1TAYA

Dissection of the functional role of structural elements of tyrosine-63 in the catalytic action of human lysozyme
Total Genus 51
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
51
sequence length
130
structure length
130
Chain Sequence
KVFERCELARTLKRLGMDGYRGISLANWMCLAKWESGYNTRATNYNAGDRSTDYGIFQINSRAWCNDGKTPGAVNACHLSCSALLQDNIADAVACAKRVVRDPQGIRAWVAWRNRCQNRDVRQYVQGCGV
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase (o-glycosyl)
source organism Homo sapiens
publication title Dissection of the functional role of structural elements of tyrosine-63 in the catalytic action of human lysozyme.
pubmed doi rcsb
molecule keywords HUMAN LYSOZYME
total genus 51
structure length 130
sequence length 130
ec nomenclature ec 3.2.1.17: Lysozyme.
pdb deposition date 1992-08-06

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00062 Lys C-type lysozyme/alpha-lactalbumin family
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
1.10.530.10 Mainly Alpha Orthogonal Bundle Lysozyme Lysozyme 1tayA00
3K3TA 1C7PA 5LYZA 4OW1A 4NHIA 1GXV2 5LA8A 1IOSA 2IHLA 4BAPA 1J1XY 1BB3A 1UIEA 2BQDA 1VAUA 4B4JA 1NMMA 2H9KA 1W08A 3J4GA 1LHMA 1NKHA 4IJ4A 5APEA 1LZ9A 1HERA 1B5WA 1B7PA 1XGRC 2H9JA 4R6CA 4N1EI 4MSTA 1B7RA 1V7SA 1GFUA 4WM1A 1YAPA 4Z3MA 1HNLA 1LYOA 1GBWA 5FHWA 3RW8A 1JKDA 1CKFA 2ZNWY 1FLWA 1UIBA 2ZQ3A 1JJ0A 1QSAA 3N9AA 1EL1A 4MR1A 2YBNA 1ZV5L 4ML7A 1OP9B 3TMVA 1LMNA 1IWVA 1LTMA 1OUGA 3AGHA 1D0MA 2F4AA 2BQKA 3AW6A 5HQ1A 4HJYA 4DDBA 6LYTA 1NF5A 4GCDA 4KL7A 1LZ1A 2DQJY 3A95A 4PPOA 3QE8A 4NWEA 5LVGA 2W1LA 1WQMA 4NHTA 5L3HA 1GF8A 4IASA 4XN6A 2Z12A 1OUFA 1LSEA 1YAMA 4WG7A 3W6FA 2BQFA 1LKRA 2IFFY 1GFRA 3WVYA 5B59A 1B7SA 3TXBA 1IR9A 1C46A 3QY4A 4ZEEA 5I54A 3EMSA 1AKIA 1LZAA 1BQLY 1QDTA 1YL0X 1BB7A 4G4CA 4QEQA 1WQPA 5ILFA 1GB9A 1DQJC 1GFEA 1JIYA 3AZ5A 1LZNA 1IORA 5LINA 4NG1A 