The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
8
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sequence length |
56
|
structure length |
56
|
Chain Sequence |
b'TFVALYDYESRTETDLSFKKGERLQIVNNTEGDWWLAHSLTTGQTGYIPSNYVAPS'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Specific interactions outside the proline-rich core of two classes of Src homology 3 ligands.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
TYROSINE-PROTEIN KINASE TRANSFORMING PROTEIN SRC
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| source organism |
Avian sarcoma virus
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| molecule tags |
Complex (signal transduction/peptide)
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| total genus |
8
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| structure length |
56
|
| sequence length |
56
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| ec nomenclature |
ec
2.7.10.2: Non-specific protein-tyrosine kinase. |
| pdb deposition date | 1995-11-09 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00018 | SH3_1 | SH3 domain |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Beta | Roll | SH3 type barrels. | SH3 Domains |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4J9C A; 2RF0 A; 2A08 A; 2KNB B; 1UTI A; 3EG2 A; 2BZX A; 3ZL7 C; 2VVK A; 1CKB A; 4IIO A; 1M3B A; 1K0X A; 1GCQ A; 2EYZ A; 2EPD A; 2EQI A; 2PTK A; 1RUW A; 2O2O A; 2JW4 A; 4JJD A; 1GFC A; 1WI7 A; 4DEY A; 2LJ0 A; 1AZG B; 3H0F A; 1VYV A; 1YWO A; 2B86 A; 5IHK A; 4GLM A; 1Y57 A; 2DIL A; 1NEB A; 1K1Z A; 1KJW A; 2RPN A; 2IIM A; 1WLP B; 1BB9 A; 4X1V A; 1H3H A; 1AOJ A; 2D8H A; 3VS0 A; 2KRM A; 4OML A; 2YDL A; 1H92 A; 3NMZ C; 1YCS B; 4HVV A; 2L3S A; 2MIO A; 2KE9 A; 2NWM A; 3M0S A; 1AZE A; 4Z89 A; 2DL3 A; 1JU5 C; 1X6G A; 4AFZ C; 4F16 A; 2W0Z A; 4JZ3 A; 2YUP A; 1ABO A; 2CSQ A; 1SHF A; 2EKH A; 3IQL A; 1ZSG A; 2A37 A; 2DA9 A; 5IH2 