1SD9A

Arsenate reductase c12s mutant +0.4m arsenate from e. coli
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
138
structure length
138
Chain Sequence
NITIYHNPASGTSRNTLEMIRNSGTEPTIILYLENPPSRDELVKLIADMGISVRALLRKNVEPYEQLGLAEDKFTDDQLIDFMLQHPILINRPIVVTPLGTRLCRPSEVVLDILQDAQKGAFTKEDGEKVVDEAGKRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Arginine 60 in the ArsC arsenate reductase of E. coli plasmid R773 determines the chemical nature of the bound As(III) product.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Arsenate reductase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
total genus 40
structure length 138
sequence length 138
ec nomenclature ec 1.20.4.1: Arsenate reductase (glutaredoxin).
pdb deposition date 2004-02-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03960 ArsC ArsC family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1sd9A00
1FAAA 1OYJA 1RK4A 2O89A 3TJFA 4IP6A 2LRTA 1MDIA 3IOSA 3H93A 2XPDA 1TU8A 4ZL8A 1WP0A 1PSQA 1GLPA 1ZMAA 2H19A 1R4WA 1XBSA 4F9ZA 1ML6A 2L6DA 1O8XA 1DUGA 4POMA 5HR2A 4DSQA 1X5CA 2RIIA 4MPFA 4DEJA 1FO5A 2PBJA 3FHKA 3F3QA 1TP9A 4PQIA 3KTBA 1U6TA 4BVYA 1XVQA 3KD0A 4WF4A 3HY2A 6GSTA 3HHVA 4POKA 1I5GA 4PGTA 1TKDB 3DYRA 3VPQA 1UA5A 4ZXGA 3OR5A 1XWAA 1BEDA 2MMZA 1AIUA 3VI5A 3QR6A 2CVDA 4ACSA 4OO5A 4O92A 4CHSA 3P7XA 2J23A 1VF4A 4E8EA 3WYWA 4Q5FA 2WULA 4V2LA 3GYKA 2DMMA 3LG6A 2C8UA 2IMEA 3GKMA 3J7Yb 3FZAA 1GSQA 3UARA 3GMFA 5E4WA 1M2AA 4J2FA 4YAPA 1JZRA 1VF2A 3TRXA 2JZTA 5JCWA 1N2AA 2GSSA 3D4MA 1K0MA 2L57A 2GQMA 4MJAA 4LA1A 1EOGA 2FA8A 3ZVJA 2YWIA 2FLSA 1JZWA 1SJ6A 3DWVA 2P31A 2AHEA 3QDNA 2PWJA 2F8FA 2B5XA 2LRCA 2X99A 3BJ5A 3CBUA 4I97A 3EU3A 1FHEA 3J7Yk 1AW9A 3FR9A 3APQA 3KEBA 