1RW1A

Yffb (pa3664) protein
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
114
structure length
114
Chain Sequence
b'TYVLYGIKACDTMKKARTWLDEHKVAYDFHDYKAVGIDREHLRRWCAEHGWQTVLNRAGTTFRKLDEAQKADLDEAKAIELMLAQPSMIKRPVLELGGRTLVGFKPDAYAAALA'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of the YffB protein from Pseudomonas aeruginosa suggests a glutathione-dependent thiol reductase function.
pubmed doi rcsb
molecule keywords conserved hypothetical protein yffB
source organism Pseudomonas aeruginosa
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 35
structure length 114
sequence length 114
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-12-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03960 ArsC ArsC family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1rw1A00
1ERWA 3JCML 1SKWB 1Z5YE 1OKDA 3ZTLA 5CYYA 5ECIB 4DVCA 3UARA 2E2MA 4TVEA 4WKWA 2DIYA 1DUGA 2VL2C 1RK4A 4TR4A 6GSYA 2B1KA 3FZ5A 5IMCA 3VLNA 3MDKA 4OFMA 1C72A 2FWFA 1YY7A 2X64A 1PMTA 2FUG2 3ZLPA 4ZB8A 3P7XA 4FH8A 3OR5A 3GFKA 6GSSA 2PVOC 1Y6EA 2WULA 3IOSA 4GSTA 1A2MA 2VIMA 4CW9A 3MAKA 3H8QA 2QGVA 4BA7A 4N10A 1V9WA 3VI7A 3P90A 1O6JA 4Q5QA 1U3IA 5F05A 1SD8A 2CAIA 1PKWA 5EVOA 4HU7A 1SKRB 2KLXA 3F9UA 2VL9A 1CQGA 1TU8A 4MPFA 1A2JA 1EOHA 1K0OA 2N5AA 3IC4A 4GSNA 3S9FA 5IM9A 3LYPA 4OCFA 1I5GA 2O89A 3BCIA 3ZMLA 3IPZA 3L9VA 1PX6A 2L57A 3TJJA 2PBJA 1FVKA 2E0QA 3W6GA 4OFTA 3WT2A 1TTZA 1YQ1A 4P3YB 5E59A 2F8AA 3AY8A 4MJCA 4ZIJA 1XCCA 3QFBC 1B9XC 2DJ0A 1M9AA 5IO2A 5LCZA 2HZFA 4ECJA 5AN1A 3DRNA 4TRXA 2OBIA 2GQLA 3W8SA 3WGEA 1ZGNA 4BWQA 2FY6A 1X9SB 1G7EA 4KGIA 2LQOA 16GSA 3LSZA 2NTOA 3ZRDA 4JBBA 4O92A 1TRUA 3TB2A 3UAPA 4ZILA 3QAGA 2DBCA 3QAVA 2PWJA 4GTUA 1ZMAA 4TW5A 4D73A 1SYRA 3O3TA 4MZWA 5D9XA 1TRVA 4K7IA 1SJIA 1X5DA 5F06A 3QDNA 4EUYA 1TW9A 1WRYA 1MTCA 3DVWA 1GWCA 2Z9SA 4NHWA 4D73B 3EE2A 1TXXA 2GSQA 3KXOA 3HZ8A 4ILFA 4X1UA 4TXOA 1YDKA 2H76A 1H75A 2P31A 2JZTA 4PQ1A 6GSUA 4MZBA 4PQHA 2VOCA 3CSJA 3RBTA 1XZOA 1HD2A 1PRXA 5DDLA 5DCHA 5C00A 4NV5A 19GSA 3DKSA 2YV7A 1MD4A 2H6XA 1WWJA 