1SYIA

X-ray structure of the y702f mutant of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) in complex with (s)-cpw399 at 2.1 a resolution.
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Tyr702 Is an Important Determinant of Agonist Binding and Domain Closure of the Ligand-Binding Core of GluR2.
pubmed doi rcsb
molecule tags Membrane protein
source organism Rattus norvegicus
molecule keywords Glutamate receptor 2
total genus 85
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-04-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1syiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1syiA02
3QK6A 1BLFA 3QAXA 2O69A 1PBPA 2Q89A 4NMYA 1TXFA 1SVXB 4PFTA 5AA4B 1PBQA 5M2VA 4GIZA 1QULA 1XC1A 3O97A 3Q26A 1AIVA 4K3FA 1IXCA 5CRYA 1B4HA 4NF4B 1JQFA 3OSQA 3ZKKA 1LSTA 5H8NA 2V3TA 3OO8A 4YKIA 3ZSFA 1M5EA 1ZLQA 1QUKA 4QFKA 3S9MC 4XKQA 2OZZA 2Q8JA 4KFQA 4F3BA 1B0LA 1DPEA 4FIMA 5DYHA 3PUVE 2NVUB 4JB7A 4DDDA 4ECFA 5KZTA 4JWOA 3RT6B 2ONSA 2XXIA 4XKRA 2H99A 3DP4A 1IQ7A 1O63A 5I59B 4RNSA 2DWHA 3MVYA 4ZEKA 3KZGA 2Z8EA 4L17A 4IO4A 3THIA 1LBCA 1Y4CA 1P1UA 4HW8A 4WEPA 3G3FA 4KQPA 1FQEA 2HCAA 3EHUA 1SBPA 2O51A 4H6DA 3IAZA 2AYSA 1B0HA 5DEXB 2H25A 1OIBA 3E4RA 1MPCA 4FEDA 2QMWA 4LONB 4N13A 1I69A 3W15C 4ZDMA 2I49A 4OEUA 4RK2A 4YB7A 3FD3A 3O9PA 3MUQA 3JYRA 2DOJA 2W7YA 2RCBA 1EU8A 2UYEA 4ZS9A 2QJEA 5FTHA 1M5CA 1MXUA 4HTGA 1MRPA 2Q88A 2A5TB 4RJZA 1T0KA 4R74A 3FVKA 3OD7A 3HO7A 5L9SA 1VFDA 5L9MA 1SYIA 1OLCA 5I56A 3CR9A 3MZ9A 1LAHE 1FTMA 3ONMA 4G8HA 4DLDA 4F3SA 1YAEA 1NNTA 4F18A 4M4GA 1PB8A 2D3IA 4YKJA 2X7PA 3G3GA 2HQ0A 3RPWA 2F7CA 3D4GA 3BFTA 3QUFA 5ICTA 3PUXE 5F1QA 3CFLA 3V83A 3LSLA 2I4CA 5CMBA 3IOUA 4MBPA 4F3GA 4IO3A 3PUWE 2PT2A 3FXRA 2REJA 1ZU0A 1OQHA 4JDFA 2KLFA 