1SLLA

Sialidase l from leech macrobdella decora
Total Genus 184
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
184
sequence length
679
structure length
679
Chain Sequence
IPEGILMEKNNVDIAEGQGYSLDQEAGAKYVKAMTQGTIILSYKSTSENGIQSLFSVGNSTAGNQDRHFHIYITNSGGIGIELRNTDGVFNYTLDRPASVRALYKGERVFNTVALKADAANKQCRLFANGELLATLDKDAFKFISDITGVDNVTLGGTKRQGKIAYPFGGTIGDIKVYSNALSDEELIQATGVTTYGENIFYAGDVTESNYFRIPSLLTLSTGTVISAADARYGGTHDSKSKINIAFAKSTDGGNTWSEPTLPLKFDDYIAKNIDWPRDSVGKNVQIQGSASYIDPVLLEDKLTKRIFLFADLMPAGIGSSNASVGSGFKEVNGKKYLKLRWHKDAGRAYDYTIREKGVIYNDATNQPTEFRVDGEYNLYQHDTNLTCKQYDYNFSGNNLIESKTDVDVNMNIFYKNSVFKAFPTNYLAMRYSDDEGASWSDLDIVSSFKPEVSKFLVVGPGIGKQISTGENAGRLLVPLYSKSSAELGFMYSDDHGDNWTYVEADNLTGGATAEAQIVEMPDGSLKTYLRTGSNCIAEVTSIDGGETWSDRVPLQGISTTSYGTQLSVINYSQPIDGKPAIILSSPNATNGRKNGKIWIGLVNDTGNTGIDKYSVEWKYSYAVDTPQMGYSYSCLAELPDGQVGLLYEKYDSWSRNELHLKDILKFEKYSISELTGQA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
molecule tags Hydrolase
source organism Macrobdella decora
publication title The crystal structure of an intramolecular trans-sialidase with a NeuAc alpha2-->3Gal specificity.
pubmed doi rcsb
molecule keywords SIALIDASE L
total genus 184
structure length 679
sequence length 679
ec nomenclature ec 4.2.2.15: Anhydrosialidase.
pdb deposition date 1997-10-14

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF02973 Sialidase Sialidase, N-terminal domain
A PF13088 BNR_2 BNR repeat-like domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.220.10 Mainly Beta Beta Barrel Intramolecular trans-sialidase; domain 3 Intramolecular Trans-sialidase; Domain 3 1sllA03
2.60.120.200 Mainly Beta Sandwich Jelly Rolls Jelly Rolls 1sllA01
2.120.10.10 Mainly Beta 6 Propeller Neuraminidase Neuraminidase 1sllA02
