1QZ6A

Structure of rabbit actin in complex with jaspisamide a
Total Genus 123
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
123
sequence length
371
structure length
359
Chain Sequence
TTALVCDNGSGLVKAGFAGDDAPRAVFPSIVGRPRDSYVGDEAQSKRGILTLKYPIEGIITNWDDMEKIWHHTFYNELRVAPEEHPTLLTEAPLNPKANREKMTQIMFETFNVPAMYVAIQAVLSLYASGRTTGIVLDSGDGVTHNVPIYEGYALPHAIMRLDLAGRDLTDYLMKILTERGYSFVTTAEREIVRDIKEKLCYVALDFENEMATAASSSSLEKSYELPDGQVITIGNERFRCPETLFQPSFIGMESAGIHETTYNSIMKCDIDIRKDLYANNVMSGGTTMYPGIADRMQKEITALAPSTMKIKIIAPPERKYSVWIGGSILASLSTFQQMWITKQEYDEAGPSIVHRKCF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Trisoxazole macrolide toxins mimic the binding of actin-capping proteins to actin
pubmed doi rcsb
molecule tags Structural protein
molecule keywords Actin, alpha skeletal muscle
total genus 123
structure length 359
sequence length 371
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-09-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00022 Actin Actin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.30.36.70 Mainly Beta Roll Actin; Chain A, domain 2 Actin; Chain A, domain 2 1qz6A02
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1qz6A01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1qz6A03
3.90.640.10 Alpha Beta Alpha-Beta Complex Actin; Chain A, domain 4 Actin; Chain A, domain 4 1qz6A04
2P9IB 5FPMA 5AQSA 4WYBA 3VEWA 3ZX0A 5F1XA 3QDKA 1ZXOA 2E8AA 2GUPA 4Y0WA 3LDOA 5BR9A 3HBTA 3WXLA 2DPNA 2P9LB 5AQXA 3A8YA 3ZETA 4C23A 1U2VA 3CJBA 1XC3A 3ATVA 2P9NA 4CD3A 1NM1A 5LJVA 1HJOA 3H45C 4I6MA 5BPLA 4FO0A 2PBDA 1NGBA 2E2OA 2GELA 4DQ8A 5BRFA 4BC2A 3VESA 3MN5A 2QW9A 4WQ4C 4O8KA 5TKYA 1HX1A 3VEVA 2ZWHA 3DXKB 3HTVA 3ENHA 4MLHA 4BRIA 1Q18A 2J4RA 3L6QA 5AQYA 1TUYA 1NWKA 5KQDA 1BOTO 3B8AX 1V4SA 5CE3A 3EKSA 2P9PB 5AQGA 1NGGA 4NO7A 4ISEA 2I7NA 3EN9A 3W3DA 4BR2A 1IJJA 1OKJA 3GDQA 2Q2RA 4K43A 2E2NA 4BGBA 1YAGA 4O5FA 3MN6A 3U8XA 2A41A 1ZC6A 3CJCA 3KZBA 4RWTA 4BC4A 3R6MA 4LC9B 1U6ZA 2ZGYA 5E26A 4WQ5C 