1SYHA

X-ray structure of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) in complex with (s)-cpw399 at 1.85 a resolution.
Total Genus 83
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
83
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAYLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Tyr702 Is an Important Determinant of Agonist Binding and Domain Closure of the Ligand-Binding Core of GluR2.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 83
structure length 259
sequence length 259
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-04-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1syhA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1syhA02
1P1WA 3CG1A 1M5FA 4QFKA 1QUKA 2A5TA 1QKBA 2ANJA 2XHDA 3G3JA 2NOOA 4U22A 4DDDA 4IY6A 3OELA 3FJGA 5I59A 2GRVA 4OQOA 1B5IA 3RN8A 3G3GA 4RPNA 3K1MA 4I62A 2Z22A 1O64A 3MQ9A 2QS4A 1Y9UA 3TZAA 4BDMA 1AL3A 2PT2A 4MLQA 1XOCA 5H8NB 1B3EA 1WVJA 4NF6B 1NL5A 3FATA 2HQ0A 3QXMA 4AB6A 3IORA 1B05A 1MXWA 3H4ZA 4POXA 4GRKA 1B3LA 4H0WA 2O7IA 5J1DA 4N6PA 4OWDA 1GGGA 1OMPA 5EHSA 5AA4B 4Q0CA 2DWAA 3UIFA 4G8NA 4MH5A 1MY2A 3N6TA 4PE5B 2VD3A 3OD7A 3T66A 3RNNA 3TQLA 2RC9A 4NF4B 3R6UA 4NWCA 3N26A 3MJNA 4XKQA 3U92A 1B6HA 2Z8DA 5DTBA 3O66A 2V93A 1A54A 5H8SA 3QSLA 2ONKE 1A40A 2XXQA 5LOMA 2Y84A 4H65A 4R6YA 3TTNA 3K6VA 4DCXA 3AXFA 1MG1A 3U94A 4F31B 1I6QA 4E0XA 1XS5A 1LFGA 3IAZA 4OERA 1OQGA 1MY3A 1LCTA 1MDP1 4UA8A 1DPEA 1N3XA 3IB2A 5DEXB 2R9JA 4EUOA 1TWYA 4L17A 4RY1A 3Q25A 5CRYA 3OMBA 4YKPA 5A5XA 3C36A 1IITA 4ZEBA 4ZZAA 1R9LA 2IA4A 3G3IA 3MVXA 3ILTB 1DTGA 4JDFA 5EYFA 1B52A 4PFWA 1M5BA 3MUQA 3MP1A 3CFLA 3FIRA 1A8EA 1EZ9A 3H06B 3V83A 1FQEA 3FASA 1I6AA 4XKPA 5FHOA 1PDAA 3QUJA 1B0LA 1IEJA 4EDPA 1SW4A 1OVBA 1DOTA 4RXLA 4IGTA 