1SJ6A

Nmr structure and regulated expression in apl cell of human sh3bgrl3
Total Genus 20
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
20
sequence length
95
structure length
95
Chain Sequence
MSGLRVYSTSVTGSREIKSQQSEVTRILDGKRIQYQLVDISQDNALRDEMRALAGNPKATPPQIVNGDQYCGDYELFVEAVEQNTLQEFLKLALE
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title NMR structure and regulated expression in APL cell of human SH3BGRL3.
pubmed doi rcsb
molecule tags Protein binding
source organism Homo sapiens
molecule keywords SH3 domain-binding glutamic acid-rich-like protein 3
total genus 20
structure length 95
sequence length 95
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-03-03

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04908 SH3BGR SH3-binding, glutamic acid-rich protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1sj6A00
3ZFBA 1MDJA 3C1SA 2NDOA 3GMFA 1QFNA 4KX4A 1S3DA 2KOKA 3QCPA 4XRDA 1FOVA 3EMPA 5KN1A 3TJBA 4F82A 3RHCA 2AV4A 3UBLA 3DXBA 3H8QA 1ERVA 2JU5A 2H1DA 2B1LA 4X1UA 3BJ5A 4KNDA 4G9HA 1YKAA 3TKSE 5DCGA 3RBTA 5G5FA 4HU7A 3LYPA 4MZBA 4MF5A 5LNKe 3LWAA 2I81A 5DJMA 1ML6A 1GTBA 2DMLA 2YWIA 4PNGA 1K0DA 5CAXA 2ALBA 1UC7A 4OWYA 1EP8A 2IN3A 1O7UA 2GS3A 5INYA 1K3YA 4PUFC 4O32A 3RAZA 3GKXA 3LGCA 1XWBA 5AISA 2HSYA 3ZLPA 1V9WA 4TXOA 3FZAA 4LMWA 3WT2A 4DSSB 3EURA 5IO2A 3EMXA 4GF0A 3APOA 3PH9A 1F2EA 1THXA 1XPVA 3VWWA 1T4YA 1PD21 3LQ7A 1YJ6A 3V1WA 3F4SA 2YANA 3KCMA 5CO3A 5D9XA 5A4VA 4JU5A 2CVBA 5F8BA 2C1YA 1R26A 3D5JA 2IMIA 3CSIA 4RUVA 2B5EA 4TW5A 4XS6A 1GSUA 4FIWA 3EWLA 3ZIVA 5JWRB 1BX9A 4NMUA 2FWGA 2IJYA 1A23A 2IMEA 3BCIA 3GIXA 1TI1A 3FK8A 2CX3A 5AN1A 3GSTA 3QFBC 1U87A 1PL2A 4HQZA 20GSA 4ULXA 2CZ3A 3IAS2 4AJ6A 3VFIA 1EEMA 4ZL9A 1ABAA 1K0MA 