1SVXB

Crystal structure of a designed selected ankyrin repeat protein in complex with the maltose binding protein
Total Genus 125
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
125
sequence length
369
structure length
369
Chain Sequence
GKLVIWINGDKGYNGLAEVGKKFEKDTGIKVTVEHPDKLEEKFPQVAATGDGPDIIFWAHDRFGGYAQSGLLAEITPDKAFQDKLYPFTWDAVRYNGKLIAYPIAVEALSLIYNKDLLPNPPKTWEEIPALDKELKAKGKSALMFNLQEPYFTWPLIAADGGYAFKYENGKYDIKDVGVDNAGAKAGLTFLVDLIKNKHMNADTDYSIAEAAFNKGETAMTINGPWAWSNIDTSKVNYGVTVLPTFKGQPSKPFVGVLSAGINAASPNKELAKEFLENYLLTDEGLEAVNKDKPLGAVALKSYEEELAKDPRIAATMENAQKGEIMPNIPQMSAFWYAVRTAVINAASGRQTVDEALKDAQTGSGGTPG
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Ankyrin Repeat Protein off7
publication title High-affinity binders selected from designed ankyrin repeat protein libraries
pubmed doi rcsb
source organism Escherichia coli
molecule tags De novo protein/sugar binding protein
total genus 125
structure length 369
sequence length 369
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
B PF01547 SBP_bac_1 Bacterial extracellular solute-binding protein
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1svxB02
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1svxB01
2FNCA 1BP5A 3KFMA 5FTIA 4RK9A 4O3CA 2XXUA 5I56B 1UIUA 4NWCA 4JXIA 3DLNA 2F6PA 2ZYKA 3O97A 5I56A 4H8IA 1Q35A 4U4XA 2REJA 4RPNA 5KCJB 4LZ5A 4IO3A 2G29A 4GLIA 1D4NA 5H8QB 1LSTA 2RC7A 1MPCA 3G3FA 4JSDA 3UN6A 4YU0A 1URSA 1IXCA 1MH4A 1FQBA 4JBZA 4IO6A 2QJEA 3GBAA 3K01A 2R71A 4I62A 2DE2A 2ZNSA 3OO6A 1HSEA 5LOMA 3CSBA 1MQDA 4GL8A 4PFTA 2F78A 1EZOA 4FJPA 2XXHA 4OFOA 1NH7A 3PPRA 5TP9A 5K2XA 4U21A 2DP8A 5DYHA 4MLQA 5I84A 3IOUA 2GRVA 5B7DA 1LAFE 4NTLA 4YKPA 4G77A 5L9SA 3RN8A 4LZ7A 5DVIA 2O1MA 2VD2A 2UVIA 2O69A 3FIRA 1XVYA 5CMMA 3OEMA 2OBGA 2YPNA 3FVKA 1Q1KA 1MPDA 4QRZA 1BIYA 2F7AA 2O7IA 4PFYA 2UYFA 3SESA 4XKNA 