1RQM | Genus

Total Genus 35

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	35
sequence length	105
structure length	105
Chain Sequence	b'ATMTLTDANFQQAIQGDGPVLVDFWAAWCGPCRMMAPVLEEFAEAHADKVTVAKLNVDENPETTSQFGIMSIPTLILFKGGEPVKQLIGYQPKEQLEAQLADVLQ'

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Solution Structure and Backbone Dynamics of the K18G/R82E Alicyclobacillus acidocaldarius Thioredoxin Mutant: A Molecular Analysis of Its Reduced Thermal Stability. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Thioredoxin
source organism	Alicyclobacillus acidocaldarius
molecule tags	Oxidoreductase
total genus	35
structure length	105
sequence length	105
ec nomenclature
pdb deposition date	2003-12-05

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF00085	Thioredoxin	Thioredoxin

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1rqmA00

1YY7A 1K3YA 4KB3A 1T1VA 5IO0A 3LEFA 3BJ5A 1K0OA 4EVMA 3KTLA 1M2AA 3E3EA 1EOHA 4K7NA 1S3DA 3SWLA 1BX9A 2FY6A 3LYKA 4GQCA 4N11A 4TXOA 1OC9A 1ZMAA 2C3TA 3LSZA 1NW2A 2BJXA 4JE1A 4X1UA 5DALA 4PNGA 4HI7A 2M72A 1Y25A 2O87A 1ERWA 1T7PB 3M9JA 4XRAA 5IO2A 3FZ4A 3EVIA 2FWHA 2M80A 4HU9A 2GT6A 1XPVA 4KSOA 3ED3A 5DJLA 2HFDA 2LJKA 2GSRA 3GHAA 3FY7A 1T00A 4QL7A 5HR2A 1K0DA 3TKRA 1BG5A 1OC3A 1YKCA 4KDUA 3G7IA 4HEA2 2JSZA 3TGZA 2LJRA 1K0CA 2F8FA 5HR0A 2YV7A 2H72A 2ON7A 3EMXA 1GP1A 2H0GA 3MDKA 4K9ZA 3RPPA 5KN1A 2XPDA 3M1GA 5CNWA 1GTBA 3FR6A 1GSQA 1SKWB 3WGDA 2C0EA 3ZFBA 1NM3A 2HE3A 3WGXA 2R3XA 5AGYA 4PUAA 3UVTA 2VL2A 1T8EB 4N10A 4WF4A 3TJJA 5E4WA 3TJKA 2WCIA 2REMA 4I5QA 4AJ8A 1TRVA 1QFNA 4YAVA 1YDKA 5JCWA 2DJ1A 1B9YC 3KZQA 2LEGA 3CBUA 2LUSA 2B5YA 2RUFA 2CX3A 3HY2A 2IIYA 3KH7A 5ECKB 4F0BA 3VWUA 2PU9C 4LL4B 4DSQA 3ZFLA 