1TE1A

Crystal structure of family 11 xylanase in complex with inhibitor (xip-i)
Total Genus 92
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
92
sequence length
274
structure length
274
Chain Sequence
AGGKTGQVTVFWGRNKAEGSLREACDSGMYTMVTMSFLDVFGANGKYHLDLSGHDLSSVGADIKHCQSKGVPVSLSIGGYGTGYSLPSNRSALDLFDHLWNSYFGGSKPSVPRPFGDAWLDGVDLFLEHGTPADRYDVLALELAKHNIRGGPGKPLHLTATVRCGYPPAAHVGRALATGIFERVHVRTYESDKWCNQNLGWEGSWDKWTAAYPATRFYVGLTADDKSHQWVHPKNVYYGVAPVAQKKDNYGGIMLWDRYFDKQTNYSSLIKYYA
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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molecule tags Hydrolase inhibitor/hydrolase
source organism Penicillium funiculosum
publication title The Dual Nature of the Wheat Xylanase Protein Inhibitor XIP-I: STRUCTURAL BASIS FOR THE INHIBITION OF FAMILY 10 AND FAMILY 11 XYLANASES.
pubmed doi rcsb
molecule keywords xylanase inhibitor protein I
total genus 92
structure length 274
sequence length 274
ec nomenclature
pdb deposition date 2004-05-24

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00704 Glyco_hydro_18 Glycosyl hydrolases family 18
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.20.20.80 Alpha Beta Alpha-Beta Barrel TIM Barrel Glycosidases 1te1A00
4D6GA 4IPLA 3CIVA 1V6YA 3BGAA 4EKJA 4F9DA 3QHMA 3ZIZA 4DWSD 4KGJA 2YL5A 4AD2A 2BY2A 3AS1A 3AHYA 1JAEA 4GZIA 4JFUA 1VFMA 3SCUA 4BQ5A 4JKLA 1M53A 1E6PA 4AEFA 2EPLX 2VO5A 3WQ5A 1R7AA 3NSXA 3VM7A 3SIMA 1QHZA 3NDZA 3RO8A 5HOSA 1AVAA 5FD0A 2VZTA 1GPFA 3SCWA 5DEZA 1AQMA 1JI1A 4EK7A 4AZ5A 2WMHA 1JZ6A 1H5VA 2J75A 4AISA 1TE1A 3WSUA 1E0VA 1W1TA 1XSJA 4NRRA 4WF7A 3BAIA 1LL6A 1TR1A 2FDMA 3TTSA 5GNYA 1JNDA 3AISA 3VUPA 3VDCA 3UERA 1WNOA 2W5FA 3AXXA 4UQDA 4CD4A 4TXEA 4ATDA 1FA2A 4UQAA 3L4ZA 3ALGA 1HKKA 3QGVA 5BCAA 2CEQA 4W8BA 1CDGA 1LJYA 4P7NA 5HPCA 1UZ1A 5GNZA 1UR8A 3AI0A 1ZBVA 4Z2KA 4MB3A 4UOQA 5I3DA 1QOXA 5A95A 1EHAA 3RIKA 1W9BM 4X0VA 2OYKA 3RPMA 5M3WA 2W91A 4XX6A 3NIYA 1ITXA 2J7BA 4DWSA 5A8OA 5C70A 2JIWA 4ZENA 1TFVA 2E8ZA 4RE4A 4B9YA 5GNXA 3WNPA 3DC0A 3MV01 1HP4A 