1SD9A

Arsenate reductase c12s mutant +0.4m arsenate from e. coli
Total Genus 40
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
40
sequence length
138
structure length
138
Chain Sequence
NITIYHNPASGTSRNTLEMIRNSGTEPTIILYLENPPSRDELVKLIADMGISVRALLRKNVEPYEQLGLAEDKFTDDQLIDFMLQHPILINRPIVVTPLGTRLCRPSEVVLDILQDAQKGAFTKEDGEKVVDEAGKRL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Arginine 60 in the ArsC arsenate reductase of E. coli plasmid R773 determines the chemical nature of the bound As(III) product.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Arsenate reductase
molecule tags Oxidoreductase
source organism Escherichia coli
total genus 40
structure length 138
sequence length 138
ec nomenclature ec 1.20.4.1: Arsenate reductase (glutaredoxin).
pdb deposition date 2004-02-13

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF03960 ArsC ArsC family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1sd9A00
3HXSA 3ZVJA 3D21A 4TR1B 1PL1A 4HQZA 1TRVA 1Z7RA 2OA7A 1H4OA 1OYJA 4F82A 2OBKA 1M7TA 3MNGA 3M0FA 1SJIA 2F8FA 5AIXA 4KUNA 3DXBA 5D73A 1PD21 5ABRA 2CAIA 1PX6A 4KSMA 3H93A 3M3MA 1GTAA 2IMEA 3VWXA 1XVQA 1T00A 3ERGA 6GSSA 2C0GA 3V1WA 1SK2A 1HNBA 2C0FA 1HYUA 3MWHA 2E7PA 3WD6A 3I6AA 2PERA 4ECJA 1G6YA 2NBSA 4NHWA 1TRSA 1YEXA 5GSTA 2HSHA 5B8BA 4JR6A 4HS1A 1J9BA 2CT6A 5H5SA 4TW5A 2HRNA 2B5EA 2LS5A 4FYCA 2I1UA 2H1AA 4F0BA 4G2EA 4MDCA 5F0GA 2VL3A 2KOKA 2TIRA 3VI7A 4ZB6A 1U87A 1TRUA 2DLXA 3UMAA 7GSSA 4IELA 3CRUA 1E2YA 2X99A 3TOTA 3GSSA 2K6VA 2DBCA 2AB6A 3O6TA 1RK4A 3IPZA 5DAKA 2MBSA 2H6XA 2YZHA 4HZ4A 3LJRA 2I81A 3TUEA 2L5LA 5LNKe 5LCZA 2HI7A 3LG6A 5G31A 2RUFA 4K7OA 1M0UA 5G30A 1OC9B 2ON7A 5GAND 1XOAA 4I97A 2DJJA 3ERFA 3F8UA 5G5FA 5IQYA 