The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
59
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sequence length |
141
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structure length |
141
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Chain Sequence |
VLSPADKTNVKAAWGKVGAHAGEYGAEALERMFLSFPTTKTYFPHFDLSHGSAQVKGHGKKVADALTNAVAHVDDMPNALSALSDLHAHKLRVDPVNFKLLSHCLLVTLAAHLPAEFTPAVHASLDKFLASVSTVLTSKYR
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| molecule tags |
Oxygen transport
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| molecule keywords |
HEMOGLOBIN A
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| publication title |
Allosteric transition intermediates modelled by crosslinked haemoglobins.
pubmed doi rcsb |
| total genus |
59
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| structure length |
141
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| sequence length |
141
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| chains with identical sequence |
C
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1996-02-26 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1PBX A; 2G3H A; 5M3S A; 105M A; 1GCV B; 2D5Z B; 2DHB B; 3MJU B; 1DO1 A; 1J40 B; 1YMC A; 3NML A; 1HRM A; 3TM9 A; 3WFW A; 2D2N B; 4ROL A; 1XZ4 B; 5C6E A; 2FAM A; 2ZSR A; 1YG5 A; 2LH7 A; 2ZFO A; 1F65 A; 1YMA A; 3BJ2 A; 4FWZ A; 1FAW A; 1S56 A; 3A9M A; 4C0N A; 4N7O B; 1QSI A; 2MGC A; 3ZJS A; 1A6K A; 3WFT A; 1VXD A; 1MOH A; 1JWN A; 1LFQ A; 2BLJ M; 1R1X A; 1ABW B; 2G0R A; 1CH3 A; 1CIO A; 5SW7 A; 3G52 A; 1HDS A; 3E4N A; 2PEG A; 3S65 A; 104M A; 1CQX A; 1S0H B; 2HBF B; 2DC3 A; 1COH A; 1I3E A; 1L2K A; 1Z8U B; 1J3Y A; 4H0B A; 1O16 A; 4MQI A; 3QM5 A; 5CND A; 1Y8I B; 3O89 A; 2ZT3 A; 1HGB B; 1NIH B; 2GRF A; 5KDQ B; 1LFL A; 1NEJ A; 3UHR A; 1HGA B; 2SPO A; 1H1X A; 4HSX A; 3BJ1 A; 4ZVA A; 1N9I A; 1Y46 B; 4AVE A; 2DN3 B; 1BJE A; 1NQP B; 5EYS A; 2H35 B; 1J3Z B; 1G0A A; 1IT3 A; 1MBS A; 1NXF A; 2HZ1 A; 2QSS B; 1G08 B; 1LFV A; 3BA2 A; 2D5X B; 3MBA A; 2XYK A; 3ED9 A; 4WJG 1; 1MTJ A; 1Y22 B; 2D2N D; 1QPW B; 1YIE B; 3GQR B; 3MJP A; 1Y4P B; 1NS9 B; 1TU9 A; 1GLI A; 3ZJM A; 5KER A; 1DKE B; 3WCU B; 2D60 B; 1UX9 A; 1YGF A; 3UHW A; 3EU1 B; 1UT0 A; 1CBL A; 5EUI B; 1AJH A; 1LA6 B; 3KMF C; 1MWC A; 1MZ0 A; 4FWY A; 1XXT B; 5AZQ A; 4DC7 A; 1Y2Z B; 1YHR B; 2NRL A; 2M6Z A; 