1SYHA

X-ray structure of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) in complex with (s)-cpw399 at 1.85 a resolution.
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Tyr702 Is an Important Determinant of Agonist Binding and Domain Closure of the Ligand-Binding Core of GluR2.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 83
structure length 259
sequence length 259
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-04-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1syhA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1syhA02
3O66A 1YPNA 1UQWA 3SEVA 1LCFA 2XX9A 4UACA 1LFGA 4OQOA 1MY3A 1RKMA 2XXWA 4GOTA 2LAOA 2RKMA 5B70A 2B3FA 1A55A 3IORA 1BIYA 2UVGA 4H5GA 2ABHA 3MAMA 4LVQA 2P2AA 3T9HB 4ZE9A 4G68A 1XVXA 2RC8A 2AL5A 3B7DA 4YICA 2OWSA 3CFLA 1AOVA 3VDFA 3OO8A 5DTBA 1I6AA 1N04A 3U94A 3KBRA 4ONYA 4BDNA 3Q26A 1H45A 1FW0A 4FATA 3KFMA 2F6PA 3PMXA 4F1VA 4OYVA 3O2AA 1B3LA 4IY5A 3T96B 1B7UA 4QFPA 5L9MA 5DVJA 4NTLA 4ZDMA 3DELB 4YMBA 1O63A 4OFLA 4E0WA 3SERA 4KFQA 4HCYA 5LOMA 4LZ8A 3IX1A 3MZ9A 3K4UA 4IO4A 3SEYA 1ATGA 5TPAB 4FAJA 4F31B 1TT1A 3FZVA 1LFHA 4G68C 3RUMA 2PVUA 3E13X 3O6IA 4H65A 1A99A 4L17A 3ONMA 1A40A 4MBPA 1Z7ME 3KEIA 3KN7A 4U22A 4JBZA 4GXAA 2DS9A 1Y3NA 4EXLA 1SW4A 1UTBA 1DPEA 1OQGA 3I5OA 4OETA 2QS1A 2D5WA 4NF6B 3TEPA 1OVTA 1HSLA 4RXLA 4IGTA 1USYH 1XC1A 4F22A 3Q27A 3FASA 4N07A 2W7YA 1FQCA 4C1TA 4LZ5A 3ZKLA 3M3KA 4O3CA 3OO9A 4KD5A 3FXUA 5FTHA 2RCAA 3K1NA 1SI1A 4KCCA 5JK4A 4F1UA 2RF1A 1FTMA 2GHBA 3RN8A 3TAJA 2XD3A 1D9VA 2O84X 2YLNA 1IIWA 3K1MA 1XHYA 3BFTA 3EHTA 4FIMA 5AE4A 2ZMBA 5KZTA 4NF5A 3VV5A 3FXQA 2DXRA 3N6TA 2XHDA 4GLIA 5K2XA 5ITOA 1R6ZA 1IEJA 4KCDA 3H7MA 5IKBA 1OQHA 3R6UA 1MY0A 4DZ1A 3EHUA 4QF9A 3OSRA 2O1LA 2Q9TA 2AIXA 5HBCA 3IK6B 3FJ7A 2Y7KA 3T9VA 1N84A 1LLSA 2H98A 1B6HA 4FE8A 4F18A 1ZTYA 2PBWA 3E9XA 4I1DA 3E4RA 5KDTA 4BDOA 4BDMA 3A3UA 4F1YA 4QFOA 2XXQA 3KN8A 2HXWA 3CRBA 5ICTA 2XXPA 3KG2A 4ZS9A 4H8IA 5AA2B 2D21A 3IAZA 