4K7OA 1LU4A 2GTUA 1TOFA 1A8YA 1K0NA 4X1UA 4JE1A 3QAGA 5FT3A 4IN0A 3M0FA 2YNXA 1EGOA 17GSA 2OADA 1TXXA 1U3IA 2H0HA 2FGXA 14GSA 4TXOA 3VWUA 4HQZA 1IYIA 1PX7A 2GS3A 2VCXA 5KN1A 1XOAA 2CX4A 2ON5A 4G9HA 2OE1A 2QGVA 1OC9A 1XW6A 3PR8A 4XRAA 3APSA 1B9YC 3NOFA 3P8WA 3ZIJA 4V2MA 2M72A 1K0BA 5IPGA 2AUVA 4FYBA 1X5DA 2VCQA 1H75A 2O7KA 4EE0A 4OFNA 4KW6A 2H74A 1ZL9A 1OC8A 1SENA 1GL8A 3E9JB 2GZPA 5B8AA 5ECSA 1FB6A 5ENUA 2H6YA 2TRCP 2HE3A 2E2GA 4MPGA 2F8AA 1XVWA 1B48A 1XW5A 1Z7RA 3KH9A 4MP4A 2GZYA 4MZCA 2L4CA 1AQWA 2YANA 3TB2A 4IHUA 1GSDA 2K8VA 3IDVA 1VF3A 1K3LA 1CQHA 2NVLA 4HU7A 1WPIA 3UOMA 3IA1A 2GVPA 1F9MA 1CQGA 4L5LA 5IMDA 4ULXA 2IMKA 3M9JA 5B7CA 3GHAA 4O32A 3D0ZA 2WGRA 2PUKC 1JLWA 3GIXA 2K8SA 1EWXA 2MBTA 5DALB 5HFIA 3TCOA 1Y6EA 3M8NA 3C7MA 3O6TA 3F8UA 4GLTA 5C04A 1TRWA 4TR1B 3D6IA 5D9WA 5D96A 2H73A 3U5RE 4TXVA 4ZBDA 4KAEA 1ABAA 4V1Ag 5ABRA 3NZNA 4OCFA 2YV9A 1J08A 4EUYA 2WCIA 1EEJA 2LQQA 3EYTA 3HVVA 3EMXA 1ON4A 2C0FA 5DCGA 2H1AA 1MD3A 1U88A 3FEUA 5ECPB 3GL5A 3EWLA 2FNOA 1K0CA 5DBQA 4DSRA 1GWCA 4OWYA 5D8IA 2BTOT 5IO2A 1GTAA 3LFLA 1TK0B 2IFQB 2OKAA 4J57E 3MAKA 3IC4A 2VLVA 4WBJA 3E0UA 2R2JA 3Q19A 2V41A 3DRNA 5J4UA 1F3BA 4XS4A 4LMVA 3WGDA 4ZL9A 6GSWA 1NHYA 4ZB9A 1OAZA 1GUMA 5LD0A 4L5OA 2O85A 1OE8A 4V1Ap 2LTKA 5JCGA 4JZQA 2CV4A 2IIYA 2DIZA 3TUEA 3G7YA 2H6ZA 3D4TA 4IQ1A 3LGCA 2FWEA 2DJKA 5C00A 3QD9A 2YV7A 2AYTA 5G1KA 2NBSA 1EV9A 6GSUA 1NW2A 3VWXA 1XFLA 4MZBA 2KOKA 3WD6A 3IRAA 1B8XA 3GX0A 1M0UA 2IWTA 4CW9A 5GAND 1DE1A 3CTGA 4EF0A 5ID2B 4KCAA 2OE3A 5EVOA 2ES7A 1O85A 2HT9A 5ELGA 1O7UA 4GF0A 1ILOA 1NHOA 2L6CA 2G2QA 2FHEA 1FW1A 4KA0A 3RHBA 1O81A 4WEYA 3RHCA 1VRSD 1YDKA 4GWRA 1USBA 1YF1A 2FUG2 1JHBA 5ECNB 3ME8A 2CT6A 2JADA 3A2VA 3SBCA 5KN3A 3QFBC 2AV4A 