1RW1A

Yffb (pa3664) protein
Total Genus 35
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
35
sequence length
114
structure length
114
Chain Sequence
TYVLYGIKACDTMKKARTWLDEHKVAYDFHDYKAVGIDREHLRRWCAEHGWQTVLNRAGTTFRKLDEAQKADLDEAKAIELMLAQPSMIKRPVLELGGRTLVGFKPDAYAAALA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule tags Structural genomics, unknown function
molecule keywords conserved hypothetical protein yffB
publication title Crystal structure of the YffB protein from Pseudomonas aeruginosa suggests a glutathione-dependent thiol reductase function.
pubmed doi rcsb
source organism Pseudomonas aeruginosa
total genus 35
structure length 114
sequence length 114
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-12-15

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03960 ArsC ArsC family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1rw1A00
2O85A 4K8MA 2R37A 1GSYA 3HJPA 3TKSA 2YWIA 5KN0A 4EDZA 3UJ1A 1FAAA 2OBKA 1YKCA 5JWOB 5AIVA 2KP2A 4JR6A 2WDUA 2NPBA 3F4SA 1G7EA 4ECIA 3HCZA 5ECNB 4K6XA 4ILFA 1SYRA 3GSTA 2DIYA 2CVKA 3N9JA 1VF2A 5AIXA 1PKZA 1N2AA 1PD21 1ZL9A 1XWCA 2C4JA 2LEGA 1BG5A 5HFGA 1EWXA 1T8EB 2YZUA 5DBQA 3OR5A 4K2DA 4POBA 5FHIA 2VCWA 1OC9B 17GSA 2C3NA 4POKA 4TR4A 4OFMA 5L71A 3TGZA 4L0WA 3FKFA 5CREA 1TOFA 5DVBA 1T00A 4GXZA 1EOHA 4EDYA 2OKAA 5D9XA 4YH2A 1O81A 1A24A 1OKTA 4Q5FA 3FZAA 5D73A 1LBKA 4D73A 2BMXA 2MBTA 3RBTA 4HQZA 4K0NA 3E3EA 5ECPB 1W89A 2OACA 4NWYA 3KH7A 3ZREA 2WB9A 3DKSA 2A2RA 1H4OA 3D4MA 3FRCA 3KH9A 3KP8A 1DE1A 2ZNMA 3KD0A 4MLYA 4N0ZA 2ZCTA 3V1WA 3VURA 5LCZA 1GL8A 2GSRA 2G0FA 1WE0A 3SWLA 1OC8A 3F0IA 4HU7A 1XW9A 2VM2A 3LXTA 1PX7A 1EGOA 3LYPA 4E8EA 3F8UA 3IRAA 1Q98A 5COHA 3TKSC 10GSA 