1QZ6A

Structure of rabbit actin in complex with jaspisamide a
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
b'TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Trisoxazole macrolide toxins mimic the binding of actin-capping proteins to actin
pubmed doi rcsb
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
molecule tags Structural protein
total genus 123
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1qz6A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1qz6A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1qz6A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1qz6A04
4DQ8A 3R8EA 2CH5A 3KZBA 2P9KA 3VOVA 3ATVA 2ZF5O 3MK6A 1YUWA 5AQGA 4F9OA 1ZC6A 4EAHD 1ATSA 1MDUB 5AFUA 2I7NA 3VEYA 4PKGA 4FL9A 2D1KA 1R59O 2AA4A 2W41A 3O5BA 1DKGD 4WYBA 1JCEA 3IUCA 2YI1A 4BVPA 4PL7A 2E2QA 4JN4A 2VWBA 1EQYA 3LM2A 3MN9A 3CJAA 3A5NC 2QWPA 3ZX3A 1NGCA 5BRFA 1GLJO 2VCPA 1K8KB 2D0PA 3SMSA 2GWJA 3BEXA 4IJAA 4Z94A 4IO8A 1HJOA 1S3XA 3SLCA 3CIPA 3H46O 1GLCG 3SJHA 4B1YB 1LCUA 3AAPA 3VESA 3VENA 4CBUA 4EHTA 3WXIA 3GDQA 5AZIB 5F1XA 3FR0A 4BRHA 1YVNA 1IG8A 3QFPA 3F9MA 3WXJA 2D0OA 2NLXA 2QWLA 1HKBA 1NGAA 4LC9B 2Q31A 2FLOA 3J8AA 3VEWA 1ATRA 3CQYA 2E1ZA 4PKHA 1Q18A 3R9PA 2HOEA 3FE1A 2E2PA 3ZX0A 3A5OC 2ZWHA 4HWIA 5JMVA 2Q2RA 3LDLA 1E4FT 3ULEA 5EOYA 4B1WB 4CJ7A 4BRLA 3LDNA 1V4TA 4ISFA 4EHUA 4CD1A 1BO5O 4EIAA 2GWKA 2ZGZA 4WQ5C 5AQKA 5EY4A 2WUSA 2Q36A 4H0PA 3MMVA 2A5XA 4WQ5A 5FPMA 5AQRA 3P4IA 4FPBA 1U2VA 4CI6A 5JLHA 2V7ZA 3KVGA 5AQHA 1E4GT 2V7YA 2ITMA 2HF4A 1GLLO 4RTFD 4K25A 3BF1A 2QWMA 1NWKA 1BWFO 3WEEA 4BRCA 3U8XA 3WXKA 3VGLA 3VETA 3ID8A 3VF6A 4GNIA 4H5TA 4BR7A 1HLUA 1XUPO 3H1VX 3IMXA 4FWOA 4H5VA 2P9SA 3D2FA 3M3ZA 3W3DA 2YJEA 3H3NO 3CHWA 2PBDA 5KQDA 3AAQA 2P9LB 4HTLA 1T6DA 2F9TA 3DXKA 2P9KB 3UKRB 4IZ9A 5BN9A 1HUXA 4BRFA 3KHYA 2AP1A 1CZAN 3ENOA 4I6MB 4B1VA 4M63C 3CQXA 1JCFA 1V4SA 3DWLA 4H0VB 5LY3A 2V51B 3ATUA 4QS9A 4K41A 2P9UA 4C23A 1TYQA 2E1YA 2ASOA 3WQTA 3AY9A 5AQYA 3C7NB 4BR0A 3HBTA 5LJWA 3I33A 1QZ5A 1BA0A 4YDUC 5AQNA 3D7EO 4FWRA 