The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
64
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sequence length |
153
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structure length |
153
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Chain Sequence |
VLSEGEWQLVLHVWAKVEADVAGHGQDILIRLFKSHPETLEKFDRFKHLKTEAEMKASEDLKKHGVTVLTALGAILKKKGHHEAELKPLAQSHATKHKIPIKYLEFISEAIIHVLHSRHPGDFGADAQGAMNKALELFRKDIAAKYKELGYQG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Crystal structures of CO-, deoxy- and met-myoglobins at various pH values.
pubmed doi rcsb |
| molecule tags |
Oxygen storage
|
| molecule keywords |
MYOGLOBIN
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| total genus |
64
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| structure length |
153
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| sequence length |
153
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 1995-10-25 |
| chain | Pfam Accession Code | Pfam Family Identifier | Pfam Description |
|---|---|---|---|
| A | PF00042 | Globin | Globin |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | Globin-like | Globins |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 1G9V A; 4KJT A; 1LFQ A; 1WMU A; 1HGA A; 4NI0 A; 5C6E A; 1JF4 A; 1BVD A; 3EU1 B; 2Z6T A; 2ZS1 C; 1C7D A; 5ILM A; 1HBB A; 2ZSR A; 3G4U A; 2ZS1 D; 1H97 A; 4C44 A; 3M3B A; 3PI3 A; 2ZSQ A; 2Z8A A; 3QMA A; 1LH3 A; 1X46 A; 1YHR A; 2RI4 A; 1X9F A; 2NSS A; 4MXL A; 5EQM A; 1QXE A; 2HHB A; 1HGC A; 3SDN A; 1MKO B; 2W72 C; 2IG3 A; 1YE0 A; 1BVC A; 1HHO B; 1YIE A; 1JZL A; 1UT0 A; 4PQC A; 1Y7Z A; 1NIH B; 2HCO A; 3WCU A; 1Y2Z A; 3WTG B; 2VYY A; 2GLN A; 2OIF A; 1A4F A; 3QZZ A; 3WCV A; 1B86 A; 2R4Y A; 4UUR A; 2HBF B; 1JDO A; 1JL7 A; 3WFX A; 1JP6 A; 3R5I B; 1LFL B; 1NQP A; 1XZU A; 1XZV A; 1N9F A; 1MLN A; 3OO5 B; 1J7Y B; 1O1N B; 4ROL B; 2VYW A; 1UVY A; 1MLQ A; 1VXG A; 3GQG B; 2G0R A; 3HEO A; 2DXM B; 1ECO A; 3R0G A; 4F4O A; 4F6F A; 3HXN A; 2EB8 A; 1V4W A; 2D2N B; 1DKE A; 1CMY B; 1A0Z A; 3BJ2 A; 3QJD A; 5HU6 B; 5JGG B; 3WR1 B; 1LH2 A; 1HGB B; 1CG5 A; 3W4U A; 1Y7G A; 3LQD B; 2MGJ A; 2M6Z A; 5E83 B; 3BJ3 A; 1SI4 B; 1XYE B; 1MYJ A; 3WCW C; 3UHW A; 1O1J A; 1S0H A; 1DXU B; 3GQP A; 4KMV A; 3WCW D; 1FSX A; 1WVP A; 1JY7 B; 3PIA A; 2V1I A; 2ZS0 C; 2DHB A; 1GZX B; 2H8F B; 1NEJ B; 1JEB B; 2ZS0 D; 1A3N A; 1YH9 B; 3MKB A; 2SPO A; 