1SD8A

Arsenate reductase r60k mutant from e. coli
Total Genus 36
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
36
sequence length
138
structure length
138
Chain Sequence
NITIYHNPACGTSRNTLEMIRNSGTEPTIILYLENPPSRDELVKLIADMGISVRALLKKNVEPYEQLGLAEDKFTDDQLIDFMLQHPILINRPIVVTPLGTRLCRPSEVVLDILQDAQKGAFTKEDGEKVVDEAGKRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
publication title Arginine 60 in the ArsC arsenate reductase of E. coli plasmid R773 determines the chemical nature of the bound As(III) product.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Arsenate reductase
total genus 36
structure length 138
sequence length 138
ec nomenclature ec 1.20.4.1: Arsenate reductase (glutaredoxin).
pdb deposition date 2004-02-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03960 ArsC ArsC family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1sd8A00
1G0TA 1O7UA 5ID2A 4KA0A 5G5EA 2MMAA 4RUVA 3PGTA 1A0RP 1YJ6A 2PPTA 1VF4A 3Q18A 1HNBA 1M7TA 2C8UA 4K7IA 5CYYA 3O76A 4GF0A 4HJMA 4PNFA 2H1BA 4L5LA 2VLVA 2GT6A 4TR1A 3M9JA 3LEFA 3TKRA 1TRSA 5G31A 1JLWA 3ZREA 1BG5A 4IP1A 1K0MA 2GVPA 5GSSA 3FR9A 3N9JA 1GRXA 1WIKA 3I6AA 3TB2A 2DJ2A 1SD8A 1V98A 2B7JA 4HZ2A 3LYPA 2O8VB 4L0WA 4BVXA 4NPBA 4HUAA 3DVXA 4LMWA 4X43A 4G9HA 2DJ1A 4KDYA 1SL1B 2DJ0A 3ERGA 5L71A 5HR3A 4PXOA 3ED3A 4QL9A 1KBNA 2WZ9A 4WR5A 1AUCA 1V2AA 3ZTLA 3QR6A 2CZ2A 3VURA 2VAFA 4D73A 3GKXA 3KD0A 1USBA 1EGRA 2AJQB 1WRYA 1U6TA 2YZUA 3P90A 1KEBA 4I2TA 3AY8A 4MF7A 2HSHA 3HHVA 5INYA 4ILFA 1ILOA 1GNWA 1SYXA 1U88A 3Q6OA 4JR6A 1BEDA 2FUG2 4F2IA 2MYGA 2M46A 2LNTA 1FB0A 2IFQB 4MABA 5DJLA 4IP6A 3CYNA 1B4QA 3WYWA 3QFBC 3C7MA 4HU9A 3HKRA 1VF2A 1K3LA 2H19A 3M3MA 2IMEA 2I1UA 2E2GA 2C4JA 2G0FA 