1R0PA

Crystal structure of the tyrosine kinase domain of the hepatocyte growth factor receptor c-met in complex with the microbial alkaloid k-252a
Total Genus 97
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
97
sequence length
311
structure length
301
Chain Sequence
TVHIDLSALNPELVQAVQHVVIGPSSLIVHFNEVIGRGHFGCVYHGTLLDKIHCAVKSLNRITDIGEVSQFLTEGIIMKDFSHPNVLSLLGICLRSEGSPLVVLPYMKHGDLRNFIRNETHNPTVKDLIGFGLQVAKGMKFLASKKFVHRDLAARNCMLDEKFTVKVADFGLARDMYDKEFDSVHNKTGAKLPVKWMALESLQTQKFTTKSDVWSFGVLLWELMTRGAPPYPITVYLLQGRRLLQPEYCPDPLYEVMLKCWHPKAEMRPSFSELVSRISAIFSTFIGEHYVHVNATYVNVK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

molecule tags Transferase
molecule keywords Hepatocyte growth factor receptor
publication title Crystal structure of the tyrosine kinase domain of the hepatocyte growth factor receptor c-Met and its complex with the microbial alkaloid K-252a
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 97
structure length 301
sequence length 311
ec nomenclature ec 2.7.10.1: Receptor protein-tyrosine kinase.
pdb deposition date 2003-09-22

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07714 Pkinase_Tyr Protein tyrosine kinase
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.510.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Transferase(Phosphotransferase); domain 1 Transferase(Phosphotransferase) domain 1 1r0pA02
3.30.200.20 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Phosphorylase Kinase; domain 1 Phosphorylase Kinase; domain 1 1r0pA01
3F6XA 3CQWA 4HZSA 5CEKA 3HUBA 2X7OA 3R00A 3TZMA 1KOAA 2QCSA 2UZUE 2C3LA 3GVUA 4G31A 4AAAA 4H39A 5IQCA 4R7HA 4TWOA 2VWXA 4QMMA 3ORMA 4FV3A 1ZOHA 4O81A 3HV7A 2GNFA 5D12A 3UQCA 5I9VA 4BC6A 3TZ8A 4RFZA 3E8DA 3FXXA 5ETFA 4YC8A 3UYSA 5A4EA 3WF8A 3LXPA 2JLDA 3ET7A 4DT8A 5C27A 2VV9A 2ZAZA 4DC2A 3PTGA 1PHKA 3VBXA 4PMPA 3BE2A 1XH4A 1OKZA 1Y8YA 2WMXA 3OD6X 5AUUA 4W9XA 5HTBA 2BHEA 5EM5A 5HICA 5C4LA 5FG8A 3F3VA 4QTBA 1PMEA 2WKMA 4EH7A 4LGDA 3GC8A 2UW6A 3KXGA 4IM3A 5L3AA 4O82A 3OTUA 1OPLA 5CI6A 2F57A 4OBOA 2OJGA 2EWAA 3G0EA 4I6BA 2WNTA 4N4SA 3U6JA 4DEHA 2V5QA 2BRGA 4D9TA 4DEAA 5DIAA 4AGUA 4WNPA 3R7UA 2CGWA 2R3JA 2W5HA 3C4ZA 3ORXA 3GC7A 5E8WA 2ITUA 2C0TA 