2HEUA 3MPLA 3PPOA 5M2VA 1JEVA 3MP8A 3T9XB 3THIA 3QUJA 4P0IA 1LAHE 3O6HA 4XKRA 2GH9A 4R6KA 2QMXA 3N26A 2HQ0A 3KJ7A 3IB2A 4OVJA 4DXBA 3KZGA 3OMBA 2DWAA 1H3DA 5DYHA 2DE4A 4ELOA 1MXXA 1XOCA 2HAUA 4JSDA 4PFYA 4K3FA 3MJNA 3VLWA 1USYE 4NF8A 1QW0A 2XXUA 3Q29A 4Q5TA 3VXBA 1OVBA 5I2KA 2XXRA 4F2QA 3SETA 4F3BA 4R75A 1MQDA 1P1WA 5I59B 5JTYB 1YCJA 4ND9A 3I3VA 4YKPA 2VOZA 3TODA 2AL4A 2REJA 4FEBA 3IJXB 3MVZA 3PUWE 4X48A 1N0TA 5AA4B 3PUXE 3VVFA 4LQ2A 4KYSA 2F35A 3U93A 2ONKE 2O7IA 4WXJA 4HS7A 3AXFA 5KCJA 1B0LA 5L8DA 3O29A 2RC9A 4QSEA 2UVHA 2I0CA 3ZKKA 1A8EA 3WAEA 2Q89A 1JW5A 1H44A 4PFWA 3OO7A 4OMBA 2Q2CA 5ISUA 2ESNA 5BUUA 3H3GA 1NNPA 2XX7A 3TCHA 4RK9A 4HTGA 4U2RA 5CMMA 1JETA 4OZ9A 1SDXA 4ZEFA 2VD2A 1IXCA 3T22A 4RPOA 3LSWA 4Q30B 2UVIA 4O3AA 2NWJA 1B1HA 2M8CA 2VP1A 4KI0E 1WDNA 3MBPA 2V93A 4KYDA 3B6TA 5DVIA 4GVOA 1O64A 3CG1A 4NF4A 4GF8A 3DP4A 1MXYA 4U23A 1QVSA 4RJZA 1Y3PA 2B65A 4DCYA 5FHMA 3VE1B 3RGYA 1LAFE 1NKXA 1XT8A 3HPIA 1A54A 2DP8A 1JW1A 3TFLA 2Z8FA 3K0VA 4JWXA 1R1NA 4I62A 3SEXA 4M4GA 4DDDA 5JEIA 2ALUA 3S9LC 3TELA 1IQ7A 4ELQA 5I58A 2XXIA 3M3LA 1MM6A 3VLUA 4JXIA 3G3KA 5K2YA 4NEDA 5AA1A 2Z8EA 3PV0E 3QSLA 3TTKA 4OWDA 5CBSA 3VXCA 1OIBA 4DLDA 4XKPA 5CC2A 4H6DA 3ECRA 2VD3A 1DSNA 3KN3A 5HM4B 2R71A 1VFEA 2QL3A 1B2HA 4R74A 1B4ZA 4F19A 3C35A 3G3JA 5L9SA 2AYSA 3K01A 2I58A 5TP9B 3RT8A 2VHAA 5L9OA 1MXVA 5H8QA 1DOTA 3MWBA 1JVXA 2ONRA 1B05A 2F5XA 2QS4A 5F7VA 1RYXA 2F7CA 4BLAA 2HZKA 1MY2A 3CFZA 2ZXTA 3FXRA 5H8NA 3K6XA 4AB6A 2GHAA 1VR5A 1H43A 1UTBB 4ZEDA 2HAVA 2Y84A 4F3PA 4ZE8A 3IB0A 3QIMA 1JEUA 2RC7A 5CMBA 3KSXA 1M5CA 1EZPA 2ZYMA 3PUYE 4OENA 3E3KA 1SYHA 1FTOA 1JVYA 3KOSA 3ILTB 3KJTA 3TTLA 5BWJA 3MUQA 3MZ1A 1B7ZA 1MPDA 2ONSA 5CMCA 1I69A 3M8UA 1PBPA 1SW5A 1MQHA 2P0SA 1D9YA 3FVKA 3LUYA 2H4IA 3H6VA 3GZGA 1B7HA 4ZEBA 3SDFA 1DPPA 2H99A 3K1PA 2OZZA 4Q8RA 5FTIA 4DE8A 4DIGA 2Y7RA 3H6UA 1ELJA 1PBQA 3V89B 4E0XA 1UTHA 2IA4A 2Y7PA 2XXXA 4NF5B 4H8JA 4PFUA 3HSTA 4JWOA 1EZ9A 1Y4TA 4HW8A 2O51A 