1RNEA

The crystal structure of recombinant glycosylated human renin alone and in complex with a transition state analog inhibitor
Total Genus 81
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
81
sequence length
336
structure length
329
Chain Sequence
NTTSSVILTNYMDTQYYGEIGIGTPPQTFKVVFDTGSSNVWVPSSKCSRLYTACVYHKLFDASDSSSYKHNGTELTLRYSTGTVSGFLSQDIITVGGITVTQMFGEVTEMPALPFMLAEFDGVVGMGFIEQAIGRVTPIFDNIISQGVLKEDVFSFYYNRLGGQIVLGGSDPQHYEGNFHYINLIKTGVWQIQMKGVSVGSSTLLCEDGCLALVDTGASYISGSTSSIEKLMEALGAKKRLFDYVVKCNEGPTLPDISFHLGGKEYTLTSADYVFQESYSSKKLCTLAIHAMDIPPPTGPTWALGATFIRKFYTEFDRRNNRIGFALAR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase(acid proteinase)
molecule keywords RENIN
publication title The crystal structures of recombinant glycosylated human renin alone and in complex with a transition state analog inhibitor.
pubmed doi rcsb
source organism Homo sapiens
total genus 81
structure length 329
sequence length 336
ec nomenclature ec 3.4.23.15: Renin.
pdb deposition date 1991-12-12

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00026 Asp Eukaryotic aspartyl protease
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1rneA02
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1rneA01
2G94A 5P2JA 3UHLA 5ISJA 3KMYA 5P2WA 4XKXA 4EJLA 4EP2A 4Y4GA 1UH8A 4HDBA 5P0OA 4DJUA 4RROA 5P7EA 1MIQA 1D4IA 3MSLA 5P0RA 3N4LA 4JP9A 1HXWA 2CEJA 3LIVA 5P2TA 3BGBA 5BWYA 1PSOE 2B60A 4CPXA 3PSYA 4BELA 1EPRE 4IVSA 3EKWA 3NU3A 5P4VA 3EM6A 2XFJA 2AZCA 5P4OA 2F80A 3QRMA 4FSEA 2VJ6A 5AHAA 5OZOA 4J0VA 3O9CA 5OZCA 3QIHA 2NXLA 3OUCA 3ZKIA 3K1WA 4LBTA 5P3LA 3O9DA 4LAPA 2QD6A 2VKMA 3S56A 4RVXA 1QS8A 1VIJA 3DV1A 2P3DA 2AVMA 1K1UA 2QI3A 3SM2A 5TOLA 5P5GA 4MC6A 2ZHRA 5P88A 1YTJA 3PHVA 2VA6A 4YCTA 2P8HA 5P3SA 1LYWA 3EL5A 4D83A 4QJAA 3EKXA 2IENA 2O4PA 3BC4A 5P81A 1EC0A 5P1IA 5P78A 4H3GA 5P8GA 1B6KA 5P3ZA 2WJOA 3PBDA 3FKTA 1B6PA 4LL3A 3MXDA 2PH8A 4J1FA 3S2OA 1A9MA 