1S3CA 4YAVA 2VL9A 1OYJA 3F3RA 4I2UA 1WWJA 1SKWB 3HYPA 2REMA 3GTUA 4OCEA 5EY6A 1CQHA 1HD2A 2H1DA 5DALB 4ZB8A 1UC7A 4MF7A 2X8GA 4Q5RA 3GFKA 5G1LA 2LRCA 3EU3A 3LORA 4EO3A 3C8EA 1SL1B 3RAZA 1QGVA 1QFNA 3GKNA 5GAND 6GSYA 1I5GA 4QQ7A 1GSUA 3D4TA 1TRVA 2ZUPA 3IK7A 2HLSA 1ACVA 5IO2A 20GSA 3GHAA 3GKMA 1AC1A 1X5EA 3D21A 3US3A 1W4VA 2RM6A 2H6XA 5B6NA 1YDKA 3BCIA 3DIEA 2CX3A 3FZ4A 2PERA 2H0IA 4WR5A 4F03A 6GSSA 4RI7A 2CQ9A 3FEUA 4ML1A 2RLIA 2TRXA 2H74A 3EYTA 4WEYA 2DC5A 1DSBA 1A8LA 2O87A 2LSTA 3L9UA 4O32A 3CRUA 5F05A 4HZ4A 5CRGA 2EIRA 5C04A 4O92A 5ELGA 2X99A 1FVKA 2K8VA 3W8SA 4KUNA 3LJRA 1ERTA 2JZRA 2M72A 5EVOA 1ABAA 3VWWA 3WT1A 2TIRA 3FK8A 2FWGA 2VLVA 4ZBAA 1SJZA 2L59A 1K0OA 5FWGA 2CX4A 2H1AA 2TRCP 2EIQA 4GSNA 2VD1A 2GVPA 4WETA 4PNGA 4TXOB 4OFTA 4GQCA 4IP6A 4PXOA 1M2DA 1KNGA 1JZOA 2CVBA 5JCUA 2GSSA 1UA5A 2F9SA 2LRNA 4MPFA 2VO4A 3J7Yk 1IYHA 2GLRA 3FHKA 5AN1A 4EXJA 1GSSA 1OE8A 2K8SA 3PH9A 2O7KA 5B8AA 4BVYA 4TRXA 5B8BA 1SD9A 2YOIA 5ECOB 3G7IA 4IKHA 5JCGA 4WF4A 3H79A 1A0RP 4L5OA 22GSA 1I9DA 2R5GA 1WP0A 4PQIA 4WR4A 5IM9A 1YJ6A 2MBSA 2DJ1A 1O6JA 5FT3A 3CYNA 2A4VA 5E4WA 2RM5A 3LQ7A 4KB3A 2V41A 2L6CA 3CSHA 5ECMB 3UMAA 4DSRA 4PQ1A 5H5QA 4JU5A 1QQ2A 1E2YA 5IPHA 2LV3A 3KIJA 2PMTA 3P7XA 1A23A 4G19A 3UAPA 2IMKA 5ABRA 4TVEA 4I5QA 2N5AA 2IJYA 2OADA 4POLA 2H6YA 3KZQA 1E6BA 2WZ9A 3CRTA 2D2ZA 1Y25A 4GTUA 1Q4JA 3MNGA 3TOTA 2JSYA 4I97A 3VK9A 1ZYEA 4HDEA 5B7CA 2L5OA 4KX4A 5KN1A 2H0GA 3HVSA 1HNAA 2L6DA 2H66A 2GQMA 2H73A 1KEBA 1AAZA 4EUYA 3VLNA 9GSSA 2MMOA 1Z7RA 5ENUA 4ZL7A 4GCIA 4RQRA 3M8NA 2IFQA 3KJYA 1DUGA 5J9CA 2PVOC 3QDNA 3EINA 1H75A 4EVMA 2VL2A 1AIUA 1GSQA 2P5QA 3FYGA 2E0QA 2XPEA 2GSTA 1F2EA 3F4TA 4MZWA 5ECRB 2NVLA 2DSAA 4TR1B 4WBJA 5D9VA 1O7UA 1JZWA 