3FZKA 4M7XA 1BA1A 4YDUA 3SK3A 3WUHA 5BN8A 1T44A 3MN7A 4B9QA 5AQSA 1S22A 4M7YA 1KAYA 2PAVA 4CZKA 4JAXA 5BPLA 4MO5A 3CI5A 2QXLA 1LOTB 2QWQA 3EO3A 3O6WA 4K43A 1GLAG 4K42A 4H5RA 4O5FA 3ZEUA 3B8AX 3BP8A 3GOIA 3VEXA 3DXMA 4B1XB 5AQUA 1GLFO 3L0QA 2Q1NA 3VF2A 5AQZA 4BC2A 5AQVA 4JHDA 5ADXH 2E8AA 1WOQA 3EN9A 5E84A 4DHYA 2P9PB 5EXWA 3UE5A 5ELZA 2FF3B 4FSVA 3D2EA 4JNEA 1D4XA 2P9IA 2A6AA 2BTFA 2IVOA 5BPNA 4FWLA 1KAXA 4NB4A 3A0IX 3WXLA 1NGJA 3RSEB 1Z05A 4BC5A 1QQMA 3LL3A 5AR0A 3VGKA 4CD3A 5AQJA 2Q0RA 1C0FA 1U2VB 2DPNA 1MWKA 3GE1A 2I7PA 4JD2A 5I9EB 1NMDA 4A2AA 4BQZA 2QM1A 3DJCA 1X3NA 4BRMA 5AQMA 2ASPA 2KHOA 2P9NB 5BRHA 5BR9A 3R6MA 3MCPA 3SMPA 3W0LA 3ZETB 3VEVA 3UB5A 4BRNA 3EKSA 4BRIA 1Z6RA 3QBXA 5KQ8A 1QHAA 1ATNA 2FSJA 2EWSA 4XH1A 4RWTA 2ASMA 2FF6A 3QBWA 1HKGA 4O8KA 4B1UB 3VERA 5EX5A 3L6QA 1P8ZA 5E26A 4PL8A 5FPNA 3O08A 4BC3A 1K8KA 4B1ZA 5AZJB 4EFHA 2GUPA 5AQXA 4H0OA 2QWNA 3GBTA 3FGUA 4FWMA 4WQ4C 3CJ1A 4CBWA 3CJCA 1NGFA 3M1FA 4BR2A 5FPDA 4WQ4A 4BC4A 3QMLA 1H1VA 4AM6A 3IDHA 5AQWA 5BREA 3FZMA 5AZIA 1DGKN 3MN6A 3ZX2A 2CH6A 3G25A 3BUZB 1GLBG 3I8BA 5LJVA 2QWOA 3A5MC 1RFQA 1SQKA 1BG3A 1BDGA 2D4WA 1NGIA 4BREA 1C0GA 4Y0WA 1BOTO 4MLEA 2YJFA 3LDPA 1X9JA 2E2NA 3DXMB 5AQIA 3HI0A 2FSKA 2YHWA 3H6EA 4FWNA 4IWVA 2A42A 2E20A 4JHDB 3S41A 1QQNA 1NGHA 2HF3A 3AARA 4MO4A 2QW9A 4XH5A 1HKCA 3WQUA 4BRAA 4ISGA 3D2EB 2BUPA 3TPQA 3VEOA 3HM8A 2H3GX 5F0XA 4FO0A 1Y64A 4IXCA 3VPZA 4QS7A 4BQLA 1NM1A 5KPRA 4MLHA 4BRPA 5CE3A 2YHYA 3CJBA 3UKUA 4AM7A 4FPAA 5F2RA 2IVPA 5KPZA 4FOIA 4XH4A 3QDKA 5B8HA 5JICA 3GG4A 4BRGA 4BRDA 3CERA 2W40A 4BGBA 1TUYA 4CBXA 3TU5A 1T6CA 5AQPA 3O80A 2P9LA 2A3ZA 1G99A 3A8YA 3UKRA 2E2OA 3QB0A 3ULEB 3JS6A 1ZXOA 4BROA 3EKUA 2A41A 4I6MA 1NBWA 4BGAA 4CZEA 3HTVA 1RDWX 4E1JA 4CZFA 3FZHA 4A61A 3HZ6A 1NGEA 1OKJA 5EVZA 3C7NA 3MN5A 4QS8A 4H5NA 5AQFA 5KPTA 4IJNA 3QFUA 4CZGA 3O1BA 5AQLA 2VYPA 3WEEB 1KXPA 1BU6O 1NGBA 4RCHA 3U9DA 2CGKA 2HMPA 3O1WA 1WUAA 2CGJA 2E88A 2FSNA 1ESVA 2Q97A 2P9SB 3D2FB 5AQTA 4CZJA 3O4WA 3DAWA 2NZTA 2FXUA 2QWRA 4BR9A 2GELA 1MA9B 4CZMA 4FWPA 1TUUA 