2VM1A 1AIUA 3TRPA 2GSQA 4Q5QA 4KDXA 3GV1A 4TW5A 1Z6NA 4MK3A 1SL2B 2AB6A 4ULXA 2H1AA 1Z7RA 5IMFA 3KP8A 5COHA 2YWNA 5G1KA 3ZFLA 4JRRA 2H0GA 2CV4A 6GSYA 3HVVA 2RIIA 4WBRD 2C0GA 3GKNA 2VUPA 5B6NA 4WKWA 3RPPA 4WETA 2OBIA 3ZITA 5IIZA 4EC0A 2LEGA 3WT2A 1AW9A 1TP9A 5IOWA 1X9WB 1B9YC 1F6MC 4NHZA 1ZOFA 1THOA 2YPMA 2XHFA 1HNCA 3HJMA 2LV3A 2CVDA 3HXSA 6GSWA 2X8GA 1YDKA 1EZKA 4POBA 1ERTA 3KTLA 2IMFA 4KCEA 4BA7A 3LYKA 1H75A 2FHEA 5IPHA 3EYTA 2IFQA 2LJRA 1PKZA 2OBKA 3D5JA 1PGTA 4KNDA 1K0AA 2O87A 4EVMA 2TRCP 1JZRA 4DSSA 1E6BA 2O89A 2IIYA 5J4UA 2I3YA 1GULA 3EMPA 2KHPA 2QC7A 4OO5A 16GSA 1WWJA 4MP4A 3TKSA 1GLPA 5KN0A 2OE3A 5CRDA 3HVXA 1TXXA 2R5GA 4QQ7A 1MEKA 2CVKA 3NOFA 2A4VA 1PQNA 4AGSA 4CDOA 5CRGA 2DLXA 1O73A 1A23A 13GSA 5E59A 1DBYA 3RBTA 3GHAA 5IMZA 1XCCA 2JSYA 4ID0A 8GSSA 2LTKA 4KB3A 4N0ZA 1H4OA 2B5EA 4NWYA 2KOKA 1XPVA 3M0FA 3VK9A 3L9UA 1FO5A 4IJIA 4EKZA 1PD21 3TOTA 4KH7A 3CRUA 1ON4A 2QKEA 2QSIA 3G9BA 2ON5A 2B1KA 1O8XA 4I2UA 3KH9A 5C04A 2V1MA 1XWKA 4I6XA 2R4VA 5D9VA 7GSSA 12GSA 4HU7A 2GT5A 5ECRB 2E7PA 9GSSA 4OCEA 3QMXA 3BJ5A 5DJMA 4XS1A 1G6WA 3FZ4A 2DJJA 4MZWA 4GLTA 4ZL9A 4OMVA 3DVWA 3UBLA 2YJHA 1GTIA 3C71A 2P31A 4FH8A 1B8XA 2YV9A 3W8SA 2JL4A 19GSA 2IWTA 1QUWA 4YQUA 4HQZA 3A3TA 4IQAA 2IMDA 2VOCA 3UMAA 5DCGA 2X8CA 2VO4A 3N5OA 1JFUA 4ZXGA 2VL2A 1THXA 1O81A 3I9V2 4AJ6A 3ZYWA 3MSZA 4GTUA 5D73A 3TCOA 2XC2A 1TOFA 2VCXA 2CZ3A 3IK9A 1UVZA 4KAEA 4K7OA 4G19A 4HOJA 2CVBA 2PERA 4OFMA 3M9KA 3TJFA 1SKRB 2YV7A 3NIVA 2IPAA 4NXIA 5HFGA 3IXRA 1A24A 4HEA2 3TUEA 1X0RA 4XS4B 3CTFA 4NV5A 2GZYA 1K0DA 1M2BA 5ECPB 1ZMAA 2YP6A 1TRUA 3HA9A 4O92A 4WF5A 1T4ZA 3QFAC 3RPNA 1X9MB 2ON7A 4Q5NA 6GSXA 3EWLA 4K7NA 1T00A 3I43A 1N8JA 3HZ4A 3KXOA 5J9BA 1YF0A 4TKYA 5ECLB 1NHOA 3F8UA 