The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
56
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sequence length |
146
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structure length |
146
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Chain Sequence |
VHLTPEEKSAVTALWGKVNVDEVGGEALGRLLVVYPWTQRFFESFGDLSTPDAVMGNPKVKAHGKKVLGAFSDGLAHLDNLKGTFATLSELHCDKLHVDPENFRLLGNVLVCVLAHHFGKEFTPPVQAAYQKVVAGVANALAHKYH
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin alpha chain
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| publication title |
Characterization of hemoglobin bassett (alpha94Asp-->Ala), a variant with very low oxygen affinity
pubmed doi rcsb |
| total genus |
56
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| structure length |
146
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| sequence length |
146
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| chains with identical sequence |
D
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-09-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| B | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 4X0L A; 2VEE A; 1ABW A; 5ILR A; 3ZJL A; 2W72 C; 4MQC A; 1VXB A; 110M A; 2VYZ A; 3G4W A; 3PEL B; 1Y8W B; 1Y35 A; 3UH3 A; 2V1H A; 1J7W A; 4MQG A; 1DO3 A; 1Y2Z B; 1CLS A; 1MNJ A; 4F4O A; 2HBC B; 1C7C B; 1OUT A; 3UHH A; 3RGK A; 2EKU A; 3PI9 B; 1S0H B; 1B86 B; 1LJW B; 1F5P A; 2LH3 A; 1LH5 A; 3TM3 A; 2YRS A; 1C7D A; 4G1V A; 1LFT A; 1O1K A; 1A3N B; 1D8U A; 1RQA A; 1Y85 A; 2PEG B; 1MLU A; 3A5G A; 3G4R A; 1IDR A; 4N7N A; 3NG6 A; 4QAU A; 1Y45 B; 1FN3 A; 1FCS A; 1HGA B; 4N8T A; 5ILP A; 1V4U B; 1HGB A; 1DXV A; 3GKV A; 1NS6 B; 5HBI A; 2WTG A; 1X3K A; 1YFF B; 2D2N A; 1R1X A; 2DXM A; 3BCQ A; 1YH9 A; 1G09 B; 1MLG A; 2GRZ A; 2HCO B; 3WFX A; 2V1K A; 4N7P A; 1O1J B; 2MGJ A; 1GJN A; 2LH1 A; 2HHB A; 3UHN A; 1G9V B; 3WCT A; 1MCY A; 2QSP A; 5AZQ A; 5E6E B; 3DUT A; 1BZ0 B; 1V4W B; 2LH5 A; 1IRD A; 3D4X A; 3PT8 A; 5E29 B; 1LFZ A; 1J3Z B; 2ZS0 A; 1FAW A; 1MKO B; 2LH6 A; 2ZFB B; 3BJ2 A; 4FC3 A; 3EOK B; 3IC0 B; 5EV5 A; 3WCW A; 5KDQ A; 1YOH A; 4ROL B; 3ZJO A; 3K9Z A; 5C6Y A; 4AVE A; 1MNH A; 2KSC A; 4MBN A; 1MLS A; 2M6Z A; 4MU5 A; 2QSS B; 2ZLV B; 1N9I A; 1MWD A; 3HF4 A; 3G4Y A; 1G0A A; 1Y7G B; 1YGD A; 5EYJ A; 1YEV A; 3FH9 A; 3WHM A; 3QM7 A; 1IT2 A; 2O5M X; 2ZLX A; 2O5L X; 1MOB A; 1G08 