4EXLA 3C32A 5AA2A 2X7PA 5HM4B 2XHDA 4M1VA 4Z0IA 4K3FA 4NF4B 5B70A 1B46A 2KLFA 1ZJLA 4MF3A 3O29A 5H8FA 5L9MA 4IGTA 4F3PA 1EU8A 5CI5A 3KOSA 1M5CA 3O28A 2Z8EA 1FTOA 2Z8DA 1P1NA 3PUXE 1MY0A 1LFGA 1B05A 2ZNUA 1VR5A 5TPAA 3TZAA 3Q26A 3KEIA 4O3BA 1TFDA 1JNFA 1QUJA 1M5FA 4FECA 1GTKA 1QW0A 3RLFE 3MBPA 5M2VA 4HS7A 3O66A 5AA2D 5EHSA 3B6WA 1IXHA 3GBBA 4F31B 1DMBA 4OMBA 2RC9A 1LCTA 3C31A 4EF1A 1MRPA 2QMXA 2B3BA 3FXQA 3SEYA 4M4GA 4Q8RA 4FATA 3CVGA 4HTGA 1ELJA 3V89B 4G68B 4GXAA 4NF5A 5K2YA 3S9EA 4GOTA 1B3EA 1JEUA 3LBSA 3T9XB 1I6BA 5TU0A 3CI8A 3U92A 5HBCA 3LUYA 4BDRA 1DSNA 3IB2A 3VXCA 2F34A 4DLDA 4OESA 2XXTA 2ESNA 2OJTA 3V5AA 3R6UA 1SYIA 4PFUA 1A40A 1S7YA 1EZ9A 1B5HA 5DEXB 1AL3A 4GXSB 3PPNA 2B3FA 1PEBA 1QUIA 4Q30B 3PD8A 3RTFB 5DEXA 1SI0A 4POXA 4QSEA 3IB1A 3G3JA 2VOZA 3VFJA 3LSFB 3KJTA 3RUMA 4TQUQ 3W9VA 3O6IA 2GH9A 2XXXA 4PP0A 3KJ7A 3FGSA 2FYIA 3IX1A 1PB9A 5DT6A 4G2ZA 3TUSA 1UTHB 4KYDA 5AE4A 2DYXA 4I1DA 4O3AA 1S9TA 4BDMA 1Y1ZA 1Y4CA 4ELOA 2ANJA 3TFLA 1B3LA 3DP4A 4F1UA 4U22A 3S9LC 5FTHA 3KSJA 3DP8A 5JTYA 1N04A 4JWYA 1JVYA 3TTMA 5L8DA 1M5EA 3O2AA 3VXBA 1MQIA 2V3UA 1HSLA 1FTLA 3EHSA 4TLLB 3FJGA 3OSRA 1Y4TA 4DCXA 4X48A 2F97A 3V8XB 4ECFA 2E0SA 1DTZA 4GFRA 1USYH 2VP1A 2OWTA 1N7XA 5ITOA 4R6HA 1B1XA 3GXAA 1DPEA 2M8CA 2XD2A 3C9HA 4NE4A 2Q89A 3MUQA 2A5SA 4X9TA 1FQEA 2QS3A 3R26A 4N13A 3HSTA 3ECRA 2F7CA 3A3UA 2XXPA 3IOWA 4IGRA 1DTGA 5FHMA 4MBPA 1HSJA 1MY2A 4ZECA 1LFIA 4RY1A 2O51A 4H5GA 2UVJA 1NKXA 4R74A 3CG1A 3K6XA 2PX1A 4IY6A 3DELB 4BDLA 2HAUA 4KYSA 4YAHX 1Y3PA 5H8NA 3TDJA 3U93A 3O6GA 4YB6A 3KGCA 3QXMA 3WAFA 1Y3NA 4OFLA 1CE2A 1P99A 1SYHA 2H9BA 1L5TA 4NF8A 2Y7IA 1US5A 2DOJA 1MQHA 3ODBA 2XXVA 4U1OA 3FD3A 3TPAA 5HPQA 4DXBA 4RXLA 5I59A 1VE4A 2XXWA 4LATA 1LBBA 3K6WA 2XX8A 2UXAA 4DZ1A 5I58B 4XTCQ 3T93B 4XKQA 3THIA 1P1WA 2Z23A 3C4MA 4OYVA 4OFJA 3FASA 5H8HA 1RKMA 3EHUA 2VHAA 4RNSA 3VLVA 2NXOA 1AH5A 