1SENA

Endoplasmic reticulum protein rp19 o95881
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
134
structure length
134
Chain Sequence
LGKGFGDHIHWRTLEDGKKEAAASGLPLMVIIHKSWCGACKALKPKFAESTEISELSHNFVMVNLEDEEEPKDEDFSPDGGYIPRILFLDPSGKVHPEIINENGNPSYKYFYVSAEQVVQGMKEAQERLTGDAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Structural genomics, unknown function
source organism Homo sapiens
publication title Endoplasmic reticulum protein Rp19
rcsb
molecule keywords Thioredoxin-like protein p19
total genus 43
structure length 134
sequence length 134
ec nomenclature ec 1.8.4.2: Protein-disulfide reductase (glutathione).
pdb deposition date 2004-02-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13899 Thioredoxin_7 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1senA00
3WGEA 3D4TA 4BA7A 4GCIA 2R37A 2K9FA 4KSMA 2RM5A 1AQWA 1M0UA 1EEJA 2JZRA 3HJPA 1GSEA 5L71A 4NHWA 3UMAA 4MF7A 1BQ7A 1FVKA 4HU7A 4WF5A 1W4VA 2XPDA 5IMFA 10GSA 4ZBAA 1E2YA 1F9MA 5FT3A 5H5SA 3FR6A 2C0GA 1GTUA 3KCMA 1WOUA 2MMAA 1YKAA 1R26A 3L78A 3CYNA 7GSSA 1MDJA 4OCEA 2C80A 1OC9B 1SYXA 5IPHA 3F6FA 2HNLA 5DCGA 5F05A 4MJBA 1XW5A 2CVDA 2LRNA 3TKSE 1URMA 2CQ9A 1X5CA 3TJFA 1MDIA 5HR1A 2X64A 1WPIA 1LU4A 3VFIA 4BVXA 3DMLA 2WDUA 2GZYA 2DJJA 2C3TA 2HSYA 2O85A 5HR0A 6GSYA 3C1SA 3SWLA 1ABAA 1T4ZA 3KP8A 3C71A 2R3XA 2B5EA 5HFIA 2KHPA 4TOPA 1GSQA 3DWVA 1QQ2A 3F0IA 3BJ5A 2OE1A 1FVJA 1XOAA 3GRXA 4ECIA 2Z9SA 1KTEA 1ACVA 1SD8A 1IYHA 4Q5QA 2DJKA 1A8LA 1GTIA 4E8HA 4HOJA 4IQ1A 3TJBA 3CSHA 3FRCA 4IJ3A 1K0CA 3GKNA 5J9BA 1X5DA 4GLTA 2JZTA 4HI7A 2J9HA 3A2VA 3TRPA 2AUVA 4LMVA 1X9MB 2HE3A 2C0FA 5HFGA 3UVHA 1M9BA 2L4QA 5J5NA 1O7UA 1X9WB 4XS4B 3UL3A 2FWGA 4DSRA 4CHSA 3LYKA 