1SBPA

1.7 angstroms refined structure of sulfate-binding protein involved in active transport and novel mode of sulfate binding
Total Genus 126
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
126
sequence length
309
structure length
309
Chain Sequence
KDIQLLNVSYDPTRELYEQYNKAFSAHWKQETGDNVVIDQSHGGSGKQATSVINGIEADTVTLALAYDVNAIAERGRIDKNWIKRLPDDSAPYTSTIVFLVRKGNPKQIHDWNDLIKPGVSVITPNPKSSGGARWNYLAAWGYALHHNNNDQAKAEDFVKALFKNVEVLDSGARGSTNTFVERGIGDVLIAWENEALLATNELGKDKFEIVTPSESILAEPTVSVVDKVVEKKDTKAVAEAYLKYLYSPEGQEIAAKNFYRPRDADVAKKYDDAFPKLKLFTIDEVFGGWAKAQKDHFADGGTFDQISK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
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publication title Dominant role of local dipoles in stabilizing uncompensated charges on a sulfate sequestered in a periplasmic active transport protein.
pubmed rcsb
source organism Salmonella typhimurium
molecule tags Binding protein
molecule keywords SULFATE-BINDING PROTEIN
total genus 126
structure length 309
sequence length 309
ec nomenclature
pdb deposition date 1993-07-19

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13531 SBP_bac_11 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1sbpA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1sbpA02
3K6WA 1JNFA 2I3VA 1HSEA 2REGA 4R75A 1B7HA 3RNNA 2RCBA 1MPBA 4F19A 3W9VA 4DZ1A 3MVZA 1LFIA 4QF9A 1ZU0A 3PUWE 4ZECA 2F7CA 3N26A 2PBWA 3KJ7A 4LA9A 4Z0IA 4H65A 5ITPA 3Q26A 3TTRA 4PETA 3PMXA 3C36A 3KEIA 1MRPA 1D3KA 2QMWA 3CR9A 3GXAA 3KFMA 3M3KA 2NOOA 1A55A 2UVGA 3LC8A 2UVJA 3T9VA 3EPEA 4F22A 2DE3A 4DE8A 1SI0A 2DOJA 2V3TA 3FATA 1FTOA 3PPNA 1FTJA 5ELVA 1MH4A 4O3AA 1NNPA 2ZMBA 3LUYA 5F7VA 4FIMA 3SDFA 4LP2B 3FZVA 1B3GA 3KN3A 1B7UA 3KZGA 3LR1A 4FATA 3T93B 4F31B 3K01A 3G3IA 5CMMA 3ILUB 5AA4A 2VD2A 5I59B 4OESA 3N6TA 2O68A 4NF6B 3O66A 4PFUA 4XXUA 5I2NB 4BLAA 2I0BA 1BIYA 3TAJA 1B5JA 1IUDA 1XOCA 3TELA 1TWYA 4R72A 3PUVE 4YB6A 1NMUA 2PYYA 4IO6A 3JYRA 4AB6A 2Z8EA 4Q30B 2F7BA 2ONSA 5L8DA 1GR2A 2ZNSA 2GFEA 1EZOA 4RXLA 2A5TA 4F3SA 4ELQA 1MY4A 3VVEA 1L5TA 4TOZA 4C1TA 3CFXA 3HSTA 2H4IA 4OENA 