1RBUA

Structural study of mutants of escherichia coli ribonuclease hi with enhanced thermostability
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADNKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural study of mutants of Escherichia coli ribonuclease HI with enhanced thermostability.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RIBONUCLEASE H
source organism Escherichia coli
molecule tags Hydrolase(endoribonuclease)
total genus 51
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1993-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1rbuA00
2FBTA 4H8KA 5SWMA 3SZ2A 1RDAA 4E7JA 4KHYA 1C6VA 1MU2A 1YTAA 4AILC 2HNDA 1SL2A 1VSKA 5CYMA 1L3TA 4CE9A 3KIOA 4FM0A 1S9GA 2FBYA 1L3SA 1WSEA 2VG5A 5J2QA 2EHGA 4BDZA 3HP6A 1KFDA 1JLFA 3QERA 4TSXA 1D5AA 4OGEA 1TKTA 1UA1A 4B9UA 1KVCA 1WSGA 3ZSXA 3OS0A 4Z4EA 3SJJA 1RT6A 1HYSA 4OKKA 1L3UA 1VRTA 3MXMA 2OPPA 4M3RA 3TARA 3LANA 4ZTJA 3HJFA 2DFEA 1IO2A 4CJ3A 2X74A 3TAGA 3HL8A 1VSHA 2F96A 3AVMA 3VQDA 3KLFA 1RT5A 1XHZA 3OYMA 3PO4A 3QETA 2OPRA 3QLHA 1IH7A 2G8IA 3OS1A 3AVBA 2G8FA 4CK2A 3KD5E 3TAMA 1NK9A 3ALYA 3S3OA 1VSJA 4XIUA 1TAQA 4R5PA 2DFFA 2QKBA 3V9XA 4AHSA 4M3YA 4UQGA 3TAFA 4L8RB 4KO0A 4B9NA 4FJMA 2Y1IA 3PV8A 1WSIA 3PO5A 4F2SA 2BGGA 4LSNA 4KI4A 4Y1DA 4FJ8A 4DFJA 3BDPA 5K14A 3HPOA 1J5OA 3RWUA 2YNHA 2JGUA 3VQ7A 4JRPA 3SQ2A 1WSJA 4CF1A 4CJ5A 3LWLA 1WAJA 3DLGA 3RR8A 1DLOA 2NUBA 4I7FA 3NCIA 4LY7A 3AO3A 4CFDA 3ZT1A 4DSEA 1TK5A 3T3FA 4PA1A 1U48A 2RKIA 3KD1E 2ITGA 5JS2A 4HCBA 3HK2A 1SL0A 1VSDA 1NKBA 3AO1A 2KW4A 3B6OA 1UWBA 3L2WA 3TWHA 4E7LA 3TAEA 2P51A 1RDCA 4LH5A 2YHBA 5CY4A 1JLEA 5D3GA 1X1PA 4NCAA 5CZ1A 1RTIA 2XY6A 2KQ2A 4LD0A 4N56A 3OYJA 4E7HA 3PY8A 4FJLA 1R0AA 4C8LA 2BANA 3TI0A 4Q0BA 4KKOA 