1S0JA

Trypanosoma cruzi trans-sialidase in complex with munana (michaelis complex)
Total Genus 174
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
174
sequence length
632
structure length
623
Chain Sequence
LAPGSSRVELFKRQSSKVPFEKDGKVTERVVHSFRLPALVNVDGVMVAIADARYETSFANSLIDTVAKYSVDDGETWETQIAIKNSRASSVSRVVDPTVIVKGNKLYVLVGSYNSSRSYWTSHGDARDWDILLAVGEVTKSTAGGKITASIKWGSPVSLKEFFPAEMEGMHTNQFLGGAGVAIVASNGNLVYPVQVTNKKKQVFSKIFYSEDEGKTWKFGKGRSAFGCSEPVALEWEGKLIINTRVDYRRRLVYESSDMGNTWLEAVGTLSRVWGPSPKSNQPGSQSSFTAVTIEGMRVMLFTHPLNFKGRWLRDRLNLWLTDNQRIYNVGQVSIGDENSAYSSVLYKDDKLYCLHEINSNEVYSLVFARLVGELRIIKSVLQSWKNWDSHLSSICTPAGCGPAVTTVGLVGFLSHSATKTEWEDAYRCVNASTANAERVPNGLKFAGVGGGALWPVSQQGQNQRYHFANHAFTLVASVTIHEVPKGASPLLGASLDSSGGKKLLGLSYDKRHQWQPIYGSTPVTPTGSWEMGKRYHVVLTMANKIGSVYIDGEPLEGSGQTVVPDERTPDISHFYVGGYKRSGMPTDSRVTVNNVLLYNRQLNAEEIRTLFLSQDLIGTEAH
Loading diagram...

The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
publication title Structural Insights into the Catalytic Mechanism of Trypanosoma cruzi trans-Sialidase.
pubmed doi rcsb
molecule keywords trans-sialidase
molecule tags Hydrolase
source organism Trypanosoma cruzi
total genus 174
structure length 623
sequence length 632
ec nomenclature ec 3.2.1.18: Exo-alpha-sialidase.
pdb deposition date 2003-12-31

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13859 BNR_3 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1s0jA02
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 1s0jA01
4M3MA 5E89A 1W20A 4B7RA 4YLZA 1IKQA 2PHUA 2C9AA 2XB6C 2C4AA 1G9BA 2ZGSA 1NCCN 3FUOA 7NN9A 1QNWA 3A72A 4WA3A 1LECA 1VAMA 1FV2A 3CNAA 3WUCA 3ALWA 2GDFA 4XJZA 3DGTA 3TIAA 4DFSA 3RG0A 1LGBA 1V2IA 1VAVA 2PHTA 2ZGUA 2UWCA 1IVBA 1LU1A 4GWMA 5GZFA 5IT6A 1NNAA 1B9SA 1A78A 1ULFA 5KXEA 1UZZA 3TAYA 3IM0A 1MVEA 1PZ8A 4FZHA 1SBEA 3SLIA 5B2DA 3NWKA 1MVQA 4FPLA 3AJYA 4R9CA 1WW5A 4BLIA 4YGBA 