1RYOA

Human serum transferrin, n-lobe bound with oxalate
Total Genus 103
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
103
sequence length
324
structure length
324
Chain Sequence
KTVRWCAVSEHEATKCQSFRDHMKSVIPSDGPSVACVKKASYLDCIRAIAANEADAVTLDAGLVYDAYLAPNNLKPVVAEFYGSKEDPQTFYYAVAVVKKDSGFQMNQLRGKKSCHTGLGRSAGWNIPIGLLYCDLPEPRKPLEKAVANFFSGSCAPCADGTDFPQLCQLCPGCGCSTLNQYFGYSGAFKCLKDGAGDVAFVKHSTIFENLANKADRDQYELLCLDNTRKPVDEYKDCHLAQVPSHTVVARSMGGKEDLIWELLNQAQEHFGKDKSKEFQLFSSPHGKDLLFKDSAHGFLKVPPRMDAKMYLGYEYVTAIRNLR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title The oxalate effect on release of iron from human serum transferrin explained.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Serotransferrin
molecule tags Metal transport
source organism Homo sapiens
total genus 103
structure length 324
sequence length 324
ec nomenclature
pdb deposition date 2003-12-22
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ryoA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1ryoA02
1M5BA 1JEUA 3F11A 1B52A 3KJTA 4OEVA 4QF9A 2DVCA 3M3FA 1MDQA 3T9VA 3VDFA 4ELPA 4NE4A 1SDXA 1OQGA 3HHGA 2PBWA 3FD3A 4F1VA 1DTZA 4LQ2A 2Y84A 5AE4A 4H67A 1T0KA 1OVTA 2RF1A 2AIXA 3OXNA 1N76A 3TTNA 1H76A 1LSTA 1P1UA 1OQHA 2WKYA 4IO5A 4R9FA 4DE8A 1J1NA 3V5AA 1XVYA 4DDDA 2F7CA 4JB7A 1LB8A 4PFTA 1SYIA 1URDA 2Z23A 3PPOA 1WVJA 2QS4A 3A3UA 5I58A 3TZAA 4EF2A 4AB6A 1B40A 1BTJA 4KYDA 2DYXA 3ZKKA 1I6BA 4BDRA 1IEJA 5KDTA 4UACA 1IZ1A 3M8UA 4L17A 3SEVA 3IOTA 5KCJB 4KI0E 4R6YA 4R2BA 4OETA 4JWOA 5M2VA 1S7YA 5EHMA 3RN8A 3FVGA 3FASA 1XVXA 3TPAA 3U1OA 5TPAB 4KCDA 3OEKA 3HSTA 3IOVA 2B65A 2ONKE 1H44A 1A55A 1FQFA 5ICTA 5B7DA 3RT6B 1SW2A 2O6AA 1II5A 1OLCA 3B6WA 1LGBC 3C4MA 5FHMA 3QUJA 4MH5A 3PUXE 3K6UA 1AOVA 4C0RA 4G8HA 3RTWB 1LB9A 3O6HA 3CIJA 3Q26A 1LCFA 5FTHA 4R2FA 1FCKA 5TP9A 