1T6EX

Crystal structure of the triticum aestivum xylanase inhibitor i
Total Genus 86
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
86
sequence length
381
structure length
362
Chain Sequence
LPVLAPVTKDPATSLYTIPFHDGASLVLDVAGPLVWSTCDGGQPPAEIPCSSPTCLLANAYPAPGCPAPSCKPCTAYPYNPVSGACAAGSLSHTRFVANTTDGSKPVSKVNVGVLAACAPSKLLASLPRGSTGVAGLANSGLALPAQVASAQKVANRFLLCLPTGGPGVAIFGGGPVPWPQFTQSMPYTPLVTKGGSPAHYISARSIVVGDTRVPVPEGALATGGVMLSTRLPYVLLRPDVYRPLMDAFTKALAAQARAVEAVAPFGVCYDTKTLGNNLGGYAVPNVQLGLDGGSDWTMTGKNSMVDVKQGTACVAFVEMKGVAPAVILGGAQMEDFVLDFDMEKKRLGFSRLPHFTGCGGL
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase inhibitor
molecule keywords xylanase inhibitor
publication title Structural basis for inhibition of Aspergillus niger xylanase by triticum aestivum xylanase inhibitor-I
pubmed doi rcsb
total genus 86
structure length 362
sequence length 381
ec nomenclature ec 3.2.1.8: Endo-1,4-beta-xylanase.
pdb deposition date 2004-05-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
X PF14541 TAXi_C Xylanase inhibitor C-terminal
X PF14543 TAXi_N Xylanase inhibitor N-terminal
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1t6eX01
2.40.70.10 Mainly Beta Beta Barrel Cathepsin D, subunit A; domain 1 Acid Proteases 1t6eX02
3SA3A 2R9BA 1ZLFA 4YD3A 5P83A 5P1HA 3QBHA 4YCTA 5P0QA 4GJ9A 3BXSA 2ANLA 4M8XA 3ZPUA 5P41A 2QI5A 1FQ8A 4AMTA 4Y3PA 5P3HA 2QNPA 5P73A 5DQ2A 3OUDA 2Q11A 3DK1A 3HAWA 1D4HA 5P07A 2QI6A 3IN3A 1MVPA 1RQ9A 1MERA 1HHPA 4RROA 1MRWA 5P00A 4APRE 5P88A 2AOHA 1ME6A 4Y3HA 3VV8A 4GIDA 4Y37A 3SACA 5P46A 4RZ1A 5P6JA 3I2LA 1YTGA 1FKNA 3HDKA 5P5JA 1OEWA 4DJWA 3EKQA 5TOLA 3IXOA 5P43A 5P0DA 4TRYA 3FNTA 2BPXA 4I12A 4Y3XA 5OZEA 2VA6A 1IZHA 3KDBA 3IXJA 4IVTA 4Y5LA 4F75A 3JVWA 1DP5A 2OHPA 3CIBA 3UF3A 5HTZA 1KZKA 3S43B 1HEGE 5P51A 5P1EA 1K2CA 3QVCA 3OUBA 1MTBA 3OHHA 5OYRA 3PJ6A 5P5YA 4B0QA 2RKFA 3DV1A 2HC0A 5P5UA 2NXMA 1HSHA 3EL0A 4AA8A 3APRE 1HPOA 5OZSA 4R91A 1T7IA 1ZBGA 1HVCA 3OUDB 4PYVA 4KB9A 4QJ8A 4DJYA 5OZ5A 1NPAA 5P45A 4DVFA 4GJCA 2QK5A 3MSJA 5OZ7A 4D89A 2VIJA 7HVPA 2ZJNA 5P48A 3T3CA 3OQFA 3ZKIA 5DR4A 3LZSA 5COOA 3VYEA 2QHZA 3OQ7A 1ODXA 5OZUA 5P5OA 1FFFC 3RSXA 3IAWA 2I0AA 4I0HA 3HBOA 4J55A 1W51A 5P5GA 1GVXA 5P09A 5P24A 1HPVA 3D1XA 2I4UA 5P64A 5OZKA 3UDKA 3KM4A 1XN2A 1SDVA 1E82E 2AOFA 1IDBA 3FNSA 3LINA 5P1SA 2O4NA 5C9FA 5P60A 1SIPA 4D8CA 2QHCA 2R3TA 1TSQA 4ER4E 3RTMA 5P2LA 3QBFA 1D4YA 5DQ4A 3CMSA 1K6CA 2HIZA 3SA5A 3SAAA 4AUCA 5P1LA 3NSHA 5P6YA 1BV9A 3T7PA 1YT9A 3NU6A 4DQHA 4FAFA 5OZDA 3IVHA 4QJAA 5P7OA 4CPWA 3VF7A 1QS8A 1FB7A 4D88A 3K5DA 1IIQA 3OTYA 4I1CA 5P2RA 1VIKA 4R8YA 3S53A 3PM4A 5P3WA 5P58A 1LF2A 2IENA 5P1YA 5KQZA 3LIXA 4I11A 1EAGA 2G1RA 4DH6A 2R3WA 3DCKA 5P3QA 4PHVA 4TVGA 3NU3A 3KMXA 1T7KA 3T11A 1TCXA 1EC3A 5P7AA 5OZPA 1HEFE 5P0PA 4FL8A 2G27A 5P1CA 5P25A 5P2HA 4F73A 4CPSA 1LZQA 4NPTA 1N49A 5P4CA 1PSNA 4R5NA 3WB5A 5P7WA 3OQDA 2P4JA 4Y50A 5P0LA 2NXDA 3BUGA 4FM6A 1B5FB 2ER9E 5P2YA 4BEKA 1OD1A 3GW5A 3IXKA 5P5FA 3B7VA 3TKWA 2VIYA 4FRSA 2Q54A 1B6LA 1YM2A 2I4WA 3K5CA 3ER5E 4Y4UA 5P0IA 5P4ZA 2PQZA 5P5NA 2OHNA 1ENTE 1GNNA 5P7JA 4Y5KA 5P7UA 4QGIA 3IN4A 5P5QA 1NPWA 2R5QA 1ODYA 3O9AA 4NJVA 1W5YA 4RCDA 3EMYA 5P4GA 3K4VA 1APTE 2JJJA 2V00A 4Y3YA 2HAHA 1IBQA 1BVEA 3WZ7A 5HE4A 5P39A 3M9FA 3FV3A 3A2OA 5OZTA 3ZKXA 5P1VA 4J17A 5P69A 3QVIA 2FNTA 3O9HA 3ZPTA 5P2QA 4H3FA 4A6BA 5KQYA 5ENKA 5P36A 2AZ9A 3QIHA 5P7GA 3BVBA 2WEZA 2I1AA 3MWSA 3S7LA 2OHTA 3D3TA 4NKKA 4Y35A 5P3YA 2ZHVA 2BQVA 5P6ZA 4I0JA 3UDNA 5P52A 2G1YA 3FSMA 4Y41A 1QDMA 4Y54A 3TPLA 5P4PA 4ZLSA 4FRIA 1XL5A 3OADA 3TOGA 5SXNA 3S54A 1T3RA 4EWOA 5C9BA 1APUE 4RRSA 1W5WA 5T4SA 2QAKA 4FS4A 4DV9A 5P0YA 2V16C 5P4YA 4Y3SA 3LZVA 5B18A 4I0GA 1LYWA 5P2OA 3S56A 2IDWA 4U7QA 2XFKA 3O9IA 2J9JA 4I0DA 1D4KA 4Q1XA 5P8FA 5P16A 1BV7A 4J0YA 3U71A 1HSIA 1SH9A 5KR0A 2IGYA 5P3BA 2HPEA 3N3IA 3SFCA 5P0SA 5BS4A 2QNNA 3UHLA 3NDTA 4HA5A 4B1DA 4DJQA 3LITA 1T6EX 5OZ0A 3LPIA 5P1QA 5P1AA 4Y38A 3O9EA 