1GSFA 3IRAA 3HVVA 2TRXA 2L4CA 2MMOA 1Q4JA 3M0FA 5IMDA 4NAXA 3KEBA 3L9UA 5D73A 3EYTA 2DJ3A 3KMOA 4WF5A 2JZTA 3QFAC 3EURA 1KNGA 2N5FA 4KSMA 2Z9SA 1HNAA 3DKSA 2ZNMA 3HCZA 2B6MA 2E0QA 5IM9A 5F8BA 9GSSA 2LSTA 4O5RA 3GV1A 2H19A 1DBYA 5CREA 1KTEA 1BJXA 3F63A 5J9CA 2MBSA 2OA7A 3UAPA 3PINA 1WJKA 5DAKB 5C00A 1VGLA 1Y6EA 1I5GA 3IAM2 2V6KA 2L4QA 3LQ7A 2I4AA 2J9HA 6GSYA 1K0NA 4TXVA 1HD2A 3ZIJA 2ALBA 5A4WA 1WMJA 4K0NA 4OFTA 3QDNA 5G5FA 5H5QA 4WKWA 3JCML 5IMAA 2H74A 2HLSA 5FT3A 1SL2B 2C8UA 4GSSA 4PNFA 16GSA 1THXA 2JZRA 1Z6NA 3KCMA 1TTZA 5FWGA 3WYWA 1PQNA 5F05A 1TDIA 1A8LA 11GSA 3ZZXA 4I8BA 3IR4A 5JWRB 2OKAA 2HZFA 4JBBA 4IKHA 3L0HA 4ZL8A 1MDKA 4NHWA 4CHSA 4LMVA 3S9FA 2DC5A 4ZBDA 1XXUA 2JSYA 3TUEA 1V9WA 2YZHA 2NBSA 1HNBA 5ECNB 4G19A 4MA9A 1A23A 4IN0A 4PXOA 1OKDA 4MZCA 1PX7A 1J9BA 3GSSA 4JRRA 4OWYA 3UEMA 1TK5B 1MD4A 3IK7A 2G2QA 3N5OA 2ZCTA 3KJYA 3KTBA 6GSWA 2YN1A 4ECBA 2K8SA 1MD3A 1M2DA 2AHEA 2K6VA 1XCCA 2CQ9A 3AY8A 4WBJA 3D5JA 1DSBA 1BYEA 2YPMA 3Q18A 2H76A 5H5RA 5FHIA 4GF0A 1NHOA 3EU4A 2OE1A 3D0ZA 2WFCA 1SYXA 2JL4A 5J5NA 4KW6A 4X43A 1KEBA 2LS5A 5F0GA 4Q5QA 4O32A 2F51A 1XIYA 2OJLA 2H1DA 2CT6A 2GZYA 4TVEA 4LMWA 1GUKA 1F9MA 1H75A 2IPAA 4KDYA 1M99A 2CV4A 4TRXA 3DMLA 2HYXA 5J9BA 3GIXA 2JADA 1O7UA 5IPGA 2LQQA 2AJQB 10GSA 4KDXA 4K2DA 1TU8A 2H1AA 1B4QA 2HT9A 3C1RA 1AIUA 3LORA 3TOUA 2IL3A 5L71A 3CSJA 2AAWA 3GYKA 4I2UA 19GSA 4TR3A 1XZOA 1WOUA 3VLNA 2YCDA 3J7Yb 4DSSB 4LLRA 2WB9A 4EO3A 3F9UA 3FRCA 3UIWA 4EKZA 1JZOA 5AIXA 5J3RA 2H66A 1GTUA 3HD5A 5G1KA 1K0BA 2DMLA 2IMFA 4EDYA 2FWEA 2RUEA 2FLSA 1X9MB 1OC8A 1O8WA 3GX8A 2MBTA 4WETA 1XWKA 3Q6OA 4CDOA 1XW5A 2H1GA 3IXRA 5F06A 3GH9A 4ZILA 1EOGA 4XCSA 5B6NA 3HJMA 3APQA 4XS1A 3UVHA 4QQ7A 5ELGA 4TR0A 1AUCA 3APOA 5KN3A 4IGJA 2YZUA 3A3TA 