1SENA

Endoplasmic reticulum protein rp19 o95881
Total Genus 43
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
43
sequence length
134
structure length
134
Chain Sequence
LGKGFGDHIHWRTLEDGKKEAAASGLPLMVIIHKSWCGACKALKPKFAESTEISELSHNFVMVNLEDEEEPKDEDFSPDGGYIPRILFLDPSGKVHPEIINENGNPSYKYFYVSAEQVVQGMKEAQERLTGDAF
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule keywords Thioredoxin-like protein p19
publication title Endoplasmic reticulum protein Rp19
rcsb
source organism Homo sapiens
molecule tags Structural genomics, unknown function
total genus 43
structure length 134
sequence length 134
ec nomenclature ec 1.8.4.2: Protein-disulfide reductase (glutathione).
pdb deposition date 2004-02-17

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF13899 Thioredoxin_7 Thioredoxin-like
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1senA00
1XFLA 2XPDA 4XS6A 5IOWA 4PQ1A 3TOTA 1QK8A 3HVXA 5HFIA 5FHIA 1CQHA 4L5LA 2JZRA 1Q98A 2WZ9A 4AJ8A 5IMCA 4K0GA 3KIJA 4WF5A 4BVXA 4DVCA 4RQRA 5DALA 5KN1A 2VLVA 3UOMA 3CRTA 2F8FA 3O76A 3D21A 5ECOB 5ID2B 5D93A 2VD1A 1U3IA 4KDYA 2K8SA 1W4VA 3N5OA 1QQ2A 4V2LA 3W8SA 3G7IA 3HXSA 3KMOA 2EIOA 3CYNA 1EV4A 1Y25A 4K7IA 5J9CA 2PN8A 1V58A 4PQHA 4EF0A 4N11A 2FY6A 2AV4A 2LRNA 1AW9A 4O5RA 1MD4A 2RIIA 2H1DA 5C00A 3LQ7A 3LJRA 1B9XC 1OC9B 2C8UA 5D9XA 3Q19A 2OKAA 2PPTA 2CQ9A 1A2LA 20GSA 4HJ2A 2FHEA 3GRXA 1EWXA 3L4NA 4X43A 3UEMA 1DE2A 4I97A 3TJGA 3DGQA 4Q5NA 4OFNA 3LYPA 1AQVA 3GH6A 2I1UA 7GSSA 2ZCTA 3V1WA 1R7HA 3TRQA 2WB9A 5DCHA 4MZWA 1GL8A 3WGDA 2H19A 5IMDA 4DSSA 2QSIA 2H0IA 5J3RA 1B9YC 6GSXA 1JZRA 3TJFA 3UL3A 4F0BA 1X5CA 3CTGA 4WETA 4MH2A 4XHMA 4ZIJA 4GXZA 1TDIA 4TXVA 3FY7A 3WT2A 2L4QA 1WJKA 1XWBA 3GUSA 1RQMA 1XOAA 1VF1A 