1MEKA 1R5AA 3CSHA 3KH7A 4TXOB 4HQSA 2ES7A 2A2RA 3HY2A 5J5NA 4MZCA 4ISDA 3I6AA 4MA9A 2HYXA 1U88A 1N2AA 2VUPA 3ZIJA 3QFAC 2O7KA 2WS2A 2FWHA 2HRFA 2IN3A 2YOIA 3TKQA 1NSWA 3KTBA 3PGTA 1ZYEA 1AQWA 2MMOA 3KMNA 4KNDA 2YNXA 3IDVA 3C7MA 4I8BA 4L0WA 1ABAA 1JZWA 2IL3A 1TOFA 4Q5FA 3UVTA 1TDIA 2L5LA 5CP1A 5CRGA 11GSA 3IHQA 1EEMA 3QCPA 4FYUA 1DE2A 1NHYA 1JZOA 2CAQA 3CTGA 4V2NA 4JRRA 4HS1A 5A5KA 5CRDA 20GSA 3EINA 2WZ9A 2GSSA 5JCWA 3DMLA 4ZBBA 4V2LA 3L78A 5C04A 3KCMA 3NIVA 2L4CA 4HEA2 6GSTA 3G7YA 3HHVA 5GSTA 2PUKC 1K0MA 2FCHA 2H1AA 4N11A 1YKAA 3TKSC 2VD0A 4IN0A 4L0UA 5G5EA 2FA8A 2JZSA 5ECKB 1GH2A 2FWGA 4ZL7A 1ZYQB 3ZVJA 3PR8A 1GSSA 2YZUA 4BVXA 4RUVA 4EO3A 1PKZA 4FO5A 5INYA 1XWBA 1AQVA 1T8EB 2H0GA 2HE3A 3LXTA 2OE0A 3TKSE 2VCXA 2M72A 2EIOA 5DALA 4LMWA 3CXGA 4KUNA 2PERA 3APQA 3KM6A 4Q5NA 2MYGA 1OE8A 5ECHB 1OVNA 2I3YA 3GH9A 4EC0A 2IJYA 4IBPA 4WBRD 3HKRA 4NV2A 2GTUA 5DALB 3DVXA 3QD9A 4AJ7A 3D4TA 2H1GA 2WFCA 2K8VA 5ECPB 1GLQA 2K6VA 1GL8A 1FVJA 3GX8A 4L5OA 2O85A 5D73A 1VF1A 2O8VB 1O85A 1G6YA 3GX0A 3TUEA 4WR5A 1WMJA 3ZREA 4J2FA 4PUFC 5L71A 1QMVA 1GSQA 1OYJA 4N30A 3TKSA 22GSA 2H1BA 2LRCA 3G7IA 1QK8A 1V98A 2L59A 3F8UA 4F0BA 3I43A 2QSIA 2RUFA 1EP7A 3K8NA 2IFQB 1AW9A 1QGVA 4ZB9A 3ZFBA 1BG5A 2DJKA 1XFLA 3VWXA 1S3DA 1A8YA 2AUVA 2C80A 3IK7A 3CBUA 2LRNA 2WRTA 3O6TA 4KA0A 3GSSA 2GQKA 2D2ZA 2JU5A 1K0DA 2M80A 4V1Ap 2PN8A 3LFLA 1GP1A 18GSA 2MMZA 2I4AA 1M2DA 1EOGA 1BYEA 1YEPA 6GSWA 1RW1A 1X0RA 5IMAA 1V58A 1B4PA 1T4YA 1XPVA 4RQXA 1XW9A 3FY7A 4GWRA 4IVFA 2PVQA 3CRUA 3EU3A 5B8AA 3ERWA 1XW6A 5ELGA 1AUCA 4G10A 2DMLA 1Q98A 2G2QA 1GNEA 2H70A 4ZBAA 2HSHA 3C73A 2R6KA 1UN2A 1JHBA 3H79A 1AAZA 4ECIA 2NBSA 2CA8A 3RHBA 1UC7A 1V2AA 3ZZXA 1BX9A 2MBSA 1F3BA 2XBIA 3FR9A 1T7PB 4KDUA 8GSSA 2YWNA 3LORA 2RM6A 3TJKA 1URMA 2DMMA 1Z6MA 1Z7PA 2VLUA 4ML1A 3GH6A 1BJXA 3LWAA 2LRTA 1QXHA 4MABA 3UVHA 5A4VA 2C0FA 4PURA 3WGXA 5JCUA 4JU5A 3NOFA 3WGDA 10GSA 5AISA 1XWKA 3N5OA 1GTBA 2XHFA 1RQMA 5G5FA 2P0GA 3E3EA 4MJAA 2XPDA 4YQMA 1AXDA 2LTKA 3A2WA 2VO4A 3RPNA 2V2GA 4BWSA 3F3RA 4ML6A 5IIZA 2KOKA 4GSSA 4L5LA 1XW5A 