1SW1A

Crystal structure of prox from archeoglobus fulgidus in complex with proline betaine
Total Genus 93
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
93
sequence length
270
structure length
270
Chain Sequence
ERVVIGSKPFNEQYILANMIAILLEENGYKAEVKEGLGGTLVNYEALKRNDIQLYVEYTGTAYNVILRKQPPELWDQQYIFDEVKKGLLEADGVVVAAKLGFRDDYALAVRADWAEENGVEKISDLAEFADQLVFGSDPEFASRPDGLPQIKKVYGFEFKEVKQMEPTLMYEAIKNKQVDVIPAYTTDSRVDLFNLKILEDDKGALPPYDAIIIVNGNTAKDEKLISVLKLLEDRIDTDTMRALNYQYDVEKKDAREIAMSFLKEQGLVK
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Structural basis for the binding of compatible solutes by ProX from the hyperthermophilic archaeon Archaeoglobus fulgidus.
pubmed doi rcsb
molecule tags Protein binding
source organism Archaeoglobus fulgidus
molecule keywords osmoprotection protein (proX)
total genus 93
structure length 270
sequence length 270
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-03-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF04069 OpuAC Substrate binding domain of ABC-type glycine betaine transport system
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1sw1A01
3.40.190.120 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Osmoprotection protein (prox); domain 2 1sw1A02
5I84A 4F31B 2RCBA 4R9GA 4I1DA 3LR1A 1N04A 3K1PA 4HCYA 1WVJA 5F7VA 2VD2A 1FQAA 2GFEA 1IQ7A 4ZE8A 3M3FA 2XX9A 4F3GA 3SEVA 3PU5A 2FNCA 3FXQA 1US4A 3OSRA 1RKMA 3OO7A 4OESA 1AH5A 5H8HB 5I2NA 1JETA 1UIVA 3FV2A 1B4HA 1P1OA 1WODA 3QSLA 2R9JA 2ZYNA 1NKXA 3E9XA 2R71A 1Y20A 1UIUA 4O3BA 1IXIA 3G3IA 3K6XA 3O2AA 1SW2A 1MG1A 4PFUA 4QFPA 2DYXA 2AL4A 5H8NA 5AA2A 2Z8FA 3O29A 4BLAA 3MWBA 1MY3A 5KZTA 2X7QA 3QUFA 2DXRA 4QHQA 3UA8A 3EHUA 1MXWA 4LATA 2GRVA 1B5HA 1VFEA 1M5FA 3DLNA 2RCAA 4DIGA 2PT1A 3MVXA 3RY3A 1DTZA 2AL5A 3SERA 2OBGA 4EXLA 1SD3A 2XXTA 4LUBA 1FTLA 1LAXA 1H3DA 4K3FA 4F1VA 1UTHB 2X7PA 