The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.
Total Genus |
26
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sequence length |
77
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structure length |
77
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Chain Sequence |
b'LPPSLPSDPRLWSREDVLVFLRFCVREFDLPKLDFDLFQMNGKRLCLLTRADFGHRCPGAGDVLHNVLQMLIIESHS'
|
The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.
After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.
| publication title |
Derepression by depolymerization; structural insights into the regulation of yan by mae.
pubmed doi rcsb |
| molecule keywords |
Ets DNA-binding protein pokkuri
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| source organism |
Drosophila melanogaster
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| molecule tags |
Transcription
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| total genus |
26
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| structure length |
77
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| sequence length |
77
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| chains with identical sequence |
B
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| ec nomenclature | |
| pdb deposition date | 2004-03-26 |
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
| Class | Architecture | Topology | Homology | Domain |
|---|---|---|---|---|---|
| Mainly Alpha | Orthogonal Bundle | DNA polymerase; domain 1 | Transcription Factor, Ets-1 |
#chains in the Genus database with same CATH superfamily 2KE7 A; 5F3X B; 1X9X A; 4NJ8 A; 4PZO A; 1SGG A; 2EAM A; 2F3N A; 2F8K A; 2LPE A; 3BS5 B; 1B0X A; 3BQ7 A; 1OW5 A; 1X66 A; 2DL0 A; 2Y9T A; 2K60 A; 2KSO A; 3BS5 A; 5JU5 A; 2EAN A; 2EAO A; 2L5Y A; 2B6G A; 1PK1 A; 4PZN A; 5JTI A; 2DKZ A; 2KSO B; 2YTU A; 2KMD A; 5J8Y A; 1RG6 A; 4RQN A; 5JRT A; 5L1M A; 2E8P A; 4RQM A; 1PK1 B; 1LKY A; 2FE9 A; 5J8Y C; 3SEI A; 2ES6 A; 4MHV A; 2QAR B; 2K4P A; 1DXS A; 1LKY B; 3TAC B; 2F44 A; 1PK3 A; 1WWV A; 3K1R B; 1V85 A; 1V38 A; 1OXJ A; 2QB0 B; 1COK A; 2D3D A; 2EAP A; 3H8M A; 1SV4 A; 2QAR A; 3TAD A; 2ESE A; 1KW4 A; 1F0M A; 