1SYIA

X-ray structure of the y702f mutant of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) in complex with (s)-cpw399 at 2.1 a resolution.
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
publication title Tyr702 Is an Important Determinant of Agonist Binding and Domain Closure of the Ligand-Binding Core of GluR2.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Glutamate receptor 2
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 85
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-04-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1syiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1syiA02
1ZU0A 1BP5A 5I58B 4ZEDA 2NOOA 2RC8A 3KN7A 2QMWA 1VSOA 2DVZA 1FW0A 2QSXA 2AL5A 1ATGA 3DP6A 4F2QA 3K2DA 5JTYB 1LFGA 4POXA 3IORA 3T9UA 3HCQA 4WEPA 5B7DA 4GQOA 4ZE9A 1CB6A 4DCXA 2QS2A 4WEDA 4FIMA 3EPEA 4ELRA 4HCWA 2F8DA 4TQUQ 2D3IA 4NWCA 2CZLA 4DLDA 2PT1A 1B7UA 3SDFA 3HPIA 3D4CA 1O7TA 4GF8A 3D4GA 2DE4A 5K2XA 3V89B 5CBSA 2F97A 2V84A 2PBWA 1B0LA 5FTHA 5M2VA 3Q25A 5AA4B 3K6VA 1D9VA 3JYRA 1SYIA 4KR5A 4F31B 2ONSA 2XD3A 4DCYA 3DP4A 2RINA 2V25A 1UQWA 3SEXA 1HSJA 1SW5A 3JV9A 2NVUB 1MPDA 1UIUA 2R9JA 3B7DA 3SKPA 2QL3A 4QFOA 1XS5A 4R74A 2O1LA 3U93A 3N6UA 4LZ7A 3MAMA 4OFOA 1Y3NA 3UP9A 1MQJA 2A5TB 2QRYA 2Q2CA 1N04A 3OELA 4IO6A 2V3UA 1QJMA 1EZPA 1AH5A 4H1XA 1ZMGA 3U8QA 2DE2A 4G68C 3S9EA 2D21A 3QAXA 3TDJA 2H5YA 3MVYA 3C34A 4BDQA 2KLFA 2FA7A 3CG3A 4QRZA 2X7PA 2ZNSA 4OVJA 4AB5A 3KG2A 3S9NC 4ISUA 2Y7IA 1DMBA 1UIVA 3V5AA 3O97A 2AIXA 3RT8A 5L9OA 1OIBA 3ONMA 4NMYA 2P1SA 1GGGA 5CMKA 2XXUA 4R6YA 3O66A 2OLBA 1B5HA 4OXVA 1H44A 3RTFB 5K2YA 1Y4TA 1UTHB 3VVEA 3N94A 3FZVA 3TTKA 2HFBA 4Q30B 4F19A 1MQDA 3PPQA 4GLIA 1DSNA 1H43A 1MXVA 4RY1A 1HSEA 3LR1A 1DOTA 1FTJA 5H8FB 2ALUA 2O1MA 1FCKA 2DSFA 3PUVE 1FTOA 3VVDA 2DOJA 2VGQA 4KD5A 4JWOA 4N6PA 3OO7A 1NMUA 1Z7NE 3MPLA 3I5OA 3MVWA 4OETA 2UVHA 1B3LA 2I3VA 4R72A 3KOTA 4ZS9A 1ZLQA 3FUZA 3IJXB 5JTYA 3L6HA 1SW1A 4OESA 3GBAA 3TELA 1PB9A 