1SBPA

1.7 angstroms refined structure of sulfate-binding protein involved in active transport and novel mode of sulfate binding
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
309
structure length
309
Chain Sequence
KDIQLLNVSYDPTRELYEQYNKAFSAHWKQETGDNVVIDQSHGGSGKQATSVINGIEADTVTLALAYDVNAIAERGRIDKNWIKRLPDDSAPYTSTIVFLVRKGNPKQIHDWNDLIKPGVSVITPNPKSSGGARWNYLAAWGYALHHNNNDQAKAEDFVKALFKNVEVLDSGARGSTNTFVERGIGDVLIAWENEALLATNELGKDKFEIVTPSESILAEPTVSVVDKVVEKKDTKAVAEAYLKYLYSPEGQEIAAKNFYRPRDADVAKKYDDAFPKLKLFTIDEVFGGWAKAQKDHFADGGTFDQISK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Dominant role of local dipoles in stabilizing uncompensated charges on a sulfate sequestered in a periplasmic active transport protein.
pubmed rcsb
source organism Salmonella typhimurium
molecule tags Binding protein
molecule keywords SULFATE-BINDING PROTEIN
total genus 126
structure length 309
sequence length 309
ec nomenclature
pdb deposition date 1993-07-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1sbpA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1sbpA02
3I6VA 1A7LA 4XKRA 4WEPA 2V84A 3FXQA 5CBRA 2GHAA 2O69A 2Y84A 5FTHA 4G68C 1IITA 1B9JA 1SW1A 1ZIUA 3QUJA 4FORA 2ONSA 4M1VA 4KI0E 2H4IA 2H99A 3QXMA 4DZ1A 5CRYA 1OMPA 5KDTB 5ISUA 3FZVA 2XXIA 4G4PA 3KN8A 1QW0A 2D3IA 1USYH 3N6TA 4OESA 4Q5TA 5L8DA 3TODA 4OQOA 1OVTA 1MH4A 1Y4TA 4MF3A 4E0WA 2OBGA 3ECRA 1IZ1A 2AL5A 4H5GA 2F34A 3I5OA 4MLVA 4OMBA 3FVKA 1NKXA 1LAGE 4YKIA 3VE1B 3RLFE 4U4SA 2CZLA 3O6GA 4QFLA 4DIGA 3TCFA 4OHNA 4EF1A 3PU5A 3OMBA 4QSCA 3KN7A 1CE2A 1D3KA 1N84A 5H8QA 1FTOA 4EQ9A 1AL3A 2Q88A 4QSEA 4RJZA 2DWHA 3SEXA 1KWHA 4EXKA 5JEIA 1H45A 1O7TA 3S2VA 3OO9A 1M5CA 2O7UA 1JW1A 1A54A 3CFLA 4ZEIA 4N07A 3UP9A 5H8FA 3KG2A 4GVOA 1B51A 3LSFB 1EZ9A 2DVZA 3HSTA 3TTKA 3Q28A 3MPKA 1P1QA 3OD7A 4GXAA 1B2HA 2RC8A 3MVXA 1UTBB 3BFUA 4RK9A 2FYIA 3VLUA 3RPWA 3VLWA 2H98A 3LR1A 5FHOA 4DXCA 1M5FA 4X1DA 2XD2A 1DOTA 4QRZA 2OWTA 4RYAA 3JZJA 3MBPA 4GD5A 3VXCA 5I2NB 1OQGA 1PBPA 3G3IA 1OLAA 2VD2A 3LSXA 1P99A 3MP6A 4NEDA 3TTRA 1FCKA 2ZYOA 