A; 5IHN A; 4RUG A; 4K11 A; 3UA7 A; 1M3A A; 4R0K A; 2RQV A; 1W1F A; 3TSW A; 4ZNX A; 3M0R A; 2KRN A; 1WXU A; 1WFW A; 2FPF A; 2K6D A; 2CSI A; 2KRS A; 3R6N A; 4D8K A; 2ABL A; 1QKW A; 1U3O A; 3REB B; 1AEY A; 1W6X A; 2YUO A; 2DRK A; 2HDA A; 3LH5 A; 1U06 A; 3H41 A; 3PE0 A; 3O5Z A; 2AKL A; 1HJD A; 1H8K A; 2DE0 X; 1XOV A; 1MV3 A; 1K9A A; 2CH4 W; 4LNP A; 2CT3 A; 1X2Q A; 2K2M A; 4Y92 A; 5IHI A; 1TG0 A; 2CUB A; 1B07 A; 2L3P A; 1K0S A; 2CRE A; 3A98 A; 1U5S A; 2CH4 A; 4Z88 A; 1GBR A; 2EYY A; 1VYT A; 2ECZ A; 4CC7 A; 2FG0 A; 2V1R A; 3NPF A; 1GCP A; 1K4U S; 5FWB A; 1PRL C; 4GBQ A; 2GNC A; 2MCN A; 3VS2 A; 1M8M A; 2JS2 A; 2RN8 A; 4RTW A; 1JXO A; 1V1C A; 1X43 A; 1UEC A; 2KEA A; 4AG1 C; 2DL8 A; 4AFS C; 1GBQ A; 1UDL A; 4KRT A; 2KGT A; 2FPE A; 2I0N A; 2J6K A; 3EG3 A; 1NG2 A; 4HCK A; 2OAW A; 4OMM A; 4OMN A; 4J9E A; 4JPB W; 1JEG A; 2DNU A; 4EIK A; 2BZY A; 2LMJ A; 4E6R A; 1NLO C; 4IIM A; 4WCI A; 4Z8A A; 2C0I A; 3U23 A; 4RTX A; 2EBP A; 2K9G A; 4RTU A; 2EVR A; 1AD5 A; 2J6O A; 2K3B A; 2O88 A; 5GJV B; 3H0I A; 1ZLM A; 4LUE A; 4HVU A; 1TUC A; 1WXB A; 2OJ2 A; 1NYF A; 1PRM C; 2SRC A; 4LUD A; 2KXD A; 2DJQ A; 2PZ1 A; 2GQI A; 3VRZ A; 1MV0 B; 1MUZ A; 3CQT A; 4JJB A; 1AVZ C; 5FWC A; 2P4R A; 2DYB A; 1JXM A; 3I9Q A; 2L0A A; 3EHR A; 2LCS A; 3EGU A; 4OMQ A; 1I07 A; 1ZUY A; 2AKK A; 2YT6 A; 4J9G A; 2OI3 A; 2O31 A; 2CUD A; 2O9S A; 1LCK A; 1I1J A; 3I35 A; 5ECA A; 1OV3 A; 2RNA A; 1KSW A; 1Y0M A; 2KXC A; 2DBK A; 2J6F A; 1ABQ A; 4J9D A; 1T3S A; 4ORZ A; 2RQW A; 5FW9 A; 2LNH B; 2J7I A; 2EGA A; 2M51 A; 2YSQ A; 4ESR A; 1SHG A; 1QCF A; 2DM1 A; 2KT8 A; 1NLP C; 2DL7 A; 2LZ6 B; 1ZUU A; 3VS7 A; 1GRI A; 2ENM A; 4AFQ C; 2JTE A; 2V1Q A; 2LJ1 A; 1ZX6 A; 1RI9 A; 1UE9 A; 1JO8 A; 1B3Q A; 1UGV A; 1AWJ A; 4D8D A; 1RLQ C; 4CC4 B; 3UAT A; 2A28 A; 2ED1 A; 4OMO A; 3C0C A; 1ZBJ A; 2ROL A; 1EFN A; 2FPD A; 2DRM A; 2VKN A; 2F2V A; 2HEQ A; 3H0H A; 5L23 A; 2JXB A; 4J9B A; 3VS1 A; 1PKT A; 2VWF A; 4AG2 C; 2EW3 A; 2AZS A; 