1RBUA

Structural study of mutants of escherichia coli ribonuclease hi with enhanced thermostability
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADNKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structural study of mutants of Escherichia coli ribonuclease HI with enhanced thermostability.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RIBONUCLEASE H
molecule tags Hydrolase(endoribonuclease)
source organism Escherichia coli
total genus 51
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1993-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1rbuA00
1LW0A 3AVJA 4ICLA 3NDKA 1Q8IA 1NK5A 4DTRA 4KREA 3AO5A 3PO4A 2VG5A 1N6QA 5J2MA 3MXIA 3MXMA 4DQQA 3K5OA 4FJ8A 1NJWA 2O4GA 4Z4EA 1VRTA 3DRSA 2ATQA 4CFCA 3ASMA 1ZBFA 3OYHA 4DS5A 2KTQA 2RKIA 4N47A 1VSLA 1XHZA 1UAXA 1YT3A 1Z26A 2JGUA 4ELUA 1LWFA 4CJ4A 4DSIA 1B9FA 5J2NA 1L3VA 4KHSA 2GBZA 3NGZA 1QSYA 3K5NA 1D9DA 1VSEA 4E1NA 4FJ7A 4CGJA 1QHTA 3RRHA 2XO7A 3ULDA 2HHXA 4CIFA 4CGIA 4OPKA 3AVBA 4CF0A 4DG1A 4JRQA 4FCYA 3DLGA 4CEQA 3ZSQA 1RTJA 3SUOA 1NK4A 3DOKA 2G8UA 3VN5A 3DLHA 4CF1A 3OYBA 1S9EA 3VQ9A 4QAGA 1BCOA 5E41A 3NH1A 3SQ1A 1CZBA 1C1AA 1QS4A 2OPPA 3KLIA 3SV3A 4DTSA 1D5AA 3KKSA 3SV4A 2XY8A 1VSJA 4GW6A 4AHSA 4KB1A 4DSLA 2PYJA 2ITGA 3KIOA 4CK2A 4H4MA 2KFZA 5FROA 4M3UA 1X9MA 3C95A 4ID1A 4FM0A 2OYQA 5DMRA 1RT5A 2YNHA 2Z1GA 4FJJA 1QTMA 2AJQA 4ID5A 4M3WA 3TAQA 4FM2A 4O4GA 1NKBA 1L5UA 3V1QA 3RMAA 3OYGA 3ZSYA 4OKJA 4ZTJA 1MU2A 3O4NA 1U4BA 3LP0A 1F21A 5KGWA 3DYAA 4CECA 2DFEA 4B8AB 4CGHA 3NF6A 4CK1A 3SCXA 3V9UA 4DS4A 2O4IA 3OY9A 2R7YA 2HMIA 4H8KA 4IFYA 3AVFA 3DI6A 2Z1IA 2OZSA 3M8PA 3LZJA 1WSEA 4O5BA 4R5PA 1ASWA 1S1VA 3LZIA 3L2UA 1JLEA 1QSLA 4HHTA 5HRSA 3OYIA 2IGIA 1BI4B 1WSJA 4J2AA 2IAJA 4DFMA 1RBTA 4RW4A 3P83D 4KTWA 1RCHA 5FRNA 3K59A 4FJKA 4B08A 3K58A 3CFRA 4MFBA 4LD0A 4DTPA 2HVIA 4DTNA 4O0IA 1X9WA 1D9FA 4DQRA 1Q9XA 2HW3A 4KHYA 3C6UA 5J2QA 1JKHA 3RMDA 4HUEA 4E0DA 3OYEA 2YV0X 4M41A 3LAKA 4CJQA 3AVGA 