4OO4A 2DMLA 3GKXA 1WMJA 1SD9A 2QC7A 1GLQA 1DE1A 4XRAA 1THOA 4IVFA 3IBHA 1GNEA 2PGTA 1K0NA 3HHVA 1HNBA 3UIWA 2VL9A 1M99A 1MD4A 3QOUA 3LXZA 4XS1A 5LNKe 2BTOT 1X0RA 3I69A 1AQVA 4IW9A 3KD0A 3CTFA 1PGTA 2HRNA 2NBSA 3TKRA 4XCSA 1VF1A 4YQMA 2HZFA 5KN3A 1XWBA 4GSTA 5ECKB 3CRUA 3GA4A 1TP9A 2MBTA 3UARA 2DLXA 2K8SA 2YCDA 2VD0A 2IMDA 2RUFA 1JHBA 1QFNA 5ECIB 5DDLA 4L0UA 3EVIA 4TVEA 2YN1A 1K0OA 1PRXA 2LTKA 3C7MA 3L4NA 2JSYA 4IJIA 4TR1A 3MNGA 1W89A 2YWMA 2O87A 4O7HA 4OFMA 4KUNA 1YJ6A 1IYIA 2R4VA 2I3YA 1XWAA 2KLXA 2V1MA 2QGVA 2H01A 4OFNA 4MPFA 5AGYA 4TXOB 4G10A 3C1RA 4MZWA 3LGCA 5G5EA 1PL2A 2L59A 2V6OA 5F07A 2HLSA 3VURA 1KBNA 1ZGNA 1XFLA 1XWGA 4N0VA 3ZFLA 4IELA 4NXIA 3TKSA 2X99A 3H8QA 5EY6A 3FZ9A 5H5QA 3GN3A 1AQXA 4KNDA 3ERFA 4ISDA 1OC9A 4OCFA 3BCIA 2CAIA 2PWJA 1QGVA 3APSA 3GTUB 4MH2A 3GX0A 3F8UA 3O6TA 1F3BA 1AIUA 2GSQA 4IGJA 4ZXGA 4YQVA 4ECJA 3QFBC 1PKZA 1EP7A 1K0BA 2XPEA 3UOMA 1EOGA 1T1VA 2LJKA 1TRUA 4E8EA 4EUYA 2AJQB 1R5PA 5CNWA 2EC4A 2R5GA 3M0FA 1SJZA 3NZNA 4HQSA 4RQRA 2GT5A 3TUEA 4FH8A 2OE0A 1RQMA 1RW1A 4TXVA 2K18A 1SU9A 4ML6A 4GSSA 5D9XA 2ES7A 5C00A 2CX4A 3GX8A 1SL0B 1ILOA 3MAKA 2OE3A 1OAZA 4KDYA 2YZHA 1GLPA 2WCIA 4XS4A 1TRSA 5CP1A 3EWLA 1FOVA 1ON4A 2JADA 4EE0A 1LJRA 1K3LA 1SL2B 1KNGA 5IMCA 2X8CA 2GZZA 3TOTA 3KM6A 2E7PA 2LSTA 4L0WA 4PUFC 4TRXA 3E0UA 3HJMA 2CT6A 4HUAA 5ELGA 4RI7A 3UBLA 2B1KA 1JZWA 1MTCA 3ERGA 3D0ZA 5D9VA 3M9KA 4PNFA 4ZIJA 4WF4A 3CSJA 4MDCA 4KB3A 5F06A 1AAZA 4BVYA 4OO5A 3FW2A 3W8JA 1EOHA 2H0GA 1ZCPA 1NHYA 4OFTA 4EF0A 3FZAA 1K0AA 4PX1A 2X8HA 2FCHA 3D5JA 4F0CA 6GSUA 2C0DA 1DE2A 4KGIA 3GMFA 4KA0A 4Z7XA 1N2AA 4MCUA 1TU7A 4TR4A 3GKKA 3FYGA 4MF5A 1YKCA 3VPQA 2A4VA 2FA8A 3IA1A 3FHKA 4YH2A 2LQOA 4EXJA 4V2NA 3FZ4A 1GULA 