1SAZA

Membership in the askha superfamily: enzymological properties and crystal structure of butyrate kinase 2 from thermotoga maritima
Total Genus 114
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
114
sequence length
375
structure length
375
Chain Sequence
MFRILTINPGSTSTKLSIFEDERMVKMQNFSHSPDELGRFQKILDQLEFREKIARQFVEETGYSLSSFSAFVSRGGLLDPIPGGVYLVDGLMIKTLKSGKNGEHASNLGAIIAHRFSSETGVPAYVVDPVVVDEMEDVARVSGHPNYQRKSIFHALNQKTVAKEVARMMNKRYEEMNLVVAHMGGGISIAAHRKGRVIDVNNALDGDGPFTPERSGTLPLTQLVDLCFSGKFTYEEMKKRIVGNGGLVAYLGTSDAREVVRRIKQGDEWAKRVYRAMAYQIAKWIGKMAAVLKGEVDFIVLTGGLAHEKEFLVPWITKRVSFIAPVLVFPGSNEEKALALSALRVLRGEEKPKNYSEESRRWRERYDSYLDGILR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Crystal structure of butyrate kinase 2 from Thermotoga maritima, a member of the ASKHA superfamily of phosphotransferases.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Probable butyrate kinase 2
molecule tags Transferase
source organism Thermotoga maritima
total genus 114
structure length 375
sequence length 375
ec nomenclature ec 2.7.2.7: Butyrate kinase.
pdb deposition date 2004-02-09

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00871 Acetate_kinase Acetokinase family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1sazA01
3.30.420.40 Alpha Beta 2-Layer Sandwich Nucleotidyltransferase; domain 5 Nucleotidyltransferase; domain 5 1sazA02
1T44A 3VEZA 3CJ7A 2KHOA 3ULEB 1ZC6A 2VWBA 2H3GX 3CJCA 4CZHA 1GLDG 3QFUA 2QWMA 5ADXH 3H45C 2GTDA 1ATSA 2FSKA 1U2VA 5FPDA 3MMVA 3O4WA 1G99A 2YCHA 4H0YB 4PKHA 5AR0A 3B8AX 1JCFA 5LY3A 2P9NA 3LL3A 1HX1A 4FWMA 1ZXOA 1X3MA 1GLCG 2A42A 2D1KA 4WYBA 5AZIB 4BC4A 3A5OC 1HKGA 3KVGA 4AM6A 3G25A 4A62A 3R8EA 4WQ5C 4CD3A 4ISFA 4CJ7A 4WQ4A 5E84A 4B1YB 4BRCA 2FSNA 1TUUA 4I6MB 