1SVXB

Crystal structure of a designed selected ankyrin repeat protein in complex with the maltose binding protein
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
369
structure length
369
Chain Sequence
GKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTGSGGTPG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule tags De novo protein/sugar binding protein
source organism Escherichia coli
publication title High-affinity binders selected from designed ankyrin repeat protein libraries
pubmed doi rcsb
molecule keywords Ankyrin Repeat Protein off7
total genus 125
structure length 369
sequence length 369
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1svxB02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1svxB01
1B1XA 1SW5A 3IX1A 5KDTA 1FTJA 1PC3A 1ZBMA 4KYEA 4OMBA 4Z7EA 3VE1B 2B65A 1MH3A 4JXIA 1M5FA 2Z22A 4KYSA 2V3TA 4YB5A 4UACA 4ESWA 2FA7A 1GVCA 4RPNA 1MQIA 3UP9A 5CMKA 2O1LA 1O64A 3TKDA 1N04A 3U94A 3TODA 2DWHA 2XD2A 4YMBA 1I6QA 1LCFA 2VHAA 3OD7A 1H3DA 3IAZA 4XKRA 4KHZE 4R9FA 2NUVA 3T93B 5HBCA 1MY0A 3Q26A 2O68A 3SEYA 1O7TA 3FGSA 4Q0CA 4JDFA 1H43A 4JB7A 1LB9A 1VFDA 4JSOA 4XKPA 2XXPA 4MLVA 4TQUQ 3KGCA 3KN8A 3JZJA 2F36A 2Q2CA 5BUUA 1NNTA 5I56A 4F19A 3D4GA 3PUYE 3OEMA 1POY1 3C32A 4JSDA 2O1MA 3FJMA 1IXCA 2E1SA 4P0GA 3RGYA 5KCJB 3E13X 1DPEA 3DELB 4OVJA 2ZNSA 2AIXA 3O6HA 1A55A 2XXVA 3BFUA 2Q2AA 1NNKA 3C31A 3H03A 2LAOA 3O9PA 3QUJA 4G2ZA 4ZEDA 4RY1A 5CMCA 2ALUA 5I59B 3B6QA 1SD3A 3FXUA 5BWJA 2V3QA 3TPAA 1JVYA 4X1DA 1Y3PA 4R2BA 4DXUA 3S9LC 4HW8A 1II5A 4G68B 1EZ9A 2RKMA 4ZZAA 3FXQA 3C35A 3MPLA 4H6DA 4QHQA 2E0SA 3DP6A 3MZ9A 2O69A 3OSQA 2GFEA 4F3BA 5I57B 4YKPA 1QKAA 1N76A 3ODBA 1UTBB 4KCDA 3CR9A 1Y4CA 1EZOA 2O6AA 3RTFB 1B3LA 3RUMA 4WKMA 1IXIA 5EYFA 3S9NC 1ZIUA 1ZTYA 2P0SA 