2DJJA 5JCUA 4KE3A 3UBKA 2H70A 3H79A 3QCPA 3EC3A 2LEGA 1KEBA 2XBIA 4D73A 1YEPA 4EC0A 4P3YB 4I6XA 4PUFC 1OE7A 1Q98A 3ZRDA 2YZUA 2OJLA 4KSMA 4AJ7A 4Q5RA 3KMOA 1HQOA 4OO4A 2K9FA 2BMXA 4LLRA 5B8BA 1AC1A 3DD3A 4TRXA 4IKHA 4ZBAA 3IV4A 4BPYA 5LNKe 3F9UA 4J56E 3JCML 2LJAA 4PNFA 1YEXA 3GTUB 3D21A 4F82A 2ZCTA 3HVXA 2GZZA 3HXSA 2TIRA 1GSEA 3TKSE 3RPNA 2VAFA 2IMFA 3QAVA 3GNJA 3I69A 5EPFA 3KP8A 4HDEA 5IOWA 2JACA 1ZGNA 2CX3A 4FYCA 4BWQA 3VI7A 2DLXA 1ZYEA 3DVXA 2DBCA 1SKWB 2VL2C 3RBTA 2DSAA 5G31A 3D5JA 2R37A 4WF5A 3SWLA 3ZREA 2JSYA 3LYPA 1ZYQB 4IELA 2A2RA 2C0DA 1FG4A 4MABA 4K2DA 1Z5YE 2B1LA 4LMWA 5H5SA 1SK0A 2HZFA 2QSIA 1A8LA 5J41A 5G5EA 5D9TA 1GLQA 1T3BA 4GCIA 4JEDA 5FHIA 2H66A 4K0NA 1B4QA 1R5PA 4JU5A 4WKWA 1BYEA 2I9HA 1MTCA 3MNGA 1QUWA 1T1VA 1A0RP 2V6OA 1X5EA 2AAWA 5FWGA 1ZZYA 1UN2A 3CYNA 1ERWA 2FY6A 2F9SA 1ZCPA 2CZ2A 3EU4A 3UVTA 5ECIB 3IXRA 5IMZA 2RUFA 4CDOA 5H5RA 5KN2A 1WRYA 2RUEA 4X43A 1GH2A 2H01A 1V40A 4IBPA 3KCMA 3L4NA 2VM1A 2HRFA 2C80A 4ECBA 1FVKA 5DQSA 4MF6A 2PPTA 4GSSA 3ZFBA 1MEKA 1IYHA 1HNBA 5CP1A 5ECHB 1F6MC 1MDKA 3O3TA 3IK7A 1J9BA 5DAKB 4ML6A 4XHMA 1SL0B 2VCTA 2DIYA 4F0CA 5KN0A 3A2WA 3KMNA 3ERGA 5J3RA 2R6KA 5D9XA 3G7JA 2KP1A 5IMCA 2HLSA 1G6YA 3BCIA 4EDYA 1GSFA 3VPTA 3QMXA 3VFIA 2L59A 4QQ7A 1WOUA 4F03A 1G7OA 1SL1B 3KXOA 1Y25A 2DJ2A 1OKDA 2B7JA 3HZ4A 4K8MA 5AN1A 2N5AA 2OACA 3GFKA 2VM2A 1B9XC 4EKZA 2MZCA 3IHQA 5CRGA 1T8EB 3KM6A 4JR4A 1JFUA 3DGQA 2OBIA 2MMOA 2H0GA 2H75A 1NM3A 4OMVA 4WR4A 2RLIA 1XW9A 2VLUA 3ZITA 1A2MA 2YZHA 4I5QA 4ECIA 3ME7A 20GSA 5LCZA 1X0RA 1XZOA 1KBNA 5DCHA 5IOXA 2JSZA 4BA7A 16GSA 1PN9A 4IJ3A 1HD2A 4HI7A 1TRVA 3UBLA 1PKWA 3IAM2 3BBYA 3UVHA 2GT5A 1XWBA 1QFNA 3ZFLA 4NAXA 2B6MA 3APOA 4GSNA 3UAPA 1GNEA 2KHPA 3U6VA 2EC4A 4EL1A 