1J1NA 2ZNTA 5I57B 1LBCA 1FCKA 2OCUA 2QMWA 4PQJA 1B1XA 2GRVA 4U4XA 3SEUA 3Q28A 1QUIA 2WKYA 3FATA 5H8FA 4ZEIA 4THIA 3TTRA 2Q88A 2Y7WA 5KDTB 4POXA 4PETA 1BKAA 3KGCA 2NXOA 3JV9A 3RNNA 1F9BA 2A5SA 3HHFA 1ZMGA 4NMYA 2V3TA 1Q35A 2UVJA 3OOAA 4AB5A 5FHNA 3G3GA 4OERA 4F29A 4C1UA 2FYIA 3GBAA 3PU5A 3IJOB 1P1OA 2P1SA 2QSXA 3UGWA 4EF1A 2F97A 3G3FA 3H03A 2UXAA 3BBRA 5DEXA 4H67A 2ZNUA 3TQWA 1SD3A 5I56B 1PB8A 2XD2A 1AH5A 1LB9A 2GFEA 1LFIA 2B3BA 3RQTA 3EPEA 1D4NA 1N3XA 1B5JA 4X1BA 3LSXA 4NF8B 1PEBA 4YB7A 3W15C 3VVDA 4ESWA 5I2KB 3RT6B 2ZYOA 1B3GA 3EQ1A 4OESA 1US5A 4LA9A 1Y3QA 4WKMA 1MDQA 4RA1A 4YB5A 2I49A 3N5LA 3S9EA 3VLVA 5A5XA 1QUKA 4N6PA 3LC8A 2E1SA 4QSCA 3IB1A 3IOUA 3MW0A 2NOOA 4EUOA 4RYAA 2IEEA 3C34A 4F39A 4IGRA 4KPTA 3LSLA 3B6QA 3FJGA 4IB2A 1P1QA 2QS2A 1SVXB 5CM6A 2OJTA 4UA8A 1ZJLA 4U21A 3K00A 5KCJB 3GLBA 3PPQA 2O1MA 1B58A 4JDFA 4GRKA 3O97A 3MVYA 1YAEA 4OFOA 3V8XB 3RY3A 4O3BA 1CE2A 2NUVA 4EXKA 3FV1A 1LSTA 4FECA 1SYIA 4LZ7A 3B6WA 2V3UA 4OTEA 4NWDA 4YB6A 3FD3A 2F7BA 3CVGA 1MY4A 2ANJA 1EU8A 4GL8A 2H9BA 4U4SA 3K6WA 3PD9A 1B3FA 4ZZAA 2Q2AA 2QS3A 4EQ9A 1JQFA 1GVCA 3OEMA 3OEKA 4R2FA 4QFNA 3QXMA 3L6GA 2DVCA 3BFUA 2I4CA 4RK2A 4AQ4A 3G7WA 4I8CA 3HV1A 1PB7A 3ZSFA 2O69A 5AA2D 5HPQA 2HFBA 4BDRA 4NF4B 4YKIA 3O28A 2G93A 4RY1A 3MP1A 1TXFA 4BDLA 3F11A 3TTMA 1ZKBA 3U8QA 1GTKA 3MZBA 1MXZA 4YAHX 5CRYA 1B9JA 3MVXA 2DSFA 1FQAA 2I6EA 1N3WA 2PX1A 4U1OA 3A3CA 1QUJA 3T9UA 2E0SA 1BP5A 1DMBA 3H6TA 3GBBA 2O68A 4XTCQ 1POTA 2DVZA 3QYTA 3UN6A 4MLQA 2D3IA 3T66A 1SQYA 5I2NA 2FNCA 1NH7A 3SESA 1FQBA 4Z7EA 1LCTA 3MP6A 4G77A 3UIFA 4DXUA 5F1QA 2ZYKA 5H8SA 2R9JA 3HCQA 4R72A 1MS7A 5AA4A 2Z23A 2NVUB 1WVJA 2F78A 3TUSA 5H8HA 3OELA 1YTVA 3LR1A 3PUZE 3UORA 1ZBMA 2A5TA 5CMKA 5J1DA 4KHZE 1KWHA 4G68B 1MDP1 4JWYA 1IXGA 1PB9A 3H6WA 3IOWA 1QJMA 4GIZA 2Q8JA 3TTNA 3MPKA 1I6BA 3Q25A 1TFAA 3A09A 2V3QA 1B51A 2F8DA 4MH5A 3PGFA 1HSJA 4HCWA 1MY1A 4IO2A 3D4CA 4NE4A 4YKJA 4IO3A 3TCGA 1P1UA 1ANFA 2F34A 1II5A 3DP6A 3ODBA 3QK6A 