1SBPA

1.7 angstroms refined structure of sulfate-binding protein involved in active transport and novel mode of sulfate binding
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
309
structure length
309
Chain Sequence
KDIQLLNVSYDPTRELYEQYNKAFSAHWKQETGDNVVIDQSHGGSGKQATSVINGIEADTVTLALAYDVNAIAERGRIDKNWIKRLPDDSAPYTSTIVFLVRKGNPKQIHDWNDLIKPGVSVITPNPKSSGGARWNYLAAWGYALHHNNNDQAKAEDFVKALFKNVEVLDSGARGSTNTFVERGIGDVLIAWENEALLATNELGKDKFEIVTPSESILAEPTVSVVDKVVEKKDTKAVAEAYLKYLYSPEGQEIAAKNFYRPRDADVAKKYDDAFPKLKLFTIDEVFGGWAKAQKDHFADGGTFDQISK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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molecule keywords SULFATE-BINDING PROTEIN
publication title Dominant role of local dipoles in stabilizing uncompensated charges on a sulfate sequestered in a periplasmic active transport protein.
pubmed rcsb
source organism Salmonella typhimurium
molecule tags Binding protein
total genus 126
structure length 309
sequence length 309
ec nomenclature
pdb deposition date 1993-07-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1sbpA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1sbpA02
4U1OA 3THIA 1FQFA 4NF4A 4ZECA 1QUJA 2IA4A 4ELOA 2O68A 3TDJA 2O51A 2E1SA 4HS7A 3H6TA 5H8HB 3LC8A 1IZ1A 1FTLA 1Y20A 2XXUA 5I59A 1PB9A 3H4ZA 3ONMA 3K6UA 3H6UA 4P0GA 3B7DA 1N04A 5I2NA 4F1VA 1ZKBA 4O3BA 3SEUA 3G3IA 4H8JA 3B6TA 3PPQA 2HCAA 5AA3A 1JVXA 1NNPA 5F1QA 3VFJA 3DP6A 1R6ZA 3U1OA 1B6HA 1MY0A 3PU5A 3QXMA 4IB2A 5K2XA 4ELRA 2I58A 4H67A 2FYIA 1SW4A 1LSTA 1DTGA 4GLIA 1XOCA 1O64A 2PX1A 5TP9A 5HPQA 4G68C 3OO6A 3H6WA 5CBRA 3MVXA 2R6GE 5DVJA 2Q2CA 2Y7KA 2V3UA 1D9YA 2ONKE 4H8IA 2DYXA 2Y7IA 1B5HA 3FJGA 3MVZA 2GHAA 3PUYE 1MPBA 3A09A 3N94A 1A7LA 3LSFB 3EHUA 4G68B 3PUWE 4RK9A 2ONSA 5J1DA 4GD5A 2HAVA 4YICA 1B52A 3IL1B 4AQ4A 2E0SA 3PMVA 2DE4A 1H3DA 4MF3A 1KWHA 4OETA 1OLCA 2CZLA 3C9HA 1MQJA 4RJZA 2NUVA 3E13X 3O6GA 5FHOA 5AA2B 4DE8A 4F18A 1LCTA 4OZ9A 3BFUA 5L9MA 3KJTA 3S2VA 3T9UA 4WEPA 3MUQA 4R9GA 5H8QA 3ILTB 1HSLA 3TELA 4G4PA 3VLUA 4GF8A 1OMPA 4FIMA 3QUJA 4KHZE 