2W40A 3VEYA 5E84A 2D0PA 2P9KB 3LDQA 2AA4A 1IG8A 3HSCA 1RGIA 4BRFA 3J8AA 2NZTA 5KPRA 2AP1A 1RFQA 2D0OA 2E1YA 3QB0A 3O8MA 3O80A 2Q0RA 5KQ8A 3IDHA 3R8EA 3AARA 3MN7A 4FWQA 5F0XA 1LOTB 2V7YA 4CZHA 3ATUA 4A62A 4FOEA 2QWLA 1MWKA 2H3GX 3SMPA 3A5NC 1DGKN 4BG9A 3VF2A 1ATNA 1GLFO 5AZIB 3F9MA 3H1VX 4PKHA 3UKUB 4FL9A 2VWBA 3JXUA 3UKUA 1CZAN 3BP8A 1JCEA 5BREA 3H3OB 2IVOA 5FPDA 1BG3A 4CZJA 4JNEA 4I6MB 4FWMA 4RTFD 5AQZA 3M1FA 5JMVA 3WUHA 2BTFA 2BUPA 4PL8A 1NGFA 2QM1A 5FPNA 3WXJA 3QBWA 3GOIA 2Q0UA 4IXCA 4HTLA 4YDUA 4BGAA 3LDNA 2KHOA 3I8BA 2P9IA 2QWRA 4CZLA 1QZ5A 3H6EA 4B1YB 3U4LA 3H3NO 1U2VB 2E88A 2A40A 4A61A 3A5OC 2OANA 3AAQA 2P9SB 1NGCA 3FGUA 4H0VB 3IUCA 1YXQA 2Q1NA 3SLCA 1TYQB 3O08A 5EY4A 3BUZB 1WOQA 3RSEA 3WXKA 1BUPA 3QBXA 1K8KB 3O4WA 1SAZA 2YHYA 5AQKA 3GE1A 4RCHA 4WQ4A 3HZ6A 3MK6A 4FWOA 2YI1A 5AQWA 3CQXA 1BU6O 3WQTA 3C0BA 4BR7A 2F9TA 4BR0A 5AQVA 3FR0A 4JAXA 3D2EA 2FLOA 3VGMA 3LM2A 5LJWA 1KAXA 1Y64A 1Z6RA 3D7EO 3ZX3A 1ESVA 4FWSA 1NMDA 1GLJO 4EHUA 5EOYA 2VCPA 3LDPA 4IZ9A 5KPTA 3CHWA 4YDUC 4XH5A 5AQRA 4CD1A 3M6GA 1RDWX 1BA1A 4K41A 3ZEUA 4B1ZA 3CERA 1KAYA 4QS9A 1QQNA 4J8FA 4DB3A 3FE1A 3O1WA 4BROA 5FPEA 2V52B 4CBUA 1T6DA 3UKRB 4BRCA 3VEOA 5AQUA 3TU5A 4BRKA 3QICA 1HKCA 5AZJB 4H03B 3SJHA 2E20A 4FPBA 3ZETB 2QWQA 4B9QA 1J6ZA 3VEZA 4CZEA 4IJNA 3WEEB 3M3ZA 1C0GA 5F2RA 3H46O 1GLEG 1MWMA 4BR9A 3SK3A 3FZHA 1V4TA 2YCHA 4XH1A 3ENOA 3FLCO 1C0FA 4H0OA 4H5TA 2GWKA 1D4XA 5ELZA 1DKGD 3FZFA 2WUSA 3WXIA 5BPNA 2GEMA 4XH4A 3QMLA 2YJFA 1BWFO 1QQMA 3CETA 3LL3A 3FZMA 4H5WA 5ADXH 3MN9A 3FZLA 1Z05A 3UE5A 1LCUA 2GTDA 3VF6A 1NLVA 1GLLO 3A0IX 1X9JA 4BRLA 5AQPA 5AQFA 2CGJA 5AQMA 4BC5A 4BRQA 4CJ7A 3DXMA 3QFUA 1BDGA 1GLCG 3UKRA 1GLDG 2CH5A 4JD2B 4CBWA 4Z94A 2CH6A 2QWMA 3I33A 5BPMA 4JD2A 4BVOA 2ASMA 3DXMB 4JHDB 1GLAG 2HOEA 4BG8A 4BRNA 3C7NA 2V7ZA 4DCHA 2F9WA 5AQIA 3C7NB 2GWJA 4WQ5A 1NBWA 1NGIA 3KHYA 1ATRA 1ATSA 2D1KA 2W41A 3VENA 2A42A 5EVZA 1WUAA 4BRPA 1E4GT 4EFHA 2A5XA 4BREA 2Q36A 4PKIA 2ITMA 1XQSC 2IIRA 4BR5A 1KAZA 5BN8A 2YJEA 4BQZA 2P9UA 