1R5PA

Crystal structure analysis of kaib from pcc7120
Total Genus 27
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
27
sequence length
90
structure length
90
Chain Sequence
b'TYVLKLYVAGNTPNSVRALKTLKNILEQEFQGIYALKVIDVLKNPQLAEEDKILATPTLSKILPPPVRKIIGDLSDRERVLIGLDLLYEE'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Anabaena circadian clock proteins KaiA and KaiB reveal a potential common binding site to their partner KaiC
pubmed doi rcsb
molecule keywords circadian oscillation regulator
source organism Nostoc sp.
molecule tags Gene regulation
total genus 27
structure length 90
sequence length 90
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-10-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07689 KaiB KaiB domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1r5pA00
3RHBA 1XW5A 4LL1B 1O73A 4WR4A 4J2FA 3HVXA 1UN2A 1TRWA 4TR1A 3GA4A 4Q5NA 2GZZA 1WMJA 3W6GA 2VUPA 1OC9A 4RQRA 4EUYA 1WE0A 2J9HA 5ENUA 3TOUA 4J56E 4F9ZA 1GSQA 5GAND 2VD0A 1OVNA 2O87A 3V1WA 3VPQA 1SK0A 10GSA 2ZNMA 1A2LA 5D9WA 3KCMA 2O85A 2BMXA 3QFAC 4TR1B 3TKPA 1GSSA 5JWQB 4IHUA 2C4JA 4EVMA 2VL9A 2CX4A 1OE8A 1OC9B 1EGRA 4XCSA 1GUMA 2HT9A 4MF5A 3ZFLA 3PINA 3A2WA 1YY7A 4TR4A 1XOBA 1EZKA 2YV9A 2K9FA 4MPFA 4ML6A 4TN8A 3F6FA 2PWJA 1MD3A 2IN3A 3RBTA 5HR2A 1O81A 1YZXA 4I5QA 4DSRA 2AB6A 2YJHA 3IV4A 4L5LA 3NIVA 1CQHA 4BVXA 3GKKA 2IMDA 2MMNA 4I2UA 4OFTA 2XC2A 3D5JA 4IJIA 1M2DA 3MWHA 4POBA 2YWMA 2VD1A 4KGIA 1X0RA 3NOFA 1QMVA 2YCDA 4I6XA 3A2XA 2FUG2 2GSTA 2I1UA 1V2AA 3CSJA 1ZMAA 2YPMA 3FR3A 2GQMA 4GSTA 1JZDA 4H86A 4O5RA 1XWAA 3ZMKA 2V1MA 1FW1A 1A24A 4WF4A 4YQUA 5B6NA 1G6WA 2C0DA 1C72A 2FWHA 5JWRB 1VF2A 2J23A 2F8AA 1VF3A 1AIUA 4XS4A 3I69A 1GLPA 2XHFA 4N10A 2RIIA 6GSTA 1X5CA 1WJKA 1FG4A 4CW9A 1TI1A 3DMLA 4JE1A 5G2ZA 5G5EA 3TKSE 2NVLA 1FB6A 1X9MB 3CMIA 3ERWA 1T4YA 1U88A 3H79A 2YZUA 1QXHA 2VAFA 2K6VA 2X99A 3CRTA 1T3BA 1BX9A 2L59A 3HJMA 3KEBA 1OC8A 5B7CA 3DGQA 2LQQA 4DSSA 3DVXA 4MDCA 4IQAA 4G2EA 3EVIA 1ST9A 5ECKB 4HOJA 4O7HA 3VWVA 1G7EA 1TXXA 1XPVA 3HXSA 6GSUA 3TUEA 3S9FA 