1ZOFA 3ERFA 4OO5A 1R7HA 1JZRA 4GSTA 1EEMA 1K0BA 2CZ3A 1THOA 4OCFA 3AY8A 4ZL8A 2F51A 4G9HA 3GL3A 4ZB6A 4WBRD 1T4YA 4GSSA 5J41A 2KLXA 2A2SA 3G7YA 4Q5QA 2EC4A 3D5JA 4QL9A 5J4UA 4BA7A 4KCAA 2DJJA 3TCOA 2MMAA 5H5RA 2HSYA 5LD0A 2JU5A 3MWHA 1MDKA 1FO5A 5G2ZA 5IOXA 3LG6A 1G6WA 3IPZA 2YANA 2B1LA 4XRDA 2JACA 4KW6A 2XBQA 5C00A 4ISDA 3ERWA 3I43A 2OBIA 2NDOA 2E2MA 4NV5A 3HA9A 2DMLA 4AGSA 3TJGA 2E2GA 1XPVA 2IMIA 3HDCA 5G30A 2VCZA 4LLRA 2LNTA 5DJLA 1BQ7A 3UARA 2YWNA 3ERGA 2L57A 4HS1A 4K1FA 4KSOA 3VWVA 5GZZB 5KEJA 1YEPA 2H71A 3LSZA 4I6XA 5EPFA 2M80A 4IN0A 5H5SA 1PL1A 2VL2C 4I8BA 1ERUA 3TJJA 5JWQB 3D22A 3BD2A 3HZ4A 3IOSA 4OD7A 1TK5B 1GULA 2WS2A 1VF3A 1JLWA 3F63A 3GMFA 3L4NA 3EU4A 1IYIA 4OMVA 3TDGA 4IW9A 1TDIA 1VF4A 5F0GA 2FY6A 1S3AA 2LQOA 5D96A 4ACSA 4XS6A 1HQOA 3TKSE 3EC3A 2QGVA 1TP9A 2CT6A 4JEDA 1EZKA 2HSHA 2VCVA 2YJ7A 3UOMA 4FYCA 3PR8A 1GTIA 2LJKA 1AQXA 1OC9A 2AHEA 2PBJA 4AJ6A 4NMUA 2PGTA 1F37A 4NPBA 1GWCA 5G1KA 1SK1A 1TK0B 1Z6MA 2DLXA 1K0MA 1XWAA 1WIKA 1USBA 1T3BA 4E8HA 3LXZA 2BJXA 3ED3A 2IN3A 2CAQA 3QCPA 4ZBBA 1LU4A 1M9BA 1U88A 4HZ2A 4N11A 2B5XA 1ON4A 1PKWA 2HT9A 4NV2A 4PUAA 5HFKA 2I4AA 5CRDA 3RPNA 3G7JA 3FW2A 5ECHB 2OE0A 4MCUA 1M7TA 4HJ2A 2IIYA 2C80A 1TTZA 2FHEA 3GUSA 2DJKA 1GSEA 1SKRB 2LRTA 2V32A 5DJMA 3BCKA 4JRRA 3QD9A 1K3LA 1TW9A 2AV4A 2R4VA 2VCQA 5HQPA 1O73A 4XS1A 3HD5A 3WT2A 5D9WA 3KMOA 2QKEA 3LFLA 2OJLA 2I81A 4J57E 5ID2B 2WRTA 5CNWA 1TRWA 3DD3A 3ISOA 6GSVA 4EC0A 2H01A 3TRQA 2JADA 4IBPA 5IQYA 3RHBA 4MP4A 4PGTA 1GTAA 4GQFA 4ZBDA 4ZXGA 3PGTA 2H76A 2AAWA 3TKRA 1PGTA 3L9VA 4O5RA 2AB6A 2LS5A 1XBSA 2DJ2A 1UN2A 8GSSA 4HQSA 3TJKA 3I69A 2RUFA 4G2EA 5JWRB 3ZTLA 2G2QA 3CBUA 3PINA 3QFAC 5CRHA 2VLTA 1M2BA 2C8UA 3F9UA 1GTBA 2ON5A 3IHQA 