1SVXB

Crystal structure of a designed selected ankyrin repeat protein in complex with the maltose binding protein
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
369
structure length
369
Chain Sequence
GKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTGSGGTPG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title High-affinity binders selected from designed ankyrin repeat protein libraries
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags De novo protein/sugar binding protein
molecule keywords Ankyrin Repeat Protein off7
total genus 125
structure length 369
sequence length 369
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1svxB02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1svxB01
1PB7A 3N26A 5CMKA 4R9FA 4F3BA 1DSNA 3QUFA 1BLFA 4H67A 2A5TB 3PD8A 4YB7A 5I59A 3OEKA 1IEJA 1Y20A 2IA4A 3C33A 3UGWA 2DQVA 1EH3A 3HV1A 4R73A 4Z0IA 4FAJA 1R6ZA 4HCWA 2V3QA 4H5FA 4OTEA 4G77A 2OZZA 2PMSA 1Y4CA 3GZGA 1SQYA 4O3CA 4PP0A 2XX9A 3TELA 3MVWA 3T22A 4OENA 2Q2AA 1BTJA 1HSJA 2AIXA 2H9BA 1IXHA 3DM0A 4G68B 3CI8A 4G8HA 1XS5A 4QF9A 3SEXA 3UN6A 3IO6A 4F1YA 2UYFA 5CBSA 3ECRA 1UIUA 3OSRA 2RKMA 1LGBC 1IUDA 1WVJA 4NF5B 5I56B 1S50A 1LB9A 1D9YA 1MG1A 2OWTA 3CSBA 3H4ZA 4RPNA 4NWDA 1B5JA 3CFLA 3KBRA 5CMMA 1D4NA 2Z8DA 3S2VA 3OMBA 4MLQA 1D9VA 2Q88A 5L9SA 1OVBA 1B4HA 4YMBA 4ZECA 3FIRA 1S7YA 3FVKA 4OFOA 4PFYA 2RINA 3O97A 3T66A 2V25A 1UTBB 2GRVA 2QMXA 2D3IA 2YPNA 4Z7EA 1P99A 1MPDA 1NH7A 3C36A 3OO9A 1H45A 4GQOA 3A3UA 4N6PA 4PE5B 4R74A 2GFEA 1LLSA 2XXYA 1QULA 3PUYE 3UP9A 4I1DA 3H6VA 1VFEA 2XXUA 3FV2A 2P2AA 2NWJA 2I48A 3UK4A 3MVXA 3W15C 3N6TA 5L9MA 3B6QA 4HW8A 1UQWA 4NF4B 2HQ0A 5HM4B 4YKPA 1USYE 2CMOA 2WKYA 2XXXA 5FHOA 3K6WA 3TZAA 3K00A 4IO3A 2HAVA 3CIJA 1R1NA 5I2KB 2Y84A 3HCQA 1GVCA 1DPPA 3WAFA 3G3IA 2PT1A 1NNTA 5F1QA 5AA1A 2Q9TA 4RJZA 1MY4A 4G2ZA 3K02A 3TUSA 1H3DA 4JBZA 2D21A 4DLDA 1BIYA 1NKXA 2QS1A 2Z23A 5K2XA 4XKNA 4IB2A 4FATA 4GVOA 1LAHE 1POTA 2XXTA 3MP1A 1SI1A 1FTKA 3CFXA 3FATA 3FXRA 