4KCDA 1MM7A 4DXBA 1Y4TA 5J1DA 3EF7A 4FJPA 2XD3A 3TODA 4YB5A 2D21A 1FQCA 4ZE8A 2XXHA 3UK4A 4G68A 1I6BA 2QRYA 3S2VA 4NWCA 3BBRA 1AL3A 3FGSA 3C4MA 1N3WA 1A99A 3TZAA 1M5FA 1QUIA 2I6EA 2OCUA 5AA4A 4C1UA 4JBZA 3TCGA 5A5XB 1R9QA 3CG1A 3RUMA 4XXUA 4AB6A 4EUOA 4NF4A 4ESXA 4ND9A 3JZJA 3OOAA 4KYDA 4G4PA 2REGA 1Y3PA 2DWJA 3IO6A 2DE4A 2RC8A 4OXVA 2B65A 3QUJA 3GBBA 1B6HA 3RTFB 3PUZE 4R2BA 1QW0A 4ELRA 1B5IA 2PYYA 3CSGA 4FECA 1DMBA 5CBRA 4X1DA 4JSDA 3R26A 3OELA 3RT8A 2O6AA 4OETA 1SD3A 4DXUA 3CRBA 5F7VA 1A55A 3GBAA 1OVTA 5I59A 1USYH 3OEKA 4QFLA 3G3JA 1MM6A 1TFDA 2OJTA 3C35A 3DP8A 3N26A 1XVXA 3Q27A 2DE2A 3C36A 2Z22A 5ELVA 1ZJLA 3VVDA 2Z8FA 2WKYA 1A40A 3TUSA 5DEXA 4GLIA 4TLMB 1Z7ME 4ZZEA 2P2AA 1NFTA 3IO4A 5H8HB 3VXBA 1TT1A 3KN8A 4RY1A 3RN8A 3IK6B 4Q5TA 2DQVA 1BIYA 2A5TA 3KGCA 2HXWA 2P0SA 4R72A 1JW5A 3U72A 3UIFA 3DELB 3MQ9A 4GWOA 3O66A 1ZIUA 2ZYMA 2Q2CA 4O3AA 3FJGA 5K2XA 5HPQA 3E9XA 4O3BA 4QRZA 3PPNA 4G2ZA 4H8IA 4OWDA 5BUUA 5IAIA 4WXJA 1Y20A 3IJXB 4F2QA 4P0IA 3G3KA 3TTKA 1MY0A 1LFHA 3MPKA 1DTGA 2QL3A 2Q9TA 4TQUQ 4BDOA 2DSFA 3O29A 4I1DA 4U4SA 3VXCA 2HEUA 4LA9A 4YKKA 4QFOA 2I58A 3ODBA 3Q29A 3ILTB 1BKAA 4GQOA 3K6XA 4X9TA 4LQ5A 4GL0A 4QHQA 4NF8B 3SEXA 1NL5A 4FEBA 1FQBA 3V89B 3VLUA 5CC2A 3B6TA 1MQDA 1LCFA 2AL4A 3C32A 1O64A 4FE8A 1MQHA 2G93A 2I0BA 4IO7A 4RXLA 1SW1A 3CI8A 1DSNA 1EZ9A 2G29A 2ZYKA 3OXNA 4IO6A 3SEWA 3TAJA 3TTMA 5DVFA 1SDXA 4DXCA 3V5AA 1RYXA 1MH4A 2Z23A 1GGGA 3SEYA 1OVBA 1UTHA 3KBRA 4YZZA 1MY1A 4ZEDA 4IY6A 4PQJA 1SI0A 3KJ7A 2NUVA 1FTOA 3N5LA 1LAXA 3EHTA 1GVCA 1EZOA 3MBPA 5AA2D 4FAJA 1DOTA 1YTVA 5FHOA 1B7UA 4O3CA 3QYTA 4GVOA 1B40A 3B7DA 2PBWA 5AA3A 2I3VA 2XX9A 3PD9A 1SYHA 2THIA 2I48A 3MVXA 1MXYA 3H3GA 1XHYA 1LGBC 5DTBA 2XXVA 3PPPA 2RKMA 2F7AA 3C34A 4PP0A 2A5SA 5I57A 4ISUA 