1R30A

The crystal structure of biotin synthase, an s-adenosylmethionine-dependent radical enzyme
Total Genus 102
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
102
sequence length
312
structure length
312
Chain Sequence
RPRWTLSQVTELFEKPLLDLLFEAQQVHRQHFDPRQVQVSTLLSIKTGACPEDCKYCPQSSRYKTGLEAERLMEVEQVLESARKAKAAGSTRFCMGAAWKNPHERDMPYLEQMVQGVKAMGLEACMTLGTLSESQAQRLANAGLDYYNHNLDTSPEFYGNIITTRTYQERLDTLEKVRDAGIKVCSGGIVGLGETVKDRAGLLLQLANLPTPPESVPINMLVKVKGTPLADNDDVDAFDFIRTIAVARIMMPTSYVRLSAGREQMNEQTQAMCFMAGANSIFYGCKLLTTPNPEEDKDLQLFRKLGLNPQQT
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of biotin synthase, an S-adenosylmethionine-dependent radical enzyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Biotin synthase
molecule tags Transferase
source organism Escherichia coli
total genus 102
structure length 312
sequence length 312
chains with identical sequence B
ec nomenclature ec 2.8.1.6: Biotin synthase.
pdb deposition date 2003-09-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04055 Radical_SAM Radical SAM superfamily
A PF06968 BATS Biotin and Thiamin Synthesis associated domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.70 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Aldolase class I 1r30A00
1YTKA 2Y7DA 1I2PA 3LBMA 1W5OA 2QCGA 1ME8A 3UPWA 3LI0A 4OV4A 1QCWA 1XDLA 1K7FA 2VFDA 1C9DA 1PS9A 3UWQA 2OZ0A 1LORA 3PY2A 1H7NA 2VEMA 2FFCA 1SFJA 3H53A 1HFBA 5FI8A 1W5QA 2X2GA 4YCPA 3GR8A 4UFKA 3EX3A 4A2RA 5F1VA 3IRDA 3UWVA 2Y88A 3DXIA 4AXKA 4MY8A 2FQIA 5CPNA 3M5XA 2E6YA 3L5MA 1XBYA 2QCDB 5U7SA 1QO2A 4MFDA 4OGZA 4AWUA 3LCIA 5KINA 4IGHA 2GVGA 1WQ5A 2QCEA 4UMAA 1O94A 5CGQA 1SW0A 3DI1A 2FB2A 4EOUA 4I7UA 2BLEA 3QMTA 3TSBA 1F6KA 3W1MA 1Q6LA 5AC7A 5DXXA 4QITA 1TPWA 3IVTA 4IXXA 2LLEA 2PC4A 3KRSA 1ONRA 4UMBA 3WJZA 3P80A 1QNVA 1K8XA 2WSYA 5CG7A 3VFLA 1D3GA 3LXAA 3EEGA 3FS2A 2G96A 1LRQA 3W1AA 2GJNA 4M5PA 2Z1BA 2Y61A 5AHIA 4MY9A 2QCFA 5C55A 2J88A 1KFKA 5HMSA 4QSHA 1O60A 1TYGA 5FF2A 3W1TA 1BEUA 1V5XA 3F4NA 4C1KA 2BSLA 5I3FA 1ICSA 3B8DA 3N3MA 5BW6A 1KA9F 1XBVA 5LHEA 3HJZA 2ZA3A 3PWAA 4LWWA 4O17A 1MSSA 4GWEA 2ZZ2A 2Z6IA 4E38A 1IIHA 3HG3A 1KM1A 