4N0VA 3ZL5A 4MJEA 3QOUA 2GVPA 4OMVA 3EMPA 2FGXA 1SL2B 2V41A 2FHEA 4WF5A 3TRQA 3GURA 1F6MC 4J57E 4POLA 4IS0A 2CX4A 4MMMA 1PQNA 2DSAA 4TKYA 4JE1A 4OD7A 1B8XA 2XPEA 3APOA 3FK8A 5CAXA 1F2EA 4I5QA 4BPYA 1XWGA 2R5GA 1PN9A 2B7JA 3ZYWA 2JL4A 3J7Yk 4TOPA 3FZ4A 4E8EA 5LD0A 2ZCTA 2MMNA 1TRSA 2C4JA 2CV4A 4EL1A 5CREA 2GZPA 1PX7A 4IKHA 4OFNA 4E8HA 4ACSA 3V1WA 2EC4A 3IA1A 2QKEA 1NM3A 3FR3A 2C0GA 2TRCP 4OCEA 2VL2A 3KGKA 4MH2A 2DIZA 3FRCA 3HJPA 3GV1A 1W4VA 2YWOA 4JR4A 5HFGA 1LU4A 3HYPA 4PX1A 2C3QA 4O32A 3DWVA 4NAXA 4IQ1A 3IAS2 4DSSA 3TOUA 3SWLA 4QL7A 1GSYA 3IR4A 4XCSA 4HZ4A 2PMTA 5J9CA 1BAYA 3HDCA 4DSSB 2P5QA 2KUCA 4EE0A 2IMIA 4K7NA 12GSA 5DVBA 2JSZA 4AJ8A 2JSYA 4I2TA 1X9MB 1G0TA 3DEXA 3HVSA 3VK9A 2TIRA 5ABRA 1MD3A 3FR6A 3FW2A 4HQZA 3VPQA 4WETA 5FHIA 1USBA 4I6XA 5ECSA 1MDJA 3CYNA 4KX4A 4JR6A 3LGCA 4JZQA 3LEFA 3GTUA 3U6VA 4GCIA 1EWXA 4KCEA 3RDWA 2YPMA 4K0NA 4WR4A 2KHPA 4G9HA 2EIQA 2CQ9A 3CSIA 1O7UA 3HJMA 5B8BA 3L9UA 3GTUB 3M9JA 3H1NA 4LLRA 2LKUA 4GRFA 4YQVA 1XVWA 1X5CA 4KAEA 2V6OA 4HDEA 3D5JA 4K7OA 3M9KA 2IMFA 5DQSA 2X8HA 1TP9A 1A24A 2OJLA 5J41A 2VL3A 3KZQA 2DJ1A 2DC5A 3F4SA 3RHCA 3DXBA 2WJUA 2G0FA 2BTOT 1GUMA 2WGRA 5GZZB 3TJBA 1QQ2A 3KTLA 3TRPA 4GXZA 2YWMA 5HR3A 1JZRA 1NHOA 3M3MA 4LL4B 4LL1B 1J08A 3F0IA 4MF5A 4XHMA 5ECOB 1FB6A 5IMDA 4F82A 2X8CA 1J9BA 1ERUA 1PSQA 5IO0A 2I1UA 4YQUA 2K18A 5A4UA 3P2AA 4PGTA 2I9HA 4IGJA 4HU9A 2L4QA 2HZEA 1X5EA 1ST9A 1ACVA 5F07A 3I9V2 5E4WA 4Q5RA 2NPBA 1ZCPA 1XOAA 2H01A 2KP2A 3L0HA 1DBYA 1WOUA 1HNAA 2R4VA 2HZEB 1XVQA 3FKFA 3EC3A 3A5WA 3MWHA 3ZMKA 2IMEA 4HJ2A 1ZL9A 4ZXGA 3GL5A 1CQHA 2R37A 1AIUA 2X8GA 5JWOB 2GSRA 2MZCA 1I9DA 1ZOFA 3W8JA 4DSRA 5DBQA 3QPMA 4XS1A 5EL8A 1OC9A 4I2UA 2WDUA 2CVBA 3WYWA 3CMIA 4AF2A 1A2LA 4F0CA 4YAVA 1MDKA 2B5XA 4IHUA 1XWCA 4OO5A 1XXUA 1M2AA 1OC9B 3FEUA 5KN0A 2B3SA 5ECRB 2JZRA 2A4VA 4FYBA 4DSQA 2NDOA 1QUWA 1GSUA 2BMXA 4MP4A 3VI5A 2HXKA 9GSSA 5CO3A 3H93A 3KIJA 5HFKA 4F2IA 5ID2A 5H5SA 2H71A 1U6TA 4LA1A 2VLVA 4GQCA 4XIHA 3EVIA 1SJ6A 4XS4A 2HRNA 3G9BA 2OBKA 3FHKA 2ON7A 2PPTA 5G30A 5ID2B 1R26A 2H6YA 5ECNB 4PNGA 