1QZ6A

Structure of rabbit actin in complex with jaspisamide a
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Trisoxazole macrolide toxins mimic the binding of actin-capping proteins to actin
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 123
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1qz6A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1qz6A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1qz6A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1qz6A04
1NGEA 3A5LC 5BR9A 4CZGA 3D2FB 4BRLA 4B1WB 3MN6A 3OHRA 2Q1NA 3DXKB 4YDUA 1JCGA 3SMSA 2AP1A 3VERA 1ATSA 3HBTA 3VEVA 4BRAA 3O8MA 2GELA 1X9JA 3VF6A 2DPNA 2NLXA 1QQOA 2GWJA 2P9LB 1TUUA 5AQUA 2V7ZA 4ISGA 3UKUA 1JCEA 4O5FA 1D4XA 1NGGA 3KZBA 3I8BA 4BRDA 3H1QA 1XQSC 3CHWA 5F1XA 2CH5A 3MK6A 4BC5A 2P9IA 3RSEA 4EAHD 4XH5A 1U2VA 2A5XA 4A2AA 3BEXA 3EL2A 4H5NA 4CI6A 5EX5A 1MDUB 4QS9A 3WQTA 4H5WA 4GY2B 5EY4A 2GWKA 5EOYA 4BRNA 4A62A 1HUXA 4QS7A 5AQRA 1TYQB 2ASOA 3D2FA 3R6MA 3WT0A 4BQLA 3DXKA 3D7EO 4XEIA 5BRFA 3VOVA 3R9PA 2QWNA 3DWLA 4FWQA 1HJOA 3CJAA 5KPZA 2QW9A 3VETA 5AQXA 3ZX3A 2P9LA 3FZLA 1KAXA 3L4IA 1XC3A 1V4SA 2P9KA 2V51B 5AQSA 3FLCO 4XH1A 2HOEA 1BO5O 1MWMA 3LDPA 2FSJA 3M6GA 1NGCA 5AQLA 2QWRA 4CZMA 3FZFA 2Q97A 4NO7A 3MN9A 5E84A 3VEWA 2GUPA 3H1VX 4BREA 3LM9A 3VF4A 4RCHA 3WXKA 1GLCG 3A8YA 3O6WA 4CZFA 4PKIA 1GLEG 3VF2A 4F9OA 2E2QA 5AQFA 4FWLA 4A2BA 4GNIA 5B8HA 1ESVA 4H0XB 4HTLA 5ADXH 2QXLA 1R59O 3FE1A 1BA1A 1HPMA 5BREA 2P9NA 3JS6A 4JD2B 4EHUA 2D0OA 1NGAA 3FGUA 3O4WA 1S3XA 3MN5A 4B1UB 2IVPA 3EKSA 1P8ZA 4CZKA 2WUSA 4K42A 1RFQA 4M63C 4CZEA 3P4IA 3UKUB 3FR0A 1V4TA 5ADXA 4MLHA 3U9DA 2YJFA 4BRMA 1Q18A 4FWKA 3WXLA 4IJAA 1NGIA 4BRKA 2P9IB 5AQZA 3RSEB 2YI1A 3G25A 3QFPA 2W41A 5AQQA 4WYBA 4BC4A 4LC9B 1EQYA 5AFUA 2E1YA 3LM2A 2A6AA 1GLJO 4PL7A 1Y64A 4FL9A 4H0YB 5FPMA 3DJCA 3HSCA 3QDKA 4WQ4C 2HF4A 5AQGA 4B9QA 3SLCA 1QZ5A 1GLFO 1KXPA 4FWNA 3J8AA 2YHXA 5AQHA 3UKRA 2FLOA 4JD2A 4E1JA 2E8AA 3ATVA 3ENOA 4Z94A 4JNEA 4BRPA 2QWMA 3HZ6A 1S22A 1KAYA 2YHWA 