2HS6A 4XZ9A 5DN1A 3BGGA 3W7KA 4E2DA 1W5NA 1KLYA 2E68A 3VI2A 3LOTA 3TAKA 4MZ1A 5FEZA 5AB3A 3KVLA 4JD4A 2P0OA 1EEPA 2QF7A 1OX5A 2Z2UA 3NZRA 1O5KA 4N9CA 3TIMA 2A6LA 1WA3A 1H7OA 3NXFA 3N34A 3PSWA 1GVSA 2JKAA 5G2IA 3U6WA 2YW3A 4PEKA 4O57A 4JTLA 3DKLA 2I14A 2QJHA 5DELA 2WOQA 1JR1A 4GE8A 1NSJA 5FEWA 2GQAA 4JEQA 3LB0A 3RU6A 4LVAA 3C2FA 5EPDA 3TE9A 2TPSA 3P61A 3W9ZA 3T40A 5I3HA 1JCNA 2Y89A 4O4VA 2J9YA 3HO8A 4Q4KA 3NAVA 2R8WA 3W74A 4LUIA 4MYXA 1WOBA 1DORA 3A21A 3GKFA 3C3NA 1EUNA 3C6CA 3TQVA 4FX8A 2PRMA 3W7RA 1KM4A 5K3VA 5IBXA 1LLZA 3BW3A 2V2CA 2VFGA 3CWOX 2WJZA 4FNPA 4IMEA 4IOTA 4TMCA 3TKFA 5C6MA 4UTUA 4UTTA 1KM5A 4CLMA 3NNTA 1LLWA 1OJXA 1KFEA 3S42A 3LTSA 3UWWA 1F73A 2YXGA 5K9DA 4S2BA 4U4MA 4RXFA 2EKCA 5AHMA 1QR7A 1Q45A 3N2XA 2E1DA 2GQ9A 3BG3A 3DHFA 3G24A 4N6EA 3C2VA 2C16A 4AHQA 2JK2A 1FCQA 1JCYA 1QFEA 1SO4A 4YCOA 1GVRA 3MMTA 5AN7A 5LHFA 4HNTA 5KZDA 2ISVA 5E93A 3EWZA 1I2RA 3LCXA 2Z0IA 2RDWA 1RQBA 2EHHA 4Z0SA 4BI7A 3GLCA 2YPIA 1F7BA 2J27A 3GDMA 3TFCA 3UWYA 2FLIA 2FJKA 3BVJA 3MP3A 1A5SA 2H90A 3W6YA 1K3UA 3G8EA 1XBZA 3K30A 1EP3A 3PUOA 2Q8ZA 3VE9A 3LRKA 3HB9A 1OHLA 5EYWA 5LNWA 2CLMA 3DFQA 3DFNA 3QSTA 5G4WA 1GYNA 3W7JA 4NNAA 2V0TA 5LZLA 1YXDA 2CWNA 3C2OA 4UFIA 2BXVA 4ZQPA 3W7GA 2ZTJA 3IIOA 2H8ZA 3I7SA 1ZAIA 3BW2A 1G4SA 4FNRA 3W83A 1ZY9A 1TTQA 1W8SA 4O53A 5G5IA 3I6RA 4JDBA 3UXAA 1XM3A 1PHWA 3S5YA 1BWKA 4JX4A 3SR7A 3U2OA 4DF1A 3PG8A 3W73A 1SO6A 2HS8A 1QPRA 4Q33A 2NUXA 4JYFA 5J5RA 1DBTA 1AW1A 1G7UA 3S9YA 4IMFA 4WOZA 4RCXA 3DAQA 1OG0A 2ZFAA 3NZ1A 4EVZA 2QAPA 2ZZ5A 1ICQA 4NNCA 4GBUA 4XBKA 3GVGA 1M7PA 2QCDA 2BTMA 1A50A 1UJPA 4O16A 5C5YA 2RHGA 5EL1A 1KTBA 3EWXA 4CNOA 1KW1A 2V30A 3QPYA 1JVNA 1W54A 2FTPA 3G1AA 3P8JA 4A2SA 1YTDA 1I45A 3P62A 4PH6A 4X9SA 5D2XA 4A21A 5BMWA 1DHPA 4JR5A 1S3HA 2FIQA 1VCFA 4S1FA 3DHDA 1SFLA 1GJPA 2D73A 3N73A 5HJLA 2GQ8A 1GYLA 1GQNA 4XKYB 2ATSA 3G0UA 3STGA 4RZ4A 3FOKA 2RDTA 4BR1A 3W7PA 4ZMGA 3O1NA 4LVBA 4OWGA 1GPWA 3THQA 3DZ1A 1A5AA 3ABOA 3W07A 3S1XA 4JNMA 5FF7A 2JKEA 3BARA 2HMCA 4WJEA 4JICA 3LCFA 1R2TA 3M43A 3O6YX 3S1UA 3SJ3A 3S1WA 2B4GA 2BZNA 1I8JA 4N4QA 1TREA 3E0IA 2ZBTA 1MXSA 3SGZA 4ONVA 3G1XA 5AYYA 3STCA 4TU1A 1HUVA 1B9BA 2JBMA 2I1OA 