1DHKB 1A4QA 2JE9A 1WD3A 3QCWA 4LBQA 5IK7A 1INFA 2VK7A 1NSDA 2SBAA 3VKMA 1J1TA 4XILA 4YW5A 1S0DA 1INGA 5BYNA 3B3QE 5CAZA 3WZ1A 4FQZA 5DXDA 1W21A 4ITCA 3RSJA 1WBLA 4GXLA 1WLCA 3ALXA 1W0PA 5IK4A 3CL0A 2F11A 2DTWA 3WHTA 2YA5A 1DQ2A 1G86A 3AYEA 4XJUA 4BLJA 1EUTA 3USUA 1Q8VA 1F8BA 3A0KA 1INXA 3WHUA 1G9CA 1MS4A 4XZPA 2DUOA 4LBKA 1GLHA 5HUGA 2HTWA 1BZWA 4LBQB 4Q1RA 2UWAA 3JU9A 4P9XA 2HYKA 2CWMA 3WDXA 5GLZA 4AGRA 3ZXLA 1UL9A 1DYPA 4LBQD 1FAYA 3H0OA 2DU1A 1W1XA 3NSSA 1NMBN 1O4ZA 3VV1A 2CWSA 1ZM1A 2YZ4A 4D8SA 1HLCA 1QGLA 3O9JA 4QN7A 4UW6A 3PJQA 3USUB 4YG3A 2DV9A 1Q8SA 1MS1A 1QDCA 2EAKA 5IK5A 4NO4A 2F28A 3PVOA 1BXHA 4XOGA 1Z4VA 3FUQA 2A5ZA 4CPNA 1F5FA 2VY0A 3AYDA 4Y22A 4RA0A 1AF9A 5EWSA 3SITA 2WLQA 3B7EA 4BMEA 4GZTA 3OBTA 3UJOA 1WLDA 1GV9A 4ZKTB 4CRQA 4FPKA 2D6MA 2VU9A 3O0WA 4Y1VA 4DQAA 2CY6A 1NCDN 1Q56A 2A71A 3N7JA 4GZPA 5HUMA 3ASIA 4MWYA 1IS3A 1B9VA 2FHRA 4GA9A 2A6VA 1IOAA 4MWJA 2QWAA 4Y26A 4MYEA 4BQ1A 4Y22B 1EUSA 5JOYA 2GNTA 3N7LA 5M1ZA 2ZB5A 1MS5A 1SNTA 4UW5A 1MR5A 1V6KA 4XE9A 4GZXA 4NCSA 3M2MA 2NN8A 3OJBA 4B7QA 4H55A 1BKZA 2YMZA 2E51A 4XMAA 1ULCA 4BMBA 2F0ZA 5GLWA 2CMLA 1WD4A 4PBOA 4KS4A 1DYKA 1MACA 1YXWA 1V6JA 3NN9A 4FPCA 2YXSA 4M00A 2W39A 2LALA 5JVVA 1I1EA 3AZZA 1UPSA 4Y1YA 1W6PA 4XBQA 5GZCA 3BTAA 2ERFA 3WG4A 4AGGA 4H52A 2XZIA 4PF5A 3K39A 2JECA 4PCRA 5IK8A 5T5JA 4MWUA 3WDUA 4GKXA 4JRAA 2A6YA 4XYXA 4MZEA 1CR7A 3HMYA 4Y20A 4WA5A 2F12A 4WA4A 1LU2A 4KS2A 2D3RA 1UAIA 1RINA 1AJKA 4HZWA 3ATGA 2EXHA 4YGDA 1EPWA 1OFSA 3WDYA 1DFQA 1W6NA 2QWGA 2BF6A 1L7HA 1O4YA 1SLIA 1W6PB 1XOEA 1AXYA 4QN4A 2R1BA 3ILNA 2DVBA 3NV3A 5FRAA 3OPZA 4XIKA 5CB7A 2GNMA 1CVNA 3MPPG 1LHNA 1RITA 1V3BA 2FMDA 4FPOB 4Y20B 1DQ5A 1E8UA 3KQRA 2JD4A 2QWKA 4GZQA 4MWVA 1DZQA 1F8DA 1GZCA 4MX0A 2JJ6A 1NSCA 1ENQA 3ILRA 1IS6A 3RMXA 1W6NB 4FVVA 4YW4A 1INVA 4U36A 4KS1A 4Y24A 1HQWA 2OUHA 3GALA 2V73A 4FPJA 4XJRA 3K3AA 4BPZA 4YW3A 1SLTA 3AXEA 5GM0A 3D12A 3WG1A 