1MQJA 2ZYOA 1IUDA 3T9HB 3G7WA 3UORA 4ESWA 4FEBA 4G68C 1B5JA 4H0WA 4R2BA 1FTKA 1NNFA 3E3KA 3K1MA 4F2QA 1SW2A 1NH8A 2PT2A 2HFBA 1UQWA 2DWIA 2HZLA 4L17A 2H25A 1JW5A 2OWSA 1MDP1 3K00A 1Y3QA 5DTBA 3EN3A 1Y20A 5CMKA 3K02A 4F29A 4NF6B 3TQWA 5DVJA 3ILUB 3LR1A 3FATA 3PUVE 1YTVA 3W9WA 5CM6A 4ZE8A 1NMUA 3TMGA 4OWDA 2YJPA 4OEUA 1N84A 2XD3A 3H6WA 3Q25A 2PT1A 4OEVA 2RC8A 3PPQA 5KCJA 4R9FA 3FVOA 4AQ4A 1ZTYA 4JWXA 5H8QA 4ISUA 4H65A 4GQOA 3IORA 1II5A 3PU5A 3TTLA 1A54A 4IO5A 4F1YA 3IO4A 4KR5A 3H06B 5ITPA 4QFNA 3MAMA 1A99A 2ZYMA 2I3WA 1RYOA 2F5XA 2B65A 3EPEA 3G3GA 4KCCA 3RPWA 1AOVA 2RCAA 4AB6A 3ZS6A 4PFWA 1YPNA 3MC2A 1KWHA 3CRBA 3UIFA 4P0IA 3OXNA 1SBPA 4LZ8A 3QIMA 1B3GA 1PC3A 1AMFA 1FQDA 3KN8A 2FA7A 1XHYA 4HCYA 4GD5A 1B7ZA 1O7TA 5A5XB 3SEXA 1B58A 1P1UA 4OVJA 4GL0A 3I5OA 4XXUA 4GIZA 3C36A 4FEDA 2D5WA 3BBRA 1IZ1A 1ZKBA 2AYSA 3N6UA 2XXQA 2UYEA 4XKPA 3SEUA 3QK6A 3GLBA 4NF4A 1FQFA 3UGWA 1SI1A 3MQ9A 2OK2A 1PBQA 1NNPA 3U8QA 2HQ0A 1IXIA 1JW4A 5AA1A 3OOAA 1BTJA 4G8NA 1MXZA 3K4UA 5J1DA 1XT8A 3QUFA 4F19A 1IEJA 1H43A 1I6AA 1POTA 2CZLA 4TLMB 2R6GE 1LFHA 1IITA 1IQ7A 1A8EA 1MQGA 4YMBA 5L9OA 4QHQA 2DXRA 1MXVA 4IB2A 4NEDA 3PV0E 2G93A 3E13X 5ELVA 2Y84A 4YICA 2AIXA 4Q0CA 2ABHA 3V83A 1FCKA 4MLVA 4ZEFA 3MZBA 2Q9TA 4LA9A 4KYEA 4PE5B 4H5FA 2OCUA 1VFEA 3E4RA 4QFLA 1Z7NE 1URDA 2D21A 4I8CA 1B7HA 4OERA 5CBSA 4RPOA 3D4GA 3KG2A 3TTNA 3MZ9A 4G68A 2Z8FA 1OLAA 3FV2A 2XXYA 3OD7A 2NOOA 1LCFA 4I9DA 5FHOA 3M3KA 3FJMA 3MP1A 5JEIA 4P0GA 5IAIA 3IB0A 3LSLA 3PD9A 5CC2A 2VGQA 4KFQA 4R9GA 1J1NA 1OQHA 3IK6B 2DE4A 3UP9A 1MS7A 4ZEBA 1UTBB 2RF1A 4KI0E 3MP6A 3K2DA 1LBCA 4DCYA 2Y7RA 2X7QA 1R9LA 4MFIA 2GFEA 3D4CA 2I4CA 1POY1 4R73A 3LSXA 3OEKA 3PPPA 2NUVA 3Q29A 1TXFA 5H8SA 4X1DA 3Q27A 4EQ9A 3S2VA 2I4BA 5KDTB 1IXGA 1UTHA 3MVZA 4N6PA 1QKBA 2OLBA 3VLWA 4RJZA 5KDTA 3FJ7A 2ONSA 1JEVA 3S9NC 2V84A 5BWJA 2LAOA 3QUJA 3CR9A 1SQYA 3MVYA 3VLUA 2E1SA 