1LBCA 5H8FB 4FATA 1ZU0A 3IOWA 2PYYA 4ZE8A 1I6BA 1H45A 1Z7ME 2RC9A 1H44A 2DS9A 5DVIA 3KG2A 1P1UA 1Q35A 5EYFA 3N26A 4QSCA 3VLWA 1PEBA 3LBSA 1QW0A 1SBPA 4PFUA 4LATA 1B2HA 5B70A 4I8CA 2DQVA 1GVCA 4IO2A 4GL0A 3OSQA 1YPNA 3C36A 2VGQA 1B3GA 1LLSA 1M5BA 2O69A 4H65A 2Z8EA 4AB5A 1B4ZA 4H1XA 1AL3A 5KDTA 3DLNA 4LA9A 2I3WA 3TCFA 2FA7A 1MY1A 1QUIA 3K1PA 1B4HA 5F7VA 3V89B 3DP4A 3F11A 3G3GA 2XXIA 3KEIA 4MBPA 4ESWA 3TTNA 2HZLA 4F2QA 1MH4A 4GL8A 4X1DA 4BDMA 2F97A 1OIBA 4XKQA 1OQGA 2QS3A 4KD5A 4KCCA 3CIJA 3MP8A 1I6AA 4F3PA 4Z7EA 3PGFA 2P2AA 2HXWA 3EHSA 2OBGA 5AA4B 3C34A 3CG1A 1URGA 1I69A 4WXJA 3S9MC 2NVUB 4DCYA 3TODA 5TPAA 2REJA 4Q30B 4F3BA 3VVEA 2Y7WA 3VVFA 2G93A 2AYSA 3U8QA 2PT2A 3O97A 4GIZA 5I58A 3MJNA 2AL4A 2RINA 3EPEA 4GVOA 1UTBA 3UA8A 2O1MA 1UQWA 1VFEA 2F36A 2R71A 2O84X 4JDFA 3RN8A 1S7YA 1MS7A 1JW5A 3IX1A 2W7YA 1MQHA 1MY2A 1VFDA 1SD3A 3K1MA 1SVXB 2QMXA 3LSLA 1B0LA 1TFDA 2ANJA 5I59B 1ZBMA 1MDQA 4OWDA 4O3AA 3O66A 4ZZAA 3SESA 1MQGA 1SQYA 5I2NB 4POWA 1Y3QA 2I6EA 5DVFA 3R7XA 1YAEA 2F6PA 1FW0A 2I4BA 1OVTA 4Z0IA 4OTEA 3KN3A 1B9JA 2F7AA 4GWOA 3SERA 3H7MA 3TYHA 5M2VA 1N7WA 4BLAA 2HZKA 3IAZA 5TU0A 4LZ7A 4DXBA 2YPNA 3H3GA 4H0WA 2GHBA 4YKJA 3K6XA 3C4MA 3IK6B 5CMKA 3LSXA 3CI8A 3FZVA 1JW4A 4OESA 1BP5A 3TPAA 3IOVA 2HFBA 1DSNA 4X48A 3OOAA 3TAJA 3H06B 2OLBA 2I3VA 2D3IA 4C0RA 3OXNA 3T9XB 3WAFA 3N6UA 5DEXA 3FATA 4EQ9A 1P1OA 3R26A 3SEXA 5CMMA 5KZTA 3FV2A 2F6GA 3O9PA 1QKAA 2B65A 2BJJX 3FASA 2DP8A 2ZYOA 5H8NA 1LB8A 3RT6B 2I0CA 3QAXA 2YJPA 2LAOA 4C1UA 1JW1A 5I57A 1YCJA 4JSDA 3QYTA 2R9JA 3MPKA 3PUZE 1FTJA 3RT8A 1NNTA 4Q0CA 4MLQA 5CMCA 1AIVA 4FECA 3EF7A 3VXCA 1UIUA 3OELA 1M5CA 5ITOA 2DWHA 1OVBA 4FORA 4WEDA 3Q26A 3V83A 1A55A 3MZ1A 4QFNA 1R1NA 3IB2A 1M5EA 4YAHX 2Z22A 2RCBA 3K02A 3ZS6A 4QHQA 3K01A 2XXTA 1A8FA 4I9DA 1N0TA 4NWCA 1B32A 3IOTA 1FTOA 5KCJA 3E3KA 4KYSA 3N5LA 5H8QB 3RTWB 3CFLA 1SW2A 4JBZA 2O6AA 1URDA 2A5TB 1EH3A 3D4GA 2THIA 4JB7A 4OHNA 1MDP1 1XC1A 1D4NA 3M3FA 4THIA 2NXOA 4F2OA 1MM7A 3LSWA 4LONB 2OCUA 4IY6A 4E0WA 2O7UA 4F29A 5IKBA 4PFYA 1MPDA 4NF8A 4PFTA 1LFGA 4JXIA 2ESNA 5I2KA 1LBBA 3E9XA 4YMBA 