1PB8A 1OQGA 3IORA 3K4UA 1ZBMA 4EDPA 5H8FB 3O9PA 2ABHA 5DEXB 3T9HB 1KWHA 1YAEA 3IB1A 3B7DA 3R26A 4H8IA 3V83A 4N13A 4EQ9A 3PUXE 2F97A 2HXWA 1LCFA 3K1NA 2CMOA 5BUUA 2PT1A 3DELB 1M5CA 1JW5A 2QS4A 2XXRA 3Q25A 3QUJA 1JVYA 3ZKKA 4KI0E 5H8QB 1EZPA 1URDA 2XXVA 1NH7A 4UACA 5KDTA 3TUSA 4TQUQ 2R9JA 4MLQA 2XXYA 4C1UA 2VGQA 5CBRA 1NNFA 4ESXA 3QAXA 5A5XB 2XX9A 3T22A 2ZNUA 3U93A 2QS1A 4OEVA 3K6VA 3SETA 1SW2A 2Y7IA 3MP8A 2KLFA 3O2AA 4JSDA 4MFIA 3VXBA 2FYIA 1JEVA 2A5TB 3B6WA 4IY5A 1ZTYA 2RKMA 3QSLA 4JWYA 4THIA 4G8HA 3SEYA 5FHMA 1QUIA 3G3HA 3D4GA 3MWBA 4ZE9A 2QRYA 3TPAA 2Q89A 3DLNA 1BP5A 1PC3A 3B6QA 3H6UA 3MAMA 3QYTA 2ZXTA 4G68A 4NF6A 4U4XA 3KOSA 3MVWA 3GZGA 2ZYKA 4FEDA 3TTLA 3U8QA 1CB6A 2XXPA 5EHMA 3TFLA 1SYIA 2O84X 1M5BA 2QMXA 4NE4A 1I6AA 4ZDMA 3GLBA 1N0TA 4ESWA 5CC2A 4NF5B 5I56B 2B65A 1LFHA 1SQYA 2IEEA 3E13X 2V25A 3VXCA 1SDXA 2REJA 4H6DA 1SVXB 2QS2A 3K1MA 3TQLA 4KCCA 4EXKA 3FVGA 4RPOA 2OWSA 5CBSA 1GV8A 1VE4A 4XKNA 1Y1ZA 4QRZA 1POY1 3F11A 4U1ZA 1SD3A 3PD8A 3ZSFA 5IKBA 4F3GA 2DVZA 2XXQA 3JV9A 1N7WA 1OLCA 2QJEA 4GWOA 4H8JA 1D9YA 1Y4CA 4F2OA 4MF3A 1IXGA 1Y3NA 1B2HA 4LZ8A 4MLVA 1Y4TA 3FXUA 1XVXA 1B3EA 3T9UA 2VD3A 1P99A 4KYEA 4FE8A 1MH3A 1IZ1A 2DE4A 1B0HA 3TDJA 3CSGA 3HV1A 3FVNA 4F29A 2Y7RA 1NNKA 1QUJA 4K3FA 5F1QA 1NH8A 1A40A 2ZYMA 1A7LA 4LATA 3G3KA 5KDTB 1DTZA 4U4SA 1LB9A 3KN8A 3CFZA 1SW5A 3KGCA 2O69A 4JSOA 2XXHA 4OWDA 2I4CA 1P1UA 4X1DA 3PPQA 3UGWA 5DVJA 4O3CA 2QS3A 2UXAA 3S9LC 1Q1KA 1DPPA 5DEXA 3SEWA 2ANJA 5I84A 1PB9A 1AL3A 3M3LA 2DYXA 3RTFB 1EH3A 5TPAB 1B3HA 3Q28A 3QK6A 5J1DA 1AOVA 4R2BA 1WDNA 1R9LA 1I6QA 4IGRA 3RGYA 4R9GA 4WKMA 3VLWA 4QFOA 1LFGA 1O7TA 2X7PA 3FIRA 4XKPA 1Q35A 3C4MA 1UQWA 4IGTA 1ZLQA 3UK4A 3RY3A 3LBSA 5I2NA 1UIVA 1M5DA 4I1DA 4OYVA 1SI1A 2ONRA 5CI5A 4C0RA 1GTKA 3O29A 3V5AA 4N6PA 4JBZA 2QL3A 3CRBA 4LONB 3T9XB 1A54A 1USYH 3S9NC 3I6VA 1TFAA 1ZMGA 1UTBA 3CFLA 1P1NA 2AL4A 3C34A 4KCDA 1VSOA 2RC8A 3MJNA 3THIA 4H5FA 3RQTA 4BDMA 1JW4A 3N5LA 4GF8A 4PFTA 3BFUA 3IX1A 5TP9B 4F3PA 4UA8A 3PD9A 3KOTA 2HAUA 4GL8A 4ND9A 3USDA 4R6YA 2XXXA 4JWOA 5I2KA 2F6GA 3N6UA 2W7YA 3QUFA 5L9OA 3VFJA 2O1MA 3ODBA 4HTGA 4MBPA 4YKIA 2B3BA 