3I69A 5CAXA 3UBLA 1QFNA 2VCZA 2P5QA 3WT1A 4MJEA 2B1LA 1U3AA 3IK7A 4IVFA 3GMFA 4TR1A 3UEMA 1XW5A 1X5DA 3A2WA 2C8UA 1SENA 4HI7A 3C8EA 2RIIA 1M2AA 3GKNA 1ZYQB 1M9BA 2LKUA 1ABAA 1WIKA 5G1KA 2HE3A 3SWLA 1KBNA 2N5BA 2BTOT 1GNWA 2LQOA 4ECIA 3TDGA 2HYXA 4V2MA 2MMZA 3TJFA 1U3IA 1URMA 4GQCA 2LRCA 3D0ZA 3ZVJD 2IMDA 4ID0A 5DJLA 3FHKA 1TI1A 1EP8A 1A2JA 2DJ0A 4AJ7A 3KH7A 1ERTA 14GSA 2B7JA 1O85A 2YP6A 1DUGA 4KGIA 1K3OA 3NIVA 2L5OA 3VK9A 2VOCA 2IL3A 2R4VA 3SBCA 5ID2B 3GH6A 2YZUA 4RI6A 5ECKB 2IWTA 4K6XA 4WEYA 4GSTA 4LL1B 4NV2A 2AV4A 1PMTA 4ILFA 4WKWA 3IRAA 4RUVA 2JU5A 1JHBA 3TRQA 2YV7A 2R6KA 3VI5A 4GSNA 3F9UA 3FW2A 3KIJA 4TN8A 2RM6A 1MD4A 1TU8A 4XS1A 1TJDA 3ME7A 4PUFC 2VCTA 3FZ4A 4IKHA 1XWGA 2VCXA 5HQPA 6GSWA 5IPHA 5B6MA 4JU5A 4Z7XA 2DC5A 3DMLA 4XS4B 4PXOA 2FWFA 5ECPB 3F3RA 1ZCPA 1A8LA 2G2QA 2P0GA 2IMFA 3TJJA 4KA0A 2QSIA 4TR0A 3LYKA 2NDOA 1SD8A 3D4TA 2H0IA 2XBQA 2E2MA 4GSSA 4HQSA 2EIQA 1JLVA 1GSDA 4I5QA 5DCHA 2IIYA 5IIZA 2GZPA 4TXVA 4OCEA 3UL3A 8GSSA 2AAWA 3ZFBA 2AJQB 5HR0A 3F0IA 1JLWA 4NHZA 3EURA 1K0BA 3A3TA 5IMZA 5B7CA 5JCGA 2YN1A 5B8AA 2DMLA 5IPGA 3O76A 1PA3A 4K1FA 2I3YA 4NV5A 2FHEA 1V9WA 1EGRA 1F3BA 2VL9A 3NZNA 1NHOA 2E0QA 4YQMA 2CX4A 5C04A 3QAGA 3H1NA 3DVWA 1XBSA 4MPGA 3HA9A 1O73A 2XBIA 2H1DA 1LBKA 2H1GA 5ECOB 3S9FA 3TRPA 1T8EB 2DSAA 2EIRA 2C1YA 2VL2A 4ZL8A 1B8XA 3DWVA 3QD9A 5IOWA 1YF0A 1R7HA 1TDIA 5H5RA 2H19A 1GSQA 5CRDA 5IO2A 3DD3A 1T4ZA 2HZEA 3TRXA 3J7Yk 4D73B 2GSRA 3VWUA 2XPDA 4RI7A 4IJIA 2X64A 1GTIA 1PRXA 5ECMB 5G1LA 3K8NA 1TI3A 3HY2A 1ZL9A 4GTUA 5IMAA 4TXOA 3KP9A 4QQ7A 1Z6NA 1YEPA 4LMVA 1ST9A 1GUHA 5CNWA 4P3YB 2H72A 1FO5A 4RQXA 5ECHB 1VF3A 1B48A 5HR3A 2H74A 1GTUA 1QMVA 1MDIA 1TP9A 1TKDB 2YANA 4KNDA 5C00A 3F6DA 5CRHA 2MYGA 3ZTLA 1OKDA 5JCWA 2X8GA 