1N7WA 3FV2A 1OMPA 3HO7A 2PT2A 3DM0A 2THIA 5EHMA 3JZJA 1EZOA 3FUZA 3MC2A 4LQ5A 1IXIA 1AIVA 1IXHA 3KSJA 1O7TA 3TCFA 3O9PA 1SI0A 2HCAA 4RNSA 4P11A 2I3VA 1R9LA 1UTHB 3OENA 4QFLA 1LAGE 3PMVA 2I4BA 4FJPA 1IITA 3FGSA 5ELVA 3TKDA 3C32A 4G8MA 3K6VA 1FTJA 3D4GA 3VVEA 2KLFA 1A8FA 4R2BA 4MF3A 2V84A 2G29A 4OFJA 1AMFA 2XXTA 3IR1A 4YZZA 3OSQA 1H76A 4XXUA 1NNKA 5H8FB 4F3GA 1NFTA 2DQVA 4QFKA 3UP9A 4M1VA 3IOTA 4X1DA 4U1ZA 3W9VA 4G2ZA 1MRPA 1MPBA 5TP9A 1Z7NE 4IO5A 3K02A 2OWTA 2PT1A 4JSOA 1FQFA 4Q0CA 3K2DA 1DTZA 5DEXB 3IO6A 4ELPA 4OEUA 3C4MA 2VGQA 1SBPA 1B0HA 4ZZEA 4KR5A 3G3HA 3IL1B 4GQOA 3R26A 1LAXA 1MQIA 3H4ZA 4LONB 2QJEA 4GWOA 1NL5A 1MM7A 3U1OA 2UYEA 1S7YA 2REGA 4ZEKA 3U92A 2YPNA 1B52A 1Y1MA 3O6GA 1MG1A 1TFDA 4R6HA 1MH4A 2DWJA 4QSDA 3PPNA 4OHNA 3PPRA 1NNTA 1Y4CA 1FQDA 1T0KA 4MFIA 3TQLA 4LATA 4OEVA 4TLMB 4IO6A 5A5XB 5TPAA 1UIVA 4TOZA 4XIGQ 4I9DA 5FHOA 3V5AA 4XKQA 1M5BA 4FEDA 1LB8A 2F7AA 4ESXA 5AA3A 1M5FA 1OLAA 4FORA 3FJMA 4DXCA 4DCXA 2I0BA 4MLVA 4LUBA 1MPCA 1RYOA 1N7XA 5CBRA 1R9QA 3W9WA 1BTJA 4LP2B 1TWYA 3GXAA 3U72A 1UIUA 1S9TA 3N6UA 1Q1KA 4H5FA 3S4UA 1Y9UA 1NNFA 1B3EA 2F36A 4BDQA 3PUVE 4NF6A 4YMAA 1B5IA 5EHSA 3TZAA 4P0GA 4N13A 1B40A 5I57A 1ZIUA 1PC3A 4R9GA 1XVYA 2X7PA 3RPWA 3CSBA 3TMGA 1SW1A 1POY1 3HHGA 3BKIB 2DYXA 4IO7A 3FIRA 5IAIA 3EF7A 3DLNA 3QUFA 4KQPA 3JYRA 5DT6A 3OO6A 4EQBA 3MQ9A 4POWA 4QRZA 1B3HA 3CIJA 3EHSA 5ICQA 2O7UA 1QKAA 4OXVA 2DOJA 4ZECA 2XXVA 3S9NC 3S2VA 2R6GE 1VE4A 3VFJA 2PMSA 2DE3A 5I56A 1OLCA 2Z8DA 2OBGA 2Z22A 2QPQA 4C0RA 2V25A 1MXUA 2XXYA 4Z0IA 3CSGA 2BJJX 4RPNA 1US4A 4ELRA 1URGA 1LBBA 4KYEA 1B5HA 1MQJA 3TDJA 1M5DA 3M3FA 1Y1ZA 3K6UA 2HZLA 2X7QA 4PFTA 2OLBA 1HSEA 3C36A 3WAFA 3CFXA 2H25A 1VFDA 2XX8A 3CG3A 4PE5B 4R73A 4YKKA 4G4PA 4H0WA 5I2NB 3C9HA 3EN3A 2I48A 3IOVA 1GGGA 4JB7A 2CZLA 5AA2A 2DE2A 1M5EA 3FVNA 1ZU0A 3N94A 1QKBA 3P7IA 4NWCA 3PPPA 3HN0A 1B46A 2ZNSA 5H8HB 4F2OA 3TYHA 4YU0A 3USDA 2ZYNA 1B4HA 3SKPA 3ZS6A 3S9MC 1URDA 1ZLQA 3ILUB 1BLFA 2A5TB 3FVOA 