2AUVA 4ZILA 2GQKA 2VM1A 2RUEA 1O73A 1XWCA 2H6XA 4LLRA 3ZMKA 2KHPA 2PUKC 1TRVA 4MZCA 3D5JA 5H5RA 3M3MA 3WD6A 1ABAA 1ERTA 1R5AA 2C0DA 3D4MA 3PGTA 5CP1A 3VPQA 3F0IA 1GLQA 4HU7A 2XC2A 1TK0B 1FVJA 4ZL8A 4LA1A 1YQ1A 1QMVA 4OO5A 4FIWA 2TIRA 4BA7A 1YY7A 2PWJA 3ERGA 1A0FA 3L9SA 4RQXA 1J9BA 1QGVA 4TR1A 5IO2A 2OE1A 2LRCA 3QAGA 3DEXA 3R2QA 2H66A 3VWXA 4F9ZA 1FAAA 4F03A 1GSFA 3TRPA 2CT6A 4TR3A 3CSIA 3IXRA 1O8XA 4NAXA 2ZUPA 4ECJA 2KOKA 4TVEA 5DBQA 1AUCA 3KH7A 3TDGA 3U5RE 3ZVJA 3FEUA 4KUNA 4TW5A 3ME8A 5JWRB 1XWAA 2J23A 5GSTA 3OR5A 4NHZA 2DLXA 2YJ7A 5G2ZA 2OBKA 2YWNA 2B6MA 2EIRA 5B6NA 2HZEA 2H75A 2IIYA 1SJ6A 4HUAA 4JBBA 4NV5A 3HVVA 3VLNA 1YDKA 4MF6A 1SL2B 4QQ7A 4X0XA 2A4VA 1XW6A 5HR1A 3TUEA 3DMLA 1SKSB 2V6KA 2F9SA 2YV7A 1FOVA 1FO5A 1ON4A 3EU4A 3KP8A 1TJDA 2FLSA 2LEGA 3HZ4A 4HEA2 1XW5A 4RI6A 2H73A 3F3QA 5J4UA 1BAYA 2IFQA 1OKTA 2QC7A 2GSRA 2C0EA 2P0GA 3IHQA 2CV4A 12GSA 5DQSA 2OBIA 1PQNA 2IN3A 4EKZA 1IYHA 4KSMA 2C4JA 2O7KA 1ZYEA 3M9KA 4IBPA 3IK7A 2C3QA 2VCQA 5IPGA 1YKCA 4IKHA 3RDWA 4HQSA 1VF3A 1TKDB 3G7YA 3F63A 5EVOA 5AIXA 1DSBA 1M0UA 1CQGA 2PVOC 2BJXA 2CVKA 1X9SB 3WT1A 4ZB6A 3IAM2 4TN8A 1LU4A 4JRRA 3E9JB 2GGTA 3GH9A 5G5FA 1JHBA 1SK2A 3GKNA 2YWIA 18GSA 5DCGA 5ABRA 2FWGA 1SU9A 2E0QA 4OCFA 2CVDA 1Z6NA 4K1FA 4POKA 2L59A 4JE1A 3ERFA 4GLTA 2OE0A 4KA0A 2H8LA 4L5OA 2WJUA 1HYUA 1TRSA 1VF4A 3LXZA 4OFMA 4MF7A 3WYWA 2YCDA 5KN2A 3CTFA 2RUFA 1WOUA 3G9BA 4LMWA 2YWOA 3UARA 2LQQA 6GSYA 3GKKA 4FYCA 2YOIA 3NOFA 1SJIA 2CZ3A 5IQYA 3EE2A 2YN1A 4KB3A 4K7OA 3F4SA 1PX6A 1EV9A 2AHEA 2I4AA 2DSAA 3KZQA 2AYTA 2GT5A 2RM6A 3H4KA 3BBYA 3IE3A 5JCWA 2JZSA 2LNSA 2ES7A 2LNTA 3TCOA 3TKPA 1BJXA 2VOCA 4MZBA 2GQLA 3FZ5A 3KXOA 5JWQB 1V40A 3LG6A 1DE1A 1R26A 2YJHA 1VRSD 3ZIJA 4ECBA 3HDCA 4EL1A 1XWGA 