5DVIA 3SERA 4G8NA 2O7IA 3VE1B 1FQDA 3MZBA 4X1BA 4DCXA 4FAJA 4YKPA 4ZE8A 3UIFA 1I6BA 3TQWA 1MQGA 3SEVA 4M4GA 3MVYA 1D4NA 1BKAA 1IXIA 3EN3A 3OEMA 3S2VA 2DWHA 3BBRA 1OMPA 4RPNA 1SW4A 4ZEFA 2RF1A 1DSNA 4OZ9A 2O1LA 3JZJA 3TTKA 1POTA 3KG2A 4IO5A 4XTCQ 1JQFA 1N3XA 3FJMA 1MY3A 2GHAA 3IAZA 4KFQA 4XIGQ 5K2YA 4G68B 1Z7NE 4KHZE 4H0WA 3U72A 3ECRA 3MBPA 4FJPA 2OLBA 1SYHA 1LAHE 3C32A 3MP6A 4GD5A 4RA1A 2VP1A 3VLVA 1FTMA 1MQHA 3C9HA 3PPOA 1QVSA 3FV2A 2HFBA 4H1XA 4L17A 3S9EA 1B52A 2H5YA 2OZZA 3FASA 1MXWA 4YU0A 4EUOA 3OO8A 4R74A 5AA3A 3A3CA 4RK2A 3FJGA 1A8EA 1EU8A 5TPAA 1QKAA 4EF2A 4QFKA 3TYHA 3CVGA 3VVFA 4E0XA 5CRYA 3H03A 1ATGA 2DS9A 5FTIA 1FW0A 3IL1B 1MM7A 3Q29A 1MM6A 3HCQA 1LB8A 2R6GE 5H8HB 1BTJA 1MPCA 2F35A 3HN0A 4YKKA 5B70A 4ELOA 3W9WA 3ILTB 4O3BA 1B51A 4F3BA 3VVDA 5AA2A 4HS7A 3TODA 4LZ5A 2DSFA 3H4ZA 4I9DA 3TCHA 3RPWA 4GXAA 1URSA 4FEBA 4FORA 4BDRA 1XVYA 4OFLA 2H9BA 4KYDA 3AXFA 4ZZAA 2ZYNA 3HHFA 1WVJA 4IO3A 5HM4B 3FUZA 3DP6A 3LSWA 4OHNA 3ZKLA 4IY6A 1B46A 3IJXB 3GBBA 3UA8A 4F1VA 3EHUA 1ELJA 3HHGA 1ANFA 4RJZA 2XXTA 1MXXA 1P1WA 3E9XA 4NMYA 1H44A 5JEIA 2I48A 1FQCA 2PT2A 4OFJA 2V3UA 3U94A 3OO6A 4AB5A 4POXA 1II5A 4ELRA 4Q8RA 4RY1A 3G3JA 1P1QA 2HCAA 4ISUA 4OERA 3RT8A 1H43A 1MY2A 1ZJLA 4F1UA 4U1OA 1AH5A 4JXIA 5I56A 5EHSA 1MXVA 4GIZA 2P0SA 2YPNA 2Q2CA 4H67A 4JWXA 5CMBA 5I57B 4R73A 3EQ1A 2I6EA 1I69A 3FJ7A 1B4HA 3GBAA 4BDLA 2D5WA 1DOTA 3FVOA 1MXZA 3A09A 1B4ZA 3IOUA 4ZEBA 1USYE 3G3GA 2B3FA 3MUQA 3PPRA 2PVUA 2H99A 4GXSB 4R6KA 4RNSA 5L9MA 1H3DA 1FTKA 2OK2A 3CSBA 3FXRA 3H6VA 3VDFA 2RINA 4OEUA 5K2XA 4NWDA 1OIBA 3K0VA 1QKBA 1FQBA 5M2VA 5TP9A 3TTNA 3C33A 1TXFA 2F6PA 2XXIA 2Z23A 5CMKA 1LBCA 2NUVA 4JB7A 1DTGA 1DMBA 3TEPA 3WAEA 4QSEA 2AL5A 4GQOA 4QFPA 2RCAA 3KJTA 4ZEIA 3MW0A 1XT8A 4I62A 4ECFA 1JVXA 5H8NB 4XKQA 2XX7A 5JTYB 4P0GA 3OMBA 1US5A 1IQ7A 2ZYOA 5HPQA 1B6HA 4FECA 5ICQA 4IO4A 4OVJA 1MPDA 3O28A 3O97A 2XD2A 1Y3PA 3LSXA 4EQBA 5CMCA 5H8HA 4U21A 4U2RA 2F78A 3MC2A 4G4PA 4PQJA 4Q5TA 3RT6B 1URGA 4G2ZA 4ZEDA 2H25A 4G77A 1XS5A 1MY0A 2Q9TA 4M1VA 4PE5B 4YB5A 4DIGA 3B6TA 1J1NA 4Q0CA 2I4BA 1MXUA 2Y84A 5H8FA 3E4RA 3PGFA 2PMSA 2VHAA 2XXWA 