3IOTA 4YKJA 3USDA 3AXFA 1B1HA 3I3VA 1B40A 2RKMA 4C0RA 2F35A 4KHZE 1N3XA 3C34A 3VVFA 3DP6A 3SEWA 3UK4A 3ZKKA 4ESXA 4HW8A 2I3VA 4UA8A 1AIVA 5ICQA 3PMVA 3TYHA 3M3LA 3PUYE 2H98A 4N07A 2ZMBA 1CB6A 5EYFA 3CIJA 5I2NB 3K6VA 1B51A 2Y7KA 4R75A 1D3KA 3RY3A 3W15C 2WKYA 3MVWA 3PGFA 1XVXA 3B6TA 3KOTA 4GWOA 1LAHE 2V25A 1MPBA 4QSCA 4U2RA 2D3IA 1A55A 2F8DA 3MPLA 2H4IA 3KSXA 4QFOA 5I2KB 2IEEA 4RK2A 2ONRA 1MM7A 1B7UA 3BFTA 1DPPA 4P11A 1US4A 1JW1A 1PB8A 1B32A 4QFPA 2Q8JA 3VDFA 3S4UA 5ISUA 3PMWA 2DQVA 3RNNA 4IO7A 3ILTB 5CMBA 1N76A 3VVEA 5CRYA 1NL5A 2HEUA 1P1OA 3ONMA 1F9BA 2ZNTA 1OLCA 4YKIA 3ZKLA 4DE8A 2HAVA 4MH5A 3OO9A 2I0CA 4Q5TA 2DWJA 3HO7A 1YCJA 2DE3A 3F11A 3IOVA 4FIMA 2I0BA 4IY5A 3KBRA 5IKBA 3SKPA 2QS4A 3K6UA 2HXWA 4NMYA 5I58A 5AA4B 4BDOA 2Q2CA 1TWYA 3EHTA 4WEDA 4F1VA 4YKKA 3TCHA 3CFLA 4ELPA 4LQ5A 2QPQA 2W7YA 1MY3A 1QUKA 3KZGA 3IJOB 4ONYA 1Y9UA 4OZ9A 2QMWA 2I58A 4IO4A 3IR1A 3CG3A 3EQ1A 2P0SA 5CBRA 1PDAA 3CSGA 1URGA 3N5LA 4KPTA 4UACA 1LLSA 2Q88A 4GVOA 4R6KA 2H99A 1IIWA 3PUWE 2RINA 1NFTA 1O63A 2H5YA 1B0LA 4THIA 3JZJA 4U23A 4NF6A 4E0WA 3JV9A 1OIBA 1A7LA 4OHNA 1OQGA 1MXXA 1Z7ME 1JQFA 3TCGA 2XXRA 2GHBA 4GRKA 1H3DA 1BLFA 1O64A 1SVXB 3WAEA 1ANFA 4LVQA 3H7MA 5F7VA 3MJNA 1R6ZA 2DXYA 4OTEA 1R1NA 4DDDA 4RYAA 2DS9A 2Y7WA 4R2FA 3FUZA 3L6HA 1GGGA 3U72A 4ELRA 4LUBA 4ZZEA 3IL1B 4OETA 2CMOA 2RCBA 4ZEKA 3VE1B 3LSWA 4QF9A 1QJMA 1MY4A 2REGA 4XKRA 2ONKE 3FXRA 3TODA 5TP9B 1MXYA 3VVDA 2DSFA 4U1ZA 1XC1A 2UVGA 1B4ZA 3QYTA 4KQPA 3RQTA 1B5IA 3TTKA 2GHAA 3TTRA 4QFKA 1ZMGA 4C1TA 5A5XA 5FHNA 5AA2B 2Q2AA 3HCQA 1MDQA 2P1SA 3EF7A 4ND9A 3T22A 1FTJA 1QULA 5H8FB 4FORA 1T0KA 1YAEA 1Y1MA 3FVNA 2AL5A 3ZSFA 4Z7EA 1N0TA 3KN7A 3DM0A 2THIA 4LQ2A 1GR2A 2P2AA 3OELA 4OQOA 4ZDMA 3TCFA 2ZXTA 4F2OA 5TPAB 4E0XA 4GF8A 5ICTA 1I69A 1B52A 4R72A 4F3GA 3FZVA 1PB7A 2QRYA 4RA1A 1SW1A 4ZEIA 1QKAA 2DWHA 1USYE 1ZLQA 3M3FA 4LP2B 1XOCA 4JSOA 4KD5A 