1SXD A; 1B4F A; 3HIL A; 2D8C A; 2JV3 A; 3KKA A; 3TAD C; 1UQV A; 2QB0 A; 2KIV A; 2E8O A; 5KNI A; 3KKA C; 1WWU A; 2E8N A; 2GLE A; 2LMR A; 2QB1 A; 3IDW A; 1X40 A; 4NL9 A; 1SV0 A; 2DKX A; 3BS7 A; 3SEN A; 2QKQ A; 1JI7 A; 2E8M A; 2Y9U A; 1UCV A; 1Z1V A; 1SXE A; 2KG5 A; 4NL9 C; 1SV0 C; 4IS7 A; #chains in the Genus database with same CATH topology 2W3R A; 1X9W A; 2KE7 A; 2W11 A; 5CA7 A; 4US9 A; 2W9C B; 4KLO A; 2DWQ A; 1SWW A; 3WKE A; 4XUS A; 5AKJ A; 5DBC A; 5DLF A; 5DB9 A; 3ZDA A; 9ICB A; 9ICN A; 2KP7 A; 5KG0 A; 1URJ A; 3M1Y A; 4P0P A; 1UHU A; 1KLN A; 5DDY A; 2ZIV A; 1T4G A; 4KN7 A; 2M0N A; 4R8U A; 5KAI U; 7ICN A; 1S77 D; 2XC9 A; 2EAN A; 3OSP A; 3ZDD A; 4O3S A; 4F2R A; 2EAO A; 1SL2 A; 2NRT A; 4MFF A; 2JZB A; 1ZQR A; 3A0H U; 4RQ7 A; 5JTI A; 2BPG A; 4DQR A; 4YR3 A; 4C0Z A; 3DEE A; 3HW8 A; 3U26 A; 3OGU A; 2FJ6 A; 4AP9 A; 4F5O A; 5KFA A; 2HBL A; 1X9S A; 3D2S A; 1L6N A; 3UMB A; 3RJK A; 1B43 A; 1ZXI A; 3C23 A; 5AM2 A; 4RQ8 A; 1LKY B; 2JEF A; 5IIN A; 2BCQ A; 1HJP A; 1KRP A; 1ZQX A; 4YMO A; 4C8N A; 4TUR A; 5J2I A; 5HHH A; 2EZZ A; 1UA0 A; 3PO4 A; 2KZ3 A; 3FYH A; 3OSN A; 3TAD C; 2OHF A; 1O08 A; 2DF4 B; 5ALJ A; 3HT3 A; 3Q8R B; 3HP6 A; 1N56 A; 2B21 A; 4OJO A; 1NK6 A; 2GLE A; 4J9O A; 5BPC A; 5EOZ A; 3PZP A; 2QKQ A; 2FPM A; 1J2M A; 4M9N A; 3FM9 A; 3NVZ A; 1ZJM A; 3AUO A; 3H8J A; 3MC1 A; 4BXO B; 3HKZ C; 2AGP A; 5B66 U; 4O3R A; 4RQ1 A; 5KTQ A; 3IN5 A; 2KHV A; 2J6U A; 4QZC A; 3OHB A; 5KG7 A; 1U49 A; 2YB4 A; 1H38 A; 5HMM A; 3M9M B; 2E1F A; 1BPE A; 1NZB A; 2Y9T A; 4FS2 A; 7ICJ A; 1ZD3 A; 4IR9 A; 3MBY A; 4QZG A; 1X2I A; 3BS5 A; 2BPC A; 3MFI A; 4F5N A; 3M8R A; 1T94 A; 4OJ6 A; 4NXZ A; 3SI8 A; 4RQM A; 1BNO A; 2B0C A; 2JZB B; 3RRG A; 4EX6 A; 2ZTE A; 1C20 A; 4IRD A; 4Y2X A; 4PL2 A; 2KZM A; 3PMN A; 2W43 A; 4AYB F; 3TAC B; 2F44 A; 1TVA A; 2KTQ A; 4QIW C; 1SZP A; 3T5K A; 2R8J A; 4JV2 A; 2PI4 A; 1L7O A; 2F8L A; 3KHR A; 1SV4 A; 3NGD A; 2V9W A; 1LVH A; 3N7S C; 2HHX A; 2C2R A; 1Q3U A; 9ICU A; 1F5S A; 4R63 A; 2A1J A; 2ZTD A; 5DQI A; 1BGX T; 4MFC A; 7ICE A; 1SB3 C; 8ICS A; 2XVT A; 1ZYQ A; 2BQU A; 3IDW A; 1QH9 A; 9ICL A; 4QZI A; 4I2F A; 5AKI A; 4BX9 C; 3RTV A; 1KKX A; 2G09 A; 4ZOH C; 2MRL A; 1BPY A; 4BUG A; 8ICT A; 5AHX A; 3H0M B; 