1RQMA

Solution structure of the k18g/r82e alicyclobacillus acidocaldarius thioredoxin mutant
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
ATMTLTDANFQQAIQGDGPVLVDFWAAWCGPCRMMAPVLEEFAEAHADKVTVAKLNVDENPETTSQFGIMSIPTLILFKGGEPVKQLIGYQPKEQLEAQLADVLQ
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Solution Structure and Backbone Dynamics of the K18G/R82E Alicyclobacillus acidocaldarius Thioredoxin Mutant: A Molecular Analysis of Its Reduced Thermal Stability.
pubmed doi rcsb
molecule tags Oxidoreductase
source organism Alicyclobacillus acidocaldarius
molecule keywords Thioredoxin
total genus 35
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-12-05

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1rqmA00
4GQCA 3IAM2 3FZ9A 3I69A 5HR1A 5DAKA 4OFNA 2GQMA 3GL5A 3ERWA 2IMFA 1BJXA 1SU9A 4D73B 4L5OA 2HLSA 1AUCA 1ACVA 3CRUA 1LU4A 3M9KA 1G6YA 2VCQA 4ZL7A 1KNGA 3GUSA 3MSZA 6GSUA 2FWEA 3QPMA 1R4WA 1X5EA 3RBTA 2LQOA 1H4OA 5H5RA 1YKAA 1B4PA 2RM6A 2JACA 1XBSA 1V57A 5AIVA 2BJXA 2PMTA 4EXJA 4IELA 5JWRB 1GUHA 1YF1A 3D4MA 6GSWA 22GSA 2QKEA 2DJ3A 1K0DA 1HYUA 1UVZA 5ECLB 5D73A 1V9WA 1I9DA 2J23A 1M7TA 2F8AA 2MYGA 4POMA 6GSVA 4GRFA 4ZL9A 5F05A 5ELGA 2PUKC 3TGZA 1B9YC 2H01A 1A24A 2CVDA 2PN8A 3ZMKA 1A0FA 2HRFA 3L9SA 4MK3A 5B8AA 3DIEA 3GH9A 2H0IA 4XS4B 4OFMA 5DQSA 3E0UA 7GSSA 2F9SA 1GNWA 2LUSA 5B6NA 1WMJA 4PXOA 2J9HA 4BWQA 2YJ7A 2LRNA 3W8SA 2I4AA 3W6GA 4NHWA 3CSJA 1BG5A 5LNKe 2WJUA 1SKSB 2VD0A 3HJPA 2P31A 4IGJA 4K7IA 2YNXA 4XRAA 1HNBA 4TVEA 3KCMA 1TRWA 1ABAA 4FH8A 2JSYA 4HU9A 2OE3A 4AGSA 3Q19A 3EMPA 4GTUA 1FOVA 3QDNA 2H1BA 3GSTA 4IHUA 10GSA 1XIYA 1ZGNA 4MF7A 3LFLA 1S3CA 2X8GA 5CNWA 5C00A 1U87A 1K0NA 2IPAA 3FEUA 