3DXKB 1NLVA 4FWQA 5FPEA 3FFKB 3L4IA 5ADXA 3LDQA 4A62A 1HX1A 4DB3A 1GLEG 1XC3A 4A2BA 2P9PA 1BUPA 2GEMA 3LM9A 4BVOA 1SAZA 3JXUA 3H45C 3VEZA 1DEJA 5JLFA 2P9UB 1MWMA 4BR4A 3GL1A 1TYQB 3ENHA 2GTDA 3O8MA 4FWSA 3RSEA 5AQOA 1QZ6A 3EL2A 4FOEA 4ISEA 4BR5A 2UYTA 3H3OB 5AQQA 3C0BA 4XEIA 4BRQA 2CGLA 3M6GA 4NO7A 3IFRA 4BG8A 4DCHA 5BPMA 3WT0A 3VGMA 3FZFA 1XQSC 2OANA 4GY2B 3UKUB 4J8FA 2P9NA 3U9ZA 5AFUH 2Q0UA 4CZIA 1J6ZA 3EZWA 3ZETA 3ZEUB 1X3MA 2A40A 1HPMA 3OHRA 4KBOA 3VF4A 2YHXA 2ZGYA 1NGGA 4CZHA 2F9WA 2J4RA 4L3QA 2IVNA 3FLCO 3LDOA 1U6ZA 2IIRA 1RGIA 1GLDG 1ZBSA 3H1QA 4H0TB 4H5WA 3CJ7A 4H0YB 3QICA 4H0XB 3BF3A 1YXQA 2P9IB 3U4LA 4PKIA 1JCGA 1QQOA 1IJJA 3CJ9A 5AZJA 3A5LC 4BRKA 2NRHA 5TKYA 4BG9A 4H03B 3FZLA 5BRDA 1KAZA 4FWKA 3HSCA 3MDQA 1YAGA 2YCHA 3CETA 4CZLA 4JD2B 1SZ2A 1NGDA 2V52B
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FW6A 3R8EA 2CH5A 1S9EA 3KZBA 3VOVA 4U7BA 4NCBA 1K6YA 3THYA 1S1UA 3VQEA 4CJ5A 2ZF5O 3MK6A 5AQGA 1RT2A 3QEWA 4EAHD 3EY1A 1JJ2M 1MDUB 2I7NA 2AA4A 5HL7L 2HBKA 1Y97A 1YJNN 4PL7A 1RT4A 4K8XA 4JS4A 3ID6A 4KKOA 1EQYA 4BDZA 5BRFA 4ELUA 3NVKA 1K8KB 2VCPA 2HVIA 4IJAA 4Z94A 4IO8A 4KH6A 1S3XA 3SLCA 3TI0A 2YNFA 3CIPA 3H46O 2G8IA 1GLCG 3SJHA 1C1BA 1OVYA 2YNGA 4EHTA 4CVNE 3K0SA 3F2KA 3L2UA 4YY3K 1RTHA 4PA1A 1K9MO 1NJIO 3RR7A 3ULDA 1BCMA 3HJFA 2QWLA 1HRHA 2FLOA 3J8AA 3MX2A 1VRTA 3ZX0A 3A5OC 2AJQA 4DSLA 4FK2A 3D45A 3EE8A 4FXDA 5CR4A 3U6FA 4CJ7A 1R0AA 2X78A 4ISFA 3T69A 3PLAA 2UXBK 3L3VA 3E66A 4M3RA 4ELTA 3C6HA 1BCOA 4WQ5C 4PUOA 2UXCK 5EY4A 2Z1GA 4H0PA 4GW6A 3OS1A 3M8SA 5FPMA 3CCJN 3P4IA 5GINA 4CI6A 2V7ZA 3KVGA 5AQHA 2V7YA 1TV6A 4K25A 2FBXA 2QWMA 1BWFO 1ZBUA 2BE2A 4KI4A 3RMAA 3VF6A 3NH2A 4IDHA 3PIOL 1HR0K 4KHYA 1HLUA 3IRXA 3AO5A 4JKFA 4FWOA 4DTUA 2P9SA 5GADP 1SKSA 1L3TA 2E4LA 1RDAA 2OYQA 3CHWA 2PBDA 3CMEN 4FLVA 4KH5A 3DI6A 3K5NA 3DXKA 4B9VA 5KRSA 4OKJA 4IZ9A 3LP1A 5C42A 4EZ9A 4V19S 1GOAA 4O44A 4JEPA 4BRFA 3LZJA 4DR3K 2AP1A 4K8ZA 4I6MB 3VTIA 3CQXA 1JCFA 3LPTA 4CHZA 5LY3A 4CERA 4RW7A 4K41A 1UOCA 2P9UA 2ASOA 3DLGA 3HRGA 3HBTA 5LJWA 4YDUC 