1SYIA

X-ray structure of the y702f mutant of the glur2 ligand-binding core (s1s2j) in complex with (s)-cpw399 at 2.1 a resolution.
Total Genus 85
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
85
sequence length
259
structure length
259
Chain Sequence
NKTVVVTTILESPYVMMKKNHEMLEGNERYEGYCVDLAAEIAKHCGFKYKLTIVGDGKYGARDADTKIWNGMVGELVYGKADIAIAPLTITLVREEVIDFSKPFMSLGISIMIKKGTPIESAEDLSKQTEIAYGTLDSGSTKEFFRRSKIAVFDKMWTYMRSAEPSVFVRTTAEGVARVRKSKGKYAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGIATPKGSSLGNAVNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWWYDKGEC
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Chord Diagram
{{ tooltip.sname }} connected with {{ tooltip.tname }} : {{qFormat(tooltip.svalue) }}
molecule keywords Glutamate receptor 2
publication title Tyr702 Is an Important Determinant of Agonist Binding and Domain Closure of the Ligand-Binding Core of GluR2.
pubmed doi rcsb
source organism Rattus norvegicus
molecule tags Membrane protein
total genus 85
structure length 259
sequence length 259
chains with identical sequence B
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-04-01
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1syiA01
3.40.190.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich D-Maltodextrin-Binding Protein; domain 2 Periplasmic binding protein-like II 1syiA02
1LB9A 3K02A 3VV5A 4U1OA 1YPNA 3ECRA 1MM7A 3FJMA 3R26A 1B3LA 2HFBA 3N6UA 3QYTA 3FIRA 3MPLA 4WEPA 2P0SA 2UYFA 1D9VA 3KEIA 2I0BA 2A5SA 3V5AA 5JTYA 3N5LA 3R7XA 3SEYA 3VLWA 4OYVA 2DE3A 2OWTA 1OMPA 3QXMA 1WVJA 1DSNA 5FTHA 1J1NA 2Q88A 3IJXB 1IXCA 2NXOA 1P1OA 1NH7A 4NWDA 1NNKA 2YPNA 3KSXA 4U21A 3WAEA 3CSGA 4QSEA 5H8HB 3OEMA 3ONMA 5BWJA 4F2OA 4R6HA 4JWXA 3C34A 5EHMA 1MQGA 4RXLA 4F22A 1ATGA 3TTKA 4ZEBA 3FVOA 2Y7KA 1FQFA 2OJTA 4I8CA 3TZAA 3G3KA 4TLMB 4Q0CA 4GIZA 4RJZA 1MPBA 1XHYA 2I3VA 1XT8A 4E0XA 4IO2A 1QJMA 3N6TA 3ZKKA 2QJEA 