4ULXA 1ZGNA 2F3MA 1R26A 2FA8A 2VCXA 4N10A 4V2MA 1AXDA 5F07A 4CDOA 3CTFA 3LGCA 5EL8A 3EURA 5DAKB 5CRWA 2C0DA 3GL5A 5AISA 1R5PA 4XS4B 2B5EA 2LTKA 2YV7A 3U5RE 5AGYA 4BL7A 3DMLA 1KBNA 3O3TA 1X5DA 3VI7A 2HZEB 4IP1A 3GKKA 3IBHA 4MJAA 3P2AA 3APSA 2HRFA 1PL2A 1SK2A 6GSWA 4K9ZA 5CO3A 5IMZA 2JSZA 1XW6A 1OC3A 4L8EA 5IMCA 3TUEA 3M9JA 4KCEA 2VOCA 2I9HA 4IS0A 3DVXA 2VL3A 5J9BA 4LMWA 2NBSA 4N30A 14GSA 2FWHA 4NXIA 2H8LA 2GS3A 4DVCA 1Z9HA 3NZNA 3QAGA 2H30A 5ELAA 2KHPA 2CVDA 4TXOA 1GH2A 1SJIA 4FYUA 4TR0A 2EIOA 5ECQB 4PQHA 3S9FA 3RHCA 3IA1A 2HFDA 1J0FA 2V2GA 1TKDB 4MF6A 1X9MB 2VLUA 2X64A 5D8IA 2V6OA 3CTGA 4IJIA 3KCMA 3GX0A 2XPDA 4EL1A 3GURA 4F0BA 4X43A 2WULA 4HU9A 1B4PA 3KXOA 3DXBA 3GIXA 4IQ1A 1EV9A 4XHMA 2F8FA 3Q6OA 1SKSB 4J56E 1MD3A 3DYRA 3A2VA 1GUMA 2H72A 5A4UA 11GSA 1GNWA 1F6MC 1GUHA 4K7NA 3HXSA 3FZ9A 4DSSB 1R5AA 4NHWA 2HE3A 2IPAA 3ZFBA 1PA3A 16GSA 2N5BA 1PX6A 1Z6NA 4JZQA 4WXTA 2VIMA 3ME8A 1SENA 2O8VB 2MZCA 1URMA 1B9YC 3UEMA 4IQAA 1XOBA 2HZFA 2GTUA 2GZPA 3GA4A 1UVZA 4X0XA 3LEFA 13GSA 3F3QA 1U3IA 1XWGA 3HZ8A 4CHSA 3JCML 3UL3A 4MH3A 1TK8B 1YZXA 2GZZA 4ZILA 2C3TA 3GV1A 2CAIA 2KOKA 5IMFA 2WCIA 2LQQA 4KAEA 3H1NA 1M2AA 1PN9A 4ECCA 4Z7XA 1A8YA 1T4ZA 4CW9A 5INYA 2I3YA 4N0VA 4KE3A 5E59A 3MSZA 4AF2A 2FWEA 2DIZA 1V9WA 3Q18A 1JLVA 2YCDA 2C0FA 3W6GA 3KM6A 2P5RA 2GSQA 3M0FA 5D9TA 5B6MA 2LNSA 3H93A 1V57A 4I2TA 1OVNA 1FB6A 4QL7A 3O76A 2HYXA 2IL3A 1VF1A 3DEXA 2H19A 3UBLA 3C71A 1KTEA 2IMDA 3HVVA 2P0GA 1WJKA 1B9XC 3VWXA 4F82A 1SD8A 3M9KA 2ES7A 4MABA 3SBCA 3VWUA 1BX9A 1EOGA 4HI7A 4KA0A 3ZMLA 5DCHA 3GRXA 1QMVA 4MA9A 1XIYA 2GGTA 2AUVA 4ML6A 5HFIA 3ZVJD 2FA4A 2GQKA 3APOA 3G9BA 5HR0A 4TR3A 4MPGA 3BJ5A 4O7HA 3QOUA 1EP8A 1V2AA 3H4KA 4K7OA 1XXUA 2B3SA 4K0GA 1AW9A 