1US4A 1NMUA 4RPOA 4R72A 3K00A 1O63A 1AMFA 4ZEIA 2Q2CA 3R26A 5L9MA 3DP6A 1MQJA 1MY4A 2QSXA 2RC9A 1QUJA 4U1ZA 3H6TA 3VVFA 3U93A 3SEXA 2XXYA 4JWYA 2DWJA 2FNCA 4Q5TA 3U94A 2DE2A 4ZECA 5K2YA 4NEDA 1GR2A 3RPWA 2Y7WA 2OZZA 1R6ZA 1B3EA 3R7XA 4LZ8A 1S9TA 4YB7A 4P0GA 3W15C 3IJOB 4BLAA 1SYHA 2D3IA 4U4XA 2GHAA 4YZZA 3LSWA 1B32A 2KLFA 1SI1A 3C36A 1GTKA 4H5GA 2OJTA 3N94A 1N04A 1Y9UA 3K1PA 3KSXA 5BWJA 1B3LA 2VP1A 5IAIA 3PD8A 4RPNA 3BBRA 3MP6A 5L8DA 2A5TB 4HCWA 4NWCA 4TQUQ 2F6GA 3PPQA 1CE2A 2HEUA 5CMKA 1Y1ZA 2GRVA 3H6UA 1YPNA 1MXWA 1NH7A 3FIRA 1LAXA 2H25A 3ILUB 5AA4A 4F3PA 1Z7ME 2F35A 3IB0A 1F9BA 1ZMGA 4R6HA 2IEEA 3IB2A 2XX8A 1IIWA 4LATA 3Q27A 2PX1A 1MQDA 2H99A 1NH8A 2QJEA 2Y7KA 3QSLA 3IJXB 3KEIA 4BDLA 1B7ZA 1MM6A 3S9LC 1N7XA 1DPPA 4BDOA 3IK6B 2DS9A 1UTBB 1MM7A 2I4BA 2O69A 2G29A 4YICA 1NL5A 2F36A 4RK2A 1SW5A 3LC8A 1QULA 4R9GA 4F2OA 1PC3A 3OSRA 4FAJA 3CFXA 5HBCA 2RC8A 3IO4A 4KHZE 3DM0A 1LFGA 2O51A 1PEBA 2CZLA 1DPEA 1M5DA 4IO7A 1B5IA 3MQ9A 2H98A 1MDP1 1POY1 4POXA 4AQ4A 3H7MA 3S9NC 3IX1A 4HW8A 3QK6A 2I0BA 1O7TA 1WDNA 1POTA 4Q0CA 1FTLA 4FECA 1YAEA 3TTLA 3K6XA 3S9MC 5L9SA 4K3FA 1N7WA 1MXVA 4RYAA 4GRKA 4C1UA 4GVOA 1ZLQA 3PPRA 4P11A 1B0LA 2V84A 3KN3A 3HCQA 5DVIA 4FATA 2R6GE 3FJMA 1MRPA 3FV1A 5AA2A 1JW4A 4PFWA 4WEPA 4BDMA 2DE4A 3OO8A 2H5YA 1DMBA 4DXUA 5L9OA 3EHTA 3H6VA 4N6PA 5H8HA 1FQCA 1OVBA 4ZE9A 1XC1A 2A5SA 3A09A 2F78A 2XXXA 2DVZA 5DYHA 1IQ7A 1B3FA 4GQOA 2DSFA 2XXUA 1HSLA 2G93A 2HZKA 1MY0A 1SVXB 4PFUA 1ANFA 1ZKBA 1ZTYA 2V3QA 3PUWE 2Q8JA 4QFPA 2O84X 2OBGA 3D4GA 4ELOA 3C34A 2HXWA 1FQEA 3UIFA 5A5XB 4NF6B 1CB6A 3OEMA 4U4SA 3FGSA 4QFOA 4PE5B 1ELJA 2E1SA 2Q89A 1AL3A 2I3WA 3T96B 5H8QA 3OO7A 3KBRA 1R9QA 1P1QA 4NF5A 2M8CA 4XTCQ 1A99A 5EHSA 2VOZA 3CSGA 3V89B 2ZNSA 1TXFA 1EZOA 3QYTA 1B5HA 1B2HA 4G8MA 3VXCA 4YMBA 2XXRA 4F29A 1VR5A 3BKIB 3FVOA 3UGWA 2ANJA 1S50A 