1D4NA 4PE5B 2Y7IA 3MZ9A 3MW0A 4GL0A 1FQEA 4OQOA 4JXIA 4FIMA 1IQ7A 2ZMBA 3Q27A 2DXRA 4O3AA 2I48A 2ESNA 2Q9TA 4YAHX 4NE4A 4ND9A 3OO9A 2ZYOA 3R6UA 1MY1A 4LVQA 1II5A 5AE4A 2GH9A 1UTBB 4IGTA 3DP4A 4XXUA 2FA7A 1GV8A 1SBPA 4N07A 3OEKA 1BKAA 2F8DA 4C1TA 3FV1A 2PMSA 3O66A 4TQUQ 4ZDMA 4DXBA 3G3JA 3LR1A 4H65A 1LB8A 1NMUA 3T9UA 1FQBA 2XXUA 4Z0IA 1MXVA 1B2HA 4DCYA 3CFZA 3E13X 5IAIA 1MDP1 4XKRA 3CSBA 3QUJA 1MG1A 3DM0A 3ZKLA 4OMBA 1ZJLA 4F3GA 4G68C 5I84A 4ZZEA 3B6QA 5FHOA 1ZIUA 3ZSFA 4LA9A 1IXIA 1QVSA 2REGA 1DTGA 5I2KA 2CZLA 5K2YA 1ZTYA 2NWJA 3EQ1A 1TXFA 1LSTA 4X48A 4GVOA 4JWOA 4OETA 2VOZA 1SDXA 3PMWA 1ZLQA 2HAUA 1POTA 2QS1A 5H8QB 1PC3A 4IO6A 3K6UA 4QSDA 4LZ8A 1HSLA 3T9VA 1A8FA 1TFAA 1UTBA 4NF6B 5FHMA 4G2ZA 3E9XA 2O51A 3KZGA 3MZ1A 3PV0E 3RPWA 2DWIA 2UVGA 3WAFA 4ESXA 1S50A 4RK9A 1P1WA 5F1QA 3G7WA 2QS2A 4F1VA 3IB2A 1AOVA 3QK6A 2XXHA 1FCKA 3H3GA 5CRYA 3CRBA 4OEVA 3EN3A 3EHTA 3KSJA 4I1DA 4EDPA 2Y7WA 3SEWA 1H44A 5JEIA 5BUUA 3IR1A 3FXRA 1QKBA 1MQHA 3VXCA 5M2VA 4RA1A 5DVIA 5B7DA 1IZ1A 4GL8A 1WDNA 1N84A 1MY0A 5CM6A 3L6HA 3MVXA 3T22A 3PGFA 3FXQA 1OVTA 4RPOA 5H8QA 2F6GA 4HW8A 2YJPA 3FV2A 3HCQA 4YICA 5IKBA 2XXTA 4NF6A 3B6TA 4U22A 2DWJA 1R9QA 2Y7PA 3V8XB 3HV1A 4GOTA 4KYEA 1VFEA 4KI0E 1UIUA 3CG3A 4MH5A 1FW0A 4OFJA 5TPAB 5ITPA 3UGWA 3TEPA 1EZPA 2H98A 4AQ4A 3B7DA 4F31B 4AB6A 1LCFA 3T96B 1JEVA 3OO7A 1XOCA 5KCJB 5I58A 4ZEKA 3PUXE 4ZE9A 2PT2A 1IEJA 4H8IA 2XXPA 4LZ7A 1B3EA 4X9TA 2ZNUA 3K0VA 1MXWA 4H8JA 1P1UA 3H6TA 5DTBA 2G93A 4ECFA 2UYEA 3K1MA 3LSXA 4F19A 3IK6B 4PFYA 1Z7ME 3A09A 2VGQA 4ELOA 3IOVA 1B3FA 3O6IA 1MPCA 3A3CA 3L6GA 4MFIA 1MH3A 3C31A 3RTWB 3G3GA 1MXXA 4ELPA 1MPDA 1O63A 1B1HA 5TPAA 5KDTA 3F11A 3RNNA 2GFEA 2F7BA 3IOUA 3VFJA 3IAZA 3TPAA 2GHBA 4GD5A 3VVDA 1XC1A 1CB6A 3N94A 2QSXA 5ITOA 1T0KA 5AA4B 3MQ9A 2D3IA 3KOTA 1Q1KA 5KCJA 3FJ7A 4ZE8A 2F34A 4BLAA 2D21A 3PUVE 3FXUA 2F36A 3CI8A 4PETA 1PB9A 3MP1A 3IB0A 2XXYA 3CFLA 4YZZA 3HN0A 2DVCA 4NMYA 3H03A 4E0WA 2CMOA 