1QZ6A

Structure of rabbit actin in complex with jaspisamide a
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
publication title Trisoxazole macrolide toxins mimic the binding of actin-capping proteins to actin
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
total genus 123
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1qz6A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1qz6A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1qz6A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1qz6A04
1SZ2A 2P9LB 5ADXH 4EAHD 1Z05A 3VGMA 1RFQA 3ENOA 5E26A 1ZBSA 3WXJA 2HMPA 4CD1A 4CI6A 1ATRA 4A61A 4HTLA 4EIAA 3FR0A 4BC3A 5EOYA 1TUUA 3LDNA 1ZC6A 1GLDG 3O6WA 1NGDA 1HJOA 1H1VA 1U2VB 3GL1A 3BP8A 4FOIA 3HI0A 1K8KA 5LJVA 3I8BA 2P9LA 3CHWA 1XUPO 4BG8A 2D4WA 3H3OB 5AQQA 2ITMA 2FLOA 3U4LA 4BRQA 1ZXOA 4IO8A 3CQYA 2GTDA 3VENA 3VEWA 3VF4A 2ASOA 3IDHA 4AM7A 3FZKA 2A41A 3MMVA 2YHYA 4H0OA 1BA0A 4C23A 1RGIA 3QICA 4BGAA 1U2VA 1BUPA 5AQTA 3O4WA 4FWPA 2NRHA 4M7YA 3H6EA 1SAZA 3VEXA 4BRDA 1LOTB 4CBUA 1DKGD 4AM6A 2ZGZA 3OHRA 2QWRA 5AQYA 4JNEA 2I7NA 3HZ6A 1QHAA 2YI1A 4FWMA 3GBTA 2A42A 2HOEA 3CI5A 1NGBA 5AQNA 1HKBA 5EVZA 3FFKB 3W0LA 2Q1NA 3ZX0A 1RDWX 3KZBA 4FOEA 2CGLA 1OKJA 3DAWA 4CZJA 4FPBA 4DQ8A 4CZFA 4H03B 3A5OC 1ATSA 2QXLA 3VERA 3HTVA 4FWQA 4BRNA 2NLXA 1EQYA 3QFPA 1T6DA 1D4XA 2D1KA 3MCPA 4Z94A 5CE3A 1QQOA 1HKCA 3W3DA 1WOQA 2E88A 1TYQB 3D2FA 1WUAA 4H5RA 3FZFA 4EHUA 2P9IA 4FL9A 1XC3A 5AQZA 1QZ5A 3VOVA 2V7YA 4BC5A 1YUWA 2YJFA 3SK3A 4H5VA 3GDQA 4BQZA 1LCUA 5AZJB 3A5NC 3CQXA 3KHYA 3UB5A 4B1VA 4CZIA 2W40A 2OANA 3B8AX 5BPLA 3F9MA 1CZAN 1X3MA 4CZKA 4BC2A 3UE5A 5ELZA 1TYQA 3S41A 2PAVA 2P9SA 3CJ7A 4PKGA 5JICA 3I33A 3DXMB 3ATUA 1NGHA 1SQKA 1YVNA 3IMXA 2QWPA 5F0XA 2CH5A 4CJ7A 1Q18A 2P9PB 2P9NB 4BR2A 3CIPA 3IUCA 4FWSA 2YHWA 5BPMA 2W41A 4MO5A 3A0IX 3H45C 3VGLA 1BU6O 1ESVA 3FGUA 3HM8A 1YAGA 1GLCG 2IVPA 3GE1A 4BROA 3FZMA 4FO0A 1MWKA 5EX5A 3DXMA 5AZIA 2Q2RA 4BREA 4IJNA 1V4SA 2P9PA 2P9NA 1NBWA 4M63C 4L3QA 2E2QA 4M7XA 3H46O 1HUXA 