3ED3A 1HYUA 3GH9A 4PNGA 1V57A 5ABRA 4TXOA 4IKHA 3HKRA 1TI3A 1A0RP 4J57E 2FNOA 5DAKB 3ZRDA 5H5RA 2B7KA 1A24A 3QR6A 1U87A 3A5WA 2YV7A 4QL9A 2WB9A 4KH7A 1WJKA 2EIOA 2VL3A 4GRFA 3CXGA 4ZB6A 5J3RA 2JL4A 4OD7A 4GF0A 3TJGA 2LUSA 3U6VA 4LA1A 4KDUA 4JR6A 5JWQB 2YANA 1KEBA 2OKAA 3UVTA 2MBSA 2ZUPA 1WE0A 1V98A 3E9JB 1PN9A 4XIHA 3GHAA 3GTUA 4POLA 5KEJA 2H1AA 4HJ2A 2IMFA 4POKA 3ZMLA 1YQ1A 3QD9A 2NPBA 3EMXA 4ZL8A 3PH9A 3GFKA 5KN2A 4WR5A 2YJHA 3ZITA 2WGRA 2HRFA 1ZL9A 2C4JA 2VM1A 1WRYA 3TRQA 2REMA 1H4OA 3WYWA 2H71A 8GSSA 1XW9A 1CQGA 1XWKA 2GT6A 1SJIA 5G31A 1BX9A 2F8AA 1TK8B 3HVVA 3RHCA 3LYPA 2TIRA 1B48A 5JCGA 5FWGA 4TR0A 4J56E 3IPZA 4PXOA 1GTAA 3NIVA 1PA3A 4FIWA 3M1GA 4I2TA 2LJAA 4GXZA 2H1BA 5CREA 1J9BA 1M2AA 1A23A 3M9JA 2VCVA 5J41A 4RUVA 4IBPA 5IMDA 5G5FA 2YV9A 1O6JA 4HS1A 2DJ3A 1DSBA 2CAQA 1GH2A 2CVBA 1OYJA 1EGRA 1WIKA 2H0HA 2V41A 3HZ8A 2K6VA 1PKWA 2PMTA 5DBQA 2PBJA 3QAVA 3CBUA 2AB6A 1QMVA 1Z6MA 3GNJA 4IP1A 4JE1A 2AYTA 2YP6A 1GSFA 5DALB 2C0EA 4ACSA 4GSNA 5D93A 5G30A 2QSIA 5F0GA 2F9SA 2YNXA 2P5RA 1JLVA 2FWEA 1ERWA 1ZZYA 2GQMA 1G6YA 2L5LA 4H86A 5ECHB 4L5OA 3GL3A 3FKFA 4RI6A 1XW6A 3CRTA 3R2QA 3PINA 4TW5A 3DXBA 2ALBA 4HJMA 1GRXA 1FB6A 2IFQB 5ENUA 3EMPA 4ECBA 4Q5RA 2MZCA 2C3NA 1GSDA 1YF1A 2L5OA 2MMNA 1BYEA 4G2EA 1MEKA 4QL7A 5CRDA 3UBKA 3WGXA 1U3IA 1PD21 2L6DA 2EIRA 4JRRA 3HA9A 2B6MA 2J23A 5B8BA 2CA8A 1XWCA 1ST9A 3F6DA 2G0FA 4KCAA 1QK8A 2CVKA 2TRCP 2H6ZA 4I2UA 3UEMA 5ECSA 4MZBA 1PQNA 5DAKA 2L6CA 1Z5YE 2C8UA 2DJ1A 3FEUA 2O7KA 4MP4A 3ZYWA 3J7Yk 5CRWA 4AJ6A 4XS6A 2G2QA 3IAM2 4K0GA 3IHQA 4NHZA 1PSQA 4POMA 4EL1A 3D6IA 3EU4A 2XBIA 4AJ7A 4GTUA 4EDYA 1A2JA 4GWRA 1GNWA 5JCUA 3M3MA 3RAZA 1O8WA 2B5YA 4KX4A 2R2JA 2H75A 2CV4A 3HVXA 1U3AA 3ZZXA 4KW6A 