4HUFA 4FLTA 1NK0A 4W5TA 4M7XA 3WUHA 2YV0X 5AQSA 5HRPA 1S22A 4LF8K 5BPLA 4MO5A 3KK3A 2QXLA 1LOTB 5HRSA 3NVMA 4GV9A 1HNZK 1GLAG 2C1IA 4CGHA 4DU4A 3V9SA 4JLHA 4CK3A 4KHSA 1C1CA 2VGNA 4I7FA 3VEXA 3CCVN 3S3OA 4B3SK 2Q1NA 1QSSA 4JHDA 5ADXH 4BY9C 2HW3A 3HM9A 3UE5A 4FSVA 4J2EA 1E3MA 4RW8A 1FKPA 2BTFA 1K73O 1KAXA 4AF1A 4M3UA 5AR0A 3VGKA 1KFDA 1BIZA 4FLUA 2HNZA 2I7PA 4JD2A 5I9EB 4DV2K 1NMDA 1T05A 3RMDA 1J53A 3VQAA 4BQZA 2G8HA 3DJCA 4BRMA 2UUBK 1BI4A 2OTLN 2KHOA 3SMPA 4WE1A 3S3MA 1VQ5N 1Q8IA 4BRNA 2XY7A 4DFKA 3EZ5A 4JKGB 3CCEN 2FSJA 3U3YA 4FZZA 4XH1A 4RWTA 5LL6Z 4C8NA 1QE1A 4N41A 2D0AA 2PZSA 3L2QA 1KVAA 4AHVA 1A5VA 1P8ZA 5HBMA 3CFRA 4HTUA 3VQPA 4IG0A 4PL8A 2QKKA 1WAJA 4EFHA 5JVHL 5AZJB 2GUPA 4DR2K 3FGUA 2E5LK 4DMNA 4BACA 4F2RA 2F4VK 4CBWA 3M1FA 4KTZA 4AM6A 3IDHA 3E1YA 5AQWA 5BREA 5AZIA 3OYCA 3ZX2A 4DU3A 2CH6A 1LAVA 2KFNA 5LJVA 3Q7BA 3QERA 3VN5A 1NGIA 2BH1A 4BE1A 1L3SA 4BREA 3MEEA 4Y0WA 4CEZA 3LDPA 1CLQA 3R1XA 3OBYA 4M3XA 4IEEA 3K2PA 4AHCA 4E7JA 4KHNA 4PQUA 4IWVA 2E20A 2NRXA 3DLEA 4JHDB 4JI7K 4NCAA 3SQ0A 1BQNA 3WQUA 1HKCA 4OLAA 3VEOA 2HBLA 3NF6A 4CEDA 5DMRA 3T3FA 4PHTX 5JS2A 3CG7A 5KPRA 4OGCA 3OW2M 4BRPA 1JLGA 1RBRA 1XNRK 4FPAA 5F2RA 4FJLA 3ZYYX 3QIPA 3MWPA 3E9OA 3V4IA 4KTWA 3CCLN 3CERA 2W40A 3LALA 1T6CA 3AVLA 1IKYA 3O80A 2P9LA 4OX9K 2E6LA 3QEVA 5C12A 1EX4A 3UKRA 3JS6A 1WNSA 4QAGA 3V9WA 1S1WA 3CMAN 4J2DA 3K58A 1WN7A 3G0ZA 5M1PA 1U4BA 3SQ1A 3ZSQA 5JS1A 1ZBIA 3F73A 3HZ6A 1NGEA 3HXMA 4C8LA 3MN5A 4DQPA 2O8FA 4CF0A 1RBUA 3THXB 3QFUA 5C10A 3WEEB 1VQON 4B8AB 1WBDA 2PFUA 5I3UA 3V9UA 1VQKN 3KD5E 1WSEA 2FSNA 1ESVA 2Q97A 3P83D 2FBVA 3O4WA 3VQ4A 4YOWA 2GELA 4CZMA 2QA4N 3L2RA 2IS3A 3CPEA 4BE7B 4IOAL 3LDQA 3ZCMA 2HHQA 4FVMA 4A2BA 1TK5A 4CHNA 4G1QA 1SV5A 2GEMA 2WC9A 4DR5K 4BVOA 1SAZA 3MCAB 1NMNA 4FJGA 1RT6A 4W5QA 1TYQB 1SL0A 2GTDA 1UAXA 3RSEA 4DTJA 4H4MA 1L3UA 3EL2A 2P5GA 3PY8A 4ISEA 4A57A 4FCYA 2W6KA 4BRQA 4MDBA 5M1FA 5DM6L 2OANA 4GY2B 4FJXA 1BHLA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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