4K7OA 3ZTLA 1MDKA 5J4UA 1VF1A 3D4TA 1PGTA 4HUAA 5FHIA 3GNJA 3QDNA 3TJFA 1K0AA 3CYNA 4TR4A 1OC8A 4NAXA 5ECHB 4D73A 1EZKA 9GSSA 4F9ZA 3DWVA 4I5QA 1ON4A 4CHSA 5EVOA 5F0GA 1XXUA 3FZ5A 1GTAA 2C4JA 2GVPA 3G9BA 1GLPA 4XRAA 3UBKA 1I9DA 1X9WB 1EOHA 5DVBA 2A4VA 4DSRA 1XFLA 3TJGA 3TKSA 1XW6A 1TI3A 2NTOA 3WYWA 4N0ZA 4ML1A 1Z6NA 5ECRB 2H01A 4K7NA 1PX6A 4AF2A 5HR1A 3KIJA 1AXDA 2VCXA 2DIZA 3FRCA 2L6DA 1MD3A 4V2NA 1F6MC 1PMTA 4ZB6A 2CZ2A 1PKZA 2RIIA 3WT1A 4EF0A 2P31A 4CDOA 2L5OA 2F8FA 3IV4A 1Q4JA 3TKQA 4KE3A 3LXTA 2FD3A 2KHPA 4FYUA 4O5RA 2H19A 1MEKA 1JZOA 4EDYA 2PWJA 3IK7A 5CYYA 1T7PB 2CAIA 1SK1A 2WDUA 4TOPA 4BL7A 1GWCA 4FH8A 4MH2A 4F03A 4QQ7A 4NXIA 1NW2A 12GSA 3TB2A 2WGRA 1U3IA 5IMFA 4TVEA 4L8EA 3QR6A 1PQNA 2HXKA 3IHQA 2PVOC 4MJCA 3ZMKA 4KAEA 2F9SA 5IMDA 4FYBA 1ZGNA 4K1FA 3TDGA 1GNEA 1BQ7A 2VD0A 5ELAA 1IYIA 1ERUA 2FWEA 2VAFA 1TKDB 4ID0A 1JZWA 1EEJA 3F6FA 2REMA 2OBKA 5CNWA 3M1GA 1WE0A 2Z9SA 18GSA 2M80A 4IVFA 4BWQA 1OAZA 4NWYA 1PKWA 4IHUA 4O92A 1YEXA 4ZBBA 2HLSA 3UL3A 3TKRA 3GH9A 2HE3A 5IMCA 3UARA 1A2JA 5GAPD 1SENA 2OJLA 4LL4B 4YAPA 4KSMA 1WWJA 5G2ZA 1TRUA 4JRRA 2OE1A 1Z3EA 1ZOFA 16GSA 2TRCP 4EDZA 5EPFA 2BTOT 1K0CA 3G7JA 5IMAA 4ISDA 4G19A 4OFTA 4MF7A 2FWFA 4JR6A 1Y25A 2DJKA 4WR4A 1EGOA 4POBA 2MZCA 1OC9B 2PERA 1EOGA 1V58A 2DJJA 1G0TA 2MYGA 5A4UA 3TGZA 2HFDA 2FLSA 2LJKA 2V6KA 2WFCA 4JE1A 3QAGA 4NV2A 4HDEA 4PNFA 2ON7A 2LQQA 1FG4A 3CTFA 3VPTA 2GT5A 4QL7A 1MTCA 1VF4A 3F4TA 5GSSA 2R6KA 3FZ9A 1XCCA 2DJ0A 4IELA 11GSA 1O85A 5ECOB 1GNWA 2EIQA 4WKWA 2CT6A 4OO4A 4GSTA 3DYRA 1NSWA 1X9MB 3M9JA 5J9CA 2IPAA 2GTUA 5HR2A 2JZTA 2AAWA 1TTZA 3OR5A 5AIXA 1B9YC 4GRFA 3HXSA 2IFQB 1EGRA 2H1BA 5F07A 1ZYEA 2K9FA 1TU8A 2ZCTA 4IS0A 4KW6A 1YF1A 2HZEB 3C73A 2H66A 3TCOA 5B6MA 5B7CA 2KP1A 3FY7A 2VCVA 