2OVUA 4FP3A 3FFZA 2H0BA 2PHRA 4FVKA 2P34A 3TI3A 2R0HA 1ENRA 4X47A 3LSDA 1H9WA 3WCRA 2D6LX 4SLIA 3SILA 4FOVA 2R16A 1IS5A 2PELA 1NNBA 1SCRA 4XJAA 3WG2A 2JDZA 1S0GA 4PBPA 2YA7A 4XXPA 4MWRA 2GNDA 3AYCA 3RQ0A 3VKOA 3ZPYA 2ZBJA 3R4SA 4B7NA 4XJ9A 1IVGA 1W8NA 4MZAA 3H71A 1JOJA 3FLTA 1H9PA 2NMNA 2YDPA 1MS3A 2DWRA 4GKYA 1QDOA 1SLCA 4K1HA 3N7KA 4JCKA 4P14A 4BOWA 3H72A 2B7YA 1LOGA 2UU8A 4K1ZA 2KM2A 2RHPA 1L7FA 4GZSA 2P3KA 3AYAA 4UW3A 1GYKA 1MS8A 4FJ6A 1AZDA 1F31A 1DIWA 1A3KA 4DRRA 4M3CA 2BERA 2YV8A 2I2SA 4RL7A 3RMYA 5GLUA 5GLVA 1AXZA 4K1KA 1VCUA 1APNA 1W6OA 2AUYA 2ZHKA 1Z4WA 4YG6A 3BOPA 4HL0A 1LOEA 1UZYA 4YZ4A 5F5QA 2ZGLA 3UJQA 1Z50A 4M3CB 5T54A 1FV3A 3O12A 1MWEA 1SBFA 4X49A 1LTEA 2PHWA 2F13A 4MJVA 3PVEA 1W6OB 2E7QA 5KXDA 1EURA 2HTVA 4YM1A 4NC5A 1CESA 3WDTA 5DZFA 4XBLA 4GEZA 4UW4A 3BODA 1GNHA 4M01A 1G9DA 4GDJA 2D44A 2DUPA 4AGVA 3N36A 2B8HA 1D2SA 1XOGA 3SALA 3UL2A 1LGNA 2DUQA 2A6XA 3WUDA 4WZFA 5JDBA 1LULA 1U0AA 4I30A 4ASMB 1IS4A 5IUQA 2VWDA 2VVZA 3M3QA 3ZSLA 3SH3A 2XZKA 3WOGA 4CZSA 2ZGQA 3TIBA 2ZHMA 1URXA 3D5OA 1UN1A 5GZEA 3O5SA 1NN2A 4MWXA 2DU0A 2XCYA 1N3QA 2JKBA 4AVVA 4CPZA 3M3EA 1GBGA 2GNBA 2SILA 3FLRA 3V64A 1W8OA 1LCLA 2ZGNA 4CPMA 3O0XA 5T52A 5NN9A 1LHUA 4Q2FA 1FX5A 4M4UA 2P3IA 3A0NA 2QWJA 3T1MA 1ULEA 4K21A 4QNPA 1JN2P 1SFYA 4BBWA 3POWA 2D6OX 3ZVXA 2ZGOA 4Q1PA 5T5LA 2LTNA 1GZ9A 2W52A 2R1DA 3I8TA 1ULGA 5EYXA 1L7GA 4YZ5A 5JOZA 1DQ6A 4FQ4A 3WVJA 4TYSA 4F83A 2EALA 1GSLA 3DUIA 2DVGA 2A3XA 2DVDA 2WT0A 2ARXA 1HQLA 1DIMA 2ZAAA 1F8CA 1CIWA 2AR6A 3QLQA 1PZ7A 1QF3A 1V0EA 5HUKA 2G4IA 3MEPA 3I4IA 4M4NA 2HT7A 5B2CA 3ZYPA 4OZXA 5DZGA 3POSA 3AP5A 1HDKA 4MWLA 3VKLA 3L2YA 4FOWA 3R05A 2DURA 3OGGA 2AENA 2CL2A 2HT8A 1NCAN 1KITA 2VXRA 2QWHA 1LOFA 3WDWA 2YA4A 1WUVA 2CNAA 5DUWA 1GZWA 3AFKA 1R1ZA 3V0BA 5H9RA 3RRDA 2A7AA 1G9FA 3ZSKA 4Q8KA 1N1TA 2ENRA 4KS5A 3SNMA 4YZ1A 3K36A 1NMCA 1V0FA 2HTRA 4FOYA 4I00A 4Q6KA 1UMZA 4Z8BA 5GALA 5HCAA 1WLWA 