2V2HA 1LM1A 2R91A 1LP6A 3PBWA 3ZFHA 3G18A 4O10A 5K4XA 3TQKA 1SO3A 1FQ0A 1P1XA 3CLMA 3W7DA 2ATMA 2QJIA 2GUUA 5L9FA 2Y6ZA 3QRHA 4QAIA 2C6QA 1L6SA 2A5HA 4U28A 5BMXA 4N6FA 5LNUA 4O1AA 5F2IA 3NQCA 5IBXC 4JYDA 4FIQA 4M7SA 3W88A 2DP3A 1AL8A 4BF9A 3IIXA 2ZZ7A 1H51A 3NQ8A 3TAOA 3P8IA 4FO4A 1SUXA 4GJ1A 3NDOA 2O7SA 3MI2A 2VENA 4WZHA 1NF7A 1H62A 3INPA 1VLWA 2A7RA 2J9ZA 3UY7A 2OCZA 3GK0A 2ZRVA 3P67A 1XUUA 1WV2A 1PCKA 4UFMA 2A6NA 2ABBA 2WQPA 3S6DA 4O1BA 2V2DA 3PC0A 4MLJA 3STFA 5IM51 2WNNA 4GUFA 4RXGA 3W2UA 4CNNA 1TB3A 4LV4A 2PCQA 4S2CA 4DEFA 2C19A 1I2OA 4RZ6A 1UUMA 3DFOA 1VR6A 1Q6QA 4UUIA 4TO8A 2NUWA 3GDLA 1GVQA 4JTHA 3TJLA 1W1ZA 3W85A 3NPUA 2E6AA 5D33A 1J5TA 1H50A 2C3ZA 2YR1A 4HNVA 3MO7A 2E6DA 2YX0A 5F4SA 4Z1AA 4FXRA 4K38A 5DCBA 1YLVA 4YMZA 3C56A 2CLIA 2GVLA 1XCFA 4AAJA 2NWSA 4WY0B 5LGXA 4XWUA 1K02A 4JTJA 3NA8A 3LDVA 5K7JA 5I3JA 1IXNA 5G2HA 5TQLA 1TV8A 1EP1A 3EXRA 1KM0A 4N9DA 2GOUA 3NQ6A 3QQ1A 3TFXA 3YPIA 5LGZA 4WQ6A 2RFGA 2V9DA 1HO4A 1QO5A 3CHVA 3MHGA 2YDAA 1AMKA 4ZQRA 5HWJA 2QAFA 1VS1A 2VELA 1FCBA 4UTJA 3FKRA 4UR8A 1OF6A 4RKAA 1M6JA 5D2TA 3BPWA 4KWWA 4JS3A 2B7PA 3SY5A 1ZCOA 5FESA 1TPDA 3RK8A 3HPZA 2NX9A 2TSYA 3BW4A 3BV4A 2JKPA 4X2RA 4Y6GA 3CPRA 4LVDA 1W37A 3EKLA 3W86A 4UTWA 4FEZA 3W7EA 1ICPA 3FIGA 1WOAA 1VYPX 5DBUA 3PS7A 4JTIA 3LERA 5CSSA 4GRSA 4DBEA 3E12A 1O95A 2TMDA 4CQ9A 4X3ZA 3HGJA 4HHPA 3PSVA 7TIMA 2ZRWA 4ALDA 3QF0A 1A5BA 4MKNA 5EMUA 3RLUA 1Z42A 2YGYA 1K7EA 1JCJA 3L2IA 3M5YA 4UTLA 3ABRA 1R2SA 1TPC1 1V7YA 3P5ZA 3B05A 3O63A 2F84A 2VEIA 5G2WA 4BI6A 4ZQOA 4WY0F 2X30A 2UV8G 3BGJA 4JTKA 4GUGA 5ABTA 4FNSA 4DELA 2DJXA 2Y62A 1KFBA 4XTIA 1QOPA 3W1UA 2VEPA 3S5OA 3W7CA 2QCCA 3QMSA 1ZAJA 3W1PA 2XN1A 5L6UA 1K8YA 5CSRA 1GVOA 1VCGA 3EWYA 3NQGA 5KZEA 3IIZA 3BG9A 3MBDA 1LOQA 3LCHA 2TRSA 1HO1A 2Z6JA 2OT1A 4QM1A 3T55A 1OFDA 3I65A 4QJ1A 1CX9A 2ZZ6A 5CKSA 4K37A 5D04C 1LOLA 3G3DA 2FPTA 2V5LA 1C29A 3PAJA 3GZ3A 4AB4A 4ADUA 2P10A 2OT0A 1GOXA 3W7LA 1KBIA 1G4EA 3PR2A 5KZMA 1KFJA 1RZMA 2QCMA 1J4EA 1VPXA 2PURA 4DO4A 3NR0A 3LLDA 4MIMA 3E96A 1B3OA 4OE7A 3M0ZA 2ZZ4A 3A22A 5EBUA 3QQ0A 2V8ZA 2ZA1A 4LUJA 1AL7A 2ZDRA 2CFFA 3Q2DA 4LS0A 1TTIA 3W87A 2CLLA 3QW3A 4N02A 3PM6A 1SR9A 1NEYA 4K39A 