1Z6MA 3FYGA 17GSA 3ERWA 1TRWA 2FD3A 3IC4A 1EZKA 3QAWA 3GTUB 4HZ2A 3APSA 2MMNA 3IR4A 2LRTA 3M8NA 4PGTA 5ELAA 4BVYA 1V57A 2GLRA 2L57A 1WRYA 4JBBA 3UIWA 2WDUA 3UAPA 3KXOA 2DIZA 3QPMA 5DJMA 3APOA 4V2NA 2D2ZA 2CA8A 1GSEA 1XOBA 5ECRB 3HDCA 1SYRA 1K3LA 4OFTA 3VURA 5KN1A 2M46A 2FCHA 2PVOC 2B3SA 3IAM2 3IDVA 2VD1A 4MK3A 5L71A 2WRTA 2WCIA 12GSA 3M1GA 1FAAA 1YF1A 1TK5B 1W4VA 1YKCA 1O81A 2GTUA 4I2TA 4ZB8A 2H30A 1EOHA 2MZCA 4HJMA 4IHUA 1R4WA 2PUKC 2JL4A 5EL8A 1OAZA 1TU7A 2R37A 3A5WA 4IN0A 4JR4A 4MJCA 4LLRA 1GSUA 3HKRA 4TR3A 3CBUA 2C3NA 1UN2A 5FWGA 4GWRA 1J08A 3ZIJA 2PWJA 3ZL5A 3PGTA 3FR3A 1NM3A 3FZ9A 4F9ZA 1YJ6A 4WF4A 4L8EA 5AIVA 1SJZA 20GSA 3EMPA 2IPAA 1H75A 2JACA 4V1Ag 1TW9A 3PR8A 1YKAA 4V2LA 2O8VB 2ZNMA 4DSQA 2CV4A 1OE7A 4ISDA 1Q4JA 1K0CA 1A2MA 1XWKA 3IAS2 4FIWA 4JRRA 5D8IA 4K0NA 1V58A 4KW6A 1V40A 2VM1A 4OMVA 2H76A 4K8MA 1AIUA 4Q5NA 4KH7A 2F9SA 4POKA 2OJLA 3GYKA 4JZQA 2VM2A 5D96A 2LQQA 3GX0A 4KDYA 2JADA 1BG5A 2HFDA 2LJKA 1G0TA 3M9KA 3LFLA 1UA5A 1DSBA 2CZ2A 3CSHA 4WF5A 2YCDA 3Q74A 2V6OA 3DRNA 3W6GA 4I8BA 1M99A 3G7IA 2H1BA 5A4UA 2XC2A 4IQ1A 3FR9A 3QCPA 4OO4A 1OVNA 5F07A 2VCVA 3FK8A 4K0GA 4YAVA 1SK0A 1OE8A 4MZBA 5A5KA 2L6CA 1EV9A 1M9AA 1A0RP 3GIXA 4FYUA 1SKRB 4KE3A 3E0UA 4TR4A 3G9BA 2X8CA 3DKSA 4POBA 2K18A 3PH9A 4EF0A 5E59A 2FWGA 3A2XA 2RUEA 3EWLA 5DDLA 3C73A 3G7YA 4AJ6A 3IK9A 5INYA 4ZBAA 4MF5A 4TVEA 2C0DA 3LXTA 3VWWA 1OKTA 3FKFA 2OKAA 3BCIA 3WGDA 2H73A 3P7XA 1V98A 2GSSA 4E8EA 3L9UA 3L78A 1ON4A 4GLTA 4MCUA 1ZMAA 3KCMA 4BWQA 1U88A 3TOUA 4YQUA 3BJ5A 3EC3A 2OE1A 4QL7A 2YWOA 4FH8A 1F9MA 4N11A 2P5RA 3GFKA 2CQ9A 1BJXA 2B7KA 4GRFA 4L0UA 2LV3A 3VPTA 1TTZA 4IS0A 1K0AA 2IMIA 2XHFA 3FZ5A 3GA4A 4TOPA 1HNCA 4XCSA 1ERVA 1BAYA 3L9VA 4KSOA 1Z7PA 1X0RA 5B6NA 1GSYA 3HYPA 