1SW1A

Crystal structure of prox from archeoglobus fulgidus in complex with proline betaine
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
270
structure length
270
Chain Sequence
b'ERVVIGSKPFNEQYILANMIAILLEENGYKAEVKEGLGGTLVNYEALKRNDIQLYVEYTGTAYNVILRKQPPELWDQQYIFDEVKKGLLEADGVVVAAKLGFRDDYALAVRADWAEENGVEKISDLAEFADQLVFGSDPEFASRPDGLPQIKKVYGFEFKEVKQMEPTLMYEAIKNKQVDVIPAYTTDSRVDLFNLKILEDDKGALPPYDAIIIVNGNTAKDEKLISVLKLLEDRIDTDTMRALNYQYDVEKKDAREIAMSFLKEQGLVK'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis for the binding of compatible solutes by ProX from the hyperthermophilic archaeon Archaeoglobus fulgidus.
pubmed doi rcsb
molecule keywords osmoprotection protein (proX)
source organism Archaeoglobus fulgidus
molecule tags Protein binding
total genus 93
structure length 270
sequence length 270
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04069 OpuAC Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1sw1A01
3.40.190.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Osmoprotection protein (prox); domain 2 1sw1A02
2Y7IA 5CI5A 5I59A 1AL3A 4DDDA 3O66A 4QSDA 3VV5A 3M3KA 5LOMA 1H76A 1I6AA 4RNSA 1B3FA 3FVOA 4HCWA 3KN8A 1TT1A 4O3AA 4GOTA 3R26A 3H03A 4ELOA 4RPOA 1MS7A 5H8FB 4DXCA 3PGFA 1MY4A 4ESWA 4F22A 4ZEKA 1PB8A 3PMVA 2NXOA 2Z8EA 2V93A 2HZLA 4EXLA 2ESNA 2YLNA 1UIUA 4IGTA 1A40A 1ATGA 4F2QA 5ELVA 1MQIA 3T66A 4ELRA 2REJA 2FYIA 4ONYA 4LQ2A 3U8QA 1US4A 5CRYA 1ZTYA 2GFEA 1B9JA 3Q27A 3JZJA 2UXAA 4OMBA 4GLIA 3FXRA 1D9YA 2Y7KA 1B7ZA 3PU5A 5H8SA 1UTBB 3FV1A 1CB6A 3VLUA 2Q2AA 1XT8A 4LA9A 2V25A 5IAIA 4F1YA 3H6TA 4GIZA 4RYAA 3TDJA 2UVGA 3BKIB 3LSWA 4GRKA 1LAHE 2H9BA 4F3PA 2BJJX 2XXQA 4F1VA 2AL4A 3IOWA 3CG3A 2DXYA 2CMOA 2CZLA 1LBBA 1JW5A 3VLWA 3H6UA 5FTHA 3PUVE 3M3LA 4F1UA 5F1QA 3UP9A 3OELA 4KYSA 5DEXB 3RTFB 3O6GA 4G68C 5AA1A 2RCAA 1P1QA 3KN3A 