4FEBA 4Q0CA 3TPAA 1T0KA 4DE8A 3PPNA 4BDNA 1FCKA 4GLIA 2ZYMA 5LOMA 1YAEA 3Q29A 4G68B 3V89B 3U1OA 4OHNA 3USDA 2DOJA 3LUYA 1Z7ME 1AIVA 4MF3A 1B32A 1PB8A 1IXGA 5CC2A 4U2RA 5L9OA 3U8QA 3MVZA 3C36A 2OCUA 1LFGA 5I56A 3OOAA 3UGWA 4PFWA 2X26A 5CMCA 1EZ9A 5IKBA 4ZS9A 2F97A 4FORA 3VDFA 1XHYA 2IEEA 1CB6A 3PD9A 5DEXA 1MXVA 4L17A 2O69A 1IEJA 2HAUA 3LC8A 2UVJA 3T9HB 3EHTA 4G8NA 2UVHA 2V3UA 3IB0A 5KCJB 4BDMA 3MPLA 1DPEA 5KDTB 5ISUA 1OLCA 1M5EA 2Z22A 4F1YA 3H6VA 4RK2A 3OO9A 4H1XA 4YMBA 1XVXA 3IJXB 1UQWA 3CSBA 1RYOA 1TXFA 1NNTA 4OTEA 1N84A 3KOSA 3OMBA 4GQOA 4DDDA 3K01A 3MJNA 5K2XA 3C4MA 1R9QA 1P1UA 2NUVA 2Q2CA 3HO7A 3LSWA 3RNNA 4ESXA 1RYXA 2HFBA 3KG2A 3CVGA 3IOWA 1Y9UA 1DOTA 2AIXA 4BDRA 4IB2A 3S9EA 3ECRA 3KSJA 2V3TA 3Q26A 3TELA 5H8FB 4QFNA 2XXUA 2OJTA 2Y7PA 2VD3A 3C34A 3SKPA 3O6IA 1B1XA 4XXUA 4KD5A 1D3KA 2ABHA 4H0WA 4NF8B 3D4CA 3WAFA 4GIZA 2I3VA 4NWCA 2H25A 4YKPA 3TCFA 3IB1A 3U92A 3CG1A 3O28A 2F35A 4R74A 3C33A 5I57A 4KHZE 1S50A 4LP2B 3RT8A 4RK9A 1LBCA 1AOVA 3T9VA 3QAXA 1F9BA 1VR5A 1GVCA 1LFIA 3L6HA 1M5BA 4H8IA 4NE4A 4F39A 5H8SA 3ZS6A 4MLQA 3OSQA 4ISUA 4OEUA 4U4XA 4ZEBA 3IOUA 3MBPA 1LB9A 4IO7A 3K0VA 3TCHA 3PD8A 1B1HA 4YZZA 3MUQA 2QS4A 4DXCA 1CE2A 3HPIA 3QIMA 3UORA 5TPAB 4IGRA 1N7XA 1ELJA 3TTNA 2XX7A 3T22A 3O9PA 1L5TA 3O6GA 4GFRA 1QUKA 2KLFA 3OO6A 1LGBC 1OQGA 1ZBMA 3FV1A 2OK2A 2Q8JA 3VV5A 1B7UA 3U93A 2ONSA 4ZE9A 5TU0A 2HCAA 1A7LA 2REGA 1NH7A 3UN6A 3DM0A 4OXVA 3G3HA 4X48A 1SI0A 3IK6B 4MH5A 4Q8RA 1USYH 3DP4A 2YPNA 3RTFB 2DE3A 4YMAA 2XXWA 2A5TA 3PPOA 3LSFB 4MBPA 3KJTA 3FVNA 2QRYA 1FQDA 1Q35A 3B6WA 1MXXA 4KCCA 1JVXA 3FZVA 4KCDA 2RC7A 4H67A 5I58A 2I3WA 1YPNA 4I62A 2H98A 4KYSA 4RY1A 4JWXA 2RKMA 4QSEA 2F6GA 1OLAA 1I69A 3O97A 5IAIA 3W9VA 1N3WA 2RC8A 4ZDMA 1QUIA 4NF6A 1ZJLA 3KN3A 2LAOA 2F5XA 4IGTA 1ZU0A 5DT6A 3FXRA 1LLSA 3SEYA 1NMUA 2WKYA 4PP0A 2QJEA 1EZOA 3VLUA 1P1QA 3KSXA 2DWAA 3S4UA 2F7BA 1NL5A 