3ZMKA 3HA9A 1FVKA 2VUPA 4JU5A 2B1LA 3GL5A 4HDEA 1QXHA 2I9HA 4AJ7A 4F03A 4PGTA 3Q74A 2FCHA 5IMCA 2DJ2A 1G7EA 5IQYA 3I43A 3I69A 2PERA 2QKEA 3ERWA 3MSZA 3KD0A 5ECLB 2C3QA 2HZEB 4GSNA 2GSTA 3A2XA 2B7KA 4H86A 2EIQA 3GKKA 2B3SA 2DMMA 2V32A 5F07A 2VO4A 4ULXA 1YKAA 4RI6A 2D2ZA 3TRPA 3EWLA 3A2VA 2YV9A 5A5KA 4IQ1A 4K6XA 1MDIA 3FYGA 1X9WB 2HRNA 1YZXA 1ERTA 3VFIA 5CRWA 1B9XC 4XTSA 4HZ2A 1OYJA 1WPIA 2R6KA 2PVOC 3UL3A 2V2GA 5ECRB 3TJBA 1EEJA 2WZ9A 2VLUA 5EVOA 5GSSA 5DBQA 1B4PA 3HKRA 2LRTA 2P0GA 4NMUA 1PL2A 2VOCA 3RBTA 2H30A 3ZVJA 4OCEA 1K0AA 1KBNA 5HR3A 3P2AA 4ZB9A 3CMIA 2DJ0A 5ECIB 1EV4A 3ZYWA 1O73A 4ECCA 4KAEA 2JACA 4F0CA 2H6YA 2KUCA 4WEYA 3TKSA 5HR1A 2YP6A 3LG6A 3BBYA 2LQOA 4FYCA 4OFNA 1ERUA 2OADA 2CAIA 3ZIVA 5G31A 3K8NA 1XWAA 3ME7A 2IJYA 2PPTA 3F6FA 2B5XA 2L6CA 3H93A 1RW1A 2FUG2 1I9DA 1TKDB 3QR6A 3KMNA 3FR9A 2VL2C 1GSYA 2E2MA 2HZEA 4MZWA 2K9FA 1GSEA 1M9BA 2TRCP 1TP9A 5G5EA 4DSRA 3GN3A 2B1KA 2E2GA 3M8NA 3TOTA 3FHKA 3C71A 2IMIA 3O3TA 20GSA 2OACA 2WRTA 3EINA 2FGXA 3GKNA 3VPTA 1T4YA 1EZKA 1RQMA 2DJJA 2L5LA 2CAQA 2VCQA 4K0GA 1YF1A 1J08A 2H0IA 2VCTA 2X8HA 1TRUA 1A0RP 4EF0A 1MDJA 2MYGA 1F37A 3UBKA 3QAGA 1WRYA 4EL1A 4L5LA 4V1Ag 5DCGA 1Z5YE 2PGTA 1IYHA 4POKA 2BMXA 4MH2A 2P5RA 1GTIA 2YWMA 5JCGA 1TI1A 1OAZA 3QOUA 3ISOA 4KNDA 3GFKA 3IK9A 1Z7RA 3D4TA 2K18A 3US3A 3ME8A 1QUWA 1Z6MA 5GZZB 5J41A 1PN9A 2A2RA 4IJIA 3GSTA 4AJ6A 4OFMA 3KGKA 3O6TA 2LRCA 3SBCA 1OE8A 3DIEA 1U6TA 3V1WA 3QAVA 2QGVA 4YQMA 1GWCA 1ZYEA 5HFIA 1PMTA 4YH2A 3FKFA 4X0XA 5LNKe 3IV4A 4FYBA 2WS2A 4ML1A 3KXOA 3KIJA 5ECQB 4I6XA 1V2AA 2L6DA 4TN8A 2L59A 1O85A 4J56E 3HZ4A 2OE3A 4GWRA 4MK3A 1R26A 2KP2A 5ELAA 1PD21 5CRDA 2V1MA 2VAFA 1THOA 3UOMA 4E8EA 1QK8A 5EL8A 4GSTA 1PA3A 4KA0A 3ZL5A 2DJKA 4F82A 4ECJA 3ZREA 2GTUA 