5AA3A 5CMKA 1I6QA 2QL3A 2VHAA 2YLNA 3RT6B 2O7IA 4F1UA 3HHGA 3H6WA 2RCBA 1JETA 3DELB 1H45A 2R6GE 2V84A 4H0WA 3CIJA 3HSTA 4YU0A 3GBAA 4G8NA 4FEDA 3TELA 3IORA 4BDRA 2VD3A 4O3BA 1JNFA 2P1SA 4PFWA 2M8CA 4GF8A 2XXIA 2NVUB 1B4HA 4U4XA 1S7YA 2Z8EA 4LZ5A 1SI1A 5CBRA 1FTOA 4UACA 4Q5TA 4P0IA 1B32A 5AA4A 4BDNA 2XD2A 1GVCA 2LAOA 4GLIA 1Y4CA 2O68A 3TCGA 2AIXA 2ZXTA 3GZGA 3LBSA 3S9EA 1MY2A 2P2AA 4DLDA 4RNSA 3FVGA 3PPNA 3TAJA 3VLUA 4HTGA 2XD3A 1B46A 3KN8A 4OZ9A 3LUYA 3DP6A 4POXA 3RN8A 3MWBA 4OERA 1O64A 3SDFA 2RC9A 3TODA 3BFTA 3K4UA 4H5FA 1JW1A 1YAEA 1MQJA 4XKPA 2Q89A 3IO6A 4JB7A 2GHAA 4OFOA 1R1NA 2BJJX 2QS3A 3RLFE 2B3FA 1GGGA 3T66A 1M5EA 4DZ1A 3FZVA 2DYXA 2O1LA 1Y20A 1AL3A 5I2KB 5I57A 3OO6A 2E0SA 2Q2AA 4QSCA 4H1XA 1OVBA 3SERA 1DTZA 4RYAA 2HEUA 2F78A 2REJA 4BDOA 2F7AA 1Y3QA 1M5DA 4G8MA 4MLVA 1H43A 1NKXA 4GRKA 3MP8A 4F29A 4GXSB 4LUBA 5ISUA 1QULA 3K1PA 4DE8A 1H3DA 1MS7A 2F5XA 4P11A 2G29A 3AXFA 3W9WA 3QIMA 5FHNA 3TKDA 3Q29A 3TTRA 4R72A 1JW4A 2DXYA 3ODBA 4NEDA 2DE2A 3OENA 1IIWA 2NUVA 3PU5A 4UA8A 2XX9A 2XXQA 5EYFA 1AMFA 3KGCA 1FQDA 1XVXA 2B3BA 3W9VA 4K3FA 4DDDA 4GXAA 5LOMA 3TQWA 1HSJA 4DIGA 4LONB 4F3BA 2DP8A 4JBZA 1SW4A 3OOAA 3HHFA 2HAVA 1OIBA 4Z7EA 1FQAA 4YB5A 3CG1A 2DSFA 2THIA 2XX7A 3JV9A 2XXRA 2PBWA 4WEDA 1JVXA 1NL5A 1PDAA 4R9FA 1Y1MA 1USYE 1MXUA 4OESA 3PPOA 4KPTA 4EF2A 4BDMA 2ZYMA 1A7LA 4I62A 2RC8A 3QAXA 3LSFB 3H4ZA 3OXNA 4R75A 4H5GA 3O97A 1Y1ZA 4OHNA 3FD3A 5CBSA 2D5WA 1N3WA 2HCAA 2IEEA 3IO4A 5DT6A 2RF1A 2ONRA 3SETA 2XXXA 2VD2A 3FJGA 3MZBA 1B1XA 1IUDA 4OFLA 1B52A 1TWYA 1Y3NA 1SW1A 2XX8A 4ESWA 3VVEA 1TFDA 1VSOA 2AL5A 2I6EA 4XKNA 5H8SA 3TQLA 3UIFA 5TP9B 2QMXA 3BKIB 3GXAA 5I58B 5K2XA 2DOJA 4RY1A 1LAXA 1R6ZA 3PUZE 3VE1B 3W15C 3B6WA 2X7QA 4IO4A 4PQJA 4RK2A 1VFDA 2B65A 4YB6A 4OWDA 5KZTA 4GQOA 2RKMA 5I56B 1Y9UA 4H6DA 3M3LA 4FATA 2Z8FA 4M1VA 3K6XA 2KLFA 4IGRA 4BDLA 4R6YA 1URSA 4G8HA 2UVJA 5DVFA 2ZNTA 2DS9A 3SEVA 4G4PA 2Y84A 5F7VA 2HQ0A 4F3SA 2OBGA 1B9JA 