2D21A 2XXQA 1KWHA 2O84X 1MXUA 2P2AA 4GL8A 2V93A 2ANJA 1A8FA 5CMKA 2I49A 5FTHA 4TOZA 5H8QB 1NNPA 1ZLQA 4UACA 1B9JA 3CR9A 1BTJA 2ZMBA 4NF5B 5FHOA 3FVKA 5I2KB 3BKIB 4H5GA 2R6GE 4F3BA 3TTMA 4LA9A 1NFTA 1Y3PA 4G2ZA 4IO6A 2NXOA 3G7WA 4F1UA 2D3IA 3ONMA 2H9BA 1DPPA 2ONKE 3TTLA 5EHSA 4ND9A 4FE8A 4F19A 4ONYA 1QKAA 1P1NA 3T9UA 4R6YA 4LONB 1B5JA 2G93A 5DTBA 3A3UA 3FATA 3MZ9A 1SI1A 1SW5A 3IX1A 1LAHE 1TFDA 2DP8A 1MY2A 3IB2A 1IXHA 3RLFE 3HV1A 3MQ9A 2B3FA 4IY6A 4ELQA 4KFQA 3THIA 4Z7EA 4UA8A 2DWHA 3FASA 3FJGA 1H43A 1MM6A 1HSLA 3G3JA 1JNFA 5CMBA 3LBSA 2PYYA 2XXXA 1B52A 3JV9A 4P0IA 4LZ7A 5CBSA 4QFKA 1FTKA 3MAMA 4KYEA 2O1LA 3CFZA 3MPKA 3IOTA 3TYHA 4NF4A 2Q2AA 4F18A 3U72A 1PB7A 3RGYA 3TKDA 4DXUA 1BLFA 2XXHA 2I6EA 4ZEDA 3N26A 3S9LC 4HTGA 3HHFA 2FYIA 3H03A 1BP5A 1JW5A 3N6UA 4DCYA 2FA7A 1XVYA 4IO2A 2QPQA 1DSNA 4NMYA 1R9LA 3B6TA 4ELRA 4LZ8A 1EZPA 4Q5TA 3M3KA 4YB7A 3H4ZA 4ELPA 4H6DA 2O6AA 4DCXA 1NH8A 5I2NB 2PMSA 3CFLA 3IO4A 3VFJA 3C31A 3TEPA 2OZZA 1Y4TA 1FQFA 1QJMA 1PC3A 3CIJA 2CMOA 2GH9A 4O3AA 3C32A 4OENA 5CI5A 1PBQA 5DVIA 3K1NA 2UVGA 4F3PA 4H8JA 4KYDA 5H8NB 5AA2B 4YKJA 3OEKA 3T66A 4KQPA 4U1OA 2NVUB 3ZKKA 4FAJA 3PPQA 3PUVE 4H5FA 4LVQA 3UIFA 3TODA 2QL3A 4XKQA 4GL0A 3IJOB 1B40A 1GV8A 4MFIA 2XXPA 3MP1A 4EF1A 3K2DA 1URDA 3TZAA 1AMFA 4Z0IA 3KN7A 2OLBA 4POWA 1MDP1 3AXFA 1MY4A 4RPOA 1MXYA 2F7AA 3K6VA 2ZNSA 3TDJA 5DVJA 1N7WA 1BIYA 4RNSA 1B0LA 4EQ9A 5BWJA 3WAEA 5ICQA 3PMXA 5HBCA 1FQCA 4DZ1A 3FGSA 4WEDA 3PMVA 4YU0A 1N76A 1LCFA 1I6BA 2ESNA 3SEUA 4JBZA 4RPNA 1JQFA 4JXIA 4GXAA 1J1NA 1I6AA 1AL3A 1BKAA 4GOTA 3KBRA 4P0GA 4E0XA 3KN8A 2F7CA 1TWYA 2QSXA 1B3FA 2QS1A 1GGGA 2YLNA 2DSFA 3OEMA 5B70A 5I56B 2OWTA 4GRKA 2VOZA 2HQ0A 4YAHX 3O66A 4ESWA 1ZKBA 5DEXB 4I9DA 1S7YA 1FTMA 3H06B 2I58A 3L6GA 5CBRA 1JW4A 5BUUA 1Q1KA 4F29A 3EPEA 4OEVA 2V25A 2DE4A 3VVDA 3ZKLA 2IA4A 4GD5A 4QF9A 1H44A 4QSCA 1MQHA 4KI0E 3N5LA 4GXSB 3JZJA 3OD7A 