2I5JA 2B4JA 1TKXA 3ISNC 4AHVA 3DLBA 1B92A 3SYZA 4B9TA 2HNDA 3AVLA 3QEVA 3SI6A 5HROA 4G1QA 4DWIA 1NJZA 1VSKA 1TAUA 1LV5A 1B9DA 3V1RA 4ZHRA 1S1TA 4OKEA 1TV6A 4K8ZA 3EZ5A 4F3TA 1ASVA 1ZYQA 4CJKA 1HPZA 2GV9A 3ZT1A 4JS4A 2G8IA 3AO3A 1TK0A 3RWUA 3S3NA 4CIGA 4CJFA 3SUNA 3NFAA 2X74A 1X9SA 5HLFA 4DSKA 3OYNA 2YHAA 3HJFA 2P1JA 4HCBA 1I3AA 1TVRA 5K14A 1HYSA 2OPSA 3VQ8A 4CJ3A 4CHNA 1KCFA 3SPZA 3BDPA 2BGGA 3VQQA 4AHRA 1TKDA 4FLVA 1ZBIA 2HHUA 1DLOA 1UOCA 4CGGA 1HJRA 4FK0A 2ZE2A 4NCGA 3LP3A 3KLEA 3OYCA 3VQ7A 1C0MA 5FDLA 3PY8A 1RT7A 3VQBA 4FK4A 1WAJA 4CJUA 4I9QA 3JSMA 4KI6A 1TKTA 1NK0A 2F96A 3QIPA 2W42A 1A5XA 4KKOA 3QEIA 4BE1A 2BANA 4XIUA 1NK6A 3ZSOA 3SJJA 2XHBA 4O55A 3CM6A 1JLCA 1VSFA 3T3FA 4M3RA 3S3OA 2Y1IA 2DFFA 2ZD1A 1SL0A 3VA3A 1D8YA 4FZXC 5I42A 1JLGA 3QEXA 3IG1A 3KTQA 3KK3A 1S1UA 1Q9YA 4BDYA 4KPYA 3PUFA 1NOYA 1KSPA 1UWBA 3VQ4A 3C6TA 4FVMA 4EP4A 3NF9A 4E7HA 1KVBA 4DTJA 3NH0A 3G10A 1SL2A 3I8DA 4KFBA 1HYZA 4FLYA 1XHXA 1VSIA 3AVIA 3K57A 4CJVA 4CJPA 1U47A 3ZCMA 1HMVA 3SPYA 3NAEA 4OLAA 2BDPA 2DY4A 1HNVA 2B6AA 3DOLA 4M45A 3UIQA 4B9NA 4DQPA 4M42A 4FLZA 4F4KA 3L8BA 3L2VA 4AILC 4CEZA 2PY5A 3KLHA 1RTHA 3ALYA 1XI1A 5J2PA 1J53A 4OLBA 3NBPA 3LP1A 4TSXA 1RDCA 2YNFA 1U45A 3V9ZA 1RT2A 3VQPA 4CHPA 4E19A 3TAPA 4IKFA 4M3YA 4Q0BA 3TABA 2P51A 1S6QA 4IBNA 4CESA 2G8FA 1O1WA 4BE2A 1JLBA 1RT3A 4IG3A 4Z0UA 4CEOA 2QXFA 2VWKA 4AHTA 2X6NA 1GOAA 1I39A 5KGXA 5KTQA 1CZ9A 1BIZA 4DF8A 1RBUA 2YKNA 3ZT3A 3DLEA 1G15A 4M3ZA 5C25A 3NGYA 3QNNA 4RW9A 1KTQA 4KAZA 4JS5A 1C1BA 3CFOA 4CJSA 3TWHA 1NJYA 4FLXA 1R0AA 3LWMA 4F3OA 4OGEA 4FZZA 4B9MA 4O0JA 1YTUA 4FXDA 4CEFA 3MEEA 1JL1A 3KLGA 4OJRA 3LWLA 3PX0A 2FBXA 2D0AA 3HO1A 3ZSWA 3VA0A 2HHSA 3V6DA 3AA3A 4FJGA 1RBVA 2E4LA 4WE1A 1LW2A 3KLFA 3HP6A 3QEWA 3TAEA 1C0TA 4KHQA 3G0ZA 2HHWA 4NYFA 4FLTA 5SZTA 1VSHA 2G8HA 4EZ6A 1WSHA 5EU7A 4CFBA 4CIEA 1NOZA 5KRSA 1S1XA 2FBTA 1LAVA 4UQGA 3LPTA 4FLUA 1RT4A 4OKKA 4N5SA 3NGIA 4DU3A 3DMJA 5KI6A 5HRRA 4KB0A 2KZMA 3AA2A 4EZ9A 2XRIA 