1SSWA

Crystal structure of phage t4 lysozyme mutant y24a/y25a/t26a/i27a/c54t/c97a
Total Genus 59
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
59
sequence length
164
structure length
164
Chain Sequence
MNIFEMLRIDEGLRLKIYKDTEGAAAAGIGHLLTKSPSLNAAKSELDKAIGRNTNGVITKDEAEKLFNQDVDAAVRGILRNAKLKPVYDSLDAVRRAALINMVFQMGETGVAGFTNSLRMLQQKRWDEAAVNLAKSRWYNQTPNRAKRVITTFRTGTWDAYKNL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase
source organism Enterobacteria phage t4
publication title Alanine-scanning mutagenesis of the beta-sheet region of phage T4 lysozyme suggests that tertiary context has a dominant effect on beta-sheet formation
pubmed doi rcsb
molecule keywords Lysozyme
total genus 59
structure length 164
sequence length 164
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 2004-03-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00959 Phage_lysozyme Phage lysozyme
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.40 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1sswA00
166LA 169LA 4ARLA 3DN1A 2B74A 3C80A 1L62A 3HT9A 2OU9A 2OU0X 109LA 251LA 1L38A 3HUQA 210LA 2RBRA 1CVKA 3SB8A 3HT6A 245LA 1QTDA 4EKPA 1CU5A 1P6YA 1LYGA 141LA 1OVJA 3C8QA 1QS5A 2QARC 237LA 1L19A 1L95A 1L07A 227LA 1P3NA 3OE8A 1L13A 4YXAC 1OYUA 261LA 1L76A 1QTHA 1CU3A 4GRVA 1LGUA 1L61A 1C6IA 1L17A 4I7RA 1L09A 1L03A 4I7TA 1XJTA 238LA 1L66A 3QAKA 1L84A 3SB5A 180LA 1CU0A 137LA 3DKEX 1SWYA 1KS3A 1L93A 1LPYA 242LA 2LZMA 2F2QA 3DMXA 7LZMA 3HT8A 1C6KA 4ARQB 107LA 158LA 1CU2A 4I7JA 1C6FA 1C69A 1L57A 1L85A 3HH4A 1QT8A 1L37A 3HU8A 1L70A 1D3FA 130LA 128LA 1QSBA 129LA 1DYEA 3G3XA 3HTFA 4YXCA 3HDFA 3FADA 240LA 2RH1A 1QUGA 1C63A 248LA 142LA 187LA 3CDOA 4LDEA 3F8VA 1L92A 3SN6R 3DNAA 4ARMA 172LA 2NTHA 1P64A 1CV0A 1CV1A 3L2XA 1L69A 1L32A 177LA 1C66A 3PBLA 3LZMA 185LA 1QT3A 189LA 1L88A 1D3MA 1I6SA 217LA 1L91A 249LA 3HTBA 1D2WA 1OVKA 1L54A 1T97A 1G0KA 1OWZA 215LA 3K2RA 1G0LA 1C68A 1L97A 149LA 211LA 2QB0B 3VW7A 3C83A 1SX7A 4I7OA 1L49A 220LA 219LA 243LA 4I7PA 155LA 1C6LA 120LA 1DYAA 1L67A 2B70A 3OE9A 1KW7A 1D2YA 1L0KA 1G06A 111LA 259LA 1C60A 1L94A 3C7YA 1LI3A 222LA 230LA 2B6ZA 4K5YA 1P56A 1L81A 1P46A 3SBAA 2B6TA 253LA 1L74A 1L36A 1ZWNA 150LA 1C65A 214LA 140LA 4W56A 1KY0A 3C7ZA 3DMVA 223LA 1JTNA 1L10A 1L24A 4GBRB 