1EXPA 3BLKA 3SCOA 1KQZA 3T0BA 3PZMA 2VURA 1W1PA 5IFTA 1EQPA 1LLOA 1VJSA 2C8NA 4PMYA 4CD6A 2FH6A 5LA1A 1UKPA 2PBGA 3MMUA 2D24A 3HN3A 1HJUA 3PTKA 4X9YA 4LQ1A 1P6WA 4CKQA 1UG6A 1CXEA 3EDJA 3ZSSA 5FL0A 3AMCA 3W6MA 4PMUA 1QBBA 3OGSA 2F8QA 1FHLA 3B9EA 1J0KA 1CGYA 1PEZA 2JIEA 4QAWA 4U33A 1E70M 3OLDA 1QVBA 1MQQA 1HJSA 1QBAA 1W1VA 2J79A 3VD7A 1CGWA 3SCTA 5JBFA 2WC3A 5A6LA 3RM9A 4LYPA 3EMQA 1PX8A 2J8FA 4H7VA 1PZ2A 4ZXOA 4J3WA 2O9TA 1XYZA 4GO8A 4GZJA 3N13A 5JIWA 1J0HA 1UH3A 3DYPA 2GFTA 3ZR6A 4D1IA 1X6LA 1TVNA 3DYMA 1XYFA 4J3XA 2PB1A 2WM0A 1SFSA 3QHNA 2D20A 3S6TA 3WEZA 1FH8A 5A8PA 1GUVA 2G4FA 9CGTA 4HZ6A 4OOUA 1MW0A 3VGBA 1BAGA 1BG9A 2CBIA 2J74A 3T09A 4KRUA 3OIHA 1RPKA 1MQRA 2VCCA 1H2JA 1NOUA 3AZRA 1UR0A 3RM4A 4NSBA 4XZBA 1VFOA 3NJ3A 3L4TA 4M1RA 4CN6A 1KFWA 2YLAA 3CHDA 3PZOA 3BAJA 4JAWA 2A3CA 4D6DA 2WZHA 2X05A 4DUVA 1XCXA 1L0PA 2AAAA 1RP8A 4M29A 2VVNA 2PI6A 1B0IA 3TONA 3VGGA 3PN8A 3EMZA 3OB8A 1TA3B 3OZOA 4HPHA 5FOOA 3L2LA 1E73M 1HKJA 2DGAA 2BV9A 3S2CA 3KWXA 3WDIA 4BQ3A 1FP8A 1WPCA 3ZT7A 3F5KA 4W5UA 1BGGA 1VFFA 2DT2A 3GDBA 4Z2HA 1BYCA 1EDGA 3ECQA 4ACYA 4BCEA 1SR0A 3FN9A 4AD5A 3BAWA 1GZJA 4AYSA 3W6LA 1EH9A 1PZ3A 1E6NA 2XVLA 4JCLA 1JXJA 1ZBWA 4HZ7A 1HJWA 3K8MA 1RH9A 3IJ8A 1XH2A 1LG2A 2YL6A 1OT2A 3WUBA 2VT0A 2Y2WA 4M82A 1WKYA 2ZUWA 1OSEA 1ESWA 4MTVA 3WQWA 5A6MA 1JF5A 2XG9A 4OBSA 4TX8A 3VDAA 5CSYA 1QHPA 1WDPA 3VVGA 1AQHA 1J0YA 4MDPA 2VJXA 2JEPA 2W62A 2C0HA 4CU6A 1Y7VA 4WKHA 5A3HA 4AW7A 4NF7A 2X09A 5ABHA 2Q8XA 4AD1A 1UKQA 3WNKA 5BRPA 1GNXA 4JL2A 1K9EA 5KZ6A 1LWJA 3ARZA 5D9NA 2QF8A 3WMSA 3PZNA 4CCEA 3WF4A 4AD4A 2X0YA 4W5ZA 2J7CA 4OUEA 1KXVA 5CQ1A 4AD0A 2Z1SA 2Y24A 3BMVA 1FH9A 1JZ4A 3ZJKA 1ISZA 4U5KA 3VGHA 1UR2A 3WL1A 2W66A 3NCOA 4HTYA 1UWSA 1MVYA 3RDKA 1M03A 1XV8A 4CU8A 1ZB5A 2GJXA 2PBOA 2ZWYA 1XD0A 4FK9A 2Y5EA 3CLWA 2WCSA 3O6AA 1WDQA 3WF1A 1XGZA 4V2XA 3T2QA 1CXLA 3AS0A 3ARXA 1GOMA 3UEQA 5FIPA 4ACZB 3RM8A 5DF0A 2O9PA 4P7LA 2DQXA 1QI0A 2WWDA 3ZM8A 4A3HA 2VQTA 2ZX8A 4BZYA 2WAGA 3GH7A 1UKSA 2YDQA 2J78A 3N9KA 1EOMA 3OLIA 4UZSA 3OLEA 4JIEA 2Y8KA 1CTNA 3DYOA 4N42A 4PRWA 