4N10A 22GSA 5LCZA 3QFAC 3TGZA 2KP1A 5CRHA 1O85A 1UA5A 5DQYA 3ZTLA 4K7OA 1BJXA 1USBA 4ID0A 1OE8A 2H66A 5G1LA 3IV4A 2PUKC 2LNSA 3A3TA 1BG5A 3EC3A 2QKEA 5D73A 2EIQA 2IL3A 1G0TA 3IDVA 4WR4A 2YWIA 5HFKA 3MWHA 5EPFA 5HR3A 1SKWB 3BBYA 1LBKA 3P8WA 3W8SA 3IC4A 3H1NA 5CO3A 4CW9A 4PQIA 2O8VB 5G1KA 4MH3A 3N5OA 5ECMB 3Q74A 4XTSA 4Q5NA 4IHUA 3MDKA 1XVQA 2PVQA 3VI7A 5AN1A 4ZBBA 2RUEA 4YQUA 3DYRA 1EWXA 5DJMA 1G7OA 1K3YA 4MPGA 3HVSA 5INYA 3F3QA 3GIXA 1GSSA 2VCQA 5IOWA 1VF4A 2PVOC 4I6XA 1EV9A 4XRDA 2LS5A 3EYTA 4DSSB 2OA7A 3TJJA 2LJRA 3F4SA 4O5RA 1OC3A 1HNAA 5ECPB 3GKMA 2VCTA 4ECCA 1TK0B 3BOAA 1EP8A 5D96A 2YPMA 1M9AA 2E2MA 3IK9A 3TCOA 2DC5A 3ZFBA 2DIZA 3P90A 5DALA 1EGOA 3I9V2 5JCWA 4NPBA 2DJ2A 2AHEA 2I81A 4KE3A 1GP1A 2B7JA 3GSTA 1Y6EA 3EURA 5COHA 2DMMA 1JFUA 3V1WA 4F2IA 2ZNMA 1GUMA 3FR9A 1B9XC 4EC0A 4F9ZA 4LLRA 2GDRA 3JCML 4AF2A 1DUGA 1C72A 2H74A 4F03A 3DVWA 2V2GA 4K9ZA 1FAAA 2IFQA 2GS3A 2H73A 2R6KA 3G9BA 3D21A 2O89A 1FW1A 3TKSC 4IP6A 3TJKA 1NSWA 1Z6NA 3QAWA 4ML1A 1Q98A 4FYBA 13GSA 2H6YA 3HXSA 4K1FA 2XHFA 4X1UA 2H1GA 4MF6A 4WBRD 1GUHA 2LV3A 3G7YA 2VLUA 3VK9A 2XC2A 3BCKA 4GQCA 4MA9A 1SYRA 2V32A 5ELAA 2IWTA 1HNCA 1F3AA 4N30A 3L9SA 4FYUA 1XXUA 1J0FA 2H8LA 4D73A 2GVPA 3RPNA 1JZRA 1A0FA 3Q19A 5KN1A 2RM6A 1BAYA 3ZL5A 3IXRA 3MSZA 4MZCA 3DEXA 2GLRA 5GAPD 4BL7A 3EINA 2IMKA 4ZB8A 1RK4A 5DQSA 1WP0A 4HQZA 2ON7A 3DRNA 5D9WA 1UN2A 5CRGA 3EU3A 1Z7RA 4QQ7A 4DSQA 1Z7PA 1ZYQB 4G9HA 1FHEA 2F8FA 5CYYA 1OKTA 1VRSD 2GTUA 9GSSA 5ECRB 3DD3A 6GSTA 1HQOA 1OVNA 3FY7A 1EEMA 4WETA 1B8XA 5FHIA 3KMOA 1TW9A 2IJYA 5D9TA 4TKYA 4BWQA 3O3TA 1YDKA 3D4MA 5LD0A 1TDIA 1VF3A 3DGQA 4I8BA 4OWYA 4TR3A 2HXKA 2M72A 20GSA 1MD3A 3ISOA 5AISA 2VLVA 5DJLA 4NMUA 2FGXA 2IIYA 1Q4JA 2FD3A 