1RBUA

Structural study of mutants of escherichia coli ribonuclease hi with enhanced thermostability
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
155
structure length
155
Chain Sequence
MLKQVEIFTDGSCLGNPGPGGYGAILRYRGREKTFSAGYTRTTNNRMELMAAIVALEALKEHCEVILSTDSQYVRQGITQWIHNWKKRGWKTADNKPVKNVDLWQRLDAALGQHQIKWEWVKGHAGHPENERCDELARAAAMNPTLEDTGYQVEV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural study of mutants of Escherichia coli ribonuclease HI with enhanced thermostability.
pubmed doi rcsb
molecule keywords RIBONUCLEASE H
molecule tags Hydrolase(endoribonuclease)
source organism Escherichia coli
total genus 51
structure length 155
sequence length 155
ec nomenclature ec 3.1.26.4: Ribonuclease H.
pdb deposition date 1993-02-16

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00075 RNase_H RNase H
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.10 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Ribonuclease H-like superfamily/Ribonuclease H 1rbuA00
4FJMA 4M42A 3HPHA 3BDPA 2Z1IA 1SL0A 2P1JA 3TAMA 1NKBA 1BHLA 4AILC 1FK9A 1KFDA 4N56A 5SWMA 4UQGA 1Q9YA 1VRUA 4CGJA 2HHQA 3T19A 3QEVA 1HRHA 3CG7A 2IAJA 2WONA 3S9HA 3MEEA 4B3OA 3WNFA 4CGGA 4E89A 5SZTA 5JS1A 1C0UA 1VRTA 3AVHA 2KQ2A 4Q5VA 3H08A 1VK0A 4CESA 1HNVA 4HUGA 1QS4A 3AVCA 3DLBA 1RNHA 4CGIA 4HVJA 3RMAA 2XRIA 3AVAA 4ID1A 1B9DA 4CF9A 3DRRA 3OYLA 1L3UA 1IKVA 4CFAA 1EXQA 4KAZA 4E19A 4FLVA 4Z4EA 1W0HA 4EZ9A 1QE1A 4F3OA 4K8XA 4C8KA 4FM1A 2ATQA 4JRQA 2XHBA 3V6DA 2HHXA 3CFRA 3SQ4A 1VSMA 1ZYQA 4HTUA 3V9WA 1B9FA 2D0CA 2HHVA 2FC0A 3SQ1A 1JXBA 3QIOA 2X6SA 2X74A 3KK3A 3PO4A 3CFOA 1QQCA 4CF1A 3OJUA 1JKHA 3VA3A 2XY6A 3HJFA 4DSFA 3ZT3A 4OJRA 1TK5A 4G1QA 2HB5A 4CEFA 2Y1JA 1A5XA 3QEXA 5FRMA 4CCHA 4O0JA 3V9SA 4DU1A 3MEGA 3QEPA 1SKWA 5E41A 4KTQA 1BQMA 2GV9A 4KFBA 1D9DA 