3UHC A; 1SHR A; 3HF4 A; 1R1Y B; 1SDL B; 4C44 A; 2XKG A; 1HV4 B; 2Z6N A; 1YGD A; 3ZJI A; 5CN6 A; 2ZLT A; 1MLM A; 4UIQ A; 2V1K A; 3CIU B; 1YE2 A; 3M3A A; 2HBD B; 2GNW A; 1UC3 A; 5EV5 A; 1Y0T B; 2ZFB A; 1DWT A; 3TLD A; 3NFE A; 3MOU A; 3D1K B; 3HEN A; 1HBA A; 4YU4 B; 4OF9 A; 1MKO A; 3D4X B; 3QJD B; 3SDN A; 3MVC A; 2ZS0 C; 2LH3 A; 2RAO B; 1ASH A; 4XDI A; 4G51 B; 3G4R A; 3E55 A; 3AQ5 A; 3IC2 B; 2LH1 A; 1YDZ A; 1A00 A; 2HHE B; 2WTH A; 2FRJ X; 4M4A A; 2GKN A; 3DHT B; 1FHJ B; 4ODC B; 2DN2 B; 4O4Z A; 4F6D A; 1MYJ A; 1A9W A; 2D2M C; 2V1E A; 1MYM A; 2HBS A; 3SZK A; 3S66 A; 1Y0A B; 1MGN A; 3IC0 A; 2MGL A; 1URY A; 3GOU A; 4F6F A; 3WCT D; 1RVW B; 1V4X B; 1YEQ B; 4ROM A; 1LH7 A; 1MWD A; 1BZR A; 1Y5J B; 3H58 A; 4X0L B; 1A0U A; 1SDK A; 2VLX A; 2EVK A; 1RQA A; 3GQG B; 4U8U D; 3WFU A; 1IRC A; 2O5T X; 3P5Q A; 1MYH A; 3LHB A; 1CIK A; 4MBN A; 1HDB B; 3OGB A; 1KD2 B; 3ARJ A; 1FDH A; 3M3B A; 1JY7 B; 2W6W A; 4AVD A; 1YOI A; 5HU6 B; 1B0B A; 1CH7 A; 2GRZ A; 5HLU A; 2QFK A; 1Y85 B; 1Y7C B; 3IA3 B; 2LH6 A; 2Z85 A; 2D5Z A; 1RQ4 B; 3PI1 A; 2DHB A; 3QZX A; 2MYD A; 1LFT B; 3MJU A; 2AV0 A; 1J40 A; 4PQC A; 1CG5 B; 2ZLW B; 1EBT A; 1AZI A; 1DO7 A; 1O1K A; 2SPM A; 1XZ5 B; 1MDN A; 1MLF A; 3NL7 A; 1YH9 A; 1GBV B; 1KR7 A; 2ZS0 A; 1T1N B; 2OLP A; 2MHB B; 4F4O B; 1IT2 A; 2BNL A; 3G53 A; 3OO5 B; 1WLA A; 1ITH A; 4N7O A; 1YE0 B; 1QSH B; 1YHE A; 1DXV B; 1NPF A; 1C7B A; 1X9F B; 1XZU B; 2D2M A; 3VHB A; 1YEN B; 2HBE B; 1HBS B; 1MLQ A; 1XYE B; 1BZ0 B; 1A01 A; 3FH9 B; 1GZX B; 1HBH B; 4M4B A; 1Y7D B; 1MLJ A; 3LQD B; 1VXE A; 1S0H A; 2HBF A; 2ZS1 C; 1WMU A; 1IBE B; 111M A; 2VYY A; 1BIJ B; 3GYS B; 3BJ3 B; 1XZV B; 1VRE A; 5HLX A; 1Y8I A; 3ORD A; 1M9P B; 1VXG A; 2ZLX A; 1LUE A; 2Z8A A; 1BZZ B; 1G9V B; 1F5P A; 2HHD B; 4IRO A; 1DXU A; 4N7P A; 3QM6 A; 2W6Y A; 1Y09 A; 1Y31 A; 4HBI A; 2FRI X; 3ZJH A; 2DN3 A; 1NQP A; 3A5B A; 3EOK B; 2H35 A; 3RJ6 A; 1J3Z A; 2NRM A; 2AA1 B; 1G08 A; 3GQP B; 2D5X A; 1YFF A; 3G4V A; 1J7S A; 2EKT A; 1V5H A; 1ECO A; 4MPM A; 1Y22 A; 1YCB A; 1YIE A; 4F6G A; 1Y0C A; 5EE4 C; 1NS9 A; 2MB5 A; 4BJA A; 3UHU A; 3NMM B; 2KSC A; 2MGJ A; 2O5Q X; 1DKE A; 1FN3 B; 3WCU A; 2D60 A; 1IRD A; 102M A; 1Y83 A; 2B7H B; 1A6N A; 1YEU A; 4MQK A; 3EU1 A; 5EUI A; 1LA6 A; 3QQR A; 3HEO A; 1XXT A; 2Z6S A; 1SI4 B; 5CN7 A; 1BVD A; 3WCV D; 2WTG A; 1XCH A; 1MLN A; 1IOP A; 1YHR A; 3AT5 A; 4MXL A; 5CNE A; 1JZM A; 1DWS A; 3VRF A; 2O5O