1GSDA 2ES7A 1A2LA 4YAVA 1DSBA 3IPZA 2R37A 3JCML 1TRWA 3U5RE 5B8AA 1FW1A 4I2TA 2L5LA 1XWCA 2V41A 1T8EB 3ZYWA 2ZUPA 1UVZA 2GZPA 3HKRA 4MP4A 2VCTA 1THOA 3KH9A 5FT3A 1ZMAA 2VIMA 2IIYA 3GKMA 5D93A 1YY7A 2G2QA 3A2VA 1OC3A 5IMZA 2H6YA 2LQOA 3TRPA 2FA4A 2VCQA 2GZYA 1T3BA 4V1Ap 3D22A 1AAZA 1I5GA 2H75A 1XVWA 2DJ1A 3GSSA 5G31A 2V1MA 4IQAA 3IE3A 1WPIA 5H5QA 4TXVA 5ID2B 1SKRB 3EINA 4L5LA 3ZZXA 2VCZA 3EE2A 2O8VB 2GQLA 1GSYA 1GRXA 2DJ3A 2IWTA 3SWLA 5ELGA 2H70A 2MMOA 3VK9A 5KEJA 3HJOA 3TKSC 2LJAA 3F6DA 3ZRDA 2FCHA 3CMIA 3HVSA 1M99A 1XW9A 3IR4A 1SK0A 3ERFA 3ERWA 2JADA 5DALA 1WP0A 2K18A 1SJZA 4IJ3A 1SK2A 2F8AA 4G10A 3APSA 3I69A 3BD2A 4MCUA 2LEGA 2MBTA 2RM5A 2YJ7A 3D6IA 1S3AA 3TOUA 3QD9A 2RM6A 4HEA2 5DAKB 2FHEA 2GLRA 5HFGA 3KM6A 2JZRA 1LJRA 2K8SA 3HJMA 2LV3A 3KTLA 1HQOA 3VPQA 3VURA 3IA1A 4ECBA 2VLTA 1UA5A 1F37A 2HNLA 4K9ZA 5DQSA 1SD8A 3GURA 1K0OA 3M0FA 2V32A 2L57A 2V2GA 1PRXA 3VWUA 3DVWA 3KMOA 2L6CA 1ZCPA 2PU9C 4DSQA 1A2MA 3TRXA 4I2UA 3ED3A 4IKHA 1X0RA 1S3CA 3HHVA 1SKWB 3GV1A 3LXZA 4J57E 4EUYA 4IW9A 2K6VA 1B8XA 4IQ1A 4J2FA 5IQYA 2BJXA 3O76A 3D0ZA 3LJRA 2X64A 5DJLA 5J41A 1DE1A 1NHYA 5JCUA 2YV7A 5B8BA 4I8BA 4PX1A 4GQFA 2FUG2 5J9BA 2R4VA 1H4OA 1H75A 1URMA 1W4VA 1A0RP 3WGEA 3GTUA 3KH7A 2PN8A 4Z7XA 4FO5A 2CVKA 4ZXGA 3VI5A 2XC2A 3GRXA 3N9JA 4V2MA 2AUVA 6GSUA 1AQXA 5D73A 1GP1A 1RW1A 3FR9A 2VOCA 3U6VA 3I43A 2YWMA 5EY6A 3FHKA 3TOTA 1XOAA 5D9WA 1M7TA 4BA7A 2OKAA 3CTGA 4JEDA 1AW9A 1DE2A 1ERTA 5CRGA 3UVTA 3SBCA 3VI7A 3QAWA 1J08A 4MF6A 3HYPA 1O81A 4BVYA 4QL9A 1TU7A 1F3AA 4WBRD 1OKTA 3KJYA 5HQPA 4MLYA 5KN3A 1SL0B 2C3TA 4WBJA 1MDIA 3GH6A 4ZBDA 1M2BA 4YQMA 2NBSA 2RUEA 2EIOA 2I3YA 5F06A 2LRNA 2LSTA 2I9HA 2IFQA 4X43A 2LNTA 3WGDA 4ECJA 3Q19A 1T1VA 2DBCA 1ACVA 2CX4A 4WEYA 4PGTA 4HI7A 3PGTA 