1SVXB

Crystal structure of a designed selected ankyrin repeat protein in complex with the maltose binding protein
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
369
structure length
369
Chain Sequence
b'GKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTGSGGTPG'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title High-affinity binders selected from designed ankyrin repeat protein libraries
pubmed doi rcsb
molecule keywords Ankyrin Repeat Protein off7
source organism Escherichia coli
molecule tags De novo protein/sugar binding protein
total genus 125
structure length 369
sequence length 369
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1svxB02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1svxB01
3KN8A 1EZPA 1QUIA 1LAXA 2XXQA 5BUUA 3KSXA 4TOZA 1QKBA 1O63A 1MXUA 3SEYA 5I2NA 4R9FA 5ITPA 5AA3A 4U4SA 1OLCA 4TLMB 3C32A 1LAHE 3DP4A 4WEDA 2OBGA 4GL0A 2NXOA 4BDNA 3K01A 1PBPA 4KYDA 2V3TA 4F39A 1Y3PA 1SDXA 3PUZE 4QSEA 2R6GE 1Y3QA 4MF3A 5F1QA 3VXCA 4EXKA 2DOJA 2IEEA 1Y9UA 3IJOB 1AOVA 2OWTA 4AQ4A 3LSXA 4ZEFA 1B4ZA 4IO3A 4R6HA 4KFQA 4XKPA 1NH7A 3PPRA 3OEMA 3MC2A 4PFYA 1D4NA 3TYHA 2OCUA 4OQOA 2QSXA 4U22A 5CMBA 1OQHA 4NWCA 1MPBA 5JTYB 4ZEBA 3G3HA 1B3LA 2FA7A 5CMMA 1B2HA 1A54A 3TQWA 2DP8A 3C33A 1QJMA 1B1HA 1MQIA 1N04A 2RCBA 4PFWA 3FVKA 2ZYKA 4OENA 3UN6A 1FCKA 2QL3A 2UYFA 5IAIA 1MDP1 5AA4A 4QSCA 1MY4A 3LSFB 1NNPA 2F97A 2Z8EA 4ELRA 1CE2A 3A3UA 3UP9A 2O7IA 4LVQA 4LONB 4U21A 3T9UA 1TXFA 4DXUA 2I3WA 2F5XA 1SD3A 4OHNA 2IA4A 3G3GA 4H1XA 1URSA 4MH5A 1IXCA 2I3VA 3TUSA 2PYYA 3CVGA 3T9HB 5H8QA 2H9BA 2UVIA 4IO4A 2F6PA 1JVYA 2ALUA 1B3EA 1SI0A 4OXVA 3ZKLA 3MVWA 3SKPA 5H8FA 1AH5A 3PUWE 3GLBA 2W7YA 5ICQA 3KZGA 3K6UA 4H6DA 1II5A 1UQWA 1NNFA 4YZZA 1KWHA 1GV8A 3VXBA 3U8QA 4GIZA 2Q9TA 4IGRA 5DT6A 2B3FA 3FGSA 4YAHX 3WAEA 5CC2A 3MUQA 1ZKBA 5I56A 4F19A 4H0WA 4QFOA 5DVIA 2DWHA 1ZLQA 4ZDMA 5AA2D 2O51A 3E3KA 3KOTA 5HBCA 2UYEA 4G8NA 5TP9B 3PUVE 4QF9A 4JDFA 2GFEA 3VLVA 4NMYA 3FVOA 1B52A 1IXIA 3PV0E 