1T4Z | Genus

Total Genus 19

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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus	19
sequence length	105
structure length	105
Chain Sequence	GSSLSPQALAQPLLLQLFVDTRPLSQHIVQRVKNILAAVEATVPISLQVINVADQPQLVEYYRLVVTPALVKIGPGSRQVLSGIDLTDQLANQLPQWLVQQEGIF

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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.

Genus data interpretation

Chord Diagram

publication title	Structure of the N-terminal domain of the circadian clock-associated histidine kinase SasA. pubmed doi rcsb
molecule keywords	Adaptive-response sensory-kinase sasA
molecule tags	Transferase
source organism	Synechococcus elongatus
total genus	19
structure length	105
sequence length	105
ec nomenclature	ec 2.7.13.3: Histidine kinase.
pdb deposition date	2004-04-30

pfam database annotations

chain	Pfam Accession Code	Pfam Family Identifier	Pfam Description
A	PF07689	KaiB	KaiB domain

Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)

cath code	Class	Architecture	Topology	Homology	Domain
3.40.30.10	Alpha Beta	3-Layer(aba) Sandwich	Glutaredoxin	Glutaredoxin	1t4zA01

4KUNA 2X64A 2AB6A 1B4QA 3GHAA 4YAPA 1OVNA 4KE3A 2VIMA 1GUMA 1GSDA 2HSYA 1A0RP 1X5DA 3ERFA 1VF1A 5ECIB 5G2ZA 4IELA 1T7PB 5ECRB 2KP2A 1ZZYA 5DALB 4XTSA 5J9BA 3ERGA 1U88A 2DLXA 1VF4A 3TCOA 4K8MA 2LUSA 3KH7A 3GKMA 3WGXA 1NHOA 3JCML 1SK1A 2YCDA 2L57A 2NBSA 5DJMA 1OAZA 2DJKA 4ML1A 2FA4A 2H0GA 3TOUA 2IJYA 2OJLA 1XOBA 4F0BA 1EGRA 2MMAA 1X9SB 5CRDA 1YZXA 4Q5NA 1R5AA 1HNBA 3O6TA 1TU7A 2H6YA 4OMVA 1TI3A 1PL1A 2LJKA 1PN9A 5L71A 4IJIA 3ZIJA 1ABAA 4K7OA 2YPMA 5ABRA 3RDWA 1V58A 4K6XA 1ST9A 4K2DA 2LS5A 4ZL9A 2HT9A 4TOPA 5ELAA 2ON5A 3U5RE 4L5OA 1U3AA 3VLNA 1WP0A 3CSIA 3C7MA 2I81A 1URMA 1PL2A 4TR4A 4NV2A 3FRCA 2N5BA 3L9SA 4I2UA 2IWTA 3EE2A 2LQOA 2JSYA 2VCQA 3LXTA 4K1FA 1A8LA 2R37A 6GSXA 1BQ7A 3ZFLA 2H01A 1BG5A 1XWGA 2L4QA 1MEKA 1EEMA 2CAQA 3ZREA 3KD0A 5F07A 4OFMA 3FEUA 2OBKA 3A2VA 5JCWA 1EOHA 2HE3A 1Q98A 1A23A 3IRAA 4ILFA 1F3BA 3C73A 5A4VA 4IW9A 2O87A 4POLA 5B8BA 4K9ZA 4MJEA 2AAWA 4OO4A 2VAFA 5CNWA 1AQVA 1K0AA 1FHEA 2XBQA 2L5OA 2HFDA 4MA9A 1BJXA 2MYGA 5JCGA 1M0UA 2FLSA 3DMLA 4POBA 3D6IA 1G0TA 3F0IA 4RQRA 2NDOA 1ERTA 1A24A 4K0GA 3Q6OA 2PMTA 1Z3EA 2KUCA 2GQMA 2QC7A 3EU3A 3D21A 18GSA 2LTKA 4HJ2A 3HXSA 1EP7A 1B4PA 1U6TA 1V57A 1ERUA 2YP6A 2L6CA 1S3CA 4CW9A 3ED3A 1T1VA 3M3MA 1JHBA 3KEBA 1SJZA 2VLVA 1XW6A 2PWJA 2XPDA 4KCAA 3GURA 4OFTA 4IBPA 1K3YA 2I3YA 3VI5A 2VD1A 10GSA 2RLIA 3C1RA 2H70A 2PVQA 4MZCA 3APQA 4AJ8A 2AYTA 1USBA 1K0DA 1TW9A 3GL5A 1NSWA 3CRTA 2DJJA 5A4WA 5D93A 2L6DA 2LSTA 4OFNA 2YJHA 3TKSC 1XFLA 2V41A 1EV4A 2HRNA 3C8EA 3GKXA 4IQAA 4E8EA 4Q5RA 4JU5A 4KSMA 1E6BA 4MDCA 3VPTA 1JZRA 3D4TA 1Z9HA 4OWYA 1MD4A 4P3YB 2FA8A 6GSTA 1X0RA 4XRDA 3RBTA 14GSA 2X8CA 3EVIA 5H5QA 1PGTA 3Q18A 1AAZA 1Y6EA 3CSJA 2B7KA 4YQUA 2YZUA 3F6FA 4HQZA 5G30A 3TKPA 3GH9A 1SJIA 4NHZA 2LRCA 4MF7A 2PERA 1XWAA 3BOAA 1TI1A 1J9BA 4YAVA 5EPFA 3HJPA 5CRGA 2B5YA 5ECNB 2CT6A 4MABA 5D9VA 4N10A 2C0FA 1KEBA 1Z7PA 3IC4A 4ECIA 1GSYA 5ECOB 1YKAA 2V6KA 1S3DA 4JRRA 4KDYA 2E2GA 2XHFA 5D9TA 2CX3A 2H1GA 1WWJA 3F9UA 4ULXA 1IYIA 5F8BA 2GDRA 1THOA 2CZ2A 4MJAA 2E7PA 2VD0A 4PXOA 2VLTA 3P7XA 4NMUA 2IMEA 5KN3A 1YQ1A 1V2AA 4YQVA 4ACSA 1SL2B 1DUGA 1JZOA 4DEJA 2VCVA 3M9KA 3QCPA 2R5GA 1T3BA 1W89A 3HVSA 3SWLA 3ZFBA 1XZOA 3F63A 4ZBAA 1QMVA 2Z9SA 5C04A 2OE3A 4HOJA 3QOUA 2P31A 2GT6A 1TRVA 5ECKB 4EL1A 4GRFA 2OE1A 2H1DA 5D96A 1TOFA 1O73A 3HY2A 6GSYA 4MMMA 3P2AA 4TVEA 3GFKA 3F3QA 4X43A 2C3TA 1J08A 1TRWA 4HEA2 2YWOA 1R5PA 1QFNA 3GX0A 4MJCA 1BAYA 5HFIA 2WGRA 1DSBA 5LD0A 4WF4A 2LRTA 3GTUA 1GTIA 2FD3A 3G7IA 1EP8A 2MMOA 3R2QA 5ECSA 3HD5A 1MTCA 4PGTA 3P8WA 2FNOA 1K0NA 4X1UA 3DWVA 2HXKA 3ZVJA 2RIIA 4MPGA 2FWFA 3HZ4A 1TRSA 2E0QA 2H76A 4PQHA 3UJ1A 1HNAA 4EKZA 3HZ8A 4DSSA 3UARA 4JEDA 1OE8A 2HRFA 2RM5A 2K18A 3EU4A 1WPIA 2H75A 4L0UA 2MMZA 3TKQA 4FO5A 5LCZA 4TW5A 2LJAA 4G19A 1ERWA 1C72A 2HI7A 5IMCA 1Z6NA 3I6AA 3EYTA 1GNEA 1KBNA 2WJUA 1A2LA 1PMTA 3L78A 2DIZA 3GKNA 5CRWA 1FB6A 4HZ4A 4TKYA 1T4YA 1SK0A 2GGTA 3IK9A 3GH6A 3N9JA 4ZB8A 5KEJA 1ZGNA 4NAXA 1R7HA 1QQ2A 1TJDA 4BPYA 4FIWA 1UN2A 1YF1A 3ZZXA 4XS4A 1ZMAA 1PD21 1M2DA 1SKSB 1QK8A 5ELGA 1A2MA 2NTOA 4I6XA 3MSZA 1I9DA 1EV9A 4KDXA 1GUKA 1B9YC 1GLQA 1SYXA 3BCIA 4GXZA 3PINA 2DC5A 4MZBA 4OCFA 4ZB6A 4L5LA 4IKHA 1LU4A 5HR1A 3UBLA 5IMAA 3LEFA 3TKSA 4LMWA 5ECPB 5IOXA 4ID0A 2V1MA 4TXVA 1QGVA 3HYPA 3IV4A 3TOTA 4KAEA 2WFCA 4EE0A 4JBBA 4NV5A 1RW1A 3D4MA 5B8AA 1CQHA 3H4KA 2OA7A 2VL2C 3MDKA 1TU8A 4RQXA 1OC9A 4GF0A 2F8FA 3O76A 3D5JA 2LEGA 3FYGA 2HLSA 3FZAA 1M99A 3UMAA 1BX9A 3KGKA 2PGTA 1X5CA 4PUAA 4MF6A 2XBIA 2O8VB 3ZITA 2P5RA 4HDEA 4JR6A 1SKWB 4IP1A 4NHWA 1XOAA 5COHA 2H73A 3TKSE 3TRQA 2GS3A 4KH7A 4XCSA 2FCHA 4IGJA 3F3RA 5JWRB 2VCTA 2VO4A 2DIYA 1FB0A 2HSHA 2H8LA 2ALBA 2HZFA 4PQIA 1AUCA 4EVMA 2WRTA 1YY7A 3W8JA 1M7TA 1T4ZA 3ME7A 1TP9A 3TJBA 1VF2A 5EVOA 3FW2A 2EIRA 3UAPA 1I5GA 3GL3A 1K0MA 11GSA 4MPFA 5INYA 1VGLA 1X5EA 4NPBA 2L5LA 4NWYA 1B8XA 1JLVA 2M80A 4KB3A 5ECLB 3WT2A 1O8WA 3WT1A 3FKFA 4H86A 2GZYA 4MZWA 3BBYA 1OE7A 5C00A 2H0IA 4KDUA 4RI6A 3GV1A 1Z7RA 5B6NA 2LKUA 1TK8B 1OKDA 1Q4JA 4YQMA 4KCEA 3G7JA 1O7UA 3QDNA 3TRPA 2OACA 3K8NA 1XVWA 1OC8A 4F2IA 1ZCPA 2C3NA 2J23A 3UBKA 2CV4A 5IMVA 3A2WA 4AGSA 1ZYEA 1GP1A 3Q74A 1M2BA 4WETA 3IDVA 3TB2A 3RPNA 2OKAA 2CX4A 16GSA 5ECMB 2CZ3A 1BEDA 1TXXA 3CBUA 2WZ9A 1PRXA 2VL9A 1Z5YE 2FY6A 4GQFA 1R4WA 2D2ZA 3FZ5A 3G9BA 4MH3A 4TR3A 1OC3A 2MZCA 2JL4A 3A5WA 3H79A 5KN0A 4BVXA 3VFIA 3UL3A 4IJ3A 2LV3A 3IAS2 4ZXGA 1GSEA 2M72A 1GTUA 5EL8A 3TRXA 2DSAA 3GSSA 4K7IA 3CSHA 3DVXA 5F06A 1B9XC 3PGTA 4GSNA 4HZ2A 3DXBA 2JACA 5D9XA 1PKWA 1H75A 1AIUA 5JWQB 1XVQA 1H4OA 4ZIJA 3M9JA 5E4WA 2KLXA 4ISDA 4EDZA 3LGCA 3HVVA 4TR1A 3GNJA 1JFUA 2BTOT 3RHBA 2NVLA 3VWWA 4ZL7A 4GCIA 4FYCA 3CMIA 4L8EA 3GA4A 5J4UA 3V1WA 3CYNA 1SL0B 5D8IA 1OYJA 4EO3A 5IOWA 3HDCA 4QL9A 4MJBA 1PSQA 2DBCA 1G7EA 2YN1A 2FHEA 2C4JA 4WBJA 1GNWA 4LA1A 2VOCA 1FG4A 1V40A 4GTUA 1YEPA 3HJOA 3HVXA 2YOIA 3OR5A 3E3EA 2DJ0A 2F3MA 4WBRD 2YWIA 5FHIA 3TJGA 3KXOA 2MBSA 5E59A 3TGZA 2BMXA 2YZHA 3VWUA 5IM9A 2FWEA 3IOSA 5IPHA 1XWBA 4PQ1A 5G5EA 3GUSA 5B6MA 2PBJA 9GSSA 2KHPA 1JZDA 1S3AA 2IPAA 4ZBDA 2V32A 3US3A 2AHEA 2KP1A 3Q19A 4WKWA 2LJRA 1FW1A 2V2GA 5IIZA 2VL2A 3KH9A 4GQCA 1WOUA 1WRYA 3ZLPA 4DSQA 5GSSA 1TDIA 3F6DA 3F4RA 4OO5A 3L0HA 4I8BA 1SU9A 3VWXA 2PN8A 1G6YA 1GLPA 4BVYA 5DAKB 2JZSA 2HYXA 2C0EA 7GSSA 5JWOB 5CP1A 4V1Ag 1JZWA 1V9WA 2C8UA 4GSSA 3GTUB 4IHUA 5CYYA 3RHCA 5IO0A 3N5OA 3D0ZA 1RK4A 20GSA 5ID2A 4JR4A 1PX7A 1MDKA 5GSTA 4OD7A 2H1BA 4ZILA 1GTBA 1A2JA 1QXHA 2X8GA 3KMNA 1EGOA 1PX6A 4D73A 4V2MA 3KIJA 1U87A 3KM6A 4EDYA 1NW2A 1UA5A 4QL7A 4CHSA 4BWQA 2RM6A 1A8YA 5H5SA 2R2JA 1XWCA 3IHQA 4DSSB 5GZZB 2N5AA 3M1GA 2HZEA 2K9FA 2DMLA 4L0WA 1O8XA 5G31A 2PUKC 2YJ7A 5IMFA 5DCGA 2X99A 2EIOA 3BCKA 2DJ1A 4PUFC 3I43A 4IP6A 5DAKA 5DQSA 3RAZA 8GSSA 1GUHA 1YKCA 3EC3A 1Y25A 3EMXA 1F9MA 2GZPA 4HUAA 2CA8A 3F8UA 1ERVA 3PH9A 4WR4A 3RPPA 1KNGA 2DJ2A 3H93A 3BJ5A 3CRUA 3HKRA 4XS1A 2XPEA 4KGIA 3DYRA 2GT5A 4XS4B 5CRHA 2JADA 2CQ9A 5H5RA 3KP8A 2PU9C 3NZNA 1XXUA 4HQSA 1N2AA 3ZYWA 5IMDA 2VL3A 4J56E 1O81A 1WE0A 3ZVJD 4CDOA 2GSRA 3GMFA 1F6MC 5G1LA 3VI7A 2L59A 2JSZA 1HNCA 3QFAC 2WULA 3L9VA 3I69A 2I4AA 3QMXA 2L4CA 4AJ6A 4HU9A 4Z7XA 5G5FA 2DJ3A 1LJRA 3E0UA 3QAVA 2YNXA 1FAAA 3C1SA 5J41A 4LMVA 1VF3A 3DVWA 2GQLA 2O89A 3LG6A 2K6VA 4K0NA 2LNTA 4EXJA 1K0BA 2QGVA 4ML6A 2NPBA 4XRAA 1OC9B 1SJ6A 3ERWA 13GSA 1HD2A 3LJRA 3AY8A 2GSTA 3WGEA 1U3IA 1RQMA 1SYRA 2FWGA 5F0GA 1DBYA 4WR5A 1X9WB 4F82A 1G6WA 2RUEA 3H8QA 2P0GA 5CO3A 4KX4A 3W6GA 5ECQB 5IO2A 4EC0A 2C0GA 4TXOA 4FYBA 4MH2A 4GWRA 3F4TA 1MD3A 4RUVA 1F3AA 1ZL9A 4MK3A 4ECBA 1WIKA 3LWAA 1N8JA 3QR6A 4ZB9A 3DEXA 1ON4A 3IR4A 2YANA 2H6ZA 1XBSA 1GSFA 4JZQA 2H19A 1PKZA 4IN0A 1SL1B 3DGQA 12GSA 2R4VA 3A3TA 3APSA 3H1NA 1E2YA 1AC1A 1TRUA 2G2QA 5AGYA 3ZIVA 3M0FA 1AQWA 3VWVA 1PA3A 2H66A 2AUVA 4GLTA 2B1KA 4XIHA 3CTGA 5GAND 4N0VA 3VK9A 2VCZA 2YV9A 4LLRA 3S9FA 4GSTA 4O92A 4ZBBA 3CTFA 2MBTA 1AW9A 1VRSD 1XW5A 4V1Ap 3UIWA 3QAGA 4DSRA 2VCXA 2EC4A 1PQNA 4E8HA 5G1KA 3VPQA 3ZMKA 1BYEA 4KW6A 4ECJA 1GL8A 2I1UA 4OCEA 3KCMA 1XPVA 2GSSA 2H72A 1TKDB 3D22A 2IN3A 5HFGA 4BL7A 3QPMA 3FR3A 5CREA 3DKSA 1DE2A 3GRXA 4BA7A 3FR9A 3A2XA 2GZZA 2KOKA 5FWGA 2IMKA 4XHMA 2HNLA 2WDUA 3L9UA 2PVOC 2B5EA 3EMPA 2F9SA 3HJMA 5DALA 3HHVA 5A5KA 2A2RA 3IE3A 4J2FA 1SK2A 4G10A 2FUG2 1A0FA 1QUWA 2FGXA 1B48A 4TR1B 2TRCP 3IBHA 2B6MA 2F51A 4NXIA 3LQ7A 4MP4A 4F9ZA 2CVBA 4YH2A 2V6OA 1JLWA 2M46A 2B7JA 3MAKA 1FVKA 2H74A 1YJ6A 2OADA 6GSVA 1F2EA 3IXRA 2I9HA 2O7KA 3EINA 4G9HA 1AQXA 2DMMA 3ZTLA 1EZKA 3O3TA 3CXGA 1CQGA 3TUEA 4Q5QA 5KN2A 3PR8A 3J7Yb 3ISOA 3FR6A 4AJ7A 1XCCA 1G7OA 3E9JB 3FHKA 1GWCA 4FYUA 2PPTA 3EWLA 4MF5A 1GSUA 5HR0A 3U6VA 1OKTA 1J0FA 1GSSA 1F37A 3QAWA 5DVBA 2IFQB 1ZOFA 2ZUPA 1ACVA 4N0ZA 1ZYQB 4N30A 3LYKA 3P90A 5B7CA 3EURA 4O32A 2ES7A 1O6JA 2AV4A 2REMA 5D9WA 1T8EB 4HU7A 2VCWA 1K3OA 2C80A 1SENA 2R6KA 3TJKA 2ZNMA 2K8VA 2WCIA 3TJJA 1TK5B 5GAPD 2E2MA 3LYPA 3KP9A 1SKRB 4EUYA 2IMFA 4BWSA 4O5RA 3UEMA 1SD8A 1O85A 5CAXA 2VLUA 1R26A 4F03A 5J3RA 3LORA 1WMJA 3TKRA 1MDIA 2JZTA 4PX1A 5ID2B 1XWKA 4IS0A 19GSA 1K0OA 2OBIA 5AISA 1YEXA 1GULA 2LNSA 5HR2A 5AN1A 4D73B 1IYHA 4J57E 3IA1A 2EIQA 4AF2A 4I5QA 3FZ4A 4TN8A 4LL1B 3I9V2 1FVJA 1YDKA 3QFBC 2IFQA 5IPGA 3J7Yk 1GH2A 5HFKA 3UOMA 2VM1A 2HZEB 5IMZA 2H71A 2JZRA 2TRXA 2CAIA 3QD9A 3LXZA 2A4VA 2O85A 5HR3A 1EWXA 3GX8A 6GSUA 17GSA 2CVDA 1DE1A 22GSA 3WGDA 1K0CA 4PURA 4DVCA 1TK0B 5KN1A 2XC2A 1TTZA 3WYWA 5J9CA 4QQ7A 3W8SA 2YWMA 2AJQB 4O7HA 4FH8A 2J9HA 2BJXA 3BD2A 1WJKA 4TRXA 2YV7A 3ZL5A 4MLYA 4RI7A 2B1LA 4KNDA 3LSZA 1K3LA 3KTLA 5ENUA 1M2AA 1GTAA 2MMNA 5DQYA 2GQKA 1EEJA 4WF5A 2B3SA 5D73A 3NOFA 2H6XA 3M8NA 3GKKA 3UVHA 3WD6A 1Z6MA 3ZMLA 1UC7A 5DBQA 2VM2A 3HCZA 4ZL8A 5DCHA 1ILOA 1M9BA 3L4NA 2IL3A 1NM3A 4X0XA 2K8SA 3LFLA 4WXTA 5J5NA 2F8AA 2LQQA 3IPZA 2ON7A 2B5XA 2C3QA 3C71A 4PNGA 1NHYA 4V2NA 3ME8A 1M9AA 3NIVA 2N5FA 5LNKe 2OE0A 1V98A 3DIEA 5EY6A 4POKA 2LRNA 3DD3A 2H0HA 2TIRA 3IAM2 4LL4B 4G2EA 3TJFA 3G7YA 5ECHB 2IIYA 1THXA 3IK7A 1XW9A 4IQ1A 1HYUA 3FY7A 2C1YA 3ZRDA 4V2LA 1ML6A 2G0FA 4TXOB 1FOVA 3FZ9A 1SD9A 1GSQA 5IQYA 2WB9A 3APOA 5A4UA 1X9MB 2H1AA 2ZCTA 5DDLA 2YWNA 1HQOA 2X8HA 3KJYA 5JCUA 4TR0A 4N11A 3TDGA 4MCUA 2GLRA 3FK8A 4KSOA 6GSSA 5DJLA 1UVZA 4F0CA 1T00A 4JE1A 2GTUA 6GSWA 3KZQA 5AIXA 3HA9A 2FWHA 2H30A 3F4SA 1GRXA 4WEYA 2RUFA 2IMDA 3KMOA 4I97A 2A2SA 2JU5A 2C0DA 4PNFA 2P5QA 1EOGA 1FO5A 3UVTA 1W4VA 2QKEA 3KTBA 4HS1A 4K7NA 5F05A 4ECCA 3MNGA 1MDJA 2QSIA 4IVFA 2WS2A 1XIYA 4HJMA 1LBKA 4HI7A 4I2TA 2IMIA 3VURA 3MWHA 2CVKA 2GVPA 3GYKA 3SBCA 2R3XA 1AXDA 2VUPA 3GIXA 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chains in the Genus database with same CATH superfamily

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chains in the Genus database with same CATH homology

#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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