4QFKA 2XXYA 1B7HA 1B1XA 1NFTA 4XKPA 3W9VA 1A40A 4QF9A 1GR2A 1IITA 4F22A 1SW5A 5ISUA 3MVWA 1FQDA 1IUDA 1AMFA 2NOOA 4MH5A 1GV8A 3MBPA 3TMGA 3HO7A 5H8SA 1Y9UA 4XIGQ 1B05A 2QPQA 1N7XA 1LCFA 2GH9A 2PVUA 2IEEA 2REGA 4F19A 2UVIA 3WAEA 3TTRA 4U4SA 4H6DA 5CMBA 4YKKA 4ZEDA 4M1VA 1AH5A 4YKIA 4GOTA 1S50A 2XX8A 4DCXA 1IXCA 3HV1A 4PQJA 3TQWA 3H6VA 1US4A 1UIVA 4JWOA 2H98A 1MXUA 5L9SA 3IB0A 4QSDA 3KGCA 4U21A 2XXWA 3MZBA 3PD8A 2QL3A 1BTJA 5TPAB 3L6HA 3C32A 4RPNA 1JEUA 3G3JA 4BDQA 2P0SA 4U2RA 3UN6A 5I58B 4BDRA 1PDAA 1VE4A 1RYOA 1UTBB 2D5WA 1WODA 4NMYA 3OENA 2DE3A 3HN0A 4IO4A 3OD7A 4LQ2A 5JTYA 1GGGA 3KJ7A 3U93A 3QIMA 1ZMGA 3SEVA 2DXRA 4DZ1A 4WKMA 1B7ZA 1QULA 4BDNA 4IGRA 4C1TA 1LAHE 4F3GA 3FJMA 3MVYA 3DP8A 4KYDA 5B7DA 3W15C 3HCQA 1NH7A 1PBQA 1M5FA 4R6YA 4R9FA 4FEBA 1N3XA 4P11A 2V93A 5HBCA 1BIYA 2QS4A 3PD9A 1NKXA 3E4RA 2RKMA 3IO4A 3GBAA 2ZYMA 1MG1A 2GFEA 3CFZA 2H5YA 3RLFE 1LFIA 1O7TA 4POXA 1N84A 3GLBA 3OSRA 5BUUA 3SKPA 1NL5A 2Z8DA 4RXLA 3BKIB 2A5SA 4U4XA 3UP9A 3EN3A 3TUSA 3DELB 3K6VA 2I0BA 3VV5A 4R72A 4XKRA 1QKBA 4IGTA 3W9WA 1MXZA 1USYH 4NE4A 3B6QA 2DWAA 2P1SA 4KI0E 2XD3A 4Q5TA 3TEPA 1TWYA 3MP1A 4OERA 4PFWA 4N6PA 2UVJA 2Z23A 3G7WA 4RYAA 3ZKLA 1B46A 4TLMB 2AIXA 2RC7A 1EZPA 1FQAA 3K1NA 1IXIA 4QFPA 3K6WA 1JVYA 5I56A 4ZEIA 4I1DA 2ZNSA 5DEXB 3IO6A 4OENA 1T0KA 3RTFB 1ZTYA 4U23A 1B3HA 3MWBA 1Z7NE 1QVSA 5DT6A 5H8NB 3IR1A 3VVDA 3B6WA 3S9EA 5K2YA 5I57B 1YTVA 4OFOA 4ELQA 1XT8A 3RNNA 3FVKA 2DE2A 4NF6B 5FTIA 1Y4TA 3IB1A 1ELJA 1ZJLA 1B1HA 4NF4B 5ELVA 3FXUA 4KCDA 2F5XA 4H5FA 4TQUQ 2I4CA 1MXYA 1I6QA 4FE8A 3MZ9A 3M3LA 3O29A 2VD2A 4UACA 1USYE 2ZYKA 4G2ZA 1NMUA 1Y3PA 5JEIA 1JNFA 2QS1A 1VR5A 2ZXTA 5KCJB 1HSJA 4LZ5A 1JETA 4EDPA 1IQ7A 1JEVA 4N07A 1JQFA 3TTKA 3G3KA 1Y1MA 2F8DA 1POTA 1OLAA 4KPTA 3ODBA 4ZEFA 2DSFA 2HEUA 4ZDMA 2DWJA 3CSGA 4YMAA 3HHFA 5CC2A 1Y3NA 2QRYA 2V25A 4OVJA 1LGBC 1M5DA 2Q8JA 4NF8B 5TP9B 2QMWA 5ITPA 1DTZA 3PMWA 2RF1A 4FJPA 3CR9A 3ECRA 5I2KB 4LUBA 2PT1A 3HPIA 3KFMA 1PB8A 4ONYA 3V8XB 1FTKA 4OMBA 4ESXA 4OXVA 1Q1KA 1B3EA 2QSXA 1UTHA 3IJOB 3SEWA 5BWJA 3O28A 3A3CA 2RCAA 1B7UA 2QS2A 2O7IA 1EU8A 