4FZYA 4FJXA 1WAJA 3U3YA 4CJPA 2XY5A 1X1PA 1YTUA 2A1RA 1X9SA 3OS0A 4DF8A 4N5SA 3L2RA 4FZZA 1HYVA 1TVRA 3NGYA 1GOBA 1EX4A 4ZHRA 3KLHA 4FM0A 2F96A 4OGCA 4FJGA 4OPKA 1U48A 1NKEA 4W5RA 2HHTA 1IH7A 3NH1A 1S6QA 3AVKA 2PY5A 3L3UA 2YNHA 4C8NA 1TK0A 1S1WA 3DMJA 5FDLA 3MXMA 4FJHA 3TAEA 4AHCA 2HNZA 1SL2A 4AHUA 1BI4B 4KB1A 3KD5E 4IG0A 4CJQA 4E7LA 1NJXA 1U47A 1VSKA 3M8SA 1S1XA 2KZMA 1I39A 3CYMA 1BL3A 2ZQBA 4CJVA 1QSLA 1WAFA 1BISA 2E6LA 3OYKA 3NAEA 4E3SA 3VQ9A 1U49A 1LW2A 2JLEA 4W5TA 1SKSA 1TGOA 2YHAA 3OYHA 4DQQA 2Y1IA 4M3WA 3C6TA 3E01A 3VQPA 4ICLA 3AVMA 2E4LA 4YNQA 3S3NA 2OZSA 4O0IA 1XC9A 5C24A 4QAGA 4DTXA 4KKOA 3ZCMA 2NUBA 4F4KA 2HHWA 3ITHA 1LAVA 3OYEA 3ZSVA 3QEIA 4ZTFA 2QKBA 1RDAA 3RRHA 3O3GA 3OYGA 1FXXA 3NF8A 1NK4A 4B9SA 4DSIA 5J2NA 5HRSA 3KIOA 4FLWA 4F3TA 4BWJA 3LALA 4FJNA 1RT7A 1QSYA 1Y97A 1CXUA 4CHYA 3K5LA 4M3UA 1RILA 4C8OA 1NK8A 3LWLA 2G8KA 4CFBA 1S9EA 1B92A 3K59A 4CE9A 1HPZA 2FBYA 1ZBUA 4LSLA 1RTIA 5KRSA 3VQDA 1TKZA 2OZMA 4W5NA 4DSKA 3ZSOA 3VQ5A 2IDOA 3OYAA 1UA0A 1L3SA 4FJ9A 3ISNC 3P83D 3HM9A 4OGEA 1SKRA 4F2RA 3PX4A 4N47A 1NK9A 2OPSA 1JL1A 4DTPA 4JRPA 1VSHA 2EHGA 1JLFA 4F2SA 1WSGA 4IFYA 3VQCA 3NGIA 4E0DA 1EP4A 1U4BA 4FK4A 4HUFA 2QK9A 3V1QA 5FRNA 1RDBA 3ALYA 4EP5A 1SL1A 1J9AA 2YNIA 2B5JA 1BQNA 1NOZA 5HRRA 3NH2A 5CZ2A 4FK2A 4OPJA 3SYZA 1EETA 3ASMA 3OS1A 2ZD1A 4CGDA 1TL1A 4C8MA 3HVRA 1IKYA 1LWFA 1VSDA 3NE6A 3LP1A 1BI4A 4B9LA 1J53A 4RG8A 4M45A 3VQ8A 4R5PA 2F8SA 3HYFA 4DQRA 3AVFA 1HMVA 1REVA 5KTQA 1LW0A 1RTHA 4FJLA 1UAXA 5CYMA 3OS2A 5KGXA 4L8RB 4LSNA 3LP2A 4I2PA 2OA8A 3C95A 1RBVA 1C0MA 4LY7A 3I8DA 3K5OA 2XO7A 3AO5A 3HPOA 4DSJA 1BCOA 4NYNA 4JS5A 1R0AA 1HQEA 2E6MA 3NFAA 4KO0A 3KJVA 4ZTJA 4Z4FA 4I7FA 2FBXA 1RDCA 1JLCA 4Z4IA 3AV9A 4NCGA 4FJIA 1RBTA 4DLEA 3AO2A 3DLEA 3V1OA 3CM6A 3NBPA 2X6NA 1UWBA 3PY8A 3MAQA 4CJLA 2XY7A 1RT6A 3V9XA 1TKDA 1S6PA 