5GZZB 1X9WB 4ZBAA 1FO5A 2JU5A 1A8YA 2RM6A 6GSWA 1WRYA 5DJLA 3TRPA 5D9TA 4DSSB 1GSEA 1AXDA 4GXZA 2LJAA 3CRUA 1HD2A 2AHEA 5ECLB 4AJ7A 2HRNA 4G10A 1G7OA 5CRGA 3F0IA 4XTSA 2C3NA 2IWTA 4EDZA 2HYXA 2OE0A 2H75A 4V1Ap 5KN1A 5ABRA 1K3YA 2CAQA 3KP9A 3F3RA 3FR6A 1XXUA 1GUHA 1N8JA 2JZSA 3WT2A 3APOA 5IMDA 3J7Yk 3C7MA 4TRXA 2ALBA 4QQ7A 3GKNA 2PN8A 2QSIA 3P2AA 3IDVA 4FO5A 4DSQA 3ME7A 4POLA 1BQ7A 1MD4A 5J4UA 5C04A 1K0MA 3IK9A 1DUGA 2OBKA 1WOUA 1EEMA 1YEXA 3F4SA 5F05A 3A5WA 2VLVA 3UL3A 3D4TA 2DLXA 5EL8A 5ECMB 1FVJA 3C71A 4NHZA 1HNBA 5DAKA 3I6AA 1B4QA 1DSBA 3EE2A 4EC0A 2I81A 2HSYA 4POKA 2PERA 4AJ6A 5AISA 1UA5A 2DBCA 2I3YA 2B5YA 4PUFC 5IO2A 4MZBA 3QOUA 3Q74A 4FIWA 4OO5A 2VL3A 2EIQA 2L5OA 3FZ4A 3UVTA 1YEPA 4E8EA 3RPPA 3TJJA 1ZYQB 1S3CA 3L78A 2H70A 5DAKB 1VRSD 3OR5A 2WGRA 1AQWA 3ZREA 3IR4A 2LKUA 4XRDA 2JSZA 1AQXA 2DMLA 2R4VA 5DJMA 2PPTA 3WYWA 2JACA 5IQYA 3KTBA 1PGTA 2FLSA 5G30A 1R5AA 2L4QA 2IJYA 2AYTA 5B6MA 4EDYA 1SKSB 1Q4JA 2BTOT 1U3AA 4KB3A 3TKRA 1V58A 2F51A 5ECNB 5LD0A 2YP6A 1K0BA 2OE3A 4KDUA 5AIXA 3ERFA 3QMXA 4ISDA 3QPMA 4GF0A 1TP9A 1K0OA 3KH9A 3N5OA 4EKZA 1JLVA 3DYRA 4O32A 1M0UA 4JU5A 3GH6A 2LV3A 2KP2A 3O76A 2VCQA 4MPGA 3ERGA 2V2GA 4XS6A 1XWCA 3PGTA 2YJ7A 1PA3A 1Z5YE 3MNGA 2P0GA 4N30A 2DJ1A 2EIOA 1A0FA 3FR9A 5CAXA 3VURA 4WXTA 3EWLA 2GDRA 4I8BA 2H6XA 3ZRDA 3QFBC 2A2SA 3M1GA 2H72A 2N5BA 3ME8A 4GSSA 4LMVA 1X5EA 2WCIA 1ILOA 5CNWA 1U6TA 2HI7A 6GSVA 4OCFA 13GSA 3IAS2 5JCGA 1GUKA 3FW2A 2PBJA 1V57A 1SJIA 3QAGA 3SWLA 3KMOA 1F3BA 7GSSA 2FY6A 1PX7A 4ILFA 1AAZA 4HZ2A 2KLXA 2R5GA 4V2LA 2DSAA 4YH2A 2OACA 5DQYA 3GL5A 1WWJA 3D0ZA 3FYGA 2IMFA 3C73A 4MZWA 1SKRB 1SD8A 4PURA 2ON5A 2PUKC 3LXTA 2WULA 5LCZA 4MH2A 2XBQA 4K1FA 5D9XA 1Z6NA 4L0UA 4OCEA 2R37A 1Y6EA 5F06A 2C8UA 4JEDA 3ZTLA 4NHWA 1SK1A 1RK4A 3FZ5A 2DC5A 3KIJA 2EIRA 2C3QA 3DRNA 3HYPA 1RQMA 2C0GA 2JADA 2KP1A 2FWGA 3A3TA 1B4PA 1PKZA 4IKHA 1B48A 5C00A 1ZYEA 1W89A 1R26A 1FHEA 4BPYA 1EV9A 4OFNA 1TOFA 4FYBA 4ZB9A 3F8UA 18GSA 4F0BA 2OBIA 3DD3A 4JZQA 3TRQA 4GSNA 3WGXA 2YWNA 2B1KA 3IHQA 4ECJA 4POMA 4MJCA 3KH7A 2FNOA 4OFMA 1MDJA 