2CMOA 1S9TA 2GHAA 2H4IA 2OLBA 1HSEA 4YICA 4H5FA 4F3PA 2I3WA 1FQDA 1NNKA 2ZNUA 2FNCA 2Q2AA 1JEVA 5B7DA 3G7WA 1PB7A 2PVUA 3KSJA 2UVIA 3RY3A 1JETA 5KCJB 3RGYA 2B3FA 3K1MA 1IITA 1B5HA 3TTNA 1LB8A 4DIGA 3CVGA 3UP9A 5H8HA 3W9VA 1FQFA 3MZ1A 1B4ZA 4ELPA 1PB9A 1FQAA 3M3FA 1SW4A 1LCTA 2XXTA 1IEJA 4H8JA 4EXKA 1B52A 1L5TA 1B3GA 4IO2A 4DE8A 2QS4A 1CB6A 4LZ5A 3QXMA 1URGA 1B3EA 3WAEA 1Q35A 3H6UA 3H4ZA 3MP8A 4FORA 5CMCA 3TFLA 2VOZA 4QSCA 2ZNSA 3FASA 3L6HA 5FHMA 2RCAA 2V3QA 3OMBA 1N3XA 2F6GA 1N0TA 2Y7IA 2UVHA 4DZ1A 3K1PA 3U8QA 5AA2B 1FTJA 3DM0A 5LOMA 4OZ9A 3TMGA 4HCWA 1SQYA 3VV5A 2DP8A 4JWYA 4OENA 1QKAA 2QS3A 4R6HA 2F6PA 5CMKA 3O2AA 3S9LC 3K6UA 4NF8A 1MDQA 1IXIA 1MG1A 4XTCQ 3K4UA 2F34A 2F78A 3EPEA 4GD5A 3K00A 2Y7RA 3TDJA 3OENA 3S9EA 3T93B 3LBSA 5FHNA 1D9YA 1H45A 2VGQA 1B3HA 3S4UA 4YU0A 3VFJA 1B3FA 1TFAA 3I5OA 3T22A 3E3KA 1XS5A 3QSLA 4MLVA 3K02A 2RC9A 3FATA 2VD3A 5KDTB 3C31A 2ABHA 4R75A 4WKMA 3N6UA 1MDP1 4KI0E 4Q8RA 3B6QA 2DWIA 3DP6A 1IZ1A 4BDLA 1ZBMA 1II5A 2F97A 3CIJA 1B1XA 2XXPA 3MVZA 4MLQA 4KHZE 2IA4A 3VVEA 5L9OA 3H06B 3JV9A 5CM6A 5H8QB 5JK4A 1UQWA 1P1WA 1P1NA 1OMPA 4I62A 1B32A 2OWTA 4QFPA 2Y7WA 3SKPA 1B3LA 4U23A 3D4CA 1A54A 1EZPA 3HPIA 5BWJA 3U1OA 1H43A 1M5BA 2V25A 2VD2A 4DCYA 4HS7A 3N94A 4OQOA 2PX1A 2FA7A 3OSRA 3M3LA 3SEUA 4R9FA 1MS7A 4I8CA 2ZXTA 1AMFA 1ATGA 2F35A 2V84A 3KSXA 1F9BA 2RINA 5EHMA 5KCJA 3CG3A 5HM4B 4IB2A 1N76A 3K01A 1B05A 3PPRA 2VP1A 1UTBB 1MY3A 2R9JA 4OFOA 1TWYA 5ISUA 3T9UA 1Y3NA 3PMWA 4GL8A 2VHAA 4NTLA 1P1OA 2XXUA 2YJPA 4IGTA 5ITPA 2O1MA 3TYHA 5CI5A 1MXWA 2AL5A 3MVWA 1POY1 1POTA 4ZEFA 4JWXA 1H76A 1J1NA 3RQTA 4KD5A 3LSFB 3FUZA 4PFWA 5JTYB 2UXAA 1I6QA 3VVFA 4FATA 3USDA 4POWA 3MC2A 3FV2A 1US5A 2UYFA 1QVSA 4OEVA 2O7UA 3QIMA 1D4NA 2HAUA 3FVOA 3LSWA 4ZE9A 