3TKSA 2HXKA 3D0ZA 3FR6A 3TKSE 1G6YA 3QFAC 3MDKA 3NIVA 2YZHA 5INYA 1T7PB 1OC9A 4ISDA 1K0MA 3F3RA 1FG4A 1O7UA 1AAZA 1ZCPA 3P8WA 4IW9A 2IWTA 4KSOA 2MBTA 4K0NA 4WEYA 2MYGA 1XVWA 4CDOA 3A2WA 2XBQA 3A2XA 4E8EA 2LRTA 4ACSA 3ISOA 4WXTA 2H71A 1JZDA 2WFCA 3ED3A 1JLVA 3CMIA 1SL0B 1FW1A 4O32A 1W89A 2B3SA 2H76A 6GSTA 1TK8B 5D96A 1TU7A 1Z5YE 2GSQA 5G5EA 3CXGA 5HR2A 1GP1A 3N9JA 4MJBA 1K0OA 1SK1A 2R6KA 4K2DA 2DMMA 1SKRB 1F6MC 3ZMLA 2JL4A 4KDXA 5IMZA 2A2RA 3SBCA 1EEJA 3APQA 2X99A 4IHUA 1J0FA 2R4VA 1U3AA 3W8JA 1ST9A 2WCIA 4PGTA 2X8GA 1NM3A 1VF2A 2C3TA 3O3TA 1K0CA 3MNGA 1O85A 5D73A 4KE3A 5F07A 1LBKA 4WBJA 1X9WB 11GSA 1ERWA 1FVKA 1J08A 2GZYA 2CVBA 3F9UA 2L57A 4GCIA 14GSA 3QR6A 3ZTLA 1T3BA 2F8AA 4Z7XA 3TJKA 3EC3A 2X64A 3GX8A 1BG5A 1K0DA 3I43A 4ZBAA 5KN0A 2LQOA 3RHBA 3QPMA 2M72A 2OA7A 2CX3A 2F3MA 4Q5FA 1MTCA 4EXJA 4GRFA 3UVTA 2N5FA 4ECIA 19GSA 4YAVA 2H6ZA 2L5LA 1HNAA 3E0UA 3W6GA 2AAWA 1N2AA 2B1LA 3I6AA 2QGVA 1GUMA 3KH9A 8GSSA 3VWWA 3GKXA 4MF5A 3DVXA 1PKWA 4POLA 1V57A 5CRWA 4POMA 4JZQA 1G0TA 3F4RA 3GL5A 3J7Yk 3HVSA 2IMFA 9GSSA 2TRXA 3WGXA 5ECHB 3IV4A 3I69A 4PURA 5G30A 1K3OA 4H86A 3LXTA 5GSSA 1WRYA 4KGIA 1UC7A 1X5DA 1OC3A 3ZREA 4GQCA 4V2NA 3LORA 1M9BA 5CAXA 1K3LA 4IJ3A 1THXA 1XIYA 4K8MA 1A2JA 3TJBA 5IIZA 4GF0A 5ECMB 4PNFA 4QL7A 4EVMA 1HNBA 2R5GA 3C8EA 3LEFA 3F6DA 3ZVJD 3GKMA 1EGOA 5ECPB 3P2AA 2LS5A 6GSUA 1XPVA 2IMKA 3MAKA 3UBKA 2H72A 3VI5A 3RHCA 3GYKA 4WBRD 5KEJA 2JSYA 1K0BA 2DIZA 3L0HA 2DBCA 3KM6A 2IJYA 3TB2A 1Z7PA 4IJIA 1TK5B 5A4UA 1PL1A 3TKQA 2VL2A 3GSTA 4J56E 5CRHA 3GURA 1ZYQB 2IMEA 1SKWB 4PUFC 5L71A 1E6BA 2NBSA 1TOFA 3HA9A 4G19A 4XRAA 4GSNA 2GSTA 1PKZA 1XW9A 2VCXA 2NVLA 3TKSC 2FGXA 3DRNA 4GQFA 2B1KA 2VD0A 3M0FA 4MDCA 2JACA 1G7OA 1WWJA 5IO0A 1JFUA 2P5QA 2GVPA 5HQPA 