1T44A 3ZEUB 4NB4A 3GBTA 4FWKA 2D4WA 2P9UB 3HM8A 3DJCA 3S41A 2EWSA 5KPZA 4EHTA 4ISFA 5EXWA 1E4FT 2FSJA 2FF6A 3IFRA 4JN4A 4FWRA 4CBXA 1BA0A 2A6AA 4A2BA 5AQQA 5AR0A 2VYPA 1HKGA 5B8HA 3LM9A 3HI0A 2HMPA 1DEJA 1ZBSA 5JLHA 1HPMA 1NGAA 2P9KA 2HF4A 3ULEB 1XUPO 2IVNA 3O1BA 5EX5A 1MDUB 2Q31A 1HUXA 4AM6A 4KBOA 5AQNA 1HKBA 3EL2A 5I9EB 3IMXA 4EAHD 3FZKA 2PAVA 2UYTA 4H5RA 3O5BA 3WQUA 4BRMA 4FWPA 1R59O 5BRHA 3ZX2A 1YUWA 3AY9A 4H0YB 3D2FB 4ISGA 5BN9A 3CJ1A 5AQJA 5AFUA 3VF4A 3U9DA 3DXKA 2E2QA 4B1VA 1EQYA 3U9ZA 3CJ9A 4QS8A 1MA9B 3D2FA 3O6WA 3VETA 4BQLA 4A2AA 3SMSA 2ZF5O 4K25A 4GY2B 2FSKA 4QS7A 2FF3B 3CJAA 3CJ7A 3VEXA 5JLFA 2FSNA 1NGDA 5ADXA 1X3MA 4FSVA 1HLUA 2Q97A 2P9SA 5LY3A 4FOIA 2E2PA 2NLXA 4K42A 3L4IA 2HF3A 2IVPA 3A5LC 3WT0A 4IO8A 4H0XB 4M63C 4CZKA 5BRDA 4CI6A 3G25A 4CZGA 1K8KA 2QWNA 1SQKA 3P4IA 3EZWA 3VGKA 2FXUA 5AQLA 4CZMA 3A5MC 3UB5A 5AQHA 4GNIA 1YVNA 2QWOA 4B1UB 2V51B 5JICA 2QXLA 1T6CA 4L3QA 2I7PA 1QQOA 3DAWA 1QZ6A 1BO5O 1S22A 2P9PA 3ID8A 3RSEB 3CI5A 3VPZA 4H0PA 2QWPA 2CGLA 4BRDA 2NRHA 4MO5A 3R9PA 4XEIA 4AM7A 3MDQA 4H0TB 4MLEA 3ULEA 3TPQA 1NGEA 2YHWA 4BR4A 4BC3A 4DHYA 2ZGZA 4FPAA 3MCPA 5AQTA 2CGKA 3FFKB 2E1ZA 4IJAA 5AZJA 1QHAA 3AAPA 3QFPA 3VERA 3D2EB 1NGJA 3KVGA 3GG4A 3GL1A 3VOVA 4JHDA 4PL7A 4HWIA 2ASPA 2P9LA 1TUUA 3JS6A 1NGHA 5AZIA 4E1JA 4M7YA 1S3XA 3CQYA 4B1XB 1SZ2A 1H1VA 2ASOA 4H5VA 2P9NB 3CIPA 1GLBG 5AQOA 3W0LA 3DWLA 3L0QA 3BEXA 4M7XA 1P8ZA 4CZIA 3BF3A 4PKGA 4BRHA 4IWVA 3WEEA 4FWNA 4BRAA 3OHRA 4MO4A 1JCFA 3H1QA 1X3NA 4CZFA 3EKUA 3EO3A 4H5NA 4B1WB 4BRGA 4EIAA 5AFUH 3VGLA 3MMVA 1G99A 1TYQA 2YHXA 3BF1A 4F9OA 3LDLA 2A3ZA 4BVPA 1JCGA 4FWLA 1KXPA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3DOLA 5F1XA 1VQ6N 3V6DA 1VQ5N 3MWTA 2OZMA 4F2SA 3I8DA 4DQPA 1EKEA 3AVAA 3DOKA 1T8EA 3VQ7A 4F8RA 1KD1O 3SUQA 3IS9A 2P9LB 3K0SA 4NCAA 3A8YA 4R5PA 1XC3A 3CJBA 3AVBA 2NUBA 4CD3A 3IRXA 1NM1A 1HJOA 3H45C 1SKRA 2E2OA 4JI2K 3G0ZA 3P5JA 3AVHA 3DXKB 4LF6K 3HTVA 3ENHA 4MLHA 1WBDA 2J4RA 4UY8O 2XY8A 5KQDA 2HNYA 2HNDA 3B8AX 5I42A 