1II5A 5AA4A 1QJMA 4O3CA 4XKNA 3MW0A 4LQ5A 1O63A 2XXVA 4OEVA 3TQLA 1MM6A 2X7QA 4KYEA 3FGSA 4F1UA 2UVHA 5AE4A 3SDFA 1QUKA 1PC3A 5A5XA 4GRKA 3SETA 1XHYA 4K3FA 1B3LA 4EQ7A 2Q89A 1IXHA 2Q88A 3MC2A 2F7BA 4U1ZA 3UORA 3C35A 3QK6A 4ND9A 4F31B 2H9BA 2XX9A 3HHGA 3AXFA 3I3VA 2X26A 1FTMA 3OO7A 4H5GA 1GTKA 3K0VA 2UVGA 4MLVA 2Y7RA 3FV1A 4MFIA 1ATGA 1IIWA 3TZAA 1CE2A 1XVYA 3C31A 3QSLA 3U92A 4E0XA 5IAIA 5EHMA 4RK2A 4YZZA 1MRPA 3IOUA 5JTYB 4DLDA 1S9TA 1D9VA 3KZGA 3R6UA 1RKMA 2DXYA 1LAFE 3Q25A 5CRYA 2XX7A 4QFLA 3OMBA 1R9LA 3PPPA 3MPLA 2XHDA 2H25A 3FXRA 3FJ7A 4DIGA 1FQEA 1ANFA 1EZ9A 4IY5A 2DOJA 2F35A 1SI0A 3VLVA 1P1WA 3LUYA 4NTLA 1TXFA 2YLNA 3KSXA 4PETA 3FVGA 4JWYA 4F39A 2PMSA 4R2BA 3RY3A 3KOSA 2NWJA 5KDTB 3FIRA 4NF5A 1B51A 1H43A 4LZ8A 4HCWA 1MXXA 4ZEBA 1LB9A 3JYRA 3O6IA 2WKYA 3RPWA 3VE1B 3T9VA 4RNSA 1RYXA 1PB7A 3VDFA 3CSBA 3KSJA 3T96B 1FQCA 2Q2AA 5DYHA 1DOTA 2ZNUA 1R9QA 1NNKA 1SYIA 4ZE9A 3Q29A 3U72A 5L9OA 1MXVA 3C33A 1FCKA 2V84A 4QFOA 3L6GA 2DVZA 2OWTA 1IEJA 4U22A 1B0HA 4IO3A 1A54A 3PPNA 4YB6A 1FQBA 1NNFA 1PBPA 1L5TA 3S4UA 5I56B 4IO5A 3MQ9A 4TLLB 2G29A 1B3FA 1SYHA 1SDXA 3MP6A 3K2DA 2Y84A 5H8HA 3T9HB 4AB6A 5EHSA 2XD2A 3TTMA 3T93B 3FUZA 1J1NA 3PV0E 2V3QA 1VSOA 2I48A 4R75A 3USDA 1BLFA 3EQ1A 3G3FA 1WDNA 4HCYA 2A5TA 5JK4A 3KN8A 4G77A 3N6TA 3IORA 3PUVE 1DMBA 4BDLA 3OO8A 2Z8FA 3UIFA 4EQBA 5I84A 4OFJA 3JZJA 3BBRA 4OYVA 1ZLQA 3CFXA 4HW8A 1LAXA 4EXKA 4NEDA 4ZEKA 2F7CA 4NWDA 2ONRA 4PE5B 3BFTA 5HM4B 1NH8A 2XXXA 3EHTA 2F78A 1Y1ZA 2ALUA 3JV9A 3U94A 3S9NC 3VXBA 4ELPA 4YU0A 3I6VA 2UYEA 3CVGA 4HTGA 1MPCA 1LFHA 2M8CA 1B5JA 3RQTA 4R6KA 4GXSB 5FHMA 5CI5A 2X7PA 2DWIA 4G68A 4R73A 3G3HA 4OEUA 2D21A 1POY1 4ZZEA 3GZGA 4XXUA 4GXAA 1BKAA 3S9LC 1A8EA 1D3KA 5AA2D 2PBWA 5CM6A 4GQOA 4UA8A 3OO9A 1B5IA 3LR1A 3GXAA 1LAGE 4YKPA 2B3FA 3ZSFA 3I5OA 4OQOA 3M3KA 4ECFA 3FD3A 1UTHB 4YB5A 1B40A 3K4UA 4N13A 2DVCA 5L8DA 2VP1A 1Y4CA 1SI1A 3HSTA 2OWSA 2UXAA 3PPOA 2ABHA 4EXLA 4RY1A 5AA2A 4DDDA 4P0IA 4G8MA 3P7IA 2UYFA 3Q28A 3K00A 1MY3A 3QUFA 1DPPA 1F9BA 3TCHA 2HQ0A 1CB6A 2GRVA 3KN7A 3ILUB 2VOZA 3CG3A 5A5XB 1US5A 2XXHA 4KR5A 