1SAZA

Membership in the askha superfamily: enzymological properties and crystal structure of butyrate kinase 2 from thermotoga maritima
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
375
structure length
375
Chain Sequence
MFRILTINPGSTSTKLSIFEDERMVKMQNFSHSPDELGRFQKILDQLEFREKIARQFVEETGYSLSSFSAFVSRGGLLDPIPGGVYLVDGLMIKTLKSGKNGEHASNLGAIIAHRFSSETGVPAYVVDPVVVDEMEDVARVSGHPNYQRKSIFHALNQKTVAKEVARMMNKRYEEMNLVVAHMGGGISIAAHRKGRVIDVNNALDGDGPFTPERSGTLPLTQLVDLCFSGKFTYEEMKKRIVGNGGLVAYLGTSDAREVVRRIKQGDEWAKRVYRAMAYQIAKWIGKMAAVLKGEVDFIVLTGGLAHEKEFLVPWITKRVSFIAPVLVFPGSNEEKALALSALRVLRGEEKPKNYSEESRRWRERYDSYLDGILR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of butyrate kinase 2 from Thermotoga maritima, a member of the ASKHA superfamily of phosphotransferases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Probable butyrate kinase 2
source organism Thermotoga maritima
molecule tags Transferase
total genus 114
structure length 375
sequence length 375
ec nomenclature ec 2.7.2.7: Butyrate kinase.
pdb deposition date 2004-02-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1sazA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1sazA02
4BRKA 2V51B 3JS6A 3VEVA 1Z6RA 4IXCA 5AQKA 3A5NC 3KHYA 4K25A 1WOQA 4BRFA 3G25A 3QDKA 4EIAA 3O6WA 3C7NA 1GLFO 3HBTA 4BC3A 2YJEA 3IFRA 3EN9A 3RSEB 5KPRA 4FWOA 4B1WB 2GELA 1H1VA 3D2FB 1EQYA 4FPBA 4HWIA 4NO7A 3ZEUB 5AQYA 1X9JA 4DB3A 1JCGA 2QWOA 4EHUA 3U8XA 4O8KA 3ZETB 2IIRA 1LOTB 5JICA 4BR9A 3L6QA 4QS9A 4A61A 1SQKA 2Q0RA 4QS8A 4BQZA 4H0YB 5FPNA 5LY3A 1V4SA 1C0FA 4CBWA 1HKBA 1HX1A 1R59O 1MWKA 4I6MA 2KHOA 3QFPA 4A2AA 4JAXA 5AQUA 1K8KA 2F9WA 1T44A 3DXKB 2A40A 4ISEA 1GLEG 4FWLA 3LDOA 4ISGA 2P9LA 5BPNA 1NBWA 4YDUC 3H46O 2Q36A 3BF3A 4BRGA 4IO8A 4H5NA 3R9PA 4H5VA 4CBUA 3GOIA 2E1ZA 4MO5A 3LL3A 4HTLA 4WYBA 2YHWA 3TPQA 3F9MA 5AQJA 5EOYA 4H0OA 3WXIA 2QWLA 5FPEA 1NGGA 2P9KB 2ZGZA 5EX5A 2E2PA 4CZHA 1V4TA 2QWMA 3WQUA 3HSCA 1XQSC 3IDHA 1Y64A 4FPAA 5F1XA 3BP8A 3U4LA 2BTFA 3EKSA 2J4RA 2CH6A 3VF4A 1YAGA 3CHWA 4XH1A 4EAHD 3IUCA 4B1XB 2E2OA 2Q1NA 1IG8A 5ADXA 4RCHA 1TYQA 3GG4A 4PL8A 3C7NB 2YHXA 2I7NA 2P9IB 2ZGYA 4PKIA 1DGKN 3MMVA 5AQLA 2ZWHA 3VEWA 3AY9A 