2OHRA 5P5DA 3QI1A 5IE1A 4GJ8A 5P4DA 4GMIA 5ISKA 5P6VA 2BJUA 1QBUA 3PSGA 1XE5A 2CEJA 1ZTZA 2BKSA 2G20A 2IRZA 1GVVA 5P56A 4Y57A 3L5EA 5P5WA 1EPNE 2QMPA 4J1IA 4Y3NA 2NNPA 1E80E 5P6SA 3OUCA 5AH9A 3OADB 5P68A 5OZCA 4I8ZA 3PI0A 3GI5A 3KN0A 5P06A 3D91A 1W5XA 2F81A 5P8LA 5DR3A 6APRE 4ZIPA 1SMRA 4LXMA 4LXKA 4RGHA 4K4PA 3UDRA 2HS1A 5P4LA 1E81E 2AZ8A 1HTFA 5P4KA 5P2IA 5P32A 3VV7A 3ZKGA 3QAAA 3KDCA 5P5AA 4JPEA 4Y3WA 3T7XA 3RVIA 1FFIC 5ER1E 5P2KA 2J9JB 4OBGA 3ST5A 1YTHA 1SDTA 4B1EA 4JECA 5P6OA 4CPQA 3N4LA 5P0MA 4Y4BA 5P4VA 5P8UA 5P14A 2VNNA 1PFZA 5P80A 2XFJA 2G1NA 5DGUA 3O9CA 4Y53A 2FDPA 2PH6A 1FG8C 3K4VC 5KR8A 5P0GA 3RTHA 2NMZA 1MT8A 4FE6A 5P29A 3NYGA 4EHCA 1FF0C 3U6AA 1F7AA 5P42A 3PWWA 2O40A 6FIVA 5P3MA 5OZOA 3IA9A 5P1XA 1EBYA 4ZSPA 4EJ8A 3RU1A 2WF2A 5HCOA 4Y3JA 5P8DA 4CMSA 2FS4A 5P1KA 3PRSA 3VLBA 1TQFA 4EP3A 5P1RA 4ZPGA 3PHVA 3OU1B 4COEA 3URIA 1YM4A 1T6GA 4Y48A 4GJDA 5P7DA 3I25A 1F34A 3OQAA 5JFUA 1IVQA 3BHEA 4OC6B 1APVE 3NXEA 3FKTA 3KF0A 3SA8A 4OBKA 1ZAPA 1K1TA 5KR2A 3NWQA 5I3YA 3OHFA 5P8NA 3VYFA 4JPCA 1M4HA 2NR6A 3SABA 1MTRA 3PLLA 3UDMA 1IZIA 3UTLA 2RSPA 4KUPA 5P5MA 5P03A 5P7YA 5P04A 4I8WA 4Y5BA 3VFAA 4U7VA 4LBTA 5P26A 3VG1A 3WZ6A 5J25A 2OF0A 3JW2A 1PSOE 5ENMA 5P5XA 1ZSRA 1QBSA 2ER7E 5HE5A 5P17A 5P71A 2J9KA 1TSUA 5P6TA 1APWE 3OOZA 4Y3RA 5DR8A 3WB4A 5DR1A 3S7MA 1XS7D 3PCZA 3FIVA 2PH8A 5P54A 3TL9A 5P81A 1D4SA 5OZLA 5HVPA 4F76A 4Y3FA 3ZMGA 1GVTA 4DQEA 1HXWA 4ACXA 4B00A 1ZPKA 5HDXA 5P0NA 3DUYA 1HVJA 4I10A 4Y3LA 5P6IA 3OU4A 3VV6A 5P1NA 5P7ZA 5P20A 5P6DA 5OZ9A 1ZP8A 2PSGA 5P62A 4YOBA 4EP2A 5P2DA 4CP7A 3O9FA 4HLAA 1AIDA 5P3GA 5P3TA 1FMUA 1D4IA 3JVYA 5AH7A 2P3BA 5E5KA 1HVLA 5P0AA 1KJGA 4CPTA 2HM1A 3HW1A 5OYYA 5KQFA 4FAEA 3UPJA 2G22A 3TOHA 4PZWA 1LYBA 3IGBA 3R1GB 5OZZA 5P63A 5P33A 2HB4A 2AVSA 5DQCA 3INEA 2VJ7A 4YCYA 1META 3NR6A 4Q1WA 1HTGA 3HZCA 1QBTA 5C9DA 5P0JA 1CPIA 5AHCA 4I0FA 2AVVA 2ZYEA 2OHLA 5I70A 4OD9A 3BUFA 3QRVA 4Y44A 4B70A 4LHHA 3NU9A 4DQFA 5EZZA 2QI1A 1LYAA 3HAUA 2CEMA 2V12C 5P7EA 2BPWA 2OAHA 3MXDA 2PMAA 5P8GA 1FQ7A 5P5VA 5P8IA 4GJAA 5P7XA 5P1BA 4GJ7A 2B8VA 4N00A 1RNEA 1G6LA 2WF4A 2HS2A 5P3SA 2AOIA 6UPJA 2AOGA 1HVKA 2QNQA 2Q64A 3VSXA 5P0EA 1G2KA 5P3UA 3KDDA 2UY0A 5P77A 1AAQA 1WKRA 5P5CA 4J5JA 1OHRA 3DOXA 5P86A 3PMUA 3PB5A 4X2LA 3BXRA 2MIPA 4QJ7A 4GYEA 5OZ2A 2QU3A 2NMYA 4D83A 4KE0A 2P3BB 4Y4WA 5P3EA 5P6QA 4LL3A 1DMPA 5P4XA 5P19A 4ZEAA 5P53A 5JODA 5P4WA 5P5HA 5P7SA 3VF5A 2R38A 1IVPA 2Q3KA 1UH7A 5IVTA 3ZKQA 4X7IA 2G1OA 5P8PA 2ZJIA 4RVIA 2WEAA 3VLAA 4Y45A 3LIQA 3INFA 2G69A 4B78A 5P6LA 3LZYA 5OZMA 3R0YA 1BXQA 4Y3EA 4GB2A 1BAIA 1LYAB 1Z1HA 4Q1NA 1E5OE 2PYNA 5F01A 5P75A 1PPME 4GZFA 1BIMA 3UFLA 4B05A 5P6RA 4WY6A 5KQXA 5P8MA 5P4NA 1HPXA 3IVIA 3CYXA 3BVAA 5P2GA 3UQXA 1B6MA 3SKFA 1K2BA 5HCTA 5AGZA 4Y36A 4BFBA 2WKZA 1VIJA 5P6MA 4ZPFA 2R5PA 2OHKA 1IDAA 4L7JA 5P8SA 1FEJC 3KT5A 1MT9A 5JFPA 3EKWA 5P0ZA 3QPJA 4LP9A 5P82A 3UDPA 4Y5NA 3G6ZA 3ER3E 5P10A 4YD4A 3PSYA 4Y5GA 1TZSA 4FLGA 5P27A 4L6BA 1K6TA 5P7IA 4DJRA 2B7ZA 5P2TA 4A6CA 1SBGA 3KFPA 3NWXA 4EXGA 5P2EA 3NU4A 2PWRA 4U8WA 1KJFA 2Q63A 1MUIA 5P4EA 1FGCC 2Q55A 2IEOA 3UDJA 2XYFA 3TPPA 5P6EA 1XN3A 4YHQA 4HZTA 5P11A 3OTSA 5P67A 4HE9A 4XXSA 3ZKNA 9HVPA 4L1AA 4H1EA 2VA7A 4DJUA 4Y4GA 5P0TA 2AOEA 1LF4A 3T7QA 2O4PA 2IQGA 4HEGA 5P5EA 2AOCA 1HOSA 3QN8A 1EBZA 3CKTA 2BPZA 2AIDA 1SDUA 3H0BA 2ZJJA 4I0ZA 4NJSA 1HPSA 3S45A 4I0IA 4MC6A 4K8SA 2OHUA 5P13A 2QZLA 4Z2ZA 2ZJKA 1EPLE 2PSUA 3KMYA 1GVWA 3PI5A 5EZXA 4HDBA 5P7FA 3CKPA 2IKOA 4RVXA 3LIVA 2G94A 2QP8A 1RL8A 4NJUA 2ER6E 2IS0A 1DAZC 5AH8A 2FXEA 5P59A 4Y58A 4F74A 5OZ6A 3GI0A 4CKUA 3K5FA 5P3RA 5P6AA 5P2XA 5P3LA 5P6BA 5COPA 2QMFA 1EPQE 3OOTA 3Q6YA 4J0TA 1K6PA 2NPHA 4RYCA 3ZKMA 3PLDA 5P85A 4J1KA 3HVPA 4J0PA 2F3EA 4MC9A 2Z54A 5OZ1A 4KE1A 3DCRA 3SKGA 2G1SA 5P0BA 4ACUA 5P3FA 1HVRA 4XX3A 5FIVA 2PSVA 5KR1A 5P3JA 5BWYA 5P05A 4Y3DA 4YOAA 1ODWA 5OYXA 2H6TA 4FSLA 5P72A 4YD7A 3O9LA 3S2OA 1LS5A 3S85A 1QRPE 2QI0A 2B42A 5P6HA 5HU0A 3SA7A 5P6FA 4JP9A 5P1ZA 5P5SA 