1KNGA 1Z7PA 4GSTA 1SL0B 2FWFA 2MBSA 4GXZA 2L4QA 3TKSE 3UL3A 2RLIA 1AQWA 3FKFA 3DIEA 4DSRA 3KCMA 2F9SA 2HT9A 1PMTA 1Z6MA 1XWAA 3BCKA 5AN1A 3EU4A 2OKAA 2PN8A 2H73A 3VI5A 4L0UA 4MLYA 1ZYQB 3IBHA 1QXHA 2WGRA 2G2QA 1TI1A 1AXDA 3QPMA 5IO2A 3HCZA 1B48A 4KSMA 4MJEA 4KGIA 2V6OA 3KM6A 4GCIA 3FK8A 3KZQA 1GH2A 2OA7A 3TDGA 3QCPA 4TRXA 1GSUA 2ZUPA 1IYIA 4XS4A 5CREA 4IJ3A 1VF3A 4F9ZA 4TR0A 2LKUA 3M8NA 1TK5B 1TW9A 4ZIJA 5IMVA 3KIJA 3LORA 1VF1A 2H01A 2AV4A 5G1LA 5CRWA 2CX4A 1FAAA 4D73B 1ML6A 5ECSA 5A4WA 4YH2A 1XZOA 4FO5A 1JLVA 3IPZA 5JCWA 1X5CA 5D96A 10GSA 1XOAA 4EO3A 2MMNA 2FA4A 1X5DA 4RI6A 2HNLA 1ZCPA 4PQ1A 3E3EA 6GSUA 1CQHA 2RUFA 4IVFA 2HZFA 1OYJA 2IMKA 3S9FA 2E0QA 3EURA 4I8BA 4IBPA 3BD2A 2FA8A 1PL1A 4G2EA 5LNKe 3GIXA 5EVOA 1EV9A 1F3AA 1OVNA 3DMLA 1JZOA 1URMA 3APOA 2ALBA 3G7YA 1CQGA 3GURA 1NHYA 3D4MA 2HFDA 1M2DA 3D21A 4QL7A 3QDNA 5FT3A 1GLQA 2OADA 2REMA 1YEPA 4P3YB 1X9SB 1YKCA 2R3XA 2C3NA 2O85A 2K6VA 4XCSA 1XWBA 3DGQA 1BJXA 4NV2A 5DVBA 1BYEA 2MMZA 1Z3EA 3J7Yk 3GL5A 2R37A 5IMCA 3W8JA 1TKDB 2P5RA 1LU4A 5DCHA 1XWCA 2IL3A 5D9TA 3UJ1A 3QAVA 5AGYA 2YN1A 2VD1A 3H1NA 4O32A 3DD3A 4ZBAA 1GUMA 2MBTA 2EIQA 5ECIB 2H76A 5A4UA 3H8QA 2WULA 2LRTA 4ZB6A 4V1Ag 5IOXA 4N10A 1NM3A 4LA1A 3GSSA 4DSSB 2L4CA 2WRTA 3VWUA 1OE7A 4DVCA 3FZAA 2TRXA 4KUNA 4YAPA 1XW9A 4EL1A 3TRXA 4X0XA 3H4KA 3TJJA 2LNSA 1O6JA 1XW5A 4MCUA 1QMVA 2KP2A 4EXJA 3HVSA 1EV4A 4ZB8A 5H5RA 2H66A 3ZFBA 2IN3A 4RI7A 4MH2A 3ZVJD 4K9ZA 3A5WA 3KH7A 4GSSA 5JCUA 5G5FA 1K0BA 2H0IA 3FYGA 1O8WA 1WMJA 5ECMB 3UIWA 3UVHA 5HR0A 5DBQA 3ZVJA 5ENUA 1F37A 5FHIA 4OO4A 1TU7A 3TKSC 2I81A 5F05A 3K8NA 3E9JB 1DSBA 2H1GA 3F3QA 2V32A 2LJAA 4NMUA 1U3AA 1Z9HA 3DKSA 4ML1A 2CAQA 3HY2A 1XOBA 1GTAA 2IMIA 1TRVA 1XFLA 2J23A 4YQVA 1M9BA 