2ZMBA 2FNCA 2RC8A 5H8FA 1MXWA 1XVXA 1TT1A 1P99A 4G8NA 4DXCA 3H03A 1IXGA 3A3UA 4DXUA 3Q27A 1TFAA 4QSEA 2HAUA 4R2FA 4RPOA 3M8UA 1ZIUA 1MH3A 4RA1A 5FTHA 4I62A 3T22A 4EF1A 4X9TA 2XXQA 2I49A 1B58A 5CBSA 3ZKKA 4EUOA 1N76A 3D4CA 5ICQA 2ZNTA 3PPRA 4KFQA 4F1YA 2V3TA 4KQPA 3TCGA 1URSA 4M4GA 1P1NA 4PP0A 4TOZA 4G8HA 2KLFA 1SW1A 5FHNA 1MQDA 3OEKA 2AL5A 4L17A 3UK4A 2F34A 5ICTA 4GFRA 1H76A 3RUMA 4BDOA 3O2AA 4JSOA 3V5AA 3KOTA 1EZOA 2VHAA 1DPEA 4F3SA 3FVNA 4ZS9A 2VD3A 5AA1A 3PMXA 4R6HA 4IO7A 3PUXE 5LOMA 1WVJA 4IO6A 4QRZA 2Y7PA 3IJXB 4FEDA 4YB7A 1MQIA 2OK2A 3O6HA 2H99A 4OFLA 1P1QA 3GBBA 3UGWA 1N3WA 3FVOA 3KBRA 2OJTA 3RGYA 4LVQA 4NF5B 2XXRA 3OEMA 3MAMA 2B3BA 2O1LA 3SEYA 3T66A 1AOVA 4JWXA 4FAJA 3TFLA 4ISUA 2OZZA 4Q8RA 4X1BA 1A99A 3CRBA 2XXPA 1MY4A 1HSEA 2H4IA 1XS5A 2Q9TA 3TKDA 3DM0A 4XTCQ 4LP2B 1OQHA 4NF6A 4EF2A 5DTBA 3FXQA 4R74A 2ZYNA 2CMOA 2QJEA 3TTLA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4U1OA 3THIA 1FQFA 4NF4A 4ZECA 1FPFA 1QUJA 2IA4A 4ELOA 2O68A 3TDJA 2O51A 3D1RA 2E1SA 4HS7A 3H6TA 4JVDA 5H8HB 3LC8A 1IZ1A 1FTLA 1Y20A 2XXUA 1INPA 2ZZVA 5I59A 1PB9A 3H4ZA 3ONMA 3K6UA 3H6UA 4P0GA 4PBHA 3B7DA 1N04A 5I2NA 2XWIA 4F1VA 1ZKBA 4O3BA 3SEUA 3G3IA 4H8JA 3B6TA 3PPQA 2HCAA 5AA3A 4JVIA 1JVXA 1NNPA 5F1QA 3VFJA 2XWVA 3DP6A 1R6ZA 3U1OA 1B6HA 1MY0A 2B4LA 3PU5A 3QXMA 4IB2A 5K2XA 4ELRA 1RDXA 5IZ3A 2I58A 4PGNA 4H67A 2FYIA 1SW4A 1LSTA 1DTGA 3MYUA 2WEFA 4GLIA 1XOCA 1O64A 2PX1A 5TP9A 4PCDA 4G68C 1NV4A 5HPQA 3OO6A 3H6WA 5CBRA 3MVXA 2ZZXA 2R6GE 5DVJA 2Q2CA 2Y7KA 2V3UA 1D9YA 4HXVA 5LDZA 2ONKE 4H8IA 1G0IA 2DYXA 2Y7IA 1B5HA 3FJGA 3MVZA 2ZZWA 2JJKA 1LBYA 2GHAA 3PUYE 3T1BA 1MPBA 3A09A 3N94A 2WYPA 5ET7A 1A7LA 3LSFB 3LUZA 3EHUA 4G68B 3PUWE 2PCRA 4RK9A 2ONSA 4HE2A 5T3JA 5J1DA 4GD5A 4P47A 2HAVA 4YICA 1B52A 3IL1B 2Y5LA 4AQ4A 2E0SA 3PMVA 4H45A 2DE4A 1H3DA 4MF3A 1KWHA 4OETA 1OLCA 2PFYA 1NUXA 2CZLA 3C9HA 1MQJA 4RJZA 2NUVA 3E13X 3O6GA 5FHOA 4MCOA 5AA2B 4DE8A 4F18A 1LCTA 4OZ9A 3BFUA 5L9MA 3KJTA 3S2VA 2FVZA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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