1Z9Q A; 2E5K A; 1J3T A; 3PVQ A; 1JQQ A; 1UFF A; 3RNJ A; 1YWP A; 2DL4 A; 1UG1 A; 1Z9Z A; 1PWT A; 2BZ8 A; 1OOT A; 2F2W A; 2EGC A; 2FO0 A; 2O9V A; 1PNJ A; 2YUQ A; 2CT4 A; 2C0T A; 1YN8 A; 1UHF A; 1E6G A; 2X3X D; 4J9I A; 1KFZ A; 1PKS A; 1G83 A; 1YP5 A; 5IXB A; 1GFD A; 4F17 A; 1N5Z A; 1W70 A; 2D1X A; 1NYG A; 1VYU A; 1T3L A; 1OPK A; 2JMC A; 4CC3 A; 5GJW B; 3ULR B; 3VS5 A; 1E7O A; 2F2X A; 2RMO A; 2A36 A; 2PNI A; 5HCK A; 1X6B A; 3SHW A; 2FRW A; 4RTV A; 1AWO A; 5IXF A; 1UHC A; 4FSS A; 2EGE A; 3KFV A; 1KIK A; 3REA B; 1S1N A; 1BK2 A; 1E6H A; 3GBQ A; 2LX7 A; 1A0N B; 2JM9 A; 1WX6 A; 1WXT A; 1M27 C; 2DBM A; 2ESW A; 3THK A; 1CSK A; 2QDL A; 4DEX A; 2C0O A; 1QLY A; 1HSQ A; 4LE9 A; 2J05 A; 2NUZ A; 3QWY A; 4A63 B; 1AWW A; 1AWX A; 2DVJ A; 4RTZ A; 2BTT A; 2HCK A; 4F14 A; 1SRM A; 1M3C A; 3M0U A; 2JS0 A; 1SPK A; 1X27 A; 2MOX A; 1SSH A; 1PHT A; 2LP5 A; 1UJY A; 2FRY A; 1BBZ A; 1NM7 A; 5EC7 A; 3NGP A; 3UA6 A; 5I11 A; 4HVW A; 2KRO A; 3VS4 A; 2LQW A; 2ROT A; 2KYB A; 2EYX A; 2LJ3 A; 2K7A A; 1GCQ C; 3EHQ A; 4OMP A; 1X2K A; 2AZV A; 3M0T A; 1FMK A; 1QKX A; 3EG0 A; 2HBW A; 3M0Q A; 1WA7 A; 4LN2 A; 1YNZ A; 4AFU C; 2SEM A; 2L3Q A; 3TSZ A; 1VA7 A; 2D8J A; 1QWF A; 2DX1 A; 2DF6 A; 1UUE A; 3VS6 A; 2GBQ A; 4J9F A; 1M30 A; 3I5S A; 2KYM A; 2HSP A; 1WDX A; 1NEG A; 2K79 A; 4J9H A; 1SEM A; 2LQN A; 1TUD A; 2W10 A; 1SRL A; 1RLP C; 2D0N A; 1GL5 A; 3M0P A; 2M0Y A; 4QT7 A; 1CKA A; 1OPL A; 2KBT A; 1ARK A; 2KT1 A; 3UF4 A; 1OEB A; 2GTO A; 2JT4 A; 3NHN A; 2GGR A; 3I5R A; 2RQR A; 1K76 A; 1HD3 A; 1T0H A; 3RBB B; 4CC2 A; 2X3W D; 2L2P A; 4RTT A; 2YUN A; 2JMA A; 1BU1 A; 1ZUK A; 2DLP A; 1WIE A; 3JV3 A; 4RTY A; 1G2B A; 5I22 A; 3EG1 A; 2CDT A; 1I0C A; 2AK5 A; 2FEI A; 2GTJ A; 3TVT A; 2J06 A; 2DL5 A; 1WYX A; 3SEM A; 3FJ5 A; 3VS3 A; 2KR3 A; 3VRY A; 4JJC A; 2RQU A; 1QWE A; 1IO6 A; 4M4Z A; 1FYN A; 1UJ0 A; 2DMO A; 2EYW A; 3PVL A; 4HXJ A; 2RQT A; 2ED0 A; 2XMF A; 3QWX X; 1T0J A; 2G6F X; 2JM8 A; 1X69 A; 2H8H A; 4JZ4 