1R9QA 1BP5A 1ZLQA 4PFUA 3LBSA 4EXKA 1HSLA 2PT1A 4GL8A 4ZE8A 3MVZA 2VD2A 1OVTA 5KZTA 2RINA 3ILUB 3TTMA 4LA9A 4N07A 3W9VA 3UN6A 3FJ7A 1FW0A 2PVUA 2X7PA 5JTYA 2V93A 1TFAA 4N6PA 5CC2A 3BKIB 4GQOA 4OHNA 3RLFE 1LLSA 4YAHX 2ZYKA 1MS7A 1N3WA 5H8FA 2I0CA 5F7VA 1MY2A 5CBRA 5F1QA 4LATA 4YICA 3FD3A 3CFZA 1AOVA 1SW2A 1IITA 1PB8A 4AQ4A 1US5A 2ZYOA 3S4UA 3ZSFA 3W9WA 3K01A 1URSA 5H8HB 1N7WA 1FTMA 4ONYA 4HCWA 4PFTA 3T66A 4YU0A 1LCTA 5AA2B 3USDA 4ELRA 1USYE 1MXWA 1SW4A 3VDFA 4G77A 2XXTA 2R71A 5AA4A 1PB7A 4Z0IA 3LSWA 2DYXA 5AE4A 5FHMA 2OWTA 2OLBA 2D3IA 3V5AA 2ONKE 1FQCA 2OBGA 3MZBA 3UORA 1Y3QA 3EHSA 1IXHA 3VV5A 3MJNA 1Y1MA 1B3FA 1WDNA 3TTNA 2FYIA 3G7WA 3IB0A 3G3HA 1QKBA 4BDRA 3OELA 1MRPA 3HPIA 3PMXA 3IB1A 3S2VA 1QULA 2QS1A 3SDFA 1RKMA 4GD5A 3IOUA 1NKXA 4YKIA 3IJOB 3I6VA 4OXVA 1YCJA 3T22A 1OLAA 4DE8A 1MG1A 3R7XA 1NL5A 2RC9A 2GH9A 4POWA 4FORA 3TTKA 3ECRA 3L6HA 2QMWA 4XKNA 3H6UA 4PFWA 4NF4A 1YAEA 4AB5A 1FCKA 4WEPA 3UGWA 3TEPA 5FHOA 1MM7A 4EXLA 3O66A 4I1DA 1XHYA 1H44A 3C33A 4R6KA 4KI0E 1B5JA 3F11A 4QFNA 3VLWA 3ZKKA 3LUYA 2M8CA 4BLAA 2Z8FA 1USYH 3GBAA 3H6WA 1POTA 1B5HA 4MH5A 5B7DA 2H5YA 4RA1A 1JVXA 4TLLB 5L9MA 2R9JA 5LOMA 1RYXA 2VOZA 1IQ7A 1LBBA 3IOTA 4DIGA 5DYHA 4QSCA 2QS3A 1JW5A 3KFMA 4IY6A 5L9SA 2I3VA 3JYRA 4G8MA 4QSEA 4GFRA 2UVHA 1A40A 2W7YA 1FQBA 3QK6A 4F2OA 5TPAA 2ONSA 3VVEA 1SBPA 3TCFA 3A3UA 4F2QA 2F7CA 2UXAA 3LC8A 2NOOA 1MH4A 2DP8A 1DTZA 4GLIA 5A5XB 1OQHA 1M5CA 4U4XA 2HQ0A 1B40A 3T96B 4U2RA 3C4MA 4R74A 3TQWA 3CSGA 1B58A 4LZ8A 4R72A 4OEUA 4PQJA 2F97A 4JWOA 3FV1A 3PMVA 3OEKA 3SEXA 5JEIA 3DM0A 1L5TA 5TP9A 2V3UA 3PUVE 4HS7A 4EDPA 4LQ5A 4P11A 3FATA 4NF5B 2HZKA 4G4PA 2UYFA 3KOTA 1URGA 2O84X 3O97A 2P1SA 1D3KA 1NNFA 4ZEBA 1MY4A 1JQFA 2PT2A 1NH8A 3H7MA 1B3GA 3O6IA 1CB6A 4LZ5A 3FVNA 3N5LA 2NWJA 3TQLA 3UA8A 