4Y20A 2A71A 3OYWB 4YM2A 4GZXA 2VSKA 5H9QA 2NMNA 4QN5A 2A6VA 3A4UA 2RKCA 4J9TA 1AVBA 3RSJA 5JMCA 2C4LA 4X49A 1GNZA 4HZWA 4K1YA 4FOQA 1WD3A 3BIWE 4MWRA 5HUMA 2ZGLA 1A8DA 2PHRA 1V6IA 1CPNA 2A6WA 2BATA 3V64A 4K1KA 2A6YA 1W6NA 4YM0A 1TEIA 4YFZA 4GZTA 3RS6A 2HTVA 3USUA 3TI5A 1DILA 4XMIA 1LTEA 2DYCA 1MWEA 1JYCA 3WCRA 1S0JA 4ISQA 1SO7A 2HYKA 3WHTA 1JYIA 2HTUA 1N1VA 1KJLA 1S1AA 2F12A 2DVDA 3OY8A 3UJQA 5GZFA 4XOGA 4XMAA 3T2TA 2UURA 1MS5A 5GLZA 1MR5A 5CAZA 3CNAA 1C1FA 1GICA 1LOBA 1C1LA 2PHXA 3CL0A 5LK5A 4GZQA 1BJIA 3AYEA 4KS2A 4Q27A 3B3QE 1LU1A 3QLQA 4GKXA 3WZ1A 2D7FA 4XE9A 3TIAA 4AWDA 1QOOA 1E8TA 3A71A 2ZA9A 4AVVA 1DIMA 2A70A 2VSMA 5IUQA 4AGGA 4XJ8A 2FMDA 4QN6A 1GNHA 4CPLA 3BEQA 3AK0A 4M01A 1Z4VA 1E8VA 4Q8LA 3AJZA 2QWHA 4MJUA 2ZHNA 1HQLA 3GNEA 4MWXA 1DHKB 3RQ0A 3RG0A 4CPZA 1IS4A 2NYYA 3SH3A 3UL2A 4XILA 2QWEA 2VU9A 5AVAA 1O4ZA 2A5ZA 1UMZA 2ZGTA 1WD4A 1ENQA 4X4AA 2E53A 1NN2A 3AYAA 4W65A 3AP9A 1OQ1A 1GBGA 1DYKA 2ZHMA 2ZGSA 3TI6A 1VLNA 5T55A 4MZAA 3C2UA 5E89A 1GLHA 2A7AA 3IM0A 3R05A 1SLLA 4MWQA 4JCKA 4Y22A 4YM3A 2P3KA 1INWA 1SCRA 1GYKA 3FUQA 4QN3A 4MC7A 4BBWA 2YA8A 2YA7A 2EXIA 5GALA 1V3EA 4Q8KA 1Y7BA 4JC1A 4B7RA 2G4IA 2WNEA 5DG2A 4UW6A 2VK5A 5H9PA 1WW4A 1N1TA 3ZPYA 1LOFA 1BQPA 4FQ4A 2SBAA 2D3SA 3AZXA 1AXZA 4NOTA 1MS9A 4XJAA 3SLIA 2V5YA 3JU4A 1JW6A 1WCSA 4HL0A 2EIGA 1IKQA 2D6MA 4GZPA 1HKDA 4HZZA 2SLIA 4HZXA 4MWWA 2EALA 2V73A 2CNAA 3N3HA 2ZGKA 4Q26A 1NNAA 4GWMA 4YG6A 2XZIA 2YZ4A 3M1HA 2ARXA 3K3AA 4X6KA 2GN7A 2YMZA 4M00A 2GNMA 2DWRA 2NN8A 2AENA 2B8HA 4M4VA 4FPOB 2F10A 1AJKA 1SBEA 1WBFA 1PZ8A 1IVFA 3UK9A 2X9MA 2XB6C 1IS5A 2QWBA 3LCPA 1N47A 3FLPA 2VH9A 2VXRA 1URXA 1SLTA 2F27A 1ZA4A 1SLBA 3M3QA 1F31A 2UWAA 3U4XA 4BMEA 4FJ6A 1V6JA 3ZXKA 2TEPA 3D12A 3W59A 1B9TA 4PCRA 1V0FA 4CPMA 3SANA 1APNA 1N1YA 2OUJA 1LHOA 1LENA 1BKZA 3WOGA 1WCQA 1NCDN 1V6KA 1W8NA 1C57A 4XTMA 3RMYA 