1YCJA 1YTVA 2O51A 4O3CA 4KI0E 4RPOA 4DZ1A 4E0WA 2PT2A 3N26A 3VLVA 1MM6A 1MXWA 3PPOA 2VOZA 4BDLA 1M5CA 1JW4A 4H5FA 2QS3A 1D3KA 1LAHE 1MPCA 1USYH 2IA4A 2Y7KA 4NEDA 2REJA 3PD8A 3PUYE 5H8HB 3CFZA 3OD7A 4JSDA 5DEXA 3H3GA 1Y1MA 3G3JA 3U72A 1VFEA 1AOVA 2UYEA 4RA1A 3FVNA 3HV1A 3E9XA 2ZXTA 1A40A 1N3XA 4POWA 2O69A 3MVZA 4O3BA 1LB8A 2HZLA 2ZYMA 4ELPA 5KDTA 1N0TA 1JVYA 5ICTA 3A3CA 4IO5A 5I2KA 3KJ7A 4G77A 4ZEBA 4F29A 3B6QA 3RUMA 2XHDA 1MY0A 2UXAA 3E3KA 4NF4B 4XXUA 3KFMA 4NF8B 5TPAB 3TUSA 5EYFA 3S9MC 1BLFA 3K01A 3IB0A 3C35A 2Q89A 4OENA 3MP6A 3O6IA 3IO4A 2QMXA 5FHMA 3O6HA 3OENA 1EH3A 1P1NA 3PMVA 1LFHA 1B9JA 2XXHA 3K6UA 3FGSA 4XTCQ 3W9WA 3RN8A 4JDFA 5ISUA 3H03A 3I3VA 1B3HA 2OZZA 4RYAA 2DWJA 4EUOA 2H98A 2I49A 4PFTA 4KYEA 1B1HA 5ITPA 5FTIA 1B52A 4FJPA 1WVJA 4U23A 2XXQA 4WKMA 5CBRA 1MH4A 2HQ0A 3DP8A 1MDP1 4F1YA 1YAEA 1QUIA 2B65A 3C4MA 1NH8A 3SEVA 2O7IA 3QSLA 3B6TA 4AB6A 2ABHA 3A3UA 1Y9UA 3QUFA 1GTKA 4XKRA 4OFLA 2YJPA 4H5GA 3H6WA 4MH5A 2NUVA 2O68A 3PUWE 2RKMA 3W15C 4OFJA 4U1OA 1N76A 2XXWA 1TFDA 1EZ9A 4KQPA 3HN0A 3M3FA 4G2ZA 4R9FA 3H6TA 1IUDA 1IEJA 4RXLA 4QSEA 3IX1A 1S9TA 4G4PA 1H3DA 1MY2A 3FJ7A 5H8QB 3FXUA 3KGCA 4NF6A 1L5TA 3P7IA 3KSJA 4Q0CA 2H99A 3K6XA 1IXHA 3QYTA 4OQOA 1OVBA 3OO8A 2NWJA 4H8IA 3LSWA 3K00A 1F9BA 3OOAA 2XXRA 1FTKA 5AA2B 2ESNA 1IZ1A 4THIA 5I84A 1POTA 1ZKBA 3VXCA 2I4BA 5F7VA 3S2VA 3UA8A 3QUJA 4H67A 4OHNA 5CMCA 1AIVA 5B70A 5H8SA 2HXWA 4NF8A 4E0XA 3MC2A 3MWBA 4OYVA 3N6TA 2ZYNA 1MXUA 1N7WA 1LBBA 2F5XA 3TPAA 2OCUA 1H45A 4YU0A 3K1MA 1NFTA 3MP1A 2RF1A 4QSCA 5H8NB 1DPPA 5HM4B 1QUJA 1B58A 1R6ZA 2PX1A 4RPNA 3FASA 4KPTA 5CRYA 3DM0A 1MG1A 2QPQA 4MF3A 4ZEIA 3DELB 3VV5A 4FE8A 3FJGA 2NXOA 1WODA 3IOWA 4FEDA 4LZ5A 1B4ZA 4LVQA 3ILTB 3G3FA 1QUKA 5AA3A 2RCAA 1NNFA 1TXFA 1YPNA 5LOMA 2Y84A 3RTWB 2VD2A 1JQFA 3R6UA 2ONRA 1P1QA 4R2FA 1XC1A 3OSRA 2E0SA 4JSOA 2D5WA 2G93A 3FV2A 3TTLA 1POY1 3C9HA 2HZKA 1T0KA 4P0GA 1P1OA 5I57B 3QK6A 3FXQA 4AQ4A 1ZIUA 4YKJA 4QF9A 4QFLA 3G7WA 5CMBA 5ITOA 2DWAA 4R6KA 