5HX6A 3ZSGA 5JGDA 2XEYA 5AR7A 5BUEA 4KSPA 3VN9A 4QMNA 4B0GA 3F5GA 4IACA 2PZIA 3DJ6A 3D7ZA 3OEZA 4FTNA 4IAZA 3R7VA 1W84A 2FVDA 1CTPE 5EI8A 4RVKA 1KE7A 2XA4A 3EN9A 4EH9A 3V51A 3D9VA 4BDIA 4AGDA 3VWAA 4A9SA 4TYGA 3UVRA 4O0RA 4E5AX 4PTCA 5HVJA 2XF0A 4CTCA 4ANLA 5CEIA 3LOKA 3QQGA 4U42A 4AOTA 4KSQA 4AW0A 4QP3A 2P33A 4JBQA 1KWPA 3CY2A 4O2PA 4WG4A 4UWYA 4EOIA 4IWDA 3SLSA 3QXPA 4GMYA 3LFFA 3MJ1A 3Q60A 1WBWA 1JSTA 3CJFA 3E88A 3UGCA 2J7TA 4D4YA 4HGSA 4EQMA 5B7VA 4JQ8A 4AACA 4XP2A 5GIPE 1RJBA 5ANOA 3QZHA 2IW6A 1IA9A 3GB2A 4PL4A 1ZARA 4BF2A 4FTCA 4FL2A 3BU5A 5FGKA 3DTCA 4W4VA 5FWKK 4ZLZA 5M4CA 1JBPE 4W8EA 3VULA 4FGRA 2R7IA 4E20A 4V0GB 2B9IA 4K0YA 4Y85A 2A0CX 4Q2AA 4EOLA 2I0VA 2UZWE 4BR3A 2C1AA 3GBZA 5AR2A 4C3PA 4KIPA 5IISA 4O22A 4ZTMA 5EOLA 4CFMA 3EQIA 3EQCA 3KA0A 2GNJA 4BWXA 4CCBA 4EOJA 3O8UA 4S30A 3F9NA 2FGIA 2UVZA 2ZDTA 4A9RA 4C57A 4NM7A 2G9XA 2G15A 1ZY5A 4KWPA 3MFSA 3EKKA 4EWHA 3KRJA 3JXWA 3OBGA 1GOLA 4Q9SA 4L44A 4ITJA 3TZ7A 3GP0A 2AC5A 3GC0A 3I81A 1CKPA 3TZ9A 5A3XA 3QD2B 4QMTA 2XYUA 4AWIA 5I9ZA 1M7NA 3P0MA 4YHFA 3UODA 4I5CA 3O17A 4YZDA 3P5KA 3UO6A 4QP6A 2CN5A 4ONAA 2HW6A 2O0UA 4HPTE 3LHJA 4M12A 3ZH8A 4AT5A 3FQHA 2W1CA 1MUOA 2XIRA 3MW1A 4TNBA 4JNWA 4BCGA 2GNHA 4OBPA 3PRIA 3PWYA 3BBWA 1H1SA 2VNWA 3W55A 4TWCA 3R8ZA 4RFYA 5T6KA 4MBIA 4OGRA 4CQGA 1O9UA 3MIAA 4RJ7A 2FB8A 4X2JA 5FQDC 4H05A 4BY9E 1DAYA 2GTNA 2GTMA 3NUAA 5AUTA 4JDKA 2WXVA 4RZWA 3PA3A 5AWMA 4DFLA 4UMRA 5KE0A 3R1YA 3CSVA 4PPAA 3V6RA 3ZBFA 5CQWA 3S1HA 1KUTA 5I4NA 2C6MA 4I0TA 4ZMEA 2I0YA 3LFBA 3FMMA 1JVPP 5DFPA 4DCEA 1M2QA 2OF2A 4Z16A 4UZDA 5DGZA 2IO6A 3WYYA 5KCVA 3MH3A 2GQSA 4O2ZA 3BQRA 5IZFA 3AT3A 2ITYA 3W2QA 5EDRA 3V04A 5ANEA 3BU3A 3OC1A 3VS6A 4IANA 4QMWA 3EN5A 1UV5A 4GFMA 3RTPA 4M97A 4QMLA 5CZIA 4Y83A 5I5ZA 5IA4A 5LVOA 2GNLA 5HO8A 4I21A 2ZM3A 5CT7A 4JAIA 1G5SA 1YQJA 4RMZA 2HYYA 3HUCA 2QOBA 4D9UA 5IH4A 4I0RA 3UNZA 3O2MA 3FMJA 2RL5A 1NT2A 4FKGA 4PNKA 5BYLA 4R3RA 3SHEA 3MY5A 3E8NA 5DRDA 4BCNA 2CNQA 2UZEA 3LLAA 4LV5A 3Q53A 4ACGA 3TUDA 5CF8A 4EJNA 4FEQA 2VU3A 3KVXA 3Q9XA 5JFSA 3LCDA 3NW7A 2ERZE 5CSHA 4L43A 2WHBA 4OLIA 2F4JA 4WOVA 5E92A 5BYYA 3E3BX 3OY1A 4JDHA 1U54A 2W1HA 2P0CA 1ZLTA 5KMJA 3G90X 4GJ2A 4K2RA 4B7TA 5AP4A 2J0KA 2PVMA 4JQEA 4TZRA 5ETIA 1JKKA 2RFEA 