1N3QA 2HTQA 1S0CA 2GNBA 1SLCA 1CESA 4UF7A 1AXYA 2HTYA 4GZWA 1Q8QA 5T54A 3A0NA 1Z4WA 3H72A 2C5DA 1S0EA 1RITA 2W20A 2P3JA 1MACA 1H30A 1SBDA 1CONA 2EXKA 4R9DA 2F24A 2AYHA 3DGTA 1IVBA 4B7MA 5CNAA 3NWKA 5GZGA 3WUCA 3W58A 4BPZA 4GB1A 1NMAN 3M3OA 3WDWA 4FVVA 4LBQA 3INBA 4MX0A 4K1IA 1QNYA 4B7QA 4XJWA 2WQZC 2XZKA 1UN1A 3WDUA 2YROA 1V3DA 1Z4YA 3HMYA 3I4IA 1ONAA 4WA5A 1WW6A 1JUIA 2D6OX 4WZFA 3BTAA 1GKBA 5IK8A 3NV4A 4HZVA 4HANA 1B09A 3AZYA 1UKGA 2DTYA 4SLIA 3KM5A 1QDOA 5E88A 1YXWA 1SLAA 1W6MA 2VY0A 4LBJA 5L73A 3AP6A 4LBKA 4RA0A 5IT6A 3ALWA 2WLQA 3JUUA 3O9JA 1GZCA 2WSVA 1FX5A 1SBFA 4NO4A 1PZ9A 1Q8PA 1QNWA 1NCCN 3TAYA 2ZBJA 2CMLA 5JOWA 4D69A 1LULA 1WLCA 3NN9A 3V0BA 3FBYA 4K1ZA 4FOYA 1FNZA 2CTVA 3AXDA 1S0FA 4AGRA 4YW4A 5B2CA 2C4AA 4K1HA 4P9XA 1UZZA 1KITA 2VK6A 5SV8A 4Y1YA 4UW5A 1S0DA 1PZ7A 5DZFA 1VAVA 4C1XA 1Q8SA 1MZ6A 3Q9OA 1LHNA 1NCAN 3TB0A 3AZWA 1GZWA 1W6OA 1A4QA 3K37A 5GLVA 4NCSA 2ZAAA 4WVWA 5JLVA 4XJQA 4QN7A 4Y1XA 1VIWB 5JDBA 5DUVA 1INGA 3MW3A 4NC5A 1ENRA 3AP4A 1QGLA 1F8CA 3AX4A 1AXKA 2A3WA 2WSUA 4AYUA 4GDIA 1NSBA 4F83A 4WVVA 3H73A 4FPFA 3ZSJA 2P34A 4ZKTB 1LCLA 2FHRA 1G7YA 5IK7A 4U2AA 5IK5A 1VALA 5EWSA 3H71A 1HDKA 2ARBA 2CY6A 5JYYA 4FZHA 1ULFA 2WT0A 2ZMNA 2HT7A 2A3YA 5CB7A 2QWAA 1KDKA 2E51A 1IVCA 3RMXA 1B9SA 1CIWA 4H52A 3N7LA 4TYSA 1G9FA 1HQWA 3AZZA 2H0BA 4FPKA 1QU0A 4GA9A 1EURA 5H9RA 5T5JA 2W68A 4Q6KA 3D6EA 2YA5A 2WT2A 4M3CF 2WT1A 3AJYA 3INAA 3OYWA 1LODA 1ENSA 1SFYA 4MYEA 1LEDA 1DQ1A 3CL2A 1F8BA 3SNMA 3GVJA 3QCWA 1W21A 3WHUA 2ZB6A 1GZ9A 1LESA 1Z50A 3ENRA 3IPVB 3PMEA 3D5OA 4Z8BA 1NNCA 3A0KA 5GZDA 2UU8A 1UZYA 4DQAA 4BLJA 3WG3A 4HZYA 1LHVA 1XOEA 1LOEA 4M4UA 4GZOA 2P37A 2AEPA 3MEPA 2QWDA 2E6VA 2F28A 3WUDA 1QF3A 2ZHLA 2ZZJA 3ALXA 1GANA 1RINA 3DUIA 2CWSA 4WA4A 2R1DA 2AGSA 4YG3A 2D6LX 3ZYPA 4XJZA 1D0HA 4WV8A 3TIBA 5GJ6A 2HT5A 2GMMA 