1XVWA 2YNXA 4EDZA 5IMDA 2DSAA 2CQ9A 3L4NA 5F06A 20GSA 2KUCA 2VLTA 2H71A 4ZL7A 1Y25A 2F3MA 3TOUA 3FW2A 2KP1A 1FB6A 3VPTA 1GSEA 3GUSA 1XW6A 3DWVA 3C1SA 1LBKA 4ECBA 4FYCA 4PUAA 4IELA 5IQYA 1MD4A 1SJIA 1M2AA 4K8MA 1TTZA 2NVLA 4N11A 2WJUA 1LJRA 5GAPD 2ZCTA 3V1WA 2LRCA 3PR8A 3UBKA 4PURA 3GL3A 5G2ZA 3PH9A 1YY7A 3IOSA 3TJBA 2JACA 1MDIA 3IE3A 1EEJA 3VI7A 1TI3A 3VWXA 2R6KA 4JEDA 2DIYA 3GMFA 4BVYA 3SBCA 1ZGNA 4Q5RA 1AQVA 4MZCA 3F3RA 3HJPA 3QD9A 2GSRA 1SK2A 2H75A 4I97A 4MH3A 1K3YA 1F2EA 3UEMA 2ZNMA 4J2FA 3F0IA 1FW1A 3PINA 2B6MA 4LL1B 1HQOA 3TJGA 4F03A 3CMIA 2H1DA 3QOUA 2JSZA 1A0FA 2NPBA 2L5LA 5GZZB 5ELAA 3WGEA 5JWOB 3EMXA 3HJOA 1V9WA 3D6IA 4MDCA 1FG4A 4IW9A 4DEJA 1PRXA 2LJKA 3LXZA 1WPIA 3ISOA 1RW1A 4K6XA 2VL2C 2Z9SA 1EEMA 4JE1A 3QAWA 5FWGA 4FYBA 3LFLA 3GYKA 2H6YA 5KN2A 3H79A 3C73A 1WP0A 2GGTA 3IK7A 2PBJA 1DE2A 4WF4A 2WFCA 2DMLA 2LQQA 2DJ3A 3Q74A 4TR3A 4HS1A 4O7HA 4V2NA 5J3RA 1A2LA 3F4RA 3U6VA 5G30A 2JZSA 2PVOC 5B6MA 3ZMLA 4E8HA 1BQ7A 2IJYA 3LGCA 3RHBA 5CAXA 3FR3A 2XPDA 3KMOA 22GSA 2HYXA 2B7KA 3C8EA 2RM5A 1FHEA 4KCAA 5H5SA 1ZZYA 1V40A 5ECOB 3GN3A 1OKTA 3GH9A 4WBJA 4GQFA 6GSSA 4XRDA 1SYRA 4LL4B 5DAKA 2C1YA 1S3AA 4F0CA 1TU8A 5F0GA 2F51A 1R5AA 1R4WA 1SJZA 3IRAA 2YWMA 1ST9A 5J41A 4HI7A 3FEUA 5IO0A 4ZBDA 2F8AA 2FGXA 4BWSA 3LXTA 18GSA 4J56E 5HFIA 1GP1A 1HD2A 1YEXA 1A2MA 1GUKA 4OCFA 4XRAA 4ZILA 1PSQA 1PN9A 1U87A 1T1VA 4PNGA 1ABAA 2JZTA 1ERVA 2L59A 3F9UA 3ZIJA 4MF5A 2GSTA 1J0FA 3L0HA 1RQMA 3EVIA 2H8LA 2DBCA 2N5AA 4MJAA 2B3SA 2K18A 3TKQA 2WCIA 1XBSA 1K0CA 3LG6A 1W89A 2HRFA 2X8HA 1UC7A 1M99A 1K0NA 4IS0A 2H72A 4AJ8A 1VGLA 4TN8A 2VCVA 5EPFA 1XVQA 4TR4A 1GSFA 3ERWA 2HE3A 4PUFC 1GSSA 4MJBA 2H70A 2C0EA 4YQMA 2R2JA 4YAVA 4HJ2A 1OC8A 2L6CA 3FHKA 5ABRA 2GSSA 