1RYOA 3O6GA 4OESA 1MM6A 5K2YA 3U72A 1B3EA 2B3FA 4NF8A 2ZNSA 3G3HA 3IB1A 2X7QA 1VFDA 2AL4A 3DP6A 1XVXA 4OETA 4RXLA 4HS7A 4XXUA 1R9LA 2Q8JA 1B3LA 1PBPA 3KSJA 5I58B 2O84X 5DEXA 5ITPA 3OO7A 4Q8RA 3KOTA 1LAFE 1A7LA 2DVCA 1US4A 4GLIA 4LUBA 5A5XB 4OYVA 1FW0A 2DSFA 5CC2A 2QS2A 4FECA 2PYYA 3KG2A 2ZXTA 3SKPA 3MC2A 5AA2B 4H65A 4ELQA 4JDFA 2A5TA 1I6QA 3IB0A 4LQ2A 3TTLA 4KCDA 4OHNA 4AQ4A 3LR1A 4DIGA 2DS9A 1B52A 3T9UA 5H8NB 5KCJB 3O2AA 3GLBA 1CB6A 3ODBA 3VE1B 1MQJA 4PETA 4F1VA 4XKQA 3U94A 4BDNA 4ZE9A 1GR2A 4M1VA 3TMGA 1USYH 3CVGA 2RC9A 4DXUA 5AE4A 3E9XA 3K1NA 3KGCA 2ANJA 4QSDA 4ZDMA 3MJNA 5I56A 4QSEA 1I6BA 2QS4A 1AH5A 2DXRA 1I69A 3IOUA 4MF3A 1TT1A 3PD9A 4HCYA 3U8QA 1FQDA 2ABHA 2VD3A 4RYAA 2GH9A 2ALUA 4G4PA 4G68C 1H44A 4YB5A 1Y3NA 2V3TA 1MXYA 3K6VA 3O66A 1LCTA 4GRKA 3OSQA 4KI0E 4U4SA 3RGYA 1UTBA 1OLAA 3EHTA 3DP4A 2F35A 1SYHA 3A09A 2P0SA 2V84A 4GIZA 4U1OA 3G3GA 1CE2A 1QJMA 3FUZA 3JV9A 3LUYA 4O3BA 4RK9A 5TU0A 5B70A 1M5BA 3ILUB 3C9HA 3E3KA 2F5XA 3MQ9A 1FTLA 3WAEA 1A40A 5L9OA 2Y7RA 4BDLA 2D5WA 3CRBA 4IGRA 4UACA 3SESA 2XXHA 3MUQA 1MQHA 1NMUA 3TTMA 5JEIA 3B6WA 3MWBA 2OCUA 3GBAA 1MH4A 1MQDA 4ZEFA 4GL0A 1SI0A 2Z8EA 1MDP1 4BDOA 3CFZA 2F6PA 5CBRA 1N0TA 4H6DA 3I6VA 5LOMA 1MY3A 3OELA 4DE8A 5TP9B 4ELPA 5H8QA 1RKMA 5ITOA 2P1SA 1ZMGA 3FVOA 1N3XA 3O6IA 4WEDA 3SDFA 3THIA 4EF1A 4YKKA 4EXKA 1XT8A 4TOZA 2I3WA 1UTHA 2ESNA 2R71A 4RK2A 1D3KA 4X1DA 3S9LC 3TEPA 1JEUA 4AB5A 2DWJA 3M3KA 1N76A 4F18A 2I0CA 3FXUA 1ZKBA 3QIMA 4LZ7A 3RY3A 2QMWA 3KZGA 3KJTA 3OENA 3RTFB 3C4MA 1H76A 3OXNA 2HAUA 1J1NA 3KN3A 2HZLA 4LATA 1A54A 1IITA 5A5XA 1YAEA 1FTOA 3HN0A 3K6UA 3G3JA 1IQ7A 1IXIA 4E0WA 5I84A 2DVZA 1EU8A 4BLAA 3FJGA 1MXWA 3TTRA 4R9GA 1IZ1A 5DTBA 4WKMA 2OK2A 1B3FA 1ZU0A 3K6XA 3GBBA 5AA3A 3Q27A 4ONYA 4OEVA 1NL5A 2UVGA 3KEIA 4F39A 1P1UA 1YPNA 3QK6A 4FEDA 4GOTA 4ESWA 1P1NA 1B2HA 2QL3A 1XC1A 1US5A 2RC7A 4YAHX 5KCJA 5KDTA 4KPTA 3CR9A 3QXMA 1N04A 3R26A 4NF6A 5HPQA 1FQAA 4ND9A 3G3KA 1LAGE 2XXRA 2NVUB 3U1OA 3FVGA 3K4UA 3KFMA 2OBGA 4MLVA 4F2OA 