4DH3A 5DMZA 4TL0A 1G3NA 1JPAA 3NEWA 4RJ4A 2OLCA 4WUAA 3QTRA 4CCUA 5A14A 4V01A 3LCKA 5D11A 4YNEA 2CKPA 2YM6A 3PLSA 4FIHA 4LMNA 1OL5A 1S9JA 3BQCA 4U44A 5FTOA 4DFYA 2YM5A 4IM2A 4NJ3A 2RFDA 3NUNA 4XMOA 4B9DA 5FUTA 5BVOA 4TY1A 2VX1A 2UW4A 3MSSA 1YXTA 4AN2A 2J90A 3JVRA 4FL1A 3C4XA 4I6HA 3U6HA 4RIXA 4RA5A 4XP3A 3FKLA 4FF8A 3ZTXA 4BCMA 1ZZ2A 1YHSA 5K3YA 3OOMA 3F82A 4AA5A 3IO7A 1WAKA 2FYSA 2FUMA 5J9YA 4UX9A 1SVGA 2WFYA 2GNIA 4RX8A 5F20A 3NUXA 3FZOA 1P5EA 3RGFA 3TXOA 4OTIA 4QMYA 4XG6A 5HNIX 4XOZA 4DH8A 1K2PA 2R9SA 2JBPA 4LRMA 2X9FA 5FXQA 4ZJVA 3CGOA 4C7TA 5L6PA 1FGIA 4DEEA 2UW3A 4AZFA 1ZZLA 2VD5A 4QPMA 2GHLA 1UNGA 4IAYA 3AC3A 4M84A 3FMEA 1PXMA 3FDNA 3FI8A 2WELA 2WTCA 4HVSA 2BCJA 3I1AA 4K77A 4EI4A 5L2QA 4RJ8A 1KV2A 4WNOA 3ROCA 4EK8A 3O7LD 1XHAA 2WOTA 4Q9ZA 2QLQA 5HE0A 5KMKA 3FLNC 3RCJA 3SXRA 4MXZA 3BHHA 4YLLA 4FEUA 4FKSA 4OTRA 2QO2A 5AR3A 1P2AA 1GJOA 1QL6A 1WZYA 3AMBA 4RQVA 5CU2A 2FH9A 5T3QA 3S2PA 3FHRA 5CANA 3C50A 4EQUA 1Q99A 5KBQA 3ZHPC 5FLFA 3HLLA 5JFXA 3R9HA 4RQKA 1H0WA 1ZYDA 4WBBB 4USFA 2AUHA 4FSYA 3EHAA 3OXIA 4DFZE 5KKRB 4V05A 3QD3A 1Q24A 4JIKA 3ORPA 3ZCLA 5JQ5A 1UU7A 3BRBA 4XG9A 1AD5A 4TTHB 4FKVA 3BELA 4UEUA 3DAEA 4ZSAA 4DH1A 5AIKA 2DUVA 3UC4A 4BICA 3K5VA 5I9XA 2BKKA 1GNGA 4PMSA 1ZYLA 3O0GA 4AXAA 2VWUA 1OB3A 1PKGA 1ZYSA 2EXEA 4AZEA 1P4FA 1WVYA 2BZHB 1MRUA 2R3IA 2OKRA 1I09A 1XJDA 3WE8A 4TPTA 3HNGA 2A4LA 4GFGA 4I0SA 3Q5ZA 4GK2A 2C47A 2QOCA 1YWVA 1WMKA 2JKMA 4QQ5A 3PXZA 4BI1A 2AC3A 4QMPA 5CZHA 5E7RA 2QOHA 5EW9A 3TM0A 5TO8A 4BDCA 1MP8A 3RM6A 3RPYA 5IMEA 4IHPA 2PSQA 3B2TA 1J91A 1G8AA 5CLPA 3IOPA 4HNFA 3V5WA 4L42A 4NTSA 2YA9A 3D83A 5I9WA 3VUMA 3PFQA 2WTVA 3IPHA 4QYGA 4WA9A 1U5RA 3QC9A 5DBXA 3DAJA 1VJYA 4A7CA 1Q4LA 3LXKA 2QI8A 4L7FA 1Z57A 2W1IA 2XM9A 3AC2A 4WRSA 5AFVA 1R1WA 4CLIA 3F5UA 1LR4A 3C0IA 4FNWA 5G1XA 4GG5A 5DN3A 4IB1A 4ZK5A 3P9JA 4XLIA 3WOWA 3ZUTA 4QOXA 3P7BA 3D5WA 3ID6C 4DFXE 4C38A 5GJDA 5F1ZA 3HMIA 4GKIA 4EH8A 2PULA 3QRIA 2C3JA 5ITAA 5AR8A 3GCSA 4DEBA 4CZTA 4EUTA 4CKJA 4DTAA 3HEGA 2BRMA 3QYZA 1Q97A 2CGXA 3LJ1A 5AUWA 4XV1A 4A9YA 4F99A 2X7FA 4F1OA 1YW2A 1MQ4A 4YC6A 1IA8A 1OUYA 3ZM9A 3H9RA 4DINA 5A46A 3PVUA 4G3FA 3H10A 4BDDA 3CQUA 1UU9A 3EYGA 3Q6WA 4L3LA 4TW9A 5ACBC 1W7HA 2XRUA 3VHKA 4QNYA 1ATPE 1J3HA 3FHIA 