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2LT4 A; 4C0G A; 4M78 E; 1VQ8 T; 4PFZ A; 4NL3 A; 2A08 A; 2X4X A; 1UTI A; 3EG2 A; 3CME Q; 3ZL7 C; 3A8G B; 2VVK A; 3G6E T; 1ACM B; 4C8Q G; 4HCB A; 1GCQ A; 1WPY A; 3C95 A; 1IHW A; 2ZAE A; 1RUW A; 3HL8 A; 2JW4 A; 2HD0 A; 4N0A C; 2MWO A; 2LJ0 A; 3BDL A; 1YWO A; 3RKW A; 3QHS A; 1V29 B; 1D1C A; 4C0F A; 1N9S A; 1NEB A; 3CBP A; 4AT1 B; 4JDS A; 4IUV A; 2RPN A; 1YHQ T; 2KRM A; 2VGN A; 3CCS A; 3OS1 A; 4KUD K; 1YCS B; 1I4K 1; 3L2U A; 2ATC B; 2R5M A; 2NWM A; 3M0S A; 2RHX A; 1X6G A; 3TCJ A; 4C8Q D; 1C6V X; 3V8K A; 5HKC A; 2QTX A; 3CPF A; 4O5V A; 3BDU A; 2EKH A; 3IQL A; 1NJI C; 2LDM A; 1VQO A; 4IUT A; 1VQ6 T; 5KYN A; 3UA7 A; 4M77 B; 5GAN 3; 4ZNX A; 3M0R A; 3RKY A; 1PCX A; 1S72 A; 2DXU A; 2L8D A; 2K6D A; 4PJO B; 3G6E Q; 2RI2 A; 1U3O A; 5CQY A; 3V7C A; 2FZK B; 2HQX A; 5LJ5 g; 3CMA T; 2YUO A; 2DJZ A; 2DRK A; 4KUL A; 1FMV A; 5LJ3 h; 3DB4 A; 5LJ5 j; 3MEV A; 5GMK j; 3RIR A; 1M5Q 1; 2AKL A; 2A0F B; 3VUZ A; 4FCY A; 2DE0 X; 2MYS A; 2LT1 A; 2ZPH B; 4LNP A; 2CT3 A; 1Q7Y U; 3KUF A; 3V7S A; 1QMC A; 4PJL A; 2CUB A; 2RK2 A; 1YIJ Q; 4M7A G; 2CRE A; 3A98 A; 3VKI A; 4EDU A; 2EYY A; 4C8Q A; 1N6A A; 2MWP A; 3CCV Q; 2PUO B; 2H3J A; 3NPF A; 2DD5 A; 4GBQ A; 3CCL A; 3VS2 A; 1BI3 A; 3GNF B; 1B34 A; 5IN1 A; 1X43 A; 1BYM A; 1VQL A; 1UEC A; 4PFO A; 4KRT A; 2K3X A; 2KGT A; 3L2Z A; 4ZTJ A; 2DIQ A; 4OMM A; 3OMG A; 4OMN A; 1JEG A; 5IT9 E; 4EIK A; 5CK9 A; 2PVD B; 2BZY A; 2E6N A; 2P84 A; 1NLO C; 3X20 B; 4E6R A; 5CKD A; 4IIM A; 2EQM A; 4WCI A; 4J6Y A; 1M1K C; 5FRM A; 1KG1 A; 4M7A D; 3VUB A; 3Q1J A; 2JUF A; 1VOM A; 1AD5 A; 4N4I A; 2K3B A; 1MMA A; 5DLQ E; 3CMA Q; 1VQ7 T; 1TUC A; 1WXB A; 2FB7 A; 3JCM J; 1PRM C; 8AT1 B; 2QEX T; 2D9T A; 1IZ6 A; 4QQG A; 4XU1 A; 2WSE E; 3EH2 A; 2KXD A; 1TXQ A; 2PZ1 A; 2GQI A; 1ZA2 B; 3AHU A; 1NJI U; 3GP8 A; 4BY6 B; 3SB2 A; 1XNI A; 5D6W A; 3OYN A; 2COW A; 2OTJ A; 2RHU A; 2COZ A; 1KQ1 A; 2OI3 A; 4GLK A; 2CUD A; 2O9S