4BE0A 4QOZB 4CHZA 1C0UA 4FJLA 1TGOA 3DLKA 4ZTFA 1IKVA 1ZBLA 2G8VA 3AO2A 3PO5A 3V4IA 5HP1A 1X1PA 3DLRA 3FFIA 4CE9A 2A1RA 1QE1A 1WAFA 3P1GA 4DTOA 1RTDA 1EX4A 1KFDA 1RTIA 3QIOA 2OA8A 4FJ9A 4Z4CA 1KVCA 3DRRA 1EKEA 4CFDA 2BE2A 3AVKA 3L3VA 4DLEA 4OPJA 3V9XA 1JLQA 2G8KA 3U6FA 3QO9A 3TARA 1EXQA 3ZT2A 4EP5A 4FLWA 3SUQA 4K8XA 3LP2A 1JL2A 2OPRA 2F8TA 1C6VA 4F2SA 1IKWA 3ZT4A 5T7BA 2G8WA 2D5RA 5HBMA 1J5OA 4PUOA 3MAQA 3NF8A 3AVMA 4DMNA 1BISA 3E01A 4C8MA 4CHQA 3VQAA 1NKCA 4C8KA 3OYDA 3D0PA 4LH5A 3M8QA 1FKOA 3KJVA 2A1SA 3SQ0A 4B9VA 1FXXA 1WLJA 2EHGA 4J2EA 1ZBUA 4OGCA 3HYFA 4LY7A 1EP4A 3RTVA 3HL8A 1KLMA 1RBRA 1S5JA 2P5OA 2IC3A 3QINA 3O3HA 1SKRA 1KLNA 1U48A 1HNIA 2VG7A 1N5YA 1VSMA 2ETJA 2E6MA 4HUGA 1L3SA 2VWJA 3F73A 4W5QA 2KQ2A 4CJLA 3LPUA 4FJNA 1J9AA 1L3UA 4FJ5A 3MEGA 4IFVA 3U3GA 3OYMA 3U3YA 1JXBA 4W5RA 3HPOA 4CK3A 3QETA 4E89A 3L2QA 4LSLA 4FJIA 4RW8A 1NK7A 1XWLA 4CJWA 4YNQA 3KK2A 4E7JA 3HVTA 1DTQA 2EX3A 3MXJA 5J1EA 3CQ8A 4CEAA 3TANA 2OZMA 3K5MA 4B9LA 1IO2A 3AVNA 4HTUA 3AV9A 3IRXA 3DM2A 3O4QA 3HVRA 1UA0A 3OYAA 3PX6A 4FYDA 1WSFA 5JS2A 1LAWA 4NYNA 2QK9A 4W5TA 1T05A 4Z4HA 2HNZA 1IKXA 2OPQA 3WNFA 3OYKA 5DK5A 2NUBA 3NHGA 3HSTB 3LANA 3VQ6A 4O44A 5HRNA 4DTUA 3CYMA 1S1WA 3THVA 4BWMA 3VQ5A 2B5JA 3M8SA 1FKPA 5KRTA 1NJXA 4FW1A 3QERA 1RDBA 1A5VA 1U04A 4CERA 4E7IA 1L3TA 3RR8A 2HHVA 3MEDA 3RRGA 1RDDA 2ZQBA 2IOCA 2YNGA 3IS9A 4BWJA 4KTQA 3DRPA 3I0SA 1JLFA 3P5JA 1JXEA 5CYQA 2QKKA 3CG7A 4N76A 3ZSRA 2KZZA 3C94A 3VQEA 1WNSA 4J2DA 4CJTA 3AVCA 4KHUA 3ITHA 2Z1JA 2HHTA 3QESA 4N56A 4PQUA 2Y1JA 3OYJA 3ZSVA 4HCCA 5FRMA 1YVUA 2RPIA 5I3UA 3AO4A 4YFUA 3OS1A 1KVAA 4CEEA 4DSFA 4FJXA 4CHYA 1REVA 4IDKA 2FBYA 1KFSA 4RW7A 3NCIA 3KKRA 4BDZA 4FK2A 3V81A 3TAFA 4KTZA 5CYMA 2YKMA 1RBSA 3H08A 3T19A 1UA1A 4DQSA 1DTTA 3AVHA 4B3OA 1ZBHA 4CEBA 3B6OA 4AH9A 3HPGA 2Z1HA 5SWMA 3KK1A 4CJ5A 3TAGA 4B8CA 3HM9A 4FW2A 1YTAA 2DFHA 4LH4A 5D3GA 3OYFA 2XY5A 1QQCA 3F9KA 1S9GA 1U49A 3B6PA 4KHWA 2IS3A 4PA1A 5HRPA 4Q5VA 1BCMA 4Y1CA 