1GTKA 4LQ2A 2I48A 1B32A 3LSFB 3O29A 1VE4A 3USDA 4DXUA 1AMFA 1PB7A 4F29A 3FZVA 4HW8A 1TT1A 4KCCA 1SW1A 2O68A 1SD3A 4NF5B 1ANFA 3QUFA 3TPAA 2KLFA 1J1NA 2HZKA 4YKJA 5FHNA 1EH3A 4BDOA 3PUZE 3G7WA 4GXSB 1I6BA 4BDRA 3MWBA 4DLDA 4LP2B 4G68C 3C4MA 4P11A 5H8HA 1NH7A 4Q5TA 2Z23A 4H5FA 4RPOA 1T0KA 2VP1A 1JW5A 3C9HA 1Q35A 1SDXA 1MQGA 1USYE 2HAUA 4R75A 5JTYA 1AH5A 1XT8A 1SVXB 5HPQA 2OJTA 4R9FA 1DMBA 4QRZA 4KYDA 3P7IA 4FE8A 4RA1A 3IK6B 3IX1A 3KG2A 4KI0E 3O97A 3M3FA 3ZKKA 3TFLA 1MM6A 2H5YA 1H44A 3H6VA 3MP8A 4O3AA 4FAJA 4U2RA 1VFDA 1MQDA 1MS7A 4G77A 1ATGA 2UYFA 2I4BA 3CFZA 2XXIA 4H5GA 3RLFE 3H6UA 1US4A 2OWTA 1YAEA 1FW0A 4P0IA 4NE4A 5ITPA 2A5TB 3PPQA 1FQDA 4AQ4A 1NNFA 3TTMA 3TODA 4OENA 4G68A 3U1OA 3V8XB 3L6HA 2WKYA 3IOTA 4GIZA 4LQ5A 2Y7IA 3I6VA 1IIWA 2ZXTA 1N76A 2O7UA 5F7VA 1FTKA 3VE1B 3K00A 5EHMA 4DXBA 3G3HA 1OIBA 4ZEFA 3N94A 3TUSA 1QUJA 4LONB 5ELVA 3O6GA 1Y1ZA 3K1NA 3HN0A 5K2YA 5BWJA 3H6WA 3ECRA 1TFAA 2I6EA 3PV0E 3TCHA 2Q2CA 1B58A 1LGBC 1MRPA 4OEVA 1Y4TA 3I5OA 3OO9A 4KHZE 2F6GA 4XXUA 4KYSA 4FIMA 2VGQA 4XKRA 3GLBA 5I58B 3HPIA 2XXRA 1KWHA 3MW0A 1PB9A 2B3FA 2F7CA 4Q30B 2F97A 2D21A 5CBRA 3E9XA 4H6DA 2P1SA 3MAMA 3SERA 1A7LA 2PX1A 3JV9A 2R71A 4G8MA 1DSNA 5CI5A 3DLNA 3O28A 2FNCA 4RYAA 4R2BA 2VHAA 4EQ7A 4OETA 3SETA 2Q9TA 1LCFA 4QSEA 1B9JA 1MXXA 3VXBA 3TQWA 4IO3A 3ODBA 1H45A 3TAJA 3QIMA 2IEEA 1P1OA 3FVKA 2F7BA 3KSJA 3T9XB 3RUMA 3MZ9A 4QHQA 4DXCA 4JSOA 4ISUA 4YZZA 5FTIA 1MH4A 4LZ5A 1SQYA 3LUYA 3KOTA 1LFHA 3W9VA 4IO2A 3FVGA 2HCAA 1JEUA 4EXLA 1GVCA 2VOZA 3KZGA 3GBAA 1Y3PA 4OHNA 2GH9A 3SESA 3FXUA 1Y3NA 4ZDMA 3IR1A 2XD2A 3BBRA 5L9SA 1HSLA 1RYXA 1PB8A 3FD3A 2R6GE 4ELPA 4GLIA 1B4HA 4OVJA 3DM0A 5DVIA 4F18A 3K4UA 5AA2B 2NUVA 1Y1MA 4ESWA 3TTLA 1M5EA 3BFUA 1B7ZA 1BLFA 4GFRA 2HEUA 3ZKLA 3Q26A 3K2DA 1IXCA 