3C31A 3FVGA 2XXHA 5B7DA 4R9FA 1NMUA 3UA8A 1A7LA 2QRYA 3TPAA 3PMWA 3G3IA 4EQ7A 5CI5A 4TQUQ 3DP8A 1MXWA 4XKNA 1JNFA 1QULA 2UYFA 2YJPA 3UK4A 2CMOA 1D3KA 1VSOA 3SEWA 1FTKA 5DVFA 1IZ1A 5I58B 4ECFA 5I59A 3L6HA 5JTYA 4G8NA 1JW4A 1I6QA 3CR9A 1B32A 1FQEA 2I3WA 2F6GA 4IY6A 3LSFB 2DWIA 3RTFB 1WODA 4GXSB 5ITPA 1EH3A 1DTGA 1P99A 1IUDA 1MQGA 4G8HA 3CI8A 5EYFA 1PDAA 3I6VA 4GL0A 3PD8A 2OK2A 1FTLA 1Y20A 3T93B 2DWHA 3R7XA 1MH3A 1XS5A 3C33A 3QAXA 5H8QB 1N76A 4ISUA 2Y7IA 2RINA 2DXYA 4WEDA 2RCBA 1NH8A 3V83A 1SW2A 3RLFE 3OD7A 4PP0A 4F3SA 5H8NB 1AL3A 4QHQA 3H06B 1GV8A 2PYYA 4EF2A 3OXNA 5I84A 2X26A 3KOTA 2H5YA 1GR2A 4X9TA 5TU0A 4H1XA 4TLLB 2FA7A 4WEPA 1L5TA 4GD5A 2O6AA 1LGBC 4R6YA 3LBSA 3RTWB 3MVWA 1S50A 4EDPA 4GFRA 1CB6A 3IO4A 1URSA 1P1NA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
2VPOA 2B4MA 3O66A 1IMDA 1YPNA 1UQWA 3SEVA 3SZPA 1LCFA 2XX9A 2OWZA 4UACA 1LFGA 4OQOA 1MY3A 1RKMA 2XXWA 5EQ8A 4GOTA 2LAOA 2RKMA 5B70A 2B3FA 1A55A 3IORA 1BIYA 4O94A 2UVGA 4H5GA 2ABHA 3MAMA 4LVQA 2P2AA 3T9HB 4PGPA 4ZE9A 4G68A 1XVXA 2RC8A 2AL5A 3A29A 3B7DA 4YICA 3GYYA 2OWSA 4P1EA 3CFLA 1AOVA 3VDFA 3OO8A 5DTBA 1I6AA 1N04A 3U94A 3KBRA 4ONYA 4BDNA 3Q26A 1H45A 1FW0A 5IZ3A 2PFYA 4FATA 3KFMA 2F6PA 4XEQA 3PMXA 4F1VA 2CZKA 4OYVA 3O2AA 1B3LA 4IY5A 3T96B 1B7UA 4QFPA 5L9MA 5DVJA 4NTLA 4ZDMA 3DELB 4YMBA 4GX6A 1NUZA 1O63A 4OFLA 4E0WA 3SERA 4KFQA 4HCYA 1FRPA 1KA1A 5LOMA 2GQ1A 2V4CA 4LZ8A 4NN3A 3IX1A 3MZ9A 1LEVA 3K4UA 4IO4A 3SEYA 1IMEA 1ATGA 5TPAB 4FAJA 4F31B 4I3EA 1TT1A 3FZVA 1LFHA 4G68C 3RUMA 2PVUA 3E13X 1LBYA 3O6IA 4H65A 1A99A 4L17A 3ONMA 1A40A 4MBPA 1EYKA 1Z7ME 3KEIA 3KN7A 4U22A 5F24A 4GBWA 4JBZA 4GXAA 4GWYA 2DS9A 1Y3NA 4EXLA 1SW4A 1UTBA 1DPEA 1OQGA 3I5OA 4OETA 2QS1A 2D5WA 4NF6B 3TEPA 1OVTA 5IM2A 1HSLA 3RPLB 4RXLA 4IGTA 4MNPA 1USYH 1XC1A 4F22A 3Q27A 3FASA 4N07A 2W7YA 1FQCA 5LTCA 1FPKA 4C1TA 4LZ5A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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