2V00A 1U8GA 3U6AA 1TZSA 2FLEA 5P09A 1EBZA 3IXKA 4J1IA 3TPRA 3SLZA 2PC0A 4Y3GA 4I0IA 4GYEA 4D8CA 1YTIA 5P3YA 5P4RA 1EBKC 4Q1WA 4CPWA 5OYXA 1RV7A 2FGUA 3UDPA 3SKGA 4JOOA 5KR8A 5P5KA 1Q9PA 5P2YA 2QHZA 4F75A 4JECA 3URIA 4CPRA 5P7ZA 1D4KA 2NXMA 4Z22A 4PYVA 4L1AA 4FL8A 5P7JA 3B80A 2WEDA 1FMUA 4Y5GA 1HVLA 2NMYA 3OQDA 4FM6A 5P6RA 5AGZA 5OZ7A 2QNPA 1PPLE 3KT2A 2R38A 5P1PA 2B8LA 4Y51A 1AXAA 3L38A 5P85A 2R9BA 3DV5A 4WY1A 2WKZA 2PWRA 5P3OA 1GKTA 3UDMA 5P0PA 2QI0A 4YCKA 1AJXA 4DQHA 4DQBA 2BJUA 4Y5CA 2IS0A 2OAHA 1XE6A 3JW2A 3HAWA 5P6DA 1W5WA 3R0WA 5P44A 1ZJ7A 5P5UA 3VFAA 5P2ZA 4Y4UA 1M43A 5DQ4A 2PK5A 5P6CA 5HCOA 5P00A 3SA8A 2I4DA 4CPTA 3CYXA 2FS4A 2G27A 2O4SA 1W6IA 3ER5E 3NWXA 4OD9B 2NPHA 1MRWA 2ZHUA 5P2DA 4K9HA 4YBIA 5HDZA 1OEXA 3CKRA 3OQKA 2VA5A 4J0PA 2V16C 4I12A 5P3XA 2O40A 5P43A 1BV9A 4J1CA 3U71A 3EKTA 2ZJHA 4TRYA 2HIZA 2BPXA 3S8IA 5P7GA 5P84A 3OQFA 5P08A 5P4CA 3BUGA 5P55A 4WTUA 5OYSA 5P3QA 4J1EA 3N3IA 5P6YA 2QNQA 3IN4A 1D4YA 4Q1NA 3TTPA 4NPUA 1FQ5A 2G24A 3L3AA 5AHBA 2AZ9A 3SA6A 4PZWA 3IAWA 4B78A 3EL1A 2FXEA 3ZPUA 5P1RA 1MEUA 1XN3A 3NDXA 3QI1A 1T7KA 1MT7A 4Z2ZA 1G0VA 1YG9A 2PYMA 2ER0E 3SO9A 3BUFA 5P8MA 1XN2A 1HTFA 5P4FA 5P5XA 4XX4A 5AHCA 4CPSA 4LXKA 3O9AA 1BDLA 2QMPA 1HSGA 5I3WA 3HD8A 4Y5PA 5P5CA 1FLHA 5P68A 2O4NA 5IVRA 5P57A 2ANLA 3GI4A 4RGHA 5P27A 2ZHTA 5P2QA 4Y5EA 5P2IA 5P8BA 3RTNA 1DIFA 2I4UA 1HSHA 3DCRA 4ZPEA 1WBMA 5P4QA 3PMYA 3URJA 3VG1A 4BFDA 4TRWA 3ZLQA 5P6QA 4Q1YA 5P7UA 2ZYEA 4LC7A 3VV6A 5OZKA 4FIVA 3ZMGA 5P18A 5OZIA 4Y3QA 3SKFA 3URLA 4H3JA 1CPIA 4L7JA 1KJ7A 5P17A 5P34A 5P5LA 5P30A 4J55A 4U7QA 4B70A 5SZ9A 5P50A 5P69A 1CZIE 5P7OA 3HZCA 3K5CA 4GJBA 1IZHA 1XL2A 2JXRA 4YBFA 4GJCA 5P8IA 3SA7A 2IEOA 1FQ4A 1FG8C 5OZVA 2RENA 3D91A 5P19A 2BPVA 3NDWA 3NXNA 5T4SA 4EQ0A 4ZLSA 3LZVA 5JFUA 5P5MA 1TSQA 2Q55A 5SY2A 3SQFA 4FRKA 2Q11A 1KJGA 3LITA 4J0ZA 5P3NA 5P8TA 5P2KA 3EL0A 3EMYA 4RZ1A 5P35A 1LF2A 5P26A 4DPFA 5COKA 1HTGA 1W6HA 1B5FA 2AZ8A 4YD5A 1HHPA 3OTYA 