2WS2A 1Z5YE 2B5XA 4MLYA 4ZBDA 1AQXA 1U88A 1H75A 1AQVA 1PKZA 3ERFA 3VWWA 3R2QA 4XIHA 3KTBA 4IVFA 4HQSA 1ZYQB 1OC3A 1R26A 1ZOFA 5ABRA 2O8VB 2IJYA 3ZIVA 2OBIA 3HDCA 5J9CA 4DEJA 3O6TA 4JE1A 4PNFA 2YZUA 3GN3A 3QFAC 1MD3A 1G7OA 4IS0A 2PBJA 2GT6A 5ECNB 3BCIA 3D21A 2GZPA 2VOCA 3TCOA 2GSTA 3FHKA 3KXOA 2H76A 4TXOB 2DJ0A 4ECBA 1PD21 2R3XA 3LXTA 2A2SA 4O5RA 1S3DA 5ID2A 1GTUA 1EOHA 1YZXA 3M0FA 5G5EA 3QR6A 2FA4A 3DGQA 3L9VA 1PQNA 3H8QA 3VPTA 1W89A 1SKWB 1FVKA 4TN8A 2FLSA 1TDIA 2B1KA 1WOUA 5D9VA 1K3YA 20GSA 2CT6A 3GMFA 1USBA 3IE3A 4V2NA 4ZBBA 4L0WA 2H0GA 5ENUA 4YAPA 2XHFA 4XS4A 5GSSA 4YQMA 4JU5A 3WT2A 4ZILA 2O7KA 5ECPB 1R7HA 4K6XA 2L5OA 1M9AA 4X0XA 4N30A 5L71A 1GUMA 3TOUA 3LYKA 2RUFA 2C3QA 2GSSA 1XWGA 2IL3A 1EOGA 3ERGA 3KGKA 5ELAA 1O85A 1XWKA 3F9UA 2I3YA 3RPNA 2I9HA 1NHYA 2DSAA 5JCWA 4V1Ag 2GGTA 4OD7A 2H30A 1DUGA 3HCZA 3U6VA 4XRDA 2MMAA 4IQAA 2C3NA 3ISOA 5JWOB 4I8BA 1GSYA 3M1GA 3ZREA 5GZZB 3C1RA 1K0BA 4JR4A 2H73A 2VIMA 4ULXA 1GTBA 5E4WA 4BPYA 1LJRA 2B7KA 5CRDA 2AYTA 4AJ7A 5KN3A 4K7NA 5GAND 3VWUA 5A4VA 1FO5A 3BJ5A 2VO4A 2NBSA 2FY6A 4H86A 5D9WA 4IKHA 1F3BA 3HZ4A 4KB3A 5HR0A 1F37A 2H72A 4MJCA 3TJGA 4JEDA 5CO3A 2JZTA 3VFIA 2EIOA 5IPHA 2KP2A 1CQHA 1MTCA 1X5DA 2WCIA 4HI7A 5J5NA 3GL3A 1BX9A 2YOIA 2PWJA 3CYNA 1TK0B 4GWRA 1EZKA 4NPBA 2IWTA 3TDGA 5FWGA 2VCXA 1GTAA 4GSSA 3WGXA 4K7OA 5JCUA 4CDOA 1VF3A 2QC7A 4TXOA 1HQOA 1JFUA 2REMA 4MJBA 4MMMA 3EVIA 3KZQA 2CAQA 1SKRB 2RUEA 4AJ8A 1YKCA 2FUG2 2G2QA 1ERTA 1TRVA 2LQQA 1AAZA 2TRCP 2ZCTA 1PA3A 2Z9SA 1U3IA 4I2TA 2AJQB 2PERA 4PQHA 1JZRA 4HDEA 3N5OA 3H79A 2M80A 2V2GA 4N10A 3EWLA 2H75A 5EY6A 4GCIA 2R5GA 1VF4A 4LL4B 3ME7A 1FVJA 5LCZA 1U3AA 1SL0B 2LTKA 1GLQA 3F3QA 3MWHA 1HNAA 2DLXA 1EV4A 2XPEA 