3TTRA 4NF4B 4C1UA 3OMBA 2I4CA 2O1LA 1PEBA 3TKDA 5TPAA 3R7XA 1LB8A 1MRPA 4WXJA 2D3IA 1R9QA 5I59A 1M5EA 3F11A 3CR9A 3G3JA 3HHFA 3Q29A 3KJ7A 3O6IA 3H6TA 4POXA 4G2ZA 2V84A 1FTMA 2F36A 1RKMA 2ZYOA 2ONRA 2O68A 4FE8A 4E0XA 2DWIA 4NF6B 2G93A 3K0VA 4FIMA 2F7BA 5H8HA 2R9JA 3W9VA 1N3XA 2XXHA 1AMFA 3KN3A 2R71A 1MY0A 3Q26A 1L5TA 3IORA 1M5DA 3S2VA 2VGQA 4RPOA 1VR5A 3P7IA 4LZ7A 2XX7A 1QULA 1A99A 1LFGA 3S9LC 1FQEA 5LOMA 3O9PA 3O97A 1AL3A 1LLSA 3M8UA 5JK4A 1WDNA 4ZZEA 3N5LA 3OD7A 4ZZAA 3HO7A 5I2KA 5DEXA 2XXWA 3CI8A 3PMVA 3ZKKA 2O6AA 1B7UA 3HN0A 1MM6A 4F1UA 4ZECA 4ZEIA 1SI1A 3C35A 3MPKA 3RLFE 4ZEDA 3LSWA 3VFJA 1PB7A 5ITOA 3OELA 1OVBA 3HSTA 4IY6A 2DE2A 5I58A 1VFDA 3Q25A 3FV1A 1SQYA 1B32A 1NFTA 1QKAA 2NWJA 4QFNA 3UORA 1FQDA 2Y7WA 4YB5A 1PC3A 3OSRA 4G4PA 1LGBC 2XXIA 2ZNTA 1UTHB 5TU0A 3L6GA 2H25A 5KDTB 2QS3A 2Y84A 1NL5A 3I6VA 3TCGA 3S9EA 3ODBA 4OETA 2F34A 2DWJA 4GRKA 5H8SA 3TCHA 4F3SA 5CRYA 2V3QA 4GVOA 3S9MC 4OZ9A 1H43A 4F31B 4JSOA 4OERA 4YICA 1I69A 5EHSA 3IO6A 1YTVA 1IXHA 1FQAA 1DPEA 1A8EA 2A5SA 3VV5A 2O7UA 4HCWA 1FQBA 3BFTA 1POY1 4U1ZA 1WVJA 2VHAA 3H6VA 3HHGA 4X9TA 1B5JA 1JW4A 5L9SA 3D4CA 4YMAA 4Z7EA 4MBPA 1US4A 4OEUA 1B7HA 2G29A 4IY5A 3FUZA 1ZIUA 2PMSA 2P1SA 5H8NB 3Q27A 1F9BA 1XVYA 3RGYA 1I6BA 1OIBA 1UIVA 4HW8A 2X26A 4X48A 1ZTYA 2KLFA 3K6XA 5AA2B 3H03A 3RY3A 1GTKA 4TLLB 2H98A 4WKMA 3E4RA 4DCYA 4KI0E 3N6TA 3B6QA 3PMWA 2O1MA 1TWYA 3S9NC 2VD3A 1QVSA 2D5WA 2I0CA 1A55A 4DLDA 1Y20A 3OO6A 1IZ1A 3IOVA 2E0SA 3B6TA 1AIVA 1LFHA 2Q88A 2OWSA 3TPAA 4FJPA 1NKXA 5CBRA 4LP2B 1ELJA 2Z23A 4F18A 2X7QA 1QUJA 1FQFA 3H6WA 1P1UA 1PB8A 3TTMA 4R75A 3UIFA 1BTJA 1M5CA 2ONKE 4XKNA 3W9WA 3IOTA 4ND9A 2Q2CA 1HSJA 2V25A 2HCAA 3V89B 2HQ0A 3Q28A 4LQ2A 5A5XB 2A5TB 2THIA 3UGWA 3IO4A 1D9VA 4RK2A 5L8DA 5TP9A 1P1NA 2F7CA 3G3FA 1FW0A 4O3BA 4THIA 1B51A 2DVZA 1SVXB 3MZBA 3QSLA 3LUYA 3O28A 4KPTA 1B5HA 3TDJA 1N3WA 1DPPA 1M5BA 3TFLA 3MBPA 4NF4A 1ANFA 4NF5A 4RPNA 4XIGQ 1MQDA 2H4IA 3R26A 1O7TA 4OESA 1DSNA 4PFUA 2RC8A 3O66A 4RYAA 5AE4A 3LC8A 3TTKA 