4I0GA 5P5BA 4K4QA 5OZNA 3CKTA 2VNNA 1VIKA 3LPJA 3RTMA 1BV7A 3IA9A 1RQ9A 3EXOA 1UH9A 2ZJIA 2JE4A 1D4HA 1B11A 3KYRA 4B1DA 5J25A 2UPJA 4Y4TA 1E81E 4YA8A 6APRE 1HPXA 4GJ9A 4D85A 3QRVA 5P8QA 5P2CA 1HVSA 3UQUA 5P1QA 1K6TA 3Q70A 4Y5KA 5P5QA 2WL0A 1K2BA 3KF0A 3GGUA 2AOCA 2OHPA 2H6TA 3VEUA 3UQXA 1PSAA 4DV9A 4YD4A 5P6IA 3QS1A 5OZ2A 3GI5A 1UH7A 2VJ9A 5KQFA 3G70A 1HPOA 5HCTA 5P6XA 2RKFA 7UPJA 5AH6A 1FQ7A 2PK6A 3PRSA 5AH8A 4FGXA 5P1JA 1APWE 2NNKA 4F73A 1HBVA 3FIVA 3I6OA 1D4JA 4DJWA 3INHA 5P4GA 1K1TA 1TW7A 4Y3PA 4Z4XA 5P2LA 5P1KA 5DGWA 3DOXA 3TH9A 3SA3A 4MC2A 3MSJA 5I3VA 5P7WA 4OBJA 5OZBA 5P1GA 1BVEA 4QJ7A 3KFNA 5P5ZA 4OD9A 4Y3RA 5OZ1A 3KM4A 3BGCA 1APTE 4Y3WA 5OZ6A 1ZPKA 4H1EA 1IBQA 1WKRA 1HPVA 1ZSRA 1GVTA 2VIZA 5P5HA 3MXEA 4KE0A 3O9GA 5OZ3A 2AODA 2P3BB 3PVKA 5P6NA 1EPLE 5IE1A 4Y39A 3QBFA 2HPEA 5P1FA 3I8WA 4Y57A 5P42A 5P6SA 4Y54A 5P1WA 4ZSMA 5JG1A 1YTHA 2FDEA 2BPWA 1PPKE 1APUE 1HIIA 3EL9A 2P4JA 3NUOA 1ME6A 5P86A 4RRSA 5P8FA 3HW1A 4I0JA 5P4AA 3S85A 3K5DA 1Z1HA 1DAZC 5OZLA 5P8VA 3T7QA 2IL2A 5P3HA 1LF3A 4ZSPA 1MUIA 1LYAB 4DQGA 2O4KA 1KJHA 4ER2E 3UF3A 1PFZA 3Q4BA 4I10A 4DQEA 5P62A 2VIEA 3OUDB 4ZSQA 1HEGE 1PROA 2QHYA 3LIQA 4B72A 3OU1B 1N49A 5P7BA 5P1HA 1MT9A 1RL8A 5P4XA 4I8WA 5P3EA 1HTEA 3WZ6A 4B05A 5P8SA 4Y9WA 3OAGB 5P7AA 5DR4A 2A1EA 5P0KA 4I11A 3LZUA 2CEMA 3GGXA 2FGVA 5P3KA 3I25A 3OTSA 4L7HA 5P1OA 1AAQA 5P13A 4RCFA 1DMPA 4YDGA 2AVSA 5P8UA 1EPME 4XXSA 3ZPSA 4Y3SA 1BWBA 1FQ8A 2Q5KA 5P3PA 4Y56A 5HE5A 3S7MA 3L5EA 2V10C 3KFRA 3VLAA 1LEEA 4D89A 2ASIA 1EPPE 3SABA 2B7ZA 4N00A 2QI7A 1K6CA 2XFIA 1IZIA 3I2LA 2IKUA 3OOZA 4Y4BA 5AH7A 4Y41A 5P49A 5ENMA 2VJ7A 4AA8A 1IVQA 5IS4A 5P67A 3JVYA 3EL4A 5P8OA 4M8XA 2UXZA 5P33A 1B6MA 3OUAA 4J17A 2NNPA 1KZKA 4ACXA 5P3FA 4QJ9A 3RTHA 1B5FB 2PH6A 4RVJA 4OBZB 4A6CA 3VV7A 2QMGA 3IGBA 5OZ8A 2AVVA 1SDVA 2QZWA 4Y5BA 4Y3XA 5KAOA 4Z50A 3VYEA 2QD8A 4YD6A 3Q6YA 2WF2A 5P65A 4GJ8A 4Y5LA 4DUSA 2AVOA 5P7TA 4YDFA 3GGVA 2ZE1A 5DPZA 2FDDA 3EM4A 5P0GA 