5D9TA 1SK1A 1Z6NA 5IMAA 3LSZA 3G7YA 4J2FA 3FY7A 3MNGA 4KW6A 2R37A 3BD2A 1Y25A 2YJHA 2OBKA 5J4UA 3ED3A 4IP1A 17GSA 1OC8A 2WB9A 2DBCA 3GSSA 2HSHA 4OMVA 3I9V2 4I97A 2L59A 3PINA 4WKWA 3C1SA 1F6MC 2ZUPA 3FYGA 1KBNA 3IC4A 5DVBA 3VI7A 2DMLA 1XVQA 3F3RA 1EP7A 3CTGA 2HE3A 1O8WA 1QXHA 5CRGA 2FNOA 4GSTA 1PL2A 4K2DA 3EC3A 2VCTA 2H74A 2YANA 4YAVA 3FR6A 1RK4A 1A2MA 1X9WB 1V58A 4MDCA 3ZVJA 2MZCA 4IBPA 1Z9HA 2DJ2A 3DD3A 5ECRB 3AY8A 2WGRA 5IQYA 2NDOA 4KX4A 1I5GA 3WGDA 4QL9A 4EDYA 3W8JA 2P0GA 2FWGA 2PVQA 1QQ2A 3IXRA 4V1Ap 3LQ7A 5A4WA 3GKMA 5A4UA 3IR4A 11GSA 4HU7A 5IO0A 2V6KA 2H66A 4XCSA 5EL8A 1AC1A 3KD0A 3FZ5A 1QMVA 3LYPA 3IDVA 5G2ZA 1TU7A 4BA7A 1GH2A 2H1AA 4RI7A 3DRNA 1O6JA 2CAIA 4CHSA 2PPTA 1XW9A 4I6XA 2NTOA 2BMXA 4GQFA 2IMDA 1GWCA 4ECIA 3A5WA 5J41A 2X64A 1J08A 4PGTA 5KN0A 3M9JA 4P3YB 3ZIJA 5DDLA 9GSSA 3FZ4A 2I81A 1TP9A 3HJMA 2XC2A 3HHVA 5DALB 1IYIA 6GSSA 5IMDA 4TXVA 3CMIA 4EO3A 1A23A 2HT9A 3N9JA 4J57E 12GSA 1UA5A 2E0QA 1NHOA 2V1MA 1OE7A 2XPDA 3EU4A 4F82A 1YY7A 2L6CA 1BAYA 2CZ3A 4HEA2 2H70A 3DXBA 4N0ZA 2GSRA 1GSEA 1GSDA 5IO2A 1XOAA 4BVYA 1EGOA 2HZEB 4NAXA 1GNEA 5IIZA 2F51A 1THXA 4KAEA 1ST9A 4Z7XA 2I1UA 2GLRA 3S9FA 1SD8A 1GSFA 1TI3A 2DC5A 1NM3A 1SJ6A 2YPMA 3H1NA 4O92A 1G0TA 2IFQB 3KJYA 1OYJA 1FB6A 2LKUA 1Z7RA 2B5YA 1SJIA 1EV9A 3D4TA 4POBA 2H71A 4WBRD 3HD5A 1Y6EA 2MBTA 2YWMA 1N2AA 2CV4A 5DQYA 3UBKA 2DMMA 3Q18A 4KGIA 3UL3A 4XTSA 2JSZA 1X0RA 4TOPA 1BEDA 2HRNA 1GULA 4MF5A 4WXTA 2VM2A 3RPPA 4D73A 2AB6A 3L4NA 4PURA 1ERVA 2KLXA 1M2AA 5IMCA 2O89A 2E2GA 4WR5A 5HFKA 4LA1A 1SL2B 2LJRA 4OO4A 3GIXA 4DSSB 4KNDA 1OVNA 1M2BA 5H5QA 1SD9A 5ECIB 4K0NA 1THOA 2ON7A 2B7JA 2R6KA 2GSQA 3SWLA 1M0UA 3APOA 3FKFA 2PGTA 2K6VA 2H6XA 3D22A 1W4VA 2CX3A 3I6AA 