3EKSA 2P9PB 4JS5A 1KSPA 4NO7A 1RBSA 1WSGA 4ISEA 3W3DA 3TSQA 1IJJA 1NJXA 2E2NA 2KZZA 4KHUA 3SZ2A 2XO7A 2HW3A 4DR5K 2A41A 4GV9A 1VSKA 4LSNA 4BDYA 4RWTA 2NRWA 4ID5A 4BC4A 4IKFA 1U6ZA 3VN5A 2W40A 1TKZA 4WFBL 3U3GA 1F21A 2D0PA 1RGIA 3K59A 4BRFA 3J8AA 2XY6A 4DFMA 4DSIA 1RFQA 4C1NI 3O8MA 2Q0RA 3R8EA 1C1BA 4CJQA 5T7BA 5F0XA 1LOTB 4CZHA 3DMJA 4FOEA 4OGEA 4AHVA 3KIOA 4NLBA 4EZ9A 4LFCK 3ULDA 3A5NC 1A5XA 1DGKN 1GLFO 5J2NA 2HVIA 1QSSA 4CJPA 2VWBA 3OBYA 4RW4A 1CZAN 2G8WA 3MAQA 2IVOA 4CZJA 3F2KA 4FWMA 2IDOA 3NDKA 3VQAA 3M1FA 4PL8A 4JKHA 5FPNA 3TR8A 3RRHA 4FLYA 4AHRA 3LDNA 3DYAA 3OTOK 3TAGA 4CZLA 4E7KA 3THYB 5GAEP 3H3NO 3OYLA 4ZHRA 4CF9A 3A5OC 5C12A 4LF5K 1ASVA 2BH1A 4KO0A 3QEWA 3HVTA 2QTDA 3SLCA 3AVJA 3SQ2A 5EY4A 4CK1A 1WOQA 2ITGA 3E1YA 4L8RB 3CPWM 4KHPK 2KQ2A 3P31A 2QXFA 1S1XA 4FWOA 1BU6O 3V1QA 3OYFA 2F9TA 1SKSA 3FR0A 3O4QA 4JAXA 2ZJPL 3D2EA 2FLOA 3VGMA 4N5SA 1Z6RA 3D7EO 5CHIA 3V81A 3ZX3A 4FWSA 1J5EK 1NMDA 1GLJO 4H4MA 5CZ2A 3TTFA 1IBKK 2HNZA 1D5AA 4NYNA 4BWMA 4YDUC 4JI8K 5AQRA 3NCIA 3ALYA 4CD1A 4E7LA 1J5OA 3KLFA 3ZEUA 4V19S 4QS9A 3ZLJA 3QEPA 5I3UA 4DV0K 1S1TA 4CW7B 4DB3A 3FE1A 3OJUA 2HBJA 2V52B 1T6DA 3UKRB 3AA2A 5AQUA 4CEAA 3LP2A 3HYFA 4BRKA 4CIEA 3QICA 4B9SA 3O3HA 3OYJA 4AHTA 4YFUA 3AVFA 1SL0A 3AVGA 1ZBHA 3HPHA 1C1AA 3C6UA 3PO5A 1C0GA 1LV5A 3H46O 5HRNA 1REVA 3MECA 2B6AA 4BR9A 3CCQN 2DY4A 1VAZA 3KLGA 1KTQA 4DR6K 3I0RA 3FLCO 4Q0BA 2FBTA 2GWKA 1WNSA 5ELZA 4OGCA 2OPQA 4Y1DA 4XH4A 3LP3A 4W5NA 3I55N 1QQMA 1HNVA 3CCVN 4DTMA 3ZT4A 4HUFA 3FZLA 1Z05A 4CF2A 2GTDA 2Z1HA 4W5QA 2IC3A 1WB9A 1VSDA 3JSMA 5AQPA 3T7ZA 3MCAB 4BRQA 4CJ7A 1XNQK 3QFUA 1BDGA 4DR3K 4FW2A 2QWMA 3I33A 2FC0A 4JHDB 3H08A 1RDUA 4DS5A 2O8EA 4JKBA 2OZSA 2B5JA 3OBWA 2XY5A 4U67L 3C7NA 2V7ZA 1U04A 2GWJA 1M1KO 3NGIA 1ATSA 1NKBA 3L2WA 3VENA 4E89A 5EVZA 1WUAA 3AVLA 1IKXA 1HYZA 4BREA 4CGIA 4PKIA 5BN8A 3CCRN 2P5OA 3ZEUB 3HPGA 1OVYA 3DJCA 4CGDA 4DSFA 5KPZA 2EWSA 2RN2A 2JLEA 3IFRA 3V9ZA 4JN4A 3CMEN 3LZIA 1VRUA 1HKGA 1B92A 5B8HA 3KK1A 3ZT3A 1O13A 3CYMA 5JLHA 1DEJA 