3M8UA 4TQUQ 2AYSA 3O66A 4EQBA 4RY1A 5FTHA 3O9PA 3FV2A 4IO4A 1R6ZA 4FIMA 2O69A 3GBAA 3HN0A 1MG1A 3KFMA 3LSWA 5JTYB 2X7QA 3CFLA 2F35A 4BDLA 4R2BA 2M8CA 5L8DA 5CMBA 3C35A 4N6PA 3UN6A 1II5A 3FVGA 4FECA 2XHDA 4X1BA 3TYHA 1A54A 3RPWA 1B3FA 1VE4A 1LFHA 1B4ZA 3KOSA 1Y3PA 3EPEA 2V3QA 4YAHX 1B1HA 5IAIA 5I56B 2DE4A 4KI0E 4POWA 3IOWA 2ZYOA 1MY0A 3F11A 5BUUA 5DEXA 1ZKBA 4MH5A 1I6BA 3Q26A 3ODBA 4R9GA 1P1NA 3VVFA 5LOMA 3OSRA 5CBSA 1WVJA 5I58B 3K4UA 4OWDA 3MVZA 4ISUA 1MPBA 4YB6A 4R6YA 1R9QA 3ZKKA 3UP9A 1Y3NA 4GIZA 5DVIA 1S50A 3FUZA 3BFTA 4L17A 3MAMA 4IY6A 2PBWA 2O1MA 1DMBA 4IO3A 4OESA 5ICTA 2QS2A 3UK4A 5CM6A 2DQVA 3KBRA 1USYH 1MXUA 4XTCQ 2QRYA 5CC2A 4YZZA 3C36A 4I9DA 3CSGA 5K2YA 4EUOA 3S4UA 5FTIA 2I3VA 2H99A 1Y9UA 4F2OA 1B46A 1UQWA 1SQYA 1MQIA 2HAUA 1VR5A 4HCWA 3C33A 4AB5A 2ALUA 4R75A 3KJ7A 2PMSA 4OEVA 3USDA 4XXUA 1JVXA 3PPOA 4HW8A 3RGYA 3SEUA 4PFTA 5ELVA 1USYE 4ZZEA 3OXNA 3CFXA 4FEDA 2UVIA 4LZ5A 3KJTA 2FA7A 3MVWA 1XVXA 5KDTB 2XX7A 2XX8A 1OQHA 1IXIA 1UIUA 4ESXA 1WODA 1XS5A 4TLMB 1MY4A 4UACA 1KWHA 4H0WA 1FQFA 3RTWB 1B51A 1Z7ME 3S9NC 2RC8A 4P0IA 3SEXA 2UVGA 2Z8FA 1XVYA 4ESWA 3S2VA 1D9VA 1JW1A 3FATA 3UIFA 1D3KA 3TQWA 4KHZE 2O6AA 5EHSA 3ILUB 4F22A 3SERA 3VLUA 1SW1A 1LAHE 3FASA 3T9UA 1VFDA 2REJA 3EN3A 3RTFB 5L9MA 1BKAA 1B5IA 1FTJA 3ONMA 1QUIA 3FD3A 4U4XA 1QUKA 3UA8A 3OELA 1IUDA 3MVXA 3UGWA 1M5FA 2AIXA 3TTKA 4H5GA 5HBCA 4Q5TA 1NNPA 4M1VA 3MQ9A 4GOTA 1IITA 1I6AA 4F31B 1HSJA 2DWHA 2D3IA 3HV1A 3C4MA 4IO7A 4AQ4A 3HO7A 4EXKA 4EQ7A 3KN3A 1MPCA 2H25A 3QUJA 2Y7IA 1NH8A 1P1UA 2VHAA 5I2KA 5AA4B 5ITOA 3PMWA 3D4CA 3TTLA 2HAVA 2UYFA 1FQAA 2VD2A 2G93A 1B5JA 3LBSA 3RN8A 3KOTA 2ZNTA 1N0TA 1GGGA 3FXRA 3TDJA 1LGBC 1LBCA 1B7ZA 4G8MA 4IO6A 4QFPA 3LSLA 3IL1B 5JEIA 1TFAA 1A7LA 3PD9A 2Y84A 5A5XB 1Y3QA 4BLAA 3L6HA 3G3JA 3KSJA 3Q28A 4KD5A 3RY3A 2I4CA 1H3DA 3CG1A 3FZVA 4GFRA 3WAFA 2XXVA 4PFUA 1HSLA 3N6TA 4YKIA 4YICA 2PT2A 1Q1KA 3KG2A 1B2HA 2CMOA 3FXQA 5TPAB 1B3LA 3K0VA 1B5HA 2VP1A 3BFUA 3JV9A 4BDRA 2O84X 3TFLA 1MPDA 1GTKA 1EZ9A 1PBPA 1ATGA 1JEUA 3FV1A 4F3GA 1Y20A 1VFEA 3OO8A 1MS7A 4BDMA 3TKDA 2UYEA 1OVBA 3T93B 1PBQA 2QPQA 3IOVA 2THIA 4NF4B 3FVNA 2UVJA 2O68A 3SEYA 3U93A 3OO6A 4DXBA 2QMXA 4ZE8A 4NF8A 2Z22A 1EZOA 5DYHA 3DLNA 2ANJA 1B7UA 2GFEA 5DVFA 1N7XA 5HM4B 1N84A 4QSDA 4G68B 3E3KA 3TELA 3EQ1A 3U72A 3T96B 4WKMA 4LQ2A 3A3UA 3RNNA 4RA1A 3ECRA 2ZMBA 1NNKA 4PFYA 1L5TA 4DXCA 1AIVA 2LAOA 4RYAA 3PPQA 1LLSA 3R26A 4Z7EA 3TODA 4KPTA 1QJMA 2ESNA 1FQBA 4GD5A 3H3GA 2OCUA 3MW0A 1LBBA 1UTBA 3A09A 4I62A 1AH5A 4MLVA 3TZAA 4DCXA 3H03A 2OBGA 4KFQA 2HZLA 4NTLA 4N07A 1I69A 4EF1A 3G3KA 3K6VA 2A5TA 4C0RA 4Q0CA 4DLDA 4U1OA 1DOTA 1UTBB 3HCQA 3IB0A 4PQJA 3B6QA 4OVJA 5H8SA 1MY2A 4G2ZA 1FQEA 3K1NA 3PUZE 2Q8JA 1MM7A 2Q2AA 5DTBA 4OFOA 4QSEA 4R6KA 2XXXA 2HQ0A 1A8EA 4I1DA 5I84A 3SETA 4QFNA 3UORA 1YAEA 3V8XB 1B0LA 2QJEA 1FQDA 1MXXA 1NNFA 4RK2A 4F1UA 1Y4CA 4X48A 2OZZA 3W9VA 4BDQA 3V5AA 3HPIA 4F1VA 2ONKE 1NL5A 1SYHA 5AA1A 4F19A 5BWJA 4RPOA 2F6PA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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