4IP6A 1E2YA 3UJ1A 2B6MA 2OE1A 3MAKA 3EU4A 4IN0A 5FWGA 4K0NA 1XIYA 2BJXA 4F2IA 1XWBA 1A8LA 4OMVA 4HU9A 3D21A 4RI6A 4PQIA 3UIWA 4KSMA 3WGDA 4HZ4A 5ELGA 1YJ6A 3VI7A 4NWYA 3QD9A 3KJYA 2MYGA 4MF7A 1LJRA 3E0UA 5HQPA 2B7JA 3APQA 3IK7A 1PX6A 5ECPB 2B5XA 1PMTA 5J41A 4JBBA 2GS3A 2CQ9A 3HVSA 3LYPA 2L5LA 1NHOA 2WB9A 3GN3A 2GVPA 2CV4A 3F6DA 4AJ8A 1GWCA 2VCXA 2OADA 5CRHA 3P90A 4MK3A 3QAVA 1T00A 3C8EA 4BWQA 3L0HA 2WFCA 4KX4A 2VCTA 1A0RP 4PXOA 2H71A 2JSYA 2NBSA 1U3IA 20GSA 2FGXA 2HLSA 2MBSA 1ERVA 4HJ2A 3KGKA 4O92A 3G7YA 5DCGA 2FHEA 2MZCA 2CX3A 1TW9A 1SL1B 2CAIA 16GSA 3LEFA 4MP4A 3GL3A 2LNSA 2L6DA 3VWXA 3HZ4A 1TRUA 2NTOA 4OD7A 1TRVA 5DVBA 1OC3A 1TK0B 1Z7RA 1GRXA 1IYHA 4ECCA 3LSZA 3H93A 3CTGA 2LJKA 2AJQB 3A2VA 1GL8A 5J9BA 2TRCP 3Q6OA 2O7KA 5LNKe 2ZUPA 1ON4A 2G0FA 2DMMA 2P5RA 1W4VA 2V6OA 4BWSA 5G1LA 1JHBA 1QUWA 2VL2A 3TJFA 4WF5A 2RLIA 2K8SA 5A4VA 3M9KA 3UAPA 1QFNA 2QKEA 3FK8A 4QL9A 3TGZA 3LWAA 2YANA 2PVOC 1M2BA 4KW6A 1PQNA 1WPIA 3QDNA 1HYUA 1OE7A 1XVQA 1EP7A 1I5GA 1EGOA 5COHA 3UARA 3QR6A 4KNDA 2VM1A 2B1LA 2H66A 1BG5A 1K3OA 2GGTA 3BJ5A 1GSYA 2YNXA 1USBA 1M9AA 1ZGNA 2X64A 3E9JB 1H4OA 2G2QA 1ML6A 2IMKA 1Z3EA 5ECRB 1SK2A 3Q19A 3ZL5A 2Z9SA 5HFIA 3BD2A 2JZRA 4FH8A 4ZB6A 1ZZYA 1Z6MA 2DIYA 4HEA2 3HJOA 1NSWA 4QL7A 3LJRA 4ZBBA 1LBKA 2HSHA 2AUVA 2MMAA 5F0GA 1GP1A 2KHPA 2WDUA 2TIRA 2WZ9A 1VF4A 3ZYWA 2LEGA 2H01A 2VCWA 2F8FA 3KXOA 2VL2C 2A4VA 2F3MA 1BEDA 1EWXA 5AN1A 2PU9C 3KZQA 2H1DA 4CDOA 4RUVA 5FT3A 4BA7A 1A2JA 1YKCA 4KCAA 2ES7A 2LRCA 4D73A 3VPTA 4IBPA 5J5NA 3F4TA 2VLTA 2DJ2A 3LQ7A 4XRAA 4X0XA 2V41A 5A4UA 3M8NA 2LJRA 2FWFA 4TKYA 5B8BA 5J9CA 5JWOB 1UC7A 1PL1A 4F03A 5J3RA 3JCML 3GIXA 4ZL7A 4NV2A 3RDWA 4JRRA 1AQVA 1H75A 1N2AA 1GTIA 4D73B 4ACSA 3GNJA 1T4ZA 1PRXA 1XCCA 3G9BA 4N0ZA 3E3EA 3TKQA 3GYKA 3HHVA 4IVFA 1K3LA 1VF1A 2FWEA 3ZLPA 1NM3A 4K7OA 5IO0A 4K2DA 2HZEA 4I97A 1PL2A 4NAXA 4NMUA 3HDCA 4JR4A 4TR3A 3VWWA 1IYIA 3EMPA 5ECHB 3GUSA 3IC4A 4KUNA 3UMAA 3M0FA 3GH9A 2C3TA 3C1RA 3EYTA 1MDIA 4V1Ag 2FA8A 4I2TA 3P7XA 3D4MA 4ML1A 2HZEB 1Q98A 1PD21 2FCHA 2DIZA 1GSDA 4HQZA 4L0WA 1NW2A 