5P3CA 3JVWA 5FIVA 5UPJA 5P1YA 4Y53A 3ST5A 3QBHA 3VCMA 1EEDP 5P46A 2ZJNA 4APEA 1TCWA 2R3WA 3S7LA 3TNEA 1EC1A 1Z1RA 3OXWA 3UPJA 3ZKXA 4R5NA 1KJFA 2F3EA 1DW6C 3H0BA 3DJKA 4B1EA 2QNNA 5P14A 5P2GA 1FF0C 2ZHSA 4NPTA 1APVE 3LZYA 5P7CA 4Y45A 4J0YA 3DK1A 4F74A 5P0DA 2J9KA 4DQFA 2WEAA 5P3JA 2R43A 4DJOA 1DP5A 2I1AA 5IVSA 3TOHA 3ZKGA 5P0BA 5P1BA 1ODYA 4OC6B 3T11A 1NPWA 3BVBA 4HA5A 5P6VA 2HM1A 4EQJA 5P7MA 2ZGAA 3DCKA 3GI6A 5DR3A 3UFLA 4Y5AA 5P4HA 2WF3A 5BRYA 3D20A 1D4SA 5AH9A 3Q3TA 4YOAA 1EPNE 4EPJA 4A4QA 1B6JA 3Q5HA 3T6IA 1MVPA 4JPCA 4CP7A 3NSHA 4ZSRA 3O9IA 1EPOE 2XYEA 4GMIA 4U7VA 5P41A 3S43B 5P2NA 3WB4A 2QZXA 5P6EA 3D1ZA 3OHHA 5OZMA 5P0CA 5P2EA 3UDNA 5P0SA 2P3BA 3NU6A 3LPIA 5P3GA 5BS4A 4J0TA 3APRE 5OZQA 4KE1A 4K8SA 5P7XA 1SIVA 2FMBA 4Y43A 5P23A 3OXXA 4I1CA 3BHEA 4Y3JA 3ECGA 4GJ7A 1C6XA 5P58A 5P7SA 1FKNA 3OADB 1RNEA 5P05A 1AZ5A 2QU3A 3KT5A 5P7YA 5P2SA 5P31A 2G69A 5HU0A 5P0XA 4QLHA 1GVWA 3ZKSA 1LYAA 1GNNA 5P8NA 2HAHA 3VSXA 3CKPA 5P5RA 1BBSA 3S45A 3OU4B 4Y44A 2AOFA 5P4KA 5KQYA 5OZEA 5P80A 2R3TA 3OUDA 4FS4A 5P83A 2FNSA 3OU1A 4X7IA 4EXGA 5OZ5A 4GJAA 5P3UA 3UQPA 3PSGA 1IDBA 4S1GA 2Q3KA 3OAGA 4XX3A 5HTZA 1LYBA 3K4VA 2OHUA 2ER6E 3F9QA 2FNTA 1ENTE 5P6WA 1HWRA 2H6SA 4H3IA 3NR6A 5P3VA 3ZKMA 2R5QA 4GIDA 5P7IA 4Q1XA 5P73A 5OZGA 4ZEAA 3O9BA 3R2FA 2Q54A 4Y3YA 1NSOA 2HB3A 3BXRA 5P0HA 2ER9E 2WF1A 5P7FA 3KMXA 3KFPA 4L6BA 4Y36A 5P4UA 5P8EA 1GVUA 3UTLA 2Z54A 4QJ8A 4EJKA 3FSMA 5OZFA 4NJVA 2VS2A 1BVGA 1A30A 5P0VA 5P1SA 3SFCA 2OHKA 5P0UA 1PPME 5P4BA 1BILA 1SBGA 1RPIA 2PYNA 5OZZA 1W51A 5P8KA 5P3RA 4OBZA 2WEBA 5HE4A 2I0AA 2EWYA 3R0YA 2I4VA 5KR2A 5P89A 5APRE 3PGIA 2QHCA 2G22A 1HTRB 2AOEA 2JYSA 1W5YA 4Y4JA 5P5FA 4I0EA 4Y58A 1M0BA 3ER3E 4GB2A 2OHRA 1Z8CA 3B7VA 4RRNA 2UY0A 3QP0A 1GVXA 3SA4A 5P07A 1DPJA 3UFNA 4PZXA 2B42A 4Y4XA 2QK5A 3NU9A 2PQZA 5P2BA 4A6BA 1G35A 3LHGA 4EJDA 1ZBGA 2ZJLA 5P2OA 1T6EX 2PSVA 5EZZA 3HVGA 1MRXA 3CYWA 4HDPA 4OBDA 4Y3HA 2OHNA 4HLAA 5P2UA 5P3TA 1HIHA 