3OD7A 5ICTA 1YPNA 3GBBA 4U4XA 3TELA 4ZS9A 2B3BA 4IGRA 3C31A 3SDFA 1XVXA 3K6XA 4L17A 3PMXA 5DVJA 1GVCA 1N84A 4ZE8A 4Z0IA 2Z22A 3VFJA 1B3EA 3CSGA 4NF4A 2G93A 3FJ7A 5F7VA 3K01A 3MJNA 4FATA 3MBPA 4O3BA 4EF1A 3S9EA 3IO6A 3FUZA 1LFGA 4I1DA 1FQDA 3USDA 1MQGA 2NUVA 4FORA 3S9NC 2Z8DA 4NWCA 1Y4CA 1R9LA 3C9HA 1MDQA 3O6HA 5EHSA 3EF7A 4DXUA 3PPOA 1NH8A 5A5XB 3WAFA 3TQWA 1ELJA 1FQAA 2PT1A 4TOZA 2F7CA 1SI1A 4TLLB 4F3SA 4G4PA 1I6QA 1A54A 1B05A 4OVJA 3V8XB 3IX1A 3C32A 4R2FA 3MPLA 1FTOA 5I56B 2Y84A 4JSDA 1MXWA 1MY0A 1N04A 3TEPA 1NL5A 3FD3A 4UACA 5CMKA 3OSRA 3B6WA 1YAEA 1H3DA 4U1ZA 5FHNA 3PV0E 3BFUA 4KPTA 1YTVA 3TTKA 3DM0A 1JETA 5BWJA 2RC9A 3W9VA 4YKPA 1SW1A 4H6DA 2RINA 1NMUA 5AE4A 4H1XA 1VFDA 5I59B 4LUBA 1ANFA 4AQ4A 2ZNUA 1VR5A 4OQOA 1TFDA 1B3HA 1A55A 4EXKA 2A5TB 5L8DA 4C1TA 1NNFA 3OSQA 1B0HA 4ZEIA 5TU0A 4POXA 3C4MA 3A3UA 4R74A 3Q25A 4QF9A 2Q8JA 1BKAA 4YMAA 1BTJA 1B1XA 1LBCA 3MPKA 3EN3A 4EDPA 1A8EA 2REGA 5DYHA 4EF2A 3TYHA 3TFLA 3D4GA 4E0XA 4IO3A 4BDMA 5IKBA 1PBPA 1WODA 3LSLA 4LZ8A 1OLAA 1Z7NE 3MAMA 1P1NA 3LSXA 3E13X 5L9OA 3SEYA 3KSJA 2OZZA 4OFOA 3A3CA 2PYYA 2O51A 4XKQA 4G8NA 2Y7WA 1MPDA 3KN7A 3U92A 1XC1A 1NH7A 2XXRA 3L6GA 1I69A 5I58A 1PBQA 1P1OA 3QAXA 4G8HA 3ONMA 2RF1A 3RT8A 2O1MA 3SEXA 3IB2A 4E0WA 3SEVA 1LB8A 2GHBA 3O2AA 2QSXA 2Q89A 3FVNA 3PUWE 1Y4TA 3LUYA 4JSOA 4QSCA 1IIWA 2Y7RA 3GXAA 1YCJA 4N13A 2QRYA 1JW4A 1OVBA 3RPWA 4HW8A 3MWBA 4MH5A 5M2VA 5I2NA 2O6AA 3U93A 3TUSA 3FXQA 1N3XA 4U21A 3OO9A 4C0RA 3MVWA 3SKPA 4YU0A 3TTLA 4Q0CA 1NNKA 1M5CA 1MDP1 4QSEA 1LGBC 5JK4A 3IOUA 3N6UA 2IEEA 3ZSFA 1QKBA 4YICA 1P1UA 2W7YA 4ZZEA 4JDFA 2FNCA 2ZYOA 2NWJA 4ZECA 4NF4B 3TTRA 3B7DA 3C36A 1Y20A 3FJMA 2PBWA 3OXNA 1Q1KA 4WEPA 3KEIA 5H8HA 4FEBA 4IY5A 3VVFA 2F36A 4PETA 3N94A 1WDNA 4PFTA 2DQVA 4QHQA 4GVOA 5ISUA 3H7MA 3HV1A 3PD9A 1B7HA 1SQYA 3C33A 4KFQA 1B58A 2HEUA 1JVXA 4PFUA 