1RQMA 5F0GA 3HVSA 1K3OA 5COHA 1V2AA 2EIRA 3I43A 3ED3A 2M80A 3PGTA 3IE3A 3GN3A 4RQRA 4TN8A 4DVCA 3IPZA 2JU5A 4AJ8A 2J9HA 1V57A 1BQ7A 3WGXA 4ECJA 2CVBA 2VOCA 2XBQA 4IVFA 4HS1A 2C1YA 2P5RA 2HI7A 5D9VA 3FR6A 3CRTA 4MF5A 2DJ1A 9GSSA 2K6VA 4IQAA 1WWJA 4I2TA 4YQVA 1PX6A 3C1SA 5ECRB 2F51A 3TJJA 2YN1A 3F0IA 5AGYA 3RAZA 2FD3A 1R7HA 1LBKA 1E2YA 3V1WA 4EO3A 1W4VA 5DQYA 4L0WA 5J5NA 2PVQA 3EVIA 1R26A 2GQKA 2L5OA 4MZWA 3UJ1A 2O8VB 3I6AA 3DXBA 4WR5A 2C4JA 4EVMA 1U3AA 2H0IA 3KH7A 5GSSA 4DSSB 2FWGA 7GSSA 2HRNA 1MD4A 5IQYA 1S3DA 4BWSA 3W8SA 1GULA 5CRHA 3GA4A 1SD8A 2B1KA 4ZB6A 4OFTA 3DKSA 4IP1A 1T7PB 2H1BA 4KB3A 3ZMKA 1HNAA 2GSRA 1YF0A 3US3A 2H72A 1YJ6A 3GH9A 2RM6A 2VL2A 3TJKA 3ZL5A 1O8WA 4ZIJA 3TJGA 3A3TA 2GLRA 3VLNA 5G30A 2WFCA 6GSVA 1SJIA 2X8CA 3M3MA 1M7TA 2YWOA 3LYKA 2FWHA 2D2ZA 3F63A 2KLXA 1EEMA 1TJDA 3ZLPA 4OD7A 5DJLA 2YWNA 2G0FA 2K18A 2WS2A 3PH9A 1WJKA 1PRXA 2HFDA 5CREA 3G9BA 3F4TA 10GSA 1TW9A 1XCCA 1THOA 3LEFA 4YQMA 4X0XA 4AJ6A 1TRUA 1C72A 2YP6A 1X9SB 3Q74A 3FYGA 5DALA 3ZTLA 3Q6OA 1FOVA 5CAXA 1WIKA 4NXIA 1T00A 2DJ0A 1M2BA 3TRQA 1GP1A 1QMVA 1TRSA 4TR1A 5F8BA 4FIWA 4KCEA 4XIHA 2OA7A 1SKRB 3K8NA 2VD0A 1SD9A 2LSTA 3DEXA 1J0FA 4G10A 4MJEA 3GRXA 4MDCA 1GRXA 3EURA 2XHFA 4XTSA 3CMIA 2HZEB 4MCUA 3WT2A 2GSTA 3L9UA 13GSA 4PX1A 1GSUA 2I81A 2HXKA 1YKCA 2CZ3A 2MBSA 3BCKA 2VUPA 5D73A 4FYUA 1TI1A 1K0DA 3HD5A 2WJUA 4N10A 2I1UA 4RUVA 3MDKA 1VF1A 3GKKA 4ZL7A 2C3QA 3H4KA 2IFQA 4L0UA 18GSA 4KDUA 5AIXA 4WETA 2VO4A 3ERFA 2DMLA 3EMPA 1B4PA 2FWFA 4NWYA 2LUSA 2ZNMA 4MF7A 2C3TA 2H71A 1G7EA 4IW9A 1GTUA 4NV5A 4HZ4A 4FO5A 4QL7A 3D22A 4V2NA 3I9V2 2VCZA 4MJCA 4MK3A 1THXA 2HSYA 1GNWA 3F6FA 3S9FA 5CNWA 4TVEA 3VWWA 1YKAA 3TKQA 3TOTA 3C1RA 1BX9A 1BG5A 1EZKA 4MLYA 2NDOA 1Z6MA 