2AYSA 4X9TA 4IO7A 1NNTA 4F22A 1LB8A 4YU0A 4F2QA 3U72A 3RTWB 5H8QB 2HZLA 2W7YA 5CMMA 4NEDA 5H8HB 2HXWA 2F8DA 2UXAA 3TEPA 5CMKA 3CI8A 4U1ZA 2UVJA 1MY4A 1SYHA 3RY3A 4OESA 2DXYA 2QPQA 1B1XA 2ZYKA 5JTYB 3CSGA 1P99A 3V89B 4F3SA 4I1DA 3T96B 2XD3A 4U21A 4MBPA 4JB7A 3UGWA 4ZEIA 3TYHA 4GVOA 3CVGA 5H8FA 1B2HA 2ZMBA 1UQWA 2QS1A 3TMGA 3E3KA 1IXHA 3TCFA 2Z8EA 1R6ZA 4LATA 1B5HA 5I57B 4EQBA 1OQHA 3SEWA 3LSWA 5HBCA 4OMBA 3D4CA 4JWYA 2E1SA 4YKIA 3MVWA 2XX9A 3TTRA 2RCBA 2BJJX 1UTHA 4G2ZA 4BDQA 4G68B 1B46A 5I2KB 1LBCA 3IL1B 3H03A 1NKXA 1NMUA 1JQFA 3KGCA 2GHAA 4OFOA 3O6HA 1MDQA 3HO7A 4YMBA 3Q29A 3K0VA 4IO5A 1QW0A 3VLVA 1D9YA 1MXYA 1ZLQA 4H67A 1TFDA 4X48A 1OLAA 3UP9A 3IOVA 3LR1A 3KN7A 4P0GA 3W9WA 4ESXA 3MZ1A 3A3UA 4HCYA 3KFMA 3W15C 5TPAA 3VVDA 3KJTA 1HSEA 4QFNA 2XXTA 1ZMGA 5HM4B 1SW5A 3G3KA 4OTEA 4POWA 2M8CA 3HHGA 2V3TA 2YPNA 1B3FA 3H6TA 4YB6A 2ZNUA 3IB0A 1A8FA 1QVSA 1WDNA 2DWHA 3C34A 2Q2AA 2V3UA 3RTFB 2O6AA 1MPBA 4GF8A 1BKAA 2B65A 3PGFA 2D3IA 2QJEA 3MVYA 4FEDA 4BLAA 1BP5A 4NF8A 3V5AA 4JWOA 4PFYA 2OZZA 2I0BA 5I2NA 4U4XA 4R74A 1DTZA 3OO7A 3M8UA 4BDLA 3UA8A 2P0SA 4KFQA 3VV5A 1R1NA 4M1VA 5KZTA 1MPCA 1S50A 4DCYA 3B6QA 4ZZEA 5ICTA 4MLVA 4RJZA 4F39A 4C1UA 4GQOA 1MY1A 1O63A 3HHFA 3ZSFA 2Z8FA 4K3FA 4TLLB 3VVFA 4R6HA 4KD5A 2H4IA 3MP6A 4Z7EA 1O7TA 4ND9A 5AE4A 3GBBA 4GXAA 5TU0A 3DP6A 1RKMA 4UACA 5F1QA 4GWOA 5M2VA 2Y7RA 2F34A 3PMVA 1B1HA 2DSFA 1FQCA 3N6UA 3H3GA 4F3PA 2F7AA 1D3KA 5H8NA 5B7DA 4NF6A 1LFIA 1UTBB 5ITOA 3VXCA 1B40A 4GL0A 3VVEA 4JSDA 4LUBA 1ZTYA 2AL4A 3QK6A 1VR5A 3PUYE 1MQHA 2OK2A 2QS2A 3SKPA 1N7WA 4QFLA 2Q8JA 1N84A 3S9MC 1EZPA 5I59B 3TCGA 4F1UA 1A55A 2DS9A 1B7HA 1MH3A 4JXIA 4XIGQ 3FUZA 1YTVA 5CC2A 2O51A 1CE2A 2I3VA 2NVUB 3FJMA 4YICA 4PFUA 5DT6A 2CZLA 3UORA 1XVYA 2RC7A 1YCJA 3RT8A 3T93B 3K6XA 