1TI3A 3QR6A 3A2VA 4XS4B 2FNOA 2YANA 1FB0A 2AJQB 4PUAA 3H4KA 2IMKA 2ZNMA 2HSYA 5H5RA 5GAPD 4G2EA 5LNKe 5J9BA 3TCOA 4FIWA 1NW2A 1HNCA 5J4UA 1GTAA 2YN1A 1THXA 3VURA 1ML6A 5HQPA 3VWWA 4TN8A 5FWGA 1TK5B 3CRTA 2ON5A 4F9ZA 3KH9A 4HUAA 2VCWA 3GIXA 2H1DA 1SJZA 4ZBDA 3R2QA 1HYUA 3BOAA 2RUEA 2K9FA 2F8FA 3C71A 3TOTA 1G7OA 3BCKA 2H66A 1K0AA 3F4RA 3GA4A 2NVLA 1GNWA 3ME7A 3ERFA 4ID0A 2GQMA 4POBA 4YAPA 5HR0A 1OAZA 4IJ3A 1R7HA 4EF0A 2B6MA 4K8MA 1EGOA 1XBSA 4MJBA 3WD6A 1ERTA 3US3A 4HI7A 2IIYA 1U3AA 2HNLA 4GQFA 17GSA 5HFIA 2C8UA 4TR0A 3P8WA 6GSXA 1EEJA 3ZIVA 3UJ1A 3D6IA 3IV4A 2IWTA 4WBJA 4KB3A 4L8EA 1O8XA 3F4TA 2H6ZA 2OACA 2REMA 4F03A 1YJ6A 4JEDA 1GSEA 2MBTA 4K9ZA 1K3YA 1O73A 1SK2A 1E2YA 1T1VA 2H30A 2R2JA 4PNFA 1TRWA 4KH7A 3DYRA 3IK9A 1ERVA 3LYKA 4DEJA 4EDYA 4IQAA 3IE3A 2VM2A 1YF0A 1WE0A 3D4MA 2GT6A 5DCGA 2I81A 3D21A 2N5FA 5EPFA 3DIEA 5D8IA 2HI7A 3KP9A 2GZZA 1IYIA 1T4ZA 2IMDA 2HT9A 1JLVA 2LS5A 3VWVA 1WPIA 2B1LA 1AQXA 2CX3A 2H72A 2VCQA 5KN2A 3F6DA 3GKNA 1SK0A 4H86A 4MH3A 4XRAA 3DD3A 3KD0A 3Q18A 2BJXA 3GUSA 4KW6A 4WXTA 5JWRB 5ECMB 3HCZA 3O76A 1TI1A 1YZXA 4ZB6A 1KTEA 2AYTA 5ELAA 3M8NA 2C0DA 2WB9A 3C1RA 4WEYA 2A2SA 1EV9A 2LNSA 5KN3A 4Z7XA 1ON4A 1TK0B 4WF4A 3IBHA 2GZYA 14GSA 1VRSD 4FYCA 1M2BA 2K8SA 2RLIA 2AAWA 4AGSA 2YZHA 5G31A 1SD9A 3UEMA 1A8LA 1PL1A 1F3AA 1JLWA 3HZ4A 2DJJA 1IYHA 4MPGA 1B48A 3FZAA 2GGTA 1K0NA 5CNWA 3Q6OA 3D0ZA 3BD2A 1ZZYA 2HFDA 2OE1A 3IAM2 2OADA 4EDZA 2IPAA 1FAAA 3PINA 1TKDB 1SKSB 5COHA 3QAWA 3TDGA 1FOVA 4IELA 4TXVA 1VF4A 1GLPA 5DQYA 1GSDA 4I97A 3IXRA 1EV4A 5AIVA 1K3OA 3BBYA 1VF3A 2PU9C 3ED3A 2V32A 1S3CA 1OC3A 5F8BA 1XIYA 1GUKA 1B4QA 1Z6NA 3ERGA 5IOXA 2F9SA 4TR3A 2H8LA 4IP6A 3GL3A 4J56E 1PGTA 2YCDA 3C1SA 1SENA 2L6DA 2OKAA 1A0RP 3GHAA 1GTIA 5H5QA 1R5PA 5GAND 1PA3A 3E0UA 3I69A 4CDOA 5G1LA 1K0BA 1F9MA 3GN3A 2ALBA 3M0FA 3ISOA 1GULA 2OE3A 3TJFA 2H75A 5KEJA 2RM5A 4QQ7A 4QL9A 2LQQA 3NZNA 5B6MA 2F3MA 2GLRA 4ULXA 3LXZA 4N0ZA 2J23A 1T00A 2DJ2A 2FA4A 1WJKA 2X99A 3LG6A 3WT1A 4MK3A 5AIXA 3HVXA 1MDIA 4IP1A 1VF2A 3E9JB 3F6FA 4K2DA 4RQRA 2L5OA 4MDCA 3HD5A 4ZL9A 