1L00A 1LYFA 115LA 1L33A 1L59A 3DN4A 1L08A 1JQUA 1L02A 4EJ4A 2RB0X 3CDRA 1L41A 1LI6A 1ZYTA 199LA 1C6NA 4W51A 1L18A 1T8GA 4EKQA 3NY8A 1P37A 1L86A 3JR6A 1OWYA 4ARJA 239LA 1CU6A 4EPFA 4PK0A 3HDEA 108LA 1C6TA 255LA 3HUAA 164LA 2OE9X 1L43A 1NHBA 3D4SA 119LA 1LLHA 1XJUA 1L56A 1PQJA 250LA 257LA 2RBNA 1G07A 1C67A 146LA 1L45A 138LA 1CV6A 1QTCA 191LA 1L46A 2HUMA 206LA 196LA 3ODUA 1L48A 1C61A 2B72A 1T6HA 2OE7X 1LYDA 145LA 1QTVA 1L05A 122LA 216LA 4ARQA 1QTZA 1K28A 1CV3A 151LA 3GUPA 1L29A 3C81A 1L80A 168LA 3C7WA 2RBOA 3C8SA 2RBSA 4I7QA 1L31A 2OU8A 1D3NA 1L16A 1PQMA 197LA 147LA 144LA 2IGCA 246LA 1L87A 4IAPA 1CTWA 1PQKA 159LA 2Q9DA 1LYJA 5LZMA 3HTGA 1G0JA 1CV5A 3V2WA 4LZMA 110LA 1D3JA 3L64A 2A4TA 4I7SA 3HH6A 3SB6A 1L53A 1QT5A 1KW5A 1L63A 1SWZA 3G3VA 3HT7A 1CX7A 1L71A 212LA 5I14A 1LGWA 229LA 160LA 3C8RA 262LA 1EPYA 236LA 1P36A 4I7LA 2B6YA 4S0WA 4EXMA 1DYCA 260LA 195LA 232LA 2F47A 2RBPA 176LA 125LA 4W54A 1SSWA 1C6AA 188LA 3NYAA 4DJHA 2CUUA 112LA 1L35A 1C6BA 3HH3A 1L98A 1L34A 1L30A 2OTZX 4YX7C 4AQNA 4I7NA 1LGXA 1QTBA 1P2RA 1L64A 1PQIA 2RB2X 1PQDA 3GULA 3HU9A 2RB1X 1LW9A 1CUPA 184LA 1P7SA 224LA 4W53A 1SX2A 175LA 3DN2A 2L78A 2OTYX 228LA 152LA 1L51A 2B73A 2B6XA 1C6HA 1L89A 225LA 1ZURA 1L20A 104LA 1DYBA 1OV7A 1PQOA 4W55A 1L40A 3DN8A 1L99A 3DN6A 1P5CA 183LA 1L77A 3RUNA 1G0QA 192LA 1L65A 103LA 2O4WA 2Q9EA 1L01A 231LA 1G0MA 1C6GA 1L28A 4LDOA 1QUOA 3HWLA 2OEAX 1L75A 171LA 1QT6A 3V2YA 2NTGA 3DMZA 3HTDA 4LDLA 1L68A 4ZPUA 190LA 1DYFA 1LWKA 1QS9A 1G1WA 4W59A 1L90A 3RZEA 1SSYA 167LA 2RAZX 1L47A 1L39A 157LA 1L15A 1P2LA 234LA 200LA 1QSQA 3PDSA 3GUIA 1C6JA 1L11A 241LA 213LA 6LZMA 1DYDA 3SBBC 1L79A 1QT7A 123LA 4W57A 1LYHA 1L22A 1DYGA 1L55A 1LI2A 3FI5A 1C64A 2OE4X 4EKSA 3UONA 1TLAA 198LA 1L25A 4W52A 1L72A 181LA 3CDVA 1OVHA 3SB9A 1L83A 4ARPA 1L52A 1XEPA 3OE0A 3HUKA 2ANVA 3GUMA 163LA 102LA 1B6IA 2O79A 165LA 1C6QA 205LA 126LA 1L73A 3CDQA 182LA 2B75A 1QT4A 1T8AA 2Z6BA 1L06A 4DKLA 1KNIA 178LA 1C6MA 1L58A 1QUHA 1L50A 2RAYX 1G1VA 256LA 1D9WA 258LA 2B7XA 143LA 3FA0A 1T8FA 3GUJA 1OV5A 221LA 170LA 1L60A 1C6CA 3DN3A 3G3WA 3NY9A 127LA 2LCBA 4DAJA 1L04A 4EPIA 4ARMB 233LA 1C6EA 1L27A 4I7KA 2RBQA 4PJZA 254LA 209LA 4E97A 1G0PA 1L0JA 2HULA 1L26A 2LC9A 1QUDA 162LA 2ANXA 3CDTA 156LA 4I7MA 3C82A 2HUKA 114LA 2O7AA 3GUNA 4W58A 1C6DA 1LWGA 2B6WA 1CX6A 1L82A 1KY1A 2F32A 118LA 1L12A 1LYIA 252LA 1CUQA 1L14A 186LA 247LA 3HH5A 174LA 201LA 1WTHA 3SB7A 244LA 4EKRA 1JTMA 226LA 131LA 3F9LA 1L23A 3EMLA 173LA 1LYEA 3OE6A 1L42A 1L44A 1C6PA 218LA 3GUKA 3GUOA 161LA 4OO9A 1CV4A 139LA 1L96A 1L21A 1C62A 235LA 113LA 1G0GA 3DN0A 148LE