3N5LA 4NTLA 1H76A 4TOZA 3FXRA 2UYEA 5H8FB 1OLCA 1MQIA 2ZYNA 3BFTA 3PPRA 2ZYOA 3A3CA 1NNPA 3K6UA 5AA3A 5KCJA 5DEXA 1QJMA 1NFTA 1Y4CA 4XKNA 5K2XA 4AB5A 1US5A 2DE3A 1QUIA 4U4SA 1MM7A 1URGA 3CG3A 4LZ8A 2REGA 3OSQA 1XHYA 3OO6A 3WAEA 3O2AA 4F3BA 1B51A 2DP8A 2XXVA 2FA7A 3PUVE 4QFPA 2DYXA 1I69A 1LAXA 1UIUA 4YMAA 2I3WA 2YLNA 4I8CA 4DIGA 3M3KA 4M4GA 3S4UA 4C0RA 4Q8RA 3OO8A 2X7QA 4G8HA 3SEUA 2G29A 3PU5A 2RCAA 1S9TA 4LVQA 2DVZA 2RC8A 1ZJLA 2ESNA 3LC8A 5I56A 2Q88A 4C1TA 3OSRA 4JBZA 3CRBA 5TPAB 3TKDA 4PP0A 1N04A 5A5XB 4TQUQ 1H3DA 1P1UA 1BIYA 2OCUA 4G4PA 2OWSA 4IGRA 2ZNTA 3FVOA 2ONRA 3ILUB 1PEBA 2DXRA 3PUWE 1TXFA 2ZNSA 4O3CA 3BKIB 3OEKA 1USYH 2I58A 1JVYA 4FECA 1JNFA 3OENA 3IJOB 3VLWA 2RKMA 1AOVA 3MPLA 4JWXA 1FQAA 3MC2A 4FJPA 4U1OA 1Y3QA 1ZU0A 2NXOA 2I49A 1B3GA 1S7YA 1LAHE 4KCDA 1AIVA 3MVZA 1SYIA 3QAXA 3OOAA 3C31A 2ABHA 3MZBA 1Z7NE 3C35A 4HCWA 4R9GA 2QRYA 1SW2A 1URSA 2PT1A 2DWJA 1BTJA 3EHUA 2Y7KA 5TP9A 3D4GA 3C33A 4F19A 1Q1KA 1FTLA 3DP4A 3U93A 1F9BA 2ALUA 2XXXA 3PPOA 4H8IA 3OEMA 4OEUA 3SDFA 3L6GA 3EQ1A 4ELOA 3Q27A 4OYVA 1UIVA 1B3HA 2DE4A 3GXAA 3T9UA 5IAIA 2PMSA 4ZE8A 3CIJA 4PQJA 1H43A 4X1DA 4RK9A 1SBPA 3FV2A 1MY0A 4NMYA 1JW1A 2F5XA 5AA1A 4N07A 1D4NA 4OFLA 1LAFE 1WODA 4DE8A 1L5TA 4F1YA 3O9PA 4GL8A 2QS3A 3IOWA 2OBGA 4PFTA 3SEYA 1LBBA 3EHSA 5I58A 2B3BA 4ZEDA 3B6TA 5KDTA 1OVTA 5ICQA 2PYYA 1MQJA 3FJ7A 5CM6A 3T9VA 2DQVA 3HSTA 4EQ9A 3THIA 1B7UA 4H1XA 2QMWA 3EF7A 2RF1A 1URDA 2H98A 2DVCA 3EPEA 4O3BA 2AIXA 1LLSA 3IO6A 1IXIA 4FATA 1ZBMA 3KN8A 3T9HB 5L9MA 3S9EA 1HSJA 5ISUA 1IUDA 3MPKA 2CMOA 1MXUA 5FTHA 2LAOA 4HTGA 1RYOA 2O69A 1EU8A 3VFJA 5JK4A 2NWJA 2ONSA 3CSBA 2UVGA 3PD8A 2A5SA 4R73A 2P2AA 3IOUA 5KCJB 4R6KA 3WAFA 5JEIA 2V84A 3FGSA 3E13X 4ZS9A 1ELJA 3E4RA 2DWIA 2PBWA 2XXYA 1VFEA 2QMXA 3KN3A 4TLMB 