1KJ7A 2QD7A 4FRKA 3H5BA 2JYSA 2F3KA 5ISJA 1B6JA 4OBHA 3SO9A 5P1OA 3UQWA 1ZJ7A 1BDQA 3VEUA 4UPJA 3PBDA 3TH9A 3EL4A 2Q15A 5P50A 1LV1A 5P4MA 5OZIA 4EJDA 4YA8A 5P8RA 5P6UA 5OZ8A 4FCOA 4NPUA 4DQCA 3VFBA 4XKXA 1A8KA 4FM7A 2QMDA 4Y56A 5AHBA 3URLA 3O99A 3PWRA 4NJTA 5P89A 5OZWA 4RYGA 2AZCA 1C70A 3SA4A 5P15A 3OXVA 1FQ6A 5P7QA 4Q1YA 1LYWB 5OYUA 3EKTA 5P5BA 3NU5A 2FMBA 4YD6A 2QI7A 4ZSQA 3AIDA 5HD0A 2I0DA 3OWNA 5P0HA 2ZHUA 5OZQA 5P4JA 3EL9A 5P01A 3EXOA 2BBBA 1AM5A 4PEPA 2EWYA 2XFIA 4FM8A 3UDHA 4EJLA 3LPJA 5P4HA 3TTPA 4ZSRA 5P8AA 3NDWA 5P3KA 5P2JA 4J1HA 3SLZA 1QBRA 2IL2A 2QI4A 3BUHA 2PK5A 4CPRA 3EKXA 3PWMA 1EPOE 3C9XA 5P3VA 2P3CA 4Y9WA 2FDDA 3R0WA 3BGCA 3EKPA 4WY1A 4S1GA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3SA3 A;  2R9B A;  1ZLF A;  4YD3 A;  5P83 A;  5P1H A;  3QBH A;  4YCT A;  5P0Q A;  4GJ9 A;  3BXS A;  2ANL A;  4M8X A;  3ZPU A;  5P41 A;  2QI5 A;  1FQ8 A;  4AMT A;  4Y3P A;  5P3H A;  2QNP A;  5P73 A;  5DQ2 A;  3OUD A;  2Q11 A;  3DK1 A;  3HAW A;  1D4H A;  5P07 A;  2QI6 A;  3IN3 A;  1MVP A;  1RQ9 A;  1MER A;  1HHP A;  4RRO A;  1MRW A;  5P00 A;  4APR E;  5P88 A;  2AOH A;  1ME6 A;  4Y3H A;  3VV8 A;  4GID A;  4Y37 A;  3SAC A;  5P46 A;  4RZ1 A;  5P6J A;  3I2L A;  1YTG A;  1FKN A;  3HDK A;  5P5J A;  1OEW A;  4DJW A;  3EKQ A;  5TOL A;  3IXO A;  5P43 A;  5P0D A;  4TRY A;  3FNT A;  2BPX A;  4I12 A;  4Y3X A;  5OZE A;  2VA6 A;  1IZH A;  3KDB A;  3IXJ A;  4IVT A;  4Y5L A;  4F75 A;  3JVW A;  1DP5 A;  2OHP A;  3CIB A;  3UF3 A;  5HTZ A;  1KZK A;  3S43 B;  1HEG E;  5P51 A;  5P1E A;  1K2C A;  3QVC A;  3OUB A;  1MTB A;  3OHH A;  5OYR A;  3PJ6 A;  5P5Y A;  4B0Q A;  2RKF A;  3DV1 A;  2HC0 A;  5P5U A;  2NXM A;  1HSH A;  3EL0 A;  4AA8 A;  3APR E;  1HPO A;  5OZS A;  4R91 A;  1T7I A;  1ZBG A;  1HVC A;  3OUD B;  4PYV A; 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#chains in the Genus database with same CATH homology
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