2O89A 3VI5A 4NV5A 4XS4B 4ZXGA 3NIVA 4YQVA 2RLIA 3IC4A 4HQZA 1U3IA 2X8CA 4ZB6A 1SU9A 3DVXA 2IMKA 1TW9A 1X0RA 1TJDA 2VL9A 2VM1A 1F6MC 1OE7A 4HJ2A 5HQPA 3UMAA 1ST9A 4XRDA 1HNCA 3WT2A 3CYNA 2VLTA 2PMTA 1YQ1A 2VLVA 5G1LA 3IAS2 2IMEA 4HZ4A 2HI7A 1UC7A 3D22A 4MDCA 2LTKA 1S3AA 4GCIA 3VK9A 3GKXA 4AF2A 4CW9A 4KCAA 3UARA 1PSQA 2EC4A 3H4KA 1WIKA 3L4NA 2L5OA 2I81A 3VPQA 4HU7A 5CAXA 4RQXA 2RM5A 5B6MA 1AAZA 1V98A 3F4TA 4EC0A 1FO5A 2P31A 3GUSA 3L9SA 3CSHA 3Q19A 5ENUA 2WGRA 2KLXA 1A2LA 3EU3A 1FB6A 2LNSA 1BQ7A 4F2IA 2LNTA 4NHZA 2QSIA 2B7JA 3GH6A 4V2LA 2K8VA 2AV4A 4EUYA 1FOVA 5B7CA 1SK1A 2F8AA 1AQWA 3TKPA 1XVQA 3HXSA 2PUKC 4ZBBA 1G0TA 2GQKA 5JWOB 5G2ZA 1M7TA 2C4JA 5DAKA 1XWGA 4IP1A 5A4UA 2ES7A 4MJAA 5E59A 3BD2A 4ISDA 1GNEA 4N30A 3UBLA 1GLPA 1RK4A 2WULA 1FW1A 1CQGA 1XW6A 1U3AA 2AUVA 3QMXA 2X64A 4BVXA 4JR4A 4YAPA 3APSA 3GTUB 2CVBA 3W8SA 1UN2A 2HSHA 4KCEA 3C1SA 1X5DA 1FG4A 4Z7XA 2YOIA 2ZUPA 4OCFA 1XFLA 3E9JB 3FK8A 2GZZA 1JZDA 2X99A 1G6YA 4FIWA 3ZMLA 5ABRA 2OE0A 1FHEA 2IMDA 1QQ2A 1YJ6A 1R7HA 4POBA 1SJIA 1AQXA 1O6JA 2R5GA 2C0GA 3CTFA 5GAND 1NHYA 5B8AA 3KP9A 3TCOA 3GA4A 3LFLA 1PKZA 4TW5A 3GMFA 3HYPA 3TJGA 5IMVA 3D4MA 1GSUA 1B48A 2VCVA 6GSTA 2PN8A 3DGQA 4LL1B 1K3LA 4IQAA 4Q5RA 4NXIA 7GSSA 1DUGA 1FB0A 3LXTA 2FA8A 2GSSA 4BVYA 1OVNA 4ILFA 2LV3A 3DD3A 4NPBA 4P3YB 2HRFA 4BWQA 2R2JA 2H70A 2X8GA 1VF2A 4MMMA 1EV9A 4BL7A 3QFBC 2F3MA 1N8JA 1EGRA 3FW2A 2I1UA 2FA4A 1YEXA 6GSUA 1F2EA 4K7OA 2GVPA 3F8UA 2FWFA 3GTUA 4TOPA 3WT1A 3WGEA 3CTGA 1Q98A 1URMA 1HQOA 2EIOA 2N5BA 4RQRA 2MMZA 3RHBA 3FZ9A 1TXXA 2R37A 2V41A 3P7XA 4L5OA 18GSA 3DXBA 2J23A 3PH9A 1B8XA 4TXOB 4IBPA 1A8YA 5D8IA 5HFKA 3ERGA 4TR1B 1LJRA 4KH7A 1JZRA 4MP4A 5DALB 1EP7A 1T3BA 2GZPA 2IN3A 4IS0A 3TKSC 1E2YA 4AGSA 4KGIA 3TDGA 1PKWA 