1RDDA 4CEDA 3S3NA 2QKKA 3CG7A 3VN5A 4CF0A 5KTQA 2XY5A 1QQCA 4CGGA 3DLKA 4FVMA 3PX0A 4DSJA 1DTTA 3SPZA 4DQSA 5FDLA 4FLTA 1S5JA 3KKSA 2PYJA 1BQNA 1W0HA 1RBRA 3ZSZA 4CF9A 5J2MA 3L2QA 1BL3A 1NKEA 3NFAA 3E01A 4IKFA 4FJKA 1BGXT 2KZZA 2OYQA 3DRPA 3ZSRA 3NH1A 1BCOA 1S6QA 1WNSA 2ZD1A 4LSLA 4CIEA 1TKDA 1KTQA 4F3TA 3DLRA 4QCLA 5CZ2A 3K57A 1HQEA 2IGIA 3KK3A 5CYQA 3BGRA 4FJJA 4IG3A 1SKRA 4F2RA 1C1CA 4FLVA 1RT4A 4CGHA 4DU3A 4CEEA 5E41A 4B9LA 1RTHA 1BQMA 1RT2A 2RPIA 3MEDA 3LAMA 3QO9A 2GUIA 3HPGA 1REVA 2YNIA 4CIGA 3ZSYA 3PX6A 4DQPA 4RG8A 3NH0A 3KKRA 1RNHA 1TVRA 2X78A 1NKCA 1TV6A 3ZT3A 3SUNA 1Z25A 4OPJA 4B8AB 4F4KA 4E3SA 1LV5A 1A5WA 4MFBA 3IAYA 1S1XA 2OZMA 1U04A 3AO5A 3NDKA 1ZBUA 4CIFA 4DTSA 3UIQA 2XY8A 2D5RA 4B9TA 3SUPA 1CXUA 1JXBA 1SKWA 2XHBA 3CM6A 4W5OA 1BHLA 1UAXA 1NJZA 2KFZA 4BE1A 3SCXA 4RW8A 1TKXA 1VSIA 4KI6A 3ZSWA 3C95A 3T19A 4CJEA 3HSTB 1T7PA 1C0MA 1B9DA 1I39A 4C8MA 3OYBA 3P1GA 2PY5A 1RILA 3KJVA 3QEVA 1KVBA 2ATQA 1T05A 4FYDA 4KHQA 1XI1A 2KZMA 3RMAA 3O4NA 3QEWA 1NOZA 3LP2A 4E1NA 4DFMA 3ZSOA 2AJQA 4CGFA 3AA2A 1NK5A 5KRSA 3AVJA 2XRIA 4I2QA 1ZBHA 3QEXA 1X9MA 3L2RA 3RRHA 4E0DA 3LDSA 2HHWA 2YNGA 3DYAA 3OYEA 1UA0A 1HNVA 2HHVA 4O5BA 4HUGA 4CJLA 4EP4A 3AVGA 3DLEA 3HP9A 1ASUA 3VQPA 4CK3A 3P5JA 2A1RA 1QTMA 3MEGA 3OY9A 3V81A 3NAEA 4DSKA 1CXQA 4HVJA 1CLQA 4MQ3A 2HHUA 3ASMA 1O1WA 1TK8A 3O3GA 4H4OA 4IFYA 3AO4A 4IG0A 3WNGA 3HPHA 4CEQA 3K5MA 1NJYA 5FRMA 4KFBA 3CFPA 2F8SA 2DY4A 2HHQA 4C8OA 3U3GA 4ELUA 3SUQA 2P5GA 3TR8A 1XC9A 4EZ9A 1JKHA 2EX3A 3MEEA 3MXJA 4CEAA 4HHTA 3K59A 4CJRA 3ISNC 2G8UA 5EU7A 4FJXA 3RRGA 2GV9A 1EETA 5KRTA 3OJUA 4CJFA 2G8VA 3F73A 1Q8IA 1KSPA 2YKMA 1JLGA 4CCHA 1S1TA 4HUFA 2PZSA 2HHSA 1RCHA 3DM2A 3V1OA 3OYLA 1D9FA 4CJPA 2FC0A 4FJIA 4M3XA 3VQBA 4QOZB 1NK8A 