2X8GA 2L57A 3APSA 3KM6A 2H76A 4OO4A 4KDXA 2RM5A 4KH7A 3U5RE 2GZYA 4IELA 1Z7PA 5DQSA 2F9SA 5EPFA 4N0VA 1XVWA 2I9HA 4NV5A 2DJ0A 2X8CA 3N9JA 1QGVA 5H5QA 3EMXA 3I9V2 1EV4A 1K0DA 4JR6A 4N11A 3TRXA 1X5DA 1HQOA 2HFDA 4BL7A 3F3QA 1M2AA 4K8MA 3VK9A 4PQHA 4E8HA 1OYJA 2VIMA 4PNFA 5DALA 4L5OA 3F9UA 4HDEA 1EP8A 1TU7A 2MBTA 3CTFA 4WBJA 3FEUA 2AV4A 2HRFA 5ECIB 2LNTA 4HUAA 4GQFA 1F9MA 4LA1A 3LGCA 4MJEA 5KN2A 2NPBA 3ISOA 1VGLA 1U87A 4KE3A 3DKSA 4LLRA 1XFLA 5DALB 1DBYA 2V6KA 5KN3A 5L71A 5A4WA 1V9WA 2M80A 3RHCA 2GTUA 3KD0A 3P8WA 5CREA 22GSA 4TW5A 1R4WA 3FRCA 2IIYA 4KDYA 4ZL9A 1XOAA 1O85A 2C80A 3BBYA 4KCEA 5ID2A 3FZAA 3LG6A 1FB0A 5IIZA 1O7UA 3PR8A 4ZL8A 3FY7A 2PGTA 3W8SA 2HE3A 5CO3A 5DBQA 1G6YA 1LU4A 2GQKA 1EOHA 3LFLA 3TOTA 19GSA 1GTBA 3FKFA 4XS1A 5EY6A 4YQVA 2WJUA 1S3AA 2HNLA 2LUSA 1F2EA 2JZTA 8GSSA 3H8QA 1F37A 2P5QA 4YQMA 5CRWA 3QAWA 5ID2B 5JCWA 3W8JA 2H1AA 2REMA 2H6YA 4J57E 1M99A 1T7PB 3HY2A 3TKSA 1FAAA 1YDKA 2VO4A 1SL0B 1JZRA 2PVQA 1ABAA 3TCOA 5G31A 3TJBA 3ZIJA 3CYNA 5G5FA 4WETA 3VFIA 1TI3A 2VCVA 2CVKA 2GT6A 3WT1A 4FYCA 3IXRA 3BOAA 3KTLA 2IPAA 4P3YB 4PX1A 4TR0A 1XW9A 2H30A 5DDLA 2E7PA 4IW9A 2IMEA 1DE1A 1OKDA 3ED3A 2N5FA 1YKAA 2X8HA 1V40A 3G7IA 2E0QA 1SYXA 4LL4B 2O89A 1BYEA 1ERUA 2EC4A 1TTZA 2IMIA 5IM9A 5IOXA 3PH9A 4YAPA 2PMTA 3ZVJD 4HJMA 3QCPA 4MZCA 1GULA 4WKWA 1AC1A 3CSIA 5H5RA 3EURA 1ERWA 1J0FA 1XZOA 2R6KA 1TJDA 4Q5QA 3ZIVA 4GTUA 5IMZA 4PUAA 2AAWA 1GTUA 3TKSC 2P31A 2LTKA 3TJGA 1K0CA 3M3MA 1YF0A 3UBLA 1SKWB 4KA0A 1MEKA 2NDOA 2H0GA 4TVEA 2LRTA 1URMA 5HR3A 5CP1A 2DJKA 3GSTA 3UEMA 4F0CA 1MDKA 2O8VB 2B5EA 2L6CA 2CZ3A 5HR1A 2K8VA 3US3A 1HNAA 2N5AA 3O6TA 1G0TA 2R2JA 4PQ1A 2ON7A 5IMFA 3GV1A 2RUEA 1THOA 4MJAA 5A5KA 4EL1A 5D8IA 1OKTA 1YF1A 3ZMLA 4IQ1A 4MABA 3KMNA 4GCIA 5AIVA 1F6MC 2DJJA 2LRNA 4L8EA 2QGVA 2HXKA 1KNGA 3EU3A 2GSSA 4NXIA 4PNGA 3H1NA 1BJXA 3DEXA 4K6XA 3I43A 3CSHA 3RAZA 1SL2B 4PGTA 3L9SA 1TU8A 3DXBA 5KN0A 1O8WA 3C1SA 3WGEA 3LXZA 5HR0A 3GKMA 1Y25A 2OA7A 2M46A 4YAVA 2XPEA 1J08A 4HQSA 4Q5FA 4MH3A 4XS4B 3DIEA 2CZ2A 2WRTA 3HKRA 5KEJA 3H4KA 2VLUA 2GQLA 2FD3A 