A; 3I35 A; 5ECA A; 1M90 C; 2I2L A; 1OV3 A; 2KMT A; 1ZSZ C; 2DTI A; 2VAS A; 1VQP A; 1WHH A; 4P5N A; 1Y0M A; 1Q81 R; 1ABQ A; 3M9Q A; 2RQW A; 4ORZ A; 5FW9 A; 3OYM A; 1O9S A; 3BW1 A; 2EGA A; 2M51 A; 3A5Z B; 3OS5 A; 3QSU A; 5GAN d; 4WTO B; 4RCC A; 1NLP C; 2RI3 A; 2KY9 A; 3I56 Q; 1I5L A; 5KYX A; 2OX7 A; 1UE9 A; 4EMK A; 1JO8 A; 1B3Q A; 5CKE A; 1UGV A; 4D8D A; 5GAN g; 2KDS A; 3VJP A; 3BE3 A; 2QK0 A; 3PIP A; 5GAN j; 2LRQ A; 4FYX B; 4FYY B; 1BIB A; 3RUX A; 2DD4 A; 1VQ5 T; 1D1A A; 3H0H A; 5L23 A; 2JXB A; 2QTV A; 3LW5 E; 2EW3 A; 1Z9Q A; 1KC8 U; 3JB9 H; 3X26 B; 4XTV A; 4MML A; 1YJ9 A; 2CP3 A; 1Z9Z A; 1PWT A; 3L1A A; 2O9V A; 4C8Q B; 2C0T A; 4FM4 B; 1E6G A; 3URG A; 4JRK A; 1KFZ A; 2R58 A; 4BI8 B; 2XG8 D; 1B34 B; 2EWN A; 1G83 A; 2EFI A; 1N5Z A; 5A0L A; 2X51 A; 4X9D A; 3A8H B; 1K9M R; 1OPK A; 2JMC A; 1E7O A; 3CPW A; 2F2X A; 3OSS C; 1R0B G; 2CKK A; 1JJ2 S; 1PG5 B; 3OB9 A; 4KBM B; 4N4G A; 1RAF B; 1Y7X A; 4HCC A; 1WQ7 A; 5C6S A; 3JCM P; 3KFV A; 3ZBD A; 1YIT T; 1BK2 A; 2X4Y A; 2QXF A; 3PIO A; 1M90 U; 2DBM A; 1EIF A; 1D3B A; 1CSK A; 3JSC A; 2QA4 T; 1YJW Q; 3QWY A; 4LDV A; 2KQW A; 2E5Q A; 5LJ5 f; 4A63 B; 4BDY A; 2L5Q A; 2AHJ B; 4IUQ A; 1SRM A; 2NUT A; 4OVA A; 2JS0 A; 3GPL A; 1X27 A; 1P92 A; 2VUB A; 2K3Y A; 1VQN A; 2F69 A; 1B7T A; 3EGX A; 5GMK i; 1BBZ A; 1NM7 A; 5EC7 A; 3OQ5 A; 1K8A R; 3MKD A; 3TU4 K; 1XQH A; 2ROT A; 3T9N A; 2F5K A; 2JNG A; 2HQH A; 5GAM g; 4M7A B; 4AMC A; 3CCM Q; 2DAQ A; 1X2K A; 4ZN3 A; 5GAM j; 3M0Q A; 4EPC A; 1TUG B; 3C94 A; 3CCJ T; 3HPW A; 3TSZ A; 1VA7 A; 2DX1 A; 2GQV A; 1TSF A; 3JCM d; 1N8R U; 1UUE A; 2GBQ A; 4EMK B; 1VQ4 T; 2KYM A; 3O8V A; 4XTU A; 3CCL Q; 2HSP A; 2DEQ A; 2C06 A; 1Q82 C; 4NL2 A; 1TH7 A; 2O4X A; 1SEM A; 2W10 A; 2V8J A; 3JCM g; 2LC4 A; 4J5Y A; 2QA4 Q; 1RLP C; 3M0P A; 3CBO A; 3OW2 S; 4M7D F; 1CKA A; 1BKB A; 2KBT A; 2RJC A; 1ARK A; 5HK0 A; 4E7L A; 2EJG A; 3NHN A; 3CXC P; 2RQR A; 1N9R A; 3OA6 A; 4QKU A; 2HQE A; 3I55 T; 1FX7 A; 4M77 F; 