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1FDLY 1LYYA 4DD0A 1C7PA 1L62A 1VDTA 4DDAA 2WARA 251LA 1NWGA 1CVKA 3HT6A 245LA 1QTDA 1BGIA 1CU5A 1UIBA 2BQKA 1P6YA 1OVJA 3B0OA 4NGKA 1L95A 5HMVA 1L07A 4MCKA 3HBEX 1P3NA 2DQAA 4WM4A 1OYUA 4MSTA 1F10A 4NWEA 1GF9A 3AGGG 5LVHA 1JISA 1GF6A 1AT5A 1LZNA 3LZTA 5I4WA 1IP7A 1LPYA 2BQGA 1NDGC 4B4EA 3AJNA 4QDNA 4ARQB 4ETBA 4I7JA 4J7VA 5IELA 3HH4A 154LA 1QT8A 4O34A 2HECA 3TXGA 4Z41A 3G3XA 1FBIX 5KXKA 5LYZA 3HTFA 3HDFA 5I5QA 1QUGA 187LA 4TSBA 4LDEA 4X3BA 3DNAA 4ARMA 2NTHA 1LJGA 1CV1A 5APDA 5FSTA 1IC5Y 3PBLA 3ATNA 4B0DA 189LA 3TMWA 5LYMA 1L91A 2BQMA 1LZTA 3HTBA 1OVKA 1L54A 3RNXA 1GFKA 1D9UA 2DQIY 2QB0B 1GBWA 4XJIA 3VW7A 4I7OA 3WUMA 1JIYA 1L49A 4H94A 4NSHA 1NBYC 3A8ZA 5LA5A 2B5ZA 1GFTA 1VDSA 3LYTA 1BB6A 3M3UA 230LA 1VDPA 1BB7A 1P56A 1VEDA 1P46A 2EIZC 3A3QA 1RI8B 2B6TA 3LHMA 2YBIA 1VATA 3LYZA 3C7ZA 1EQEA 223LA 1YAPA 1L24A 1L00A 1C46A 1B7MA 1A4VA 1L33A 3WVYA 1L08A 1IP2A 1L02A 4RW2A 1DPWA 4R0FA 3B72A 3D9AC 5I54A 1C6NA 1LYSA 4N1EI 3NY8A 1P37A 1CU6A 1LMCA 4NGIA 2C8OA 1OUFA 1L43A 1NHBA 2Z38A 3CSRA 257LA 1CKFA 5LAGA 1REXA 138LA 3ODUA 2B72A 1T6HA 5LVKA 1IWYA 1CNSA 1BVXA 2MEIA 1LAAA 3TXFA 151LA 1LSPA 3C81A 3C8SA 168LA 2Z2FA 2DQGY 3C7WA 4CFPA 2F2NA 4WL7A 1XEJA 5F9XA 1L16A 4LT3A 1IWWA 246LA 1DQJC 5F16A 4GCFA 1CV5A 1MELL 3V2WA 4DWXA 110LA 3RT5X 2MEGA 4IATA 1GFHA 4LYMA 1LMNA 3LYMA 4H92A 1UIGA 1L53A 2C8PA 1UIFA 2IFFY 2FBDA 3HT7A 1L71A 1J1XY 2X0AA 1E8LA 1NF5A 1GF3A 2B6YA 1NQIA 4H9IA 3K3TA 4RW1A 260LA 4H8ZA 232LA 4ZIXA 3RU5A 125LA 1T6VL 3G3BB 3NYAA 4XJBA 1QTEA 1CKDA 3HH3A 1L34A 5B1FA 4YX7C 1GD6A 1JHLA 1VFBC 193LA 1YAMA 1L64A 1XFPL 4LYTA 2BQHA 1PQDA 2RB1X 4HJZA 4NFVA 1B7LA 1HELA 175LA 1LZGA 1LPIA 2OTYX 152LA 1L51A 1GFEA 1ZURA 1W6ZA 1GXXA 2BQIA 104LA 1KIPC 1OV7A 1PQOA 4W55A 4QY9A 1IR9A 4YENA 4DDBA 1L99A 1JUGA 103LA 1LJHA 5L9JA 1G7JC 2HEAA 1L75A 2H9JA 3ULRA 2NTGA 4LDLA 4NGJA 1XEKA 2G4NA 1L39A 157LA 3WMKA 1QSQA 4DT3A 1L11A 241LA 4ET8A 123LA 5B05A 1SQ2L 1L55A 2LYMA 198LA 2A7DA 4H9FA 3CT0A 