1V0ZA 2VVZA 2ZGUA 1W6QB 1NLSA 4MWJA 4GALA 3IKWA 3RRDA 1CJPA 2AH2A 1EUUA 3GVLA 2GALA 1N3PA 4XDQA 4Q1RA 5DZGA 5JOZA 4LBNA 1WLDA 4M3CB 4KS5A 1IS6A 3WG2A 4MWLA 1B9VA 4FP3A 3SILA 3T1LA 5KXEA 1INXA 2VW0A 2DVFA 4FP2A 5HUNA 4FPCA 2WJSA 2HU0A 2QWGA 3NV3A 2XCYA 3FLRA 5HX0A 4MJVA 2W5OA 3K39A 1UPSA 4AGVA 3GVKA 1XOGA 5NN9A 4B7NA 4LBLA 3OBTA 4IQPA 3K38A 4CTEA 4PBOA 3ZXJA 1LJ7A 5FREA 2VWDA 2ZGRA 3CKZA 1IOAA 4JF7A 1DGLA 2QWJA 2HU4A 3V0AB 1SLIA 6NN9A 4I00A 1F5FA 2DUQA 4GDJA 4DS0A 4DGRA 2R1BA 1QDCA 2ZGMA 4H55A 4K3YA 2JE9A 3BODA 1A78A 1UAIA 2D43A 3SALA 4PBPA 5KXBA 3I8TA 3M2MA 4FVKA 5GLUA 1ULDA 5T5LA 3TI3A 4R9BA 2P3IA 4FOVA 4XBLA 1KDMA 1NCBN 3WDTA 3NV2A 2QWCA 1CN1A 1G9BA 3O5SA 1I1EA 2PHTA 1L7FA 2DU0A 1C4RA 2YV8A 5T5PA 2W39A 5E8AA 1Q56A 2HTRA 3LSDA 2EF6A 1YO8A 1YYNA 1DQ5A 2ZKNA 3CYEA 4BOWA 4RL7A 3O0WA 2BZDA 3WVJA 2P2KA 1LOFC 2LTNA 5HCAA 2OUHA 4U36A 4R9CA 4GWNA 1MS1A 1IVDA 4ZXKA 1BZWA 1W0OA 1V6LA 3H6JA 5CA6A 4XJUA 4FPEA 1MS4A 2JKBA 1MVQA 4NN9A 3R4UA 1USRA 4DRRA 4B7JA 4K20A 3OBRA 2A6XA 2VK7A 2ZHKA 2YY1A 4ISRA 2EXJA 1L7HA 5T52A 2ZGNA 4ASMB 1EUTA 2NP0A 3TI8A 1W6NB 3N35A 1ULGA 3OJBA 3SH4A 1NNBA 4GJTA 1LHWA 1NSCA 3USUB 2DUPA 1DQ2A 1QKQA 2ERFA 1DFQA 1OKQA 4K21A 2VW1A 3APBA 4YG0A 3FUOA 3PVNA 3OY8B 4M3MA 1I3HA 4YZ4A 3D11A 1U0AA 4H53A 1UX6A 1FAYA 3O0VA 3MPPG 2UWCA 1GSLA 2JD4A 3NV1A 1FV3A 2R0HA 4Y24A 4R9AA 1V6NA 1LGCA 5GZCA 5EYXA 3WDXA 4YW1A 2ZABA 2GDFA 1CVNA 4TZDA 1MS3A 1Z4XA 3BOPA 1MS0A 2ZGPA 3AP5A 4XXPA 5F9TA 2VUAA 3K36A 2A3XA 4FOWA 2EXHA 1QOTA 1ULCA 1KQRA 3SITA 2F13A 4XJRA 2AUYA 1X50A 1WLWA 1AJOA 5HUKA 1W6PB 1G9CA 5B2DA 1G9AA 1EUSA 5GLWA 1SNTA 2GN3A 2CL2A 1SCSA 3AZVA 1AF9A 1W0PA 2YDPA 4QN4A 5GM0A 3V65A 3H0OA 1MS8A 2JE7A 3WG4A 4YZ2A 1UL9A 4BQ1A 2BF6A 1USXA 2Q5TA 1W8OA 5JVVA 1YI7A 4FPLA 2PHWA 4YW2A 1CPMA 3GALA 2A6ZA 5IK4A 3N36A 5DUUA 3WV6A 2SILA 