3L2UA 1IKWA 2HW3A 1GOAA 4FLWA 3AVIA 4DG1A 1J53A 1S1UA 4CGDA 1EP4A 3D45A 1IG9A 5J2NA 4BE0A 3TAQA 5T7BA 3LAKA 4CHQA 4CEZA 2D0BA 1QE1A 4CFAA 1BI4B 4FM2A 3LWMA 3TAPA 4FZXC 1HYVA 4ID1A 5I3UA 1C0UA 4AHCA 2XO7A 2HHTA 4EP5A 4ICLA 2W42A 1RBUA 4DTOA 1NJWA 2ZE2A 4F3OA 4FLXA 2G8KA 2P1JA 1LWEA 3I0RA 1EX4A 5HRPA 1A5VA 3VQ5A 2Z1IA 3C94A 1KLNA 2LSNA 3WNEA 1XHXA 2HNZA 2F8TA 4E89A 3V9UA 2O4IA 1NK7A 4AH9A 1RBSA 2VG6A 4KPYA 1QSYA 3LP0A 1G15A 3O4QA 1JLCA 4DMNA 4CK1A 1SL1A 4FJNA 3K2PA 4QAGA 1HQUA 1CZBA 4DU1A 3ITHA 3AVHA 4RW4A 3VQ4A 3QEIA 4I2PA 3QESA 3AA3A 2JLEA 1BISA 3EYZA 4B9VA 4KB1A 1ZBIA 4Q5VA 4DLEA 3S9HA 1FKOA 3AV9A 4EZ6A 3NBPA 3AVFA 1ZYQA 1KVAA 4DS4A 1EKEA 1IKVA 4B8CA 3K5LA 3SPYA 5HLFA 3DLHA 2X6NA 1TL3A 2WOMA 4DSIA 1B92A 3EY1A 3LALA 4FXDA 4N41A 2P5OA 1JLBA 3ZCMA 3VA3A 1GOBA 5FRNA 1KCFA 4CHNA 3OYGA 3AO2A 1DTQA 3AA5X 4GW6A 3CFOA 3WNFA 3AVLA 4C8NA 1X9WA 3KK2A 3SNNA 1RT3A 1VRUA 4YNQA 2RF2A 3LZJA 3HO1A 2IDOA 4G1QA 4AHRA 1FK9A 1K6YA 4OGCA 3B6PA 3NGIA 1C0TA 3SQ0A 4FJ5A 2R7YA 2HVHA 3NGZA 4KAZA 2IOCA 3A2FA 4CECA 3EZ5A 4B08A 4KHNA 5KGWA 1YT3A 2D0AA 4OPKA 3MAQA 4M3TA 3OYIA 3AVKA 4KV8A 2VWKA 4BACA 3OYFA 5HP1A 2Z1GA 3KTQA 4OJRA 4HTUA 3DMJA 3I0SA 3VQCA 3AA4A 4AHVA 4GMJB 3OVNA 3OYHA 1QSSA 2E6LA 4CJKA 1T8EA 3OYDA 3CFRA 1I3AA 4C8KA 2ZQBA 1B9FA 2KTQA 4RW6A 1N6QA 4E1MA 4E19A 4FCYA 3G10A 5FROA 1BI4A 3KLHA 3KK1A 4CF8A 4DLGA 4DTNA 1QS4A 1NOYA 3H08A 4FW2A 1RTJA 4FJHA 1T03A 2A1SA 4IDKA 3KLIA 4O55A 4CHPA 1JL1A 2Q3SA 1ASVA 2ETJA 3SUOA 3CQ8A 4BWJA 1BIUA 3QNOA 3L3VA 4J2EA 1J9AA 1XWLA 3F9KA 1W9HA 1VSMA 4CJUA 3M8RA 2OA8A 4PUOA 3P83D 3RMCA 4Z4FA 1C1BA 1WLJA 3L3UA 4CFBA 4OLAA 2HNYA 3VQAA 2B4JA 4E7IA 4J2AA 1Y97A 3LPTA 4O0JA 1RT1A 1BIZA 1RBVA 4OVLA 4N76A 4KHUA 4KB0A 4J2BA 5DK5A 4HUEA 1ZBLA 