4GTUA 1BJXA 3ME8A 1SYXA 4XS4A 1JZRA 4ZL8A 4KB3A 4HJMA 3UEMA 3FW2A 2DSAA 3NIVA 4I6XA 2YJHA 2J23A 4TR0A 1A24A 4PQIA 2VD1A 3HVVA 4LA1A 2O7KA 4KCAA 1EV9A 3P8WA 1U6TA 2B7KA 2EC4A 5GSTA 1GSQA 4TR1A 2C0FA 2BMXA 2VUPA 4EVMA 1R5PA 1TK8B 2VCWA 3J7Yb 4RQXA 1MD4A 4HU9A 5G30A 3HZ8A 2X8HA 1FVJA 4E8EA 1FO5A 4AJ8A 1YKCA 1XWAA 1Z7PA 3EVIA 4X0XA 2N5BA 5IIZA 4IN0A 1SYRA 1TK5B 1SL1B 3RHBA 5D96A 2PGTA 2P5RA 3APQA 3CXGA 7GSSA 2WRTA 3GFKA 5IMVA 2C3QA 3O3TA 2PBJA 3LEFA 3TKPA 3BBYA 5CRDA 1FVKA 4V1Ag 2VO4A 4KA0A 5LD0A 3FR3A 3KP8A 4G2EA 2A2SA 1JHBA 3QFAC 2CA8A 3H4KA 1DBYA 6GSYA 3BCKA 4YH2A 1G7EA 2CV4A 4GXZA 2D2ZA 1OVNA 3A3TA 1EP7A 5FWGA 1K0BA 1V57A 2GSQA 2YZHA 5KN2A 4CW9A 3GHAA 1TP9A 1WRYA 1XIYA 1B9XC 4PQ1A 4F0CA 5ECPB 2E2MA 2HI7A 2IMDA 3HD5A 2YWNA 2DC5A 1M2DA 2GQKA 1G6WA 4K0NA 3PR8A 3AY8A 2O87A 2H30A 1Z7RA 3KZQA 1NM3A 1GLQA 2YP6A 2CVDA 4N10A 3H79A 5J3RA 3MNGA 2GSRA 4ACSA 1A8LA 1GL8A 19GSA 3C71A 2ON5A 5HFKA 2L4CA 1R5AA 3GL3A 4MMMA 4NV5A 6GSXA 1GUMA 1QQ2A 5HFIA 5G1LA 3S9FA 4TRXA 4DSSA 5HR3A 5G1KA 1N2AA 4HZ2A 5E4WA 5IPGA 5A5KA 2RUFA 2H1AA 2O89A 1AIUA 3HY2A 3LORA 5D8IA 5HR0A 4PURA 1A0FA 2PUKC 1OE7A 4TN8A 3UOMA 4GSNA 3UAPA 3US3A 1QK8A 2YV9A 3A5WA 1XWKA 4OCEA 3UJ1A 1GH2A 1YQ1A 4ECIA 2LJRA 4BVXA 2C0GA 3WD6A 2VLVA 5DDLA 2VL2A 3M8NA 4GLTA 5JWQB 2LNSA 2JSYA 3ERGA 1BAYA 1OYJA 1ZYQB 1CQHA 2I1UA 3E3EA 3G7IA 4KDUA 3IDVA 4D73B 2GSTA 3GX0A 2HRFA 5IPHA 3I6AA 3L4NA 3MDKA 3UMAA 3O6TA 3GKNA 5ECNB 2L4QA 5COHA 1ZZYA 2H6XA 1XVQA 2XPEA 2YPMA 2QKEA 3F3RA 4N30A 5JCGA 4O7HA 3J7Yk 2QSIA 1HNCA 3R2QA 6GSWA 3F9UA 2X99A 3F8UA 2CQ9A 3W6GA 2XHFA 1SJ6A 10GSA 2NVLA 2TIRA 4MPGA 4DEJA 3LG6A 3P90A 3FEUA 4EE0A 1XW5A 1B4PA 4ZIJA 2O85A 3DRNA 3P7XA 4NHZA 2V6OA 4KDYA 3L9UA 1LBKA 4OFNA 1TOFA 5C04A 2CAQA 2AYTA 2FY6A 2WULA 