2PBDA 4FWSA 3D2EA 4QS7A 4WQ4A 1NGBA 3UB5A 3L4IA 3SMSA 4CZMA 3HZ6A 5TKYA 4B1UB 1KXPA 3VEXA 4J8FA 2CGLA 3KVGA 5AQHA 2E88A 1ESVA 1SAZA 3CJAA 4K42A 4PKGA 2IVOA 4H5TA 4BC4A 3A5OC 3FZMA 5ADXH 4CBXA 2GWKA 5AZJB 2CGJA 3AARA 3A8YA 3DAWA 4FOIA 3WXJA 3MK6A 2FLOA 1SZ2A 5AQZA 3GE1A 1KAZA 4C23A 3FR0A 1E4FT 1K8KB 3LM9A 4M7YA 4GNIA 3FZHA 1S22A 1DEJA 1G99A 2IVNA 3ZX3A 4CZIA 3DJCA 3DWLA 3WUHA 2P9LB 3VGKA 4H0TB 1NGFA 3TU5A 3VETA 3UKRA 3O8MA 4BRLA 3BEXA 3CERA 4BRCA 4FSVA 1BG3A 4H0XB 3O1BA 1ZC6A 2AP1A 3M1FA 3O1WA 5LJWA 1NM1A 4CZFA 4CZJA 1NGHA 4CZLA 3QBWA 3DXMA 1Z05A 3LDNA 1U2VA 4PL7A 2OANA 2YHYA 3LM2A 1QHAA 5JLFA 4H5WA 4BGBA 1TUUA 2QWQA 4KBOA 2WUSA 2ASOA 1JCEA 5AQTA 3VF2A 4B1YB 1BU6O 1TYQB 2P9NB 5AQRA 2H3GX 2E8AA 2Q0UA 4IJNA 2E2NA 4JD2A 3UKUB 5AZIA 3LDPA 5AQPA 3VF6A 3EZWA 5AQVA 1D4XA 4DCHA 3QICA 4CD3A 3D2EB 3FFKB 5BPLA 3WQTA 2VYPA 2V52B 1RGIA 4MLEA 3CI5A 2ITMA 2E1YA 2D1KA 5AQQA 4MO4A 2FXUA 4EHTA 4BVPA 1BOTO 4FWRA 1NGCA 1BO5O 5AFUA 1ZBSA 3B8AX 3H3NO 4F9OA 2VWBA 3MN9A 3WEEB 3I33A 5F2RA 1ZXOA 3SK3A 4BC5A 3D7EO 2IVPA 1P8ZA 3O4WA 5JLHA 4YDUA 1C0GA 4BRIA 3FZFA 3R6MA 4I6MB 1ATNA 1IJJA 3VGMA 1BDGA 2GUPA 4B1VA 3QMLA 2FSKA 1X3NA 2NRHA 2UYTA 3RSEA 4AM7A 3M3ZA 1MWMA 3UKRB 4BRDA 3D2FA 3H3OB 2YJFA 3S41A 2YI1A 1E4GT 4WQ5C 4B1ZA 3ZX2A 1RFQA 1GLLO 2YCHA 2W40A 1RDWX 5AFUH 1OKJA 4CZKA 5LJVA 4JN4A 4O5FA 5E26A 3DXMB 4GY2B 5AQMA 2FSNA 3CJCA 3C0BA 1S3XA 3FLCO 4A62A 4FWQA 5FPDA 1JCFA 3JXUA 4FL9A 3CQYA 5ELZA 3R8EA 3H45C 3SLCA 2BUPA 4BGAA 3A5MC 3MN5A 4BRNA 3ENOA 2HF3A 3UE5A 1QZ6A 1HLUA 3O08A 2QW9A 1NGIA 1ATRA 5AZIB 3IMXA 3ZX0A 4M7XA 3U9DA 5I9EB 3KZBA 2DPNA 3EO3A 2V7ZA 1NGAA 4BRHA 1YUWA 3WXLA 2CH5A 3ULEA 1BA1A 2VCPA 3P4IA 2P9UA 2FF3B 4BRPA 5BRDA 3GBTA 4BRMA 2P9SA 2GEMA 1U6ZA 3A0IX 5BRHA 3HM8A 1BWFO 1YVNA 4CJ7A 5AQIA 2QWNA 3VERA 5BREA 3QBXA 4H0VB 2Q31A 1NMDA 1NWKA 2HMPA 4BG9A 3AAPA 2E2QA 5CE3A 3CETA 3VOVA 3WT0A 3VESA 4FOEA 2I7PA 4FWKA 1TUYA 2NLXA 5AQXA 5KPTA 1HJOA 3CQXA 1CZAN 2A6AA 4ISFA 2P9IA 3VEYA 2EWSA 1YXQA 3ATVA 3CIPA 5BRFA 2HOEA 1GLJO 1DKGD 2ZF5O 2FF6A 4CZGA 3MN6A 1NGEA 2P9PA 4Z94A 4BR4A 4L3QA 1T6DA 3FE1A 3QFUA 5AQFA 3SJHA 4RTFD 2QM1A 4IWVA 2GTDA 1HKCA 3H6EA 2Q97A 3O80A 4K41A 2A5XA 3CJBA 4RWTA 2E20A 