1IWUA 1GBXA 4L41A 3RT5X 4HTNA 1QQYA 1GFTA 1JHLA 1LMOA 4B0DA 4LGKA 1LPIA 3AZ6A 1BVKC 1IIZA 1C10A 1GD6A 2G4QA 4XJDA 4I0CA 4J1BA 1GB3A 3WXTA 5LYMA 1IR7A 1LMCA 1JPOA 4HTQA 4BS7A 1ALCA 1DZBX 3W6BA 1GB7A 3T6UA 1GAZA 2BQJA 4UWUA 4ETAA 4NSGA 1IWYA 1GXXA 4WO9A 5LXWA 3IJVA 4G9SA 1GE4A 1LSBA 3LYZA 1LSDA 2GV0A 4WM6A 3ATOA 4AXTA 4DD2A 3A6CY 2YSSC 4H91A 4DC4A 1GB8A 2HTXA 1RE2A 4HPEA 1RCMA 1XGQC 2BQNA 2Z2FA 5KXSA 2BLXA 5F81A 4CHXA 1JEFA 4TX7A 3MGWA 4NG8A 1IOCA 1JSEA 1IC7Y 2HEDA 4BADA 4FJRA 1KXYA 1IO5A 1LOZA 1JTTL 134LA 1BWIA 4GCEA 5LVIA 1T3PA 1IP2A 1MELL 1YQVY 3M3UA 4RLMA 5FEKA 3WU8A 4QY9A 2Z2EA 5A3EA 3HBEX 1GDXA 1IP6A 1LYSA 3CQLA 1YKZX 3J6KA 3A91A 5EBHA 4DD0A 3A6BY 1VDTA 1GB2A 1YL1X 2RSCA 1LJEA 5KKIA 1LSYA 4NWHA 4XYYA 1G7MC 2FBDA 2DQIY 2MEEA 4RLNA 1GF0A 1UIGA 5DLAA 1IP5A 1WQRA 4NEBA 2DQFC 4NGIA 4CGEA 1B7NA 1HEWA 1YAQA 4H90A 2BPUA 4H9IA 1GF5A 3LZ2A 4WLXA 3LYMA 2N5ZA 3P4ZA 3ULRA 2D4KA 2ZWBA 1B7QA 3VWOA 1J1OY 1TDYA 1HMKA 2MEAA 1HEPA 4NGJA 2HEFA 4DT3A 1RJCB 1JSFA 1YIKA 2HEBA 2W1YA 3CSZA 5KXRA 2F30A 4WLTA 1XGPC 1AT6A 4YOPA 5KXPA 1BB4A 1GE0A 1P2CC 3A8ZA 5KXNA 1MLCE 1BB5A 5T3FA 154LA 4TWSA 1N4FA 2D91A 1GB5A 3IJUA 193LA 4NGLA 2MEGA 3G3BB 2X0AA 5LAFA 4H9CA 4MCKA 1HSXA 3D3DA 5KXWA 1O23A 2LYOA 2LHMA 4II8A 4B4EA 1IP1A 2ZYCA 1NDMC 1WTMA 3P65A 4LYMA 4DDCA 4H9AA 2MEFA 5IELA 5LA5A 1NDGC 1H6MA 135LA 1WQQA 1QDRA 8LYZA 3F6ZA 5E4PA 1A2YC 2D6BA 194LA 1DI5A 1JKCA 2HEAA 1OQMA 1REZA 5D5CA 4WL6A 1GPQC 5I53A 1LSZA 2G4PA 2WARA 3KAMA 4G49A 4J7VA 4LT1A 3CT5A 5IDDA 5IHGA 4QGZA 1IWTA 3G3AB 4NY5A 4H8ZA 1LMQA 3IWRA 4FDYA 1XGTC 1AT5A 2MEBA 1XFPL 2BQAA 1FKQA 1CKCA 1XEIA 4HV1A 1UCOA 2BQGA 1F6RA 4HJZA 4CFOA 4HTKA 4ZFPA 3FE0A 1CJ7A 1XEJA 1IWWA 1GE3A 5DN5A 5LVJA 1B5UA 3RZ4A 2XBRA 3TXGA 1LYZA 3B0OA 1Z55A 3HFMY 1LZ4A 4HPIA 4LT0A 4NHQA 5F9UA 1GFKA 2F4GA 1LJGA 4H9EA 4ET9A 5B06A 4NGWA 3WPLA 3LN2A 5FCPA 1REYA 