4GD5A 3T9HB 3SKPA 3EHSA 3O97A 5LOMA 3FJ7A 1B6HA 4OEUA 4IY6A 3G3FA 1A8FA 3Q25A 2F34A 4BDNA 3TMGA 2RINA 2NWJA 4LUBA 2I3VA 4LVQA 3T9XB 1B58A 4QSEA 4DXCA 4R74A 4KQPA 5ELVA 4GIZA 3V8XB 1B1HA 4KR5A 4QFNA 1QKAA 2DWIA 3PPNA 2HCAA 4NF4B 1SI0A 3OO9A 3G3IA 2O7IA 4WEDA 1EZPA 3C32A 3OENA 1R9LA 3IORA 1ZIUA 4GFRA 3K01A 3ECRA 3QAXA 5I57A 1FTKA 2AYSA 1LAFE 3PGFA 1Y20A 1AH5A 4DIGA 4XIGQ 5H8FA 5CRYA 4QRZA 4QHQA 3KG2A 1UTHB 2F97A 2UYEA 1PBPA 3O2AA 1B51A 3U92A 3TQLA 4OTEA 2I6EA 2V93A 3N26A 4KFQA 4YAHX 5JTYB 2HAVA 3PMWA 1ZU0A 5I56A 1XOCA 2DXRA 3CSBA 1SQYA 4H1XA 2F7AA 3BFTA 3K6VA 1A40A 1LFIA 3Q29A 3TELA 3UN6A 3FJGA 4DXBA 2DQVA 1LAGE 4WKMA 2O68A 3KN7A 2DOJA 3CRBA 3MJNA 1L5TA 2ABHA 5AA3A 4BDQA 2HFBA 5ISUA 1LAHE 3HHFA 2QMXA 5I2KB 2F7BA 1BIYA 3AXFA 5ITOA 1ATGA 1DSNA 3IAZA 3EHUA 2AL4A 1B9JA 1YTVA 4X48A 1N3WA 2F8DA 4RK9A 5CBRA 4IO3A 5I2NA 4JDFA 1FQAA 3TFLA 2ZYMA 2QPQA 2O1LA 3K0VA 3A3CA 1GGGA 4ND9A 5H8NA 5CBSA 4RJZA 4F1YA 2OCUA 4MLQA 1SW4A 3PUVE 1JEVA 3E13X 4ONYA 4ESWA 3S4UA 4HTGA 1ZJLA 2QL3A 4ZEFA 4DCXA 1HSEA 1QJMA 4NF8A 5ICQA 3WAFA 4MF3A 5DEXB 2ONRA 3VE1B 4F22A 3M3KA 5I59A 2Q9TA 3RGYA 3U8QA 2OWSA 3VXBA 4R75A 4OMBA 1PB9A 5CC2A 2PT1A 3TTRA 3G7WA 5KZTA 3KN8A 1N0TA 4RA1A 1Y4TA 3B6QA 3M3LA 1MH3A 1UIVA 4JSOA 4E0WA 4IGRA 2XXVA 1QKBA 1M5CA 2I48A 3I5OA 3SERA 1P1NA 3MAMA 4NWDA 4IO6A 1MQHA 3C33A 4PP0A 1SBPA 4GWOA 4XKPA 3G3JA 3FUZA 1LCTA 4F1UA 2PYYA 3CR9A 4OFJA 3MP1A 4THIA 2Q88A 1TWYA 5I58B 4EUOA 5CM6A 3P7IA 3BFUA 4N13A 4QSDA 4ZEDA 5KDTB 3TCHA 4TLMB 3TODA 2LAOA 2ZYOA 4DZ1A 4RNSA 4ZEBA 3RT8A 1Y3PA 4R6KA 4EQBA 3PUYE 2UVIA 1JQFA 4JXIA 2XD2A 4OWDA 3IOWA 4H65A 3LUYA 3T9UA 2VD2A 1Q35A 3TCGA 1B4ZA 3MWBA 4GOTA 4GL8A 2GH9A 1PB7A 4RXLA 4NTLA 2H4IA 3OO6A 4F31B 4PETA 5B70A 4JBZA 2YJPA 4FEDA 3VVEA 4OQOA 4KD5A 3R6UA 3PMVA 3O29A 3MUQA 4IO2A 4ELQA 4U22A 3C35A 5CMMA 2UXAA 5TP9B 4ECFA 