5HM4B 3MUQA 2QMWA 3SKPA 5HPQA 1UIVA 2ZYNA 1NNFA 1Y4TA 1XVYA 1Q35A 5KDTB 2XHDA 3RGYA 3MC2A 2FYIA 1QUKA 1B7ZA 4MLQA 4ZECA 4F1YA 1B3GA 3N26A 5TP9A 4FJPA 2QS4A 4R2FA 1BTJA 3D4GA 1PBQA 3U92A 4IY6A 1LGBC 4ZEIA 2RCAA 4BDQA 4GFRA 3PMXA 1B7UA 1VE4A 2UXAA 1I6AA 1BLFA 4ISUA 4EQBA 3U1OA 4F39A 5I56A 2DVZA 3RTFB 1B3HA 3P7IA 2H99A 4QFLA 2RC7A 3Q28A 3O6GA 1QW0A 3DLNA 1HSEA 3H7MA 1B5JA 1YCJA 1MH4A 1R9LA 4FE8A 3C4MA 5CMCA 5J1DA 4ZEDA 2DQVA 1Y3PA 2H4IA 1N76A 3OD7A 3PD9A 3PUYE 1DPPA 1MM6A 1MXZA 1RYOA 3T93B 3G3HA 1EZ9A 1POY1 2F6PA 4FEBA 2ONKE 3TTMA 2Y7RA 4OENA 4EQ7A 2HZKA 3G3FA 3V83A 3HPIA 2I49A 2ANJA 2O84X 1A8EA 2F97A 2NOOA 1DPEA 2E1SA 1B5IA 4THIA 2RINA 1BP5A 4YKIA 1B51A 1OQGA 4PP0A 4O3CA 2DWHA 1L5TA 1B0HA 3PPPA 3G3IA 1A54A 1ZBMA 1FTJA 1EU8A 2OCUA 4FECA 3RT8A 3IL1B 3MJNA 2ZYKA 1QUJA 1MDQA 3K6VA 1SD3A 1UTHA 4U23A 3USDA 4QRZA 3OSQA 3T9XB 3I3VA 3FATA 3I5OA 4OXVA 1SI0A 3T9HB 5L9OA 2Z23A 3OELA 2ABHA 1WODA 1GR2A 3ILUB 1LLSA 4LQ5A 1LBBA 4C1UA 4Q8RA 4L17A 3GLBA 3UN6A 5I57B 3JYRA 3PPRA 3TFLA 3KOSA 1BIYA 1XS5A 3H6VA 4N6PA 3LSWA 2O7UA 3FGSA 4IB2A 3S9LC 2Z8DA 1JQFA 4PFTA 2H25A 1ZU0A 1KWHA 1I6BA 1PB8A 1A55A 1ELJA 1SQYA 4H67A 3MBPA 1N7WA 3K1NA 3HO7A 2UVHA 3BBRA 3CFXA 5HBCA 1M5CA 3ILTB 3U72A 3TYHA 5EHSA 1OLAA 3OMBA 4R73A 4LP2B 3LC8A 3QUFA 4OEUA 1NNPA 4KHZE 2W7YA 1MQDA 1ZKBA 2PYYA 1H76A 1N0TA 4KCDA 1MXYA 3A3UA 5H8FB 1Z7NE 2IA4A 3Q26A 3RQTA 2V93A 4EUOA 4R2BA 2XXWA 3RUMA 3SEUA 3LSLA 3PMVA 5TU0A 1LAHE 2X26A 3VVFA 3JZJA 4HS7A 3IB1A 2H9BA 4IO5A 4KD5A 3CR9A 5L9MA 1N3XA 1P1QA 3RY3A 3MAMA 3MVZA 1UQWA 2A5TB 3PPQA 4G68B 4LATA 4LQ2A 4HCWA 3KJTA 4JDFA 1MQIA 4U4SA 3C9HA 2PX1A 1AIVA 5H8HA 5AA2B 5FTIA 1ZMGA 1MY3A 4NF8B 3QSLA 3O2AA 4XKQA 3U8QA 5ICTA 3Q25A 1M5BA 4TLLB 3KN7A 2OZZA 1TT1A 3I6VA 1NFTA 3O6HA 4YKJA 3UORA 2UVIA 3IJOB 5DYHA 4F2QA 1LAGE 5H8FA 3FVNA 1GTKA 4G77A 1A40A 2GRVA 4IO3A 4KYDA 3KN3A 4HCYA 5CC2A 1LCTA 1IXHA 5A5XB 5I2NB 4R6KA 4JSDA 1JEUA 3MP6A 1B0LA 4WKMA 1OLCA 2ALUA 