3IORA 1MPCA 2O6AA 3CSGA 3H06B 2XXPA 3IOTA 4IO6A 3MAMA 3C31A 3M3FA 3VLVA 2Q89A 4ISUA 1NNKA 1MXZA 1SVXB 3MVZA 1II5A 2O51A 2O7UA 2XXQA 3MZBA 1URSA 4Q5TA 4DXBA 4FJPA 3BFTA 3H3GA 1DPEA 3CG3A 1QUJA 5BUUA 3OD7A 1MM7A 3H03A 1M5CA 1MPBA 4U2RA 1B9JA 3IB2A 1T0KA 1SYIA 2I4CA 1YCJA 3D4CA 2VGQA 3ZKKA 4MBPA 4DDDA 2LAOA 4GF8A 4TLLB 3LSXA 4E0XA 3O28A 1LBCA 1OQGA 2DE2A 2DOJA 1N84A 4NTLA 2Y7PA 1JW5A 2O1LA 1B0LA 1M5DA 1OVTA 1LAXA 4R75A 2NUVA 1I6AA 4G68A 3U93A 4X9TA 4QFNA 3TCFA 4POWA 1N3WA 4LZ5A 5ICQA 1O64A 2UYEA 3K2DA 1R9QA 4JSDA 4R2BA 4EQBA 1MY2A 1ATGA 5I57A 5CRYA 3PPPA 4KYEA 3PPRA 2QRYA 1OIBA 1Y3PA 3R6UA 3SEUA 5AA2D 4RA1A 1MQGA 3RN8A 1SW5A 2E1SA 2UVHA 5TP9A 5H8FA 3MP8A 3ZS6A 1P1OA 1VR5A 3N94A 3GXAA 2DP8A 4PFWA 4YMAA 3PUWE 2DE3A 4JWXA 1MY0A 1NNFA 1SDXA 5DVIA 2PT2A 2O68A 3B7DA 1JW4A 3PMXA 4IO7A 3O6HA 1VSOA 1Z7NE 3KN7A 1A99A 2M8CA 4QFKA 3W9VA 1ZTYA 3MZ9A 4IY6A 3PGFA 2XX7A 3ILTB 4Q30B 3B6TA 4KFQA 5TPAB 3UORA 5B7DA 5FTHA 3TKDA 3K01A 3C32A 3DELB 1BP5A 4NF4A 1SW4A 3N6UA 4ESXA 1UIVA 3OO8A 4GXAA 3TPAA 2ZYKA 3IL1B 3VVFA 1F9BA 4F31B 5EHSA 4POXA 4YB6A 3PUXE 1A55A 4ELRA 3PPQA 4BDQA 2QPQA 3UA8A 4YU0A 3OO6A 3TFLA 2HEUA 2I3VA 4ZS9A 2ZYOA 3SEYA 4MH5A 1HSEA 1SW2A 4WXJA 4KD5A 5FTIA 1LCFA 1KWHA 3TCHA 3I3VA 2X7PA 4BDMA 4DZ1A 2DXYA 5DYHA 1Q1KA 3VXBA 1SBPA 1TFAA 3CG1A 2KLFA 1XOCA 4RNSA 1P1QA 5KDTB 1B1HA 2XD3A 3RNNA 1URGA 4H8IA 5I59B 3MVYA 3QYTA 4QSCA 4M4GA 4YKIA 2PVUA 2F78A 3S9NC 2FYIA 1TFDA 2VD2A 1B7HA 2I49A 2VOZA 4F1UA 4F29A 4NEDA 1MDQA 2G29A 3MZ1A 3Q28A 5CMBA 1B4ZA 4YKJA 3I5OA 1HSLA 1MRPA 4DXCA 1MXVA 3C35A 5H8HA 3H6WA 3PU5A 2F7CA 2F8DA 3T9XB 4EF2A 4OQOA 3O9PA 3JZJA 3VDFA 4IO4A 3TCGA 1IXGA 3BBRA 3K1PA 2IEEA 4U1ZA 1M5FA 1BKAA 1FTJA 2A5SA 4QHQA 1OLCA 4UA8A 2XD2A 2YJPA 4G8NA 1Z7ME 1Y1MA 4LQ5A 1OMPA 2HCAA 4G8MA 3PMVA 4L17A 3RT6B 2UXAA 3IJOB 1PDAA 1L5TA 5H8NA 4F3PA 4PFTA 1B3HA 1B7UA 2F97A 1B32A 3LC8A 1LSTA 2RF1A 4DCYA 3HHGA 4GL8A 1B3GA 3FZVA 3IAZA 2BJJX 4U4XA 5DVFA 2DWAA 4OFLA 1GTKA 4OFJA 2XXVA 5F7VA 3VLWA 3FJ7A 1JW1A 1DOTA 