1TI1A 1YF0A 1M2AA 2GSSA 3Q18A 3M9JA 2JZTA 2WULA 2I9HA 2K9FA 2HE3A 1F3BA 1O81A 1LJRA 2HFDA 3EYTA 2WDUA 4AJ7A 2G0FA 2LUSA 5IM9A 2DJJA 3ZIVA 1U6TA 4F0CA 1URMA 4HS1A 4FYBA 2C0GA 2VCVA 4MK3A 1BQ7A 1I5GA 1R5PA 2O89A 3EWLA 4JEDA 1JLWA 4BVYA 1PSQA 1ZL9A 4MMMA 3VI7A 2P5RA 2DJKA 4OMVA 3H1NA 3IC4A 2GS3A 1ERUA 3ZL5A 3LSZA 5GAND 13GSA 2F51A 4PQIA 1GTAA 4JR6A 2C3NA 1OYJA 1XVQA 4BL7A 2H74A 4GWRA 4MJEA 1WPIA 4I2TA 2YNXA 1Z6MA 4JR4A 3ZZXA 3DXBA 4OWYA 5LD0A 1EEMA 3D6IA 1KNGA 2H1BA 5E59A 3BD2A 1Y6EA 2KUCA 1M9AA 1WE0A 2HRNA 1R4WA 4YQUA 2LKUA 4IS0A 1PN9A 3HJPA 3FRCA 3KD0A 16GSA 5A5KA 1MD3A 1TRWA 4N30A 2HSYA 4RI7A 4O7HA 1O6JA 2IMDA 3DIEA 6GSWA 1ACVA 2VCWA 4D73A 2VLUA 4MPFA 5CO3A 5D8IA 2V1MA 1GSDA 4MH3A 1KBNA 2GZZA 3QAWA 3A2VA 1GSQA 4LMVA 2O87A 2H0GA 4TXOA 3FYGA 2WGRA 1TU8A 2J9HA 2DIYA 5DJMA 3TOUA 4ECCA 1A23A 1QFNA 4ZB9A 3GV1A 1JZOA 4GSSA 1HQOA 1ZMAA 1F3AA 2CZ2A 2JSZA 5A4WA 3K8NA 2AB6A 1SL1B 4EC0A 2JADA 2B7JA 2C0FA 2EC4A 4MJAA 4XCSA 6GSSA 2IL3A 1FB0A 3IPZA 2WRTA 1N8JA 2HT9A 2WS2A 4I6XA 5HFGA 2OJLA 3CSJA 2B5XA 1KEBA 1YZXA 5ECSA 4EUYA 2L4CA 2MMAA 3UBLA 3VURA 4L0UA 3KJYA 3C1RA 3O6TA 4DEJA 5CNWA 2FA8A 1DUGA 5ID2A 2B7KA 3GL3A 5IOXA 3APOA 2AJQB 2DJ3A 3H93A 3FZ4A 1AIUA 3NZNA 1Z7RA 4Q5RA 1ILOA 3F8UA 2FA4A 3J7Yb 1SD9A 2FWEA 5G1LA 2PGTA 3KTBA 4XS4B 3ME7A 3HY2A 4ZL7A 2O85A 3RAZA 2CX4A 2VL2C 1FB6A 4N10A 1EP7A 3VK9A 2V41A 1S3CA 4I2UA 2XBIA 3FKFA 3CRUA 5D9TA 3APSA 4P3YB 5IMVA 1BEDA 1IYIA 1TP9A 3C71A 1Q4JA 2LSTA 4YQMA 1S3AA 1GULA 1NHOA 1V9WA 4JU5A 4O92A 5G31A 4KDUA 3L78A 5J9BA 2R2JA 2OADA 2DC5A 2QKEA 2E2MA 3E3EA 5EL8A 3U6VA 3HKRA 5GZZB 5DVBA 3FR9A 5ELGA 1GRXA 5FWGA 1Z9HA 4YQVA 4NWYA 1A24A 1SYXA 5JCGA 1G6WA 4WKWA 1H75A 5CRGA 2R37A 2MZCA 3P7XA 4N0VA 3CBUA 5F06A 3FZAA 3GA4A 4WR5A 