2MZCA 4WR4A 4OFTA 4JZQA 4K0GA 5CO3A 3QAGA 1SENA 11GSA 1ZYEA 3US3A 4H86A 2N5BA 4AJ7A 3BOAA 3A2WA 1T8EB 3KP9A 4POLA 1O85A 3G7JA 5GSTA 2P5QA 4XHMA 6GSVA 5DALB 1GTBA 1I9DA 5KN3A 4MPGA 2YWIA 3FY7A 1SU9A 3GNJA 1YQ1A 2L6DA 2KLXA 3GFKA 1S3CA 2GZZA 2VL9A 5B8AA 1JZDA 2RM6A 2PVQA 3FR6A 4OFNA 4IGJA 1F3BA 2NBSA 3GTUA 4X1UA 1EWXA 2K8VA 5CP1A 2FWHA 2GS3A 2P0GA 1G7OA 4Q5FA 2K9FA 2JU5A 3LQ7A 1R26A 5HR2A 3GH6A 2JZRA 1MD3A 1WOUA 3P2AA 1V57A 2I9HA 1XWGA 3HYPA 3BBYA 3UOMA 2L57A 2N5FA 2OE1A 5AIVA 3ZIVA 3NZNA 4RQRA 2YJ7A 2VM2A 3OR5A 5HR1A 2NTOA 4EUYA 4JU5A 2GZPA 1V58A 4TXVA 5B7CA 3G7IA 1GWCA 4L8EA 5GAND 2V2GA 1YF1A 5DALA 3I69A 5ELGA 3GKKA 5F07A 5H5QA 1SK1A 4HDEA 3ZMKA 5ECKB 1OKDA 1PX6A 4EF0A 4XTSA 2B5YA 4V2LA 1HYUA 1UA5A 3VWWA 4O5RA 4EDYA 2MMOA 2OJLA 4GQCA 1OC9B 3WD6A 5HQPA 4JR4A 4XS6A 3KMNA 5KN1A 2YZHA 4OD7A 2DJKA 1SD9A 2C0FA 2LRNA 2BMXA 4HQSA 5D9XA 5LCZA 4CW9A 4BL7A 1HNAA 2GTUA 3D4TA 3KJYA 3UARA 5CRHA 5CNWA 1M0UA 4K1FA 2QGVA 14GSA 1EOGA 1QQ2A 1Y6EA 5F8BA 2PMTA 2PU9C 3H93A 3EC3A 2FY6A 1R7HA 3J7Yb 17GSA 2AUVA 2VD0A 1A8LA 3IR4A 4ECIA 5AISA 3UAPA 1W4VA 3VWVA 4PQIA 3FZ9A 4DSQA 3M1GA 4MMMA 4OWYA 1PKWA 4MZBA 2CAIA 5J5NA 1ZL9A 3GA4A 2VL3A 2HLSA 4XIHA 1SK0A 3F6FA 5DQYA 3IDVA 2VCZA 2FCHA 1G6YA 2LS5A 1OAZA 4KX4A 1FVKA 3CXGA 3KTBA 2AAWA 2HRNA 5DQSA 1A8YA 3WT1A 1EGOA 1PA3A 1PX7A 1OC9A 5HFKA 4PX1A 1NSWA 2C0DA 2XBIA 2XPEA 1SKWB 4BPYA 1EP7A 2YCDA 3DRNA 3HD5A 4N0VA 5DDLA 4TOPA 3FRCA 3MDKA 4IQ1A 1QK8A 1YZXA 3MNGA 3CSIA 3F4TA 2VIMA 4TXOB 1T7PB 4KW6A 4V2MA 1TJDA 3P8WA 3ZLPA 4KSOA 3O6TA 4V1Ap 1JZWA 2B5XA 1Q4JA 1M9AA 2HSYA 3TKPA 2VLUA 4ECCA 2H0HA 4BWQA 2H6ZA 3UVTA 4RQXA 4POMA 5J9CA 2TIRA 4ZL8A 1KTEA 4FIWA 3C1RA 1MDKA 2LUSA 3DEXA 3ERFA 3CRTA 4MPFA 5E4WA 4IHUA 1GUHA 2FNOA 3TGZA 