1MERA 2OHTA 3VUCA 3QAAA 4RCDA 2OHSA 3PBZA 4LHHA 3K4VC 5E5KA 2ZJKA 5P66A 2F8GA 1HPSA 1HVCA 3TOFA 5P0YA 2AQUA 4EXHA 3D3TA 5OYVA 2QI1A 2HS2A 1EC3A 1T3RA 3C9XA 5OZYA 5OYYA 5P4ZA 4ER4E 4X2LA 2RKGA 5P01A 2BBBA 2QZLA 1IZEA 5HVPA 5P28A 2AIDA 1ZPAA 3R1GB 4Y4WA 4RVIA 4F76A 5P7NA 3DUYA 2PSUA 1F7AA 2G1RA 5P5EA 1HVHA 3OWNA 1OEWA 4OC6A 1EBWA 2G1YA 4FE6A 5P64A 4GJ5A 2QD7A 4CKUA 5P63A 4B77A 4DPIA 2I4QA 1MTBA 2FIVA 5P6GA 1HVJA 3UDRA 5ER2E 1ZP8A 3GGAA 1W5VA 2V0ZC 5DQ5A 2NTRA 1XDHA 5P75A 3QVIA 4Y4DA 4YE3A 4Y50A 2J9JB 1FEJC 5P0ZA 1E82E 3S43A 5P10A 5DQ1A 2I4XA 4AZYA 3UDQA 3AUPA 3BVAA 3D1XA 3EC0A 2IDWA 5P36A 1ER8E 3SA5A 5P8AA 5P7QA 4QGIA 4Y3EA 5P39A 5P6PA 1YX9A 4KUPA 2WEZA 1BXQA 1HRNA 2IQGA 2OF0A 4OBKA 1LF4A 2CENA 2JJIA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 2G94 A;  5P2J A;  3UHL A;  5ISJ A;  3KMY A;  5P2W A;  4XKX A;  4EJL A;  4EP2 A;  4Y4G A;  1UH8 A;  4HDB A;  5P0O A;  4DJU A;  4RRO A;  5P7E A;  1MIQ A;  1D4I A;  3MSL A;  5P0R A;  3N4L A;  4JP9 A;  1HXW A;  2CEJ A;  3LIV A;  5P2T A;  3BGB A;  5BWY A;  1PSO E;  2B60 A;  4CPX A;  3PSY A;  4BEL A;  1EPR E;  4IVS A;  3EKW A;  3NU3 A;  5P4V A;  3EM6 A;  2XFJ A;  2AZC A;  5P4O A;  2F80 A;  3QRM A;  4FSE A;  2VJ6 A;  5AHA A;  5OZO A;  4J0V A;  3O9C A;  5OZC A;  3QIH A;  2NXL A;  3OUC A;  3ZKI A;  3K1W A;  4LBT A;  5P3L A;  3O9D A;  4LAP A;  2QD6 A;  2VKM A;  3S56 A;  4RVX A;  1QS8 A;  1VIJ A;  3DV1 A;  2P3D A;  2AVM A;  1K1U A;  2QI3 A;  3SM2 A;  5TOL A;  5P5G A;  4MC6 A;  2ZHR A;  5P88 A;  1YTJ A;  3PHV A;  2VA6 A;  4YCT A;  2P8H A;  5P3S A;  1LYW A;  3EL5 A;  4D83 A;  4QJA A;  3EKX A;  2IEN A;  2O4P A;  3BC4 A;  5P81 A;  1EC0 A;  5P1I A;  5P78 A;  4H3G A;  5P8G A;  1B6K A;  5P3Z A;  2WJO A;  3PBD A;  3FKT A;  1B6P A;  4LL3 A;  3MXD A;  2PH8 A;  4J1F A;  3S2O A;  1A9M A;  2V00 A;  1U8G A;  3U6A A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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