X; 1R1Y A; 1Y4B B; 1SDL A; 5JDO C; 1Y4G B; 1GDL A; 1O1N B; 1G09 B; 1VRF A; 1J41 A; 1OUT B; 3S1I A; 2ZLU A; 1UX8 A; 2ZSO A; 6HBW A; 4LPI A; 4TWU A; 3CIU A; 3MYN A; 1NGK A; 2HBD A; 1CP5 A; 2VEB A; 4NK2 A; 1PMB A; 1HBB A; 1A4F B; 3SDH A; 2GTL D; 2OH8 A; 2MGD A; 4HHB B; 1Y8H B; 5JGG B; 4YU4 A; 1GCW A; 3LR7 A; 4F6J A; 3UHN A; 2RAO A; 3UHH A; 1V4W A; 2NX0 A; 2W72 C; 3ECX A; 1UFJ A; 1MWB A; 1YVQ B; 1Y45 B; 1RPS A; 3DHT A; 1YHU B; 1F63 A; 1FDH G; 1FHJ A; 2DN2 A; 7HBI A; 4ZVB A; 4ILZ A; 3D17 B; 1VXC A; 1HLM A; 4NI1 B; 1XZ2 A; 3UHE A; 1Y0A A; 5E6E A; 1B86 B; 3QM8 A; 3D7O B; 1RVW A; 5JOM A; 1C7C A; 2HHB A; 1Y4Q B; 1V4X A; 1THB B; 3PT7 B; 1UIW B; 1CP0 A; 1Y4V B; 3QJB A; 1VXB A; 1MNK A; 1BZ6 A; 1C40 B; 3ZJR A; 1Y5J A; 2HBC B; 1ABY A; 3WR1 B; 1O1L B; 3HYU B; 1S5Y B; 2GKM A; 3LB3 A; 3ZJN A; 4PQ6 A; 3QMA A; 1Y7Z B; 5MBN A; 1CMY B; 3AT6 A; 4HRT B; 1F5O A; 1QI8 B; 2HZ2 A; 4L7Y B; 3HRW B; 1MLL A; 1V75 B; 1YEV B; 2MYB A; 1KD2 A; 106M A; 1Y5K B; 3ONZ A; 3QM9 A; 1JDO A; 2RI4 B; 4NXA A; 5ILR A; 1JY7 A; 1Y4R B; 5HY8 B; 1MCY A; 3AQ7 A; 3G4U A; 5HU6 A; 1C7D A; 5CHQ A; 2OH9 A; 3ZH0 A; 2MBW A; 1DUK A; 3PI8 B; 1Y8W B; 1LFT A; 3PI3 A; 2QSP A; 2PGH A; 1CG5 A; 2QMB B; 1W92 A; 2ZLW A; 1YHU D; 4FC3 B; 1LHT A; 1O1O B; 1VWT A; 5HAV A; 2G12 A; 3VRE A; 1XZ7 A; 1CPW A; 1O1P A; 2MHB A; 2W72 A; 3QJC A; 3OO5 A; 1YMB A; 3M39 A; 3DR9 A; 1LJW B; 1QSH A; 3CY5 B; 1DXV A; 3OVU C; 2JHO A; 2ZT0 A; 2W6X A; 5CN8 A; 1J7Y A; 1NS6 A; 2R80 B; 4NZI A; 1XZU A; 3DHR B; 1YEN A; 4KJT A; 1BZ0 A; 1GZX A; 1HBH A; 1MLR A; 3FS4 A; 1MNH A; 1Y7D A; 2MGH A; 3M38 A; 1IWH B; 3WCT B; 1ABS A; 1A6G A; 3LQD A; 1RTX A; 5CN4 A; 1IBE A; 4O1T A; 1BIJ A; 3WCP B; 2WY4 A; 2BLH A; 3GYS A; 1OR4 A; 3BJ3 A; 3NG6 B; 1XZV A; 3UI0 A; 108M A; 2ZT4 A; 3WFX A; 2DXM A; 2HZ3 A; 1G9V A; 2BKM A; 2BW9 M; 3A2G A; 2H8D A; 4MQC B; 2OIF A; 4MQH B; 1JP8 A; 2ZSQ A; 3MKB A; 1BBB B; 2IN4 A; 1SPG A; 112M A; 1UVY A; 4U8U B; 3UHT A; 1O1M B; 5E83 B; 3WHM B; 1IDR A; 3EOK A; 1HHO A; 3R0G A; 1A6M A; 2EF2 A; 1FSL A; 3WCW B; 3GKV A; 2ZSP A; 3GQP A; 1HAB B; 1YZI B; 1ECN A; 2D2N C; 1S5X B; 3K9Z A; 1Y7G B; 1LH3 A; 3QJE A; 3LB2 A; 2ZLV B; 2YRS A; 1AJG A; 2V1G A; 1CLS A; 5EET A; 3O7N A; 4ESA A; 3PI9 B; 5F0B A; 1Y5F B; 2W31 A; 1VXA A; 2B7H A; 1M6C A; 1HCO B; 3UBC A; 3BOM B; 2CMM A; 1BZ1 B; 5EQM A; 1SI4 A; 1HBR A; 2SPN A; 5CN9 A; 2XKI A; 1V4U A; 1JP9 A; 1HGC A; 1Y4B A; 3KUO A; 