3CFZA 2ZYMA 4JSDA 3I3VA 1BKAA 4R6KA 4NF6A 4U23A 2VD2A 4RXLA 2HFBA 3LBSA 2DQVA 2YLNA 4H8IA 4F1VA 3JV9A 5CM6A 5I57B 4F2QA 3PD8A 4R72A 3A09A 4YKJA 3SDFA 3N26A 2DWAA 1N84A 3IX1A 1HSEA 3C9HA 4LA9A 4POWA 2I48A 4JB7A 3H7MA 3K1PA 3B7DA 3ZSFA 4QFPA 1I6QA 1JNFA 3TQLA 5CMCA 4Q8RA 3BBRA 3G7WA 3MP1A 1XT8A 3L6HA 4LZ8A 4R2BA 3LR1A 4EUOA 3MWBA 4R74A 3H3GA 2XXVA 4AB5A 2ZMBA 1N7XA 1EZ9A 1H45A 4JWYA 2PT1A 3FV2A 3A3CA 4ZEKA 5K2XA 3GBBA 3FJMA 4GF8A 3KBRA 1MQJA 4I9DA 1MXVA 2Z8DA 2D21A 3HV1A 2F35A 2B3BA 3U1OA 3TCFA 3PU5A 1S50A 4JWOA 1YCJA 2RC9A 3C34A 4ISUA 4PP0A 2F78A 3SESA 4KCDA 1UTBA 3QYTA 1LCFA 3VVEA 3C4MA 1UTHA 3V5AA 4OEVA 3VLWA 2WKYA 4PETA 5KDTA 3U93A 4L17A 3IL1B 4M1VA 3C36A 4I62A 3TTNA 1DTGA 3KSJA 4G77A 4KD5A 1MXYA 4ZE8A 3T9VA 1POTA 4DE8A 1MM7A 2I0BA 3TELA 4FORA 1A8FA 4HS7A 3PD9A 4EQ9A 4RA1A 2FYIA 2XXRA 3OSQA 5IKBA 1H44A 3RTFB 1IIWA 1FTKA 2PBWA 5H8FB 2Q2AA 3IJXB 4MLVA 5HPQA 2RF1A 4LQ5A 4JBZA 2QPQA 3RT6B 1USYE 1OQGA 4YKKA 1Y4TA 4NEDA 2PVUA 4QHQA 3IAZA 1I6AA 1DOTA 3TTLA 3ILUB 5CBSA 1MY3A 5I56B 5H8NA 1JEUA 5FTHA 1IQ7A 2DE4A 2XD2A 1MXXA 1M5FA 1N0TA 1JW1A 4PE5B 2CZLA 2REGA 5DVFA 3DM0A 1SYHA 4ELOA 1CB6A 2O69A 4UACA 5FTIA 3OO7A 4NWDA 4DCXA 3N94A 1RYXA 5B70A 1JVXA 4P0GA 3PGFA 1A7LA 4X1BA 5DYHA 4H5FA 5FHMA 2LAOA 3EHSA 3H4ZA 3T9XB 1YAEA 3OENA 4R2FA 2H99A 5F7VA 2DXYA 3FXUA 4BDLA 4YB6A 1XVXA 4DDDA 5CMKA 4BDQA 1LFIA 3IOUA 2DS9A 3QUJA 4ESWA 1ZU0A 4BLAA 4ESXA 3OOAA 2M8CA 2XXUA 3SERA 3B6WA 3EF7A 3ZS6A 2GHAA 2ZNSA 2BJJX 3MZ1A 4KCCA 1XC1A 4R9GA 4KYEA 1OLAA 3DP8A 4OMBA 3JYRA 2Y7PA 1MPDA 1BIYA 2X7PA 1B05A 5A5XA 1O64A 1EH3A 3K6WA 2A5TA 3OO8A 4YKIA 2QRYA 1R1NA 2F8DA 2F7AA 4NF8B 3RT8A 3DP6A 5DTBA 4F3GA 5KCJB 3EPEA 4C0RA 4Z0IA 5I2KB 3TMGA 3USDA 5DEXB 4BDOA 2ZXTA 2V93A 1XHYA 2GH9A 2H5YA 4KYSA 3PUYE 5JTYA 4KHZE 3TAJA 4DZ1A 1DTZA 3RNNA 1IUDA 5L9MA 2ONSA 1US5A 1D3KA 1ZJLA 1FTLA 2YJPA 3FD3A 4G8MA 4H8JA 1HSLA 4O3CA 3V8XB 2F6GA 3MQ9A 2REJA 4RNSA 4O3AA 5I58B 3G3KA 2V3UA 1A40A 3PPOA 4NE4A 1QUKA 4OWDA 4YU0A 4R6YA 2OLBA 4IO2A 5B7DA 