The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
58
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSAADKTNVKAAWSKVGGNAGEFGAEALERMFLGFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKAHGKKVGDALTLAVGHLDDLPGALSNLSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLSTLAVHLPNDFTPAVHASLDKFLSSVSTVLTSKYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen storage/transport
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| molecule keywords |
Hemoglobin alpha chain
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| publication title |
Crystal structure of haemoglobin from donkey (Equus asinus) at 3A resolution
pubmed doi rcsb |
| total genus |
58
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2003-12-31 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 3GQG B; 2HZ2 A; 1Y8H A; 1YEO A; 2NSR A; 2VLX A; 1Y83 B; 1Y8K B; 5EET A; 2D2M B; 2MHB A; 1YE0 B; 2LH3 A; 3AT5 A; 5CMV A; 3QJE B; 1FAW B; 3UHG A; 5EYJ A; 1Y4B A; 2ZT2 A; 2W31 A; 1YEU B; 1MLQ A; 1NS6 B; 3D1A B; 1Y4Q A; 1HBG A; 4ESA B; 3BA2 A; 1G9V B; 3BCQ B; 3DHT A; 1MYF A; 1XZU A; 2H8F B; 1BAB B; 1ABY A; 2LH5 A; 4NS2 A; 1KD2 A; 1A6M A; 3ZJP A; 2EF2 A; 3ASE A; 3CIU A; 1DLW A; 1J7S A; 3GKT A; 2ZSQ A; 2GRZ A; 1QSH A; 2HBC A; 1LFQ A; 3IXF A; 1Y2Z B; 1Y0T B; 1BUW A; 1FHJ B; 4MQG B; 4TYX A; 4L7Y A; 1DXC A; 1Y45 A; 2NRM A; 1YEO B; 5CHR A; 1JZK A; 3GDJ A; 3S1J A; 2MHB B; 1S5X A; 5EYS A; 3AT5 B; 2O58 X; 2GLN A; 4O1T A; 1NZ5 A; 1Y4B B; 1X3K A; 1Y4Q B; 1K0Y A; 3DUT A; 4B3W A; 1CPW A; 1IDR A; 1HGA A; 4KN3 A; 3DHT B; 3IA3 B; 1OUT A; 2BWH A; 1XZU B; 105M A; 2DC3 A; 5HU6 A; 1CLS A; 4MPM A; 3A5G A; 2ZFO C; 1MLN A; 5CN7 A; 1ABY B; 1HAB A; 3HRW A; 2DN3 A; 1URY A; 3PT8 A; 1IWH A; 1A6K A; 1KD2 B; 1LH2 A; 3CY5 A; 4G1B A; 1UVX A; 2G0V A; 3CIU B; 1CH9 A; 1HGB A; 3WR1 A; 1QXE A; 1J7S B; 2MGI A; 1QSH B; 2HBC B; 1LFQ B; 1UVY A; 1BUW B; 1BZZ A; 2QFN A; 2EVK A; 4F6I A; 4L7Y B; 1NPF A; 1Y45 B; 1JZL A; 4ROL A; 3WCU A; 3GDJ B; 4F4O A; 1C7B A; 3WCP A; 1S5X B; 3ZJN A; 2DN1 A; 2HBE A; 4MXK A; 2EB8 A; 1YMA A; 3QM8 A; 3MJP A; 3WCT D; 1K0Y B; 3DUT B; 1YEQ A; 3ECL A; 4ODC A; 1HGA B; 2GRH A; 3WCW D; 2ZLW A; 1HSY A; 1OUT B; 2H8D A; 5HU6 B; 2M6Z A; 5AZR A; 1NQP B; 2D60 A; 3WCV A; 1HAB B; 3HRW B; 3G4R A; 2DN3 B; 2W6Y A; 3PT8 B; 3PI2 A; 