A; 2XKI A; 2ZFO D; 1Y46 A; 1QPW B; 2R4W A; 3HXN A; 1JDO A; 1RSE A; 2ZSR A; 2Z6N B; 1HAB B; 2VEB A; 3CIU B; 1J7Y A; 3D1A B; 1ECN A; 1YVT B; 4H07 A; 2O5B X; 1HGC B; 1LUE A; 2JHO A; 1HHO B; 1V75 A; 5EU2 A; 5AB8 A; 1AJH A; 1OFK A; 1CO8 A; 2Z6T A; 1YIH B; 1C7B A; 1VRF A; 1Y4R B; 3WCP A; 1S5Y B; 3K3U A; 3ZJN A; 4IRO A; 1UX9 A; 1HBR B; 2QFN A; 2OH8 A; 4ROM B; 2V1E A; 2HZ2 A; 6HBI A; 3FS4 B; 1QXD B; 4O1T A; 1Y0T A; 3QM6 A; 3UGY A; 5SW7 B; 1VWT B; 3HRW A; 3EDB A; 3S65 A; 5CMV A; 1YIE A; 1Y22 A; 2OH9 A; 3M38 A; 3PIA A; 1YOI A; 3A2G A; 2BK9 A; 1BZZ A; 3S48 C; 1UFJ A; 1JPB A; 1XYE B; 2BNL A; 2ZFO C; 3UHG A; 5HLQ A; 1LFV A; 2MGH A; 1XZ7 A; 1QI8 B; 5CHQ A; 1I3E A; 2ZLW A; 1ITH A; 1H1X A; 2VM0 A; 3DHT B; 1Y8W A; 1HBI A; 1K1K A; 2DHB B; 2MHB A; 2GNW A; 3WR1 A; 4XS0 B; 1Y2Z A; 1NAZ A; 2WTH A; 2ZSY A; 1C7C A; 2SPN A; 5CNE A; 1Y7C B; 2G0Z A; 1Y01 B; 3PI9 A; 1AJ9 B; 2O58 X; 1LJW A; 1SPG B; 3QJC B; 1MTI A; 3LR7 A; 1GCV B; 4MQH B; 3UHR A; 2PEG A; 2R4Y A; 4KJT A; 1LFL B; 5EOH A; 5JDO F; 2O5O X; 4HHB A; 1Y45 A; 1HCO B; 3M3B A; 1O1L B; 1QSI A; 3LB2 A; 3PI1 A; 4ESA A; 3SZK A; 3MN0 A; 3GQG B; 4MQK A; 1YFF A; 2EVP A; 1Q1F A; 3MYM A; 1COH B; 101M A; 1A01 A; 2RAO B; 3TM9 A; 1Y0D B; 3UHQ A; 3ORD A; 1XZ5 A; 1G9V A; 2WY4 A; 1OUU B; 3OK5 A; 2O5S X; 1MBS A; 1A6M A; 1HDB B; 1RQ4 A; 5E6E A; 1ECA A; 3ZJJ A; 1YCB A; 2OHA A; 3ZJR A; 1A00 B; 2HBD B; 1NZ5 A; 2ZFB A; 1OBM A; 2R80 B; 1RPS B; 3EOK A; 3IC0 A; 2AV0 A; 3KUN A; 4XDI A; 1K0Y B; 1LH7 A; 3EU1 B; 1GBU A; 2NRM A; 3EDA A; 3UHD A; 2W72 B; 1R1Y A; 1NGK A; 1YE0 A; 1VRE A; 1YEO B; 2ZSQ A; 2ZLV A; 2PGH B; 1NEJ B; 3O89 A; 2D60 B; 1MBO A; 3UGZ A; 2D5Z A; 3MJU A; 4OOD A; 1JL7 A; 3UHX A; 3M39 A; 1BUW B; 4N7O B; 5HLU A; 111M A; 1Y8K A; 1CQX A; 2EB9 A; 5JGG A; 1LFY B; 1UVY A; 1HBG A; 1KR7 A; 2D2N D; 2FAM A; 5CNF A; 2D5X A; 5MBA A; 1J7S B; 4UZV A; 3AT5 B; 4NXA A; 1QPW A; 3NFE B; 2VYW A; 1MNI A; 1DO7 A; 1YHE B; 2MGA A; 3OVU C; 2EB8 A; 3CIU A; 1YEN B; 3ECZ A; 1IBE B; 4H0B A; 1DTI A; 3KMF C; 1J40 B; 1GLI B; 1YVT A; 3ODQ B; 5EYS A; 3G4V A; 1MYF A; 1X9F A; 1YOG A; 1DO4 A; 1NZ3 A; 1Y5K B; 1U7S A; 1DWS A; 2EF2 A; 1O1M A; 1A9W E; 1LH6 A; 1YIH A; 2NX0 A; 4F6B A; 2HHE A; 2HBG A; 1SHR B; 4JAC A; 1S5Y A; 1GVH A; 105M A; 4KMV A; 1Y5F A; 3IXF A; 1CH1 A; 1A6G A; 3WCW D; 4NI1 B; 1HBR A; 1LFQ B; 2ZWJ A; 5B84 A; 1NIH B; 4ROM A; 2QLS A; 1CH2 A; 2XKH A; 3LB1 A; 2ZS1 B; 