2GH9A 2E1SA 3IB2A 4KYSA 1US4A 4JWYA 4EQ9A 5F1QA 3OSQA 5DVJA 4H6DA 1B5JA 3EHTA 3ECRA 1HSLA 3OO6A 2F6PA 2XD2A 2QJEA 1PBQA 2I3WA 4X9TA 3RQTA 3IOUA 1FQAA 2F7CA 3QXMA 1DTGA 4NF5A 2HCAA 1N84A 2DXRA 4P0IA 2RCBA 3W9VA 3MZ1A 1UTBA 5JEIA 3MJNA 4LATA 3PMWA 2LAOA 3SERA 2ONKE 1MQHA 3EHSA 4TLLB 5I59A 3PUZE 3HO7A 4F3BA 1H76A 1MY3A 3RPWA 4HW8A 4GRKA 1LGBC 2P0SA 4PP0A 2QS4A 4U1ZA 1DTZA 5KZTA 3M3LA 2ZYKA 4H0WA 4ZE8A 3UIFA 2PMSA 1Y3QA 3ODBA 1USYE 4LONB 4GWOA 3C33A 1XHYA 2YLNA 3EF7A 5DYHA 4F3SA 3ZSFA 1SW2A 5I58A 3FATA 3IK6B 3MVXA 4LZ8A 5DT6A 2UYFA 1JW1A 4X1DA 5CM6A 3AXFA 3LBSA 4YB7A 4M4GA 3LUYA 5EHSA 1Y1ZA 1LAGE 3UORA 1LSTA 1B0HA 2G29A 2X26A 1MY1A 3Q29A 5IAIA 1CE2A 1S50A 4BDNA 3O2AA 1LCTA 3PD9A 4IY6A 5H8NA 2Y7WA 1B3FA 3TZAA 4ESWA 3IAZA 3CIJA 3PPNA 5FHOA 3O6GA 3T9HB 5KCJB 1B32A 3C36A 4KFQA 1MRPA 1FTMA 2I6EA 4F22A 1Y4CA 4QSDA 2I4CA 4FAJA 5AA4A 3RGYA 3KOSA 2XX9A 4UA8A 1LLSA 1QVSA 5EHMA 3G3KA 5CMMA 2OWTA 2UVGA 3B6WA 3IOVA 3LSLA 1URSA 2I48A 2PVUA 2H4IA 3VE1B 1SVXB 2PYYA 4KYDA 3TCGA 4H65A 5FHNA 4R9GA 4IO4A 1MXZA 3QIMA 4ELOA 4LQ2A 5CI5A 3BKIB 1ZTYA 3A09A 1B3GA 1URDA 2AL4A 1O63A 4MBPA 3T22A 4UACA 4EF2A 2UVJA 2A5TA 4G68B 3PU5A 2Z8EA 1IXCA 1Q1KA 3TKDA 4EXLA 1B1XA 4JXIA 4R73A 3M8UA 1A99A 1OVTA 1RYXA 4YKPA 4LA9A 1LFIA 1B51A 1EZOA 4NTLA 1OQHA 1SYHA 1TFAA 5AA1A 3R26A 4IB2A 2R71A 5AA2D 1SQYA 1IXIA 4DXBA 3TYHA 3PMXA 1BTJA 2Q88A 3LSFB 3N5LA 3CSBA 3H6UA 4MLVA 4C1UA 4NE4A 2OJTA 4GL8A 2QS1A 4F1UA 4X1BA 5DVIA 2ZYOA 4DE8A 4ZZAA 3SETA 3T9XB 3ZKLA 1FQCA 3OO9A 1B3EA 1B4HA 5I2NB 4PETA 1I6BA 4HCYA 3FVOA 4LQ5A 1TT1A 3WAFA 1UTHA 3KZGA 3S9LC 1VFDA 5ELVA 4XKPA 3S4UA 3O29A 1RYOA 3MBPA 4OTEA 2HEUA 2RC7A 4ZEKA 3VLUA 5H8FA 1JVXA 1PB8A 2GHBA 2I0CA 3IL1B 1PEBA 1US5A 1BIYA 5DTBA 4XKQA 3KEIA 4N13A 1QW0A 2DP8A 4R2BA 1IQ7A 3PGFA 3OEKA 3ILUB 3V8XB 2M8CA 1DPEA 3KSXA 1MQIA 1N7XA 4PQJA 3EHUA 3BBRA 2P2AA 2DQVA 2VP1A 4Z7EA 3L6GA 2O84X 3M3KA 1PB7A 3H6VA 3VFJA 1BKAA 3Q28A 3CR9A 2F34A 3PUXE 2H9BA 3RY3A 1MM7A 5KCJA 2DS9A 5H8HA 3K1PA 