3GKXA 3HDCA 1XXUA 1AQVA 1ACVA 5ID2A 4YH2A 4IS0A 2H76A 3F3RA 2FA4A 2GGTA 3FZ4A 3QFAC 2V32A 4PURA 4H86A 1QGVA 4NHZA 3GH6A 1MDJA 1FB0A 5J9CA 3VK9A 3CSHA 3P90A 3HA9A 2PERA 5EL8A 2YPMA 4K9ZA 1K3YA 4Z7XA 2HNLA 2YOIA 1SKSB 2KUCA 3IK9A 2R5GA 2EIQA 3ERWA 5INYA 2LQOA 2XC2A 4ZB8A 2AJQB 1PMTA 1QQ2A 1XWGA 2F3MA 4IJIA 3CRUA 1GSSA 4EDZA 1GUKA 4LL4B 2E7PA 3MWHA 1AXDA 1S3AA 4WBRD 2VCVA 2PU9C 4PXOA 4RI7A 3TKPA 4K1FA 5D93A 1N8JA 2CA8A 2OBKA 2LJKA 3NIVA 4YQUA 3LXZA 2CQ9A 2N5BA 1PL2A 2GDRA 3EINA 3GTUA 5F07A 4AF2A 2WB9A 3PINA 3TGZA 3DVWA 3IAS2 1U87A 3TDGA 2O87A 3TRPA 4NPBA 3RPPA 1VGLA 3FZ9A 4TXOB 5JWOB 3H1NA 1UVZA 4N0ZA 1GTBA 1WMJA 4GXZA 2A4VA 2IPAA 1DBYA 4KUNA 5A4VA 5JWQB 5ECQB 1Z3EA 4BL7A 2PN8A 2A2SA 2HYXA 3L9VA 3H8QA 2ZUPA 5J9BA 4GQCA 5HR3A 5G1LA 2CAQA 1OC9B 1DSBA 5DJMA 2JZSA 3LWAA 2B5YA 4ILFA 2YWMA 1T4YA 3KP9A 4GSTA 1UC7A 4HEA2 1TK8B 4K7IA 1S3CA 3A2XA 3KIJA 2BJXA 4I8BA 1JLVA 1F2EA 1TK5B 4XRDA 3M9KA 3W6GA 4POBA 1TU7A 3HJOA 3ZVJD 2VLTA 3M1GA 4ID0A 4PUAA 3F4SA 2X64A 4IGJA 2H1GA 3ISOA 3LORA 2MYGA 1M2DA 2H8LA 5KEJA 1TI3A 11GSA 2VCWA 2E2MA 3FRCA 5AIVA 1AUCA 3TOUA 4BVXA 1JZDA 1OKTA 1FVJA 3LSZA 4MA9A 3UIWA 3FZ5A 3P2AA 2WRTA 4XS1A 5ECOB 3C71A 1SU9A 4TW5A 5IO0A 1OC3A 5G2ZA 5AISA 5ECMB 4K6XA 3HJMA 5A4WA 4K0GA 1QK8A 2LS5A 3A5WA 2Z9SA 6GSYA 2GSQA 3CSJA 3TKSA 1T4ZA 2H6XA 4TKYA 3FK8A 4NMUA 2VL3A 4NV2A 2CVKA 3WT1A 2P0GA 3F4RA 3C73A 1ZOFA 3FR3A 2LNTA 2IL3A 1M9BA 1HNCA 4ISDA 4HJ2A 5IPHA 3HKRA 5DAKA 1A24A 2B3SA 4N0VA 3HCZA 1F3AA 4KDXA 2TRXA 5F05A 3DIEA 1KTEA 3GSTA 1NSWA 2C0GA 2LRNA 1XWCA 2VL9A 3IBHA 3GSSA 4MH3A 1A2JA 1EP8A 1A23A 2KP2A 4GQFA 4PNGA 1R5AA 3GKNA 1K0AA 1O73A 5JWRB 2PMTA 2V6KA 2MMNA 1PQNA 4HOJA 1G0TA 3WGEA 2YCDA 1HYUA 1GSYA 3GL3A 1GTIA 4OCEA 1M99A 3BD2A 2IMDA 