1JW1A 4N07A 3OO9A 3I3VA 4KYSA 4F1YA 1IXCA 4GOTA 3U92A 2M8CA 1S50A 3OO7A 3K1PA 4YMAA 1IIWA 1BLFA 1QW0A 3IB2A 4NF8A 3V89B 2DQVA 4EQ7A 3OENA 2LAOA 2GH9A 4I8CA 3E3KA 4QSCA 1SW1A 2R71A 4DXUA 3VV5A 3HO7A 3O6HA 2PX1A 3VLUA 2YJPA 1RYXA 3IR1A 3MZ9A 4NEDA 1R9QA 4NTLA 2G93A 2XX8A 3K6XA 4OXVA 4QHQA 1ZIUA 5AA4B 1M5EA 2V3QA 2E0SA 2XHDA 4Z7EA 1VR5A 4F18A 4LUBA 1FQFA 3CG1A 4G68C 3RN8A 2Q2AA 2GRVA 3BKIB 5I57A 1PB7A 4OQOA 5KZTA 4DLDA 1MXYA 1YPNA 1HSJA 4YAHX 3L6HA 4ZEKA 5AA2B 1N76A 1B9JA 3ONMA 1YTVA 1H76A 3EF7A 3V8XB 2I0CA 5DYHA 4BDQA 1A8FA 2UYFA 3MPKA 4HCYA 5IAIA 1NFTA 3S9MC 2O7UA 3PMVA 1A99A 1OLAA 2UVIA 3P7IA 5I2KB 1Y9UA 2DXYA 2BJJX 2IA4A 1B40A 2Z8FA 3IB0A 1D9VA 2NXOA 4GVOA 3IK6B 4NF8B 4WEPA 1US4A 2YLNA 1Y20A 2ONKE 4IO2A 2XD3A 1H45A 1UTBB 4LVQA 4NF5A 4PFWA 5ITOA 5DVFA 2P2AA 5DTBA 5FTHA 1UIUA 3D4CA 1LLSA 3QIMA 1HSLA 1PBPA 4HCWA 1LAGE 1MS7A 3KSJA 2P1SA 3EHTA 4GFRA 4BDNA 5DT6A 5A5XA 3CG3A 4TLMB 2F8DA 3IOVA 3H7MA 1MDQA 2ESNA 2I3WA 4U23A 3C35A 3IJOB 1QJMA 1S7YA 2H98A 3PMWA 4P11A 4PP0A 1LAXA 1MQJA 1TT1A 3K00A 3M8UA 4R6HA 4TLLB 3RLFE 3CI8A 1OVBA 4NF4A 2F5XA 5FHNA 4YKJA 2ZNTA 4OFOA 1YCJA 3FXQA 2Z22A 3OD7A 2HZLA 3G7WA 4GRKA 1AMFA 4BDOA 3H3GA 1MQIA 1VFDA 5AA1A 2X26A 2RC7A 3R6UA 4XKRA 1B7ZA 2G29A 1P1OA 5AA2D 1UTHB 4NF4B 1GGGA 1OVTA 4KR5A 5JK4A 1OQHA 2DWAA 2I58A 1B1XA 1IEJA 2O51A 2NVUB 2DWIA 4QFLA 3RTWB 1LGBC 4GL0A 3S4UA 1MY1A 1MG1A 3H6WA 4KQPA 1F9BA 3OSQA 1B32A 3TMGA 2E1SA 2F36A 4AQ4A 3PPPA 1N3WA 3U1OA 1T0KA 2Y7PA 3OSRA 4IO7A 5H8NA 3TZAA 1AIVA 1MQDA 3G3FA 5I59A 5L9SA 2Q88A 1WODA 3OELA 5KCJB 3LSFB 1B05A 2F34A 3K2DA 4WXJA 5ICTA 1EZ9A 4OETA 1JEUA 4POWA 4QFNA 1JETA 3DP4A 1XC1A 2Z8DA 4RK9A 1VFEA 1N04A 3TCFA 1B5IA 2OCUA 2FA7A 1SBPA 3I5OA 3IO4A 1NKXA 3OEKA 4YB7A 5HBCA 5ISUA 4ZS9A 4F2QA 2O6AA 1S9TA 3OXNA 3IO6A 2F7AA 3K6UA 4KPTA 1IXHA 5H8SA 5I58B 3MP1A 2UYEA 2V93A 4DXCA 4YZZA 3MZ1A 1ZKBA 2UVHA 2AYSA 3FV1A 1NNTA 4WEDA 5EYFA 3IOWA 2WKYA 2DP8A 3SEUA 1PEBA 2FNCA 3H6TA 5I58A 1RYOA 2HQ0A 4R9FA 3HPIA 2DXRA 4QSDA 4F39A 1MDP1 4H5GA 3L6GA 3DP8A 1CE2A 1TFDA 3ZS6A 2ALUA 2D21A 1B1HA 4ONYA 1N7XA 1B5HA 3LSLA 1FQEA 4LZ7A 2Q8JA 3TKDA 4MH5A 3O6IA 