4FWMA 2YCHA 5AZJB 5F0XA 2I7NA 3CI5A 1HX1A 3MN7A 5KPTA 3DXMA 2P9SB 1RDWX 2P9KB 5LY3A 5JMVA 1QHAA 4O8KA 1NM1A 4FPAA 5AR0A 4JHDA 3HM8A 3AARA 4K41A 2BTFA 1DEJA 4IXCA 1OKJA 2Q31A 3C0BA 3GL1A 2I7PA 2A41A 5JICA 4K43A 4RWTA 3WQUA 3VESA 4M7YA 3GDQA 1J6ZA 4KBOA 2QWOA 4BG9A 4H5VA 1GLAG 3ZETB 4DHYA 2P9UB 1DGKN 4JN4A 3CJ1A 3GBTA 3I33A 1WUAA 5AQPA 2UYTA 3BUZB 3TPQA 4H5TA 5KQDA 1MWKA 5LJVA 3C7NB 3W0LA 3O1WA 4FWOA 3H6EA 2A3ZA 4FO0A 3HI0A 4WQ5C 3GE1A 3IUCA 4Y0WA 5AQOA 4CD1A 2VYPA 1ATRA 3FZHA 2P9NB 4ISFA 2W40A 5KQ8A 2ZGYA 4H0PA 3IFRA 1HKGA 2E2NA 5AZJA 5AQNA 1Z05A 1NGBA 2P9SA 3CJ9A 4M7XA 3W3DA 2FF3B 2H3GX 3IDHA 1BG3A 2AA4A 1XUPO 2NZTA 3CIPA 4IWVA 2E2OA 2FF6A 3QFUA 4BVPA 4YDUC 3VGLA 1C0FA 4BRCA 4BC3A 4FOIA 4BR2A 3ZETA 2QWPA 4DB3A 5AQYA 3UB5A 4FWSA 5EVZA 2P9UA 3UE5A 1NGDA 5FPEA 2CGLA 1NLVA 1SZ2A 4MO5A 1WOQA 3WXJA 1BWFO 4I6MB 3C7NA 2YHYA 1HKBA 1NGJA 2BUPA 1T44A 4BRQA 4FPBA 2Q0UA 5AZIB 1G99A 3MMVA 4HWIA 5BPLA 3UKRB 4AM7A 2Q0RA 3FZKA 3A0IX 4FSVA 2D1KA 3FZMA 2D4WA 5BPNA 1RGIA 4BR5A 4DCHA 5LJWA 3DXMB 2YJEA 1BOTO 1BUPA 3VEZA 4J8FA 3QMLA 2IIRA 1H1VA 3JXUA 4JHDB 5AQIA 1E4GT 2PBDA 1YUWA 4IO8A 1K8KA 3ULEA 5EXWA 1QQNA 3M3ZA 4H5RA 3BF1A 4H0OA 2CH6A 3BP8A 3EN9A 4H03B 4BRFA 4MLEA 4K25A 4MO4A 2J4RA 4L3QA 4CJ7A 3GOIA 4I6MA 1YVNA 2F9WA 2FSKA 1NGFA 3QBXA 1ZBSA 4B1YB 3TU5A 2HF3A 2E2PA 2F9TA 5AZIA 3VGMA 3LDLA 1GLDG 3U4LA 3EO3A 3D2EB 1X3MA 3AAPA 4PKGA 3F9MA 4BR0A 2KHOA 1HKCA 2V7YA 1X3NA 3A5MC 5ELZA 2OANA 3VEOA 2ZGZA 4H0TB 3CJCA 3VENA 1Z6RA 1IG8A 3IMXA 2GTDA 4BGAA 4CBUA 3QB0A 1IJJA 4BC2A 4XH4A 4B1XB 1DKGD 4JAXA 4BR9A 1GLLO 1KAZA 4BG8A 4CBWA 3WUHA 3S41A 3ZX2A 3AAQA 2ZWHA 3CQYA 5BN8A 3ID8A 2GEMA 1NWKA 5AQTA 1LOTB 4PL8A 3ZEUA 2NRHA 3SK3A 3ATUA 1ZXOA 5BRHA 4EHTA 3O5BA 2P9PB 2Q2RA 3EZWA 3WXIA 1MA9B 3CJ7A 3H3OB 3O1BA 3D2EA 4IJNA 2ASMA 2A42A 2VCPA 4DQ8A 5BRDA 4NB4A 4CD3A 1SAZA 4CBXA 3CERA 3A5OC 4CZLA 4PKHA 4BQZA 1TUYA 3KHYA 3EKUA 4FWRA 2D0PA 3M1FA 3MDQA 4EIAA 5FPDA 5I9EB 4FWPA 1E4FT 3H46O 4ISEA 5JLFA 3B8AX 2QM1A 1BDGA 3U9ZA 3LL3A 3O08A 3CETA 3VEXA 