4K7IA 2H1GA 5F8BA 1SU9A 1X5CA 5DCGA 1VRSD 3C1SA 2FGXA 4RI6A 1XW5A 2WJUA 1PRXA 1J9BA 4WKWA 1A2LA 4HJMA 4DSQA 2YN1A 2YNXA 4POMA 2HXKA 2GT6A 2H75A 4F2IA 4YQVA 5GSSA 1XWBA 2O89A 2PPTA 12GSA 5DQSA 3ZVJA 1A2JA 2B6MA 1T1VA 3HKRA 1EGRA 6GSXA 3N5OA 1C72A 1XVQA 3J7Yb 1YQ1A 4IHUA 2QSIA 4HEA2 2R3XA 3K8NA 1Y6EA 2YV9A 3ZIJA 5LNKe 1S3DA 1ZYQB 18GSA 5HR2A 4FYBA 2IMFA 3F4RA 4GRFA 4BWSA 3TKQA 2B1KA 3L0HA 1BEDA 6GSTA 2XBIA 1XZOA 1OAZA 1THXA 1N8JA 1HNBA 2VM1A 3FR3A 5ECSA 3ZZXA 4FH8A 4MDCA 2YWMA 4ZL9A 1PMTA 1M0UA 3C73A 5ECKB 3P90A 1TRSA 4D73B 3IC4A 1FVJA 1BYEA 1BAYA 1BJXA 1OE7A 4PNFA 3P8WA 4MJBA 5CYYA 1MDJA 4OFNA 1WPIA 2X8HA 2H0HA 1ERWA 2YPMA 3GH9A 4X1UA 1HYUA 4IJ3A 4J2FA 5ECLB 2FNOA 3KEBA 1TI3A 3QAVA 1ST9A 2RUEA 4KNDA 4BPYA 1QUWA 3UBKA 4HOJA 4JE1A 3ZMKA 5KN2A 2DMMA 1TRUA 2ON7A 3TKPA 1GP1A 3IAS2 1A2MA 2JL4A 1QXHA 4XTSA 4JR4A 3QMXA 2K18A 1MD4A 2LJAA 3M3MA 3UIWA 3UVHA 4IELA 2L5LA 1NM3A 4GWRA 4EKZA 1ERVA 3LWAA 2R6KA 3ZL5A 3GTUB 2HNLA 2GT5A 2OE1A 1V98A 2N5FA 3HJMA 1M99A 4V2LA 2F8AA 1GSFA 2HRNA 3MAKA 1JZDA 1MDIA 2KUCA 2LUSA 3CSJA 3GX8A 3ZIVA 4KH7A 2AJQB 4EE0A 1XOAA 3QR6A 1TU7A 5DALA 5KN3A 5ID2A 5GAPD 3IXRA 5HR1A 1GRXA 3F6FA 2V6KA 2IWTA 1HNCA 1V40A 2YP6A 1O85A 2R2JA 1B48A 1NSWA 2MMZA 5IPGA 3CMIA 1PQNA 5IOWA 3Q19A 3WD6A 2H6ZA 1K3YA 4LL4B 3D0ZA 2XHFA 1K0CA 1CQGA 1AUCA 3MDKA 1EP7A 3HJOA 2Z9SA 3GNJA 1NW2A 3GH6A 4V2NA 2IMEA 4AJ8A 1M9AA 3WGDA 1WMJA 1DE2A 2L4QA 1JFUA 2WFCA 2C0EA 1NHYA 1FW1A 4MMMA 2FWFA 3IE3A 1K0NA 3NIVA 3KMNA 4MJEA 4LL1B 5ECIB 3ZRDA 4DEJA 1SK0A 2BTOT 1EEJA 1PSQA 3GSSA 3KTLA 4PX1A 2JZSA 3A3TA 2OE3A 4BWQA 2FLSA 1YEXA 1SYXA 1FHEA 1YF0A 2VCTA 3VFIA 2DJ3A 4F9ZA 3UVTA 1U6TA 5HR3A 2K9FA 2B7KA 1FB0A 1GNEA 5DAKA 1AQVA 2PVQA 3EWLA 3BOAA 4ID0A 3EMXA 