5ECQB 2GLRA 1Z5YE 3ZRDA 3VFIA 3F63A 3GX0A 1QFNA 3L9SA 4NHWA 2V41A 4K0NA 2PWJA 3APSA 3BCIA 1F9MA 4F82A 2FLSA 5DAKB 2CA8A 2WS2A 4CHSA 5JWRB 2OE0A 2WB9A 1A2JA 5D9WA 2NDOA 3CTGA 3EE2A 4JBBA 4MJCA 1AC1A 1TDIA 3DYRA 4POKA 3FZ5A 1TK8B 1TRWA 3O3TA 4GSNA 2BTOT 1S3DA 3LJRA 4WEYA 2FWGA 4TXOA 1E2YA 4ISDA 1PL2A 1T3BA 4GWRA 2ES7A 3U5RE 1IYHA 2GDRA 2DC5A 2O7KA 1OC3A 2HI7A 1I5GA 1K3OA 3CSJA 3D0ZA 4KDUA 1BX9A 2CX3A 1J08A 1ERUA 1NW2A 3KGKA 1GSYA 2H74A 5B8BA 1XIYA 1K0OA 1MDJA 1OE8A 1B4PA 3Q19A 5AIXA 3E0UA 4PGTA 3ZL5A 5JCGA 5D8IA 5EY6A 2HZEB 3VPQA 2VCQA 5A5KA 4Z7XA 2FWEA 4ZBBA 2DIZA 1GNEA 2GQKA 2B1LA 3R2QA 4F0BA 1SKSB 4ECJA 3IV4A 3W6GA 1X5EA 4EE0A 2AYTA 3GKMA 2GQLA 1AAZA 5ECNB 3WGXA 2YOIA 1SJ6A 1AQXA 3VLNA 3IC4A 4LLRA 2A2RA 2GQMA 2LSTA 2JADA 1QGVA 1GTUA 5ECHB 1GL8A 3GX8A 3ME8A 3IA1A 3IAS2 4NAXA 2AHEA 3RHCA 3MWHA 3MAKA 1ACVA 1VRSD 5KEJA 2V6KA 2X99A 2CT6A 1DE1A 2EIRA 1RK4A 4FYUA 5JWQB 1U3IA 2C3QA 2I4AA 4GRFA 1GSDA 3CSHA 3EU3A 1N2AA 4E8EA 3RAZA 2EIOA 3F6DA 2XBQA 1R5PA 4IKHA 4K2DA 1MTCA 1XXUA 2DMMA 2C3TA 3APQA 2FD3A 3L78A 5EL8A 2VCWA 1DUGA 5IPGA 2HZEA 3ME7A 6GSTA 4N30A 2A2SA 4PQHA 2YANA 2HXKA 1G7EA 4WXTA 2VCTA 3P7XA 5IMAA 4J57E 1TK0B 1FVJA 4HZ4A 5C00A 1JHBA 3RDWA 2BJXA 3GTUB 1T4YA 4ML6A 5D93A 3CBUA 2WDUA 5ID2B 1WJKA 3DXBA 2RUEA 4MA9A 2D2ZA 1J9BA 3KEBA 2LQOA 4ACSA 3TRQA 3A2XA 2PGTA 3HDCA 3SWLA 1EP8A 4L5OA 4TVEA 1Q98A 2EC4A 5A4VA 3D22A 2L5OA 4TR1B 1YKAA 4IN0A 4G10A 5IM9A 3IAM2 2YWOA 2M72A 3F4SA 1ERWA 3ZZXA 4MF6A 1BAYA 3GSTA 2C80A 3EINA 3LSZA 2PUKC 4ZB9A 2J9HA 3HZ8A 1GSQA 1FOVA 3TJKA 4KE3A 5LD0A 3JCML 1WE0A 3GRXA 4LMVA 3L9VA 3LWAA 2OACA 2K8SA 4AF2A 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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