4W5OA 4DU1A 2WOMA 2HHQA 4GMJB 2XY7A 4E1MA 3K5LA 4N41A 3QLHA 4HUFA 4CF8A 4DSEA 4Y1DA 1SKWA 4DLGA 5CZ1A 4I2PA 1QSSA 4Z4IA 4W5NA 2KW4A 1K6YA 4BACA 4PWDA 1HQEA 5CY4A 4KI4A 3TAMA 2QKBA 1WSGA 4MQ3A 1BQNA 3NH2A 3CFPA 2P5GA 3EYZA 4FZYA 4KV8A 4M3XA 4AHCA 3SZ2A 3SNNA 1W0HA 1T8EA 4L8RB 1T7PA 1ASUA 2GUIA 1SUQA 3EY1A 3V9SA 3A2FA 1CXQA 3SQ2A 4Z4GA 1HRHA 3CM5A 2YNIA 5JS1A 4OVLA 2XY6A 4KO0A 3ZSZA 4E7KA 4DTMA 4JLHA 1CXUA 1RT1A 3ZT0A 4NCBA 1A5WA 4LSNA 3WNHA 4DU4A 1TL1A 2RN2A 4DTXA 1RNHA 1LWEA 2D0CA 4RG8A 1RDAA 4E3SA 2LSNA 2F8SA 1RT6A 4HVJA 3L2WA 4DFKA 2HVHA 1FK9A 3V1OA 1S6PA 3QNOA 1XC9A 3QEPA 2HNYA 4BDPA 3OJSA 3KD5E 4I7FA 4CJRA 4CF9A 3SQ4A 3VQDA 1CLQA 4DFPA 4Z4FA 1SL1A 2JLEA 4JRPA 1TL3A 1BHLA 1WSIA 3HP9A 3TI0A 1Y97A 3VQCA 1TAQA 4E7LA 4B9UA 4CF2A 3IAYA 1GOCA 3TR8A 3D45A 3PV8A 3L3UA 1HYVA 1WN7A 2VG6A 4C8NA 3T1AA 3I0RA 1GOBA 2HB5A 5CZ2A 1Z25A 4FM1A 3NF7A 4CCHA 1C1CA 1LWCA 4C8OA 2DTUA 1SV5A 3O3FA 4DF4A 1NKEA 4J2BA 3KD1E 3MECA 3S9HA 4QCLA 4CEDA 3OVNA 3OJUA 3HXMA 3V9WA 5C24A 5C42A 3OS0A 4CJEA 4RW6A 3M8RA 4M3TA 2IDOA 1NK8A 1W9HA 1JLAA 1IG9A 1BIUA 1IH7A 1ITGA 1EETA 4AHUA 1NK9A 4FJMA 3AO1A 4F8RA 1BGXT 3RR7A 1BI4A 4GVMA 4CGFA 1HQUA 3AA5X 1BL3A 1TK5A 3OS2A 1SKSA 1TK8A 4B9SA 4ELVA 4ELTA 4DFJA 4DSJA 3LDSA 2E6LA 3LAMA 2FBVA 4CGDA 2WONA 3O3GA 3WNGA 3ZSXA 3AVAA 3RMBA 1IKYA 4DQIA 2PZSA 4KHNA 3HT3A 4NCAA 4I9LA 2FC0A 3S3MA 3BGRA 2Q3SA 1VSDA 2YHBA 4I2QA 3JYTA 2RF2A 1RILA 3K2PA 1T03A 1KRPA 4IG0A 3HPHA 3NE6A 2X78A 3L2RA 1VK0A 2KFNA 1TKZA 4CFAA 2D0BA 1J54A 4H4OA 4CHOA 3RMCA 3HK2A 4FJHA 4PY5A 1BQMA 2X6SA 4F2RA 4C8LA 4KRFA 3AA4A 3PX4A 2PYLA 3SUPA 1VRUA 3LALA 3WNEA 3OYLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2Q0UA 2FF3B 3NDKA 1Q8IA 2PAVA 3DWLA 4BGBA 4DTRA 3PO4A 3MXMA 3B8AX 1NJWA 1IBLK 1HNZK 1VRTA 3CCSN 1OVYA 1ZBFA 2KTQA 1GLJO 3G4SN 4ELUA 1QSYA 4E1NA 3A0IX 4CGJA 1QHTA 3RRHA 2XO7A 4CIFA 3J7YP 4JRQA 1EQYA 4CEQA 1NK4A 4JV5K 3DLHA 1S9EA 2E2NA 4IXCA 3NH1A 3SQ1A 5M1FA 4CZJA 2OPPA 3ZETA 