2O1LA 4MFIA 3H6WA 1B5JA 4XIGQ 2ONRA 5AA2A 3CFXA 3ILUB 5CMMA 4YMBA 2DVZA 4NE4A 3PMXA 5B70A 1IUDA 4BLAA 3T9VA 1RKMA 3FV1A 2ZMBA 2F7BA 2DS9A 3UA8A 2Y7PA 1VE4A 2CZLA 1M5DA 5I58B 1VFEA 4JXIA 3TTRA 1XT8A 4Z7EA 1B7ZA 3FVGA 5I2KB 1MQJA 3U92A 5DVJA 3UGWA 4EF2A 4F31B 4G8NA 1LLSA 3KN7A 1UIVA 4RPNA 4YAHX 3FVNA 3R7XA 3MWBA 5KDTA 5IKBA 4G68C 1LAFE 4NF5B 1NH8A 5I2NB 2LAOA 1O7TA 4ELQA 3E13X 2DXRA 5CBSA 3OO7A 4H5GA 4F1VA 3DLNA 1B7HA 4OYVA 3PGFA 1QKBA 4OFJA 4EQBA 2DWAA 4NF6B 4E0WA 4LZ7A 3KEIA 4GOTA 1MXVA 3OEMA 1B2HA 2XXYA 3SDFA 3TCHA 5A5XA 5H8QA 4LVQA 2XHDA 1FTKA 2H9BA 3KG2A 1R9LA 3F11A 1N84A 1NH7A 3FZVA 3BKIB 3I6VA 3IR1A 4RA1A 3IB0A 4LZ8A 5L8DA 1AH5A 5TPAB 3Q25A 3I3VA 2ZYOA 1MY4A 4H67A 3VDFA 4YKPA 3EHSA 1BP5A 2ALUA 3KJTA 1GV8A 4KCCA 3MAMA 3SERA 4P0GA 2UVJA 4BDNA 2OWSA 4OHNA 3PV0E 3U94A 1LFIA 1D3KA 1DTZA 1BTJA 4H1XA 1B58A 1B51A 1N7XA 3K1NA 3B6WA 1UTBA 3A3CA 1MY2A 3H7MA 1Q1KA 3HV1A 2O68A 1UIUA 2B3BA 4KYEA 2NWJA 3K2DA 3LSXA 3IOVA 4BDMA 2X7QA 2NXOA 1I6AA 4MF3A 2XX7A 4GFRA 4RYAA 4BDQA 3IOWA 4THIA 4GRKA 4F1YA 3T9XB 3CSBA 2YPNA 3FXUA 2V3UA 4R9GA 5JTYA 4QSDA 1LFGA 4U4XA 2XXRA 1FTLA 2RF1A 3T96B 1P99A 1N04A 2GHBA 2F36A 3GLBA 1OLAA 3OO9A 5FTIA 4GXSB 1Y1ZA 1P1QA 2BJJX 1MPDA 2D5WA 3GZGA 2ESNA 1ZTYA 4F2OA 4LUBA 4QFNA 4OESA 4OFLA 3IB2A 2OK2A 4QF9A 4IGRA 4MH5A 4ZEIA 2QS1A 1ZMGA 1B9JA 1KWHA 1JW1A 3IOTA 2I0CA 5I84A 3MP1A 4P11A 3CFZA 3TCFA 3GXAA 1MQGA 3PUYE 1AOVA 1MH3A 5I58A 4ESWA 2E1SA 2QSXA 5JEIA 1VSOA 1WODA 3SETA 2R6GE 3TQWA 2PMSA 3HSTA 3UORA 3H03A 1H44A 3EQ1A 5I2KA 3V8XB 3MZBA 4X1BA 3HN0A 1NNFA 2XXXA 2Z8DA 4YMAA 2QS2A 4R2FA 1YCJA 1URDA 1JNFA 2Y7KA 2OBGA 2NOOA 3P7IA 4NEDA 4XKNA 3A3UA 2YLNA 5H8FB 1LAGE 1R6ZA 4NF5A 1DPPA 5I2NA 1EH3A 4EDPA 2H98A 3K6WA 3S9NC 4ONYA 4E0XA 5K2YA 4NF6A 2HFBA 4WEDA 