2GSSA 1FAAA 1JFUA 4PXOA 5IOXA 2YOIA 2TRXA 3ISOA 2H76A 4TR3A 1TDIA 1X5DA 4IP6A 3GKKA 3VWXA 5L71A 4XS1A 1AUCA 2FGXA 4ZB8A 4YQUA 2VL9A 1NHOA 5DCHA 2B1KA 2KP2A 5ABRA 1GUHA 2VL3A 1OE8A 4IBPA 3A2XA 4WR5A 4F0BA 3IK9A 4V2LA 2XBQA 4K7IA 4OO5A 2X8GA 1M0UA 3UIWA 1T00A 2GDRA 3HDCA 3QOUA 4PQHA 2JL4A 5JWOB 1SJIA 4MZCA 2HT9A 3M3MA 2H71A 1O8WA 1F9MA 2P0GA 3F63A 4KCEA 4MH3A 5CP1A 2DIYA 4L0UA 1WIKA 4XIHA 3VLNA 2M72A 2P5QA 4Q5QA 1G6YA 1Z5YE 2J9HA 3RPNA 3TUEA 1AQVA 3DMLA 1USBA 2FNOA 3KD0A 5EL8A 3FKFA 3MSZA 3IC4A 3P2AA 2C80A 4I97A 3DD3A 4LL1B 3GN3A 1HYUA 4HS1A 2E0QA 4WETA 1ZL9A 1TW9A 14GSA 4POKA 4GQCA 1T4ZA 1K3OA 5H5RA 1LU4A 3LYKA 1GSEA 2YWOA 2MBSA 1Q98A 2B3SA 1GULA 3EU4A 1KNGA 2N5FA 5E59A 2F51A 3HZ4A 3L78A 4MJAA 4BWSA 4JR4A 1K3LA 2IMKA 1ERWA 4OMVA 2B5YA 4MDCA 5G5EA 1FHEA 4IGJA 1W89A 5GAND 2IL3A 4J56E 2OE0A 3KEBA 1R7HA 1JLVA 1WOUA 1QGVA 2G0FA 3Q18A 1M2AA 1VGLA 4EC0A 1AQWA 2R3XA 1OC9A 5ECQB 1ST9A 3TJJA 3K8NA 1O6JA 2JSZA 4F2IA 2HYXA 1SU9A 1TXXA 4AGSA 2OE3A 1EV4A 4EL1A 2E2GA 4MABA 2LS5A 2PVQA 2VLUA 2VM2A 3KGKA 1O8XA 2H0GA 2DLXA 3BOAA 2JZSA 3KP9A 1N8JA 1SKSB 4MPFA 4N11A 3UVHA 4L5OA 3C8EA 3ZREA 1V2AA 2C0DA 3KMNA 2ZNMA 2WB9A 1UN2A 3EU3A 1PX7A 2DJ2A 1OKDA 1SD9A 4NHWA 1GSSA 3L9VA 1Y6EA 1RQMA 1C72A 13GSA 4DVCA 4FYCA 4GSSA 1ILOA 3RDWA 3HCZA 3GYKA 3GL5A 2H74A 4ZB9A 1FB0A 1HD2A 2GQMA 2HZEA 2R2JA 3DIEA 5C00A 3M9KA 5B6NA 5CRHA 2B6MA 8GSSA 3ZVJD 3NOFA 2YCDA 4Q5NA 5J5NA 2H72A 4KUNA 3G7YA 4MK3A 2B5XA 4XTSA 2VL2C 2KLXA 1QMVA 2JACA 3ME7A 2LTKA 3IRAA 1U88A 3D4MA 3ZIJA 2H8LA 2H1GA 5KN0A 3C1RA 2GGTA 1HNBA 4IJIA 2HSHA 1J9BA 4KH7A 3EC3A 3EYTA 5CREA 5ECIB 3GA4A 1B4QA 1R4WA 2DMMA 1KBNA 1V40A 2QGVA 1GTUA 3RPPA 3F0IA 3MAKA 4LMVA 1KEBA 1PN9A 2HRNA 3ZFLA 5ID2A 4EXJA 3TRQA 5IM9A 2C0EA 2YNXA 4K8MA 1XZOA 