3SEUA 3PPPA 3VDFA 2XX8A 2Q2AA 4LUBA 4ESXA 4IO2A 4FORA 4GOTA 3FXRA 1FQBA 2ZNTA 4BDMA 1FTLA 3FVGA 4F3PA 4PFYA 2B3FA 3TCFA 1GV8A 1B7ZA 3CFXA 2OWSA 3T96B 4IY5A 4NF4A 5L9MA 5TPAA 1I6AA 3GXAA 4YICA 1ZBMA 1XVYA 2UVIA 4C1TA 4FATA 3CG1A 3RNNA 2F78A 1WDNA 2V93A 2Z8DA 1Q35A 1ZJLA 1NH7A 1OMPA 4GIZA 4G68A 4ND9A 2Z22A 3SEYA 3IO6A 2VD3A 1SDXA 5CC2A 5J1DA 4YKIA 3GLBA 4GFRA 1D9YA 1M5EA 3BFTA 3UGWA 1QKAA 3U1OA 1NKXA 2F6GA 5DEXB 4I62A 4HTGA 3USDA 4DXCA 1MY4A 1KWHA 2F7BA 3F11A 4H8JA 2YPNA 1QULA 3K02A 2DYXA 3OEMA 2RC9A 4L17A 1ANFA 1MH3A 1FQDA 5I2NA 4OERA 5KDTB 4I8CA 1R9LA 3KN3A 1S7YA 5I2KB 3IR1A 3K0VA 1SI1A 1IXGA 4GXAA 1R1NA 1M5FA 3OMBA 4U21A 1SI0A 4F2OA 4YMBA 4O3AA 3C31A 1B2HA 2Q9TA 4GXSB 1NL5A 1Y20A 3OXNA 1A54A 2HAUA 1II5A 1N3WA 2Z23A 4Z0IA 5BWJA 2A5SA 2XX7A 2V3TA 1B5IA 2OK2A 1NNPA 1Z7ME 3TQLA 1VR5A 5HBCA 2DXYA 3EN3A 4EF1A 4YAHX 4ZECA 3BFUA 1M5BA 3CFLA 4G8NA 3TTMA 2Y7PA 5AE4A 4U4XA 4GL0A 4R6HA 5H8QA 1TWYA 1LAFE 4YZZA 4BLAA 1MS7A 2Y7RA 2WKYA 1OLAA 4ZZEA 5A5XB 2V3QA 1EU8A 1NNKA 3E13X 3Q27A 2DE3A 1LCFA 3HHGA 3TQWA 4ZDMA 1SW4A 3HHFA 4QHQA 3CSGA 5AA2A 3TTNA 1P1WA 3SEWA 5TP9B 4MFIA 4XKNA 4LP2B 5ICQA 1MQGA 2Z8FA 1B46A 4OEUA 4OZ9A 4PFWA 4QFPA 5DVFA 5JK4A 1B05A 3LSXA 4RNSA 2OBGA 4PFUA 3SESA 3CI8A 3MP8A 3TCHA 2F36A 4DDDA 3I6VA 5TU0A 4FECA 3K6WA 2F35A 2I58A 2W7YA 2XXVA 4OEVA 3ZS6A 3MQ9A 4M1VA 1PDAA 2THIA 2XXYA 2X7QA 4U4SA 1LB9A 1GVCA 4Q5TA 3Q26A 3MW0A 4NWDA 3TFLA 4NF6B 2Q8JA 1O64A 5I56B 1Y3PA 4C0RA 4U2RA 3C32A 4IGRA 1AMFA 1J1NA 1OLCA 3JZJA 2B3BA 4ECFA 4N07A 1VE4A 3RT6B 1R9QA 4OMBA 4MLQA 3GBBA 4YKKA 3CVGA 1FQEA 3H06B 3FVKA 2FYIA 3VLWA 3MZBA 4F39A 4KCDA 4KCCA 4G8HA 4RJZA 1URGA 1I6QA 3H7MA 3TMGA 4R75A 5I57A 4OWDA 1SBPA 3GZGA 3TEPA 4JWXA 3KJTA 3K1NA 4IGTA 2F7AA 1D4NA 4RK2A 1P1UA 2DWIA 3T9VA 3HSTA 5BUUA 4QFNA 3T93B 3MZ9A 4F3GA 3U92A 4F18A 1JETA 1OQGA 2VHAA 4GD5A 3ZKKA 3WAEA 3U94A 1QKBA 4IO3A 3DLNA 1JEVA 3G3HA 3LC8A 3H4ZA 3UK4A 1NNTA 2R6GE 3IJOB 3UN6A 2XXIA 3K4UA 3R7XA 1AL3A 1LBCA 1GR2A 3V83A 1A55A 