2UYTA 4JAXA 3IFRA 2D0OA 2Q0UA 3L0QA 3FZLA 3BF1A 1BWFO 3H6EA 3WXKA 2CH5A 2PAVA 3VF4A 1U2VB 2V51B 2V52B 4L3QA 1XC3A 3MN7A 2CGLA 3VPZA 3WXIA 1ZBSA 2IIRA 2P9PA 4XH5A 4CI6A 1YXQA 1Q18A 3FE1A 4K41A 4BRAA 2DPNA 2Q1NA 4GNIA 2ASOA 5FPNA 4BROA 1ATRA 4JD2A 2I7PA 3QBXA 2E2NA 4CD1A 2HF4A 3GE1A 3AY9A 4JN4A 3EO3A 2V7YA 3HSCA 2ZWHA 4PKGA 4FWSA 3FZKA 1CZAN 3EN9A 2P9LB 5AQUA 3O1WA 2Q2RA 4NB4A 2NRHA 1U6ZA 5KQDA 2P9SA 2I7NA 4YDUA 3FZMA 5EX5A 2HOEA 4H5VA 4BREA 5JLFA 1SAZA 3FZHA 3CJAA 4NO7A 2P9PB 2Q31A 3VGMA 4CZJA 3C7NB 2YI1A 3QICA 3HTVA 1GLJO 1NWKA 4H0VB 1HLUA 1KAYA 3GG4A 4CBUA 3ID8A 3VF2A 2ASMA 3JXUA 4JD2B 5BPNA 2W40A 3IUCA 2YHXA 4JNEA 4WQ5A 1GLFO 2ZGZA 3GDQA 1NMDA 3JS6A 3R6MA 4B9QA 1HJOA 4BRGA 5BR9A 3P4IA 2GUPA 5AQMA 4DHYA 1DEJA 3QBWA 2P9SB 1NGDA 5BPMA 3O8MA 3EKUA 2Q97A 3H46O 2D0PA 2F9WA 4A2BA 3O80A 1T6CA 4FOIA 4XH4A 3A0IX 4BR5A 4XEIA 4H0XB 5AQWA 1QZ6A 4BQLA 4MO4A 5AQHA 4BR4A 2FXUA 2J4RA 3VENA 3ZETA 3MCPA 1E4GT 1Z6RA 1QQMA 3MN9A 2GELA 2GWJA 5AQOA 5AQTA 3VEYA 3GOIA 2A41A 1P8ZA 5ADXA 1BG3A 3O08A 4EIAA 4BG9A 1NGEA 4FWPA 1C0FA 2E20A 1C0GA 4EAHD 5E26A 4O8KA 2D4WA 3D2FA 5AQLA 3CIPA 4QS8A 1TUYA 1S22A 1DGKN 1JCGA 5KPRA 4FL9A 3SMPA 4IJAA 2E1YA 4FWLA 3WUHA 4FPBA 2QWOA 3LDNA 3H3OB 5AQYA 1BUPA 3CETA 5F2RA 3CJ1A 3SMSA 4BRDA 3ZETB 3CI5A 4O5FA 2CGJA 2CGKA 3SJHA 2P9KA 5ELZA 4AM7A 1EQYA 1GLAG 4HTLA 2A5XA 1HKCA 4QS7A 2OANA 2GWKA 3DJCA 3ENOA 1MWKA 4BRQA 1MA9B 1WOQA 2QWNA 3LM2A 5EOYA 5AZJA 5BPLA 1IG8A 1DKGD 1JCEA 3CQYA 3L4IA 3FLCO 4FPAA 4H5RA 2GEMA 4BRPA 2P9NB 3VETA 3QMLA 4C23A 1OKJA 4MLHA 3UB5A 4K43A 1NGHA 3R9PA 4IXCA 3M6GA 1ATNA 1YUWA 3O1BA 3GBTA 4BRIA 1BA0A 1ESVA 4LC9B 1S3XA 3U4LA 3VEOA 5AFUH 3MN6A 2QW9A 2FSJA 3CHWA 3ENHA 2QWQA 4FWQA 3GL1A 5I9EB 1BO5O 3CJ9A 5TKYA 3VEVA 3MN5A 2E2PA 2P9KB 2FF3B 1NGAA 2VCPA 2AP1A 1V4SA 1RDWX 