3TKRA 5CREA 3GHAA 2H6YA 3ZYWA 2LJRA 5ELAA 3BCKA 5G1KA 4MA9A 4ILFA 4I5QA 2DJ1A 4K9ZA 1GSUA 4NPBA 4IN0A 1A0RP 1SJZA 5E4WA 4ML1A 5DAKB 3AY8A 1A8LA 3P90A 2KLXA 3EMXA 3HD5A 2H1GA 1T1VA 3FK8A 4HDEA 4IELA 4G9HA 5JCUA 4Q5QA 1GH2A 2HZFA 3US3A 1B8XA 4TR4A 1DBYA 3GX0A 2CAIA 3IRAA 1GSSA 4HZ2A 2O8VB 4EDYA 3A5WA 5F05A 1FHEA 2MMOA 1V98A 1SD8A 4IQ1A 4G2EA 3L9UA 4FYUA 2H30A 4K7NA 4KCEA 3IDVA 2YPMA 4IQAA 1F37A 2LV3A 1OKDA 3HJOA 2HNLA 4KAEA 5HR3A 5ENUA 2GTUA 1EOGA 4OO4A 1SENA 1F2EA 3MSZA 3M8NA 4ZXGA 3UVHA 22GSA 2REMA 2VAFA 1ERVA 1PA3A 3TRXA 5ECQB 4CHSA 2KP2A 1YF1A 4POBA 3DWVA 2H70A 1T4YA 17GSA 3QDNA 2R3XA 1GLPA 3RPNA 4ZL9A 1GTIA 3DKSA 1B48A 4IVFA 1OC8A 2V6OA 2DJ0A 1M7TA 2A2SA 4KNDA 1TI3A 3KTLA 4MLYA 4XRDA 2PMTA 2PVQA 3M1GA 2VIMA 4V2MA 2B5YA 1THOA 1T00A 2MMNA 2HLSA 1ZOFA 1EGRA 2E2GA 4OD7A 5F8BA 5J5NA 1EOHA 1M99A 4PX1A 1H4OA 3BJ5A 4MJCA 1U88A 4TR0A 4F82A 1XCCA 4PXOA 3QD9A 5COHA 5H5QA 4HZ4A 3VWVA 1TW9A 3EVIA 4TKYA 4HI7A 5CRDA 2L6CA 1OAZA 4KH7A 3TJJA 1AQXA 3IAS2 2BTOT 1XXUA 3FR3A 2ALBA 4ZB8A 1T8EB 2N5AA 4I8BA 3VFIA 1YEPA 3HZ8A 4J2FA 1GTUA 2V32A 1KTEA 3UAPA 1MDIA 1MEKA 4AJ6A 3C7MA 3GN3A 1QUWA 4XTSA 5ECKB 4BPYA 1TXXA 5HFKA 3GTUB 2X8HA 4MP4A 2FCHA 4EE0A 1GWCA 4OFTA 4RUVA 2OACA 1BYEA 3F4TA 2I81A 3JCML 3IBHA 4EDZA 1C72A 3GMFA 1OVNA 2EIQA 3EURA 4PUAA 2GDRA 2VM2A 3KCMA 2VO4A 5B8BA 2L6DA 1MDKA 3QCPA 4NHWA 4AGSA 2Z9SA 1GSYA 4HU9A 1U87A 5EPFA 5IMFA 5GAPD 1YEXA 1B4PA 4L0WA 3DD3A 5DALB 1RK4A 4BWSA 3IR4A 2NPBA 3D22A 3ZFLA 1NW2A 4DSRA 4ID0A 4MCUA 5A4VA 3DYRA 1ZGNA 1TTZA 3TGZA 4HJMA 2FWFA 1MDJA 1GUHA 2JU5A 1JZWA 1WIKA 3UJ1A 4NV2A 5EY6A 4YAPA 1AC1A 1WMJA 3CSHA 4XS4A 3ZFBA 5LNKe 2RM5A 3H79A 1OE7A 2HSHA 1XZOA 3LGCA 1QXHA 5ECRB 2NTOA 4IGJA 1VGLA 2FWHA 2YANA 3HJMA 2LJKA 2NDOA 5FT3A 