4DEJA 2IMIA 1YZXA 5IMZA 3P7XA 2HI7A 3ERWA 3G7JA 1B4PA 2TRXA 2AV4A 2YWNA 2VL2C 1V40A 1M7TA 1ZMAA 5ID2A 3F3RA 3IRAA 1PL1A 3QAGA 1GL8A 2OBKA 1SJ6A 5F8BA 3F9UA 2HT9A 3F63A 2LQQA 3GV1A 5AIXA 1ZYEA 2HFDA 4DSSA 2A2SA 3TB2A 3IE3A 2FWFA 4MJEA 4F82A 4FO5A 2CX3A 5D8IA 5C04A 6GSSA 1O8XA 4IS0A 4BWSA 4LMWA 1TXXA 2GQKA 4MJAA 1SK1A 5AIVA 1A8YA 1T8EB 6GSXA 4MMMA 1NHOA 3KEBA 1A2MA 4O92A 4V2MA 3L0HA 5A4UA 3VLNA 3ZVJA 4F0BA 1FO5A 1GWCA 3KTBA 4JZQA 3ME8A 4HEA2 1U6TA 3GYKA 4BPYA 4K7IA 3LORA 4K8MA 1B4QA 1M2BA 3H93A 3HJOA 4KCEA 1YF0A 4ZB9A 2NDOA 4X43A 3US3A 1TU8A 3IAS2 2CZ2A 3LWAA 2LEGA 3KIJA 2FWHA 1X5EA 4YAVA 3LXTA 4NAXA 1N8JA 2H0IA 3P2AA 3LJRA 1XVWA 3APOA 1K0MA 4OMVA 3C73A 4X0XA 5B6MA 1ERTA 3VWWA 2OACA 2X8GA 1XZOA 3O76A 1TKDB 3OR5A 5IOXA 2JSZA 1A2LA 4JEDA 1JZOA 3QCPA 12GSA 3RBTA 2CZ3A 4XHMA 2FHEA 2GSSA 5ECNB 2JZSA 4WXTA 5A4WA 1EV4A 2WZ9A 16GSA 3LQ7A 2I9HA 1UC7A 3AY8A 2GSTA 2IPAA 2FA4A 2RLIA 4ILFA 3RHBA 2DSAA 2N5FA 2VUPA 5ECLB 3PR8A 1YEPA 1SK2A 4MK3A 3IOSA 3S9FA 1B9YC 1XOBA 2C1YA 1V9WA 2E2GA 5HR2A 4POBA 1JZDA 3HY2A 3UAPA 2F3MA 2VAFA 2YWOA 3TDGA 1UVZA 3WT2A 1T3BA 3VPTA 4D73B 3PGTA 5IQYA 3FZ5A 1R4WA 4JU5A 2P5QA 1TK5B 5GZZB 1FG4A 1TJDA 1Y25A 3I6AA 1NM3A 1V58A 5JWOB 2I4AA 1TRVA 4AGSA 1SENA 3BD2A 4AJ8A 3GUSA 4JBBA 4PURA 1XBSA 1TTZA 3ZIJA 4CDOA 3D22A 2L57A 3EE2A 2MYGA 3CMIA 3CTGA 3KXOA 5E4WA 3GH6A 1F37A 2VCWA 1F6MC 3KH9A 4KSOA 3ME7A 3L9UA 4IN0A 4N11A 1TRWA 1K3OA 4V1Ap 3HCZA 3IR4A 4DVCA 5B8AA 5GSSA 11GSA 3ZMKA 2PN8A 5HQPA 3VI5A 1QUWA 4JR4A 5IO0A 3ZLPA 3LFLA 2GSRA 5B7CA 4WEYA 1GTBA 4RQXA 1TI1A 2JU5A 2WFCA 1V2AA 1YEXA 3L9VA 3TKQA 1YY7A 2MMZA 2KOKA 1NW2A 1X9SB 3A2XA 3NOFA 1PX6A 4ULXA 4KDXA 4MABA 2WJUA 3UJ1A 3N9JA 1VF2A 5ECOB 6GSVA 5ID2B 3TOUA 1ZOFA 