4ETAA 3VWOA 2F4AA 4W52A 133LA 4OWAA 1HSWA 3HUKA 4RLNA 9LYZA 4H9HA 1B6IA 165LA 126LA 4DKLA 2Z18A 1KNIA 3A92A 4KXIA 3ZVQA 1LZBA 1L58A 1L50A 3WXTA 4CHXA 258LA 1T8FA 1IX0A 221LA 170LA 5EBHA 3ATOA 4GLVA 5DM9A 4ARMB 1HNLA 1GB7A 1B5XA 1C6EA 4GLAA 1SLYA 1KXWA 4CFOA 2YVBA 1H87A 1WTMA 1L26A 1UA6Y 1VDQA 1LSYA 156LA 3C82A 3TMVA 1C6DA 1GHLA 2XBRA 1JKBA 1LWGA 1UIDA 1QQYA 1JJ3A 4J1BA 1GB6A 5B1GA 2YDGA 1IOSA 1RE2A 2F32A 4ETEA 252LA 1GF4A 4WM2A 247LA 1LHMA 1GF8A 1BB3A 5A3ZA 1IC7Y 1LMOA 4C3WA 226LA 4YF2A 1GPQC 2BQFA 1IWXA 3F9LA 1L23A 173LA 3T36A 1L44A 218LA 5B59A 2ZYPA 1NDMC 1LZCA 2MEAA 1BB5A 1L21A 1C62A 2ZQ3A 2VB1A 1IVMA 148LE 3SB6A 4ARLA 1YAOA 1KIQC 1B7SA 3A96A 109LA 1L38A 3HUQA 3W6EA 3CT1A 2RBRA 1HSXA 1CKGA 1LJNA 4H9CA 1LSBA 3C8QA 1P2CC 1QS5A 2QARC 237LA 2BQNA 1JEFA 1I1ZA 1L13A 4HTNA 5FEKA 4GRVA 1CU3A 3GXKA 1HMLA 1C6IA 4I7RA 3WPJA 3WUNA 4I7TA 1L66A 1CU0A 4DC4A 1A2YC 5E4PA 1SWYA 1KS3A 1L93A 4RLMA 2LZMA 7LZMA 4LT1A 4TWSA 1C6KA 5DLAA 107LA 1C69A 1DKKA 1L85A 4WO9A 1REYA 2YBNA 2HEEA 3HU8A 1D3FA 1HERA 130LA 3TXHA 1DYEA 1RCMA 1N4FA 4YXCA 1UIHA 1GB3A 1B5YA 3CDOA 1OUIA 1WQOA 1LSCA 2Z39A 3L2XA 4WL6A 4EMNA 2CWIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
 1FDL Y;  1LYY A;  4DD0 A;  1C7P A;  1L62 A;  1VDT A;  4DDA A;  2WAR A;  251L A;  1NWG A;  1CVK A;  3HT6 A;  245L A;  1QTD A;  1BGI A;  1CU5 A;  1UIB A;  2BQK A;  1P6Y A;  1OVJ A;  3B0O A;  4NGK A;  1L95 A;  5HMV A;  1L07 A;  4MCK A;  3HBE X;  1P3N A;  2DQA A;  4WM4 A;  1OYU A;  4MST A;  1F10 A;  4NWE A;  1GF9 A;  3AGG G;  5LVH A;  1JIS A;  1GF6 A;  1AT5 A;  1LZN A;  3LZT A;  5I4W A;  1IP7 A;  1LPY A;  2BQG A;  1NDG C;  4B4E A;  3AJN A;  4QDN A;  4ARQ B;  4ETB A;  4I7J A;  4J7V A;  5IEL A;  3HH4 A;  154L A;  1QT8 A;  4O34 A;  2HEC A;  3TXG A;  4Z41 A;  3G3X A;  1FBI X;  5KXK A;  5LYZ A;  3HTF A;  3HDF A;  5I5Q A;  1QUG A;  187L A;  4TSB A;  4LDE A;  4X3B A;  3DNA A;  4ARM A;  2NTH A;  1LJG A;  1CV1 A;  5APD A;  5FST A;  1IC5 Y;  3PBL A;  3ATN A;  4B0D A;  189L A;  3TMW A;  5LYM A;  1L91 A;  2BQM A;  1LZT A;  3HTB A;  1OVK A;  1L54 A;  3RNX A;  1GFK A;  1D9U A;  2DQI Y;  2QB0 B;  1GBW A;  4XJI A;  3VW7 A;  4I7O A;  3WUM A;  1JIY A;  1L49 A;  4H94 A;  4NSH A;  1NBY C;  3A8Z A;  5LA5 A;  2B5Z A; 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