2VC8 A; 2YUN A; 3SWN B; 4M78 C; 1NZ9 A; 2DPP B; 2QAZ A; 2E70 A; 1W2B P; 4M7D C; 1WHM A; 3LX7 A; 1BU1 A; 1WIE A; 2Y4Y A; 4E7S A; 5FRN A; 3NTK A; 4PJO F; 2CDT A; 4DA4 A; 1VQ8 A; 2XD0 A; 3QII A; 3VS3 A; 1JBM A; 1IO6 A; 1RAH B; 3OYC A; 5GAN h; 1U1S A; 4YTL A; 4HXJ A; 1FWZ A; 2P0Q A; 2B8A A; 2JOY A; 3A8O B; 3QWX X; 1YJN A; 1T0J A; 2G6F X; 2X4J A; 2QGG A; 1X69 A; 4JZ4 A; 2RF0 A; 4DBR A; 2KNB B; 5GAN 7; 4XK8 E; 3UWN A; 1CKB A; 3X28 B; 4IIO A; 4ATO A; 3DB3 A; 1M3B A; 2QQS A; 4BI4 A; 1YHQ A; 3FLG A; 3JB9 F; 2K5F A; 2DXT A; 1VUB A; 1G3S A; 4Q5W A; 1VQP Q; 3EGD B; 4JJD A; 1GFC A; 3UT1 A; 1WI7 A; 4EMG A; 3V8J A; 5GAN f; 5LJ3 g; 5CO7 A; 1OUL A; 3R6O A; 1Y57 A; 5I2M A; 5LJ3 j; 2DIL A; 3CCR T; 1HYO A; 1XTD A; 2DVE A; 2L89 A; 4X1V A; 1VQ6 A; 2D8H A; 1LNX A; 2YDL A; 3DKM A; 2NUT B; 2XHC A; 1M1F A; 3OYB A; 4L6V 5; 2L3S A; 5AT1 B; 5GAO n; 3RMQ A; 1M9S A; 2DL3 A; 1EX4 A; 1PD0 A; 2W0Z A; 1LVK A; 4JZ3 A; 1ABO A; 4J83 A; 3H8Z A; 2RD1 A; 1RAE B; 4PJM A; 1KC8 R; 1ZSG A; 2DA9 A; 5IH2 A; 4M78 A; 5KYU A; 4HA8 A; 1M3A A; 4R0K A; 2YRD A; 4RMO A; 1OZ2 A; 4FYW B; 2GCX A; 1W1F A; 5FU7 B; 1Y96 A; 2KRN A; 3CME T; 3FIF A; 3RDV A; 4D8K A; 1IGU A; 4E7I A; 1QKW A; 1AEY A; 4BI3 A; 3HRU A; 4PL6 A; 3TRE A; 1QVG P; 5GMK l; 1K73 C; 4L59 A; 3OYF A; 1TOV A; 3UPU A; 4C92 C; 1LJO A; 3NTH A; 2JZ2 A; 6AT1 B; 1MV3 A; 1K9A A; 1KQS P; 2K2M A; 1X2Q A; 4Y92 A; 5IHI A; 1TG0 A; 2NUP A; 1K0S A; 4F7U G; 5A0D A; 2ECZ A; 3MJX A; 2FG0 A; 5CKB A; 4CC7 A; 1D0Y A; 2AIR B; 1GCP A; 1K4U S; 5FWB A; 1PRL C; 4X34 A; 1YBY A; 2GNC A; 3QUI A; 4RG2 A; 3EFO B; 2YHT A; 5J3B A; 3JCM c; 2KEA A; 4IUR A; 1ZQ1 A; 2DL8 A; 4AFS C; 1PSE A; 4RG8 A; 2QGF B; 2XKO C; 2I0N A; 1VQ9 A; 4LDX A; 4ZTF A; 4BB7 A; 1UGP B; 2QG9 B; 1K8A C; 2QEX A; 2LMJ A; 3EG9 A; 4M7D E; 3GNG A; 4OGE A; 3JCM h; 4Z8A A; 3LWH A; 5GAM f; 2EVR A; 4E7H A; 4C8Q F; 2RHY A; 1O75 A; 3H0I A; 3UDC A; 1BCO A; 1FMW A; 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