2XYK A; 2CMM A; 5ILE A; 1DXV A; 1D8U A; 3CY5 B; 1YCA A; 2RI4 A; 1O1P A; 1HGB B; 3LB2 A; 3WR1 B; 5E83 A; 1JL6 A; 2MGA A; 111M A; 1G0B A; 3TLD A; 1BJE A; 2BLI A; 2NSS A; 5EV5 A; 1Y0A A; 3UHK A; 1G08 A; 3QM5 A; 1S5Y A; 1BZZ B; 2ZSN A; 2XKI A; 1L2K A; 1MTK A; 1J3Z A; 1Y0W A; 2HBF A; 1BZ6 A; 4F4O B; 1C7B B; 2HCO A; 3WCP B; 2DN1 B; 2HBE B; 109M A; 2R4Y A; 3MJP B; 2ZSS A; 1Y5K A; 5F0B A; 4JAC A; 1YEQ B; 4MQJ A; 4ODC B; 1Y7D A; 2ZLW B; 3DHR B; 1BIN A; 1A3N A; 2H8D B; 1YEV A; 2M6Z B; 2D60 B; 1U7R A; 3PI3 A; 2NRL A; 3ZJR A; 1RVW A; 3MKB A; 2ZT0 A; 3WCV B; 5KER A; 1JP8 A; 1VXE A; 1YGD A; 2BLJ M; 1DXV B; 3UHD A; 1MLU A; 1Y85 A; 2RI4 B; 1O1P B; 2R4X A; 2PEG B; 3M3B A; 5EE4 D; 2W6V A; 3S66 A; 1AJ9 A; 5ILM A; 3ZJS A; 1G0B B; 1URV A; 1Y0A B; 108M A; 2R50 A; 1G08 B; 4NZI A; 3ODQ A; 1QSI A; 4NI1 A; 2G10 A; 5EUI A; 3UHC A; 3UHW A; 2XKG A; 3D4X A; 5KKK A; 3E5I A; 1R1X A; 1J3Z B; 1Y7G A; 1HDS B; 1XY0 A; 1Y0W B; 1YDZ B; 2HBF B; 1YHU C; 4F6J A; 4OOD A; 3G53 A; 5MBA A; 2EKT A; 106M A; 3A59 A; 2ZFO A; 1Y5K B; 1U7S A; 1KR7 A; 3LB1 A; 4MQJ B; 3G4Y A; 1SDK A; 1Y7D B; 1YCB A; 1MLO A; 1O1J A; 1YEV B; 1HGC A; 2VYY A; 1RVW B; 3MKB B; 5KER B; 4C0N A; 4UIQ A; 1MLL A; 3OGB A; 1YGD B; 2VM0 A; 1XXT A; 1BZ1 A; 1HBH B; 1Y85 B; 5C6E A; 1C7C A; 3LB4 A; 3S65 A; 1CH1 A; 3G52 A; 2FRJ X; 2W6V B; 2AA1 A; 2D2N D; 2D5X B; 3S66 B; 1AJ9 B; 2YRS A; 1MKO A; 5B84 A; 2MYB A; 1BZ0 A; 3MJU A; 2O5Q X; 3ODQ B; 3R5I B; 1QSI B; 2GDM A; 4NI1 B; 4FH6 A; 5EUI B; 5JDO D; 1MLG A; 2HZ1 A; 1R1Y A; 3D4X B; 1A9W E; 4F6D A; 1R1X B; 1Y7G B; 1V4U A; 1O1N A; 1XY0 B; 3ZJO A; 3M39 A; 1J7W A; 3OK5 A; 1Y8W B; 2V1I A; 1N9H A; 2O5O X; 1YE2 A; 1FSL A; 2D5Z A; 3A59 B; 1LH6 A; 3ZJH A; 1J40 A; 5ILP A; 2ZFO B; 3SDN A; 3ZJI A; 2O5S X; 4FWX A; 4L2M A; 4HRR A; 1SDK B; 1V5H A; 3WCT C; 2DHB B; 1NXF A; 2G0R A; 2G0Z A; 1O1J B; 1OJ6 A; 3OO5 B; 1IRD A; 1HGC B; 1LTW A; 1HDA A; 2SPO A; 4VHB A; 1RTX A; 1XZ5 A; 5JGG A; 3FH9 A; 4PQB A; 3KUO A; 1LH5 A; 1GDL A; 1XXT B; 1BZ1 B; 1NS9 A; 1C7C B; 3AQ7 A; 3UHX A; 3S65 B; 1JW8 A; 5JOM A; 2AA1 B; 1YZI A; 1DUO A; 2YRS B; 3EU1 A; 1MKO B; 3VAU A; 3UHZ A; 3GOU A; 2GNW A; 3MJU B; 3QJD A; 3TM3 A; 2QRW A; 1MDN A; 2FRK X; 2MYA A; 2ZSP A; 1R1Y B; 4YU3 A; 1V4U B; 1O1N B; 1F63 A; 1XZ7 A; 3AT6 A; 1DKE A; 3EOK A; 1MNJ A; 1J7W B; 1MWC A; 1MOC