3H3NO 2ZF5O 3BUZB 4BVOA 1J6ZA 2HMPA 5LJVA 3U8XA 4FWKA 2CH6A 1MDUB 3CJBA 3VF6A 3HZ6A 3KHYA 3LDLA 1NGCA 3M3ZA 2P9IA 4PL7A 4RCHA 5AQRA 5F0XA 3ATVA 4M7YA 3LDPA 2IVOA 3ZEUA 2Q0RA 5AQFA 3AAPA 3IMXA 4BG8A 4BR9A 3EL2A 2BUPA 2WUSA 1D4XA 3MDQA 1KXPA 3LDQA 4CZMA 4Z94A 3QB0A 3C0BA 4FOEA 2Q36A 4BC2A 1HKBA 3WEEA 2EWSA 1NBWA 3FFKB 5AQSA 3ATUA 4M7XA 3D2EA 2ASPA 2PBDA 4H5TA 3UKUA 2E88A 4JHDA 4BR0A 2YJEA 4H0OA 4WQ4C 3O6WA 3ZX2A 3EZWA 4BR7A 5JLHA 2NZTA 2FLOA 2V7ZA 3BF3A 4K42A 3FGUA 3HI0A 4PL8A 4BQZA 4A2AA 4B1WB 3U9DA 1LOTB 5AQQA 3WT0A 4RTFD 3VERA 5AQZA 5BRHA 1Z05A 3D7EO 1HUXA 4HWIA 3A5MC 1H1VA 3IDHA 4CZKA 5AQVA 5AQPA 4KBOA 3VOVA 3VESA 1RGIA 4DB3A 2HF3A 4CBWA 1MWMA 3F9MA 4FSVA 5BN9A 3BEXA 3UKUB 4BRMA 2E2OA 4JHDB 4BGAA 2YHYA 3QFPA 4I6MA 3SLCA 3ZX0A 3TU5A 4BRLA 5CE3A 3VGLA 5AQKA 2QWPA 3MK6A 4H5WA 3W0LA 1IJJA 4CZEA 4YDUC 2QWRA 2ITMA 5BRDA 1E4FT 2VYPA 2QM1A 4Y0WA 1NGIA 3BP8A 1SZ2A 3DWLA 2E8AA 3A8YA 3DAWA 3S41A 5KPZA 4CZIA 3U9ZA 3UKRA 4BRNA 3HBTA 1QQOA 1NGGA 3WXLA 4EHTA 3WQTA 3AARA 5AQNA 3DXKA 3D2FB 3VGKA 5F1XA 1WUAA 4QS9A 4CZLA 5FPEA 3O5BA 3CQXA 1Y64A 2P9LA 1SQKA 4CZFA 4BC5A 4B1VA 4BC3A 1K8KA 1QHAA 4RWTA 5AFUA 1GLEG 4B1XB 3H1QA 2P9UA 3OHRA 4MLEA 3SK3A 5KPTA 5LJWA 3A5LC 5AQJA 1BDGA 3I33A 4IJNA 3RSEA 2YHWA 4MO5A 5EY4A 3AAQA 2A3ZA 2BTFA 3FR0A 2IVNA 3C7NA 3UKRB 1BA1A 5AZJB 5EVZA 4IZ9A 3KZBA 5AQGA 1XQSC 4E1JA 4BRFA 4J8FA 2QXLA 3DXKB 1TYQA 4B1ZA 3FZFA 4ISGA 4EFHA 4IO8A 3I8BA 5KQ8A 1RFQA 4M63C 3M1FA 1T6DA 4IWVA 4PKIA 4XH1A 1QQNA 1K8KB 4DQ8A 4H03B 4FO0A 3VEXA 4BGBA 3DXMA 3UE5A 3W3DA 3LM9A 1NGJA 2P9UB 1QZ5A 1BOTO 4B1UB 4BRKA 2F9TA 1BU6O 1HPMA 5EXWA 3HM8A 3RSEB 5JMVA 4F9OA 3CERA 3A5NC 4H0TB 2YJFA 2QWLA 1NGBA 5BRFA 1YVNA 4EHUA 5FPMA 4DCHA 5JICA 1KAXA 5BN8A 4H5NA 4FWOA 3L6QA 3QDKA 4H0PA 3TPQA 2IVPA 3ULEA 4FWRA 1TYQB 4A61A 