3ASE A; 5SW7 A; 1VWT A; 1V07 A; 1C40 A; 4MQJ B; 1Y4Q A; 5CN5 A; 3ZJQ A; 4M4A B; 5EQM A; 5EE4 D; 2ZLT B; 1N9F A; 5E83 A; 1AZI A; 1MBA A; 1GZX A; 1XYE A; 2W6V A; 3MOU A; 4ILZ A; 3AG0 A; 2FRI X; 3GYS B; 3PT7 B; 3AQ8 A; 2HZ1 A; 1HSY A; 2MYE A; 4F6J A; 1V9Q A; 5C6E B; 3AQ6 A; 1BAB A; 2E2Y A; 1Y83 B; 1MWC A; 108M A; 4YU3 A; 4MQI B; 3UHU A; 1EBC A; 1S56 A; 2MYC A; 1EW6 A; 3D7O B; 2DHB A; 3TLD A; 1FSL A; 1VXH A; 4XS0 A; 1S61 A; 3DR9 A; 2ZS1 D; 1Y7C A; 2IN4 A; 1YEU A; 1MOH A; 103M A; 2DC3 A; 3PI4 A; 3WCW C; 2ZSO A; 1N9H A; 1DWT A; 2DN2 A; 2W31 A; 3WTG B; 1GDL A; 1QXE B; 2V1G A; 3PI2 A; 3MVC A; 1NS9 B; 1FSX B; 1LFL A; 2B7H B; 1CP0 A; 1MLH A; 1SPE A; 1YE2 B; 4U8U D; 2Z8A A; 1GCW B; 5EE4 C; 1Y4G A; 102M A; 2ZSX A; 1SDL B; 1HBH A; 2GRF A; 3UH6 A; 2HBF B; 3PI8 B; 3LB4 A; 1Y0W B; 3GQG A; 1PBX B; 1T1N B; 4H2L A; 1SDK A; 3GLN A; 3G53 A; 2BKM A; 3VHB A; 1Y0D A; 4LPI A; 106M A; 1EBT A; 1MYH A; 1I3D A; 2H8D A; 3VRE B; 3MJP B; 4G1B A; 1JP6 A; 3SDN A; 3OZV A; 1GDK A; 1LA6 B; 1JZM A; 5CN6 A; 2ZS1 C; 1ECO A; 1ABS A; 1MLK A; 3P5Q B; 2BWH A; 1G0B A; 1XCH A; 2MYA A; 2HBD A; 1ASH A; 1YG5 A; 1OR4 A; 3AQ9 A; 2MB5 A; 2ZFO B; 3GQR B; 4G51 A; 1JP9 A; 2FAL A; 1YHU B; 5F0B A; 3UHK A; 1K0Y A; 1VXD A; 4U8U C; 5JDO D; 1XXT A; 1XZ4 A; 3HYU A; 1XZ2 B; 1Y0A B; 1SI4 A; 2R1H B; 2G3H A; 2W72 A; 1O1O A; 1RQ3 B; 3NML A; 1YZI B; 2SPL A; 2PGH A; 1NEJ A; 2D60 A; 3ZOL A; 1UFP A; 3A0G B; 1VXE A; 1A0Z B; 2GL3 A; 1FLP A; 3W4U B; 1N9X A; 1X46 A; 1IT3 A; 3E55 A; 4MXL A; 1XQ5 B; 1BUW A; 1CH3 A; 3R5I B; 3VAU A; 1MYI A; 2ZSN A; 1NWI A; 1CBL A; 3ARK A; 4F6I A; 1A4F B; 3UHW A; 1J7S A; 1RVW B; 2VHB A; 1YVQ A; 4DC7 A; 1Y4B B; 1Y31 A; 2ZT3 A; 3NFE A; 3S1I A; 4C0N A; 3QJD B; 3H57 A; 2OLP A; 2DN3 A; 2G10 A; 3OO5 A; 3VRG B; 2RI4 B; 1O1I B; 3WCV D; 2GKM A; 1YHU D; 1J41 B; 2C0K A; 3ODQ A; 1GLI A; 1J40 A; 1S6A A; 3V2V A; 1O1P A; 2HHD A; 1HV4 A; 1Y7Z A; 1F65 A; 3K8B B; 1BJE A; 1GBV B; 5JDO C; 5D1V A; 5D5R A; 2MGF A; 1JEB A; 1HDS A; 2QU0 A; 5CN8 A; 5KER A; 4TWV A; 1BBB A; 1MLN A; 5M3S A; 1OJ6 A; 2MGD A; 1CPW A; 3D1K B; 1MWB A; 4HRT B; 4O35 A; 2D2M B; 1HBA B; 1JZK A; 4YU4 B; 1NXF A; 1CIK A; 3WCU D; 5F2A A; 4C44 A; 3QM8 A; 1FHJ B; 5EUI A; 4FWZ A; 3ONZ B; 4MQJ A; 1O16 A; 4M4A A; 1CQ2 A; 3IC2 B; 3BJ3 B; 4ODC B; 3V2Z A; 1A0U B; 1OR6 A; 4TYX A; 3GYS A; 1RTX A; 2ZT1 A; 7HBI A; 5CHR A; 3HHB B; 1MYG A; 1VXC A; 3R0G A; 3WCV C; 1YHU