4KDXA 5AN1A 5ECQB 3APSA 2L4CA 3ZZXA 3BOAA 5DJMA 5IOXA 3WD6A 1TI1A 3DVWA 3UAPA 4MZBA 4OFTA 2HXKA 5G5FA 4KSOA 5DALA 3I43A 4MPFA 1YQ1A 2PVOC 2RIIA 4ZB9A 3Q6OA 5ECSA 4I2UA 3GKKA 4ML1A 3D0ZA 3GHAA 2GDRA 4X1UA 1A8YA 1AW9A 1LBKA 4WF4A 5CAXA 2FWFA 4GXZA 1DE2A 5ECMB 3C73A 3QCPA 4TR3A 4J56E 4IJIA 2KP1A 1V2AA 3H4KA 3UOMA 1JLWA 4KSMA 4MP4A 3TOTA 3E9JB 2HZEA 2XBQA 1AXDA 2VLTA 1OE8A 1TOFA 4TR0A 1WIKA 2C80A 1Q4JA 4NV5A 3MDKA 4IQ1A 1TRUA 3PGTA 3CSIA 3ZLPA 4JR6A 3F63A 2IFQA 1GSUA 4TRXA 3D6IA 1EWXA 4FYBA 3TJKA 3VLNA 1TK5B 3ZMLA 3ZFBA 3IA1A 4F9ZA 1TXXA 1GUKA 2BTOT 3CXGA 2GS3A 1WP0A 2AHEA 4DVCA 4F2IA 2YWOA 1GRXA 4FO5A 1M9BA 3HYPA 3KH9A 2GVPA 3F4SA 5J3RA 3O3TA 3GKNA 5HR2A 3KM6A 4K9ZA 2RM5A 4HOJA 3C7MA 3UEMA 3G9BA 4L0UA 2ZNMA 2LNTA 5AIXA 4G19A 1QK8A 3QAGA 1X9SB 1M99A 1FG4A 4PUAA 4ML6A 1PSQA 1K0MA 3Q74A 3DKSA 1V98A 3EYTA 3LG6A 4G2EA 1C72A 3FR3A 4JBBA 4LMVA 2VCWA 1PMTA 3A2VA 3J7Yb 4DSSA 2FCHA 2V41A 4ZL8A 3U5RE 4HQZA 8GSSA 4GSNA 2LJKA 4X43A 1A0RP 1T3BA 2X99A 1YEPA 2VM1A 1T8EB 3IAS2 4MZWA 5DJLA 3NZNA 2ON5A 5FHIA 1FB0A 4EE0A 3WYWA 1MDJA 4NV2A 1XPVA 1AIUA 2TIRA 2M46A 1B8XA 5INYA 3NIVA 4MJAA 1XZOA 2GZYA 1EEMA 5EPFA 1T1VA 5KN2A 1OC9B 2KUCA 5J9BA 3P90A 2YV7A 3EINA 1GP1A 2NPBA 2WZ9A 2LV3A 3A2XA 2HI7A 4EF0A 4KA0A 3APQA 3L9UA 2JU5A 2K8VA 1Z6MA 2HFDA 5KN1A 1XCCA 5D8IA 3UJ1A 1X9MB 4XS1A 2QGVA 5G1KA 3HY2A 2YN1A 1SYRA 2JL4A 3C71A 4ZBAA 4RI6A 3IBHA 1XOBA 1WE0A 4XS6A 4E8HA 1FW1A 1Z7PA 1B48A 5D93A 3WGEA 4ISDA 2FD3A 1OKTA 14GSA 1A2JA 1PKWA 3TUEA 1RQMA 2GTUA 2HYXA 3D5JA 1GSQA 3LEFA 4JZQA 2L57A 3F4RA 3GYKA 1HNCA 4FIWA 1K0CA 4NWYA 2HZFA 1ML6A 2AUVA 5ECHB 3FW2A 2K9FA 5HQPA 1EEJA 3OR5A 4PNGA 1T7PB 4QL7A 4F03A 2CA8A 4HJ2A 1QFNA 1NSWA 3EE2A 5ECKB 1URMA 