2CGKA 3L6QA 3QDKA 5AR0A 4BGBA 2QWLA 4CZEA 2A6AA 2AP1A 3WEEB 1HKGA 2Q31A 3CJCA 2ZWHA 3JS6A 1GLAG 3WUHA 2EWSA 4BR5A 2QM1A 2F9TA 3BF3A 4XH5A 4MLEA 3JXUA 1ATNA 2CGJA 3LL3A 3UKUB 5AQFA 1MA9B 2A5XA 4BR7A 3O80A 3WT0A 1DGKN 3FE1A 5FPNA 4H0PA 2YHXA 4MO4A 2VYPA 3WEEA 3CJAA 1BDGA 2ZGYA 3EL2A 1E4FT 1XQSC 4K41A 1U6ZA 3P4IA 5BN9A 1MWMA 5KPRA 2GELA 4BRKA 3ULEB 5FPDA 1KAXA 3U8XA 1Y64A 4CZMA 1R59O 3ZX3A 4BVOA 2FSJA 2BTFA 3AY9A 3O08A 3VEZA 2GWKA 1GLFO 3UKUA 4GY2B 4ISEA 4BRIA 1X9JA 5JLHA 3EKUA 1GLLO 3GOIA 3WQTA 3D2FB 3HBTA 3EKSA 3ID8A 3VEOA 2V51B 3CERA 3SJHA 2P9IB 3R9PA 4EFHA 1Z6RA 2UYTA 4E1JA 4A2AA 3EZWA 3ULEA 2IIRA 4H0VB 2Q0UA 4BQLA 1J6ZA 3DXKA 3KVGA 2FF6A 3MN5A 4H5NA 2GWJA 3RSEB 4FSVA 5LY3A 2Q36A 2P9SB 3ZX2A 1NGCA 4IWVA 4NB4A 2E1ZA 3SMSA 1NLVA 3WXKA 5FPMA 3C0BA 1NGFA 4FWNA 2NZTA 5BRHA 3VEYA 1S22A 4YDUC 4PKHA 5BRFA 4IXCA 2H3GX 5KQDA 3RSEA 4NO7A 4WQ5C 3WXIA 2YCHA 1HPMA 4BRFA 4ISGA 1KAYA 3LDPA 3WXLA 4BR0A 5AZIB 3H1VX 4BR9A 5EY4A 4FPAA 5EXWA 2VCPA 3LDLA 3H3NO 1GLJO 1JCGA 3TU5A 2QW9A 2P9UB 3M6GA 4PL8A 4CD3A 3U9DA 2E2NA 1E4GT 3SMPA 2FSNA 3AARA 3QBWA 2J4RA 3J8AA 5JLFA 1BA1A 2QWNA 2GUPA 1KXPA 2QWQA 2PBDA 3LM9A 3MN7A 2E20A 3D2EA 4BRAA 1C0GA 1T6CA 4BRMA 1NMDA 3M3ZA 4JAXA 2HF3A 3LM2A 4RWTA 4MLHA 5AQWA 5KPZA 1TUYA 4BRLA 3R8EA 2Q0RA 2P9UA 3QMLA 4RCHA 2QWMA 5KQ8A 2DPNA 3L4IA 4BVPA 5AQUA 3H1QA 3VETA 4DB3A 4A2BA 1BOTO 1BG3A 3BUZB 5E84A 5AQGA 3TPQA 4KBOA 2D0OA 3M1FA 4H5WA 4K43A 5AFUA 4FWKA 5B8HA 5AQVA 4DHYA 4HWIA 5AQPA 2GEMA 1NM1A 4H0TB 5BN8A 4JHDB 5FPEA 1NWKA 4I6MA 2P9KA 4PKIA 4IJAA 3GG4A 2I7PA 3VF2A 4H0XB 4CBXA 5AQIA 2Q97A 4K25A 4FWRA 3DWLA 3MN6A 3QBXA 1BO5O 2V52B 4O5FA 3ATVA 1GLEG 4FWOA 1HX1A 5AQOA 5AQXA 1MDUB 4B1YB 4JHDA 1X3NA 2ZF5O 4EHTA 3DXKB 4JN4A 3UKRB 3VPZA 3ZEUB 4J8FA 5AQKA 3MN9A 5BR9A 2QWOA 3MDQA 2WUSA 2YJEA 5AFUH 1HLUA 4B1UB 3ZETB 4H0YB 1QQMA 3A5MC 1NGJA 3FZLA 3CJ9A 3IFRA 3CJ1A 4DCHA 1NGIA 1KAZA 2FF3B 3VESA 5BPNA 2E2PA 1V4TA 3G25A 2D0PA 5AQJA 5AQSA 3D7EO 1DEJA 4O8KA 3UKRA 4K42A 2A3ZA 3QB0A 3ZEUA 4WQ4C 4JD2B 3R6MA 1GLBG 4B1ZA 