5ECMB 2KOKA 1ERVA 4DSSA 5JCUA 3LYPA 1UVZA 2N5AA 3F3QA 3HDCA 4IP6A 1LU4A 3QCPA 1GSDA 2HNLA 1DE2A 1ZOFA 1R5AA 4OO5A 1FVJA 1V57A 2BTOT 4IVFA 3MNGA 2MMAA 1AQVA 2O7KA 1SK0A 1SL0B 1GLQA 2FHEA 1CQHA 4DVCA 4HOJA 1PX6A 2DLXA 1ZZYA 3NOFA 4JEDA 1LBKA 3PR8A 3EE2A 1T4ZA 4Q5NA 1O81A 2HSYA 1F3BA 2LRNA 2WDUA 5D9XA 2H6XA 4RI7A 2KHPA 3W8JA 1EP8A 3RHCA 3E0UA 4V1Ap 5EY6A 4TR4A 1ZCPA 4IJ3A 1PL1A 4RUVA 1EGOA 2PWJA 1C72A 4XHMA 1DE1A 1GTAA 3GNJA 4GXZA 5EPFA 3F4SA 4PURA 3U6VA 3C8EA 4ZB8A 1XOBA 3D6IA 3ZVJD 5ID2B 2FNOA 5D9WA 2C0FA 4MF7A 4TKYA 2JZSA 1S3CA 3W6GA 3GX0A 3OR5A 4XIHA 2I3YA 3LJRA 4NV2A 3FZ5A 3VWVA 4TR1A 4ZL9A 4MH3A 4POMA 1F3AA 3L78A 3HVXA 1TRSA 4K8MA 1G6WA 1WWJA 2GDRA 4ID0A 3I9V2 2C80A 4IW9A 3TB2A 4GTUA 5LD0A 1A2MA 2CX4A 4E8HA 2XC2A 4KUNA 1A2JA 4G2EA 5A4VA 4JZQA 1TOFA 3HVSA 2F9SA 4LA1A 2RM6A 1Z3EA 1VF3A 2CVKA 2P5QA 1Z9HA 2TIRA 4N0VA 1K0MA 1MEKA 3A2WA 4BWSA 3RAZA 1BEDA 1XWBA 4EDZA 3VURA 1YF0A 3N9JA 5IOXA 3FR3A 2A4VA 1SK2A 2KP1A 5ECHB 2JU5A 1SENA 1QGVA 4L0UA 3UJ1A 3P90A 4GQFA 2DIZA 3IE3A 4WBRD 3QAWA 5ID2A 1TRWA 3GKMA 2C1YA 3FZAA 4BPYA 2GGTA 2ON5A 1AW9A 3O76A 2QC7A 1ZL9A 6GSVA 1SD9A 2A2SA 14GSA 2AYTA 4K7IA 2VM2A 2H75A 3VWXA 3DEXA 3CSIA 1SJ6A 1XWCA 5CYYA 2VCXA 2DIYA 1TU7A 1WP0A 1A24A 6GSXA 4V2NA 2CA8A 2MMNA 3MWHA 3H79A 4NWYA 1GL8A 1VF4A 3HZ8A 3BCKA 2NPBA 5JWQB 3CXGA 2RIIA 4OMVA 2XBIA 4G9HA 2C3NA 4ZL7A 4XS6A 4PUFC 5CP1A 3U5RE 4MF5A 6GSSA 3IOSA 3ZRDA 3GURA 3DYRA 4N0ZA 3NZNA 5IPHA 3BOAA 3IPZA 3H1NA 1HYUA 4MJBA 12GSA 1OKTA 1ABAA 3HJPA 2GSQA 1ACVA 2XBQA 3EMPA 3GRXA 5H5SA 5C04A 4EXJA 2XPEA 3C73A 5IMFA 2H01A 4MPGA 3CRUA 1AC1A 1MTCA 4ML6A 3H8QA 2VL3A 1V40A 5HFGA 4KX4A 1BAYA 4MABA 4MLYA 1U88A 1A0FA 3F4RA 3GL3A 3J7Yk 3G7YA 3EC3A 13GSA 5GSTA 1ON4A 1V58A 5ECOB 2OBIA 3HHVA 2DBCA 