3VKMA 3WDVA 4XXAA 1Q8OA 1AX2A 4P9YA 4MWVA 1MZ5A 1FATA 4FPHA 4CPNA 5DZEA 5EYYA 4X47A 1LU2A 3ASIA 4Y1UA 4AVTA 1LGBA 3R4SA 4MWUA 2PHUA 4CPYA 4LBMA 2DTWA 2W08A 2CWMA 2QWFA 4XBNA 1WBLA 3MW4A 2QWIA 1NMBN 4YZ3A 4C1WA 1KRIA 1O4YA 1LOCA 2D44A 1VCUA 4XHXA 2ZGOA 5GZEA 1WUVA 2D3RA 4Y22B 4Y26A 1FV2A 1R1ZA 2W38A 2BERA 4M4NA 2OVUA 5BYNA 4XJ9A 1DQ4A 1INVA 2R0FA 1KJRA 3M3CA 1IS3A 1LEMA 2W5NA 4AVSA 2D6NA 3L2YA 3ZSMA 4FPGA 4DPNA 2KM2A 1LECA 3HN1A 2DVAA 1G9DA 2F29A 4YFWA 4OZXA 5HUGA 1J1TA 3ZYRA 5DXDA 3IMNA 2D6KA 1W6PA 3HR9A 3T1EA 3WCSA 3B01A 1NMCA 3ATGA 4PQ9A 2LALA 2SIMA 2C9AA 3ZSLA 1WW5A 2JDZA 4XYXA 3OPZA 3VKOA 1N1SA 4YZ1A 1INHA 5DG1A 3FLTA 3MW2A 1S0GA 1V0EA 4Q1PA 2D6PA 2ZMLA 2XZJA 2E7QA 3B7EA 1CR7A 3O0XA 4YW3A 3AXEA 2ZB5A 2ES3A 3AFKA 3ZXLA 3ILRA 4GKYA 2R49A 1LGNA 2F0ZA 4XIKA 5DUWA 5CBLA 3ZSKA 2GMPA 3LSEA 2AR6A 1AX1A 1IVGA 4ATEA 5GLTA 1EPWA 4P14A 3VUOA 2HTWA 4HIZA 5JOXA 1Z0HA 1ULEA 3O9KA 3N7MA 3B9CA 1YRZA 3SH5A 1AX0A 4M3CE 3M3EA 1YIFA 4WEFA 2B7YA 1N3OA 1Z4ZA 4CRQA 2EAKA 2YDTA 3WDYA 2ZMKA 3WLUA 1S0IA 1LOGA 4JRAA 4ITCA 1JN2P 2GNDA 3ILNA 2JJ6A 3VKNA 5M1ZA 1OFSA 1V3BA 2Z42A 5T5OA 5KXDA 2F11A 4BLIA 1LOAA 2AEQA 1G86A 3T1MA 4LBQB 3ZXEA 2NMOA 1DLLA 4KS4A 4GZSA 1RIRA 2OW4A 3IPVA 5KXCA 2F26A 1F8DA 1LHUA 1S0BA 3AP7A 3SISA 1DBNA 1BXHA 3VKFC 1G8WA 3TICA 3ZXFA 5JOYA 1VCJA 2DVBA 2NZ9A 4CPOA 3PJQA 1W1XA 2AREA 1BJQA 1H9PA 2YA4A 2GMEA 3IN9A 4WEGA 4XZPA 5T50A 3WNXA 1F8EA 1NSDA 2UWBA 3POWA 1WW7A 1W6MB 4LBOA 2HT8A 2RHPA 3POYA 4FPYA 2ENRA 1JBCA 4WA3A 2E7TA 2DV9A 3NSSA 1AZDA 4CZSA 1JXNA 1W6QA 4XTPA 5DUXA 4DRVA 3ZVXA 1A14N 5FRAA 2XG3A 1F9KA 5EXOA 1Q8VA 2W52A 1Z78A 4XBQA 1JHNA 2R16A 3B00A 4K1JA 2WKKA 1INYA 1DQ0A 1GV9A 3A72A 4YM1A 4DFSA 4BM8A 1SACA 4XHBA 3V0BB 5HCFA 4M3CA 4XIOA 3N7KA 2YA6A 4MWYA 4GXLA 4ATFA 4Y1VA 2ZGQA 1BYHA 1DIWA 1CQ9A 4YGBA 4Y20B 2A75A 2CYFA 