2WS2A 3HZ8A 1BQ7A 1SJ6A 1XWCA 3Q18A 3U6VA 2PBJA 5COHA 11GSA 2ZCTA 1VF4A 4BA7A 2V32A 4MABA 4DVCA 2GDRA 4YAPA 3QAVA 5GZZB 3RPNA 4J2FA 2H75A 2KP1A 1N8JA 2H6YA 1TXXA 4OWYA 2GGTA 4I2UA 1X9SB 1JZOA 3G7JA 1GSFA 3TJGA 3CTGA 3TKSC 3IHQA 3C1SA 5DALB 2F3MA 1EEMA 5IMCA 4G19A 2GSTA 1Z5YE 4MF6A 1N2AA 1PKWA 3HCZA 5GAPD 1TK8B 4KX4A 5H5QA 2QC7A 1R5PA 5ECQB 5CRWA 2R3XA 2M80A 2DJ1A 2B5XA 2YNXA 4I6XA 4NPBA 5JWQB 2A2RA 3FZAA 4BWSA 5J41A 3TKRA 1SKWB 4IP6A 3RDWA 2RM5A 1WWJA 1GUKA 2HRFA 1XW9A 3GNJA 1ZOFA 2BJXA 1QGVA 4EO3A 1VF1A 5DVBA 1SL2B 3JCML 3N5OA 13GSA 2V2GA 3R2QA 1G7EA 1NW2A 1Y6EA 1OC9A 2VO4A 3KGKA 2L6DA 1GSSA 2RLIA 1A0FA 1FG4A 1EEJA 3TJBA 1QQ2A 2J9HA 1F37A 5HR1A 3CRTA 2GQKA 3QMXA 5DCGA 1FHEA 1A23A 1THOA 2J23A 3F3QA 5F05A 5IM9A 1M2BA 3QOUA 3D5JA 3IBHA 4IP1A 5ENUA 2WULA 2N5FA 3KEBA 5KEJA 2VD0A 3P90A 4EKZA 1AUCA 5GSSA 3KTLA 3TKSA 2KHPA 2FA8A 2FNOA 5IMDA 4ZIJA 2FA4A 1T1VA 5G2ZA 4XRAA 1PQNA 3A2VA 4KCEA 1DE1A 1WMJA 4CDOA 2H01A 3L4NA 3ISOA 2GZYA 2LSTA 4MLYA 4WETA 1GLPA 2H71A 4POLA 4HUAA 2HLSA 4PQ1A 4K7NA 2PMTA 1VF2A 1GWCA 1AW9A 2B5YA 2H6ZA 1T4YA 2JZTA 5J4UA 1DBYA 5DALA 2N5AA 1UC7A 2H0GA 3LYPA 1ZZYA 4RQRA 2LJRA 5ID2A 1EP7A 5CRGA 2GQMA 3ME8A 1R5AA 2YJHA 3GV1A 2O7KA 2WB9A 4ZL7A 2JSZA 1EGOA 1K0DA 1WPIA 3GN3A 4QL9A 4HU9A 2C0EA 1E6BA 1PL2A 4J57E 3I9V2 1ERWA 2PGTA 3F4TA 4DSSB 3HJMA 4K9ZA 2F51A 1XPVA 5EY6A 3LGCA 1ACVA 1O8WA 2HT9A 3U5RE 3UVHA 3LEFA 2M72A 2VIMA 1MEKA 3D22A 3O3TA 2ALBA 4POMA 3US3A 4XS4A 1XW6A 2K9FA 6GSYA 1GNEA 5IO0A 2ON5A 2H0HA 3BOAA 3IV4A 1AAZA 3GH9A 4N30A 1K0OA 4HEA2 2FWEA 3TCOA 4ECCA 3QFBC 4PNFA 1XFLA 1MDKA 3E9JB 2KUCA 2JZRA 3LXZA 1MDJA 1VGLA 1K0NA 4ZXGA 3WGXA 5AISA 3LSZA 2DJ2A 4BPYA 2V41A 1SD9A 1EV4A 3TB2A 3GKXA 4PQIA 3DVXA 3EU3A 3EU4A 3RBTA 1C72A 3GSTA 