4XS4A 4OWYA 4WF5A 3ZFLA 5GSTA 2VUPA 1QK8A 2X8CA 2J23A 2HZEA 1G7OA 4LMVA 2DJ0A 1LJRA 4ZIJA 3ZLPA 2PN8A 3C7MA 2C3QA 1Z7PA 3TJFA 4V1Ap 1YKAA 1Z3EA 4MJCA 3IAM2 2FD3A 1SJ6A 6GSUA 2YJHA 3ZITA 3QFBC 1ML6A 2P31A 1J08A 1FG4A 2CA8A 3IV4A 5F06A 5IIZA 3L9SA 4PUFC 4KSMA 1OKDA 4NHZA 3VPTA 1RW1A 2V1MA 2FUG2 3C1RA 1GSDA 1X0RA 3H8QA 19GSA 3HY2A 3FR6A 1V58A 1NHOA 3U6VA 1TI1A 1DBYA 1MTCA 2PWJA 1G0TA 3M1GA 1ILOA 1ZMAA 2PUKC 2LJRA 1X9SB 3GKXA 1ZCPA 1TXXA 4IVFA 2MYGA 1VGLA 5A4VA 3IR4A 3ZYWA 1MEKA 4MZBA 2MMNA 3A2XA 4YQMA 4TXVA 2VD0A 1B8XA 2JZTA 1TJDA 4RUVA 1O8WA 2XC2A 3DVWA 3GN3A 4KDYA 4AJ7A 3KTBA 2LKUA 1U87A 1GLPA 5G31A 5G5FA 3R2QA 1Z5YE 2QC7A 1K0AA 4TKYA 4OO4A 5D93A 3Q74A 3FZ5A 3RPPA 5IO0A 3KGKA 4BVXA 5IMVA 1YY7A 2H1BA 4XCSA 3HVXA 3L78A 5A4WA 3TJBA 4DSSA 3VPQA 4YAPA 4GLTA 2E7PA 3DGQA 2M46A 2RIIA 2PU9C 1XWKA 1U3AA 2YZHA 1G6YA 1A0FA 3GYKA 4JBBA 1GLQA 1WOUA 2GDRA 2KP1A 4ECJA 5J5NA 2GZYA 3TOUA 3E9JB 3I6AA 3EVIA 2DBCA 2GQLA 4H86A 3FY7A 1EV4A 3F6DA 1O8XA 4XIHA 3CXGA 1GTUA 1FOVA 3IK9A 4KDXA 4MK3A 3E0UA 2IFQB 3CSIA 1GUKA 4P3YB 4MH2A 4RQXA 4FIWA 1ZZYA 2FCHA 4ZB9A 2VAFA 1K0DA 1WRYA 1T7PB 3WGEA 4GF0A 4TN8A 4XRAA 1TU8A 1F3AA 4ECBA 1XCCA 1YF1A 3KP9A 2I1UA 3TB2A 4MZCA 5JCWA 3IDVA 5IMAA 2CZ2A 3O6TA 1RQMA 4V1Ag 3I9V2 2L4CA 5CAXA 4LA1A 3WYWA 1B4QA 5IMDA 4YQUA 5G5EA 4TR1A 4MF5A 1F3BA 3A2WA 1AQWA 2C0GA 3QPMA 3QAWA 3EE2A 4EF0A 4G10A 3EMPA 3APQA 2B7JA 1SL0B 3NOFA 4HUAA 5CP1A 3A5WA 3D6IA 1XVWA 4Q5NA 3BBYA 4KDUA 4FO5A 4TOPA 2J9HA 5J3RA 2AYTA 1SL2B 4PURA 3TRXA 3DWVA 4L0UA 2YWOA 4F0CA 1R4WA 2HI7A 5A5KA 3LYKA 3ME7A 2B5YA 4TW5A 1K3OA 3FR9A 5DDLA 3VI5A 3RDWA 2CV4A 2OA7A 5DQYA 2H70A 4KGIA 3WGXA 2ALBA 2K6VA 2WGRA 2C1YA 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