3ZX3A 2NLXA 1GLBG 2P9IB 3WQUA 5BREA 2E2QA 4GY2B 1X9JA 3LDOA 1NM1A 3H1VX 3ZEUB 4BRHA 2A6AA 3VEWA 1XUPO 2W41A 1X3NA 4BR2A 1LCUA 3EKSA 3DXMB 2E1ZA 3WXJA 1R59O 1GLLO 4ISEA 4CBXA 4CZGA 2A40A 1NGFA 3WEEB 3J8AA 5AZIA 5AQXA 1V4TA 2AA4A 1NLVA 1KAZA 2FF6A 5AQIA 5B8HA 3D2EB 4FWNA 2ZGYA 1YAGA 4BVPA 4K25A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1T44A 4CHPA 3KK1A 3QIPA 1W97L 3ULEB 1ZC6A 4FJ7A 1BI4A 3DLBA 3NVMA 1NK7A 2NRZA 2FSKA 3RR8A 1RBSA 4BE2A 4EZ9A 1JLQA 5AR0A 4JKEA 1CXQA 5LY3A 5HRRA 2HVIA 2QTDA 1ZXOA 1X3MA 5CHIA 3CM6A 1Z25A 4DV3K 4AM6A 4MDAA 3CFRA 4C8KA 4ELVA 4DFJA 4DTOA 4WQ5C 4CD3A 3AA4A 4EP5A 4WQ4A 4I6MB 4JAXA 2UYTA 3OJUA 2O4IA 3HPGA 1HQEA 4J2DA 1Y97A 3AVCA 2NRXA 4L3QA 1Q9XA 3T69A 2AJQA 3D0PA 3ZSYA 5I42A 2P9PA 4Z4EA 1Q18A 3FE1A 4A5BA 3MEDA 5FRMA 1RDUA 3BY5A 3IKMA 5C24A 4B3MK 4BDZA 4WF9L 2HF4A 3SAHA 4DTMA 4CJ4A 4FJXA 4ILHA 4JN4A 4M42A 1RTDA 3LDSA 3K5LA 3NDKA 4B9LA 1CZAN 5SZTA 5KQDA 4OO1J 2I7NA 4Y1CA 3OA9A 1VHXA 4H5VA 4KHNA 4CGDA 2P5OA 3TWHA 1SAZA 3FZHA 4AH9A 1MU2A 3THYB 2A1RA 3EE9A 3C7NB 1HNVA 2YI1A 3G0ZA 3HTVA 5KGXA 1YT3A 4JEPA 1HLUA 3GG4A 4JKGB 2Q3SA 1FW6A 3VF2A 1NJXA 3I55N 1JKHA 3JXUA 4JD2B 4MDBA 4CE9A 3SV3A 3ENBA 5BPNA 3IUCA 3CCLN 3L2UA 4WQ5A 1S5JA 4E3SA 1ZYQA 1GLFO 1B92A 2ZGZA 3L8BA 4V19S 1NMDA 3JS6A 1NK6A 1S1UA 4CECA 4JS5A 2GUPA 4F3TA 4FLVA 3QBWA 4FLUA 3KD1E 4I7FA 3L3VA 4CEFA 5BPMA 3CC7N 4KB1A 1QS4A 2OYQA 3BGRA 3Q7CA 4A2BA 5GAGP 1T6CA 1VQNN 4XEIA 4H0XB 3EE8A 3EEQA 5DK5A 1QZ6A 5AQWA 4CJTA 4BE1A 3P83D 4ZHRA 3ZETA 3MCPA 3KWGA 3TTDA 1QQMA 3MN9A 2GWJA 2B4JA 4NLCA 2PYLA 3GOIA 4BE0A 4ID5A 1IKVA 1P8ZA 3I8DA 1BG3A 4CESA 4EIAA 4M45A 4BG9A 3IS9A 4E0DA 4LH4A 1TUYA 1S22A 1JCGA 1HJRA 4FM1A 4IJAA 2E1YA 4FPBA 1TK0A 4JKAA 1XC9A 4Z4FA 1BUPA 1BCMA 5F2RA 3SQ0A 4YFUA 1UA0A 3AO4A 2ITGA 3SMSA 1OH8A 3P39A 