1MD3A 2A4VA 1GULA 5AGYA 4NWYA 2GT5A 1X9WB 1X5CA 3IE3A 2HZFA 2OADA 1B4QA 5EVOA 2YWMA 2JSYA 4E8HA 1U6TA 3Q6OA 4JEDA 5J9CA 1GRXA 5JWOB 1YDKA 1YZXA 1K0MA 1PN9A 4MMMA 3ED3A 1HNAA 4ZL9A 4H86A 3Q19A 4WXTA 2FWHA 5A4VA 3VWVA 5DQSA 5DAKB 4EXJA 4AF2A 2PPTA 3KM6A 4NAXA 1O6JA 4L5OA 6GSUA 3AY8A 4D73A 1ERUA 3EINA 1I5GA 2LRNA 3ZMLA 2VUPA 3OR5A 2DJ3A 2I4AA 4O32A 4PNGA 5LD0A 4PUAA 2MMAA 3FRCA 2B1KA 4KB3A 3L9SA 4F2IA 3BCKA 1JFUA 1DE2A 2OE3A 4DSSA 2TRXA 1UVZA 3H79A 4TRXA 4XRDA 2OACA 4Q5FA 3W8JA 3F63A 3HHVA 5F06A 1AQXA 3GKKA 4ACSA 2H70A 2HNLA 1XIYA 1M2DA 2E2GA 2GT6A 3DYRA 3LORA 1V2AA 4IGJA 5ECNB 3GHAA 2FUG2 3M9JA 4MZWA 1HQOA 3ZLPA 2VLVA 1CQHA 4YH2A 4ECBA 1ILOA 4IBPA 3GTUA 5CYYA 2CAQA 5CREA 1SKSB 1QK8A 1XZOA 2GVPA 5J5NA 2IJYA 5IOXA 2O89A 2C3TA 3VPQA 1ZYEA 4MJBA 3HVXA 1A8YA 3VLNA 2X8HA 4OCFA 3HJPA 2FGXA 16GSA 1PSQA 2GS3A 3GL5A 2LNTA 2IMKA 5ECIB 5A4WA 5J9BA 4MH2A 4XTSA 2YWIA 4ML1A 1QUWA 3BD2A 3P2AA 2Z9SA 4N0ZA 1B9XC 1JZDA 4N0VA 1PX7A 2ES7A 2NTOA 1F3AA 1BEDA 2L4QA 2H8LA 2NPBA 5IMVA 1WOUA 2C80A 3PINA 4ULXA 3EE2A 1BYEA 4PQHA 4CHSA 4GF0A 1GP1A 2LNSA 5ECSA 3IA1A 4OFMA 2LTKA 1AQWA 1S3AA 2KP2A 2EC4A 1XXUA 2ZUPA 5D9VA 5KN2A 4EVMA 1ZGNA 1KTEA 3KMNA 4IW9A 4Q5QA 1O8XA 2GQLA 2K8SA 2YWNA 5HR2A 1NSWA 5ELGA 4ML6A 3WT2A 1LU4A 3P8WA 4JE1A 2OBIA 1EWXA 1AC1A 1Z3EA 4ZBBA 3IXRA 1YY7A 4DEJA 3UARA 3N9JA 2YV9A 1MTCA 3MSZA 4ZILA 4K2DA 2V1MA 3C1RA 2NVLA 1OC8A 3GURA 4BVXA 4OO5A 5KN3A 1FB6A 1SU9A 1I9DA 2WFCA 3DGQA 5G5EA 4L5LA 5E4WA 1IYHA 3EYTA 5IMFA 4EE0A 3F4RA 1RQMA 1S3DA 3C7MA 5CO3A 5F8BA 1A24A 2L59A 3VFIA 1TK0B 3KP8A 4MJAA 9GSSA 3ZZXA 1RW1A 3KD0A 1CQGA 4LA1A 4J56E 3APQA 1J0FA 3CYNA 3GL3A 2VLUA 4XIHA 3CSJA 4X1UA 1XWBA 3RAZA 2HZEB 3ZREA 2CVKA 4XHMA 1SL0B 3FEUA 5HFGA 4GCIA 5ECLB 2A2SA 22GSA 