3UHX A; 3AG0 A; 1G09 A; 1MLH A; 2QU0 B; 4TWV A; 1G0B B; 3G4Y A; 1OUT A; 1A3N B; 3PI4 A; 3E5I A; 4HRR B; 3PEL A; 5C6Y A; 1JZK A; 1URV A; 2FAL A; 1GVH A; 2ZSX A; 1RQ3 B; 3ODQ B; 1DXT B; 3HHB B; 5B85 A; 2VLZ A; 1Y0W A; 4HHB A; 4F68 A; 1Y8H A; 1Y0D A; 2R1H A; 1MTK A; 1EW6 A; 1OFJ A; 4ROL B; 1Q1F A; 2FRK X; 5HLQ A; 1OUU B; 3W4U B; 1YVQ A; 1XQ5 A; 1Y45 A; 1O1J A; 1XY0 B; 1MBC A; 2ZFO B; 3WCW D; 4MQG A; 3BJ2 B; 1I3D A; 2MGE A; 1FAW B; 1Y4F B; 2ZSZ A; 3D17 A; 4NI0 A; 1DXD A; 1GBU B; 2R50 A; 1QSI B; 2ZSN A; 1CH2 A; 3A0G B; 4NI1 A; 2R4Y A; 1LHS A; 1HJT A; 3WCU C; 1S61 A; 1MNJ A; 2W6V B; 1LFQ B; 1B86 A; 3ZHW A; 1GCV A; 1K1K B; 2ZT2 A; 2MYC A; 4DWT A; 1J52 A; 4KMV A; 1UIW A; 2D2N A; 1XZ4 A; 3GLN A; 2XKH A; 3UHK A; 1Y4V A; 1MOD A; 2NSR A; 3MN0 A; 2FRF A; 1J3Y B; 3UHZ A; 1C40 A; 4MQI B; 2HBC A; 2ZS1 D; 3WR1 A; 1O1L A; 1O1I B; 2NSS A; 3QM7 A; 2LH2 A; 3HYU A; 2MYE A; 3WCV B; 4PNJ A; 1Y7Z A; 3BJ1 B; 2G0V A; 1MOC A; 2V1J A; 3HRW A; 1V07 A; 4N7N B; 2SPL A; 1ABW A; 1V75 A; 1YEV A; 3UHQ A; 1TES A; 1G0A B; 1Y5K A; 2QRW A; 5MBA A; 1LFY B; 2G0X A; 2BWH A; 1LTW A; 1RTE A; 5HY8 A; 4HSW A; 3ASE A; 5CN5 A; 3OJ1 A; 3ZJO A; 3GKT A; 2GTL B; 3MJP B; 1Y8W A; 109M A; 1HGB A; 1NZ3 A; 1NIH A; 5KDQ A; 2QMB A; 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4SDH A; 3LR9 A; 4TYX A; 2O58 X; 3D1A B; 3UH3 A; 2QU0 A; 3PT8 B; 1A3N A; 1N9F A; 4F6B A; 4HRR A; 2ZT1 A; 1QXE B; 5D1V A; 1OR6 A; 3H57 A; 4H2L B; 1QXD B; 1YEQ A; 3K8B B; 3UHS A; 1RQ3 A; 3ODQ A; 3HHB A; 2MYA A; 3G4Q A; 1RSE A; 1D8U A; 1MYT A; 4X0L A; 1JEB B; 1A9W E; 2VYW A; 1J7W B; 3GQG A; 1O1K B; 3VRG B; 2VHB A; 1OUU A; 3W4U A; 3NL7 B; 1A0Z B; 1YH9 B; 3AQ8 A; 1VXH A; 1XY0 A; 4VHB A; 2ZS0 B; 1HDB A; 1Y4F A; 4KMW A; 1HSY A; 5D5R A; 1N9H A; 1YHE B; 1GBU A; 3A5A A; 2HBG A; 1X46 A; 3A0G A; 4B4Y A; 1C7B B; 2OHA A; 3UGY A; 2D2M B; 1ECA A; 1Y85 A; 1MBO A; 2W6V A; 1OFK A; 1Y7C A; 1LH5 A; 1K1K A; 1A01 B; 1RQ4 A; 2QFN A; 4M4B B; 1WMU B; 1XZ5 A; 3QQQ A; 3TM3 A; 1J3F A; 2R4Z A; 101M A; 1X3K A; 4IT8 A; 1GBV A; 1JW8 A; 1T1N A; 1O1I A; 2ZLX B; 4F4O A; 1K0Y B; 3PIA B; 1YE0 A; 4IRO B; 4N7P B; 1DXU B; 3GDJ B; 1Y09 B; 3WCV A; 1Y31 B; 1X9F A; 4N7N A; 2HBE A; 3BCQ B; 1HBS A; 2IG3 A; 1XYE A; 4B3W A; 4G1B A; 4N8T B; 3FH9 A; 1LFY A; 1YFF B; 5EU2 A; 4KN3 A; 1YVT B; 1MLG A; 1J7S B; 3AQ9 A; 3UHI A; 1CBM A; 1MLU A; 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