2F34A 3MC2A 3LSLA 3TMGA 1P99A 1B46A 4YZZA 4F3GA 3EPEA 2HCAA 1B4ZA 3KG2A 4OENA 5CRYA 4XKQA 2I48A 1BIYA 1Z7NE 4QFPA 2DE3A 1FQAA 4R6HA 4KYDA 3EQ1A 3M3KA 3O6GA 5JK4A 2UVIA 5FHNA 1OQGA 3MVYA 2F5XA 2XXUA 3IORA 2IA4A 4NF6A 4GL0A 3KZGA 2F6GA 3KN7A 4EQ9A 3HN0A 3IOWA 1M5BA 4H67A 3BFTA 3K6WA 4IB2A 1A7LA 1B51A 3T9VA 3VVFA 3HV1A 2X26A 3V8XB 4XIGQ 4NWCA 3LSFB 3K2DA 2I6EA 2HXWA 3JV9A 2OCUA 2B3BA 3PPRA 4R6YA 3PPPA 1ZU0A 3SEUA 2QS4A 1VSOA 3B6WA 5DVJA 1US4A 2ABHA 1B2HA 3G3GA 1JW4A 2V25A 3QIMA 3H4ZA 1R6ZA 2XXXA 4IGTA 2VP1A 1N0TA 3PUZE 3RY3A 1P1UA 3PMWA 3MBPA 4F1YA 2PMSA 4PP0A 5KCJA 4QSDA 1MQJA 3MW0A 4H1XA 4QFKA 1VE4A 3Q28A 3EF7A 3OO9A 1IUDA 3N94A 2CMOA 4JBZA 5I59A 3KEIA 2I3WA 5ICTA 5ITOA 5DVIA 4G68A 5M2VA 4I8CA 2A5TB 3C9HA 5JTYB 3W15C 3V89B 2REGA 1LSTA 4JWYA 4BDMA 1MDP1 1MXVA 3OO6A 1MQHA 4RYAA 3SEWA 4IY5A 3H6VA 4OEVA 2I0BA 5I57A 4OETA 4U4SA 3RPWA 3PPQA 3T9UA 1QVSA 1P1OA 4RNSA 5EHSA 1IXGA 1GR2A 4LVQA 3FVGA 4WXJA 1S9TA 3TFLA 1S7YA 4KFQA 2O7UA 5ICQA 4G8NA 5J1DA 4X48A 3H3GA 3V83A 3FVKA 2XXYA 2ZNTA 1UIUA 4F1VA 1B3EA 5AA4B 3N6TA 1MXXA 2YJPA 3CI8A 3FXRA 2I4CA 4FE8A 3K4UA 4H8IA 1S50A 4E0XA 2DS9A 4ISUA 2XXHA 4OTEA 2Y7RA 2QJEA 2RCAA 3T9XB 4ZDMA 4X9TA 2OJTA 3N6UA 1I69A 2QMXA 5DVFA 4U21A 2ANJA 1D9YA 3OENA 3I5OA 3MPKA 2CZLA 1ELJA 1SYIA 2REJA 4Q8RA 2OWSA 3M3FA 4OFLA 5H8HA 2QPQA 4DZ1A 1QUJA 4E0WA 2Y7PA 1LBCA 4LQ2A 3SKPA 3QXMA 3FUZA 1AL3A 1MY1A 3U93A 3PPOA 1JETA 1A99A 4YB7A 2NXOA 2XXRA 1PBQA 3K02A 3K00A 3DP8A 2QL3A 1P1WA 4RK2A 2DWAA 3QUFA 4XXUA 4NF4B 3B6TA 4FEBA 1FQEA 3PPNA 3G3KA 4XTCQ 4K3FA 1B6HA 2D21A 2GHBA 4H65A 4M1VA 3VLVA 1FQFA 4YMAA 2ZXTA 2XXWA 5EHMA 4GXSB 4ESXA 4LZ7A 3TZAA 1XVYA 3CFXA 3OOAA 4BDQA 4DCYA 3IL1B 5ITPA 2Z8EA 2F6PA 1MQGA 3MQ9A 3SESA 3TCGA 1PB9A 4GWOA 1B05A 5CMMA 1BLFA 1D4NA 4LUBA 4OERA 1F9BA 