3VF6A 2ASPA 3BEXA 3ZETA 4XEIA 2E1YA 4Y0WA 3BF1A 3AAPA 3VEVA 3FLCO 3U9ZA 4RTFD 4PL7A 4B1XB 4CBWA 2VWBA 4BRHA 2F9WA 3SLCA 4BG9A 4BRGA 3EO3A 4QS7A 5F1XA 1JCFA 1QZ6A 2BUPA 4QS8A 2IVOA 4FWLA 3CETA 1S3XA 4BC4A 3AAQA 4LC9B 3O1BA 1YXQA 1P8ZA 4JD2A 4XH4A 5AQMA 4B9QA 4CZLA 5F2RA 5BRDA 3FZHA 3O1WA 3D2EB 4ISFA 2CH6A 1IJJA 3DJCA 3C7NB 4BR4A 5ADXA 3A8YA 5JMVA 5I9EB 1NGGA 3CJBA 3WQUA 4WQ4A 4GNIA 2E2OA 5AQLA 2FSKA 3EN9A 3MK6A 4B1WB 3L0QA 4CZGA 1G99A 2ASMA 3QFUA 2V7ZA 3ENHA 4QS9A 3O5BA 4BRPA 1T44A 4CZHA 3LDQA 4IZ9A 4XH1A 1JCEA 2E8AA 1QQNA 4A62A 5KPTA 1NGEA 3LDOA 3C7NA 1NGAA 2FXUA 4YDUA 2A40A 5AZJA 3O8MA 4I6MB 2P9KB 4WQ5A 3HSCA 5LJWA 2KHOA 3A5LC 1C0FA 4BRCA 5TKYA 2IVNA 2HF4A 3VGKA 4H5TA 1BWFO 2AA4A 4F9OA 1IG8A 5AQHA 5AQRA 4WYBA 1K8KB 5BREA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4CGGA 3H08A 4ZTFA 3ULDA 3VGMA 3CPWM 4DR3K 4G9ZA 3AVLA 1UA1A 3R3LA 5DK5A 1ATRA 4A61A 4HTLA 1MU2A 3VQAA 2GBZA 1BGXT 1WB9A 3HL8A 4G1QA 1YTAA 3S3MA 1NGDA 1H1VA 3BP8A 4CJPA 3SAGA 3ENBA 3THWB 3I8BA 3CHWA 4BG8A 4DR4K 1ZXOA 3CQYA 1X9SA 3AGRA 2HBJA 4CIGA 1OVYA 1VAZA 2A41A 1BA0A 4I2QA 3QICA 4BGAA 1BUPA 3O4WA 2NRHA 1SAZA 4NCBA 4AM6A 1VSIA 3TAFA 4OKKA 2YI1A 2RF2A 3GBTA 2A42A 4FWMA 3HO1A 4LFAK 5C2FA 3ZSRA 2Q1NA 3KLGA 4W5NA 3HK2A 4MDAA 4H03B 3VN5A 3A5OC 4HUGA 3P31A 4DFJA 1EQYA 1RDDA 1KFDA 4CF0A 1D4XA 1D9DA 4ID1A 2UUAK 2D1KA 4JS4A 5CE3A 4B3SK 3AVGA 3RMBA 1NK8A 4EHUA 1YI2N 2P9IA 4CE9A 5HRSA 1Q8IA 1YUWA 4X64K 4BQZA 3A5NC 3KHYA 1QHTA 5GAEP 2OANA 1NK5A 1CZAN 1X3MA 1VQMN 1ZBLA 4BC2A 5ELZA 3TAQA 3NF6A 3S41A 4PQUA 5JICA 3RRHA 3I56N 3I33A 1SQKA 4JS5A 2QWPA 4FK2A 4CJ7A 4RW4A 4CVNE 2P9NB 4BR2A 1QVFM 4CFAA 3IUCA 4DSEA 4FWSA 5HRPA 3EE9A 2RPIA 4C1NK 3A0IX 4JLHA 4OKEA 3H45C 4Z4EA 2Y1IA 3QEWA 1YAGA 3TR8A 3PSFA 3GE1A 4BROA 2YKNA 3FZMA 4FO0A 4GMJB 1MWKA 4JI0K 2Q2RA 1XI1A 1RT7A 3VTIA 4PHTX 1LW2A 1XC9A 4F3OA 4L3QA 4E1NA 4M7XA 1HUXA 4OX9K 4JYAK 4CZEA 2Z1IA 4LF7K 1KLMA 3M8PA 3CCRN 3CXCM 4JKCA 3PO5A 4CK1A 1KFSA 4ZTJA 2ZWHA 3CCJN 1GLAG 4BR5A 2KFZA 3QEIA 4OPAA 4MLEA 3L2UA 