2VL9A 1ERWA 2YZHA 1YJ6A 4YQVA 4V2MA 1O81A 2IN3A 2OJLA 1ERUA 5IPGA 5AISA 3KMNA 3DWVA 2VUPA 3ZL5A 4OO5A 1T4YA 3IPZA 5HFIA 2F8FA 3L0HA 2DIZA 2LRTA 3O76A 2L5LA 3IRAA 1U6TA 4G9HA 3VK9A 4POLA 3UARA 3ZRDA 2H19A 3TB2A 4NXIA 1JHBA 4KUNA 3DVXA 5F0GA 2VD1A 4NMUA 4TW5A 2OE0A 3F6DA 4PUFC 1ZMAA 3EMXA 1BYEA 2M72A 3CSHA 2R2JA 3F8UA 3SBCA 4NHZA 4LLRA 3ME8A 2C8UA 2MBSA 5F07A 18GSA 1XWAA 1A8LA 1BQ7A 1O73A 2VL2C 1VF1A 1OC9A 1FHEA 2FHEA 2EIRA 1WPIA 3TKQA 3LJRA 1K3LA 2X8CA 1TJDA 3G7JA 1MEKA 3IV4A 3HA9A 3VPQA 4PQIA 6GSTA 2AAWA 4PQ1A 4EL1A 3CBUA 1UN2A 2GZZA 2N5FA 5ID2B 1SYXA 5HFGA 4K0GA 2L4QA 3HZ8A 1TW9A 4ID0A 5D96A 2WRTA 3PH9A 3TRPA 3GURA 3V1WA 3TKSC 4HZ2A 2YWNA 4OCFA 3UIWA 4MH3A 3HKRA 4L8EA 3DEXA 3NOFA 4V2LA 2MMNA 4FYCA 1YDKA 1Q98A 3DYRA 1RW1A 2OE1A 1XWBA 4MABA 4PX1A 1DBYA 2DJ1A 3LGCA 2LNSA 1GSSA 2H6ZA 4EUYA 4GLTA 2VAFA 4DSQA 4LL1B 4KDYA 3H93A 3HJOA 5A5KA 3TJBA 1R5PA 1SK0A 1ZZYA 1A2LA 3GTUB 2H1DA 2D2ZA 3CRTA 1ZL9A 3KH7A 5CRHA 4AJ6A 6GSYA 1JZDA 5CP1A 3KIJA 1XW5A 1Z3EA 3A3TA 5IMVA 1K0AA 2X8HA 3TRXA 1B4QA 3P7XA 5JWQB 3RHCA 2C0FA 4HS1A 1V40A 4IN0A 4KCAA 3J7Yk 2K8SA 5G31A 4AF2A 5G30A 3F4TA 4RUVA 4GF0A 4Q5QA 3EU3A 3P8WA 1XVWA 1UC7A 2V6OA 2TRXA 4ZB8A 1XW6A 2E7PA 4KCEA 4WR4A 5IMFA 4YQUA 4ECJA 1SJZA 1JZWA 4WBJA 2LEGA 4IJ3A 2OKAA 2V32A 2G0FA 1PN9A 4KDUA 2B5EA 2OADA 3FK8A 1PL1A 3TJJA 4FYUA 4K8MA 3DMLA 3GKXA 2FWHA 1AQWA 1NW2A 1XXUA 1TRSA 3F0IA 1O8XA 4F0BA 5IOWA 1B9XC 3C8EA 2JZSA 4ACSA 2MMZA 2ALBA 3VI5A 2NVLA 4BVXA 3TKRA 1VGLA 4KE3A 3QOUA 4WETA 1F3AA 3JCML 3VWVA 2KOKA 4BL7A 4WEYA 2N5AA 1PGTA 3GX8A 4POKA 1S3AA 5CYYA 1K0OA 1PX7A 4Q5NA 3QD9A 5GSTA 2WULA 3L78A 1GTIA 2XBIA 4BWSA 3QFBC 2EC4A 3A2WA 2VCZA 3IK9A 3TRQA 3CTFA 3KMOA 2HNLA 1PX6A 2PU9C 