1HJRA 3DLKA 3WNEA 4EP4A 4MQ3A 2IOCA 3TAFA 3O3FA 3VA0A 1J5OA 2WOMA 3KK1A 1MU2A 2VG5A 4CJFA 3NDKA 1TKXA 4GMJB 4B9VA 4RW7A 4CJ4A 3KLEA 1KSPA 4Z4HA 3L3VA 3RMCA 1VSFA 4FM2A 2KTQA 4FLZA 4KTWA 1JLEA 2X78A 3T1AA 1KTQA 4CJSA 2OPPA 5J1EA 2HVIA 4CEQA 4DMNA 4XIUA 3WNGA 4KHSA 4PWDA 2HHSA 3THVA 4W5QA 4CEBA 1VSEA 1WN7A 4O44A 3EYZA 4DQIA 1KLMA 1ZBLA 3C94A 4LH4A 4IDKA 2O4GA 3OYNA 4CGHA 4CFCA 4B8AB 3OYCA 4CK3A 3VQ6A 4FLUA 3IAYA 2QXFA 3NF7A 1IO2A 3G10A 2GBZA 2IS3A 1LAWA 3VQEA 3V81A 1RTDA 3SQ0A 4N76A 1TAQA 3S3OA 3PO5A 2G8WA 1NK0A 4JLHA 1ITGA 3VQQA 3TAPA 4HHTA 4CHPA 4CEEA 3DLRA 3L2QA 2HNYA 3JYTA 4CHNA 3K5MA 4CJ5A 3NHGA 5KRTA 4CERA 1NK7A 4FJKA 4DTJA 1XHXA 4EZ6A 3O4QA 2OPQA 1KRPA 3P5JA 4CGFA 1XHZA 3VQ4A 1Q9XA 1KVCA 2VWJA 4KRFA 1D9FA 4KHUA 3DOLA 4M3RA 2DFEA 2XY8A 3U6FA 3DYAA 4BACA 2D0AA 2RF2A 3CM5A 3PUFA 1VSJA 1WSEA 2PYLA 1S9GA 1KLNA 3F73A 3PX0A 3ZT2A 3TARA 3D45A 2B6AA 1C0TA 4CFDA 2YKMA 2Q3SA 3F9KA 5T7BA 4AHTA 2DTUA 3HO1A 4AHRA 2VG7A 3OYBA 4TSXA 4DF4A 3KD1E 3V1RA 3P1GA 3ZT4A 1SUQA 4CIGA 4DFPA 3HXMA 1NK5A 1K6YA 4CEDA 4FCYA 3MECA 5I42A 2HHUA 3HP9A 5HRNA 4KHWA 3DOKA 3A2FA 4HCCA 1ASWA 4Y1DA 3SV4A 2RN2A 5HROA 2R7YA 3SV3A 2PYJA 3TR8A 1VSLA 1NJWA 1EKEA 3U3GA 4LH5A 3SQ2A 2ETJA 5DMRA 3ZSRA 5J2MA 4B9NA 4FW1A 1YTAA 2RKIA 4FXDA 4CJUA 4DWIA 3NH0A 5HLFA 1RBRA 1L3VA 3ZSWA 3C6UA 5CY4A 4B9UA 3SJJA 2KFNA 2P5GA 1JLQA 3LPTA 1U45A 4FJ8A 1DLOA 4CEZA 5C42A 4YFUA 3SPZA 4HCBA 3ZSZA 3TAGA 1IG9A 2LSNA 4FW2A 3LDSA 4CJWA 1N5YA 1F21A 4NCAA 4J2DA 4FVMA 1WSHA 4BWMA 3QEWA 2G8HA 3TWHA 3AVGA 1JLAA 2YKNA 4CF8A 3L2UA 4C8LA 1C6VA 4K8ZA 3K2PA 3B6PA 4KTZA 3QERA 3QNNA 4CHOA 2AJQA 3DRPA 2D5RA 3OYFA 3D0PA 3NF6A 3BGRA 4DU3A 2QKKA 3HVTA 4B9MA 4HUEA 3KLFA 1NJZA 4OLAA 1XWLA 1QHTA 1C1AA 4ELTA 1C1BA 2W42A 4DS5A 3RMDA 3G0ZA 4NYFA 3MEDA 3SUOA 2P5OA 1X9WA 1D5AA 3HT3A 1D8YA 4BDPA 3SUNA 4J2EA 4FJ5A 