2GFEA 3VVFA 1PC3A 1FQFA 1B6HA 4DIGA 4IO7A 1XVXA 3CRBA 3MUQA 4YB6A 1I69A 5IKBA 4FEBA 4PE5B 4Q8RA 3G3GA 5A5XA 2XXTA 4X48A 3FD3A 4ZEFA 3KBRA 1MXYA 2XXPA 5L8DA 1MXXA 2DVCA 2I0BA 4TOZA 1A7LA 4EDPA 1P99A 3EQ1A 1ELJA 4EXKA 2GRVA 3MPKA 3IOTA 3PPRA 4YMAA 2O7UA 4ELQA 3O28A 2ANJA 4I9DA 1JW5A 4G8MA 4I1DA 1M5DA 2H25A 5TP9A 1IIWA 3IB1A 2CMOA 3TAJA 2REGA 4EQBA 4BDRA 5L9SA 2XXXA 1IITA 4QFKA 2DWHA 5HPQA 4RK9A 4YB5A 4F1VA 2ZMBA 2AYSA 4K3FA 4EQ7A 2GHAA 2HAVA 4DXUA 3RLFE 4P11A 1A8EA 3FIRA 4NF5B 3TODA 1B40A 4GVOA 4JB7A 3E4RA 3T66A 1UTBB 4U22A 3TTRA 1RKMA 4XIGQ 2ZNUA 2IEEA 1B7HA 4HS7A 3G3IA 4WXJA 5I59B 1XT8A 2FNCA 2O6AA 4TLMB 3KN8A 3FJMA 1SD3A 1MPBA 1LAXA 5I56A 2BJJX 1A8FA 3PV0E 1PBPA 1MDQA 4KHZE 3O9PA 4BDOA 3VXBA 3FV1A 1XOCA 1JNFA 4JBZA 1JEUA 3THIA 4ONYA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
4MIJA 1ZU0A 1BP5A 1EYJA 5I58B 4ZEDA 2NOOA 2RC8A 3KN7A 2QMWA 1FBHA 1VSOA 2DVZA 1FW0A 2XWKA 2QSXA 2AL5A 4X04A 1ATGA 3DP6A 4F2QA 4GBVA 3K2DA 5JTYB 1LFGA 4POXA 3IORA 3T9UA 3HCQA 4WEPA 5B7DA 4GQOA 2V4CA 4ZE9A 1CB6A 4DCXA 2QS2A 4WEDA 4FIMA 3EPEA 4ELRA 4HCWA 2OX3A 2F8DA 4TQUQ 2D3IA 4NWCA 2CZLA 4DLDA 4N81A 2PT1A 1B7UA 3SDFA 4P9KA 2KQZA 3HPIA 3D4CA 1O7TA 4GF8A 3D4GA 2DE4A 5K2XA 3V89B 5CBSA 4PBQA 2F97A 4N4UA 2V84A 2PBWA 1B0LA 5FTHA 5M2VA 3Q25A 5AA4B 3K6VA 4PAFA 1D9VA 3JYRA 1SYIA 4KR5A 4F31B 2ONSA 2XD3A 4DCYA 1IMBA 3DP4A 2RINA 2V25A 1UQWA 3SEXA 1HSJA 1SW5A 3JV9A 2NVUB 1MPDA 1UIUA 2R9JA 3B7DA 3SKPA 2QL3A 4QFOA 1XS5A 1FJ6A 4R74A 2O1LA 3U93A 3N6UA 4LZ7A 3MAMA 4OFOA 3RPLB 1Y3NA 3UP9A 1MQJA 2A5TB 2QRYA 2VPNA 4HE2A 2Q2CA 1N04A 1IMAA 1INPA 3OELA 3D1RA 1NUYA 4IO6A 2V3UA 1QJMA 1IMEA 1EZPA 1AH5A 4H1XA 3RYDA 1ZMGA 3U8QA 2DE2A 4G68C 3S9EA 2D21A 3QAXA 3TDJA 4MX6A 2H5YA 1DBZA 3MVYA 3C34A 4BDQA 2KLFA 2FA7A 3CG3A 4QRZA 2X7PA 2ZNSA 4OVJA 4AB5A 3KG2A 3S9NC 4ISUA 2Y7IA 1DMBA 1UIVA 3V5AA 3O97A 4N8YA 2AIXA 3RT8A 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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