2HT5A 2ES3A 5CNAA 3IN9A 3BEQA 1GZWB 1B9TA 4H53A 1AX1A 3V0BB 1SLAA 3D4KA 3NV4A 1DGLA 4AYUA 2ZHLA 1A4GA 1AX0A 1WCSA 2ZMNA 1Y7BA 2EXIA 5EYYA 3IPVA 4LBJA 1ONAA 4R9BA 1SBDA 3WV6A 4XJ8A 4HIZA 1JUIA 3T1EA 1ZA4A 4MWWA 4Q27A 4DPNA 1USXA 4YGEA 5DUXA 1NMAN 4NN9A 1SACA 2GMEA 4XTPA 1V6LA 1CPMA 2R49A 1BYHA 4YW2A 1SCSA 2WKKA 4R9DA 3TI5A 4XJQA 3TI6A 1W6QA 2NZ9A 1GICA 2BZDA 1KJRA 2HTYA 1INHA 1V3CA 3IPVB 2VW0A 3CL2A 1YYNA 4ISQA 3ZXFA 1LEMA 4C1XA 5DG2A 3LCPA 3U4XA 4GJTA 3KM5A 4Y1ZA 1AVBA 1LOFC 3INBA 2A6WA 1JHNA 2WSUA 1GANA 1QOOA 3WG3A 4K3YA 4GALA 1Z4YA 2D6KA 4BM8A 2YA8A 5GZGA 2QWDA 1W6QB 1YI7A 3H73A 2QWBA 3OYWA 5T50A 1JW6A 3BIWE 5DUUA 1Z4XA 2BQPA 2ZGMA 4XMIA 3W59A 4X4AA 2A6ZA 3VUOA 3IMNA 2A3YA 1NCBN 3V0AA 1G9AA 2P37A 2D7FA 3POYA 2VK6A 1W6MA 4WEGA 1LODA 3AK0A 2V5YA 1S0EA 5HUNA 4L8QA 1N3PA 3AP7A 1YRZA 3MW3A 3B00A 5SV8A 1VIWB 3OYWB 2X9MA 1LJ7A 3TICA 2AH2A 2RKCA 5CA6A 3CKZA 4LBLA 1ULDA 1A8DA 3V0AB 2D6NA 2WQZC 3PMEA 3B01A 1W6MB 4HANA 5H9SA 4K1JA 3SISA 1S1AA 2W38A 2D43A 1AX2A 1N1VA 1SLBA 5CBLA 1OKQA 1Q8QA 1DLLA 2YY1A 1INWA 4CPLA 3JU4A 3O0VA 2ARBA 2A75A 2GMPA 5T5PA 3N7MA 1E8TA 1G8WA 2C4LA 1D0HA 1MZ6A 4XJWA 3R4UA 4YFWA 2TEPA 3O9KA 2OUJA 4JC1A 4K20A 4FPHA 2JE7A 1H30A 1QOTA 1A14N 4KBBA 5L73A 3C2UA 1YO8A 4YG0A 1QOSA 2CTVA 4IQPA 1OQ1A 2VUAA 1F9KA 3M3OA 2AGSA 3PVNA 3N3HA 4GZOA 1C1LA 4M3CF 2C5DA 1LOBA 3ENRA 1IVEA 2XZJA 1QU0A 4B7JA 1MS0A 1KQRA 4XTMA 1WCQA 2YA6A 1TEIA 3K37A 4DS0A 1N1YA 4AWDA 2WT2A 1N1SA 4ISRA 2NYYA 1B09A 4C1WA 1GNZA 2EXKA 5GZDA 2ZMKA 4CPYA 2VSKA 4Y1UA 2HTUA 1IKPA 2P2KA 2F24A 2ZHNA 1DQ4A 2D6PA 4GZWA 4LBMA 2VSMA 2EF6A 2F26A 1NXD1 1IVCA 1V6OA 3RS6A 5KXCA 1S0FA 2DYCA 3AZXA 3LSEA 3WLUA 1MZ5A 4K1IA 1NNCA 2ZABA 4ATFA 4LBNA 3Q9OA 3GVJA 5HCFA 1GKBA 2VH9A 4HZYA 2XG3A 3AP9A 1KDKA 3GNEA 2UURA 2QWFA 2QWEA 5DZEA 2E53A 4CTEA 1S0JA 4Q8LA 1VLNA 3A71A 2ZZJA 5FREA 2ZGRA 1CQ9A 3W09A 3ZSJA 2WNEA 4M4VA 4KS3A 2NP0A 2AREA 2HU4A 1LOAA 3GVKA 