4BRHA 1K8KB 3AY9A 5BN9A 1YAGA 1HLUA 2ASPA 3ULEB 5F2RA 3KVGA 5FPNA 5AQJA 1SQKA 3LDQA 2IVNA 4RTFD 5KPRA 4AM6A 3VPZA 1QZ6A 4BRIA 3QBWA 5AQWA 3MCPA 3H3NO 5CE3A 5BPMA 1NGHA 1CZAN 2CGKA 4WQ4A 1JCFA 3ZX0A 4C23A 2E20A 3CJBA 2P9PA 5JLHA 3VEYA 3WEEB 1ATNA 1QQMA 4CZJA 1NBWA 1C0GA 2V52B 1NMDA 4QS8A 2Q36A 3R8EA 4BR7A 2EWSA 2HMPA 2E1ZA 2QWLA 1T6CA 3HTVA 1TYQA 4BGBA 3SMPA 4BR4A 5AQVA 1BA0A 2FSNA 3BF3A 4EFHA 5AQMA 5AFUH 3QICA 3SJHA 1YXQA 4BVOA 2FXUA 3L0QA 3VGKA 3ZEUB 4BRGA 3CQXA 4CZHA 1T6DA 5AQKA 4B1VA 1GLBG 3LDNA 5E26A 1LCUA 4CZIA 3ENHA 3WEEA 1U6ZA 4WQ5A 3LDOA 2ZF5O 2VWBA 3L6QA 2PAVA 4B1ZA 1U2VB 4A61A 3H45C 4BROA 3A5NC 2E88A 2A40A 5TKYA 3U8XA 2CGJA 2QWQA 1ZC6A 3FFKB 1BU6O 3O80A 4FOEA 2IVOA 3GG4A 2ITMA 4IZ9A 4H0VB 3DAWA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1ASVA 1NGEA 4CJTA 2F8SA 3D2FB 2Q1NA 4YDUA 3SMSA 2AP1A 3SAFA 4DTOA 4KB0A 4CHOA 1ATSA 1VSHA 3RTVA 3O8MA 4XIUA 3ZT0A 4B3TK 2GWJA 4FJXA 3LALA 3S9HA 3MXIA 4G9ZA 4FJHA 3UKUA 1JCEA 1EWQA 2BH1A 2KLAA 5F1XA 1XQSC 2X6SA 3CHWA 4CEFA 4JI1K 4RW8A 3RSEA 4XH5A 2HHTA 3DLRA 3B6OA 3M8RA 1WBDA 4RW4A 1LAWA 3TSQA 1FXXA 5M1QA 5JVHL 4A2AA 3BEXA 4FJGA 1S9EA 4CI6A 3QESA 3QO9A 1VSDA 2GWKA 4BRNA 3AO2A 1TYQB 1FK9A 3R6MA 3WT0A 1K6YA 4LF9K 3VOVA 3R9PA 2FBYA 4FWQA 1RBUA 5AQXA 3T3FA 3FZLA 5AQSA 4XH1A 3THWA 1N33K 2R7YA 4CGJA 3M6GA 2QWRA 2W42A 1YTUA 1JJ2M 4GVMA 4CJQA 4B9NA 3T7ZA 1GLCG 2XRIA 1HPZA 4YOUA 4CZFA 4DV6K 3LPTA 2E2QA 5AQFA 4A2BA 1VQ8N 3DOKA 3WNFA 1ESVA 4HTLA 1IKWA 5ADXH 2QXLA 1R59O 3FE1A 2KQ2A 4N5SA 1BA1A 1HPMA 4CJRA 4EHUA 5A2QO 3VQCA 3V1QA 2YNIA 2E4LA 3LAKA 1EP4A 3EKSA 2DY4A 4K42A 3OYBA 1EO1A 1RFQA 4LSLA 4E7KA 3RR7A 4B9UA 3HXMA 4CJ5A 3LP1A 4KB1A 1LWCA 4BRMA 3H08A 3KK3A 4B8CA 5AQZA 2P51A 4LF7K 2KFZA 5AQQA 4C8KA 1S1XA 4IO9L 2A6AA 1JLAA 1JKHA 1Y64A 1IBKK 3G6EN 1TKXA 4KFBA 4B9QA 2HHQA 1HNZK 3SLCA 1GLFO 3J8AA 4N47A 3AVMA 4MFBA 1YHQN 2O8BB 4IEEA 4JD2A 4JK8A 4Z94A 1RDBA 1KAYA 3HOSA 3KKRA 1S1WA 4RW6A 2I7NA 3NAEA 1HQEA 1RDWX 2P9KB 3VQ6A 5J2QA 3MXMA 5AR0A 3ZSYA 3SNNA 4K41A 2BTFA 