4QFOA 3FVGA 3M8UA 5K2YA 3QUJA 2REJA 4G77A 3ZSFA 2P1SA 2P0SA 3KOTA 1B6HA 1QKBA 1I6QA 3I6VA 2I0CA 3CG3A 2Y7RA 3H6WA 1UTBA 2XD3A 2F36A 2THIA 3LSXA 4ZEFA 3K1MA 4E0WA 3B6QA 3H6UA 1Z7NE 4XKRA 3MVWA 2CZLA 4U22A 4RYAA 2O68A 3C35A 5AA4A 3JYRA 1US5A 2F8DA 3M3LA 4Q30B 2DXYA 1POY1 1USYE 4G8MA 1QUJA 4H65A 1A99A 2QMWA 3V83A 3QXMA 3CFXA 3CRBA 3VVFA 1XT8A 2F78A 2Z8EA 2DE2A 4U23A 5CRYA 1SBPA 2UYEA 5JTYA 2XXYA 3MP6A 1H76A 1P1WA 3RQTA 3SESA 2OWSA 4OWDA 5L9MA 4O3CA 4JDFA 4JSOA 4QSDA 5I57B 3T9XB 3ILUB 2D5WA 3MZ1A 4WKMA 2NOOA 4C1TA 3N94A 4XKPA 1Y1MA 3OENA 3BFTA 4JWOA 4THIA 3MVYA 4R73A 1ZMGA 4ELOA 2ZYKA 3PMWA 4ZZAA 1FQBA 3H6TA 2E0SA 1MS7A 4YKIA 1QW0A 1B51A 1MDQA 1PEBA 3Q25A 1OIBA 1SVXB 1TT1A 3EQ1A 1B5IA 3H7MA 3TAJA 1FTJA 4NTLA 3EHSA 3S2VA 3B7DA 5L9SA 4ZZEA 1VFDA 1IUDA 4EXKA 3U94A 4PFTA 1MY1A 4OETA 1R6ZA 1B3LA 1MPCA 1OVBA 3IOVA 4TQUQ 4F22A 1GTKA 5F1QA 2DQVA 1B58A 4ZEKA 2VHAA 4OFOA 4BDOA 2I4BA 3TMGA 3Q27A 3VLVA 2A5SA 4OFLA 1A40A 2Q9TA 1O7TA 3DP6A 3A3CA 1SDXA 1MXZA 1IIWA 2H99A 3PUYE 4DXBA 2ONRA 1IITA 4POXA 4N13A 2A5TB 4AB6A 1MQGA 1Y1ZA 1WDNA 4WEPA 1B7HA 3R26A 3OELA 4BDLA 1PBPA 5I58B 2ZXTA 1VE4A 1MPDA 3FVOA 3FJ7A 4JSDA 3ILTB 3V8XB 2VGQA 1LB8A 2ALUA 1JEVA 4R2BA 4TLLB 2GHBA 2RINA 1UTHA 3R7XA 3S9MC 2GHAA 4NF6B 3IAZA 3SEXA 2ZNUA 4YICA 3BBRA 4N07A 3G3KA 4G68A 5I59A 5CMMA 1DMBA 4U21A 3TQWA 1XC1A 1MY0A 2I48A 4R6HA 5AA3A 3TTKA 3F11A 4G68C 1R1NA 3RTWB 3T93B 4AB5A 1N0TA 4HCWA 1FW0A 1LAGE 2HEUA 2HAVA 1NNFA 3K4UA 4LQ2A 1MM7A 3PV0E 2RC9A 4DLDA 5HPQA 2B3BA 2O7UA 1B2HA 4OFJA 5KCJA 3E4RA 2DVZA 4FIMA 1OVTA 5KDTA 1LBBA 2PBWA 1URSA 4GF8A 3BFUA 1URGA 1FTOA 4FECA 4F2OA 2Q89A 1XS5A 4FATA 3E3KA 2HXWA 2QMXA 2H5YA 3KEIA 1A55A 3GLBA 4OQOA 2DVCA 3Q28A 4WXJA 1B3EA 3PGFA 1D9YA 1D4NA 4HS7A 1B7ZA 1M5DA 1B3HA 1MRPA 4YB5A 4JWYA 3O6HA 4M4GA 1IXCA 2Z23A 4FEDA 3LSLA 2XD2A 4R72A 4ZECA 1Y3QA 3VLWA 1SW4A 2I4CA 5I59B 5JEIA 4OMBA 4NEDA 2Y7WA 