3VENA 4PKHA 3A5LC 1NLVA 1T6CA 4Y0WA 5EXWA 5AQSA 5AZJA 3VEOA 1HPMA 5AQNA 5KPZA 5EVZA 4JHDA 2F9TA 5AR0A 3SMPA 3I8BA 3LDQA 3FZLA 4B9QA 4BQLA 1GLAG 2A3ZA 4EFHA 4AM6A 3FGUA 3HTVA 2A42A 4H03B 4CZEA 5BR9A 4H5RA 2ASPA 3GL1A 2A41A 3VEZA 1KAYA 2AA4A 3O5BA 3L0QA 3ULEB 1BUPA 4CD1A 2P9UB 4NB4A 2P9SB 4XEIA 4M63C 4JNEA 1XUPO 3ID8A 3OHRA 4FO0A 3ZEUA 4BRQA 3FZKA 2CGKA 3EKUA 3MN7A 4BR7A 2Q2RA 4FWNA 4IJAA 3H1VX 1MA9B 4BROA 1U2VB 2NZTA 5BN8A 3ZETA 1HUXA 4K43A 4BR0A 4FWPA 2QXLA 5B8HA 1X3MA 3BUZB 3HI0A 3CJ1A 1GLDG 4WQ4C 4BRAA 3VPZA 2P9NA 1NGDA 4WQ5A 3H1QA 5EY4A 4H0PA 4A2BA 5BPMA 4DHYA 2ASMA 5KQDA 2HF4A 3UKUA 1QQMA 4LC9B 2D0OA 1Q18A 1QQOA 2QWRA 2W41A 3CJ7A 3U9ZA 5AQWA 3W0LA 1MDUB 4XH4A 1XC3A 2P9PB 3QB0A 4BVOA 4DQ8A 4JD2B 5KQ8A 3DXKA 1WUAA 4FWMA 3WXKA 4BG8A 5BN9A 5AQOA 1LCUA 4BREA 4E1JA 5F0XA 4BR2A 1HKGA 2FSJA 3AAQA 4BR5A 5E84A 3LDLA 2GWJA 1NGJA 4MLHA 3M6GA 2QWPA 3J8AA 4CI6A 3MDQA 3CJ9A 2D4WA 3EL2A 1KAXA 3GDQA 2PAVA 3WEEA 1QQNA 1QZ5A 1GLCG 4BC2A 3BF1A 1J6ZA 4IZ9A 2D0PA 2V7YA 4XH5A 3MCPA 4JHDB 1BA0A 3W3DA 5JMVA 1GLBG 3VGLA 2P9KA 1ATSA 5FPMA 5AQGA 3ENHA 3ATUA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IKXA 1TKXA 3SQ4A 4M3TA 2V51B 4BY9C 4K25A 1NKEA 5MLCQ 4KTZA 2HBKA 3TAQA 1VSFA 4J2DA 5GAGP 1RDCA 4O4GA 4JYAK 4DQRA 4DV5K 3TSQA 4FWOA 4B1WB 3NDKA 4DV4K 2WTUA 4YHHK 4HWIA 1WSIA 3VA3A 4DTJA 4CFCA 4NCBA 4YOYA 1RT2A 2DFHA 1M1KO 5I3UA 3ZSYA 4FJJA 4FJXA 5JICA 4BR9A 4X64K 4E0DA 1BIZA 4A61A 1IKVA 3B6OA 1O13A 1C0FA 3K5OA 1HKBA 1NOZA 3K9JA 4LF4K 1RT4A 3QFPA 3P5JA 1T7PA 3THXA 4OJRA 1HRHA 1K6YA 3LDOA 4CEAA 1K9MO 5BPNA 2D0CA 5HROA 4YDUC 2O4IA 1NNEA 2NRVA 4BRGA 1LWCA 4H5VA 3D6RA 3LL3A 3CXCM 3SQ1A 4WYBA 4ZHRA 2UUAK 2QWLA 4CJ4A 1NGGA 5EX5A 2KZMA 3NVMA 4ILHA 2QWMA 3WQUA 4CJPA 1XQSC 2GV9A 1Y64A 5BR8K 3BP8A 2O4GA 2J4RA 4E7IA 1CLQA 1N6QA 5H1SQ 3GG4A 4JK9A 3AVKA 1YTAA 4B3OA 5J2QA 3CQ8A 1DGKN 2X6SA 2WC9A 3VEWA 4ILGB 3E66A 5M1KA 4M3WA 4FYDA 1G15A 2UXBK 4WQ4A 3L4QA 3UB5A 3L4IA 3SMSA 1YHQN 1EX4A 4KHUA 3K2PA 3TAGA 5AQHA 2IVOA 3THVA 3OYDA 3FZMA 4CBXA 3RRGA 1YJWN 4KHPK 3R3LA 5AZJB 3A8YA 3O9TA 3DAWA 5M1FA 1TAUA 3ZSWA 1RT6A 2QA4N 1IKYA 3GE1A 4C23A 1E4FT 1LWEA 1HQEA 3I0RA 3AA3A 4G9ZA 4CZIA 2ITGA 3DJCA 3DWLA 3WUHA 