4NH1A 4M68A 4O7WA 3F7WA 4FBXA 4M8TA 4EHZA 3WZKA 5DOSA 4BKYA 4E7WA 2F7EE 1CM8A 4TYHB 4DH5A 4CG9A 1W8CA 2VTPA 4NEUA 1YXSA 3QAME 1XH8A 1YWNA 3FKOA 3II5A 1XH7A 2Q0BA 4IVAA 4BN1A 3VBWA 4LUDA 3IOKA 2HK5A 5J1WA 3FKNA 1X8BA 3MPMA 3UOKA 3Q6UA 2HXLA 5AP7A 4YSJA 4F1MA 5C4KA 2CHLA 2A19B 3L8SA 5LWNA 3ORLA 4ITIA 2VWWA 4UXLA 2WMAA 2XIXA 2JDOA 2Z60A 5AP0A 3ATTA 4ERKA 4XLVA 4PDPA 4FSNA 5K4IA 3K2LA 1ZMVA 2KTYA 2R3GA 3P4KA 3KXNA 5K0KA 4O7SA 3BLHA 4J8MA 3LLTA 2QONA 2UW7A 4LOPA 4MNEB 2J2IB 2XK6A 4BBFA 4EZ7A 3ZLSA 3EKNA 5E4HA 1Y57A 2VUWA 2WMUA 4UWBA 2YZLA 3JUHA 5J1VA 2WTDA 3FMLA 3MJ2A 4FI1A 1XBBA 3KXXA 3MPAA 3QU0A 5AR5A 3E3PA 2IW8A 2CLQA 4GYGA 2FSLX 3EFKA 4X2KA 3TT0A 2C6DA 2BTRA 4BB4A 4AZTA 3NNUA 1BLXA 4FVQA 4IZYA 5FDPA 5I3RA 1FQ1B 3FJQE 4C61A 2YCQA 3UO5A 4JBVA 2ERKA 4OTQA 4ZTRA 4TYJA 2J0IA 4KKEA 3BV2A 2YM8A 3R71A 4BZDA 4R78A 2QHMA 4A9UA 3R28A 2UZOA 3I7CA 3MTLA 4LGGA 1LUFA 4QP7A 3U9NA 4KB8A 3ZO3A 3FSKA 4E6DA 2UV2A 3BV3A 2BDWA 4M14A 4PPCA 4XBRA 5LCJA 5AV2A 1HOWA 2JD5A 4LRKA 3RMFA 2HCKA 3G51A 4XBUA 3RPOA 2EVAA 2PMNX 4RSSA 2J51A 4JXFA 1Y6AA 2JIIA 4W4WA 3NYXA 5IEXA 3EMGA 4MF0A 4O0UA 1GIHA 3ZRKA 3F3ZA 3QHWA 4C34A 4F7SA 2WU7A 2Y9QA 3MFUA 2XCKA 2VWVA 5AP6A 2BUJA 4G2FA 4DG0E 2B7AA 5CF4A 3N4VA 4G3CA 1H4LA 1S9IA 3FLYA 3MY1A 2GCDA 2H96A 5BVDA 4FTJA 1YOJA 2ZV9A 2WMTA 4DBNA 1PXNA 1PXLA 4OTPA 4O83A 1DM2A 2XJ0A 4FKOA 4MTAA 4YJNA 1Y6BA 4G6OA 4CZYB 3QQHA 3PXKA 3TV7A 4IZ7A 3HVCA 3M11A 4PL5A 5AV0A 3HMOA 3V8TA 4RVTA 5JMSA 2F7XE 3NLBA 3ZMMA 2EXMA 2VTMA 5D10A 4F6WA 1XBAA 5B2MA 5BMMA 3IW5A 4OTHA 5J8IA 4PWNA 4FV7A 4ZSJA 2WMSA 4BDKA 5AUVA 5CEOA 3GU4A 3OP5A 2O65A 2BKZA 3HYHA 3B8QA 1YDRE 4LYNA 1GIJA 5K0XA 3E63A 1APME 2B55A 3C4CA 2PK9A 4FICA 5BVKA 3NGAA 3R9NA 4AE6A 5EKOA 3PIYA 4MAOA 5IQHA 1CKIA 5GINE 5HG8A 1OPJA 3PXFA 4KBCA 2ETRA 3JY9A 3OY3A 3W8QA 3PVWA 3OFMA 5EHYA 2PZPA 3QWKA 4C02A 4ZXTA 4F6SA 4IFCA 3KU2A 4UMQA 3ZEWA 3QKKA 2W4OA 2YFXA 3CR0A 3DNEA 4YO6A 3R9OA 2C68A 3LZBA 4QYYA 2OG8A 2IPXA 3IDBA 3MB6A 4J1RA 4FMQA 3EB0A 4RWJA 2GDOA 4FIFA 3BGQA 3FMNA 4G6LA 1XWSA 4AFEA 5BNJA 3KCKA 4L53A 2PTKA 3RPRA 3TL8A 2QLUA 1YVJA 4ANQA 2OU7A 3DTWA 4AE9A 4MD9E 2W9ZB 3NW5A 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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