3PT8 A; 1Y85 B; 3KUN A; 3WCT B; 1YEN B; 1Y01 B; 1MNI A; 1HBI A; 1MTK A; 3UHB A; 2W6V B; 3ZOM A; 1HBR B; 2MYD A; 2MGL A; 1YG5 B; 4G1V A; 4GZG A; 4PNJ A; 3S66 B; 3LR7 A; 4NK2 A; 1I3E A; 2EB9 A; 5KDQ A; 1Y0W A; 1IT3 A; 1ABW B; 3AT6 A; 1UIW B; 4ILZ A; 2QSP B; 4QAU A; 3MJP B; 4OOD A; 4M4B A; 1A6N A; 2MGK A; 1Y09 B; 1OR4 A; 3G46 A; 4G51 B; 4HBI A; 2LH7 A; 3MVC A; 4ROM A; 4UIQ A; 3FH9 B; 1Y4G B; 5F2A A; 111M A; 1Y4F B; 1J40 A; 3DUT B; 1Y8K A; 3BA2 A; 5CN6 A; 3A0G A; 2NRL A; 2DN1 B; 3GQR B; 1XY0 A; 2QRW A; 4ZVA A; 3GDJ A; 1VHB A; 2MGI A; 2HBC B; 2ZSN A; 1LJW B; 1OUU B; 1MLG A; 1LUE A; 1HAC A; 2IN4 A; 3WI8 A; 3P5Q A; 3WHM A; 2ZSS A; 4FH7 A; 3ECL A; 1MNO A; 2ZSY A; 2FAL A; 1MLR A; 108M A; 1LHT A; 2ZLT A; 4MPM A; 1BIN A; 1Y83 A; 1IDR A; 3ODQ B; 1OJ6 A; 1YDZ A; 1SDK B; 1OUT B; 2NX0 A; 1MBN A; 5E29 B; 1BIJ B; 3GYS B; 1YGF A; 1A01 A; 1X9F C; 2R1H B; 4TWV A; 1FHJ B; 1BZR A; 1J3Z B; 106M A; 1C7C B; 1V4U A; 3LB1 A; 1HLB A; 1X9F D; 2O58 X; 5AB8 A; 1YHE A; 4HRT B; 3UHC A; 2ZLV B; 1FN3 A; 3TLD A; 3DHT B; 1DM1 A; 1YMC A; 3HYU A; 4FH6 A; 2BKM A; 3QJC A; 2HHD B; 2VRY A; 3VRF B; 4N7P B; 5CN5 A; 3V2V A; 1QPW B; 3WCU C; 1Y22 A; 2ZS1 B; 4MQH A; 3WCV C; 3AQ9 A; 2ZLX A; 4HRR B; 2H8D B; 3WCU D; 1S69 A; 2DN2 A; 4M4A B; 3WCV D; 1S5X A; 3M3A A; 1RPS A; 1LHS A; 1XXT B; 1Y7D B; 1O1O B; 1LTW A; 1UC3 A; 2BLJ M; 2E2Y A; 3OZW A; 3GLN A; 3K8B A; 1EBC A; 1ABS A; 2SPM A; 1AZI A; 3NFE B; 1YVQ A; 2GDM A; 1T1N A; 1IWH A; 2W72 B; 1Y4R B; 1MGN A; 4OF9 A; 1GLI A; 1TU9 A; 1NS9 A; 3WCP A; 1YVT B; 1J7S A; 1HDA B; 3QJB B; 1MOB A; 2HBE B; 1URY A; 2Z6S A; 2BLH A; 1SPG B; 1GCW B; 2LH6 A; 4B4Y A; 2QFN A; 1GBV B; 3G4R A; 2D5X A; 2PEG A; 4F6I A; 1GDL A; 1VXD A; 1YGD B; 2O5M X; 1QSH B; 1HV4 B; 2VEB A; 3S1J A; 1MZ0 A; 1DWT A; 1MLF A; 1RSE A; 3D7O A; 3UGY A; 1MOD A; 1Y0C B; 4L7Y B; 1A3O A; 1HBA A; 3AG0 A; 3ARJ A; 3D4X A; 2D5Z A; 2XKI A; 1MYF A; 3UH3 A; 1BZ6 A; 1HBH A; 1N9H A; 4MBN A; 1Y0A A; 3TM9 A; 4DWT A; 1YEU A; 1MWB A; 4MBA A; 2HHE A; 4MQG B; 3G4V A; 4ODC A; 1JP8 A; 3WCW B; 1GCV A; 1MBD A; 2BMM A; 1DUK A; 5KER A; 1RVW B; 3OK5 A; 3AT5 A; 1Y31 B; 2EKT A; 1NWN A; 5ILE A; 3UH5 A; 1YZI B; 2ZS0 B; 1DO4 A; 1WLA A; 3UHS A; 2VEE A; 3PI9 B; 1PBX A; 1ECD A; 3LR9 A; 1J52 A; 1QI8 A; 2QU0 B; 2LH1 A; 2MYC A; 1A9W E; 3UHG A; 2HBS B; 1QXD B; 2B7H A; 1THB B; 1YOI A; 1X3K A; 2W6Y A; 5EYJ A; 1JPB A; 2HBD B; 3MBA A; 1CLS B; 4MQJ B; 3HRW A; 3ONZ B; 