1D5AA 3SV4A 2NLXA 2XY8A 2YHYA 1X9MA 4ID1A 3UE5A 2YNHA 2Z1GA 5ADXH 2O8DA 5AQUA 1VAZA 1NKBA 4FOIA 3A5MC 1MU2A 3O4NA 5KGWA 4CECA 3DYAA 4BQLA 4CK1A 4JKFA 5KQ8A 2O4IA 3OY9A 3L6QA 4CZIA 3FE1A 3DI6A 2OZSA 3M8PA 3BZKA 2Q36A 2HBMA 3IMXA 3HI0A 3VETA 3P31A 1NGAA 3TU5A 2QWRA 4IDHA 1U2VA 4FJKA 2HVIA 1GLLO 4BRPA 3PSIA 5DM6L 4FSVA 4O0IA 2HW3A 2WUSA 5J2QA 3RMDA 2W40A 4E0DA 3OYEA 4JKCA 3AVGA 4DUYK 4JYAK 2IIRA 2P9KB 4AHVA 1KAZA 3AVLA 3QEVA 4DWIA 3AGKA 1VSKA 1LV5A 3WXIA 2F9WA 3NVMA 4K8ZA 1TV6A 3EZ5A 3SMPA 1ASVA 2YJFA 5AQXA 4CJKA 1HPZA 4M7YA 3RWUA 3S3NA 3HBTA 5AQIA 1HYSA 3VQ8A 3U9DA 1D4XA 4WCEL 1DLOA 1UOCA 3KK7A 1HJRA 2ZE2A 3KLEA 4BRFA 3J8AA 3ENHA 1TKTA 4RCHA 4K43A 4JKBA 3QEIA 4XIUA 3ZSOA 3SJJA 1SL0A 2D0PA 3IG1A 3KTQA 2W41A 4KPYA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
 2Q0U A;  2FF3 B;  3NDK A;  1Q8I A;  2PAV A;  3DWL A;  4BGB A;  4DTR A;  3PO4 A;  3MXM A;  3B8A X;  1NJW A;  1IBL K;  1HNZ K;  1VRT A;  3CCS N;  1OVY A;  1ZBF A;  2KTQ A;  1GLJ O;  3G4S N;  4ELU A;  1QSY A;  4E1N A;  3A0I X;  4CGJ A;  1QHT A;  3RRH A;  2XO7 A;  4CIF A;  3J7Y P;  4JRQ A;  1EQY A;  4CEQ A;  1NK4 A;  4JV5 K;  3DLH A;  1S9E A;  2E2N A;  4IXC A;  3NH1 A;  3SQ1 A;  5M1F A;  4CZJ A;  2OPP A;  3ZET A;  1D5A A;  3SV4 A;  2NLX A;  2XY8 A;  2YHY A;  1X9M A;  4ID1 A;  3UE5 A;  2YNH A;  2Z1G A;  5ADX H;  2O8D A;  5AQU A;  1VAZ A;  1NKB A;  4FOI A;  3A5M C;  1MU2 A;  3O4N A;  5KGW A;  4CEC A;  3DYA A;  4BQL A;  4CK1 A;  4JKF A;  5KQ8 A;  2O4I A;  3OY9 A;  3L6Q A;  4CZI A;  3FE1 A;  3DI6 A;  2OZS A;  3M8P A;  3BZK A;  2Q36 A;  2HBM A;  3IMX A;  3HI0 A;  3VET A;  3P31 A;  1NGA A;  3TU5 A;  2QWR A;  4IDH A;  1U2V A;  4FJK A;  2HVI A;  1GLL O;  4BRP A;  3PSI A;  5DM6 L;  4FSV A;  4O0I A;  2HW3 A;  2WUS A;  5J2Q A;  3RMD A;  2W40 A;  4E0D A;  3OYE A;  4JKC A;  3AVG A;  4DUY K;  4JYA K;  2IIR A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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