1NWGA 1WQOA 3WXUA 4RDSA 1OUCA 4M4OA 3AGIA 1OUJA 1VDSA 1LJHA 2BQOA 1DI3A 2NWDX 3A93A 1CKGA 4NIJA 4OOTA 5FELA 5A3ZA 4TSCA 4WM2A 1OUIA 5I4WA 4HJVA 4DDAA 4DD9A 5M1YA 3TXDA 3A90A 2FBBA 2BLYA 2LZ2A 4LYBA 3TXEA 3WYHA 2HU3A 1EQ5A 1CJ9A 1D0KA 3EO5A 4WL7A 2CDSA 3W6DA 3WW5A 1IY3A 4B4IA 1BWHA 3A3QA 3LZTA 4XENA 1D6QA 4PGJB 4M6DA 1UIDA 5E9RA 4H94A 1T6VL 1GF3A 1WVUA 4X3BA 1LSNA 1RI8B 4DD3A 4EMNA 3GXRA 1FBIX 2BQCA 4LYZA 3M18B 1NBZC 2MEIA 4Z46A 1GEZA 1JJ3A 4N8ZA 1LSMA 1JUGA 1CJ6A 4XJFA 5J7CA 4PJ2C 1GFGA 4YF2A 1REXA 1IY4A 1HHLA 1UACY 1W6ZA 3A34A 5B07A 4Z41A 1E8LA 1FN5A 1OUHA 1UICA 4H92A 4NSIA 5F14A 3B0KA 1QTEA 2YBLA 2MECA 4LYOA 1XSFA 5II3A 3WVXA 1XEKA 1LSGA 2ZYPA 1LZGA 3B72A 4NGYA 4WOAA 5D5FA 4NSJA 4DWXA 1KIRC 1KXWA 4RW1A 1ZVYB 4LYTA 1B9OA 1HEOA 4RW2A 3AW7A 2DQAA 3GXKA 1CJ8A 1LJNA 1UC0A 3CT0A 5HLLA 1TAYA 5C6LA 1LZ8A 1D6PA 3A3RX 1BGIA 4UWVA 4EOFA 1TBYA 4OWAA 1NQIA 1QUSA 5FSTA 1QSWA 5KXZA 1EQ4A 4N5RA 3A92A 4XJHA 3ZVQA 3HBDA 2BQIA 1YKXX 1LZSA 2XJWA 1UIFA 1VEDA 1GEVA 2ZIJA 3A94A 2EQLA 5KXYA 3T36A 2A7DA 1HMLA 5KJ9A 1GFAA 2A7FA 4WLDA 5B1FA 3CSRA 4ETDA 1UUZC 1JKAA 1HC0A 1IR8A 3LHMA 1JISA 9LYZA 4NGKA 1GF9A 4OWHA 1YANA 1LHHA 2YBJA 3N9CA 4D9ZA 4WM3A 4U3XB 1INUA 5KXXA 1RFPA 3LYOA 4HSFA 2YBHA 4H1PA 1GFVA 1B2KA 4XADA 1OUEA 1IOTA 3CT1A 3WPJA 3EBAB 3TMWA 1GB0A 133LA 4LT3A 3SP3A 1LJ4A 4GCBA 3TMXA 1XGUC 5HNLA 3D9AC 4I8SA 1JWRA 3P64A 4NGOA 4LYCA 1B7LA 2Y8PA 1QIOA 1HELA 4H9FA 3TXFA 4B49A 4ZIXA 7LYZA 4XJGA 1F6SA 1GBZA 1JKBA 1FKVA 1OUDA 2BQMA 4G4HA 3N9EA 5LAGA 1FLUA 3WL2A 2VB1A 1HSWA 1IOQA 4NSHA 4LFXA 3TXKA 3WPKA 4OWCA 4LT2A 3AB6A 132LA 1GHLA 5KXMA 5I5QA 5KXTA 1LZBA 1LHJA 5LVHA 3LYTA 4GN4A 4GN5C 3TXHA 1DXJA 4WM4A 1CKDA 4W94A 1LZEA 1LHIA 1WQNA 1DKJA 1HF4A 1LZDA 3WUAA 3AYQA 4UWNA 1GE1A 1QTKA 1IWXA 2DQGY 3B6LA 2XTHA 5LYTA 1D0LA 1V7TA 1G7IC 1OUBA 4PHIA 4KPMA 4YENA 1F10A 4XJIA 4N9RA 5KXLA 1IX0A 1LZRA 