3S65 B; 1Y0T A; 2QSS B; 2QMB B; 1O16 A; 1C7B A; 3HC9 A; 4MQK B; 1MBO A; 3QZX A; 2OH8 A; 2ZLW B; 1OFK A; 3UHZ A; 3UI0 A; 3OVU C; 1XZ2 B; 2LH2 A; 1YEV A; 1JWN A; 4YU4 B; 1HCO A; 1YFF A; 1GDK A; 1S5Y A; 3FS4 B; 4MQC B; 1Y46 B; 3D1A B; 1V4X B; 1Y8I A; 1DXV B; 3OO4 B; 1XZ7 B; 2MGD A; 5E6E B; 1CH1 A; 5AZR A; 4DWU A; 3GKV A; 3D1K A; 1IBE A; 2O5L X; 1Y7C A; 3MYN A; 4ZVB A; 2VLY A; 1G9V B; 5CN7 A; 1LFQ B; 3ZJH A; 1WMU B; 1HGA B; 1GVH A; 3UBV A; 1FCS A; 4NI0 B; 2D2M A; 1S56 A; 5C6E B; 3QQR A; 3QJE A; 1C7D B; 1HBB B; 3G4Y A; 1Y4P A; 1GDI A; 3A59 A; 3UHQ A; 1MLJ A; 1R1Y A; 3RJN B; 1BJE A; 1FSL A; 2YRS A; 1YHR B; 2RI4 B; 1X9F B; 4HHB A; 2GNV A; 1QXE B; 2HHB B; 3IC0 A; 1HGC B; 3AQ6 A; 1N9I A; 3O7N A; 1YE0 B; 1JW8 A; 1YIE B; 1YIH A; 3BOM A; 1MLM A; 3QQQ A; 1Y7Z B; 3ZJS A; 5SW7 A; 2QFK A; 4U8U A; 2HCO B; 3WCU B; 1Y2Z B; 1NZ2 A; 3HHB A; 1KD2 A; 3EDB A; 3PI4 A; 1A4F B; 3WCV B; 1B86 B; 1CP5 A; 1NQP B; 1XZU B; 1VXE A; 1XZV B; 1BZ0 A; 1Y4Q A; 107M A; 3LB2 A; 1A6K A; 1NXF A; 1DWS A; 2MGA A; 3UH6 A; 1YOH A; 4TYX A; 4SDH A; 3DHR A; 2R4Z A; 5D1V A; 1VWT A; 1LFY A; 4F4O B; 1G0A B; 5CNB A; 3HXN B; 1V4W B; 1MLK A; 3ZJN A; 1DKE B; 3UHN A; 3BCQ A; 3ZJQ A; 1M6C A; 2Z6N A; 1A0Z B; 3BJ2 B; 3QJD B; 2H35 A; 2AUO A; 2ZLU A; 1DXT A; 2FRI X; 1COH A; 1CG5 B; 1G0A A; 2WTG A; 3W4U B; 1Y7G B; 1D8U A; 1UVX A; 1YMA A; 3ZJR A; 2FRK X; 2M6Z B; 3UHT A; 2GKM A; 3BJ3 B; 3NG6 A; 2AV0 A; 4FWX A; 4AVE A; 1O1J B; 2HZ2 A; 1BZZ A; 2GRF A; 1S0H B; 3ZJJ A; 1O1P A; 2ZFB A; 3GQP B; 3LB4 A; 1FSX B; 1K0Y A; 1SDL A; 2ZT0 A; 3PIA B; 5EE4 C; 4MQI A; 3ZJL A; 2DHB B; 5HY8 A; 3QM7 A; 5EE4 D; 3PEL A; 1A3N B; 1JL6 A; 3MKB B; 4ESA A; 3A2G A; 1NZ3 A; 1Y8H A; 3PT8 B; 3B75 A; 1F5P A; 5CHR A; 1Y5K A; 4H2L A; 5ILP A; 3LB3 A; 4O4Z A; 4F6G A; 2VM0 A; 2AV3 A; 3HF4 A; 1LFT A; 4WCH D; 1Q1F A; 3GKT A; 1LA6 A; 6HBI A; 3CY5 A; 4XS0 A; 5KDQ B; 1G09 A; 1Y0W B; 3AT6 B; 3TM3 A; 4M4B B; 5EUI A; 5KKK A; 1NZ5 A; 1Y4B A; 2ZT4 A; 4ROM B; 1GJN A; 3ZJM A; 2ZSX A; 1IT2 A; 1O1K A; 1YCA A; 1J40 B; 1XZ4 A; 1Y8K B; 2ZT2 A; 3A0G B; 1XY0 B; 2G3H A; 3LHB A; 2MYB A; 3V2Z A; 2AA1 A; 4NXC A; 2SPL A; 3GDJ B; 1CBL A; 1FAW A; 2ZFO A; 1O1M A; 1AJG A; 1HAC B; 1SHR A; 1DTI A; 2D2M C; 3P5Q B; 3WHM B; 1VXF A; 2D2M D; 2CMM A; 2ZLT B; 3VRG A; 1MLL A; 1Y83 B; 1BZP A; 4H0B A; 3M38 A; 5JDO E; 1YDZ B; 2C0K A; 2MGH A; 2NRM A; 4DC8 A; 1HBS A; 3ZJP A; 1Y5J A; 4NS2 A; 4LPI A; 2WY4 A; 2GNW A; 