5TU0A 4R2FA 2HAVA 2QSXA 5KCJA 4NWCA 4OMBA 1B3FA 1FTLA 3SEXA 3FD3A 4DDDA 2QPQA 4ZZEA 1O63A 2THIA 1Y3QA 3FVKA 1QUKA 3CIJA 3PV0E 2I49A 3MQ9A 4YICA 4RYAA 3C31A 5FHOA 3BFTA 3SKPA 3UN6A 3WAFA 4E0WA 4EF1A 3M3FA 5CM6A 5LOMA 4GLIA 4U22A 1IITA 4KD5A 2V84A 4JDFA 1R6ZA 3KSXA 2OWTA 4X48A 5BWJA 2X7QA 1UTHA 4PFYA 3RUMA 1XHYA 2Y7KA 4HW8A 5AE4A 3SESA 1PBQA 3MVXA 1B0LA 1FQAA 1M5FA 3IOTA 5B7DA 3OOAA 4G8MA 1LAFE 3FGSA 3A3UA 4LQ5A 1NL5A 2A5SA 1B58A 2OJTA 3H06B 4OTEA 5H8QA 3R7XA 3MPLA 3PU5A 2DWJA 2HEUA 2AIXA 3EHSA 3Q27A 3UP9A 2CZLA 1LSTA 4EXLA 2D3IA 3N94A 3W15C 1Y1MA 3TCGA 4ELPA 2NWJA 1O64A 4DCYA 1Z7ME 2XXUA 1R1NA 3PUZE 2OBGA 4LQ2A 2DE2A 2RC9A 3DM0A 5JTYA 1LCTA 3KBRA 1PDAA 4X9TA 3PUYE 3O6GA 2VOZA 3QXMA 1N84A 2Y7WA 3UORA 4P0IA 3T66A 1QULA 4YMBA 3T96B 1FCKA 2GHBA 1GVCA 4DXBA 3KN7A 4IB2A 3TTMA 3K02A 2DVCA 1LBBA 1DPEA 2HZKA 1B3LA 1RKMA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4JVIA 2FIXA 4R75A 2RCBA 1MPBA 3MVZA 1LFIA 3PUWE 2PBWA 4LA9A 3C36A 5ET8A 2QMWA 3GXAA 4F22A 2DE3A 3FATA 1NV2A 1FTOA 3PPNA 4O3AA 3LUYA 4LP2B 3KN3A 3KZGA 3LR1A 1D9QA 3T93B 3K01A 3G3IA 5CMMA 4OESA 2O68A 4GX4A 5I2NB 4BLAA 1BIYA 3TELA 3UA8A 5FBPA 4X8RA 4R72A 4IO6A 1EZOA 5L8DA 1GR2A 4O7MA 1RDXA 2A5TA 2PFYA 4P47A 3CFXA 3K4UA 1ZBMA 3T9HB 3B7DA 4N13A 3PUXE 4MAGA 3K1NA 2CMOA 1M5CA 3Q25A 4N6KA 4KI0E 2XXVA 2ZNUA 2QS1A 4OEVA 3KC0A 3MP8A 4JSDA 3O2AA 4JWYA 4IY5A 2RKMA 4GBWA 5FHMA 3QYTA 3B6QA 3H6UA 2ZXTA 4G68A 3KOSA 3GLBA 1NUWA 3E13X 4OVPA 5EQ7A 1SVXB 2QS2A 4KCCA 3FVGA 1VE4A 4XKNA 3F11A 1FBFA 4MMPA 3IFAA 1N7WA 4OVRA 1D9YA 1Y4CA 4LZ8A 1JP4A 1Y4TA 3FXUA 1XVXA 4QBAA 3T9UA 2VD3A 4FE8A 3TDJA 3FVNA 4F29A 1QUJA 1NH8A 2ZYMA 5KDTB 4LATA 3KGCA 2O69A 4XEQA 4OWDA 4MCOA 3S9LC 1Q1KA 1DPPA 3U65A 3Q28A 5LDZA 4R2BA 1R9LA 1I6QA 3E79A 4N6DA 1UQWA 2WEFA 3LBSA 5I2NA 4O94A 4I1DA 2CZHA 4GWSA 1KA0A 1TFAA 1ZMGA 4KCDA 3THIA 1RDZA 4BDMA 4F1VA 4GF8A 4F3PA 3IX1A 5I2KA 5L9OA 2XXXA 3N6UA 3SERA 2B3BA 2GQ1A 4M4GA 3MVYA 3EN3A 3S2VA 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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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