3ZT0A 3DLHA 4J2AA 3NF9A 4I9QA 4CHQA 4PA1A 1NKCA 1BIUA 1S1TA 3ZT1A 1KFSA 4Y1CA 1RCHA 4AHVA 4BE2A 4OKJA 5KI6A 4CEOA 5CZ1A 4KV8A 3QNOA 5J2QA 2KFZA 2G8UA 4J2BA 1SV5A 1GOCA 1WLJA 1CZBA 1G15A 1Q8IA 3JSMA 4E7IA 4DTRA 3SNNA 4KREA 3FFIA 2VWKA 3HP6A 2G8VA 1CLQA 5D3GA 2KW4A 4H4MA 2FBVA 4M3XA 1L3TA 3RR8A 3RTVA 1T03A 2Z1JA 4CEAA 3S3MA 4NCBA 4DTNA 3SPYA 2BGGA 4FJJA 3T3FA 1QTMA 3OYJA 1JL2A 3KLIA 3RR7A 1WSIA 4KHQA 3DI6A 3M8QA 4DLGA 4FJ7A 2Z1HA 3IG1A 1TV6A 3L8BA 1JLGA 3DLGA 3OYDA 4CJRA 4DFJA 2DFHA 3AA3A 4DFKA 3I0SA 4DG1A 1S5JA 1RT5A 1VSIA 2O4IA 2RPIA 4DU4A 1ZBHA 2GUIA 1WSJA 3I0RA 4CIFA 3SI6A 4Z4GA 3LP3A 3KKSA 3ZSQA 4E1MA 1O1WA 3CQ8A 3IS9A 3QLHA 4ELUA 1NOYA 3SUQA 2YHBA 4OLBA 4M41A 3L2WA 4O5BA 1DTTA 4FLYA 4KPYA 3SCXA 5J2PA 1KVAA 2I5JA 4M3TA 4CF0A 3VQBA 1HNIA 1TL3A 1HYSA 3NGZA 1KCFA 4N41A 3WNHA 2KZZA 1S1UA 4DQPA 3LAKA 4Z4CA 1TKTA 1LWEA 1T05A 1ZBIA 1CXQA 1QSSA 5HBMA 3TAQA 3AA5X 1ASUA 2A1SA 5KGWA 3MXIA 1RT1A 4KB0A 1W9HA 3AVIA 2F8TA 4PUOA 1TAUA 4OKEA 2FBTA 5CYQA 1I3AA 3MXJA 4W5OA 4CECA 3LZIA 3KK2A 3TI0A 4QCLA 3LWMA 2DY4A 2DFFA 3AO1A 1J54A 3LANA 3QO9A 3AVBA 4DTMA 1RBSA 4LD0A 2BDPA 3HPGA 3RMBA 1WSFA 1LWCA 3M8PA 3ZSXA 4B8CA 1T7PA 4IFVA 3HSTB 1YVUA 4E7JA 2IC3A 3K57A 1NK6A 2HMIA 2IGIA 3QINA 4RW6A 3AVJA 3OYMA 2ZE2A 3ULDA 5HRPA 2B4JA 4KI4A 1X9MA 4CJ3A 2G8FA 3K5NA 1UOCA 3O3HA 4FZXC 3L2VA 3UIQA 2VG6A 4PY5A 4Q0BA 4WE1A 1DTQA 4OKKA 1BIZA 1HYZA 3B6OA 2EX3A 4DQSA 4BDYA 4DTOA 4CJTA 4AH9A 3OYIA 5C25A 3KLGA 5I3UA 1N6QA 4IKFA 3LPUA 4RW4A 4RW8A 4BE1A 1TK8A 4FYDA 2HW3A 3AA2A 3AA4A 1LV5A 4I9LA 3M8RA 2OPRA 3O4NA 4FLTA 1ZBFA 4IBNA 1RTJA 1RDDA 5HP1A 1RT4A 5K14A 4B08A 1A5WA 1BGXT 5DK5A 4KHNA 3OJSA 1IKWA 2ITGA 3DRSA 4DSEA 2BE2A 3KTQA 4MFBA 1JXEA 3QETA 4E7HA 1NJYA 2G8IA 1CZ9A 1Z25A 4M3YA 4Z0UA 4AHSA 3SUPA 4M3ZA 4DTUA 2D0BA 3NCIA 2YV0X 1HQUA 4ID5A 3VQAA 2YNGA 1S1VA 3CFPA 