4WEPA 2XX7A 4YB5A 4G4PA 4POWA 1FW0A 2IA4A 3PPOA 3TELA 1S50A 1RYXA 1H76A 3IAZA 1NNTA 3N26A 3K1PA 3G3IA 1ZIUA 1GV8A 3TEPA 4OENA 3PUZE 4QSDA 4NF5B 2HCAA 3O6HA 2XXIA 4U4SA 3T96B 1A8FA 4H67A 4EQ7A 2O1LA 2AL4A 1JETA 1P1QA 2F7BA 4DXCA 1R9QA 3FXUA 3H6UA 3C35A 4DIGA 1B3FA 2O6AA 4C1UA 4AB5A 1JVXA 4R6YA 1QVSA 2PVUA 2A5TB 3K0VA 3K1NA 3UA8A 4EF2A 1B2HA 2A5TA 3TAJA 1OMPA 2I6EA 2V3QA 3H3GA 3CFZA 2PMSA 1UTBA 2UVHA 4ZE9A 4FE8A 3Q28A 1MM6A 4G8MA 4ZEDA 3OO8A 3IJXB 3A3CA 3BFUA 3G3HA 4G8HA 4F3BA 3HV1A 3HN0A 4PETA 3JYRA 2HZKA 2O68A 2QS1A 3MVXA 4ZZAA 2PYYA 1SW5A 3H6VA 3N94A 4ZS9A 2DVCA 4BDNA 2F36A 4F22A 2PBWA 3L6GA 5DVFA 3RT8A 3CFXA 4KCDA 2OZZA 4OXVA 3KN3A 4PQJA 1SD3A 3R7XA 3MZ1A 5CMCA 3I6VA 5JTYB 1MXWA 1I6QA 3FV1A 1SDXA 1NNKA 1B4HA 3PMXA 3BKIB 1M5DA 1ATGA 3FVGA 3GZGA 1VFDA 1N7WA 3QSLA 3HPIA 4FAJA 1FQCA 1MH3A 1TFAA 3TKDA 1LGBC 3SDFA 3M8UA 1M5BA 3T9VA 3MPKA 1VSOA 1TT1A 4YB7A 1GVCA 4EDPA 1B3HA 3RGYA 3LC8A 1LAGE 1MG1A 4JWOA 4H8JA 3U94A 5I2NA 1D9YA 1FTMA 2VD3A 2ALUA 4H1XA 2QSXA 5I57B 2NWJA 4LONB 1N3WA 3OMBA 5EHMA 5AA3A 5I57A 1PBPA 3SERA 4IO2A 3SETA 5I2KA 1LAXA 3MW0A 3C33A 1EH3A 3H6TA 5BUUA 4X1BA 3MWBA 3P7IA 1LB9A 2O7UA 5KZTA 3OSQA 4BLAA 3O9PA 1SW4A 1ZU0A 3OO7A 3B7DA 3MP8A 3RT6B 1OVTA 2ZYNA 2X26A 4HCWA 1H44A 5H8NB 1LB8A 2Y7PA 4YMAA 3S9MC 3IO6A 4NF8B 1WVJA 3H03A 1B0HA 4EUOA 2O84X 3QAXA 1DOTA 2R9JA 5I59B 3H4ZA 3T9UA 4WXJA 3N6TA 3TQLA 1B6HA 1ZBMA 2V93A 1B9JA 2F6GA 5F1QA 5H8HB 2I49A 1MXUA 4XIGQ 4JB7A 5AA4A 3SEVA 4TOZA 4F39A 3T66A 2Z22A 1BKAA 4NWDA 3RTWB 4H6DA 2NVUB 2XX9A 1UIVA 3B6QA 4F3SA 3HHGA 4WKMA 3VV5A 1D9VA 4JDFA 2DVZA 1MY1A 4DXUA 2V3TA 1OVBA 3G3KA 4BDQA 3OENA 3HHFA 4ELQA 5JK4A 3A09A 2QS2A 1WODA 1XS5A 4F18A 2YLNA 2DWAA 1EZPA 1WDNA 4EXKA 2BJJX 3E9XA 4EQBA 2QL3A 2I48A 1H45A 4YZZA 3U1OA 1FQAA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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