5J29 A; 4GC7 A; 4RUC A; 4IRK A; 3RB4 A; 4B9T A; 1LV5 A; 3QZ8 A; 3T5J A; 4UB5 A; 1D8Y A; 9ICE A; 3T79 A; 2HHU A; 4CRX A; 3D2N A; 4ED0 A; 3WK5 A; 4RNN A; 2VJ5 A; 5DG8 A; 1YZ6 A; 4F5P A; 3MGI A; 4KLU A; 5AKH A; 4RPY A; 2BGW A; 1JAL A; 2W03 A; 4IQU A; 3MDA A; 8ICJ A; 2FPK A; 4MF2 A; 3V7J A; 5L1M A; 7ICT A; 4OO1 J; 3MAB A; 3NS1 A; 3ORY A; 5KG5 A; 4QZA A; 2K4H A; 4I27 A; 4I28 A; 2XY5 A; 3RAX A; 2YMM A; 2ES6 A; 4UAU A; 5GTI U; 2KJ8 A; 4DOC A; 1D9F A; 2W8K A; 3SAH A; 3THV A; 2J6S A; 1VDV A; 2JGA A; 4DFP A; 2QB0 B; 3TAQ A; 1COK A; 4JMU A; 8ICA A; 4BWJ A; 3MR3 A; 4B9S A; 4EZ6 A; 1F0M A; 4EBD A; 4I2H A; 2D8C A; 5KFR A; 1ZD2 P; 3KKA A; 2P35 A; 8ICR A; 4JK1 A; 2WF6 A; 3M6Z A; 3C2L A; 4DLG A; 3AU6 A; 9ICR A; 2FPL A; 2R18 A; 4I2A A; 4TUS A; 2HW3 A; 1SV0 A; 2W8L A; 1ECW A; 1N61 A; 5IIK A; 4AYB C; 1N5W A; 1A76 A; 4FE3 A; 3C5G A; 2BCS A; 1PVQ A; 1KQQ A; 2MU2 A; 3RH5 A; 1COO A; 8ICV A; 3RRH A; 4PGQ A; 2F3N A; 4I2G A; 1Z00 A; 3KHG A; 2Y1I A; 4F4Y A; 1U47 A; 2BZF A; 4PHE A; 4C7Z A; 4QZB A; 7ICM A; 2NRX A; 3V7L A; 1TK8 A; 3KTQ A; 2JH7 A; 2ISO A; 2LBO A; 4NM2 A; 3UQ2 A; 1N48 A; 5HP4 A; 2B6G A; 4YD1 A; 3WKD A; 1TK0 A; 7ICU A; 3WK4 A; 4ECY A; 2AHO B; 3F5E A; 4ACO A; 3LDA A; 4J9R A; 3H7I A; 1T8E A; 2WHE A; 2AGO A; 2N1R A; 3K75 D; 4DL2 A; 3QUQ A; 4O3Q A; 2ISP A; 5KFU A; 3AEV A; 1ZQF A; 3D6J A; 2FI1 A; 2OYY A; 1ZRM A; 1A0P A; 4F92 B; 2F2A B; 1D8L A; 2ZJ8 A; 5AM0 A; 1ZD4 A; 2YY6 A; 2WB1 F; 4ED7 A; 1N60 A; 9ICP A; 2D3D A; 3Q8Q B; 1QQ6 A; 1ZQY A; 5KFO A; 1TAU A; 8ICE A; 3CP8 A; 5EE9 A; 1Z19 A; 8ICG A; 4RNM A; 2YB1 A; 9ICA A; 1ZQG A; 3KOO A; 3PR4 A; 5L1I A; 4TUQ A; 1WYG A; 5DG9 A; 2DPI A; 4USA A; 2F1J A; 4M9J A; 5AI8 A; 4NL9 A; 3C1Y A; 1Z1V A; 4GFJ A; 1L7N A; 4I2C A; 1KFS A; 3UXP A; 1JXL A; 4YXM A; 5L9X A; 4NJ8 A; 4ECS A; 4LVS A; 7ICS A; 4TUP A; 8ICK A; 5AKL A; 5GTH U; 5HR6 A; 5KFJ A; 1NKE A; 2W9C A; 2G06 A; 4ECT A; 1Z00 B; 2FLP A; 5KFY A; 3QZ7 A; 3QU9 A; 1D8B A; 4QZ8 A; 1QQ5 A; 4O9M A; 2LYB A; 4A8E A; 4X5V A; 5KFL A; 3WKB A; 3F53 A; 1HUO A; 4DL3 A; 1KDH A; 2K4E A; 3TAR A; 5IIO A; 5J0P A; 1ZRN A; 3N28 A; 3WK7 A; 2YMQ A; 4F5R A; 2EDU A; 2DQN B; 1S0M A; 4QNL A; 3AQE A; 2FMS A; 2EAP A; 1F44 A; 5AIA A; 9ICH A; 1WCL A; 4ELU