C; 1URY A; 4F6G A; 5HLX A; 4O4Z A; 2VLX A; 4NI0 B; 1Y83 A; 1HBB B; 2W6W A; 2W6X A; 1IOP A; 1XY0 B; 1HRM A; 1Y8I B; 1BZ1 B; 3PEL A; 2MYD A; 2D2M D; 2FRJ X; 4PQB A; 4L2M A; 2ZLU B; 2AUO A; 2G0R A; 5CN7 A; 1WVP A; 1JY7 B; 1Y4P B; 1HBS B; 1MOA A; 1YGF B; 1V4X B; 4WJG A; 2HBC A; 1VXF A; 3UBV A; 4ZVA A; 4X0L B; 3WCU C; 1ABW B; 1NS9 A; 1S0H A; 1B86 A; 1DM1 A; 2B7H A; 4MQC B; 3AT6 B; 1MYJ A; 1DKE B; 3UHI A; 3H58 A; 5KKK A; 4ZVB A; 1YE2 A; 1DO1 A; 1A3O B; 4O4T A; 1GCW A; 1A3N A; 1Y35 B; 1M6M A; 1Y4F B; 1J7W B; 2BLJ M; 3G4U A; 3UHC A; 4MQG B; 2V1F A; 1BZP A; 2HBF A; 1CLS B; 1HGA A; 4NZI A; 3UHZ A; 4F4O B; 3PI8 A; 5HU6 B; 4BJA A; 1V4U A; 1OUT B; 1PBX A; 1HLB A; 1NS6 A; 2GNV A; 2GTL D; 2AUQ A; 2LH7 A; 1MLM A; 2YRS B; 1C7D B; 3E4N A; 1LFT B; 2HBE B; 4HSW A; 1G09 A; 1Y85 B; 3MJP A; 1A6N A; 2HCO A; 3NG6 B; 1O1J A; 1LA6 A; 1FN3 B; 2D2M C; 104M A; 1HAC B; 4N8T B; 1Y8H B; 1HGB B; 2VYY A; 1DXV B; 3GKV B; 3A59 B; 1NZ4 A; 3ARL A; 3ZOM A; 2SPO A; 1MBD A; 5MBN A; 2D2N B; 3WFT A; 4WCH D; 3BA2 A; 1R1X B; 1BZ0 A; 3GQR A; 2VLY A; 1V4W A; 2Z6S A; 1MYZ A; 3UH5 A; 5E29 A; 2BW9 M; 1J3Z A; 2V1J A; 2H8F B; 1UIW B; 1MKO A; 1MNK A; 3E5I A; 4F69 A; 2O5Q X; 2HHB B; 3A5B A; 3ECX A; 4DWU A; 1CG8 B; 1MDN A; 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2NRL A; 1J3F A; 1LH2 A; 1QI8 A; 1UMO A; 3VRF B; 4U8U B; 4NK2 A; 3QMA A; 2QRW A; 4NI0 A; 3MYN A; 1F63 A; 1Y0T B; 3WCT C; 2EKT A; 3HRW B; 3S65 B; 1XY0 A; 4SDH A; 1BZ1 A; 1J52 A; 1Y22 B; 2AA1 B; 3DHT A; 1BZZ B; 1Y4V B; 3UI0 A; 2NSR A; 2G14 A; 2VLZ A; 3UH7 A; 1Y4P A; 1HBS A; 3B75 B; 3ZJS A; 1KD2 B; 2ZS0 C; 4B3W A; 1V4X A; 3NL7 B; 3KUO A; 2ZLW B; 1DWR A; 1AJ9 A; 1BIJ B; 3M3A A; 3AT6 A; 1DKE A; 1SPG A; 1CG5 B; 3QJC A; 3GKT A; 1A3O A; 2HBS B; 1Y4F A; 1Y7D B; 1GCV A; 4MQH A; 3GQP B; 1K1K B; 1PMB A; 2LHB A; 2MHB B; 3KMF A; 3WR1 B; 1DUO A; 1MOC A; 5HU6 A; 2V1I A; 1HCO A; 1O1L A; 3BJ1 B; 2BLI A; 1ABY B; 1Y5J B; 2HBE A; 2MGE A; 2XKG A; 2G0S A; 2MBW A; 1COH A; 4KMW A; 2RAO A; 3AQ7 A; 1MLQ A; 4HHB B; 4HBI A; 1HAC A; 1Y8H A; 1JW8 A; 1LHS A; 1QSI B; 3A59 A; 1HDA B; 1OUU A; 4ESA B; 3SZK B; 2GDM A; 1HDB A; 4MQK B; 4L7Y B; 1A01 B; 1BZ6 A; 1A00 A; 3WFU A; 2H8F A; 1AJG A; 3G52 A; 1UIW A; 1DTM A; 1XZU B; 3LQD B; 1SWM A; 3HEO A; 2R80 A; 1CG8 A; 1RPS A; 1XZ5 B; 3WCV B; 2D6C A; 2ZSS A; 4HRR A; 3QZZ A; 1BVC A; 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