3CFLA 4MLVA 2FA7A 3PD8A 3MQ9A 3QUFA 3R7XA 3BFTA 3H4ZA 1N7WA 4IY6A 1USYE 1I6BA 4F2OA 3OO6A 3UA8A 4XKNA 4F29A 4F3GA 4ZEDA 4H8JA 4OEVA 4PFYA 1XOCA 4NEDA 3K6WA 1EZ9A 2ONRA 2O69A 4M1VA 1D3KA 3ILUB 3MP1A 5KDTB 3IOTA 4EUOA 4YKIA 2R71A 4Q5TA 4LP2B 1IXHA 3JV9A 1HSEA 5EHMA 3EHSA 2X7QA 3SEWA 2H5YA 3HSTA 1B7UA 1Y9UA 4PE5B 3C35A 1Y1MA 2YPNA 2Y7PA 3MP8A 3OEKA 3VLVA 1B0LA 2NOOA 2XXHA 4QRZA 3LR1A 1O7TA 4N6PA 1AOVA 3G7WA 1ZU0A 2DP8A 2DWAA 4U1OA 1LAFE 3QUJA 3N6TA 4OEUA 1FTLA 1Z7ME 3TZAA 1FQFA 1XS5A 3UK4A 4KR5A 4U2RA 2OK2A 3D4CA 3FVKA 4MBPA 1D4NA 2DE3A 2XX8A 5ITOA 1A8FA 1MY2A 1UIVA 2XXUA 3N5LA 5FHMA 3GZGA 1QULA 1IITA 1SVXB 3AXFA 3P7IA 1P1WA 2ZYMA 4ZZAA 3S2VA 5I58B 2Q88A 2Q2CA 3I5OA 2O7IA 1B4ZA 3IJXB 4TQUQ 3TCGA 3BBRA 3EHTA 2GHAA 4YB5A 1QVSA 2DVZA 2QS4A 1M5DA 4QFPA 1MRPA 4THIA 4JWOA 5CMMA 1Y3PA 3CIJA 4NF8A 3DLNA 1LLSA 1LFIA 4YMBA 2D3IA 1VE4A 5I2NB 3VVDA 2QL3A 3RGYA 3HPIA 1RYXA 1POY1 1SYIA 2PVUA 3O6IA 1B5HA 2GH9A 3RUMA 4XKPA 5AA2B 4GXSB 4OETA 3GBAA 5ITPA 3OOAA 1USYH 4FAJA 2XXXA 5KCJA 1MQHA 3U72A 4PP0A 2I6EA 5EYFA 1B52A 3C34A 4QFLA 4G68A 1MM7A 2B3FA 2F6PA 3TQLA 3IOVA 4BDNA 4RA1A 5HBCA 4FE8A 3G3IA 5K2YA 4ZE9A 4R9GA 3O29A 3FATA 3PPQA 4FIMA 4F3BA 2HXWA 2RC7A 4IO7A 4R9FA 1QKAA 1H45A 3V89B 4YB7A 2ALUA 4YKKA 4QFNA 1O63A 1PB7A 1DPPA 3E4RA 5H8HB 4JBZA 2G29A 3ZKLA 2B65A 3K02A 3H3GA 1B5IA 1DTGA 1B51A 4BDRA 3PPRA 3E9XA 4NF5B 1URSA 4P0GA 1DPEA 4R6YA 3T9UA 2F97A 3G3GA 4ECFA 1S50A 2ZYNA 1JQFA 3EPEA 4LONB 1B2HA 2XXTA 3KBRA 3Q28A 4R2BA 4KCCA 1ZKBA 2ONSA 4DCXA 1OQHA 2XXIA 2PMSA 3RTWB 1B5JA 1QUIA 3IB0A 4NF6A 1MQJA 2ZYKA 1FQCA 3QSLA 4ZEFA 2DYXA 5CBSA 5HM4B 1P99A 3M3FA 1UTHA 4H65A 3ZKKA 4JXIA 2XX7A 2NVUB 4QFOA 4JB7A 4AB5A 5JTYA 3OMBA 2AIXA 3K1PA 3FIRA 3RN8A 2DSFA 3VDFA 2ONKE 5TPAA 2DOJA 4GL0A 3VXCA 1OMPA 3S4UA 2R9JA 3RQTA 5FHOA 3G3FA 2H4IA 3H6VA 1F9BA 5FTIA 3RNNA 3W9WA 4HS7A 1B3LA 