2D0CA 4JS4A 3J7AP 2Q31A 3C0BA 2I7PA 5JICA 4RWTA 1HRHA 5GADP 1RT3A 3AV9A 4JK9A 2QWOA 1KQSM 2OZMA 1DLOA 5JENA 3AO1A 1DGKN 3I33A 1WUAA 4H5TA 3W0LA 2FBVA 4DTJA 4CFAA 4JKFA 3H6EA 3F2KA 4GV9A 5GINA 4Y0WA 3VQ7A 5HRSA 1DTTA 3NF7A 4CD1A 4B9MA 3AA3A 4JI8K 2WC9A 3IFRA 1HKGA 3VQQA 1Q81O 1Z05A 1D9DA 4BDZA 3HJFA 4M3UA 1BG3A 2AA4A 2ATQA 2UUBK 1XUPO 5GIPA 5KRSA 4KTZA 4F2RA 4IDKA 2Q3SA 4KHQA 4AHTA 1RT6A 4BVPA 3QEXA 1C1AA 4OJRA 5FLXO 4FM1A 5AQYA 1NK0A 1CXQA 2PYLA 4LF6K 5FPEA 3Q7CA 3OYLA 1SZ2A 5KGWA 1C0UA 4IFYA 3PX4A 1WOQA 4EZ9A 4I6MB 4CJVA 2YHYA 5DK5A 1JLFA 4FW2A 1NGJA 4DFKA 4DU1A 3KWGA 1N6QA 1G99A 3MMVA 1T05A 1X9WA 1XC9A 3CQ8A 3OS0A 2OYQA 4C1NK 3SUPA 4AHSA 4DCHA 1T03A 3E9OA 1BUPA 4IDHA 3CCUN 5M1KA 2IIRA 4X62K 3JXUA 4JHDB 3ZSXA 2PBDA 4M3YA 2JWLA 3CCQN 3TABA 3BF1A 1IO2A 2F96A 4IG3A 1NK5A 3R3LA 4BRFA 3THYA 3ENBA 3OYJA 3GOIA 3CG7A 4DS4A 3HPOA 2FSKA 3QBXA 3LP0A 4B1YB 3TU5A 2P1JA 5CZ2A 1HYVA 5AZIA 4JI0K 1GLDG 3U4LA 4DR3K 3D2EB 1X3MA 4DMNA 4G1QA 3F9MA 4DWIA 3NE6A 4FJKA 3LZIA 1VQ5N 3A5MC 3VTHA 3VEOA 2OTLN 3CJCA 2G8VA 2WOMA 2DFHA 2F7TA 1IG8A 3IMXA 1VQMN 2NRXA 4FZZA 4AHUA 4I2PA 4BR9A 3KD1E 3HL8A 4DF4A 4DTXA 4GKKK 3S41A 3ZX2A 3V9SA 4ILHA 1DT9A 5M1FA 4LF4K 1NWKA 3K59A 4PL8A 3ZEUA 2NRHA 4JI4K 3OJUA 1QE1A 1ZXOA 5BRHA 4EHTA 1VSJA 4J2EA 2Q2RA 3EZWA 1SV5A 3CJ7A 3H3OB 4KHNA 4OPAA 3TSUA 3KJVA 1WAJA 3V1RA 4DQ8A 5C2DA 2NRVA 4TSXA 3CERA 5HLFA 4CZLA 1I39A 1TUYA 4OO1J 3LWLA 3EKUA 4FWRA 3TTCA 1D5AA 1OH8A 4FWPA 1E4FT 3H46O 4ISEA 1HYSA 2HB5A 2QM1A 3OYMA 2HW3A 3V9XA 2ITGA 3MCAB 1K8KB 3HRGA 2YNFA 5BN9A 3ASMA 4OLAA 2YHBA 3SUQA 1JLGA 3VQ5A 1SQKA 4KHSA 3LDQA 4KV8A 1F21A 3OYNA 2VG7A 5KPRA 4PWDA 5AQWA 3OYAA 1RT7A 3VTIA 3H3NO 5CE3A 1N34K 1CXUA 1MU2A 3VN5A 4DR6K 1JCFA 4C23A 4ELTA 4E1MA 3TAEA 3VEYA 3EYZA 4HCCA 3VQ8A 1NK6A 3L8BA 3PLAA 3LAMA 2HNZA 4LSNA 1IG9A 4ILGB 2IGIA 5HRNA 2HMPA 3P39A 4KTWA 4DTSA 2HHHK 3SCXA 3OS1A 4BGBA 4X64K 4YY3K 4CF0A 3IS9A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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