2G0FA 3KM6A 4FYUA 1USBA 2CZ3A 5J4UA 5AN1A 3ZTLA 4JR6A 4O7HA 2H6ZA 2NVLA 4BA7A 1SKRB 3KH9A 4HQSA 1M9AA 2H1BA 4WR4A 3DWVA 2VD1A 5DQYA 3M3MA 4MJCA 5CRGA 1JLVA 3BCIA 4KE3A 3IDVA 1M2BA 3G7JA 2C0DA 4O92A 4G10A 1SD8A 2CVDA 4PX1A 1QMVA 1XBSA 5AIVA 3D21A 5ECPB 1GNWA 4IELA 4L8EA 1N2AA 5GAPD 4XS4A 4WR5A 3VI7A 2YWIA 4MJEA 4MCUA 2IFQB 3RDWA 1G7OA 2VCZA 2LKUA 5KN0A 3KP8A 1PRXA 3QD9A 1FAAA 2L57A 3PGTA 3ZLPA 4J2FA 4K1FA 3F6DA 1X9SB 1GSSA 2NDOA 2V6OA 5DQSA 4ECIA 1X5CA 2GQLA 1SKSB 4FO5A 1GH2A 4QL9A 3ERFA 4I2TA 1XW9A 3L9VA 5CRHA 4MPFA 3F0IA 5IOWA 17GSA 1SL1B 3A5WA 4HJMA 4I97A 2PVQA 3TKQA 3G9BA 8GSSA 4HUAA 4V2MA 3ZITA 2M46A 1ILOA 2YJ7A 2HXKA 1JFUA 2LJAA 1U87A 1O8XA 3RPNA 3FEUA 1M0UA 5D9VA 4GLTA 3TRQA 1W4VA 3LWAA 3HJOA 1JZWA 1VRSD 2R4VA 3WD6A 3IHQA 3CRTA 5G30A 4D73B 5D9TA 1R5PA 22GSA 3M9KA 2FD3A 5CO3A 5DVBA 3C7MA 4DEJA 2OBKA 4J57E 5IMZA 4HS1A 5COHA 1J0FA 5KEJA 3TKSE 1SJZA 1XVWA 1GUHA 1JHBA 5AISA 2GS3A 2GT5A 4ACSA 1TK0B 2YWOA 3IBHA 1WE0A 4OD7A 2H73A 2IFQA 1ZGNA 2VIMA 1Z7PA 1NSWA 3DRNA 5KN2A 4PQHA 1TI3A 2H0HA 3F3RA 4ZBAA 2PBJA 2VD0A 3QPMA 5D96A 2O8VB 2H8LA 5DCHA 3DVWA 2H71A 4IHUA 2YANA 4MF6A 3LGCA 4MZBA 2E7PA 5LCZA 2WJUA 1H4OA 4PQ1A 2EIRA 1OC9B 2NTOA 5B8BA 1JLWA 1AXDA 2AB6A 5IIZA 1TK8B 2MZCA 2YNXA 1E6BA 5DJMA 2GQMA 4PQIA 5INYA 1W89A 4POLA 1VF1A 1ZYQB 3TJFA 1X5EA 2DSAA 2O85A 1EWXA 4OO4A 1R4WA 2B5EA 3MAKA 3TRXA 3LXZA 4D73A 4EE0A 2GLRA 1UA5A 2VCWA 4GRFA 1EEMA 4ZIJA 2CZ2A 3VWWA 4FH8A 4F9ZA 3P8WA 4Q5FA 3I6AA 5DDLA 2XHFA 2FWGA 4L0WA 1ML6A 4WXTA 1GUMA 2IWTA 1GULA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

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#chains in the Genus database with same CATH topology
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