4I9LA 1ATNA 3PUFA 3UKUB 1IG9A 1WNSA 2P51A 3T19A 1DGKN 1KVAA 1RT5A 2YHXA 2VYPA 3WEEA 3VMFB 1TKZA 3CFOA 4E7HA 3EL2A 1NOZA 1XQSC 3P4IA 1HNWK 4BRKA 5FPDA 4CFDA 3LALA 1Y64A 3THYB 1VQ7N 1NKBA 3AY9A 1LWFA 4JRPA 3TARA 4GY2B 4E3SA 3TWHA 1X9JA 1GLLO 1IKYA 2KQ2A 3LAKA 1SKWA 2O8EA 4DTMA 3KKSA 4CEOA 3QESA 2O8FA 3CERA 2P9IB 3R9PA 4EFHA 2ATQA 4O4GA 2UYTA 1ZBFA 4JI4K 1X9WA 1YITN 2OZMA 1JLQA 5DMRA 2Q0UA 4WFBL 4DF4A 1SL1A 4BQLA 2E5LK 4OKJA 2NRTA 1O1WA 4IO9L 4CCHA 2GWJA 3QETA 4FK0A 2HHTA 4FJJA 3AVNA 2HHQA 4KH5A 3ZX2A 2BE2A 2YKMA 4NYFA 1U47A 1KTQA 3DMJA 4IWVA 2Z1GA 3SMSA 4FJGA 1NLVA 1BISA 3NE6A 1CZ9A 4DTNA 5FPMA 1K6YA 5CR4A 3J7AP 1JXEA 3NFAA 4YDUC 4IXCA 4C8KA 3C6UA 4YOYA 5J2NA 2P5GA 4HCCA 2KW4A 3OBWA 4C8NA 4AILC 2WONA 4QCLA 3K5NA 4N41A 3O9QA 1JCGA 2QW9A 3OVNA 4W5TA 3NF7A 4CD3A 3VQCA 2E2NA 2XY8A 3SMPA 5HROA 3QBWA 3LANA 4DMNA 3J8AA 4KHNA 3KK7A 3RMAA 1FKPA 4DTRA 2FBYA 1ZBIA 4JKDA 1KXPA 2QWQA 2G8FA 3B6PA 4JAXA 3O4QA 3WNGA 1YT3A 4RWTA 5KPZA 3V4IA 3L2QA 4IG0A 3CCMN 3R8EA 1G15A 2Q0RA 1L3UA 2QWMA 4L8RB 2DPNA 4BVPA 3E66A 4DSFA 3O9SA 1BOTO 4E19A 3BUZB 3RMCA 1J9AA 3TPQA 4H5WA 4I9QA 5B8HA 5AQVA 4DHYA 1YHQN 4HWIA 4AHUA 3K2PA 5AQPA 4H0TB 3HM9A 3DLEA 4JHDB 4CHPA 5FPEA 4KTWA 4I6MA 2P9KA 4PKIA 3V1OA 1RDCA 4CBXA 1S5JA 5MLCQ 5AQIA 4CECA 3DWLA 3OY9A 1VQ4N 3K0SA 1HX1A 3EYZA 1VQON 1NJIO 2G8WA 4DSIA 3OYBA 3VQBA 5HP1A 3UKRB 4V19S 1R0AA 2GV9A 2O4IA 1VQPN 1B92A 1T03A 3ZETB 1S1VA 2O8DA 4H0YB 3ZSXA 2P5OA 4CJ4A 3A5MC 4FZYA 4DCHA 1KCFA 3NCIA 3B6OA 1V4TA 2XY5A 1KC8O 4BDZA 4O44A 1EP4A 2A3ZA 3QB0A 3ZT3A 4WQ4C 2OPPA 1EETA 1W2BM 4XEIA 2E1YA 3AAPA 3VEVA 2JWLA 3FLCO 4M3RA 4CEZA 4JI7K 1RCHA 2PYLA 1OH6A 3EO3A 3LP1A 5C42A 4Y1CA 4QS8A 1JLGA 2IVOA 3CETA 1Q82O 3E9LA 2D5RA 1YXQA 4JD2A 5AQMA 1YJWN 1EXQA 2B4JA 2IS3A 4HUFA 3DJCA 3OYHA 4BR4A 3HOTA 3A8YA 3I55N 2YNHA 4DQPA 3CJBA 3LWLA 4WQ4A 2FBXA 3MK6A 3IG1A 3L0QA 4FW1A 5D3GA 1VSHA 4BRPA 3O5BA 4E7LA 1D5AA 4DV3K 4FLVA 4KH4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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