A; 3QMA A; 3ZJM A; 2O5L X; 1MTI A; 2V1F A; 1EBT A; 3SDH A; 2VLY A; 1J40 B; 5AZQ A; 1J52 A; 1TES A; 2ZS1 D; 1WLA A; 3E5O A; 3PI4 A; 4YU4 A; 1MWD A; 5B85 A; 1B0B A; 1OFJ A; 2ZLT A; 4H07 A; 1IRD B; 1FCS A; 5E29 A; 1HDA B; 3PI8 A; 4IRO A; 2AV3 A; 2WTH A; 1XZ5 B; 5JGG B; 3FH9 B; 2ZLX A; 1DXT A; 1NS9 B; 2G11 A; 2ZLV A; 1GBU A; 5D5R A; 1QPW A; 1YZI B; 3EU1 B; 3GOU B; 3FS4 B; 1YHU A; 5EE4 C; 3QJD B; 3NL7 A; 1S6A A; 4OF9 A; 4N8T A; 1CH5 A; 2W6W A; 6HBW B; 4YU3 B; 1NPG A; 1XZ7 B; 3AT6 B; 1DKE B; 3GYS B; 3BOM A; 2VYZ A; 1THB A; 3EOK B; 1MLM A; 2MGL A; 4DWT A; 4ZVB A; 1NGK A; 1CH4 A; 5M3S A; 1MYM A; 1OBM A; 1JPB A; 5CN9 A; 4YU4 B; 1AJH A; 3HYU A; 2LH7 A; 4N7N A; 2R1H A; 4HSX A; 2ZLT B; 5E29 B; 5CNF A; 3PI8 B; 4IRO B; 2OH8 A; 2W72 C; 3O89 A; 2D2M D; 3UHB A; 2ZSX A; 2ZLX B; 1DXT B; 4U8U C; 1GVH A; 2ZLV B; 1GBU B; 2WY4 A; 1QPW B; 1SPG A; 1EWA A; 3S1I A; 2MGM A; 1W92 A; 1GZX A; 1SHR A; 3NFE A; 1CH2 A; 1EW6 A; 1YHU B; 1FHJ A; 3UHI A; 1Y4G A; 3GQP A; 2D2N C; 3NL7 B; 4MQI A; 3AQ6 A; 3ORD A; 1V4X A; 1F5P A; 2ZSY A; 1UT0 A; 1LH7 A; 1Y8H B; 1S61 A; 3BOM B; 1THB B; 5JDO C; 1YGF A; 3WCT A; 1NEJ A; 2MGH A; 3AQ9 A; 1MYT A; 4NK2 A; 1VXA A; 1YH9 A; 1DTM A; 3PI9 A; 3WFX A; 2ZS0 C; 2OHB A; 4SDH A; 3HYU B; 4N7N B; 1DXD A; 4NXA A; 1VXG A; 2R1H B; 2DN2 A; 1SDL A; 4PNJ A; 2AUQ A; 3DR9 A; 4NXC A; 1DXU A; 3RJN B; 1Y8I A; 5CN6 A; 1KFR A; 1DO7 A; 2HBG A; 2O5B X; 1SPG B; 1I3E A; 3KMF C; 1GZX B; 1SHR B; 3NFE B; 1RTE A; 1Y4G B; 3GQP B; 2C0K A; 1CIK A; 3VHB A; 1CQX A; 2VLZ A; 3ZH0 A; 4MQI B; 4FWY A; 1V4X B; 2BK9 A; 3ZOM A; 1WVP A; 4KMV A; 2V1K A; 2LH1 A; 1YGF B; 1MGN A; 3UHQ A; 3IC0 A; 2BLH A; 4QAU A; 3ZHW A; 1NEJ B; 1O1O A; 4FH7 A; 2HHD A; 3OO4 A; 5ILR A; 4G51 A; 1YH9 B; 3PI9 B; 1YFF A; 1Y7C A; 2ZFB A; 3O7N A; 1VRE A; 1SPE A; 2MGG A; 1RSE A; 2DN2 B; 1SDL B; 3UH3 A; 3QJB A; 1CLS B; 1LFZ A; 1YG5 A; 1FDH A; 1GCW A; 4O4T A; 1XZV A; 2MYE A; 1LHT A; 3VRG A; 1DXU B; 3QM9 A; 1Y35 A; 1IWH B; 1Y8I B; 3MYN A; 1FLP A; 4UZV A; 1FSX A; 2DXM A; 1A6G A; 1QXE B; 1YIE A; 2G0X A; 3K9Z A; 2KSC A; 1XQ5 A; 3OZW A; 2EVP A; 2G12 A; 2WTG A; 1Y5F A; 3V2V A; 1MNH A; 3HHB A; 1MWB A; 3UBC A; 3BJ1 A; 1DM1 A; 1CBL A; 3ARJ A; 4ROL B; 2O5M X; 4MQH A; 3WCU B; 4F68 A; 3IC0 B; 3WFT A; 3WFW A; 2E2Y A; 1VXC A; 2HHD B; 3OO4 B; 3NG6 A; 4HHB A; 2W72 