1Q7YO 3Q7CA 3S3OA 3CMAN 3SPYA 4CFBA 3J80O 1KRPA 1KQSM 4CK3A 2RE2A 1HKBA 3SPZA 3L2QA 3AVKA 2GUIA 4MFBA 4EAHD 4IOAL 3O5BA 3NF8A 4FWPA 4FJMA 3NH1A 1YUWA 1HNIA 4CF8A 5J2QA 5HP1A 3K58A 3G4SN 1HR0K 1HNWK 1VHXA 3IKMA 1TK8A 3TABA 1EQYA 3J7YP 4WFAL 3M8QA 3K9KA 2YNGA 1MA9B 4CHOA 4CJLA 2GV9A 4JLHA 3D45A 4BE7B 4CJEA 3CC4N 1YITN 4GY2B 3SNNA 3CJAA 4IOCL 2KFZA 2ZJQL 1RTIA 5JLFA 2P5GA 3MXJA 1NK5A 1NGDA 2DFEA 1J9AA 5ADXA 3ZSQA 3CXCM 4AQYK 4JK9A 1ZYQA 3K5LA 2E2PA 3IAYA 4CFCA 4GKJK 1JLAA 1QE1A 2HF3A 4C1NK 4CERA 4CJFA 2P51A 5BRDA 2VG7A 4MQ3A 1RBUA 4JEPA 5KI6A 3P4IA 1SQKA 3SBTA 1L3SA 2FXUA 1QVGM 3OYHA 3A5MC 3UB5A 2QWOA 2EHGA 5H1SQ 4CJWA 2QXLA 3HRGA 1QSYA 1S22A 1VSHA 4JK8A 2P9PA 3ID8A 3RSEB 2O4IA 3VPZA 4CEEA 3HT3A 4FM0A 4CECA 1WAFA 2B4JA 4YOXA 4XEIA 5M1OA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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 3M8R A;  4AH9 A;  3E01 A;  1OH7 A;  3G25 A;  1VQ4 N;  1K8K A;  1VK0 A;  4JI6 K;  3O3F A;  2F8T A;  4U7B A;  4CZM A;  4GV3 A;  4EZ6 A;  3HOT A;  3U3Y A;  4GNI A;  5JIC A;  1IH7 A;  3ZSV A;  2I7P A;  4FLU A;  1Q9X A;  2XRI A;  1I3A A;  1BO5 O;  2G8H A;  4KHY A;  3DRR A;  1LAV A;  4N76 A;  4FLZ A;  4ELU A;  2QK9 A;  3SUO A;  4MO5 A;  5HRS A;  4CJV A;  4YOT A;  1QSL A;  2Y1I A;  1HRH A;  4IG0 A;  1T3V A;  1DTT A;  3DI6 A;  4N56 A;  3QEI A;  1N33 K;  5FRN A;  1NK9 A;  1WBB A;  1QHA A;  3NGY A;  3VER A;  4Z4C A;  1X9M A;  1NGJ A;  3KVG A;  1TUU A;  3ZSO A;  1NGH A;  5GAD P;  1N34 K;  1OH5 A;  4E1J A;  1JLE A;  2VGM A;  5HRO A;  4B1X B;  4B8C A;  2ASO A;  2P9N B;  3CIP A;  1IKY A;  1Y97 A;  3DWL A;  3L3V A;  3L0Q A;  4IBN A;  3BEX A;  3V1R A;  2YHA A;  4DUY K;  1J54 A;  4B08 A;  4W5R A;  4BEC A;  3RMB A;  3KKR A;  4MO4 A;  3AO5 A;  1NK8 A;  3BGR A;  5E41 A;  4YHH K;  3MMV A;  1G99 A;  3BF1 A;  1NU0 A;  4YY3 K;  4J2D A;  4F9O A;  2A3Z A;  4CJ5 A;  2QEX N;  3O1W A; 
#chains in the Genus database with same CATH homology
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