5J1EA 2O4GA 1HJRA 3MECA 4NYFA 3VQ9A 5C25A 4CGJA 4OLBA 2B6AA 3OYKA 1F21A 1FKPA 1HYZA 4DTRA 3LP3A 3L8BA 3RR7A 4FJGA 4KTQA 3M8QA 4J2DA 1D8YA 4JRQA 3K58A 4JS4A 4H4MA 2Y1JA 1EXQA 2FBVA 2HVIA 4Z4GA 3HXMA 4I9QA 4M45A 1C1AA 3DRRA 3KLEA 1NK4A 4N5SA 4BDYA 4M3UA 4CF2A 1ZBFA 2PYLA 3THVA 4BDPA 3NH2A 1VSLA 4RW9A 3OJSA 4DF4A 2KFNA 1S1VA 5KGXA 3VQ6A 4KTWA 1S1WA 3ZT4A 4FLUA 1L3VA 1CZ9A 1Q9YA 5JS1A 3HYFA 1D9DA 1FXXA 3MXIA 3K5OA 3CYMA 4ELVA 2DTUA 4PWDA 1WSHA 5DMRA 4BWMA 5SZTA 1LW2A 4CHYA 1KFSA 4M41A 2VG7A 3OS2A 1LW0A 1TGOA 3VQEA 4W5TA 2BDPA 5C24A 3NF7A 1RTDA 5HRSA 4K8XA 1S9EA 4DTUA 4DQIA 4OKJA 1KLMA 1ASWA 3SQ4A 1VSFA 3IRXA 3OYAA 2D0CA 3RTVA 1S6PA 3D0PA 3V9ZA 4DSFA 1Q9XA 4CJQA 3L2VA 4KRFA 1LWCA 4RW7A 4CGIA 2FBXA 3VQQA 1VK0A 4M3ZA 2Z1JA 3TANA 4AHUA 4O44A 3NF8A 5C42A 3NE6A 2QK9A 3U6FA 3U3YA 5KI6A 4DF8A 3PX4A 4IBNA 4AHTA 5HROA 3HVRA 4ELTA 2I5JA 4GVMA 3K5NA 4DQQA 2VWJA 1U49A 4KREA 4WE1A 1L5UA 2YKNA 3QNNA 2OPQA 5HBMA 3ZSVA 4CERA 1WSFA 4ZHRA 4FK2A 3OYCA 2QXFA 1U4BA 1JLAA 4FK0A 3AVNA 2E4LA 1QSLA 2YHAA 3NF9A 4PY5A 1GOCA 4DTMA 4B3OA 4E7KA 3TABA 2YV0X 2HB5A 2IS3A 3NF6A 3IG1A 1KRPA 1HRHA 3HM9A 1TKZA 3ULDA 3RMDA 3DOLA 3LZIA 3V6DA 3I8DA 4KHSA 1ITGA 1TK0A 2HHXA 4FJ9A 4O4GA 4CEOA 4JLHA 4HCCA 2YNFA 3PUFA 3HT3A 2G8HA 3M8PA 4PQUA 3S3MA 4FZZA 1SKSA 1QHTA 4M3WA 5J2PA 1N5YA 3LP1A 4M42A 4I9LA 3ZT0A 4O0IA 1VSEA 4Z4CA 3T1AA 1LAWA 1NJXA 4NCGA 3AVAA 4LH4A 5I42A 3AVCA 3SV4A 1A5XA 1LAVA 4N47A 4DS5A 3V4IA 4FLZA 1LWFA 4Z4IA 3KLGA 2XY7A 1NK0A 3DRSA 4FJ7A 1U45A 4YFUA 4DFKA 1NK6A 4KHWA 2IC3A 4FZYA 1Z26A 4NCBA 4CJSA 1JXEA 3M8SA 3SYZA 2G8WA 3SV3A 5HRNA 2X6SA 4CJTA 4CEFA 4DFPA 2HMIA 4ID5A 3VQ8A 3QIPA 1WN7A 4CJ4A 3ZT2A 1JL2A 3NGYA 4BE2A 4K8ZA 1IKYA 4FM1A 1TL1A 4FLYA 3O3FA 4CHZA 3RMBA 4FK4A 4JS5A 1YTUA 