4HQZA 3KMNA 3BCIA 5HR0A 2VCTA 4L8EA 2B5EA 2XHFA 1SK0A 1HD2A 1PD21 1PL2A 2C1YA 5H5SA 3FW2A 1PRXA 1A2MA 1EP8A 2CA8A 3D4TA 5DJLA 1PMTA 4HOJA 2N5BA 5AGYA 2ON7A 5C04A 4LL4B 4GSTA 4MPGA 4DSSB 4ML6A 2LTKA 1BX9A 3C1SA 6GSVA 2YZUA 1XWKA 4V1Ap 4MABA 4GTUA 1YKAA 1I9DA 3MWHA 3G7JA 2YWMA 5D9WA 2H01A 2VCZA 2LJAA 1NSWA 4OCEA 2HRFA 1EZKA 4E8HA 2MBSA 3QAVA 5AIVA 5DAKA 2P31A 3HYPA 10GSA 3LWAA 4TOPA 3QMXA 4IP1A 2HYXA 3SWLA 2VUPA 2E7PA 3EINA 1K3YA 1UA5A 3ZLPA 1SYRA 3L9VA 3UIWA 2PU9C 4ZBDA 1OE8A 1A8YA 1GNEA 1HNCA 5IPHA 4BWQA 5LCZA 3FHKA 3GIXA 1YJ6A 4J57E 1X5EA 4TR1B 2D2ZA 2K6VA 5AISA 1GUKA 2YV9A 1GSEA 3ERWA 4TRXA 3IK9A 2I3YA 1S3DA 2HI7A 4PNGA 3HCZA 1X0RA 4XS1A 4V1Ag 3KGKA 2FD3A 1F9MA 3PR8A 3H8QA 1RW1A 3QOUA 2IPAA 3DVWA 2K18A 3FZ9A 2GLRA 4KCAA 2GQMA 1XBSA 1XOBA 5ECLB 5B7CA 2C80A 3Q6OA 3PINA 2VL9A 4AF2A 2K8VA 1UN2A 1ZZYA 3LYKA 2ZNMA 5JWOB 4NMUA 4ULXA 4DSQA 1G7EA 2MMZA 1K0NA 1Z3EA 2CAQA 4X1UA 5DDLA 3RBTA 1T4ZA 2L5OA 3IA1A 2H0HA 1USBA 5D9VA 1ML6A 2HZEB 2PERA 1AXDA 3HHVA 1K0AA 1PX7A 1E2YA 4N0ZA 3UMAA 4F2IA 3GFKA 1WP0A 2V2GA 5B8AA 3F6FA 3ZRDA 2X8CA 3KEBA 4CW9A 2VLTA 4YH2A 2TRCP 5AN1A 3KP9A 1UVZA 2PBJA 4QL9A 3VWUA 2RLIA 1TRUA 1B4QA 4XIHA 3S9FA 5IMAA 4K6XA 2H1AA 4FO5A 2IFQB 5ECNB 2FNOA 3IOSA 2VL3A 3VPTA 5KN3A 5DQYA 2GZPA 1V2AA 3A3TA 4LL1B 1M2DA 3EU3A 4G10A 3C73A 1O8WA 2FUG2 3I9V2 2KP1A 3GNJA 2YP6A 2BMXA 3BOAA 1PGTA 2XPEA 4D73B 4WF4A 4EO3A 1NHYA 3ZITA 3Q74A 2OE3A 1M2BA 4ZBBA 1AQWA 5CYYA 4KX4A 3LFLA 2M80A 4KW6A 2IMIA 2DMLA 3QFBC 2DJ2A 1GNWA 2M46A 4TXOB 5ECIB 4WR4A 2ON5A 3GTUA 2G2QA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#similar chains, but unknotted
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#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite