1T4ZA

Solution structure of the n-terminal domain of synechococcus elongatus sasa (25-structures ensemble)
Total Genus 19
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
19
sequence length
105
structure length
105
Chain Sequence
b'GSSLSPQALAQPLLLQLFVDTRPLSQHIVQRVKNILAAVEATVPISLQVINVADQPQLVEYYRLVVTPALVKIGPGSRQVLSGIDLTDQLANQLPQWLVQQEGIF'
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Structure of the N-terminal domain of the circadian clock-associated histidine kinase SasA.
pubmed doi rcsb
molecule keywords Adaptive-response sensory-kinase sasA
source organism Synechococcus elongatus
molecule tags Transferase
total genus 19
structure length 105
sequence length 105
ec nomenclature ec 2.7.13.3: Histidine kinase.
pdb deposition date 2004-04-30

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF07689 KaiB KaiB domain
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1t4zA01
3CSJA 1JZRA 1FB0A 3PINA 3FY7A 3PR8A 2V2GA 2TRXA 1I5GA 4ZB6A 5DALA 1WE0A 2YV7A 4F9ZA 5HR3A 4BL7A 3FR9A 2LRCA 5E59A 1S3DA 4DVCA 4X1UA 2MBSA 1WWJA 1URMA 1S3AA 2R6KA 4HZ2A 3VI5A 4L5OA 1DE1A 1YDKA 2IMKA 3QR6A 3AY8A 4MPFA 2P0GA 3TCOA 4I6XA 5FT3A 1SK1A 4N11A 19GSA 3A5WA 3QCPA 2IN3A 3WGDA 2X8CA 1M99A 2I81A 3RHCA 3FRCA 1K3LA 1SKWB 3JCML 1WJKA 3F4TA 2H76A 4POBA 1A2MA 2YPMA 2CQ9A 6GSTA 2PWJA 5G1KA 3M8NA 4BA7A 5JWRB 3G7YA 4OCFA 4POLA 1SD9A 4ML1A 2WGRA 4RUVA 1XCCA 4KCAA 4IQAA 1PSQA 4V1Ap 2H1DA 2LEGA 2LS5A 3IA1A 4TXVA 4IQ1A 7GSSA 3A2VA 4ZXGA 2VIMA 3KH9A 4HU7A 2AV4A 2H1BA 2C0GA 3HZ8A 4K1FA 1X9WB 1WIKA 5ENUA 2HZFA 1JLWA 4E8HA 2MMZA 3RHBA 5HFGA 5IQYA 1R26A 3UARA 4AJ8A 2A4VA 2LKUA 5KN0A 5G1LA 1F6MC 4ECIA 1GSDA 1G7OA 3APOA 1OC3A 4PUFC 3QAWA 4OWYA 1SKSB 2HSYA 2OJLA 4K0GA 1UA5A 3TJJA 2BTOT 1X5EA 2JACA 5IO2A 1YKAA 2GZYA 3EMXA 3NZNA 3TKQA 2JADA 2PVOC 2YANA 1LJRA 2LJAA 2LQQA 1Y25A 4NXIA 2A2RA 1YKCA 3TDGA 3US3A 2VCXA 2VCZA 1OAZA 2MMAA 3GX0A 1FG4A 3BJ5A 2R5GA 4Q5QA 2DMLA 4GQFA 1T1VA 1FVKA 1W4VA 6GSYA 2F9SA 3DGQA 4KW6A 1PRXA 2OBIA 4QQ7A 4KSOA 4JR6A 4HDEA 1GLQA 1IYHA 4GLTA 3KMNA 4O92A 3HY2A 1WPIA 2WFCA 5F8BA 3Q18A 1OC9B 4TOPA 5LCZA 3L78A 1BJXA 6GSUA 3UBKA 2VCQA 2KOKA 3DKSA 3C8EA 1I9DA 3HCZA 3UBLA 1X9MB 1YF1A 4EF0A 4LL1B 3M0FA 1A8LA 4KH7A 1KNGA 1ACVA 5ECRB 4O32A 4WKWA 3S9FA 3ERWA 3FEUA 5CP1A 4DSRA 4PQ1A 2H70A 3FZAA 3KJYA 1MDIA 2ES7A 1XWCA 5CRDA 5DAKA 4ZL9A 4HS1A 3TGZA 3G9BA 3WYWA 4ECJA 4TXOB 4POMA 1S3CA 1TK8B 3J7Yk 3C7MA 2PVQA 1QMVA 4KDYA 1R5PA 1SL0B 3SWLA 4GSSA 1YJ6A 2IL3A 2Z9SA 3P8WA 4K2DA 3GH9A 4GTUA 2F8AA 3IDVA 2FWGA 2GQLA 5B8BA 1T3BA 4RQRA 5B7CA 3NIVA 1R7HA 1AIUA 1TXXA 3M9JA 3KTBA 1G6YA 1F37A 3VK9A 2YZUA 3FZ4A 4D73A 3ZIVA 1F9MA 5AIVA 4GSNA 1X5CA 3GYKA 5B8AA 3C1RA 2GT6A 4F0BA 18GSA 1SJ6A 1GRXA 4XS6A 4K7IA 1M2AA 2WJUA 3LYPA 3E9JB 5D9TA 1NSWA 3TRQA 1T4YA 4ZB8A 4G2EA 4JBBA 3G7IA 3VWUA 1V58A 2L59A 3CSHA 1HNBA 1TK5B 4YQVA 1XWGA 5G2ZA 2FLSA 4J57E 1V98A 2QKEA 3LWAA 1QUWA 4IN0A 1AAZA 3FZ5A 5A4VA 2A2SA 4HJMA 1MEKA 2DJ1A 3EE2A 3H93A 3HD5A 1XZOA 3Q74A 3I6AA 4NV2A 4HU9A 3CTFA 3A2XA 3DD3A 2GS3A 3HJPA 2GT5A 2AHEA 2L6CA 4MCUA 3DRNA 3EINA 4MZCA 1DBYA 2DBCA 5D9WA 4LLRA 5COHA 2B1LA 4PURA 1TKDB 4FYUA 2GSSA 3APSA 1A2LA 3IRAA 1GL8A 2I3YA 3DYRA 1TW9A 4GRFA 3TRPA 3VURA 2DIZA 2B3SA 3ZVJA 1U3IA 4AGSA 4IBPA 3MWHA 3VLNA 5FWGA 4LA1A 3ZL5A 4IJ3A 3DXBA 4WEYA 5DDLA 4IVFA 3GKXA 1UVZA 2HE3A 3UIWA 4X0XA 3GL5A 1W89A 1QFNA 5G5EA 2YP6A 5IMVA 3TKSE 4I2UA 1TU8A 3EMPA 3LEFA 4I5QA 2N5AA 4RI6A 4HOJA 1VF3A 4WBRD 3CBUA 3GSTA 2LJRA 4ULXA 2DMMA 3R2QA 5H5SA 1GTBA 1YQ1A 3CRUA 5CNWA 2MYGA 2P5RA 1ERTA 4N0ZA 4MZBA 2FD3A 4ZL8A 1FOVA 1EZKA 3ZYWA 1EV9A 1SJIA 2RIIA 4IP6A 1QXHA 1XOAA 2HI7A 1G0TA 1K0DA 2O85A 2BJXA 1Z9HA 2ALBA 2H0IA 4DSSB 2EIOA 3C71A 2H0HA 5CAXA 4YQUA 3GN3A 2XPEA 3D21A 4WR4A 1OC8A 4XIHA 5H5RA 2LRTA 3ZTLA 3MDKA 1QGVA 6GSSA 5CYYA 1SKRB 3EU3A 3BCIA 3HKRA 4HZ4A 3FHKA 2DIYA 3GKMA 3GURA 2NDOA 4HUAA 2CVBA 2HZEB 4BWSA 1QK8A 2H30A 2H01A 3W8SA 5INYA 5ECLB 3EWLA 3I43A 4NWYA 2M80A 5JCUA 1SYXA 3GFKA 5AN1A 3KGKA 1X9SB 4Q5NA 1O81A 4FH8A 4QL9A 2LJKA 5KN1A 3WD6A 4JEDA 4N0VA 1PGTA 1VF2A 1ON4A 2LNSA 5IMCA 3ME8A 2GQMA 2GDRA 4N10A 1K0CA 1K0NA 1XOBA 4MZWA 1NHOA 4MP4A 2AUVA 1AUCA 1GH2A 2DLXA 4NAXA 3IXRA 3HXSA 1T7PB 2LRNA 1HNAA 4F0CA 2B5EA 5C00A 1JFUA 1GSEA 4V2NA 1H4OA 2O89A 3HVVA 2GQKA 3KIJA 2VLUA 5J9CA 2H66A 3VPTA 3IAS2 2VOCA 2WZ9A 4JR4A 2HYXA 3MAKA 1NM3A 2TRCP 3IC4A 3KTLA 4N30A 1V40A 1GNEA 2D2ZA 5DALB 4XHMA 2B7KA 2MMNA 1O7UA 3F8UA 3ZVJD 2G2QA 3HYPA 1ZYQB 3TJBA 3N5OA 2VL9A 2P31A 1XW6A 3G7JA 2L4CA 5ID2A 3GNJA 2CVDA 1V9WA 1FB6A 4KUNA 1PL2A 1NHYA 1U3AA 4MF6A 4IJIA 2I4AA 3NOFA 3A3TA 5HR2A 2R37A 1UN2A 2H0GA 1TDIA 5IMFA 1G6WA 1ML6A 2LSTA 4CDOA 3QDNA 3D0ZA 4I2TA 4HJ2A 2AJQB 2H1GA 1YY7A 3H1NA 2H72A 4ZBAA 4BPYA 4I8BA 2IMDA 4BVYA 2HSHA 6GSWA 2E7PA 3EURA 2CV4A 3P2AA 1A8YA 5DVBA 4JRRA 3HJOA 4KGIA 2FA8A 4LMVA 1AXDA 4K7NA 4AF2A 5DQYA 2L5LA 4OD7A 1F2EA 1GSFA 1EP7A 2OBKA 4ZBBA 3UAPA 1N2AA 1PX6A 2H6XA 1SL2B 1XFLA 1M9AA 3QFBC 5ECPB 3GTUA 4MJEA 4PUAA 3UL3A 4DSQA 3V1WA 3U5RE 2V6OA 2V32A 4BWQA 1XBSA 3RPPA 4IS0A 1PQNA 2C1YA 1OKTA 2WB9A 3CRTA 1ZL9A 3D4MA 5ECSA 1EGRA 4ISDA 1XWAA 2DSAA 1TI1A 3QMXA 1GWCA 4K0NA 1B48A 1PA3A 1O8WA 4KNDA 1TOFA 2NTOA 2O8VB 3OR5A 3UMAA 1M2DA 2NBSA 2XC2A 1A0RP 1V2AA 1EGOA 4K6XA 5AGYA 1FHEA 1EOHA 3ZLPA 1MD3A 1Z7PA 1B8XA 3TKRA 4FIWA 3BCKA 1UC7A 4J56E 1HQOA 3P7XA 1A2JA 4YQMA 1ERVA 5JWOB 6GSXA 1SK0A 1R4WA 1TRSA 3EVIA 3F6FA 1GTAA 2B5YA 3KP9A 5IMZA 13GSA 3HVXA 1EWXA 3GSSA 1JZWA 2H71A 4KA0A 5L71A 1BX9A 2RUEA 3BBYA 4JU5A 4EL1A 4KCEA 5DJMA 3KH7A 2F8FA 3ZZXA 1V57A 1DSBA 1VF4A 2KUCA 1JZDA 1XVWA 2X64A 1AQXA 4GQCA 1K0AA 1KEBA 4IW9A 2M72A 4IHUA 4FYCA 4WR5A 3GHAA 1BG5A 3UJ1A 1FO5A 22GSA 14GSA 2C0EA 1ST9A 1TU7A 2CT6A 3RAZA 3GMFA 3M1GA 1PKWA 4MA9A 2B5XA 2OKAA 3LQ7A 2K8SA 1ZCPA 5G5FA 4MABA 5IPGA 4YAVA 3KCMA 2CAQA 2AYTA 1HNCA 3L9SA 2DC5A 1SENA 2H8LA 1VRSD 4MLYA 5DAKB 4X43A 1U88A 2ON7A 3VWWA 3TB2A 4EUYA 4WF5A 3ZFLA 4XS4A 1VF1A 2TIRA 4TR1A 4CHSA 2LTKA 1AQVA 2VL3A 2IWTA 2WCIA 5D93A 2HNLA 2GTUA 2OE1A 2R3XA 3GKNA 2QSIA 2E2GA 2FA4A 4PGTA 3VPQA 5ABRA 3IHQA 1ZYEA 1A23A 3TKSC 2B1KA 4GWRA 4D73B 3IOSA 1PN9A 1F3AA 1JLVA 2NPBA 2CX3A 4ECCA 1JHBA 1K3YA 1O8XA 2CA8A 1TI3A 3UEMA 2K18A 5C04A 3HZ4A 3ZMLA 4EVMA 2FCHA 3TOUA 3F4SA 1HD2A 2FHEA 2L5OA 1DE2A 1SK2A 4P3YB 5ECQB 1U6TA 2EC4A 4L5LA 5LNKe 2B7JA 1AW9A 4NHWA 2LUSA 2RLIA 4GF0A 5CRGA 2PERA 2IFQA 2OE3A 4XRAA 1ZZYA 1USBA 2H73A 3APQA 3HJMA 1EV4A 2AAWA 3IBHA 1DUGA 5KN3A 3LGCA 2WS2A 2O87A 2I9HA 1SU9A 4MJAA 2DJKA 4WF4A 1MTCA 1ILOA 2O7KA 5AIXA 1B4QA 3KMOA 4KX4A 17GSA 2PN8A 2GSTA 1LBKA 3C73A 3IAM2 3IE3A 1J0FA 4V2LA 5DQSA 4TRXA 1XVQA 4Z7XA 3PH9A 4FYBA 4ZBDA 3VWVA 4GXZA 2YOIA 4ID0A 4AJ7A 2VLVA 4IELA 2ZUPA 2VCTA 1WP0A 1WRYA 5IM9A 1ZOFA 1IYIA 4IGJA 4NV5A 5GZZB 10GSA 4OFMA 2CZ3A 3SBCA 3Q19A 3L4NA 3FZ9A 5A4WA 3EU4A 4GSTA 4F03A 5KEJA 4PQHA 1GUKA 1B9XC 5ELAA 4MK3A 1AQWA 1GP1A 3CSIA 3H4KA 3O6TA 2JSYA 1XPVA 3Q6OA 1WOUA 3IK7A 4ACSA 1OE8A 1ERUA 5J3RA 4OCEA 3DWVA 3PGTA 1MDKA 5DCGA 2DJJA 4F2IA 4E8EA 3WGXA 3A2WA 4MPGA 4OO4A 2YNXA 1NW2A 1GTIA 2MZCA 3GH6A 3ED3A 3LXZA 1A24A 3MNGA 3KXOA 4FO5A 2WULA 5GAND 2X8HA 1GUHA 2JZTA 1E6BA 1XWBA 4K7OA 2CAIA 1FVJA 3IPZA 1PX7A 5D73A 2JZSA 3QAVA 4EE0A 2JL4A 3CYNA 3GRXA 1CQHA 5HR0A 4EC0A 2PMTA 2I1UA 1K3OA 2JU5A 1GUMA 1X0RA 2EIRA 4TR4A 1CQGA 1PKZA 2H1AA 3DVWA 2L4QA 2GLRA 5GSTA 2FWFA 2F51A 4J2FA 4ZL7A 2E0QA 2J23A 5HFIA 4IKHA 4WXTA 5F06A 3UVHA 3W6GA 2J9HA 5D96A 5J5NA 2KHPA 2FUG2 2E2MA 4AJ6A 4JZQA 3ZREA 1M7TA 2VO4A 2OADA 4MJCA 2HRFA 5CO3A 2FWHA 2RUFA 5EVOA 3F6DA 1XWKA 3H79A 5DBQA 2KLXA 3CMIA 5ECIB 2C3QA 1GSSA 4MDCA 1KTEA 8GSSA 3KZQA 5IMAA 4LMWA 1B9YC 3LSZA 5IOXA 1ERWA 5A4UA 1K0BA 2P5QA 4LL4B 1Z5YE 2K6VA 4G9HA 5H5QA 12GSA 4Q5RA 1C72A 5HFKA 1BAYA 4WETA 5A5KA 4KAEA 3WT2A 2CZ2A 4EKZA 3QD9A 4PNGA 1SYRA 1TRUA 1GNWA 4MMMA 2B6MA 2OACA 2VLTA 2YWIA 2VL2C 1PD21 3HHVA 3LG6A 3O3TA 2K8VA 1U87A 3O76A 1YF0A 3D22A 1QQ2A 5F07A 1RQMA 3IV4A 2PGTA 2L57A 3ISOA 1OYJA 5D9VA 3P90A 1Y6EA 1Z6NA 3GIXA 4NMUA 1YEXA 3RPNA 1OVNA 3E0UA 16GSA 2N5FA 2GZPA 5IPHA 2V6KA 3LORA 4WBJA 3F3QA 4ECBA 4HQSA 2ZNMA 5E4WA 1OC9A 4NHZA 4PX1A 5JCWA 2JZRA 4MF7A 1TP9A 4XCSA 1LU4A 2PPTA 4OMVA 4XS1A 2JSZA 2IMEA 3F3RA 3K8NA 3GA4A 3VFIA 4MH3A 2VL2A 1EP8A 1EEJA 4POKA 4G10A 2YWNA 2YWOA 1GSQA 5F0GA 5ID2B 1K0OA 1PMTA 3CTGA 2VAFA 2CVKA 1O6JA 5DCHA 2IPAA 5D9XA 5FHIA 2BMXA 1TK0B 2V41A 3TUEA 5ECMB 4TW5A 5J41A 5D8IA 2PUKC 3L0HA 3TOTA 3RBTA 3KEBA 1J08A 3TKPA 3MSZA 4BVXA 5AISA 1J9BA 3UOMA 2DJ0A 1FW1A 4TN8A 1TTZA 5CRHA 2R4VA 4TXOA 2RM6A 3FYGA 1HYUA 1MD4A 2C4JA 4ILFA 2ON5A 4PXOA 5ECNB 4MJBA 3LYKA 1Z7RA 4DEJA 3HDCA 2YN1A 1GSUA 1PL1A 1K0MA 5IO0A 3VI7A 2VCVA 3ERGA 3BD2A 4CW9A 3FW2A 1O73A 1JZOA 3F63A 4KB3A 3ZRDA 3IR4A 1TRWA 1A0FA 5ECOB 5ECKB 2LV3A 1OE7A 2QGVA 1RW1A 2C3TA 3F4RA 3GTUB 2HRNA 1TRVA 4L8EA 1Z6MA 3GX8A 2KP1A 11GSA 2FGXA 4OO5A 1GULA 4OFNA 3D4TA 1MDJA 5J4UA 5IOWA 2H6ZA 1BEDA 4O7HA 4V2MA 1GTUA 2PBJA 5J9BA 3QOUA 2VM1A 2LQOA 2QC7A 5B6NA 2GSQA 2KP2A 1WMJA 3LJRA 4RQXA 3GUSA 5HQPA 1YZXA 2X8GA 2IJYA 2GGTA 3TRXA 3ERFA 3DEXA 1ABAA 1M9BA 2WDUA 3WT1A 2GZZA 1XW9A 4KDUA 3TJFA 4O5RA 3ZITA 3FR3A 2YZHA 3L9VA 4ZIJA 6GSVA 3KP8A 3M3MA 4TVEA 1Q98A 2VD0A 1T4ZA 3KM6A 1KBNA 3M9KA 4L0UA 4RI7A 5ELGA 2YV9A 1XXUA 3RDWA 1T8EB 2VCWA 3I69A 4KDXA 3EYTA 2OE0A 3KD0A 3HVSA 2IMFA 2WRTA 1GSYA 5G30A 5CRWA 3U6VA 1FAAA 1X5DA 1XIYA 3D5JA 5ECHB 2H75A 1H75A 2C0DA 1SJZA 1SL1B 3ZMKA 1EEMA 4EDYA 4HI7A 2X99A 4HQZA 1AC1A 4PNFA 2NVLA 1E2YA 3GL3A 3VWXA 2GSRA 2H19A 4EXJA 4IP1A 3QPMA 4KE3A 4H86A 5IMDA 2R2JA 4KSMA 3J7Yb 4TR0A 2C3NA 4I97A 5JCGA 1Z3EA 1F3BA 1THXA 3UVTA 2K9FA 4XS4B 3W8JA 5DJLA 2FWEA 9GSSA 4TR1B 5CREA 3D6IA 4JE1A 3FKFA 3H8QA 2EIQA 4MF5A 2C0FA 3HA9A 3FR6A 1R5AA 5GSSA 4ZB9A 4GCIA 3L9UA 1N8JA 3TKSA 2RM5A 2VM2A 1T00A 3E3EA 4L0WA 2FNOA 4V1Ag 5IIZA 1B4PA 3LXTA 2N5BA 4DSSA 3TJGA 2YJHA 2PU9C 1O85A 5EL8A 3EC3A 3CXGA 2HXKA 5F05A 5EPFA 4Q5FA 2H74A 2MMOA 4HEA2 4OFTA 2DJ2A 2YWMA 5KN2A 3F9UA 1BQ7A 4K8MA 2VD1A 2IIYA 2XBIA 2CX4A 2REMA 3BOAA 1RK4A 3ME7A 3I9V2 4QL7A 1G7EA 5HR1A 2HT9A 4EO3A 3DIEA 2HZEA 2HLSA 1VGLA 2OA7A 3TJKA 2H6YA 2XPDA 3DMLA 2IFQB 2DJ3A 1THOA 4ML6A 4PQIA 4TKYA 2F3MA 2VUPA 2LNTA 4NPBA 5LD0A 3WGEA 3FK8A 20GSA 1BYEA 4YAPA 4K9ZA 5G31A 4EDZA 1SD8A 2AB6A 2YJ7A 4XTSA 4F82A 5GAPD 3IK9A 2XBQA 5JWQB 1ZMAA 4ZILA 2C80A 2GVPA 3ZIJA 3N9JA 1EOGA 2C8UA 2FY6A 1ZGNA 1YEPA 2G0FA 1Q4JA 2XHFA 4TR3A 4G19A 1GLPA 3LFLA 2MBTA 3C1SA 3DVXA 4YH2A 2V1MA 2M46A 3GV1A 4MH2A 3QFAC 2ZCTA 1M2BA 2L6DA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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