2C15A 4LTSA 1EX5A 3SZ8A 2CU0A 4JTGA 1H5YA 3O6DA 5D03A 3TNOA 3ABSA 4HPJA 3CIWA 3DI0A 4YWIA 5HUPA 2DZPA 1ZNNA 3LTYA 4H6KA 2QCLA 2XN2A 1IGSA 1T99A 1FDYA 2WPBA 3FFSA 3F1QA 3NL5A 1A53A 1EA0A 2VFHA 5KSWA 4JY9A 4NVTA 4ZQCA 1T0OA 3CIXA 4Y96A 1YPFA 3E02A 2I9EA 1JCLA 4E2BA 4O1CA 1H61A 1LYXA 3HQ1A 1SO5A 1LCOA 1T8XA 4FNQA 2QUTA 1SPQA 3P74A 2DZVA 3G1SA 4MVAA 3O6CA 3JS3A 4UC5A 3S8HA 2PRLA 1OK6A 3BLEA 3W7HA 1GEQA 2NXHA 3NPXA 3PB2A 4GUHA 2CLEA 4NXKA 4RX0A 5K9CA 4CCCA 2WV8A 2FDSA 3UD6A 3UZJA 2E5CA 1H7RA 1SZGA 3CB8A 3T44A 1GWJA 1SQ7A 3G1HA 1OFBA 5HINA 5EA9A 4R33A 3EWWA 1VJIA 2KZHA 3FYOA 3G1YA 4Z1BA 2X1SA 3DGRA 3NM1A 3NQFA 4WY0A 5FEXA 3VNDA 1XFBA 3IEBA 4WOQA 1LTDA 3GNNA 4D2JA 1B57A 1ZJIA 1ML1A 3TU9A 5MHBA 1BKSA 5K9XA 1YDOA 3TX9A 1JRBA 2EPHA 3N14A 4JIPA 3W71A 2F7FA 3D0CA 1RQEA 4XTDA 2NXGA 3GDRA 3QMRA 4JTUA 2V81A 5D2YA 1G4PA 2ISSA 3TK7A 4JX5A 4TMBA 4K8HA 5AOUA 3W1NA 1F2JA 3B06A 2CZFA 3R12A 1VYRA 3GXPA 1P0NA 4XBSA 1PE1A 3TC7A 5AFDA 4IXHA 1TPEA 1VCVA 3NQEA 1HTIA 4IX0A 4PCFA 3TC6A 4GUJA 4Z0JA 4JGDA 3GXNA 4GC4A 3FJ6A 3M16A 3C2RA 2QR6A 2NLIA 3KHJA 1LROA 2V5BA 4MYAA 5DBTA 4AVFA 3NQAA 1WX0A 1SW3A 1EP2A 3BO9A 3EKZA 1QWGA 3W70A 5G4EA 3OEXA 4PL2A 5D05A 1O5XA 3NPWA 2XN0A 3NQDA 2A21A 4PODA 4DPQA 1VHNA 4E0CA 4H3DA 1D3HA 5AYXA 2Y70A 1LZOA 1FDJA 1YDVA 5TIMA 2NV1A 2AQWA 3KVJA 2J6XA 1VYSX 2R94A 4DPPA 4YL2A 1KTNA 1WBJA 1X6UA 4JTTA 3WFAA 1TQXA 1Z48A 4AMAA 5SWUA 1EB3A 3FLUA 1LRNA 3SGUA 1WDWA 4K7VA 2WNQA 3R89A 3IIPA 3JR2A 4WD0A 3NQ2A 4ADTA 1OYAA 1VHCA 1JUBA 5I3IA 4N4PA 4JIQA 1F5ZA 1VQTA 3G1FA 3EWBX 3W1LA 1P0KA 3TSDA 2QCHA 4LRSA 3KXQA 1CI1A 4UNLA 3W2NA 1X1OA 1G67A 3PF3A 4AF0B 2DZSA 5AYZA 3VE7A 3TXVA 4I7WA 4ZQMA 4RV8A 3LXBA 4AWSA 3CC1A 4K8EA 3KRUA 6TIMA 3CWNA 4HKPA 4KFOA 3NOEA 3GNDA 4UTMA 2J24A 3QM3A 4IUOA 1KTCA 1UCWA 1R30A 4NX5A 2A4AA 3DBPA 1IF2A 4NX0A 1FDZA 4K7YA 1I2NA 2H3BA 4MY1A 3B0UX 4FHAA 3HG4A 3L0GA 4JTFA 5CPMA 4BWLA 4IMDA 5HR6A 3NL2A 2G95A 3C0JA 3M47A 5H2ZA 5FF4A 4UR7A 1L9WA 1TTPA 3M6YA 2Q3OA 4O4WA 3L9CA 1EWEA 4L4LA 3HF3A 3EX1A 4TR9A 2YW4A 4GUIA 1VLIA 1IXOA 3M9YA 4LC6A 3BK0A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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