4FLXA 3V9ZA 1XI1A 1GOAA 3LAMA 2PZSA 4QOZB 1FKPA 3LP0A 3RRGA 2Z1GA 4DTSA 4O55A 3EY1A 4H4OA 1RBUA 4CJEA 3K58A 3LZJA 4BE0A 3HL8A 3PX6A 4F8RA 4FK0A 3V9UA 1BCMA 1IKXA 4CK1A 4DFMA 3TANA 1JLBA 4DS4A 3IRXA 1A5VA 4IG3A 1Z26A 4CK2A 1C1CA 3VQ7A 3AVNA 4DSLA 4I2QA 3PV8A 3OY9A 3SZ2A 1L5UA 4B9TA 3RWUA 4JS4A 3QIPA 3AVLA 3HK2A 2YNFA 1ASVA 4E7KA 1KVBA 5EU7A 3V4IA 4GW6A 1U04A 1WNSA 2JGUA 2HVHA 1FKOA 4H8KA 4O4GA 5JS2A 1T8EA 3TABA 4CF2A 4CJKA 5FROA 1UA1A 4RW9A 3EZ5A 4GVMA 2OYQA 4KI6A 1RT3A 4BDZA 2P51A 3VN5A 1YT3A 3AO4A 1RT2A 3DM2A 3OVNA 4CIEA 4E1NA 3QESA 4ELVA 4KHYA 4OVLA 4CHZA 3KKRA 3AO3A 3ZSYA 4PQUA 2HNDA 2BANA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3BDPA 5B8HA 3VGKA 5SWMA 1X3NA 3SK3A 1VRUA 1Q9YA 3QEVA 3S9HA 2WONA 4YDUA 3WNFA 3DXMB 3WXLA 3IUCA 5SZTA 5MLCQ 4IEEA 1J6ZA 4ILJA 1VQON 3VGLA 1P8ZA 3DLBA 2XRIA 3THYB 3AVAA 3QBXA 1L3UA 1EXQA 4E19A 5CE3A 5LJWA 2OTLN 4JRQA 1BA0A 2HHXA 3QBWA 4NXNK 4B1YB 3ZX0A 3V9WA 2FC0A 3QIOA 3KK3A 5LMUK 3CFOA 1JKHA 3WQTA 3VA3A 2XY6A 4DSFA 3ZT3A 4LF9K 3L0QA 2Y1JA 4CCHA 1VAZA 1RDWX 5HL7L 3QEPA 3CXCM 3B8AX 4FJXA 1WAJA 1O13A 1YTUA 4A5AA 4N5SA 3JS6A 1N8RO 3HSCA 4ZHRA 1EX4A 4OGCA 4FJGA 2HHTA 1U48A 1S6QA 4JHDB 5AJ3K 2P9UA 4KHPK 2O8BA 2HBMA 3G6EN 5FDLA 2HNZA 3IKMA 4IG0A 3MN6A 1NJXA 3BZCA 1U47A 1S1XA 3CYMA 3SBTA 4I6MB 1TYQA 2ZQBA 4CZMA 4CJVA 5EXWA 4CD1A 2E6LA 1LW2A 4DB3A 2AA4A 2JLEA 2YHAA 1VQ6N 2YCHA 1YJ9N 4IOAL 1R59O 4O0IA 5I9EB 3P4IA 2GELA 1TUYA 4FWMA 4FWSA 1YHQN 4FL9A 2Q1NA 3RRHA 3O3GA 1FXXA 1NK4A 4DR7K 1S3XA 1HPMA 1ZC6A 4B9SA 3KIOA 1YIJN 1Z6RA 4CBUA 3J7YP 4BRNA 2G8KA 1B92A 3K59A 4CE9A 5KRSA 1ZBUA 4M63C 4M7XA 4BG8A 4WQ5A 1U2VA 3THXA 4BR0A 4OGEA 2E88A 4N47A 3OHRA 1WOQA 4DTPA 2EHGA 3VQCA 4E0DA 2FSNA 1EP4A 1U4BA 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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