2D2ZA 4HZ4A 4PUAA 3TKPA 2F51A 2LNTA 4IQAA 3VWVA 2GGTA 3HD5A 2YJ7A 3HZ4A 1AC1A 3A2WA 3VWXA 2P0GA 2HZEB 2DJ0A 2XBQA 5IM9A 1K0DA 4I5QA 4Q5FA 1G7EA 5G2ZA 3KZQA 5IIZA 3RDWA 2LRCA 4ZL7A 1J08A 2WULA 2VO4A 3IK7A 1O81A 1PX7A 5E59A 3WD6A 1I5GA 4TN8A 4MJCA 4NV5A 4L8EA 1VGLA 3APQA 1ML6A 2MMOA 4K7NA 2PPTA 2VOCA 2HSHA 2L4CA 5DVBA 1SL1B 3KTLA 2WS2A 1CQHA 4O32A 3ZVJD 2ZCTA 1SKRB 4PQ1A 3F4RA 3K8NA 1MDKA 6GSWA 4PQHA 3SBCA 2BMXA 2LKUA 1I9DA 2FLSA 4MLYA 3GURA 3ZREA 1OC8A 3RPPA 5A5KA 5KN0A 4LL4B 3KP9A 2H6XA 1TOFA 1GSYA 2C3QA 3LEFA 2P31A 3HDCA 14GSA 2V6KA 17GSA 1XPVA 2VD1A 2ON5A 1AXDA 4L5LA 4HDEA 3G7IA 2PERA 2VCXA 2VIMA 2NVLA 2YZUA 3QMXA 2FY6A 5A4VA 1AW9A 4V2LA 4ZBDA 5J4UA 1SK0A 3H4KA 1JLWA 4NV2A 2KUCA 4V1Ag 4YAPA 2OBIA 4N0ZA 4EKZA 5DCHA 2GQLA 4I97A 1H75A 2NTOA 3QPMA 1GSUA 5EVOA 1Z3EA 2VLTA 4HZ2A 1G6WA 2AAWA 3DVXA 5IPGA 1ERVA 2VL2A 5IO2A 3E3EA 1Z9HA 2DBCA 2KP2A 19GSA 5IMAA 3J7Yb 2GZPA 3CSIA 2H72A 4P3YB 1M2DA 3LG6A 3FK8A 4WBJA 2IN3A 1S3DA 2HYXA 4ZL9A 3WT1A 3KMNA 1BEDA 2N5BA 1T4YA 3DKSA 1EZKA 3LSZA 1R5AA 4EVMA 1F2EA 3TRXA 2B1LA 5IMVA 3U5RE 4GQFA 1OKDA 3H79A 2H70A 4ZILA 2H76A 3VWUA 3F4TA 2B3SA 4KAEA 3GL5A 2I1UA 4HU9A 5CAXA 1S3CA 1GUKA 2B5XA 2OADA 1S3AA 4PGTA 1R7HA 1T7PB 1PMTA 4FYCA 3QDNA 4WKWA 3ZIVA 2M80A 18GSA 3I43A 1OE7A 2H30A 4G19A 2BJXA 3KGKA 4J2FA 3HYPA 3Q18A 5GSTA 5GAND 5B6NA 1AUCA 4K6XA 4NWYA 2OJLA 2RIIA 1THXA 1T00A 4EDZA 3WGDA 2LRTA 2E0QA 5ECQB 2M46A 1E6BA 2A2RA 3KH7A 1SKSB 1QXHA 1WWJA 2IMEA 2VCZA 2YOIA 3Q6OA 2JACA 2PU9C 2H1DA 5EL8A 3M8NA 2K8VA 2HZEA 2FUG2 2VM2A 4TR1B 4K0NA 5J9CA 2WRTA 1FB0A 1XCCA 1O73A 1XIYA 3GSSA 1HD2A 3W6GA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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