2B1LA 3GA4A 4G10A 4F0CA 2EIQA 2N5BA 2A2RA 5GAPD 3GH6A 1ZYEA 3TKPA 4TR4A 1E2YA 2C0DA 2LJAA 4MPGA 2R4VA 4YH2A 3M8NA 2VLUA 2H6YA 5DCHA 5IM9A 4MF6A 5IMZA 2QSIA 2WDUA 5ECOB 2AV4A 1K3OA 1IYHA 1XWCA 4L5LA 3WT1A 2CX4A 2JADA 3GRXA 2A4VA 3F6FA 1VRSD 2C0EA 2F3MA 2WFCA 4O32A 2P5QA 2KHPA 3RAZA 1XFLA 3ZITA 5D9XA 4Q5FA 5HR3A 2O85A 1GLPA 3ZTLA 3GTUA 5E59A 1J9BA 2CQ9A 2CVBA 5EVOA 1MD4A 4TR1B 1TKDB 2LSTA 3GV1A 2FA8A 3FZAA 1YF0A 4E8EA 5G1LA 1TK8B 3UVTA 2C0GA 5C04A 5B7CA 1DE1A 1PRXA 4EKZA 1QUWA 2GQLA 4QQ7A 2DIYA 4N11A 2IMEA 2O87A 1G7EA 4K1FA 5F06A 1T4ZA 3UMAA 5F8BA 5JCGA 2VLVA 1SENA 4MCUA 2YCDA 4ZB6A 2YP6A 3MAKA 4MJEA 1WWJA 2ES7A 3BBYA 4OCEA 3GFKA 2CVKA 2C1YA 2L6DA 1M2DA 4WF5A 3QAWA 1X5CA 1R5AA 1TTZA 5DCGA 2C3TA 3RDWA 4EC0A 2DJKA 1T00A 3KP8A 5CRWA 4I5QA 2LRCA 2HSYA 5DAKB 2H0HA 4LMWA 2CZ2A 3US3A 1ZCPA 1E6BA 3ZFLA 1TU8A 2OACA 1FAAA 4IW9A 1JZOA 5KEJA 5FT3A 1N8JA 5CREA 2YV9A 4EVMA 2VL2A 2IMIA 3GX0A 5AGYA 4MZCA 3HXSA 2P5RA 4ZXGA 1EP8A 2GT5A 6GSXA 2DJJA 2FGXA 3HVVA 4MA9A 2H1GA 1EGRA 3IHQA 4N0VA 2VCVA 1ILOA 1KTEA 1HD2A 3M3MA 3KP9A 5COHA 2LS5A 3IK7A 2MMOA 2E2MA 3PR8A 5H5SA 2RLIA 1J0FA 2B3SA 3LORA 3UBLA 3LWAA 4OWYA 4XHMA 3HVXA 1WRYA 5B8BA 4ECCA 4DSRA 1YEXA 1VF2A 3TKSA 3VWXA 2IIYA 3GNJA 3KEBA 5LD0A 16GSA 1F9MA 4HUAA 4KH7A 3K8NA 1SK2A 1ON4A 3TJFA 3TKSE 3BCKA 1QGVA 3IOSA 3ZYWA 1F2EA 1OAZA 3G7IA 3P2AA 3FR9A 4TR1A 3ZVJD 4IP6A 5DBQA 1JLVA 3QAVA 4O7HA 1MDIA 2B6MA 3E3EA 3FRCA 1WJKA 1MDKA 3QMXA 2C4JA 2YWIA 4TKYA 4ILFA 2GQKA 4CW9A 4HZ4A 1OKDA 1KEBA 2H8LA 1O7UA 2VL3A 2OA7A 4Q5RA 19GSA 4ZIJA 4JRRA 3EURA 1SL1B 4RQRA 3KTLA 3RHBA 5B6MA 2IMKA 1GL8A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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