3FV2A 3IR1A 1NFTA 3O29A 4OYVA 4KQPA 4F18A 2G93A 3FASA 4ND9A 4N13A 3TYHA 1B3HA 1GTKA 5CMBA 1XT8A 2H9BA 4F31B 5CM6A 5H8NB 2Y84A 4ZEKA 1JEVA 3ZS6A 3RQTA 2AL4A 1FQDA 2I4BA 5TPAB 1VR5A 2XX7A 3KSXA 3K6VA 2ZYNA 1MPDA 4H5FA 2XD3A 4QRZA 5AA3A 3DLNA 2RCBA 4QFOA 1URDA 1Y9UA 2G29A 4IO3A 3RTWB 1ZKBA 4DXCA 2H99A 3U1OA 3IO6A 2YPNA 3O28A 1HSEA 1OMPA 3MUQA 4LONB 3OO8A 3UK4A 2R6GE 2ZYMA 2H25A 3PD9A 1UTHB 1R9LA 2XXIA 3CVGA 3WAEA 5I2NB 4Q30B 3HHFA 2VD3A 1IIWA 1XC1A 4OZ9A 2XX8A 5B70A 5DEXB 3HCQA 2HAVA 4YKJA 3CFLA 3TTLA 3H06B 3CSBA 1NNPA 3IB2A 4YB6A 4ECFA 5KDTB 1QUKA 3TELA 5I58A 4Q5TA 2DVCA 5H8QA 1SDXA 4ZE9A 4MLQA 4F1UA 4JWXA 5I2KA 1P1NA 3TDJA 4GXAA 4IO7A 3I3VA 4FATA 4KPTA 4UA8A 2FNCA 4RJZA 2I49A 3B7DA 2AL5A 4PE5B 3Q27A 2Z8DA 1IEJA 2Y7IA 4KCCA 5ISUA 5L8DA 3Q25A 2WKYA 2DE4A 3KJ7A 4POXA 4F39A 4EQBA 1B1HA 4NF8A 1EU8A 1LAHE 3VVDA 2GRVA 3K1PA 3MWBA 4NF6B 2H98A 4NF5A 1FTOA 2DQVA 1TXFA 1SYHA 3IK6B 2BJJX 3OSRA 3PUXE 1Q35A 1IZ1A 4U1ZA 5I56B 1GGGA 3KJTA 1KWHA 1LAXA 1TWYA 4GRKA 3Q29A 3UIFA 1MQDA 5TU0A 5HPQA 1MPCA 3EHUA 3A3CA 4H5GA 1B7ZA 1O63A 1P1QA 4O3AA 1N84A 4R73A 2HEUA 3C34A 4IO5A 3ZKLA 3CG1A 4KD5A 4MBPA 4IO4A 1SVXB 1M5DA 2RF1A 3C36A 2RC8A 4OFOA 1SQYA 2XHDA 3MP6A 3PU5A 2B3FA 3RN8A 4X1BA 2Q9TA 2AYSA 3EHTA 4EF1A 1DSNA 1DPPA 2DXRA 2X7QA 4R75A 4PFYA 1QUIA 2F78A 4FJPA 1ATGA 3QAXA 3GZGA 5K2YA 3EN3A 3TTRA 3THIA 1BTJA 2HFBA 2P2AA 4F29A 3MVWA 4DDDA 4O3BA 1PEBA 3GBBA 1AMFA 2F8DA 1MXYA 1Y3NA 4F3PA 4GF8A 3U92A 2OZZA 5HM4B 2DOJA 3LR1A 2Q88A 4U23A 1LFGA 3CIJA 4OESA 1B4HA 4FECA 4U1OA 3RT6B 4BDOA 1JEUA 4G68C 4RK9A 1LGBC 2Q8JA 2RC7A 1UIVA 1UQWA 5IKBA 1A8EA 3K1NA 3E4RA 4ELOA 4NE4A 5I84A 3QSLA 4WEDA 4YKKA 3QYTA 5H8FB 1M5EA 1N7XA 4C0RA 4MFIA 2DE2A 1OVBA 3G3JA 2PX1A 4BDLA 1LB8A 5ELVA 4M4GA 5CBSA 3MP8A 3D4CA 3KBRA 1B0LA 2UVGA 3DP4A 