1M5EA 4U23A 5JTYB 3SERA 3DLNA 2RC8A 1B40A 3DP8A 4TLMB 1WODA 1XHYA 4O3AA 3RQTA 2B65A 2R6GE 3PV0E 4Q0CA 2ZYNA 4ZE8A 1B1XA 1MH3A 2YLNA 3OEMA 4QRZA 5I2KA 3ONMA 3P7IA 2F36A 2NOOA 4FE8A 1B7ZA 4IO2A 4LP2B 3T93B 2VP1A 2I6EA 4OXVA 3M8UA 3V5AA 2REJA 5BWJA 2O7IA 2F34A 2HZKA 5I57B 1IIWA 2UVIA 3U92A 1DTZA 5EHMA 3MW0A 1LFIA 1TXFA 5FHMA 3R7XA 4F3SA 1Y9UA 1B0HA 3M3LA 3Q26A 3RTWB 4KR5A 1P1WA 1MY1A 2GHAA 4KYSA 4LONB 1AIVA 5CM6A 2Y7IA 1ZIUA 4ZEBA 2DE4A 1OQHA 4N13A 3MP6A 2B3BA 3ZKLA 3MPLA 1EZ9A 3E13X 2PBWA 3OOAA 3SEWA 2H25A 1A8EA 3EHUA 3RUMA 4ZEDA 3T9HB 2OWSA 1SD3A 1DMBA 1NH8A 2H98A 3QUJA 3IK6B 5DEXB 3EQ1A 4PQJA 2DWIA 4RY1A 1MS7A 4F3GA 2ZNUA 1FQCA 4F2QA 5H8QB 3KN8A 3UIFA 5DT6A 2PX1A 1AOVA 3S9EA 4I62A 2UVJA 3LSWA 4K3FA 5CMCA 5FHNA 4TQUQ 2ONRA 4MFIA 3S4UA 4XTCQ 2R9JA 4JWOA 1UTHB 3SEVA 3FD3A 3VLUA 5AA2A 4KYDA 4GWOA 3FGSA 3FVNA 4F19A 5ELVA 1B5HA 1JQFA 3VXCA 4NMYA 1H43A 1S9TA 2FA7A 3H6UA 5M2VA 4I9DA 1FQFA 2ONSA 3K0VA 3N5LA 3FASA 4LVQA 1PEBA 3TYHA 4EQ9A 3EF7A 3Q29A 5H8HB 1FQEA 4OEUA 2F6GA 1QUKA 1PC3A 3FXQA 4R2FA 3IR1A 2Y7KA 1JNFA 3ZSFA 3HSTA 4RPOA 4IGTA 4N07A 1B51A 4C1TA 1LBBA 2I0BA 3HO7A 3VVDA 3FJMA 2O1MA 3Q25A 3PUZE 3IJXB 5I2NB 3L6HA 4OVJA 4H5GA 5AA4B 2F7BA 2XXWA 1QVSA 2O69A 1FTMA 4KHZE 4P0IA 4XKRA 3O29A 5EYFA 4ELOA 3TQLA 1SW1A 2QS3A 4GFRA 5CI5A 4IO5A 1ANFA 1VE4A 4HTGA 1MXUA 2ZMBA 2XHDA 1JVXA 4NF6B 4R72A 2THIA 1EZOA 4FIMA 3TQWA 2RCBA 3BFUA 3LBSA 4X1BA 2H5YA 3KOSA 1URDA 4XIGQ 3PPNA 5JTYA 1FCKA 1N7XA 1WDNA 4WEPA 3RLFE 4ZZEA 4F22A 1MQIA 3KSXA 4FORA 5KZTA 3G7WA 1DTGA 3IOVA 3E4RA 3IX1A 1JVYA 4OZ9A 1O7TA 1JETA 1B58A 1QKBA 3H7MA 4X48A 3VVEA 4R6KA 1ZLQA 3LSFB 3VFJA 1PB9A 1PBQA 1N7WA 4NF5A 4H0WA 3RPWA 2VHAA 3SETA 3VV5A 3LSLA 4GXSB 4OMBA 1Q35A 1PB8A 4U22A 4NE4A 1LFHA 2I58A 2Q2CA 3MBPA 2G93A 2AYSA 3RT8A 2W7YA 3TTKA 3EN3A 3V89B 4JXIA 4THIA 2QJEA 3MPKA 4YICA 1B46A 1NNPA 2V3UA 5L8DA 1RYXA 1EZPA 1IXCA 1B05A 2ZNTA 1A8FA 4I8CA 3W9WA 3KJ7A 4GD5A 5ICTA 5IKBA 2NXOA 4R6YA 5H8SA 2DWHA 3JYRA 2AL5A 1JEVA 1GV8A 1POY1 2REGA 4EXLA 