1RT7A 1YVUA 3G0ZA 3QINA 4W5NA 1HPZA 2B5JA 3CM5A 2DFHA 2IAJA 3V1RA 4CFCA 3JYTA 3NHGA 4OKEA 1BCMA 1J54A 2BE2A 3FFIA 4DU4A 1RDBA 2OZSA 4ZTFA 3DI6A 3V1QA 4DTJA 2OPSA 3V9WA 1U47A 4KTZA 4CESA 3QIOA 2Z1HA 3DLBA 4F8RA 3LPUA 4CHOA 1X9SA 3JSMA 1SV5A 4B9MA 4DWIA 3V9SA 2WONA 4DTPA 3SQ1A 3ZSQA 4CEBA 1HNIA 4FW1A 1RBTA 3C6TA 3DOKA 3WNHA 4DSLA 5HRRA 1IKXA 4W5QA 4DTXA 3O3HA 3HVTA 4CJWA 4W5RA 1JLQA 2GBZA 4Z0UA 3QEPA 3IS9A 2E6MA 1UOCA 4IFVA 3SI6A 4B9SA 1WAFA 3VA0A 3C6UA 2RN2A 1TAUA 4Z4HA 1SUQA 4CJVA 4DQRA 4NYNA 3OYNA 4Y1CA 1HMVA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2FBTA 4H8KA 1BWFO 2O8BB 2QXLA 3M3ZA 3QFPA 4CE9A 5J2QA 3HP6A 2NRTA 3HBTA 5LMUK 4NLBA 4TSXA 1D5AA 1UA1A 1NGIA 1QZ5A 4H0VB 4BREA 1L3UA 5EOYA 3LANA 1IO2A 1YXQA 5HL7L 3CCEN 3OYMA 1RGIA 4GKJK 3FZMA 5JVHL 5AR0A 4CK2A 4JYAK 1NK9A 4R5PA 3BY5A 2DFFA 4M3YA 4BQZA 4L8RB 2E88A 4YHHK 4A57A 4LF6K 4LSNA 3ID8A 3BDPA 3HPOA 2YNHA 2NNWA 3K9JA 4K0KK 3I33A 4PHTX 4A5BA 3SQ2A 4CF1A 1WAJA 3DLGA 3RR8A 4I7FA 1HPMA 3BP8A 1U48A 2HSTA 3CERA 4IO9L 4JI3K 1NKBA 1X3NA 3TWHA 3QBWA 1SS6A 2BUPA 5CY4A 5D3GA 4NCAA 3ZETA 4EHTA 1RTIA 1YJNN 5GAGP 4FJLA 5IT9O 1W2BM 3MN7A 1XQSC 2P9SB 3SPZA 4FL9A 1YHQN 2PYJA 2WBNA 2HHUA 4YDUC 2KZZA 4FJKA 2OYQA 3ZSRA 1BCOA 4JEPA 1WNSA 4LSLA 3T7ZA 1TKDA 3EO3A 4DHYA 1HQEA 3D2FA 5CYQA 4FJJA 1SKRA 4JI5K 3LDNA 4YDUA 1WBDA 5E41A 4ILGB 3DXMB 1REVA 2YNIA 4CIGA 5DM7L 4BG9A 1KAXA 4DQPA 4CZLA 1U2VA 3KKRA 1Q7YO 1C0FA 4B8AB 4E3SA 3CJ9A 2OZMA 3AO5A 3H45C 1ZBUA 1IJJA 2D5RA 3O08A 4CZIA 4FOIA 3UB5A 5AQJA 2XHBA 5AZJB 3CM6A 4AF1A 5AZIA 1NJZA 3WXKA 1WUAA 1TKXA 1VQ8N 3BZCA 3EEQA 1T7PA 5C0YA 1C0MA 3L4QA 5F0XA 3PLAA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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