2QRYA 2Q2AA 4OHNA 3TTKA 1N84A 5CMBA 1DTGA 3PMXA 2DXYA 1JNFA 4M4GA 1H43A 2Y7RA 4MLVA 3CG1A 4X9TA 3T93B 5K2XA 4YB6A 2VHAA 1ZBMA 2X26A 3FXUA 4G2ZA 2F5XA 2FA7A 5JK4A 4POWA 4X1BA 5KCJA 3CG3A 3RLFE 1XS5A 3VLVA 1M5EA 4I1DA 2XX7A 4GXAA 5TPAA 3CFLA 4ZDMA 1HSJA 1H3DA 4HCYA 4MFIA 3GZGA 1TFAA 1MXZA 1MY1A 4Q8RA 4G8NA 1OMPA 3W9VA 2NUVA 2XX9A 3KZGA 3SEUA 3IR1A 2GHBA 4HS7A 4AB5A 1IXGA 5AA2D 3MZ9A 3SEWA 4IB2A 4KCCA 1B3HA 1EH3A 4F18A 3MZBA 5I2KA 3OOAA 3EPEA 3K6WA 3PU5A 3OD7A 2XXQA 5HPQA 1OLAA 2P2AA 3TEPA 2I4CA 4YMAA 5AA4B 3D4CA 3TQWA 3K2DA 1USYE 1O64A 2D5WA 4ZZEA 1IITA 1IXCA 3MVYA 4XKRA 3MPLA 3T66A 4ZS9A 3LR1A 1D4NA 2O7UA 2R9JA 3LSFB 4GL0A 4GXSB 1WODA 2YPNA 4Z0IA 4X1DA 3QIMA 3C31A 3ZS6A 4Q30B 2UVJA 2REJA 2UYFA 3ODBA 1Y3QA 3O6GA 1B7HA 3UK4A 4ZZAA 2QS1A 4O3BA 4XXUA 2V3TA 1MPBA 1EZ9A 3MVZA 2DE3A 2ESNA 3RUMA 3TTMA 4XKNA 2GFEA 1I69A 2R71A 4JWXA 5DT6A 4YU0A 3MW0A 2ZXTA 3PUZE 4EDPA 1JETA 2A5TA 3VVDA 2X7QA 3G3KA 1US5A 1B0HA 2RCAA 4F2QA 1B7UA 3DP8A 4EQ9A 1A8EA 3SETA 4WXJA 2X7PA 1MQGA 5BUUA 4MBPA 4U21A 1QVSA 4KPTA 1FW0A 3LSXA 3FATA 3KOSA 4H5FA 3G3HA 1FTJA 3V83A 2I58A 4G77A 4OENA 1VSOA 4YKPA 3PPPA 3VFJA 3FVKA 2ZNTA 3FXRA 1B46A 1I6QA 3JZJA 1FQBA 1D9YA 5ITPA 4KYSA 3W9WA 2VD3A 2VGQA 1PDAA 3E9XA 4F19A 3FXQA 3E4RA 2THIA 1B5JA 1UTBA 3MVWA 4EXLA 4IY5A 4OFOA 3O9PA 5AA2B 2ALUA 3OMBA 3MZ1A 3K4UA 1AIVA 4ISUA 5DVJA 5H8HB 4LQ5A 1IUDA 4ZE8A 1RKMA 2NXOA 1FTOA 1NFTA 2HAUA 4PQJA 1LBCA 3O28A 4JSDA 4LZ7A 4G68B 3KGCA 1UQWA 1RYXA 2XXTA 1LFHA 3USDA 3KJ7A 3TAJA 5HM4B 2QS2A 1OIBA 4DCYA 2IA4A 2XXIA 5J1DA 3HV1A 1NKXA 1UIUA 3H3GA 3FZVA 1JVXA 4NMYA 3IL1B 3KOTA 3TYHA 3KFMA 2XXPA 3THIA 3MBPA 3OSQA 2Z22A 1N3XA 2UVHA 1BLFA 4FEBA 3GLBA 2QMWA 3H03A 3RNNA 1QW0A 3JV9A 5F1QA 2B3BA 5H8QB 2B3FA 3H4ZA 3LSLA 4H8IA 3QXMA 4IO4A 3N6TA 3TCFA 3B7DA 4U23A 4NF5B 4OERA 1GV8A 1QUIA 3ZSFA 3MC2A 4EF1A 3SESA 