1JOJA 3TI4A 5HCBA 4UW3A 1V2IA 3B69A 4D8SA 3N7JA 1QOSA 2DU1A 1DZQA 4MZEA 1HLCA 4KBBA 2PELA 4YLZA 2NM1A 3ILFA 4YGEA 3FFZA 1DYPA 4L8QA 4YGDA 1IVEA 4YW5A 2PHFA 4KS1A 1DQ6A 5F5QA 1FNYA 2BQPA 1GZWB 1W6OB 3OGGA 2DUOA 5H9SA 3KQRA 4BMBA 1FYUA 1IKPA 4Y1ZA 1E8UA 3PVOA 1MVEA 2F25A 3V0AA 2I2SA 1A4GA 2QWKA 1D2SA 1QMJA 4UW4A 1H9WA 2YXSA 3WG1A 1L7GA 2DURA 1V6MA 2D3PA 1V6OA 3W09A 3AYCA 4LBQD 3O12A 1A3KA 1V00A 4YZ5A 1INFA 4P9WA 4KS3A 1W20A 2GNTA 4QNPA 1VAMA 4FQZA 4FPJA 1NXD1 3VV1A 2JECA 3AYDA 7NN9A 3JU9A 4Q2FA 2DVGA 2ZACA 2VW2A 4GEZA 3UJOA 1XQNA 3D4KA 3POSA 4PF5A 1ZM1A 3PVEA 1V3CA 4YGCA 3VKLA 4I30A
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1YQ2A 3SCGA 2IZWA 5DPNA 1V9U1 3RFRA 4Y20A 2A71A 1VB2A 3KD4A 3ZDSA 3OYWB 3KT1A 4EWEA 4FTSA 2R071 4YM2A 4GZXA 2VSKA 4Y33A 1SHWB 3R0RA 4RHV2 5H9QA 4CH9A 2NMNA 1DP0A 4IV3B 3ETPA 4PDWC 4QQLA 4QX3A 4QN5A 1RUC2 3H8XA 2B5HA 2A6VA 1YFUA 2HWE3 2VCCA 4ZZ5A 4V1PA 4MXWA 1RUOA 2RS31 1VRH3 3A4UA 4AZZA 4ZXEA 1JS9A 3GZTB 2Q1MA 2RKCA 4J9TA 2Y6KA 4RYDA 2VCBA 4MGTA 1AVBA 5A7WA 4LO8A 3WQ7A 3RSJA 4AI2A 4LA2A 4NIIA 5JMCA 3S0MA 2C4LA 4CEWC 4X49A 1GNZA 4ZONA 4NHLA 4BIFA 4HZWA 1JHJA 1BK1A 3HEIA 3FC0A 4HK8A 4K1YA 1DF0A 3AVSA 4FOQA 4V2VA 4EWDA 2C0ZA 1CAUB 1DZTA 1WD3A 3BIWE 3CJIA 3J4UH 4QDQA 5FMOL 2ZGLA 3KVBA 4NPMA 2OYZA 2IARA 3WINE 1A8DA 1O3SA 2HEVF 3BGAA 1UWWA 2PHRA 1V6IA 3VNGA 5JZGC 1H6YA 1CPNA 2XJVA 2Y0OA 2A6WA 5LEKA 2BATA 3V64A 4K1KA 3LA2A 4DG6A 2C24A 2A6YA 1TNFA 1W6NA 4YW7A 4ZU7A 1XYNA 4YM0A 4CDQB 4W8JA 3WF3A 5A3PA 2W8BB 3UC1A 3K48A 3E97A 4PI2A 3BU0A 2JDYA 1TEIA 2XHNA 1U6DX 4YFZA 4GZTA 1R092 1HIXA 3GCXA 3RS6A 1X33A 5FZHA 4YVWB 1WCDJ 4UFMA 4LT5A 2HTVA 4XMBA 2I45A 3DEMA 3USUA 5CFCC 2ETEA 3TI5A 1DILA 1HB4A 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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