2RCAA 4JWYA 4DCXA 1LB8A 3TAJA 2QSXA 4QFLA 2HXWA 5HBCA 4KQPA 2H99A 4BDRA 2Z8FA 1ZJLA 1ZBMA 3H6TA 4KCCA 4EUOA 5JK4A 4YZZA 2F7AA 2XXIA 3TTNA 5H8FB 4PFUA 2HFBA 2H4IA 1NFTA 2OLBA 2ZYMA 4C0RA 1TWYA 3F11A 3PMWA 3PPOA 4U21A 1XVYA 3AXFA 1GGGA 1QKAA 2Y7WA 4ZZAA 3QAXA 3TDJA 1AMFA 5ISUA 2Z22A 4QFPA 1LFGA 3HHFA 2E0SA 1B6HA 3USDA 4EDPA 3TODA 4FEBA 1YTVA 1B5IA 4IY5A 3IO4A 3A3CA 5TPAA 3EPEA 4LA9A 2FNCA 4P0GA 3L6GA 3QSLA 4H8JA 4JB7A 4OERA 5DVJA 1QUIA 4ZEKA 4NF8B 2I4BA 4XKPA 1AL3A 3V8XB 4QFOA 4EQ7A 1Y3QA 3K1MA 4NWCA 4ZEIA 2GHBA 2CZLA 4C1UA 4AB6A 1O63A 2XX8A 1ELJA 3V83A 2DYXA 1Y1ZA 3D4GA 4R6HA 2ONKE 2OJTA 3G3FA 4P11A 5IAIA 3T9VA 5I58A 3BKIB 3IOWA 4LZ8A 5I2NA 5J1DA 3T96B 4JSOA 2X26A 3PUVE 5AA4A 1MXXA 1Y4TA 3HPIA 2V93A 1FQBA 4OWDA 3S9MC 3EHSA 3C34A 4ECFA 1QW0A 3FV1A 4H1XA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1PB7A 4F3BA 1DSNA 1SPIA 1BLFA 2A5TB 3PD8A 1IEJA 1Y20A 3HV1A 1EH3A 4HE1A 4FAJA 1R6ZA 3HFUA 4G77A 2OZZA 4O3CA 3GZGA 3T0JA 2XWVA 2Q2AA 1HSJA 4OENA 3CI8A 4G8HA 5CC2A 3ECRA 1UIUA 5IM2A 5CMMA 1FPEA 2Z8DA 3S2VA 4ZECA 3FVKA 3O97A 2GRVA 2D3IA 4Z7EA 3OO9A 4PAKA 1H45A 2XXYA 3PUYE 1QULA 4I1DA 4PF8A 2NWJA 3UK4A 2MKZA 4X04A 3E79A 1UQWA 5HM4B 2WKYA 5ET7A 5FHOA 3CIJA 2Y84A 2PT1A 4PBHA 4JBZA 4DLDA 2QS1A 4N8YA 1K9ZA 1LAHE 1POTA 2XXTA 3FATA 3O6GA 4OESA 2ZNSA 2X7QA 1XVXA 4RXLA 4XXUA 1R9LA 5ITPA 4Q8RA 1US4A 4HXVA 2B4MA 1D9QA 3SKPA 4P8BA 4H65A 4LQ2A 4OHNA 4AQ4A 1B52A 5H8NB 3ODBA 4MMPA 4XKQA 3U94A 1GR2A 3CVGA 1NV3A 4MF3A 4HCYA 1FQDA 4RYAA 2GH9A 2ALUA 4G68C 1FTAA 1H44A 4YB5A 1NUXA 1Y3NA 1LCTA 3OSQA 3EHTA 4N4UA 3DP4A 1SYHA 2P0SA 4U1OA 3G3GA 1QJMA 4KXPA 3FUZA 2BJIA 3LUYA 4O3BA 1M5BA 3E3KA 3MQ9A 3PTYA 1FTLA 4BDLA 3NOHA 3KC1A 3MWBA 3GBAA 5CMKA 5CBRA 1MDP1 4QBAA 1N0TA 4H6DA 1MY3A 3OELA 5TP9B 4ELPA 1N3XA 2QVUA 4YKKA 3S9LC 4TOZA 3TEPA 4O8MA 4RK2A 1JEUA 3B8BA 1N76A 2GQ1A 1NUWA 1H76A 2HAUA 2HZLA 4LATA 2ZZVA 4MAGA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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