4TOZA 3SEVA 1ZKBA 4ZEBA 5TP9B 5ITOA 1H3DA 3C33A 1HSLA 4OVJA 4BDRA 4R6YA 4M1VA 3T9HB 1JEUA 4LATA 3ECRA 4X48A 4H65A 3PPOA 1PEBA 4KYSA 2V93A 2DYXA 4PFUA 4R73A 3U93A 2R71A 3AXFA 1SW5A 1HSJA 1WDNA 4PFYA 1JVXA 5TPAA 4F19A 3FXQA 5ICQA 4F1UA 4U22A 5DT6A 5EYFA 4EQ9A 2HZKA 3IB1A 2F5XA 3HHFA 4F29A 1WVJA 3O6HA 4ZZAA 1MXZA 1UTHB 1N7WA 2RC7A 3LC8A 1D9VA 3TTLA 3IX1A 4C0RA 5H8SA 1US4A 4LQ2A 4GF8A 4AQ4A 4RPOA 1MPBA 3LR1A 4EXLA 3TEPA 3M8UA 5AE4A 3O6GA 4OERA 1A8FA 1FCKA 5HBCA 3H6VA 2PT1A 3C9HA 3N6TA 1NKXA 1Y3QA 1IXHA 1YPNA 5H8NB 5AA1A 4ELOA 3A09A 3OO6A 3MPLA 1QJMA 3HHGA 4HCYA 1A8EA 2O84X 4H0WA 1Y9UA 4U1OA 4IO5A 1A7LA 3MP6A 1B1HA 3LUYA 3RNNA 5I57B 2HAVA 4UA8A 1JW4A 2XX8A 4GXAA 4UACA 2O7IA 3K6VA 3KN3A 1Z7NE 3FIRA 3UN6A 4U1ZA 3W9WA 4I9DA 3IL1B 1PC3A 4F39A 3M3KA 1Y1MA 1ANFA 3EN3A 4RK9A 3TKDA 4R6KA 3KOTA 1FW0A 4OTEA 1XVYA 4POXA 2I4BA 3PPQA 3TQLA 1SW2A 3PMVA 3TPAA 1S7YA 4AB5A 2XXQA 4U2RA 2IEEA 3G3HA 2P1SA 4PE5B 3VLWA 4EF1A 2GH9A 2DVCA 1QUJA 5EHSA 1LB9A 1VR5A 4Q30B 2ZNTA 1NNPA 5DVIA 4KPTA 2XXWA 4DCXA 3H6TA 2GRVA 4U21A 2QMXA 3PU5A 1MQIA 2GFEA 2Y84A 1S50A 3Q28A 1OQGA 4G77A 2F8DA 3KOSA 3RLFE 2E0SA 4IY5A 4ZECA 5H8FA 4G8MA 4C1TA 1GTKA 4EQ7A 3IJOB 5I56B 1JVYA 4Z0IA 4YB6A 3ZS6A 2FYIA 1CE2A 1R1NA 2DE3A 3L6GA 1ELJA 1PDAA 3HCQA 3MW0A 4JSOA 3TELA 1B46A 3KFMA 4KR5A 4PETA 1URSA 3R6UA 3MJNA 1RYOA 4OMBA 2DXYA 5TP9A 2ONKE 2X26A 2H5YA 3VLVA 2M8CA 3O28A 3SESA 3PD8A 2ZYNA 3BFUA 1GR2A 1LBBA 1NMUA 2AIXA 3IORA 4XKPA 1SI1A 4NWDA 5TU0A 3RTWB 2QPQA 2XD2A 1USYE 1IIWA 3ZKLA 1XOCA 4QSEA 3VE1B 3FJMA 3O6IA 4TLLB 2HZLA 4Q0CA 2UVGA 4F22A 1IXGA 3FJ7A 3T66A 3WAFA 1MXXA 4G68B 4N07A 4N6PA 3K0VA 4LP2B 2ANJA 3G3IA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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