3EMXA 3ZMKA 2IN3A 2WZ9A 2QGVA 3KJYA 5J3RA 2DJKA 2VLTA 2R2JA 5D9WA 4TXOB 1GL8A 4DSRA 1S3CA 2DIYA 2K8VA 2C4JA 2L4CA 4GXZA 2KLXA 2VL2C 3CSIA 2AYTA 5CP1A 1PKZA 4F03A 1A2LA 3QDNA 2CVBA 1FVKA 3KH9A 6GSTA 3ZRDA 1VRSD 4O7HA 4LMWA 5AN1A 3ZFLA 4AJ8A 3ZITA 2F8AA 1Y25A 1SK1A 3UBKA 1JZWA 3FY7A 4CW9A 2PU9C 3F4SA 4PURA 1JZRA 2IFQB 2LEGA 2P31A 3WGEA 4ZB9A 3TGZA 1YQ1A 3HZ4A 1THXA 5DBQA 1AXDA 2FLSA 1OC3A 4WBRD 3TKQA 1NHYA 1SYXA 2CZ3A 4TKYA 2REMA 5FT3A 2V6KA 3WYWA 1WE0A 5DQYA 3CTFA 10GSA 1G7OA 3MAKA 4X0XA 3GKMA 3HVSA 3MDKA 4MP4A 4N10A 3LQ7A 5D9XA 2R5GA 1Z9HA 4EC0A 4PX1A 5KN0A 1BX9A 1FB0A 2O87A 2GZZA 3QFAC 5JCUA 3UOMA 2B6MA 2MBTA 1HD2A 1EOGA 4GQFA 2VCWA 3W8SA 4ZBDA 2TRCP 3RHCA 2G0FA 4LL4B 2MMOA 3CMIA 2H66A 2PN8A 2PVQA 4NMUA 4L0WA 3ZYWA 1X9MB 2AUVA 4EUYA 3IOSA 3H4KA 4MPFA 4F0CA 2YOIA 2VAFA 3GRXA 1TOFA 1XVWA 3RPPA 2AHEA 3TJKA 3NOFA 1FOVA 3D4MA 1O7UA 1G6WA 3TKSE 4WBJA 3UVTA 2CX3A 1B9YC 3KMOA 1GLQA 1KEBA 5D93A 5D9TA 4KCAA 2WGRA 4HJ2A 1SL1B 4EDYA 3DEXA 2BMXA 3GUSA 3HVVA 1T7PB 2YJ7A 1GH2A 3GX8A 1R26A 4IJ3A 2WJUA 1FVJA 1GUMA 1XWAA 2LUSA 4G9HA 4MF7A 1WP0A 4YQVA 1T3BA 1USBA 1QXHA 3UJ1A 3E3EA 3F6FA 1KNGA 1Q98A 4HOJA 4FYBA 1FW1A 1K3YA 4WR4A 4Q5RA 4KDUA 4WR5A 1AQVA 4MA9A 2OE0A 5JWRB 3HJOA 3LWAA 1PGTA 4EL1A 2IFQA 3J7Yb 3D6IA 4KAEA 3C71A 2I9HA 4MH3A 19GSA 5HFKA 4FO5A 4O5RA 1B4PA 2GSQA 2FY6A 4NXIA 4IQAA 4XS6A 2QKEA 2C3QA 4V1Ap 4K7IA 2YPMA 1W89A 3QR6A 1WJKA 2EIOA 1X5EA 3BBYA 2JZSA 3CXGA 4EDZA 4AGSA 3KTBA 3ZIVA 1LJRA 4BL7A 2CVDA 6GSXA 1F6MC 1XCCA 2VCQA 5EPFA 2HSYA 2HXKA 3KZQA 4HU7A 3I43A 4O92A 2LJAA 4OD7A 5HFIA 6GSVA 2XPEA 5FHIA 4X43A 1GTBA 4G10A 3HD5A 4OFNA 4MZCA 3RHBA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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