1SLYA 2C8OA 4OWBA 4XJBA 2XBSA 2EKSC 1CNSA 2FYCA 3W3EA 2ZIKA 5LVKA 2AUBA 1DPXA 1UBZA 1C08C 2DQHY 3TMUA 3WH1A 2YDGA 1B7OA 4OWEA 1VDPA 2Z19A 4G4BA 2Z39A 1G7LC 1I56A 4NHSA 3AZ7A 1GFJA 1GDWA 1LZCA 4ET8A 2W1MA 153LA 1KIPC 1HEQA 4OOOA 4H9HA 4WM5A 5APDA 2YVBA 3AJNA 1BB6A 4TSBA 1KIQC 1SQ2L 2HECA 1JJ1A 1DI4A 2I6ZA 4J1AA 3CSQA 1LAAA 4N0JA 1LSCA 2BQHA 4NFVA 1VDQA 2D4JA 1YROA 5L9JA 4Z98A 1YAOA 2FYDA 1B0DA 1FLQA 1G7JC 4ETBA 4DD7A 4LFPA 5LIOA 1D9UA 4KXIA 2Q0MX 2HUBA 5DN4A 2D4IA 2ZNXY 1ZVHL 4P2EA 1TEWA 5B1GA 5HNCA 1IC4Y 1KXXA 1LJIA 2W1XA 4H8XA 4CFPA 5HMVA 4R0FA 1GBYA 1LSFA 5DL9A 6LYZA 3ATNA 1J1PY 1EQEA 5I4YA 2EPEA 3ZEKA 3P68A 4H8YA 1JTPL 4ETEA 2Z38A 5F9XA 1LMTA 1HEMA 1C43A 2YBMA 1REMA 4LZTA 4N1CC 1NBYC 1UIHA 4NGVA 1LZYA 1LSAA 1LCNA 1LJKA 4GN3A 3AZ4A 4A7DA 5APCA 5KXKA 3P66A 1LMAA 4AGAA 2Z37A 4ANRA 4WMGA 1LZ5A 1LYYA 2LYZA 2YBIA 3WUNA 4PRQA 2CWIA 2Z18A 2PC2A 1GF4A 4HV2A 1LSPA 1HFYA 4ETCA 4PRUA 5B05A 1LMPA 3A67Y 3AGGG 4O34A 2HEEA 4TUNA 5AMYA 2I26L 1B5XA 2LYMA 1IC5Y 3OK0A 1GWDA 1HFZA 4C5FA 2G4NA 1ZMYL 2F2NA 2C8PA 3HBHA 4DD1A 5C6JA 2DQDY 1IWZA 3TXIA 2H5ZA 1DPWA 1GF6A 1NHEA 1IP3A 4C3WA 1GBSA 4CJ2A 1AZFA 1GFHA 1LJFA 1UA6Y 1YKYX 1IP4A 1LKSA 1UIAA 4TTDA 1GBOA 3RNXA 2DKVA 1FLYA 4GCFA 5F16A 5C6IA 3QNGA 1I20A 5ILCA 3BKHA 5KY1A 1WTNA 1B5VA 1HFXA 2BQLA 3TXJA 3RU5A 3WW6A 2I25L 4YEOA 1LHLA 2LZTA 4BAFA 1IEEA 3EXDA 1IP7A 2BQEA 4NGZA 2BQBA 5HMJA 3OJPA 2MEDA 3E3DA 5I4XA 4GLVA 5APFA 5L3IA 3W6EA 1PZYA 1LZTA 2CGIA 2HU1A 1VFBC 5KXOA 3A96A 4J0LA 1LJ3A 1BWJA 1LZ6A 1B5ZA 1GE2A 1VATA 208LA 4NHPA 3WUMA 5JENB 1LJJA 4GLAA 3ZVQB 1CKHA 4DYGA 1A4VA 4WG1A 1BVXA 2BAAA 1WVVA 3WMKA 3BKVA 1FDLY 1H87A 1PS5A 3W6CA 1TCYA 3WULA 1JTOL 1IVMA 4YEMA 1AM7A 207LA 4WO6A 4H9BA 4WLYA 4YM8A 4QDNA 1GF7A 1DKKA 2CJLA 1G7HC 2MEHA 2ZQ4A 3CB7A 4GCCA 2DQCY 5DM9A 3FI7A 1GAYA 4B1AA 4IATA 4HP0A 2ZILA 1JITA 4H93A 2DQEY 1LHKA 3WU9A 5K7OA 3W6AA 3B0IA 1HENA 5FDJA 2B5ZA 1B5YA 1C45A 4E3UA 1I1ZA 1OUAA 1BHZA 4W96A 2EIZC 1GB6A 4KT3A 1YILA 1B7MA 5KKJA 3WU7A 1QUTA 2DBTA 1F0WA