1B0HA 2UXAA 1XS5A 1P99A 1Q1KA 3QIMA 5I57A 4LUBA 1Y1ZA 2XXTA 1MY2A 1B3HA 1LBBA 4GFRA 4IGTA 5EYFA 4ONYA 1BLFA 3K02A 1Y3NA 3GBAA 4ECFA 3FATA 3SETA 3VVFA 2ANJA 3OEKA 4DIGA 4C1TA 2QS2A 2HZKA 1B3FA 4F1YA 1IXGA 3MZ9A 2HXWA 3H06B 3QXMA 4KR5A 5KZTA 4GQOA 4GLIA 3U72A 5I84A 2XHDA 3RN8A 3W15C 1URDA 1ATGA 3MP6A 3IK6B 2CMOA 3KGCA 4G68B 1EZOA 5EHMA 4GOTA 3SEXA 3UK4A 3O29A 2QS4A 4E0WA 4GD5A 3R6UA 3HCQA 3OXNA 2FNCA 3QUFA 5JEIA 4Q5TA 3VE1B 3VLUA 3VDFA 3CSGA 1MY1A 4GXSB 2ZYNA 1B46A 3TZAA 1IEJA 1Q35A 1P1OA 4H5GA 2B65A 1QW0A 1USYH 2NUVA 3KN7A 1RYOA 1MG1A 3ONMA 4FEDA 2YPNA 3GZGA 4K3FA 1FTJA 4IO7A 4HCYA 1B58A 5ISUA 1B4HA 2XXPA 3FASA 5M2VA 1MDQA 4U1OA 4FEBA 4ZE9A 1ZBMA 1JW5A 4EQ7A 2HEUA 4F22A 1P1QA 1SW5A 4YMBA 4HTGA 4EQBA 5FHNA 3K6VA 1PBQA 3PPQA 1Y4CA 3RQTA 2UVGA 2Y7IA 3KG2A 3IOWA 1GGGA 3T22A 1B40A 2QJEA 5I2NB 3QAXA 3PMXA 1TFDA 3MVZA 2NVUB 1H3DA 3IR1A 3M3KA 1T0KA 4QSDA 2PX1A 4F2OA 4M4GA 3MW0A 1P1WA 2PT2A 3T93B 2XD3A 3E9XA 4F3PA 1IITA 4P11A 1FTOA 2ZNUA 5CI5A 4PFTA 4X1DA 3CRBA 3MJNA 5ICTA 2AIXA 2I49A 4TQUQ 1MQHA 4XKRA 4LATA 2I58A 3ECRA 2XXYA 4H67A 3I5OA 1B5IA 4AB6A 3K00A 3O6GA 4P0IA 1TT1A 2ABHA 1SW1A 4DXCA 1SW4A 5K2YA 4F3BA 2DXRA 1B7ZA 2P0SA 2UVHA 4NF5B 3CFLA 1B0LA 1WODA 3MP8A 1LAFE 4YKPA 3T66A 2RKMA 3S4UA 1MXWA 1BP5A 2RCAA 4GXAA 3IB1A 1MH3A 4I1DA 5AA4B 3DLNA 3PPPA 1NMUA 4RK9A 1EU8A 3FVNA 4GL8A 1VFEA 2Z22A 1JQFA 3C31A 1SBPA 3TODA 2OK2A 3FIRA 5H8QB 3CG1A 3KJTA 4XTCQ 3SEVA 5HM4B 4IO6A 4Q0CA 2P2AA 1N76A 3H6UA 4LZ5A 1R9LA 1GR2A 4OTEA 3OO9A 2AYSA 4DXBA 3IB2A 3MAMA 1DMBA 3LSLA 4JWXA 1N7WA 3M3LA 4N6PA 3N6UA 4G8HA 3RUMA 1PDAA 1FQCA 5FHOA 3CIJA 2XXXA 3KFMA 4RY1A 3MVXA 4NF8A 4FAJA 4N13A 4EDPA 2QS1A 5KCJA 2DSFA 1MH4A 2ESNA 2HAVA 2VOZA 2E1SA 3EHUA 4F29A 2HZLA 3CSBA 2Z8FA 4Q30B 4R73A 5AA2A 3BKIB 3O2AA 1UIUA 4XKQA 1MXZA 3RTWB 3FXQA 3VVDA 3FJGA 3SEWA 4YB7A 1B3GA 2AL4A 2AL5A 3FVGA 4FECA 2Q8JA 3O6HA 3RPWA 4EXLA 4ELPA 3MPLA 4QFKA 3MVYA 5TPAB 1OVTA 2Y7RA 3FJ7A 3V83A 3BFUA 5DVJA 2DVCA 3CG3A 5I59B 3PPNA 5ELVA 1B6HA 2UVJA 2GHBA 1B9JA 