3NF8A 3VGKA 1RNHA 3KLEA 1S5JA 4JKFA 2YNGA 4BRCA 4FSVA 2EX3A 3ID6A 2Z1IA 1XNQK 3LAMA 4CZFA 4CZJA 4CK2A 4LH5A 4PL7A 2YHYA 4FLZA 5J2NA 1QHAA 4Y1CA 1XMOK 4BE2A 5JLFA 2IS3A 3L2UA 2QXFA 2G8UA 3AO4A 2XO7A 3DYAA 5A2QO 2ASOA 3V1RA 1U45A 4B1YB 3TTCA 2P9NB 4DKWA 1BL3A 3MXMA 4B9SA 4C8LA 4I2QA 2E8AA 1I94K 4CHOA 3UKUB 4J2BA 4W5RA 3VF6A 2IC3A 5AQPA 3SAHA 1LW0A 3EZWA 1WBBA 4CD3A 3T1YK 1VQ4N 4G1QA 3OBYA 4X66K 3OVNA 4MLEA 4FJ7A 4FLXA 4CK1A 4UY8O 4CJWA 3LPTA 3F5TA 1LW2A 3CFOA 2D0BA 3ZSQA 3RWUA 1ZBSA 4KV8A 3C94A 3I33A 4IEIA 1ZXOA 1NK4A 5I42A 2VGMA 4BC5A 4C1NI 2HVIA 4CF8A 4BDYA 1P8ZA 5JLHA 3FZFA 3R6MA 4KFBA 4K8ZA 3SPZA 3MEGA 3ULDA 4BE1A 1VQPN 3KK2A 3VGMA 1RTJA 1X3NA 4DMNA 4JI7K 1A5VA 1C1BA 1MWMA 3OYFA 3LDSA 1VSMA 1VQ5N 4HHTA 1VQ7N 2YI1A 4FK4A 3ZX2A 4DR6K 4X62K 4JN4A 3HPHA 4CJEA 3DXMB 4KHNA 5M1QA 1Q81O 2E6MA 3TAFA 2NNWA 3FLCO 4DV3K 4KH6A 3T69A 3U3GA 3EE8A 1JCFA 3JXUA 4DFPA 4B3MK 3CQYA 1HYSA 2G8WA 3KJVA 1NJXA 3ZT3A 3BZCA 4BGAA 1S72N 4AHRA 1BISA 1X9MA 4DR1K 2RE2A 2NRZA 4L8RB 4O44A 1HLUA 4DG1A 4CJ3A 1FKOA 2QI2A 5AZIB 3IMXA 4JKCA 1C0MA 1NJIO 4DTPA 3EO3A 4FZXC 1NGAA 1HJRA 1VQKN 4CE9A 5FLXO 4KO0A 3SAFA 2OYQA 4CJRA 2FF3B 4BRMA 1U6ZA 3A0IX 4CEQA 3HJFA 4JRQA 4JK8A 4RW4A 1WSFA 2QWNA 3QBXA 2Q31A 4CEOA 1QS4A 1Q7YO 2I5JA 4CERA 2Y1JA 3CETA 2HMIA 1XC9A 2HNZA 4ISFA 3HSTB 4IG3A 2IOCA 1F21A 2KFZA 2EWSA 3WNGA 3ATVA 3CIPA 4IO9L 3G0ZA 3HOSA 3OS1A 1OH5A 3PO4A 4ZTFA 2YNFA 1VQMN 1W97L 5JVHL 1C6VA 3FFIA 2OTJN 4JKHA 3NGIA 3OJSA 2RF2A 4RTFD 3MEDA 4DLEA 3L3UA 2O8CA 3V6DA 1U47A 1T03A 1DT9A 2A5XA 4K41A 3RMDA 3VENA 4PKHA 3SNNA 3AA5X 4DQIA 4M42A 1T6CA 4Y0WA 5EXWA 4BACA 4E1MA 5AZJA 3VEOA 2RPIA 1JXBA 1VSHA 5AQNA 4FLYA 1BCMA 3VTHA 4B8AB 5EVZA 2DFFA 2F9TA 3LDQA 3ZT0A 1GLAG 1RDDA 1QE1A 3AO1A 2A42A 4H03B 5BR9A 3NH1A 1JJ2M 2HVHA 3GL1A 3HYFA 4FM2A 1KAYA 1WAJA 5HL7L 3CCUN 2XY5A 1YJNN 4JI4K 3ULEB 4CD1A 3NF9A 4KREA 3NVKA 4M63C 3MEEA 4CJSA 3OHRA 1TKDA 4BR7A 4CHPA 4IJAA 4DTUA 4BROA 2NZTA 2XY6A 4K43A 4FWPA 2QXLA 3OYNA 4BRAA 3HI0A 2P9NA 4WQ5A 3ALYA 5EY4A 5BPMA 3CCRN 3DLEA 4DHYA 1N34K 4DR4K 3NBPA 5KQDA 3UKUA 1QQMA 3L2VA 2W41A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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