3K02A 3KJ7A 1ZTYA 4IO5A 1SYHA 4F3SA 3VXCA 3MC2A 2DWJA 4EQ7A 1SW1A 4F2QA 1O63A 2G29A 4ZEIA 1YTVA 5H8FA 3ODBA 5A5XA 1OQHA 2F34A 3FD3A 3QYTA 1QVSA 1SQYA 4NF4B 4OYVA 4EUOA 1SYIA 4R75A 4C1UA 1XOCA 4NF8A 2Y7IA 4U4SA 3FIRA 4RXLA 3OXNA 4PE5B 4X9TA 1O64A 1H45A 4R6KA 4XTCQ 3TFLA 3TQLA 4R9FA 3K6WA 3TUSA 3GZGA 3MZBA 5B7DA 2V84A 2XX8A 4X1BA 3G3GA 3RUMA 4JB7A 4AQ4A 4NWDA 2O7IA 1JEUA 3GBAA 2H4IA 1QULA 1VSOA 4N6PA 5ELVA 1OMPA 1S9TA 2YJPA 5L8DA 3VVEA 3RT6B 4EDPA 2QS3A 5TPAA 1GR2A 2PVUA 1D9VA 1LSTA 4YKKA 3PPPA 3K00A 2PX1A 3GBBA 4OZ9A 3HSTA 3IORA 1IZ1A 2XXIA 3D4GA 5M2VA 4EQBA 3TTRA 1MPBA 3MP8A 3V5AA 3KZGA 2Z8DA 3T96B 3KFMA 2Y7KA 2DWIA 3VE1B 4M1VA 2DS9A 3CSGA 5A5XB 1DTGA 2UXAA 4YB6A 3HN0A 4KR5A 4PFYA 3PUZE 3R6UA 1B3GA 5CM6A 2HZLA 3IL1B 5ITOA 3W9WA 1LFHA 2XXVA 1YCJA 3SDFA 4MLVA 4XIGQ 2W7YA 3CI8A 5ICTA 5EHMA 4XKNA 3DP8A 1EU8A 3W15C 3IR1A 3H3GA 1FQEA 2E1SA 2NWJA 4GWOA 3P7IA 1HSEA 1PDAA 1PB9A 3S9NC 5TP9A 1ZIUA 1Y4CA 4I8CA 2M8CA 1Y3NA 3HHGA 3K6UA 4X1DA 2VP1A 3PUWE 1MH4A 3FUZA 4RA1A 1JVYA 1LCTA 1II5A 3N6TA 4G8HA 5EYFA 3SEWA 4QFLA 4OERA 4GVOA 4LZ5A 3TCGA 5FTIA 4IY5A 2F6PA 3SETA 5FHMA 1NNKA 2AYSA 3IO6A 4U1ZA 3A09A 5AA1A 5FHNA 3HCQA 5DVFA 5H8QA 4PQJA 3C9HA 4OVJA 1A54A 1LAFE 2ZYOA 1POTA 4NF5A 2ZNTA 2O1MA 3EF7A 3KGCA 5I2KA 2XHDA 5HM4B 4IO4A 3I3VA 1B0HA 1MH3A 2UYFA 3QK6A 1EH3A 5AE4A 2UVIA 4TLMB 1A8EA 3MW0A 2XXRA 1UTBB 4ECFA 4LQ5A 3EN3A 3OO8A 1M5CA 3I5OA 3DELB 4IO3A 5TP9B 4C0RA 5AA4B 5ITPA 5H8HA 3VXBA 4P11A 3PPRA 3GXAA 4RJZA 3PUXE 4R2FA 4BDQA 1MQJA 1MQDA 1ATGA 4G4PA 3E13X 4FJPA 3RN8A 2O51A 1JW1A 2V3QA 2Y84A 4PETA 1TFAA 1N3XA 2PT2A 5JTYB 5AA2D 2QS2A 4QRZA 2RF1A 5J1DA 3UP9A 3RPWA 1HSJA 3FXUA 3UK4A 2HZKA 4KPTA 5JK4A 1P99A 2B65A 4HW8A 3FJMA 2I0BA 1B4ZA 1MQIA 2Q88A 1B46A 2BJJX 1ANFA 4EF2A 3G3FA 1B05A 5DYHA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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