4H67A 1Y3NA 2OJTA 3JYRA 1JVYA 3I6VA 4ISUA 3OEMA 2DWHA 2RC8A 4LVQA 2A5SA 1EZPA 2I48A 3IL1B 5CBRA 3G3KA 3MC2A 3K2DA 2D21A 4FECA 3SEUA 4R75A 2H99A 3MVZA 5L9MA 2ZXTA 4RPNA 4YKJA 1BLFA 1UTBA 3FASA 4NWDA 4ZEBA 3B6TA 5AA4A 4G2ZA 2AYSA 1EU8A 3KOSA 2ZNTA 4PQJA 3E3KA 1L5TA 1URGA 1QW0A 3UIFA 1N76A 4R72A 3IAZA 1NNTA 1GR2A 4DZ1A 4I62A 3PMWA 1VFEA 3SESA 4DCYA 3EHUA 4GD5A 1LCFA 4NF8B 1IZ1A 1JEVA 3L6HA 1LCTA 5DEXA 1JEUA 1LAXA 2ZNSA 3HO7A 3PPPA 1FW0A 4GWOA 1DOTA 1TFAA 1IQ7A 1XHYA 2DE4A 3TTNA 3ILTB 4TLMB 2PT2A 1FTMA 1BP5A 4ND9A 5TP9A 4KHZE 3VVEA 5B7DA 4GQOA 4IO4A 3Q26A 1NKXA 3V5AA 3RY3A 1IEJA 3KFMA 1MM6A 1R9QA 2HFBA 4OZ9A 3CSBA 2PX1A 4OYVA 3KGCA 4U23A 3OENA 1HSLA 3TODA 2VP1A 2ANJA 3FZVA 4OFJA 5H8NA 2HQ0A 4ESXA 4MF3A 2UVIA 2F8DA 4XKRA 3MW0A 1MXZA 2F34A 2VGQA 3IB1A 2XXYA 4XIGQ 1AH5A 1MH3A 3S9LC 2V3TA 4OESA 1XVYA 3OO7A 3TCHA 4LATA 1II5A 2AL5A 4IO6A 3CRBA 4H8IA 3IR1A 1DSNA 4HCYA 4GL8A 2VD2A 4GF8A 1LAGE 3T9VA 5H8QA 1TXFA 2WKYA 1N3WA 4ZDMA 4BDQA 1CE2A 3O97A 1KWHA 4OTEA 4LZ5A 2I3WA 1H43A 4I9DA 4LZ7A 3W15C 3LBSA 2H25A 4NF6B 4KYDA 3FXUA 5DVFA 1VSOA 4BDLA 4U22A 2QJEA 1EH3A 2A5TA 1LSTA 1SW2A 4ELQA 5I2KA 4OXVA 1IXIA 2THIA 3CFZA 1SD3A 3HHGA 4RJZA 4XTCQ 4YAHX 2E0SA 1UTHB 3MVYA 1ZBMA 1GV8A 2P0SA 5JTYB 2VD3A 5K2XA 3O28A 3IORA 3T96B 4NE4A 2OLBA 1MXYA 4O3CA 1FTJA 2O68A 4H0WA 5DTBA 2Z23A 3WAEA 5AA3A 1MQDA 1SYHA 4F19A 1IXGA 5TPAB 5JEIA 1SBPA 2DXRA 4ELPA 4X1DA 5DT6A 2I4BA 4M4GA 2QS1A 2OWSA 1A99A 2ZMBA 3LC8A 1FCKA 2M8CA 1B6HA 4UA8A 2HAVA 4U4SA 3PUXE 3HHFA 4EQ9A 2QMXA 5L9SA 4DIGA 1RKMA 1GGGA 2O84X 2DWIA 3HN0A 3FGSA 3VXBA 3GLBA 1LB9A 1B40A 4RY1A 1ZIUA 2Q9TA 2I58A 1T0KA 5AA4B 2I4CA 1MY3A 1O64A 4LQ5A 3S9MC 1B1HA 1B3GA 3THIA 3IO4A 3K0VA 4F39A 3KSXA 4HTGA 3MVXA 1SI0A 2OCUA 3PPNA 5B70A 3VE1B 4KI0E 2XHDA 3K00A 4AB6A 1ZJLA 4R6KA 4GXAA 3DP4A 2VOZA 3EQ1A 3FVGA 3I3VA 4G77A 4XXUA 4G8MA 5TP9B 