4HOJA 1GTUA 2CVDA 2C3TA 1DE1A 3EURA 2WCIA 2CT6A 4O7HA 4XS6A 4O5RA 1H4OA 2CVKA 4LMVA 4NWYA 5HR1A 2GT5A 1UA5A 4HZ2A 4POKA 5AGYA 1TJDA 1KEBA 2H0IA 2O87A 3KMOA 3BJ5A 4EXJA 4KCAA 5IMVA 1V40A 4K0GA 3EU4A 5GSSA 2C1YA 1PD21 3N9JA 4NHZA 4XRDA 5G1KA 3SBCA 1OC8A 3UBLA 4K6XA 1N8JA 3GMFA 1Y25A 2GSTA 3ZFLA 2V6KA 3DGQA 1Z9HA 5A4WA 1JFUA 2LJKA 2VM1A 3L9SA 3ME8A 2GDRA 2LNTA 1M7TA 2FWEA 3FZ9A 1QFNA 3VPTA 1FO5A 2LJAA 2QC7A 4OWYA 2DLXA 5CRHA 1GSFA 1X9WB 3L4NA 5G2ZA 2N5BA 4OO4A 5DJMA 5D93A 1HNBA 1S3AA 2M46A 3MNGA 2H0HA 3UL3A 2TRXA 1DSBA 1T3BA 1U87A 2AHEA 5IPGA 2LJRA 5ENUA 5F0GA 1EZKA 3GRXA 4PQIA 1J0FA 3F63A 2FD3A 1THOA 3HVVA 1XWAA 4BVYA 3RAZA 4GF0A 2L6CA 3C8EA 3Q19A 1K0CA 2PGTA 3F3QA 3HJOA 1YF1A 3GKXA 4KSOA 4V1Ag 1GRXA 3IRAA 5FT3A 2LSTA 2H74A 3UOMA 5J3RA 5DAKA 3Q74A 1A23A 3TKRA 1O8WA 4X0XA 3HXSA 4MLYA 4NXIA 4NMUA 2VCTA 2YWIA 4KDXA 4MF7A 1SU9A 1XOBA 2VCZA 4MCUA 3A3TA 2R3XA 1SL0B 5DAKB 2KP1A 3UBKA 4CHSA 1BEDA 5D9VA 2DJ3A 2XC2A 2EIRA 2VLTA 1LJRA 3QMXA 4GLTA 4TR1A 4V2MA 1JZDA 1WIKA 6GSVA 1ILOA 1SK1A 3VFIA 5D96A 1SYXA 3PH9A 1OE7A 4BL7A 2IFQA 3APSA 3J7Yb 1TU7A 3TRXA 2CZ3A 5IPHA 1VGLA 4TR1B 3GNJA 5JWQB 4KE3A 13GSA 1WP0A 3CTFA 2HLSA 3LJRA 4EKZA 1BQ7A 2JADA 5EY6A 1M0UA 2LV3A 3EMXA 2E7PA 2LEGA 3KJYA 3TGZA 2B7KA 5IQYA 2B5EA 4KSMA 4XTSA 4POMA 1LBKA 4K1FA 1YKCA 1FG4A 2E2GA 3M1GA 2C3NA 2CZ2A 1B9YC 2ZUPA 2YP6A 3HA9A 4X43A 2V1MA 5DJLA 1YEXA 1TK8B 2AV4A 1SL1B 2YV9A 2JACA 1M99A 1E6BA 4NPBA 2FLSA 3TKPA 5B7CA 4YH2A 3GKMA 2C0EA 5ECLB 5KN1A 5B6NA 2AB6A 2VCVA 2H19A 3UIWA 1W89A 5JCGA 4RI6A 1V57A 2H73A 1EP8A 2LUSA 3GKKA 2F51A 3ZITA 3TJGA 3RPPA 4EVMA 3A2XA 2VD1A 3EWLA 1G6WA 3KEBA 4ECBA 1KNGA 4ZL8A 2XBQA 4PXOA 5CRWA 3VWUA 4RI7A 3GYKA 4G19A 7GSSA 1A0FA 3U5RE 1EGRA 2J9HA 5IOWA 3EYTA 2VAFA 3KP8A 1FW1A 4ECCA 4AJ6A 1GUHA 4KDYA 1AC1A 2MMAA 1Z7RA 2B5YA 3MSZA 1FHEA 5IMZA 4IW9A 3GSTA 1UVZA 1O81A 2GS3A 1OKTA 2RIIA 2P5RA 3D22A 1Q4JA 2YJ7A 3LQ7A 5HR2A 1PL2A 3UMAA 1M9BA 3ZVJD 1R4WA 1K3LA 3G7JA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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