1JLWA 2L4CA 4WEYA 3IOSA 2QC7A 2C0EA 1GLQA 2LQOA 4RQXA 1QK8A 2GSQA 2M72A 4KSOA 3VLNA 1KBNA 1R5PA 4ZIJA 4IJ3A 3UBKA 1GTAA 3GX0A 3IAM2 5AGYA 3SBCA 5ELAA 5IMVA 2GLRA 3GKXA 4LMWA 2VCZA 2CA8A 1Z9HA 1KEBA 2OKAA 1UVZA 3HCZA 1JZWA 2CVDA 1FVKA 1NHYA 3GSSA 3GX8A 2GZPA 3TJKA 6GSYA 1PKWA 2H1BA 4MJBA 4ZILA 4K7NA 3GMFA 3IBHA 4G9HA 4GLTA 1V98A 4MMMA 4TXOA 2YZHA 1AUCA 3FZ9A 1XWGA 2H0HA 5IPGA 2IFQA 4ECBA 2JL4A 3WD6A 3EC3A 4ZB8A 1J9BA 5E4WA 4WBRD 5ECSA 2H73A 2IL3A 1AW9A 3AY8A 4MF6A 4NPBA 5EVOA 4V2NA 2YWIA 4TXOB 5D73A 2H19A 1TDIA 4ZBDA 2H1GA 2MMZA 3CXGA 2I4AA 3UVHA 2IFQB 5F07A 6GSSA 5IPHA 1GH2A 1DE2A 2YV7A 1KTEA 2C0FA 5IMCA 1THXA 1HNCA 1OAZA 2LS5A 1GNEA 2YWOA 1M9BA 4K9ZA 2KOKA 2H6ZA 2CVBA 3F4RA 3HA9A 3HZ8A 1XW6A 1I9DA 4GRFA 1TRSA 5GAPD 4HU7A 4ID0A 1ERTA 3VI5A 1GSFA 4EE0A 1FOVA 1SYRA 1PSQA 6GSXA 5INYA 2GSRA 4BVYA 1R7HA 2B3SA 3F63A 5D9VA 1XWKA 17GSA 1SJ6A 5ECOB 5DCHA 4HI7A 4AF2A 2TRXA 1MTCA 3HVVA 3GTUA 5GSTA 3IRAA 3R2QA 4OWYA 4FYUA 1T1VA 2K18A 3U6VA 1PN9A 3RPNA 4HS1A 4EF0A 3G7JA 3UOMA 2E2MA 4IP1A 4K0GA 3FHKA 3GHAA 3GFKA 3MSZA 4TOPA 3TB2A 1TKDB 2H0IA 1JFUA 5G1KA 5ECQB 2XPDA 4IS0A 5GSSA 3GTUB 5E59A 1GNWA 4MCUA 3J7Yb 4IGJA 4TXVA 2ZCTA 1O8XA 5JCUA 4XIHA 1B9XC 3O3TA 5HFKA 4DEJA 2MMOA 1BAYA 5CYYA 3DVWA 2YOIA 3IA1A 4G19A 3D6IA 1X9SB 5H5SA 3L9VA 4ECIA 3K8NA 9GSSA 4RI7A 1ACVA 4X1UA 3DWVA 1B9YC 1QQ2A 2CT6A 3ZFBA 1O6JA 1XBSA 11GSA 2D2ZA 14GSA 3TDGA 3GRXA 4Z7XA 2DJ3A 5D93A 3GURA 2KUCA 3Q18A 1K0NA 3HJPA 12GSA 1M7TA 4CHSA 5HFGA 2V32A 1RW1A 2WS2A 5F8BA 4F82A 3M9JA 3D22A 3IE3A 1SENA 4DVCA 1SD9A 2R3XA 3L9UA 1K0AA 4ULXA 4MA9A 2GT5A 1F3AA 1A23A 5D96A 2C1YA 1JZOA 4XHMA 2YN1A 2A2RA 2XBIA 1SJZA 3MDKA 4X43A 2VM2A 1YQ1A 3L4NA 1ZCPA 2H8LA 4V2MA 1ZL9A 1GSUA 3BCIA 1E6BA 2B7KA 4AGSA 2H74A 5IOWA 3LYKA 1S3DA 5FHIA 4EO3A 3CBUA 1WP0A 1TK8B 3EINA 2E2GA 3HD5A 3NZNA 2FA4A 2HZFA 4WR5A 3VWUA 1ZOFA 2LSTA 5IMAA 1WIKA 1A2MA 2OJLA 3BCKA 4GQCA 4Q5RA 2RUFA 4KAEA 1B8XA 1TK5B 3ZZXA 1SU9A 3IPZA 1CQGA 5B8AA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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