A; 4RQ4 A; 2HMX A; 2MA1 A; 5KFW A; 4F2S A; 4M9G A; 3RFA A; 5ALD A; 2KZZ A; 3UM9 A; 7ICQ A; 1V9P A; 3PML A; 4US8 A; 3C29 A; 3J81 j; 2PFP A; 3FDS A; 1ZQI A; 4O3O A; 8ICZ A; 4J9L A; 4QWB A; 4LZG A; 4M47 A; 1ZQV A; 4XQ8 A; 2PFQ A; 5III A; 9ICF A; 5DKW A; 3OJS A; 2PFN A; 2WB1 C; 5AK3 A; 2XID A; 4KN4 A; 4DLE A; 5J0U A; 2LM1 A; 5AM4 A; 5AM3 A; 1NJZ A; 5ALG A; 3C2K A; 4EYI B; 5EWF A; 5KG2 A; 3BQ1 A; 3TFS A; 2BQ3 A; 3T5H A; 1DOQ A; 3BZC A; 5DBA A; 1Q3V A; 5EE3 A; 2JRZ A; 2WF5 A; 1ZQH A; 4JB3 A; 4BXO A; 4I2E A; 3UXO A; 1SKR A; 4F3O A; 3BQ0 A; 2KFZ A; 3B9J A; 3RAQ A; 2ASJ A; 4JV0 A; 2J6T A; 4DWI A; 5KFQ A; 5JU5 A; 1PK1 A; 4Y2U A; 5KT6 A; 4J9K A; 5KT7 A; 2XY7 A; 2HOQ A; 3F5A A; 1JMS A; 8ICW A; 5J0O A; 5DLG A; 5BOL A; 3TI0 A; 5IIM A; 2KHQ A; 4FZM A; 5CHG A; 4TQR A; 4FBT A; 4F91 B; 2H5X A; 2ODG A; 1ZQO A; 4BWM A; 4UAV A; 4DF4 A; 4QIW F; 4F4Z A; 4Q8F A; 2NO4 A; 3N7R C; 5A0L A; 3PX0 A; 3GIM A; 2PKE A; 4KLT A; 1WUD A; 4RPZ A; 2I1Q A; 1L3V A; 2JR5 A; 1WWV A; 3BQT A; 4KLH A; 1DGJ A; 3GU3 A; 3ZD9 A; 5KFP A; 4KLL A; 4KLM A; 2ZXI A; 5AKY A; 3B0Y A; 4DL5 A; 3D2Q A; 4DQS A; 3WK8 A; 2P66 A; 4GC6 A; 2DBY A; 4QWC A; 4F4W A; 1RM6 C; 2E8O A; 2KK0 A; 4OD0 A; 4R64 A; 4B9N A; 4YQW A; 7ICI A; 2RQ5 A; 4ECU A; 3AMZ A; 2K8A A; 2W3S A; 1L8L A; 4IRC A; 2C2D A; 3UQ0 A; 5ALS A; 5CR0 A; 3OHA A; 1NKC A; 1SXE A; 3QU4 A; 9ICW A; 4ECV A; 5B5E U; 1X9X A; 3QU2 A; 1SGG A; 1ZQC A; 1BPB A; 1ZJN A; 4KMO B; 3T3F A; 3LWL A; 4C4S A; 1Y88 A; 2BCV A; 2BDP A; 3V6K A; 3M7D A; 2HOF A; 2HBM A; 3M9N B; 5ALU A; 3Q8S B; 3RR8 A; 2K8B B; 4C8M A; 5J0R A; 1TE2 A; 3KBB A; 1ZQA A; 1PUZ A; 5J2G A; 4PJ0 U; 1KBU A; 4KLE A; 9ICM A; 4Y2Y A; 4FO6 A; 3QUB A; 4YXJ A; 3IRU A; 8ICQ A; 4I2J A; 1A77 A; 1PK1 B; 3V7K A; 8ICP A; 4MHV A; 5ALN A; 4Q45 A; 1NI3 A; 3N4M B; 2K4I A; 5H2F U; 3HRD D; 4DEZ A; 1L8O A; 4QZE A; 5AI4 A; 1SKW A; 2VJ4 A; 1MA7 A; 1OUQ A; 1XU4 A; 4EEN A; 3RF9 A; 1S97 A; 3JPO A; 4ECQ A; 2ZXH A; 4M6W A; 2M9N A; 3ZD8 A; 5KFM A; 3GIJ A; 5G5H A; 3DV9 A; 3LVW A; 3KZI U; 5DB7 A; 4QZH A; 4YR2 A; 1FO4 A; 1UPH A; 3FC4 A; 4YP3 A; 5BOM A; 9ICI A; 1L7P A; 1Z3E B; 2WF7 A; 2RLT A; 3HPO A; 2G5H B; 8ICF A; 4DSI A; 5CRX A; 2QB0 A; 3MDC A; 1S8O A; 5ALE A; 4J9P A; 4G9B A; 5ALL