1YGF B; 1A01 B; 4FC3 A; 1V4U B; 5CHQ A; 2G12 A; 2G11 A; 3SZK A; 1YHE B; 1HDB A; 1UMO A; 1FN3 B; 2PGH A; 1Y5F A; 1MYM A; 3HYU B; 1VRE A; 5MBN A; 103M A; 1CH7 A; 1XQ5 A; 3QJC B; 1HDS A; 4U8U C; 5MBA A; 1Y22 B; 4MQH B; 1O1L A; 1RQA A; 1F5O A; 4U8U D; 1OBM A; 2ZLX B; 5IKS A; 3ASE A; 2OHB A; 2DN2 B; 3ZOL A; 1HLM A; 3BJ1 A; 1DLW A; 1S5X B; 3NMM A; 1O1I A; 1FDH G; 1RPS B; 4C0N A; 102M A; 3IC2 A; 2XKH A; 3VAU A; 4IRO A; 1N9X A; 3K8B B; 1YE2 A; 3M39 A; 1Y0D A; 1YVQ B; 1RTE A; 1T1N B; 1IWH B; 1XZ5 A; 5EU2 A; 3UHK A; 3AQ7 A; 1YEO A; 3G52 A; 1GLI B; 1NS9 B; 3WCP B; 1J7S B; 1DUO A; 1S6A A; 1MNK A; 3GOU A; 4DC7 A; 110M A; 1Y8W A; 3UHI A; 4O4T A; 1M9P B; 1G08 A; 1R1X A; 3S1I A; 1BAB A; 2D5X B; 2PEG B; 3GK9 A; 3QM5 A; 1RQ4 A; 3NL7 A; 2MGG A; 2DN3 A; 1MBA A; 1CO9 A; 4NI1 A; 1HRM A; 2MYA A; 1EW6 A; 1MBC A; 1M9P A; 2O5Q X; 1DO3 A; 3D7O B; 2FRF A; 1ASH A; 2MGB A; 2V1E A; 1A3O B; 1A0U A; 1HBA B; 3WFT A; 2W6X A; 5CN4 A; 5CNE A; 1AJ9 A; 3D4X B; 1CPW A; 1J3Y A; 1MYZ A; 1SPE A; 2D5Z B; 4MAX A; 1TES A; 3CIU A; 2SPN A; 5CND A; 2R80 A; 1KFR A; 1Y45 A; 1LFZ A; 1HBH B; 5B85 A; 4MU5 A; 3NML A; 1Y0A B; 1YEU B; 2HZ1 A; 2MHB A; 1MOH A; 2G14 A; 2HHE B; 3PI8 A; 1U7S A; 104M A; 4KN3 A; 3OJ1 A; 4ODC B; 3A5A A; 3EOK A; 2W6W A; 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3BOM B; 3PI2 A; 1S61 A; 5SW7 B; 4U8U B; 3HHB B; 1KD2 B; 5JDO C; 1RQ3 A; 2NSR A; 4N8T A; 5F0B A; 1ABY A; 2O5S X; 5JDO D; 1BZ0 B; 1CBM A; 1Y4Q B; 4IT8 A; 2OHA A; 2VHB A; 3ECZ A; 3EU1 A; 1JZM A; 1FDH A; 3UGZ A; 3DHR B; 1UX9 A; 1VWT B; 1LFY B; 3U3E A; 2ZT3 A; 4MXK A; 2VLX A; 4F6D A; 1HJT A; 3BCQ B; 3ZJI A; 2Z6N B; 2H35 B; 1HBG A; 2ZLU B; 3IXF A; 1DXT B; 1A6M A; 1PMB A; 1HSY A; 4UZV A; 3QM9 A; 1DTM A; 1COH B; 1CH2 A; 4TWU A; 1MKO A; 1LH1 A; 3NG6 B; 1MWD A; 3O89 A; 3UHD A; 2FAM A; 4HSX A; 1HHO A; 1CH4 A; 2GTL C; 1VXC A; 3E5O A; 1BZZ B; 1O1P B; 2ZFB B; 1NIH A; 1K0Y B; 2V1H A; 3WFW A; 1SDL B; 2GTL D; 5EOH A; 3WTG A; 1A6G A; 4MQI B; 5HY8 B; 2G0Z A; 2HBF A; 3PEL B; 3ARK A; 3R5I A; 1CIO A; 1LFL A; 4ESA B; 3UHV A; 1Y8H B; 1YHU C; 3G4Q A; 1EMY A; 3B75 B; 3OO5 A; 1LH6 A; 1J7Y A; 1YHU D; 1O1N A; 4ROL A; 1Y5K B; 4H2L B; 3GQG A; 3DR9 A; 1NPF A; 1MOA A; 3WFU A; 3HF4 B; 2DXM A; 2MGE A; 1LFT B; 2AUP A; 2D2N A; 1LA6 B; 1CH9 A; 3CY5 B; 1CMY A; 1G09 B; 4XS0 B; 5HU6 A; 5JGG A; 2WTH A; 3ORD A; 3WR1 A; 1HGB A; 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