4EF2A 4OVJA 4FATA 1UTBB 1YPNA 1JETA 4QFLA 1D9YA 2XX8A 4OYVA 3AXFA 5H8HB 2OJTA 4IB2A 1ZMGA 3GXAA 1Y1MA 3UA8A 3K2DA 4MFIA 3U92A 1LB9A 4PQJA 1JEVA 1NNKA 1SYIA 1XOCA 2DYXA 4OFLA 3SEUA 3FZVA 4I8CA 3EN3A 4NTLA 1VE4A 4U2RA 4JXIA 5J1DA 1URGA 3K1NA 3KOSA 4G68A 5AA1A 2GRVA 1S9TA 2QMXA 3WAFA 2HAUA 3G3IA 4EF1A 3HPIA 4BDMA 1MPCA 1LBCA 3DELB 1S7YA 2I4BA 4H65A 3PUXE 4RJZA 1H76A 4IO5A 3U94A 1TFAA 5L9OA 2XX9A 4QRZA 4GWOA 2O84X 3K1MA 1R6ZA 4N07A 1MQGA 3THIA 1LAGE 2I6EA 1Z7NE 1PB9A 4MLQA 2RC7A 1VSOA 4WEPA 5BWJA 4OFOA 2DE3A 4OFJA 1SW2A 4G68C 3CFXA 2QMWA 2VP1A 3D4GA 3K4UA 2RINA 1LSTA 4UA8A 1J1NA 2Y7KA 3TEPA 3KEIA 3FXRA 3JZJA 1B1XA 1NNTA 1MS7A 3E13X 1GVCA 2Q89A 4U4XA 4ZS9A 3ILTB 1LCTA 1Z7ME 4XXUA 3EQ1A 3QK6A 3IB0A 1OMPA 3M3FA 2OZZA 4BDRA 3T96B 2NOOA 1NH8A 3EHTA 4KQPA 4ELQA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
3KN8A 5EYHA 1EZPA 1QUIA 1LAXA 2XXQA 5BUUA 3KSXA 4TOZA 3KBZA 1QKBA 1O63A 1MXUA 3SEYA 5I2NA 4R9FA 4O7IA 5ITPA 4N6KA 5AA3A 2L5VA 4U4SA 1OLCA 1IMAA 2CZHA 4TLMB 3C32A 4P56A 1LAHE 1Q9DA 3DP4A 4WEDA 1K9YA 3LUZA 4AS5A 2OBGA 4GL0A 2NXOA 4BDNA 3K01A 1PBPA 4KYDA 2V3TA 4F39A 1Y3PA 1SDXA 3PUZE 4QSEA 2R6GE 1Y3QA 1DCUA 4MF3A 5F1QA 3VXCA 4EXKA 2DOJA 2IEEA 1Y9UA 4NN3A 3IJOB 1AOVA 2OWTA 4AQ4A 3LSXA 4ZEFA 1B4ZA 4IO3A 4R6HA 1FPEA 4KFQA 4XKPA 1LBWA 1NH7A 3PPRA 3OEMA 3MC2A 4PFYA 1D4NA 2DDKA 3TYHA 2OCUA 4OQOA 2QSXA 4U22A 5CMBA 1OQHA 4NWCA 3PTYA 1MPBA 5JTYB 4ZEBA 3G3HA 1B3LA 2FA7A 4NX1A 5CMMA 1B2HA 1A54A 3TQWA 2DP8A 3C33A 1QJMA 1B1HA 1MQIA 1N04A 2RCBA 4PFWA 3FVKA 2ZYKA 4OENA 4UABA 3UN6A 1FCKA 2QL3A 2UYFA 5IAIA 1MDP1 3T1BA 1NV7A 5AA4A 4QSCA 1MY4A 3LSFB 1NNPA 1FBDA 2F97A 2Z8EA 4ELRA 1CE2A 3A3UA 2PFYA 3UP9A 2O7IA 4LVQA 4LONB 4U21A 3T9UA 1TXFA 4DXUA 2I3WA 2F5XA 1SD3A 4MCOA 4OHNA 2IA4A 3G3GA 4H1XA 1URSA 4MH5A 1IXCA 2I3VA 3TUSA 2PYYA 3CVGA 3T9HB 5H8QA 2H9BA 3T0JA 2UVIA 4IO4A 2F6PA 1JVYA 2ALUA 1B3EA 4PC9A 1SI0A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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