A; 4IQW A; 1M6Y A; 2JEG A; 5J2D A; 1QTM A; 4P0Q B; 2E8N A; 2MAX A; 2GO7 A; 5EWE A; 4OJ5 A; 4O5K A; 3QYP A; 9ICX A; 4Y2P A; 1C7Y A; 4UAS A; 3UMG A; 8ICO A; 2G5I B; 2IOF A; 4C80 A; 5KG1 A; 1TAQ A; 2IHM A; 4K4H A; 1BNP A; 1N63 A; 5D49 A; 1KFD A; 1RXV A; 4Q43 A; 4YMM A; 4UBC A; 2EAM A; 2DGZ A; 2ZIX B; 2PXI A; 4KLJ A; 1AQ6 A; 1ZQN A; 3C5F A; 4PL1 A; 3RJH A; 3QU7 A; 3ONN A; 4LJX A; 2W9B A; 2WAQ F; 1RZT A; 1JRO A; 4JUZ A; 1ED1 A; 3PY8 A; 1IM4 A; 3EWA A; 2H3Q A; 5G5G A; 3CRX A; 1SL0 A; 8ICH A; 5CB1 A; 4UAY A; 2ALZ A; 2R8K A; 4RQ0 A; 2RRD A; 1PVR A; 3EUB 2; 4PZN A; 4PHD A; 1QCK A; 8ICY A; 4KLF A; 5K4L A; 4YVZ A; 4EEL A; 2KV2 A; 3NRW A; 4P2H A; 5KL8 B; 4O5C A; 2QAR B; 5HNK A; 3SMV A; 5ALW A; 2VKQ A; 2YN4 A; 5AI6 A; 5KT2 A; 9ICT A; 2ZIU A; 3LYS A; 1JIH A; 2W9M A; 4NLZ A; 4ED8 A; 4YMN A; 1NK7 A; 4F4X A; 2HVI A; 4M0A A; 4UB4 A; 1SXD A; 2EZX A; 1NNL A; 3I76 A; 5D46 A; 2JV3 A; 4M6W B; 1XNS A; 1NJY A; 5L1L A; 4ED1 A; 4PGY A; 4Z6C A; 2UVR A; 1T3N A; 2FMQ A; 1K5O A; 4NLG A; 1NZP A; 3KKA C; 2F77 X; 4PH5 A; 4DFJ A; 4FS1 A; 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2IHN A; 2LI6 A; 3PO5 A; 3PST A; 2Y1J A; 4KX3 A; 3GDX A; 4RQ5 A; 3RB6 A; 3V6H A; 2RDI A; 1X6J A; 1MQ3 A; 3PX6 A; 5DDM A; 7ICP A; 2DL0 A; 1ZQ1 C; 3C2M A; 1U48 A; 4ELV A; 8ICI A; 4G3I A; 3H40 A; 5J2K A; 3QEA Z; 4Y2T A; 4B9L A; 4DQP A; 5JUM A; 2WF8 A; 4YR0 A; 3LK9 A; 4QZD A; 3LWM A; 4DSF A; 2BCR A; 4OJL A; 1N2X A; 1QSY A; 2OM6 A; 3SV3 A; 4FBU A; 5J2H A; 4NLK A; 4IL6 U; 2AH5 A; 2HCF A; 3PNC A; 5J2B A; 4DO9 A; 4HAI A; 4U7C A; 3HJE A; 5J0X A; 2MUT B; 3GFK B; 4GXK A; 4RQ3 A; 4QZF A; 1YZ7 A; 7ICG A; 3O0F A; 1D9D A; 1TKD A; 5AI0 A; 1T7P A; 4NWI A; 2RP5 A; 5ALP A; 4CE6 A; 7ICR A; 3ETL A; 2HSZ A; 3NAS A; 1NJX A; 2UVV A; 2ZIW B; 1UQV A; 4QW9 A; 1XSP A; 1P7D A; 5HML A; 2KIC A; 1XO0 A; 9ICG A; 1WWU A; 2EQY A; 2R8I A; 4YN4 A; 5KFI A; 2ATL A; 2G08 A; 4P4O A; 3BS7 A; 2NRZ A; 4R66 A; 5EWG A; 5AI5 A; 3KZX A; 1ZQQ A; 4QWD A; 5J0Q A; 3AQF A; 5DB8 A; 5EE0 A; 4DCC A; 2W7P A; 5KFZ A; 4CGZ A; 2WF9 A; 2F8K A; 5KG6 A; 2YQE A; 2H3V A; 4PPX A; 1QSS A; 5KFN A; 2CPR A; 3TQ1 A; 2BQR A; 1BPD A; 1BPX A; 5T14 A; 4DF8 A; 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