1B1HA 3B7DA 2QS2A 4P11A 4TQUQ 2XXHA 4KYDA 1J1NA 2ZXTA 1IXIA 3TFLA 3E13X 3U94A 2QSXA 4R2FA 3HHFA 1MQHA 4OFOA 4RA1A 3KOTA 2AIXA 5IAIA 1MXWA 1ZTYA 2REJA 2V3UA 3LC8A 3PUZE 4BDOA 3OSRA 3E9XA 4G68A 3T9XB 1PDAA 1MM7A 1SYHA 1SQYA 4NF6A 5I2KA 2PMSA 3ILTB 2NWJA 3SDFA 1A8FA 4BDQA 3PV0E 2PVUA 1RYXA 3MVYA 4ZDMA 3U1OA 4NE4A 1R1NA 4RPOA 4X48A 1MQGA 5F7VA 3BBRA 2RCAA 3HO7A 4YMAA 1FTLA 4NTLA 4JBZA 2XXPA 4H67A 5FHNA 5AA2D 2Z8EA 3EHTA 2A5TA 1EH3A 4IY6A 4NMYA 5CMKA 4NF4A 1NMUA 2F7AA 4XKQA 1Y4CA 3THIA 3UK4A 3O66A 2GRVA 3OXNA 4PQJA 5AE4A 2AYSA 2QS1A 1MS7A 1SYIA 4GL8A 2F6PA 1P1WA 3K1MA 3MVWA 2F78A 1IXHA 4C0RA 1B4HA 5CM6A 1N7WA 5ITPA 3SERA 2FA7A 2HQ0A 4JSDA 4MFIA 4WEDA 4Z0IA 1ELJA 4F1VA 3KEIA 3RY3A 4G8NA 3QSLA 3VDFA 3HN0A 4TLMB 1GR2A 2UYEA 2Z8DA 5AA4A 3CFXA 4OFLA 1P1OA 2DP8A 5I58A 1QUJA 1PEBA 2Z8FA 2DYXA 3MQ9A 1IXGA 1NH7A 4F2QA 3MZ1A 2QJEA 5L9OA 5CBSA 4F31B 4ZEDA 3B6QA 3OO7A 4OWDA 2DWIA 4BDMA 3FUZA 5HPQA 1QKBA 1FTMA 1NL5A 3TDJA 1I6QA 1USYE 2UXAA 5CI5A 4KD5A 4F2OA 2Y7PA 4F3SA 4JB7A 1AIVA 3UORA 2AL4A 3BKIB 1D9VA 1H76A 1UTHB 3SETA 1MDQA 4RY1A 4JWYA 1B3EA 4H1XA 2ZMBA 3H3GA 3B6TA 2OLBA 4JXIA 2B3FA 4N6PA 4X1BA 5I59B 4RK2A 1P1UA 2XD3A 4YU0A 4F3PA 3O6HA 2DVCA 4ESXA 4Q0CA 2QRYA 4O3AA 3JYRA 4FEBA 4QFOA 1ZLQA 3IOUA 1LB8A 3M3FA 3QK6A 1GGGA 4R6HA 4U22A 3C9HA 1GV8A 1XS5A 4F3GA 5J1DA 3O2AA 5L9MA 3T93B 3KSXA 3D4GA 3JV9A 4U23A 2G29A 1R6ZA 3DLNA 3FJGA 4OXVA 1JETA 1URGA 3AXFA 3N94A 4PP0A 5H8HA 5TPAB 1MDP1 5I57A 1DTZA 2XXQA 1WDNA 4GL0A 2HFBA 4OVJA 3W9VA 4DE8A 4EQ7A 5I57B 4UA8A 3C33A 3EPEA 4PETA 5H8NA 2Q8JA 2HZLA 3G3KA 2DXRA 1BTJA 1EU8A 3O29A 1FQDA 1MM6A 3FVOA 3O28A 1B1XA 4GLIA 1FTKA 1MY4A 3MZ9A 1B05A 1Y20A 4ZZEA 1SVXB 4OENA 2YPNA 3VVEA 1LCFA 4YB7A 1LLSA 1N7XA 1WODA 5DEXA 1IQ7A 1H44A 1GVCA 3RN8A 5A5XA 1B5JA 5AA3A 2PYYA 4GFRA 3RGYA 5I59A 3EHSA 3Q29A 5B70A 3PUWE 1LB9A 3FIRA 2Z22A 3VFJA 1NNPA 4LZ5A 4F19A 1B5HA 2NOOA 1B7HA 2HAUA 3PUXE 4IO7A 1UTHA 4YB5A 3TPAA 4YKPA 1TFAA 2XXUA 1M5EA 3N26A 4TLLB 3RNNA 3RT6B 1UTBA 4ZS9A 2I0CA 2ONRA 3RQTA 3USDA 4NWDA 3L6HA 1F9BA 2THIA 3IO4A 4EXLA 3TTLA 3KJ7A 3K6VA 