2I4BA 3K2DA 2DWAA 4JWYA 3TUSA 1O7TA 1USYH 1LAFE 1PB7A 3S4UA 3EF7A 4Q30B 3E4RA 2ONSA 5L9SA 4ZZAA 4KR5A 1D9YA 3M3FA 4QHQA 4ZEFA 2A5TA 4G68A 4IY5A 1SVXB 1PBPA 4QFNA 3CVGA 1B5HA 4DXCA 3D4CA 1B7HA 4QFOA 2V3TA 4ELQA 1IXGA 4FAJA 1FQCA 1URGA 3TTNA 1ANFA 3K6WA 4NF4B 1A99A 4YB7A 5DEXB 2I58A 5AA2A 4YMBA 4NF8A 3V89B 3VXBA 4FORA 5CI5A 1DMBA 1N04A 3VDFA 2I3WA 3K01A 4OTEA 1B40A 2H5YA 5JK4A 3GBBA 4JSOA 2PVUA 3TCFA 1LFHA 2WKYA 4R9GA 5A5XA 5I2NA 3EPEA 1US4A 2F35A 3THIA 1B4ZA 1IITA 4OVJA 2Q2CA 2ZNSA 1JVYA 3MVWA 3MPKA 4U1ZA 1URDA 2DE4A 2AL4A 4NF5B 3C33A 3K00A 4F3PA 4XTCQ 3KBRA 1AH5A 4R74A 2FNCA 2QPQA 2F7CA 3O29A 5AA1A 1MRPA 1EH3A 3O9PA 1N7XA 4NWCA 1B05A 3PUWE 4RPNA 2X7PA 1LFIA 5I59B 1QUIA 2QRYA 3H06B 4NF4A 5DEXA 3OSRA 2V3UA 4EQ9A 3SESA 5DVJA 2PT1A 4MF3A 3MVYA 4X1DA 3PD8A 1D3KA 1EZOA 1S9TA 4F18A 1M5FA 3SEXA 1SYIA 3DP8A 3U93A 1LFGA 3BFUA 3EHUA 3OO8A 4QF9A 3IOTA 3UK4A 3FUZA 3U94A 4EXLA 2Z22A 3UP9A 2R71A 1CE2A 2R9JA 1NNTA 4KYSA 1SYHA 2VP1A 3H6UA 3S9NC 1P99A 2OK2A 5CMBA 3FASA 5ELVA 4YKKA 3VLVA 4NF5A 4GWOA 3TDJA 3ZS6A 4AB5A 3S9MC 4QFPA 2O69A 4QFKA 4WXJA 5B70A 5H8NB 3KJ7A 3IX1A 2XXVA 5AA2D 3IOWA 4ONYA 1SW5A 4EF1A 5I59A 4DCXA 2OLBA 3M8UA 1UTHB 3UA8A 3S2VA 3E3KA 1I69A 1LBCA 2Q8JA 4ZS9A 4IO7A 1RYXA 4KQPA 4EXKA 3TMGA 1F9BA 1NH8A 1QKAA 4TOZA 1VR5A 4YMAA 5L8DA 1FTLA 4X1BA 4POWA 1PEBA 2OWSA 4NTLA 2HZLA 2O6AA 2HXWA 4YKPA 4DXUA 1FTMA 5JTYB 1B58A 3M3KA 1US5A 4MBPA 3C36A 4XIGQ 2V3QA 3EHSA 3C32A 2I0CA 4ELRA 1SW2A 2O1MA 4C0RA 3KFMA 1DOTA 4M4GA 3C35A 1B6HA 5ICQA 4I9DA 1FTKA 4U2RA 1JW5A 2V25A 4PFUA 3O28A 5H8NA 1RKMA 3FVKA 4N13A 5CMMA 3TCHA 2I4CA 1P1NA 1YTVA 3TTLA 2AYSA 1MY4A 1OQHA 4KCCA 3KG2A 4KFQA 4P0GA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
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chains in the Genus database with same CATH homology


 
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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