4NTLA 3E3KA 3PV0E 5K2XA 1UTBA 1J1NA 3WAFA 3IJXB 3S9MC 4IO2A 1Y1ZA 3RNNA 1N3XA 3OMBA 3AXFA 1B0HA 5L9OA 4C1UA 1LAGE 2A5TA 3VLUA 2DSFA 4AB6A 4LP2B 3CG3A 5IAIA 1OLCA 3VXCA 1H76A 1TFDA 1MXZA 4NWDA 4BDNA 3SEVA 2O51A 5FTIA 2NVUB 1R1NA 4H0WA 3VFJA 3LSXA 4OFJA 1LFIA 3MZ1A 4RPOA 3E9XA 5DT6A 1B9JA 3ONMA 2F7BA 1QW0A 1T0KA 2ZNUA 2Y7WA 3N26A 4NMYA 1PBPA 1BKAA 1FTKA 1TT1A 3P7IA 1MPBA 5AA2D 4F22A 3FIRA 3M3LA 3SETA 5AA2A 4GVOA 1HSJA 2UYEA 4ELPA 1B5IA 3H6TA 2Y7KA 5AA1A 3OXNA 1OIBA 1I6BA 3RT8A 3L6GA 2DXYA 1ZJLA 2GHAA 1H45A 3HO7A 4ELQA 3G3FA 4G8HA 4I9DA 2ZMBA 4FAJA 3IO4A 4O3CA 4QF9A 4PETA 4F3SA 3FZVA 4ZZEA 1FTLA 4ZECA 2ONRA 1LAFE 4DXBA 1MXUA 1Q1KA 3PGFA 1CE2A 2ESNA 4P0IA 1LFHA 3MAMA 3PUWE 1PDAA 3U72A 2O7IA 1A8FA 1B32A 4FEDA 2H4IA 3KN3A 4ZEIA 2DWIA 1ANFA 3BBRA 2A5SA 4THIA 2VGQA 1DTGA 1JW1A 1XS5A 1QJMA 1NH7A 4ZS9A 1DMBA 2UVJA 4DCXA 1RYOA 4RXLA 5CI5A 4DLDA 3K1MA 3TCHA 3M8UA 1NMUA 3GXAA 1JNFA 2D5WA 3KSJA 3TAJA 2Q89A 4HCYA 3T9HB 2HZLA 2THIA 1SI0A 4NEDA 2DWJA 3FJGA 2QS2A 1MM6A 5FTHA 3TUSA 1WVJA 4EQ7A 3SERA 3K6XA 3OO7A 3O2AA 4HTGA 1YTVA 2IEEA 2DVZA 2V84A 1ZMGA 5H8NA 3GLBA 1XOCA 2HAUA 3S9EA 1EZPA 1B52A 4R9GA 3A09A 4FIMA 1DOTA 3FVOA 3VXBA 2F35A 5I58B 4TLMB 3MP1A 3CRBA 1I6AA 5H8QB 5TP9B 3KOSA 1YPNA 4ZEFA 1B7HA 4EF2A 3K6UA 2I58A 1Y20A 1XVXA 5I2KB 4I62A 2KLFA 3U8QA 5DTBA 1SW1A 1AH5A 1AIVA 1B7UA 4QFLA 2QRYA 4U22A 4GOTA 3HSTA 3R26A 1WODA 4H8JA 3K0VA 4GIZA 4TOZA 4KR5A 2XXQA 2Z23A 3R6UA 4MF3A 2XX9A 3ILTB 1MY3A 2YLNA 1VFEA 3IOVA 1UTHA 1GV8A 2PBWA 4C1TA 5A5XA 5I2NA 2QSXA 4OWDA 2OK2A 1Y4TA 3G3IA 4NF8B 1D9VA 1MDQA 2F7AA 4R2FA 1A54A 1EH3A 1SI1A 3PD8A 4IO6A 5DEXA 4L17A 3MVXA 4IGRA 5H8SA 3HHGA 4EUOA 4OQOA 2PYYA 1Z7ME
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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