2NUVA 4G8HA 4DLDA 5EHSA 3MP8A 5EYFA 3H6WA 2O1MA 4RPNA 3ONMA 1LBBA 3TUSA 3LBSA 1QUKA 1MXUA 2XXVA 3FD3A 4OZ9A 3S9LC 2Y7RA 4POXA 3OO6A 3IX1A 2YJPA 4ONYA 3IR1A 1B58A 1N04A 1FQEA 4JSOA 5H8QB 5AA2B 2QS3A 1PB7A 1IXCA 3T9VA 1UQWA 3G7WA 2HEUA 3G3GA 2QPQA 2VP1A 4KPTA 3O6IA 3ZKLA 2X26A 4DXUA 5ELVA 3VV5A 2H9BA 4G8MA 4X9TA 4F3BA 1NNFA 4ZE8A 3TMGA 3HHGA 3KFMA 1A99A 3GBBA 3C32A 4FATA 1MQIA 1B4ZA 2ONKE 2V25A 1LBCA 3QUFA 4NF5A 2I3WA 1PB9A 4PFUA 4KR5A 3VVDA 3RTFB 1VSOA 4IGTA 4F22A 4WXJA 5DEXB 1EZOA 3DP8A 2GH9A 3C36A 4H65A 3V5AA 2H5YA 3B6WA 3UN6A 4RNSA 2UVGA 3DP6A 2I6EA 3MZBA 4OERA 4TOZA 2Q9TA 3GBAA 3MWBA 1IIWA 2VHAA 4G77A 1MPDA 3QYTA 1Y3NA 4KFQA 3OO8A 1II5A 4XKNA 2IA4A 2REGA 1LGBC 1S7YA 4F18A 5I2NA 1URDA 4P0IA 4Q30B 4ND9A 4R9FA 4UACA 3VVFA 3CI8A 4N13A 5AA4B 3LSWA 3O97A 4G2ZA 1SBPA 1D9YA 3CG3A 2DXYA 4THIA 5AA2A 1TT1A 1B3GA 1N3WA 3LSLA 3SEVA 1H43A 1DTGA 2RINA 4KCDA 4RXLA 1FQBA 3IO6A 5F1QA 2R6GE 2F5XA 3GXAA 2PT2A 1Y3QA 5ITOA 1LCTA 1SW5A 1UIVA 1QULA 1XVYA 5M2VA 3PPNA 1L5TA 2A5SA 4R74A 2XXRA 3HV1A 5TU0A 4EDPA 4EUOA 4F1UA 3OOAA 3PGFA 3SEUA 2X7PA 4NF8A 1OQHA 5H8SA 1OLCA 4ECFA 2DWAA 3DP4A 1VFEA 3FVNA 3H7MA 4ISUA 3PD8A 5FTIA 4R75A 5I58B 1B0LA 2QL3A 2XX8A 3C31A 3OEKA 1YAEA 1Y9UA 1B3HA 3C4MA 2DSFA 4LQ5A 4NF5B 1MPBA 1TFDA 3RTWB 1JNFA 3BFTA 4U1ZA 1BLFA 4PE5B 3DM0A 3A3CA 1NNTA 4I9DA 4POWA 2P1SA 3CVGA 4H6DA 1LAXA 1OIBA 2Q2AA 2VGQA 4H8JA 5DVIA 4C1UA 2DWJA 1QKAA 4HCWA 2LAOA 4HW8A 1R9LA 1AOVA 4EF2A 3S9NC 4O3CA 1B7UA 1MRPA 4GIZA 4C1TA 1JEVA 4GOTA 3SKPA 3OENA 1IUDA 1SW4A 2YLNA 2ZNTA 3K01A 1WVJA 3R7XA 1FTJA 1SI0A 2O7IA 1LFIA 4QFKA 3TQWA 1HSLA 2F8DA 2P0SA 4IO6A 3T66A 1BKAA 3SESA 5H8NB 1PB8A 2ABHA 2WKYA 3SEWA 3WAEA 3CG1A 1Y1MA 1JVYA 1MY3A 2VD3A 5EHMA 4LP2B 4R6YA 2F7BA 3QIMA 4IB2A 1A40A 2RC7A 3C34A 4OEVA 5TP9B 3CSBA 4NWCA 4I62A 3Q27A 1ZU0A 4ELRA 4ESWA 5CMCA 4OTEA 1VFDA 3CIJA 2ZYNA 3Q26A 2ZYKA 3MUQA 4I8CA 4NF8B 2FNCA 5JK4A 2QMWA 4YKKA 2B65A 3SEYA 1HSJA 1SW2A 2QMXA 4IO2A 1SDXA 1QJMA 3KOSA 5AA1A 3R6UA 4QFNA 2XXTA 4BDLA 5I56A 1Y3PA 4LUBA 4NF6B 5DTBA 1FQCA 3T9HB 4YICA 3N6UA 3K02A 3G3JA 3H06B 4PFTA 1ZBMA 2DE4A 2XXWA 1Y1ZA 3KGCA 3PPOA 4G68B 3E4RA 4MH5A 3U92A 4DCXA 5LOMA 3FATA 3TCHA 2RF1A 1S9TA 1B3FA 3GLBA 4ZZAA 5TPAA 4DDDA 1R9QA 4ELPA 3K6UA 3V89B 4FJPA 5L9SA 4R73A 1B6HA 4YMBA 5KCJA 3U72A 2UVHA 3WAFA 4R9GA 2PT1A 4H8IA 4XIGQ 4FECA 2O6AA 1RKMA 4BDRA 1FQAA 1MQJA 2DE2A 2I0BA 1XC1A 2V93A 3FXUA 4FE8A 4L17A 4U4XA 3RUMA 3CRBA 3M3LA 4Q8RA 2G93A 4JWOA 2ZNUA 4MLQA 1JEUA 3PMWA 2HCAA 2XXYA 3PPPA 4MBPA 2Y7WA 1JW4A 1PBQA 5HM4B 3V8XB 2NVUB 1LAHE 5BWJA 1XOCA 2HAVA 4HTGA 1B7ZA 1MY0A 3DELB 1POTA 4F1YA 5I2KB 4XKPA 1T0KA 2OZZA 5BUUA 4ZE9A 1H3DA 5I84A 1NNKA 1NH8A 2BJJX 3IOTA 2RKMA 4IO5A 3MVZA 3CSGA 3FJ7A 1YPNA 2ZNSA 2PX1A 3CR9A 1N0TA 1I6AA 3P7IA 4H5FA 4O3BA 2V3QA 2O84X 2UYFA 2VOZA 4K3FA 4YB6A 2F7CA 3ZSFA 3PUVE 3F11A 3R26A 3H4ZA 2Z23A 2M8CA 2OJTA 2ANJA 3KJTA 4LZ7A 4LVQA 4QFPA 4DCYA 4YAHX 5H8FB 2F97A 2V3TA 3G3FA 4H0WA 4YZZA 3E3KA 4AB6A 3T22A 1JVXA 2D21A 1A8EA 4QF9A 4IO4A 3IL1B 2XX7A 1Q35A 5H8HB 4R2BA 4AQ4A 2H25A 4GQOA 2I49A 3PMXA 4JDFA 1FQFA 3UIFA 5KDTA 1CB6A 4E0XA 1A55A 4KCCA 3TELA 3L6GA 3T96B 1TXFA 3MPLA 1MH3A 2XHDA 1OVBA 5JTYA 2I58A 1B3LA 1N3XA 1B52A 3D4CA 2I48A 3MAMA 1SD3A 2RC9A 2E0SA 1B32A 1ZKBA 1VR5A 3PPRA 4R6KA 1LAFE 5I56B 2ALUA 2R9JA 4LA9A 1O63A 3S9EA 2GHBA 4HCYA 1JQFA 3N5LA 4OYVA 4IO3A 5B7DA 4XTCQ 4PFWA 2PBWA 3IK6B 1I69A 2OWSA 3FJMA 3H6TA 2P2AA 3IOVA 1HSEA 2F36A 4FIMA 1BIYA 4KQPA 4P0GA 2I4CA 3IB1A 1QUIA 2KLFA 4R72A 1TWYA 4AB5A 5ICQA 3G3HA 1FW0A 1RYOA 3ZS6A 2B3BA 4OFJA 3LUYA 3QAXA 3A3UA 3K1NA 2ZYMA 1ANFA 4LATA 2I4BA 1XVXA 3U8QA 1SI1A 2QS4A 4GXSB 3IOWA 1AMFA 1XHYA 3TQLA 2DQVA 3KZGA 1B0HA 1I6BA 2X7QA 3EQ1A 1MQDA 3ODBA 3TEPA 2DS9A 4F29A 4U1OA 1N76A 2GFEA 4LONB 4ZEBA 3MW0A 3IJOB 1YCJA 3FGSA 3OELA 5TP9A 1ZJLA 1ATGA 4XXUA 3TTNA 2F35A 4ZECA 2DOJA 2HZKA 4KYSA 5JTYB 3MP1A 4QSDA 1YTVA 1ZMGA 3TYHA 4DXBA 1JW5A 5DT6A 3T9UA 3FVGA 3H6VA 3H03A 4LZ8A 3TCGA 1D4NA 1Z7NE 2DE3A 3W9WA 2Y7IA 3IB2A 5DYHA 2HXWA 1MXVA 3MC2A 5K2XA 1IEJA 1NFTA 4IY5A 2R71A 3PPQA 1US4A 3V83A 1QVSA 3O9PA 3ZKKA 1MY2A 4U21A 2RCBA 5FHMA 2UVIA 1B5IA 2A5TB 4OETA 4PFYA 5CMMA 4WKMA 3FV2A 5DVFA 4NF4B 3TZAA 1LFGA 2Q89A 4FEDA 1UIUA 4Z7EA 2O1LA 4U2RA 1PC3A 4BDNA 2E1SA 3UGWA 4GWOA 3M3KA 3FXRA 1DPEA 3KSJA 3KN3A 3H6UA 3A09A 3K00A 4ELOA 1DSNA 3CFZA 5A5XB 1LFHA 1LSTA 5IKBA 3EF7A 3IB0A 4BLAA 5CC2A 1DPPA 1MY1A 5K2YA 5KCJB 1EZPA 1AH5A 3VLVA 1Q1KA 3EN3A 1S50A 3ILUB 4LQ2A 3RT8A 4KYEA 2NXOA 4GF8A 3FASA 2D5WA 1US5A 1DMBA 4KHZE 3PD9A 1MXYA 3TKDA 3U93A 4F39A 1VE4A 4FAJA 2XXXA 3IAZA 2CMOA 1M5DA 2Q2CA 3K1PA 4ZEFA 5ICTA 2O68A 2IEEA 4ZEKA 3TAJA 1B40A 5DVJA 1MXZA 4GRKA 1B46A 4JWXA 1BP5A 4EQBA 3C35A 1XT8A 3KBRA 3HPIA 3FV1A 3M8UA 3OEMA 4IGRA 3PUYE 3K0VA 4QHQA 2OK2A 1MPCA 3HCQA 3IORA 5HBCA 3K6XA 1Z7ME 2F6GA 2UVJA 4M4GA 4OEUA 3PMVA 2I3VA 2W7YA 3K6WA 1URSA 1P1NA 4I1DA 3VXBA 3S4UA 3W15C 3MJNA 3GZGA 4HS7A 3K4UA 4YKJA 3I3VA 1MXXA 1POY1 2XX9A 3EHUA 2O51A 3Q25A 1O64A 1M5BA 2OCUA 2Y7KA 2ESNA 3IJXB 3K2DA 4ELQA 3TTMA 5KZTA 5CMBA 3OSQA 3UA8A 3S9MC 1GTKA 1MG1A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4WEPA 5CBRA 2Y84A 5CRYA 2CZIA 3KN8A 1QW0A 2D3IA 1LBZA 4NF0A 4MF3A 2OBGA 3FVKA 1NKXA 1D3KA 1FTOA 4EQ9A 5EQ7A 2Q88A 4QSEA 4RJZA 2DWHA 3T1BA 3S2VA 1M5CA 2O7UA 3MPKA 1P1QA 4F39A 3RPWA 1FBGA 4QRZA 2OWTA 4RYAA 1OQGA 1PBPA 1OLAA 5T3JA 2QS2A 2Y5KA 3E13X 4PDHA 1MXWA 4MNPA 1NV4A 3ILTB 3SDFA 4HE1A 2WX9A 2XXPA 4NMYA 4IY6A 4NF4A 4P1LA 1FPDA 4GL8A 4O8MA 2F6PA 3MVWA 2F78A 5CM6A 5ITPA 1IMAA 1N7WA 2HQ0A 4JSDA 4MFIA 4X04A 1ELJA 3HN0A 5AA4A 1GR2A 2UYEA 4N6KA 1PEBA 2XWOA 1YYZA 2DWIA 1QKBA 1NL5A 4F3SA 4JB7A 3BKIB 1D9VA 1MDQA 4RY1A 1B3EA 4JXIA 1FBDA 1NV2A 1K9YA 4FEBA 1ZLQA 1LBWA 5J1DA 3T93B 4U23A 4PP0A 5I57A 2XWKA 4GL0A 4OVJA 1BTJA 3FVOA 1MM6A 5EYHA 1B05A 4ZZEA 3VVEA 4OENA 2YPNA 4XEQA 1WODA 1GVCA 1IQ7A 3RN8A 5I59A 5F24A 1VDWA 5J16A 2Z22A 1B5HA 3N26A 3RQTA 1JP4A 3L6HA 3QMFA 4G8HA 5EHSA 1RDZA 3H6WA 2XXVA 4OZ9A 2Y7RA 1B58A 1FQEA 1IXCA 1UQWA 2HEUA 4KPTA 2X26A 4PFBA 5ELVA 3B8BA 1NNFA 5ET7A 3TMGA 3HHGA 4FATA 3C32A 1MQIA 1B4ZA 4NF5A 4F22A 3RTFB 4IGTA 4H65A 3V5AA 2H5YA 3B6WA 4HE2A 3DP6A 3MZBA 1IIWA 2REGA 4F18A 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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