3SPZA 3CCRN 1KVAA 3O9TA 1VQLN 3CI5A 1KQSM 3EY1A 2G8FA 5ELZA 1EQYA 1KCFA 1GLAG 3DM2A 2FBTA 1NJIO 3CM5A 4Z4CA 3ENOA 4BRQA 3K59A 5J2NA 1FXXA 5AZJA 1TK8A 2ZM6K 5BPLA 4NYFA 4H5RA 3KD5E 3CPWM 2P9NB 2ATQA 1NKBA 1JLGA 4K43A 3AVIA 5DMRA 1EETA 3QEWA 5HRSA 2YNFA 3ALYA 4JKFA 5IWAK 1ESVA 5EU7A 5AFUH 2RPIA 2FSJA 3PX4A 5I9EB 2XHBA 1IKWA 2VGNA 3VQ8A 4ELUA 3VEVA 3TR8A 2DY4A 1RT6A 2E2PA 2P9KB 2AP1A 4W5TA 4JI2K 3H3NO 4N47A 4B3RK 4DKWA 4WCEL 4FWKA 2CH6A 1MDUB 1IH7A 3HPHA 2UXBK 3NE6A 2YNHA 4JKDA 4RCHA 4LY7A 2HBJA 4CHOA 4M7YA 4DMNA 3LDPA 3O3HA 2O8EB 3CCSN 3CXCM 3THXB 2HHTA 4JI6K 1M90O 3EL2A 3LZIA 4DUYK 1HYVA 4A57A 4LF5K 4K0KK 4B9TA 4KHWA 4O5BA 3TI0A 3DLGA 3MX2A 1HKBA 1TGOA 1M1KO 4GVEA 4M7XA 5GIOA 2ASPA 1WN7A 3O6WA 4FW2A 4FJIA 5JLHA 4K42A 5M1QA 4TSXA 3CQ8A 1IG9A 1X9MA 1OVQA 3AVAA 3F2KA 3HK2A 2YX6A 2E4LA 1BQMA 3AA2A 4W5RA 3SUNA 2OZMA 3OYLA 2G8VA 2YHAA 4FZYA 4CHZA 1IO2A 3HL8A 1Z05A 4CIGA 3T19A 4DSFA 3MCAB 2EHGA 4CZKA 2OTJN 3ID6A 5AJ3K 4B3SK 4H4MA 4AILC 3P5JA 2O8CA 4DB3A 2Z1GA 5FLXO 4O0JA 3MXMA 4FSVA 3TAFA 4DFPA 3NF6A 4BGAA 3VQEA 5HRPA 1VQ5N 4CEOA 1J5EK 3AV9A 3SLCA 3VN5A 5CE3A 4WFBL 4JI3K 4JI7K 4LF4K 3W0LA 3VQ5A 4FJ5A 3O9UA 4FJ9A 4YDUC 2YKNA 3PO5A 1ITGA 1E4FT 4OGCA 2HBMA 3L2WA 5FRNA 4CEQA 2ZJPL 2E8AA 1ZBHA 3CPEA 1DTTA 4AHSA 3U9ZA 1TL1A 3G6EN 3WXLA 2OCEA 1KVBA 1ZBIA 3KWIA 5AQNA 4CGIA 2UU9K 3DLHA 4DTRA 4JI8K 5F1XA 3NF8A 3DRRA 2FC0A 3CD6N 3EYZA 1Y64A 4CZFA 5GAHP 1YHQN 1J9AA 4B1VA 1K8KA 1QHAA 4RWTA 1U4BA 2UXCK 3VQAA 1C1BA 4FJLA 5CYQA 2BE2A 3ISNC 4IJNA 2YHWA 3ZSWA 2OTLN 4DTPA 2A3ZA 2KKZA 4E7LA 2B5JA 5J2PA 4JYAK 4IZ9A 4IG0A 3T1AA 1XQSC 4BRFA 4J8FA 2QXLA 3DXKB 3KTQA 4E1MA 1VSDA 4EFHA 1WBBA 3I8BA 4DTNA 3OYIA 4M63C 1D8YA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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