1V58A 4WXTA 4K7NA 4XS4B 2JZRA 6GSXA 1PD21 2EIOA 4I2UA 2X8HA 4PQ1A 4ZBBA 1K0OA 3ZMLA 4ML1A 3VURA 2I4AA 5DDLA 1XIYA 3ZZXA 1BJXA 4AGSA 1W89A 1PGTA 3UL3A 1XPVA 4F0BA 4YAVA 2AB6A 1URMA 4Q5NA 1TDIA 3L0HA 3RDWA 4XS6A 2L5LA 4MJBA 4TR3A 1V9WA 5ECKB 3W8JA 3N5OA 2M46A 2NTOA 3MSZA 3Q18A 2LKUA 4KH7A 4XCSA 2QKEA 6GSSA 1KNGA 4HU9A 3GUSA 4MMMA 1SK2A 5GSTA 2WDUA 1Z6NA 1ERUA 5IMVA 1YY7A 1Z7PA 3UEMA 4HUAA 1SJZA 3DMLA 1E6BA 1EP7A 1YQ1A 5DVBA 2X8GA 4POLA 4E8HA 3R2QA 1RW1A 3QAWA 2R3XA 3LQ7A 3L78A 2H1DA 4QL9A 2V1MA 1EV4A 3E3EA 4N30A 3CTFA 4ZILA 5H5QA 2E0QA 5HQPA 5IMAA 3C8EA 4D73B 4JRRA 4O7HA 3HJPA 1PL1A 1H4OA 4MH2A 3IR4A 3KTLA 3O76A 4KDYA 2B7KA 5HFGA 2GT6A 1WE0A 2C0EA 2HSHA 2OE0A 4Q5QA 3TKSC 5ELAA 5F06A 1QXHA 1X9WB 5CO3A 1Z9HA 5E59A 2DC5A 2V2GA 2I3YA 1EOHA 5L71A 3QPMA 4N11A 4DSSA 5CYYA 2C3NA 1EGRA 4KGIA 4PQHA 1SK1A 2RM5A 3TJBA 2MMAA 3KZQA 2GQLA 2NPBA 3LJRA 2H30A 1LJRA 2WZ9A 3FY7A 4KX4A 1G6WA 1TTZA 2LNSA 2YJ7A 3VWVA 1ST9A 4G19A 5HFKA 3HYPA 2IJYA 4TR0A 4TR4A 4FH8A 2PGTA 5ECLB 4NHWA 3CXGA 5A5KA 2CAIA 3KJYA 1PKZA 2P5QA 12GSA 2PVOC 5HR1A 5CRDA 4EXJA 1F37A 3FKFA 2YJHA 3BOAA 1SYRA 4O5RA 1M9AA 3FW2A 1AAZA 2IMIA 3KGKA 1A0FA 4KNDA 3L9SA 1SL2B 3LXTA 4HJMA 1PA3A 2XPEA 4RQXA 1ERVA 1BAYA 8GSSA 4OFMA 1DE2A 5B6MA 4LL1B 4TOPA 3QOUA 3ZIVA 5GAPD 1A2LA 4GRFA 5IM9A 3ZYWA 4JBBA 2R4VA 1XWKA 2L4QA 5GZZB 3CSIA 1OVNA 1O6JA 2LJRA 4F2IA 4KSOA 3HZ8A 3UMAA 1XOBA 5G5FA 2ON7A 3GX8A 22GSA 2N5FA 1GUHA 5A4UA 19GSA 1JZOA 2VIMA 2REMA 3G7IA 1X9MB 2B5EA 1YZXA 5IMFA 2QC7A 2LV3A 4G2EA 1I9DA 2JL4A 1V98A 5B6NA 4RI6A 2HZEA 4JR6A 3TKRA 1ERTA 4L8EA 2FCHA 3GV1A 2VD1A 3AY8A 4HQSA 1AQXA 1Q4JA 5CRWA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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