A; 4G51 B; 4HSW A; 1YFF B; 2Z6S A; 4M4B A; 1Y7C B; 2ZFB B; 1O1L A; 1MOD A; 1V4W A; 4G1V A; 1O1M A; 4U8U A; 2OH9 A; 1JDO A; 3AQ8 A; 3QJB B; 3SZK A; 1LFZ B; 3QQR A; 2R4W A; 1YG5 B; 3B75 A; 1GCW B; 3LB3 A; 1XZV B; 2VEB A; 2SPN A; 3VRG B; 1Z8U B; 2D2N A; 4F69 A; 3UHN A; 1MLJ A; 3IC2 A; 1FSX B; 4GZG A; 2GRF A; 4KMW A; 2DXM B; 3ECZ A; 5E83 B; 1YIE B; 1MLR A; 4XDI A; 1Y4R A; 102M A; 2R4Z A; 1XQ5 B; 1O1K A; 1LFY A; 2RAO A; 1AZI A; 1K1K A; 1Y5F B; 1LFL A; 1S5Y B; 5EU2 A; 3WCV D; 3M38 A; 3HHB B; 1LUE A; 6HBI A; 1MNK A; 3BJ1 B; 1Y46 A; 1HV4 A; 4C44 A; 4MQH B; 1GLI A; 2O5T X; 2ZS0 A; 4NI0 A; 2HCO B; 2H35 A; 5CNE A; 1BZP A; 3NG6 B; 4HHB B; 2W72 B; 1CQ2 A; 3HXN A; 4M4B B; 1O1L B; 1V4W B; 1O1M B; 4U8U B; 3ZJQ A; 1A3N B; 4O2G A; 1IRC A; 1A6N A; 2V1J A; 1ECD A; 3B75 B; 3KMF A; 1NWN A; 3PT7 A; 1VXB A; 3UBV A; 5HY8 A; 3PEL A; 2HBS A; 1Y4P A; 3BJ2 A; 3IC2 B; 4O35 A; 1MYZ A; 4DWU A; 3G4V A; 1QI8 A; 1X9F D; 1Y4R B; 1O1K B; 2VYW A; 3G4Q A; 2RAO B; 1RQ3 A; 1K1K B; 3UHE A; 2QLS A; 2G0S A; 2MYC A; 1LFL B; 3GK9 A; 1HRM A; 1Y46 B; 1Y0C A; 1HV4 B; 1GLI B; 3KUN A; 2ZS0 B; 1GDK A; 2H35 B; 5HLX A; 1NWI A; 3OZV A; 1MBO A; 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1DLY A; 1Y09 A; 2GKN A; 1Y4V A; 3TM9 A; 2ZSZ A; 1JEB B; 1A4F A; 2PGH A; 2ZST A; 5SW7 B; 110M A; 1YOG A; 1MOH A; 2BW9 M; 1G09 B; 1JP6 A; 1MCY A; 2R80 B; 5KDQ B; 4ROM B; 1Y22 A; 3NMM A; 1BIJ A; 3MBA A; 4B4Y A; 2EKU A; 1CP5 A; 1A01 A; 2OLP A; 1JWN A; 1A0Z B; 3BJ3 A; 2HZ3 A; 4PQ6 A; 1HBA A; 4WJG 1; 1J41 B; 2QSP A; 4FC3 A; 1HHO A; 104M A; 1GCV B; 1NZ3 A; 2XKH A; 5AB8 A; 1BZR A; 1SI4 B; 3UGY A; 1HBS B; 5EOH A; 3HF4 B; 1NAZ A; 1JF3 A; 2Z6T A; 4F6G A; 2EB9 A; 4ZVA A; 3QM7 A; 1V75 A; 1V9Q A; 1XYE B; 1LJW A; 1Y09 B; 1Y4V B; 1X9F C; 1A4F B; 2PGH B; 4TWU A; 2VEE A; 4N8T B; 5E6E A; 1GDI A; 3H58 A; 1Y01 B; 1YMC A; 2MYD A; 3ZJL A; 3VRF A; 1HBR A; 4JYQ A; 1LH3 A; 1MLH A; 4TWV A; 4MQK A; 3UI0 A; 4LPI A; 1FN3 A; 1YHU D; 1Y22 B; 3NMM B; 1BIJ B; 3G4W A; 3WCW A; 3A5A A; 1LFT A; 1DWR A; 2MGB A; 1IOP A; 2GTL C; 1VRF A; 1A01 B; 2D6C A; 2GNV A; 2MGD A; 1EBC A; 3BJ3 B; 3A2G A; 3GKV A; 1HBA B; 5CN5 A; 1YMB A; 3GQR A; 2QSP B; 3QZX A; 3RGK A; 4FC3 B; 7HBI A; 5CND A; 4AVE A; 1HHO B; 3AQ5 A; 3H57 A; 1HBI A; 5CHQ A; 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