chains in the Genus database with same CATH superfamily
1IOSA 2IHLA 1J1XY 1BB3A 1QTZA 1W08A 1LHMA 1HERA 1B7PA 2H9JA 1D2YA 2B6XA 247LA 3RW8A 1L79A 1FLWA 1UIBA 2ZQ3A 1EL1A 4MR1A 228LA 1OP9B 3AGHA 4I7TA 1D0MA 2F4AA 2BQKA 1CVKA 4KL7A 1L30A 1OUFA 1JTNA 1YAMA 2HUMA 2RAYX 4ZEEA 5I54A 1L89A 1LZAA 1BQLY 1QDTA 1T6HA 4QEQA 1DQJC 4I7NA 1JIYA 1L23A 5LINA 4ARJA 1GFTA 1L84A 1L96A 4B0DA 1LYFA 3WXTA 1LMCA 1L51A 1KY0A 188LA 1L34A 3W6BA 1GB7A 197LA 1L68A 1GXXA 4WO9A 4G9SA 1LWKA 3LYZA 3HTDA 1LSDA 2GV0A 3ATOA 4AXTA 1QTDA 3A6CY 4ARMB 1T8FA 112LA 1GB8A 2HTXA 1RE2A 1XGQC 2BLXA 4TX7A 3MGWA 4NG8A 1JSEA 1IC7Y 234LA 1L40A 1G0QA 1C62A 4BADA 1KXYA 4GCEA 1JTTL 1BWIA 5LVIA 4RLMA 1LYSA 4W52A 5EBHA 1L60A 2RSCA 3HU8A 2DQIY 1GF0A 1UIGA 1B7NA 3LZ2A 2N5ZA 3C7YA 1J1OY 2MEAA 1RJCB 2HEBA 2W1YA 3CSZA 1AT6A 3GUIA 5T3FA 162LA 1QS5A 4NGLA 2MEGA 3G3BB 1C69A 3HT9A 5KXWA 1L11A 1IP1A 1QSBA 1L98A 1H6MA 1WQQA 3F6ZA 4ARPA 194LA 1DI5A 1JKCA 1B6IA 5IHGA 4QGZA 2RBRA 4FDYA 1WTHA 175LA 1XFPL 2BQGA 1F6RA 4CFOA 259LA 1CJ7A 1XEJA 5DN5A 5LVJA 1L36A 3B0OA 3HFMY 5F9UA 1GFKA 3HH3A 4K5YA 4H9EA 3WPLA 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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 3K3T A;  1C7P A;  5LYZ A;  4OW1 A;  4NHI A;  1GXV 2;  5LA8 A;  1IOS A;  2IHL A;  4BAP A;  1J1X Y;  1BB3 A;  1UIE A;  2BQD A;  1VAU A;  4B4J A;  1NMM A;  2H9K A;  1W08 A;  3J4G A;  1LHM A;  1NKH A;  4IJ4 A;  5APE A;  1LZ9 A;  1HER A;  1B5W A;  1B7P A;  1XGR C;  2H9J A;  4R6C A;  4N1E I;  4MST A;  1B7R A;  1V7S A;  1GFU A;  4WM1 A;  1YAP A;  4Z3M A;  1HNL A;  1LYO A;  1GBW A;  5FHW A;  3RW8 A;  1JKD A;  1CKF A;  2ZNW Y;  1FLW A;  1UIB A;  2ZQ3 A;  1JJ0 A;  1QSA A;  3N9A A;  1EL1 A;  4MR1 A;  2YBN A;  1ZV5 L;  4ML7 A;  1OP9 B;  3TMV A;  1LMN A;  1IWV A;  1LTM A;  1OUG A;  3AGH A;  1D0M A;  2F4A A;  2BQK A;  3AW6 A;  5HQ1 A;  4HJY A;  4DDB A;  6LYT A;  1NF5 A;  4GCD A;  4KL7 A;  1LZ1 A;  2DQJ Y;  3A95 A;  4PPO A;  3QE8 A;  4NWE A;  5LVG A;  2W1L A;  1WQM A;  4NHT A;  5L3H A;  1GF8 A;  4IAS A;  4XN6 A;  2Z12 A;  1OUF A;  1LSE A;  1YAM A;  4WG7 A;  3W6F A;  2BQF A;  1LKR A;  2IFF Y;  1GFR A;  3WVY A;  5B59 A;  1B7S A;  3TXB A;  1IR9 A;  1C46 A;  3QY4 A;  4ZEE A;  5I54 A;  3EMS A;  1AKI A;  1LZA A; 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 1IWZ A;  3TXI A;  2H5Z A;  1DPW A;  1GF6 A;  1NHE A;  1IP3 A;  4C3W A;  1GBS A;  4CJ2 A;  1AZF A;  1GFH A;  1LJF A;  1UA6 Y;  1YKY X;  1IP4 A;  1LKS A;  1UIA A;  4TTD A;  1GBO A;  3RNX A;  2DKV A;  1FLY A;  4GCF A;  5F16 A;  5C6I A;  3QNG A;  1I20 A;  5ILC A;  3BKH A;  5KY1 A;  1WTN A;  1B5V A;  1HFX A;  2BQL A;  3TXJ A;  3RU5 A;  3WW6 A;  2I25 L;  4YEO A;  1LHL A;  2LZT A;  4BAF A;  1IEE A;  3EXD A;  1IP7 A;  2BQE A;  4NGZ A;  2BQB A;  5HMJ A;  3OJP A;  2MED A;  3E3D A;  5I4X A;  4GLV A;  5APF A;  5L3I A;  3W6E A;  1PZY A;  1LZT A;  2CGI A;  2HU1 A;  1VFB C;  5KXO A;  3A96 A;  4J0L A;  1LJ3 A;  1BWJ A;  1LZ6 A;  1B5Z A;  1GE2 A;  1VAT A;  208L A;  4NHP A;  3WUM A;  5JEN B;  1LJJ A;  4GLA A;  3ZVQ B;  1CKH A;  4DYG A;  1A4V A;  4WG1 A;  1BVX A;  2BAA A;  1WVV A;  3WMK A;  3BKV A;  1FDL Y;  1H87 A;  1PS5 A;  3W6C A;  1TCY A;  3WUL A;  1JTO L;  1IVM A;  4YEM A;  1AM7 A;  207L A;  4WO6 A;  4H9B A;  4WLY A;  4YM8 A;  4QDN A;  1GF7 A;  1DKK A;  2CJL A;  1G7H C;  2MEH A;  2ZQ4 A;  3CB7 A;  4GCC A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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#chains in the Genus database with same CATH homology
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