2UVJA 1H44A 3KZGA 3IK6B 5I57A 4KCDA 4MFIA 1TWYA 1M5EA 1MY1A 1AMFA 1IUDA 3CFXA 4H5GA 3CVGA 4JWYA 3KOTA 2QMWA 2F7BA 2Z8FA 1EZOA 5H8NB 4X9TA 4WEDA 2GRVA 4F31B 1NNPA 3MZBA 5CMCA 4DE8A 2XX9A 2XD2A 2UYEA 4BLAA 2DE2A 1QUJA 3QXMA 4KYEA 1PC3A 4Q8RA 2P1SA 1MXVA 3F11A 4WXJA 3MZ1A 5DVIA 4MLQA 3G3JA 4FJPA 2LAOA 2V84A 4RK2A 4F18A 1JNFA 2F5XA 3T9HB 4IO5A 2I3VA 1Y3QA 1OQGA 1Y1ZA 5CM6A 1SW4A 1OVTA 3V83A 5H8QB 2F78A 2IA4A 5KDTA 1N0TA 3SERA 1Q35A 4K3FA 1PDAA 2X26A 1OIBA 4IO2A 3TMGA 4OERA 1IXCA 1RYOA 1MH4A 3K4UA 3T22A 1UQWA 3DP8A 1ZMGA 5H8FA 3CI8A 1M5FA 1AIVA 5I2KB 5HPQA 4P11A 2HZKA 3M8UA 3K1MA 5KZTA 1US5A 3H06B 2DS9A 1N7XA 1GTKA 4QFKA 4DLDA 2I0BA 4OHNA 3K1NA 5CMBA 3H6WA 1R6ZA 1FQBA 1DTZA 3G3HA 1M5BA 2RKMA 3HCQA 3U94A 1A7LA 4N07A 2QPQA 2HCAA 2F35A 3FV2A 2D5WA 3QK6A 1OLCA 2H98A 4OWDA 1HSJA 2XXPA 2O7UA 4RK9A 4YZZA 4BDOA 3QIMA 2XD3A 3TKDA 2E1SA 4NMYA 4DXBA 1LFHA 2YJPA 4P0IA 3ZS6A 3KJTA 3UGWA 1D9VA 4C1UA 4PFWA 3PUYE 4R6HA 3PUZE 4FEDA 1WVJA 5J1DA 1ZLQA 2V3QA 4I8CA 2QS3A 2VHAA 4KD5A 5BUUA 2I0CA 2X7PA 4POWA 3DELB 2DWJA 3MP6A 2HAUA 3DP6A 3FJGA 1FTKA 4KQPA 5ICQA 1FQEA 3K6VA 3TPAA 3TTMA 3O9PA 3OO8A 4WKMA 1SW5A 4JWXA 3T9XB 3CG1A 5AA2A 4IB2A 5KCJB 3KJ7A 3RLFE 4R73A 3MUQA 3N26A 1MPBA 1JW1A 1R1NA 3U1OA 5CC2A 3TAJA 4G68B 4X1BA 1URDA 1MPCA 3K6UA 3KG2A 2XXVA 3ODBA 4OFLA 3ECRA 1PB9A 3T93B 2V3UA 2OWTA 5I57B 3UN6A 1B4HA 3CR9A 2F6GA 3TCFA 4Q30B 4H5FA 3IJOB 1PEBA 1S7YA 5I84A 2RCBA 1MXXA 5A5XA 1J1NA 2F7AA 3Q29A 1B32A 4YB6A 2I49A 4NF5A 2KLFA 4OENA 5I56A 2QS2A 1SDXA 1DMBA 2OBGA 3B6QA 2XXWA 3A09A 1POTA 2R6GE 2UVHA 4GFRA 3QYTA 1QJMA 3SETA 3R6UA 5AA2D 2DVCA 4EQBA 1B46A 1MXUA 3RT6B 1NFTA 1QUKA 4Z7EA 3LSFB 4EQ7A 2P2AA 4RXLA 3MZ9A 4X48A 1BIYA 1S9TA 1MG1A 4NTLA 3UORA 2ABHA 2UYFA 2O1LA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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