2H9BA 4IO6A 4OFJA 4QF9A 3JZJA 3R26A 3HCQA 1SI1A 3PMWA 4XTCQ 4KR5A 1MXZA 4EF1A 2HFBA 4EF2A 2GHBA 3KJ7A 4KYEA 1XC1A 4NWDA 1MXVA 1JW4A 4ELQA 2V25A 5DVJA 1NH8A 4I9DA 4IY5A 2XXHA 4X1BA 5AA2A 1NNKA 3QYTA 1Y20A 2I0CA 2O1MA 4HS7A 5I56B 2GFEA 2E0SA 4QSDA 1B5JA 3K1PA 4F3GA 3IJXB 4ONYA 2F35A 1PBPA 3M3LA 3RGYA 3SEXA 5L9OA 2O84X 1ZIUA 1EZOA 2DOJA 5H8QA 4U23A 5BUUA 3ONMA 3FXQA 4Z0IA 3TTKA 2REJA 4RK2A 4R2FA 5IKBA 3Q28A 1GV8A 1LSTA 4ECFA 2D5WA 4GD5A 2DE2A 3SEVA 1M5CA 3FVNA 1N3WA 1IXGA 5CBSA 3MBPA 2XX7A 3S2VA 3ZS6A 1VSOA 2XXUA 3K6WA 1GR2A 5B70A 4KPTA 1FTOA 3LSXA 3CR9A 2THIA 4PETA 1A99A 1Z7ME 4YB5A 4WEDA 5AA4A 5I57A 3RQTA 1II5A 4ZE9A 3K01A 3T22A 1PC3A 3PMXA 1D9VA 2X7PA 3K02A 2XXPA 2H99A 2Y7WA 4EXKA 5TP9B 4NF4A 3F11A 1LB9A 3I3VA 4OXVA 1JETA 2RINA 3A09A 3TDJA 5I2KA 3RT6B 4RNSA 2O1LA 5I84A 4GOTA 2XX8A 2ZYMA 1N0TA 4WEPA 3G3FA 3S9LC 1FCKA 1B4ZA 1ZKBA 5CMBA 1N7XA 3DELB 4WKMA 4YAHX 4YB7A 3OXNA 2Q89A 5DVFA 4E0WA 4ZEKA 1P1QA 3IO4A 4OZ9A 4H8JA 1FQFA 1FTMA 3UK4A 1FTJA 2HAVA 3EHTA 3PPNA 5KDTB 3UN6A 3VDFA 1UTHB 3HV1A 2QSXA 3GZGA 5DYHA 4LA9A 1YPNA 3PUXE 1CB6A 3JYRA 2F6PA 2X26A 3C32A 2F78A 3EN3A 3U8QA 3LBSA 1MPDA 3IB1A 1FQBA 4MFIA 4F2OA 1JEVA 1JVXA 2QL3A 1IZ1A 3FV1A 4IB2A 3KSXA 1PBQA 1POY1 2PVUA 4DZ1A 1QKAA 4QFOA 4NF5A 1POTA 3VLUA 3B6WA 1LAGE 4R72A 2Y7PA 3KBRA 2G93A 2I4CA 4MF3A 2F36A 4QSCA 4FORA 3PPPA 2AL5A 3KEIA 3LSLA 4LZ7A 3DP8A 4KQPA 1QULA 4FEBA 5FHMA 3PD9A 3KOSA 3TELA 4WXJA 2YJPA 2UVIA 1SI0A 2V3QA 3CFXA 4IO4A 3O6IA 1M5DA 2UVHA 4THIA 1IQ7A 1B0HA 3RPWA 4NF8B 1P1NA 2VD2A 2H25A 2XXWA 3R7XA 3H7MA 5I2NB 3B7DA 4F1VA 5CMCA 4YKKA 5AA2D 5L8DA 3S9NC 1XVXA 1UTBA 4N13A 2FYIA 4BDNA 1DPPA 1R9QA 2OLBA 4ELRA 4ZECA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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