5AGYA 3IBHA 3CSJA 3MWHA 3N5OA 2MMZA 5DALB 2NPBA 4BPYA 5DBQA 4OFMA 2HZFA 4ZBAA 1YDKA 1VF2A 2OACA 1JLWA 4POLA 3GUSA 2M46A 3ZVJA 1GSFA 3QAVA 3CSHA 3PINA 2LKUA 1QUWA 3CRUA 5JCWA 1TRSA 4ML6A 4XCSA 4H86A 2VM1A 3C7MA 2XBIA 2F3MA 1BG5A 6GSTA 1Z9HA 1GUKA 1YEPA 2GZZA 4JBBA 4KSOA 4L0WA 4NPBA 3QMXA 5CRWA 1BEDA 2PPTA 4KGIA 2A2RA 5ENUA 17GSA 2AB6A 4WF5A 2LRCA 4TXOB 1TK0B 5DAKA 4P3YB 3KXOA 2AJQB 1J0FA 3LFLA 1XOBA 4MJBA 1V98A 3F4RA 3ZMLA 4MJEA 3QPMA 4LLRA 5DQYA 2PMTA 3HVXA 5ECLB 3NZNA 4RI6A 6GSSA 4XHMA 2H0HA 4PUAA 3DGQA 2LRTA 3Q6OA 1TJDA 2GT6A 2H0IA 4GWRA 4ZL7A 1F3BA 4WXTA 3TJKA 4MA9A 2I4AA 4RI7A 2IMFA 1X9SB 3E9JB 3Q74A 3LSZA 2B7JA 3GX8A 1XBSA 3GTUB 5D9TA 4Q5FA 1G7OA 1K0NA 3W8SA 3I9V2 1U3AA 3IAM2 4TKYA 4JZQA 2L59A 4OCFA 4N0VA 3DKSA 3CRTA 4WF4A 5IOWA 2AHEA 22GSA 4Q5RA 4EKZA 4K2DA 3IOSA 3KTBA 5GZZB 1EWXA 4HOJA 1E2YA 1PSQA 4GCIA 5AIVA 5ECKB 4RQRA 5H5SA 2EIRA 1WMJA 5LCZA 4EO3A 3H1NA 1BYEA 3F3QA 3E0UA 1XWGA 2YZUA 1JZDA 3IXRA 4YQVA 1O73A 2WS2A 1M9BA 2FA8A 3L9SA 4ZILA 5F05A 4K0GA 2H73A 4HZ4A 3VWVA 5IO0A 1A8YA 2QC7A 5ECSA 1PA3A 3FYGA 2X8CA 2K8VA 2MMAA 2H6ZA 1FB6A 3FZ4A 1TRVA 6GSVA 2WJUA 3W8JA 3DVXA 4OD7A 3DEXA 1GTIA 5ECMB 2MMNA 1VF3A 3CBUA 1IYHA 1KTEA 4XS4B 4AJ7A 1M9AA 2C8UA 1YZXA 2LUSA 2OA7A 1PL1A 3FR6A 3ZL5A 3HA9A 4K6XA 4KDXA 1HNAA 2YN1A 2XPDA 3L0HA 4ILFA 2E7PA 1YF0A 5D9VA 1QXHA 4E8HA 1B48A 3H93A 4MZWA 3WGXA 4POMA 4TR1B 2R5GA 3HJPA 2N5AA 4HQSA 1AC1A 1DUGA 2KUCA 2C3NA 4HJ2A 5A4WA 2OBIA 2OADA 4ECCA 1SL2B 1RK4A 3A2WA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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...loading similar chains, please wait...
#similar chains in the pdb database (?% sequence similarity)
...loading similar chains, please wait...
How to cite