2AL5A 4FE8A 3GXAA 3RTFB 1KWHA 4N07A 2FYIA 2REGA 5CMCA 3B6TA 4OESA 3CVGA 3VLUA 3L6GA 1VFDA 4ELRA 1GVCA 5AA1A 3G3GA 4DLDA 3HPIA 1SD3A 2Y7PA 5IKBA 1VE4A 1MQIA 4EQ7A 3ONMA 2ZNUA 2Z8FA 4FIMA 1Q1KA 4F39A 1R1NA 3IO6A 2Z8DA 2OK2A 3ILTB 1NNFA 1B4HA 3C9HA 5I84A 1A54A 4U2RA 1JVYA 1D3KA 1JW1A 4O3AA 4F3BA 3N5LA 1MXXA 4FJPA 3OELA 3JYRA 2PVUA 3EQ1A 2I49A 3QUFA 1I6AA 4I62A 5A5XA 4NF6A 4G4PA 1B3GA 2ZYNA 3N6UA 4IGTA 1MPDA 4YB5A 3DLNA 1A7LA 2DP8A 1B1XA 3O66A 1JW5A 1MXYA 4LZ5A 3PV0E 2PMSA 4OYVA 1LLSA 4TOZA 3VV5A 5I57B 1LBBA 1TFDA 2ZYKA 1Y1MA 5H8FB 3TUSA 3DP4A 4OXVA 1EU8A 1XT8A 2Y7IA 4O3CA 1SW1A 4GF8A 3T22A 2XD3A 1P1WA 1FQDA 3H06B 3GBAA 3HN0A 4LP2B 3SEYA 1IXHA 5I56B 1NNKA 4ZEKA 4U1OA 3I6VA 3GBBA 1RYOA 2E0SA 2P1SA 1Y3NA 4EXKA 1BP5A 1BKAA 3K1NA 3E3KA 4I8CA 1PB8A 3WAEA 1MPCA 2V3UA 3IB1A 1VFEA 4ESXA 4YKJA 3KSJA 3EN3A 2HQ0A 4PFYA 5F7VA 4FORA 2Z8EA 1P1OA 4G68C 4UA8A 5I2NB 1USYH 2NVUB 4NF4A 2DWAA 4GLIA 4QFKA 3RY3A 5FTIA 3ZKLA 2BJJX 2XXHA 5H8NB 4I9DA 1MXUA 1MG1A 2H9BA 3L6HA 2CMOA 3H6WA 4TLLB 2P0SA 2OLBA 1NNPA 5FHNA 4C1TA 1Y4CA 3I3VA 2RKMA 1UTHA 4NF8B 4LONB 1MY3A 3TDJA 4LA9A 3K1MA 1H45A 5TU0A 3FVNA 4M1VA 4QSCA 3UORA 1B05A 5JTYA 1IXIA 5I59B 2W7YA 4P0IA 1MH4A 1Z7NE 3LBSA 3EF7A 3MPKA 4QFLA 2YLNA 2PT2A 3PD9A 4XKQA 4E0XA 4R73A 2I0CA 3MVXA 4KYEA 2O1MA 4G68A 5DTBA 3IOUA 4F3SA 1URSA 2HZLA 2RC7A 1XHYA 2D21A 4OVJA 2XXWA 4H6DA 1M5FA 3CFZA 2V25A 1NNTA 2ZMBA 3UP9A 1DOTA 1P99A 2F6PA 1D9VA 1FTMA 3FV2A 1PBQA 4YKIA 3UA8A 1MY2A 2DWHA 3MP8A 1TT1A 5EYFA 2OWTA 4RY1A 2RCBA 2NOOA 1URGA 3TKDA 3VLWA 4OFLA 3CI8A 3SDFA 3S2VA 3K02A 4F3GA 2QS3A 3S9EA 1YCJA 2XHDA 3O6IA 4Z7EA 4YKKA 5DEXA 5H8SA 3Q28A 3DELB 1QUKA 4H0WA 5JEIA 5CI5A 5FHOA 2UVGA 1MS7A 4OZ9A 2ONSA 3U72A 3HO7A 3RQTA 5DVFA 4H8JA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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