4J9TA 4CPOA 2NMOA 3SH5A 2P3JA 1QNYA 4YM2A 1E8VA 4FPYA 2ZB6A 4X6KA 5DG1A 1V6IA 5T55A 1BQPA 4FPGA 2A3WA 2ZGTA 2HU0A 1C1FA 1V3EA 4YZ3A 1LOCA 1G7YA 3NV1A 4YW1A 1CN1A 2W08A 3N35A 4DGRA 3NV2A 3TI4A 1CJPA 1NLSA 3HN1A 5GJ6A 3VKFC 3CYEA 1KRIA 3FLPA 5AVAA 3AZWA 1LHOA 4NOTA 4XDQA 3D11A 1RIRA 1QKQA 3UK9A 4WEFA 2Q5TA 1AJOA 4B7MA 1JYIA 2CYFA 2DTYA 1XQNA 1N3OA 3W58A 2D3PA 4Q26A 3TB0A 1HKDA 1IVDA 1Z0HA 1INYA 3AZYA 3ZXJA 3SH4A 4K1YA 1PZ9A 1CONA 1C4RA 4HZXA 2YDTA 3B69A 4ATEA 4GDIA 5F9TA 1FYUA 1FNYA 4QN5A 5EXOA 5H9QA 1QMJA 2SLIA 1LHVA 1S0IA 5HCBA 1IVFA 3JUUA 2EIGA 5KXBA 3AXDA 4WVVA 4XHBA 1EUUA 1WW4A 5T5OA 1USRA 1UKGA 1DILA 4UF7A 5LK5A 3K38A 3ZXEA 4YZ2A 4YGCA 1N47A 1V0ZA 4AVTA 3INAA 4M3CE 1FNZA 4AVSA 4FOQA 4YM0A 3T2TA 1LEDA 1V6MA 4QN6A 3OY8A 4R9AA 5JOWA 2F29A 2AYHA 3OBRA 1LENA 4P9YA 3T1LA 2WJSA 4W65A 2ZACA 3A4UA 1F8EA 1SLLA 3AZVA 2PHFA 2UWBA 1C57A 4WV8A 4FP2A 3VKNA 1SO7A 4TZDA 2ZGPA 2F27A 1WW7A 3HR9A 2ZGKA 1LESA 1V3DA 4U2AA 2A70A 4PQ9A 2WSVA 1CPNA 1FATA 1Z78A 4YM3A 4GWNA 3IKWA 2GALA 1Z4ZA 1MS9A 1YIFA 4HZZA 1DQ1A 2VW2A 3D6EA 4XIOA 1BJQA 1VALA 3AX4A 2NM1A 4FPFA 4ZXKA 3OY8B 2ZMLA 4XBNA 3MW4A 4QN3A 2AEQA 2QWIA 1X50A 3AJZA 1Q8PA 3AP4A 2GN3A 4D69A 4Y1XA 2W5NA 4WVWA 2F10A 3AP6A 2QWCA 5HX0A 2EXJA 3MW2A 3V65A 1AXKA 1W0OA 2D3SA 3GVLA 2W20A 4JF7A 4LBOA 2BATA 1ENSA 2PHXA 5E88A 1V00A 4MJUA 2DVFA 2W5OA 3APBA 4XXAA 3WDVA 4MWQA 1LGCA 1JBCA 2VK5A 3H6JA 6NN9A 1KJLA 5JYYA 2DVAA 1S0BA 3ZXKA 1JXNA 3TI8A 2R0FA 5JMCA 4P9WA 5JOXA 3M3CA 1BJIA 3ZYRA 1WW6A 2OW4A 2ZKNA 5H9PA 1DBNA 2GMMA 2WT1A 4XHXA 3FBYA 2ZA9A 5E8AA 4MC7A 5DUVA 1NSBA 5JLVA 3M1HA 4YFZA 1LHWA 1JYCA 2F25A 1S0CA 2E6VA 3SANA 2E7TA 2W68A 4FPEA 2VW1A 4DRVA 1I3HA 2SIMA 1V6NA 3WNXA 3ZSMA 4GB1A 2HTQA 1Q8OA 2Z42A 1DQ0A 3B9CA 2GN7A 4HZVA 1WBFA 2AEPA 1VCJA 3WCSA 1UX6A 1KDMA 5GLTA 3ILFA 2YROA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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