2RGMA 4H2CA 3CPUA 4JHOA 1HVXA 4ZE5A 1DEDA 3GNRA 1WP6A 4GXPA 2J7FA 2GJRA 3WELA 1CGTA 2WW5A 1CGVA 2WVVA 1UD5A 3EDEA 1CYGA 3M46A 5C8BB 3VILA 3W29A 4ZXLA 2OWWA 2WPGA 2YKKA 3L4UA 4AMCA 3NUKA 3UESA 3BAKA 2VCAA 2JALA 3GXIA 6TAAA 3WQ6A 1UWIA 4XV0A 4CD8A 3GH5A 4F66A 5GPRA 5I5RA 5BYWA 3FXYA 4N0RA 1JFXA 1MW1A 4MAVA 3CBWA 3AMGA 1Q6DA 5BXSA 5KEZA 1KGWA 2E4TA 3PZVA 4XZWA 3JUGA 1W32A 4R5EA 4EE9A 1X6NA 4FLSA 5LA2A 3WBAA 1C90A 1I1WA 1BQCA 2CHNA 2W61A 2V5DA 3A4XA 1JF6A 2V3DA 1W9VA 3MKKA 3FAWA 4PCTA 1D3CA 3NSMA 5A6SA 2GDUA 4JFWA 1BG4A 3KL0A 4JFVA 1UWRA 1DWFM 2YA2A 2QPUA 1AMYA 3CHEA 1DWJM 2G3JA 4QFUA 4HOXA 2VR5A 2VQUA 1D7FA 2GVYA 4CD5A 1VENA 4C7GA 1CEOA 3W37A 3AROA 2WZIA 4FLQA 3BCDA 1V6VA 3MUY1 1XD1A 3UG4A 3WQ8A 1XH1A 2OLHA 3SCNA 4MJ2A 4PSRA 1WAWA 3ZT6A 2CNCA 4W8LA 3VX0A 1GOOA 1M01A 4W89A 1WZKA 1TUXA 2OSYA 3AHTA 4UQEA 3VNZA 1US3A 2GSJA 1V02E 3GZAA 4CCCA 2O9RA 2WNWA 3BSGA 3ARRA 4TTGA 4WJXA 3PZ9A 1W3HA 1JL8A 4GIAA 3U5YA 2CKRA 2BVYA 3TOPA 5CJ5A 1C8XA 1BYBA 2X1IA 2WMIB 4TVDA 5CPSA 2E9LA 2BHUA 1XC6A 1ITCA 4RE2A 2A3EA 5HPOA 4UQCA 1GCYA 3VMNA 3B8SA 2DH2A 4KH2A 4PMDA 2ZX9A 4AIUA 3WH5A 1E0XA 2XFRA 4LGXA 1HL9A 3FHAA 4M8UA 4ZFMA 1VEOA 4PTVA 3NDYA 1UWQA 1BGAA 4CVWA 1SYTA 1B3XA 2UY3A 4KWUA 2VOTA 5D9PA 2EXOA 1UYQA 3WF3A 2HISA 4D6FA 1DWAM 1PPIA 2IXUA 1X1NA 3BAXA 4MNJA 3K8KA 2V3EA 1LL7A 1NH6A 2ZE0A 1V3KA 4Z2GA 5CGTA 5IFPA 3AIWA 2VRQA 2ZUVA 3EMCA 1J0ZA 4JFSA 3A3HA 4U3CA 5I0DA 3BC9A 3K1DA 4P8XA 4JKKA 4W84A 2IUZA 3AQUA 3MUZ1 1EOKA 5IHSA 3WEOA 1JXKA 3M6DA 3WDPP 1J01A 4J3UA 1R85A 2WMGA 1ZS2A 2QLYA 3GXMA 4H8HA 2D22A 5I79A 3THCA 1F4HA 3BH4A 4F8XA 4LPCA 5I78A 1E5NA 2BHZA 1UR4A 3VIFA 1TVPA 1OIMA 4DM1A 2CHOA 3VU2A 2PC8A 3N04A 1C3FA 2WKGA 5I77A 5M5DA 1Z32X 2ZOXA 4W7WA 2ZXBA 1G9HA 2E9BA 5A2AA 4MB5A 3U7VA 4A3YA 4W93A 1D2KA 4IPNB 1HJXA 2XM2A 4UQ9A 4OZOA 5M03A 4MB4A 3QOKA 3GM8A 2G3MA 3T0AA 2FHBA 2VRKA 3DECA 4PTXA 5CGMA 3ZMRA 5I24A 1UWTA 3K8LA 1UKTA 1UA3A 4P8VA 1HL8A 2GK1B 1W9XA 1B3ZA 4Q7NA 3SUUA 1CBGA 5IDIA 3THDA 3IJ7A 4U3AA 4AZBA 3A47A 3J7HA 3N12A 5BWFA 1NWRA 4PBGA 4CN1A 2BVDA 2NT1A 3CMJA 4AEEA 4UR9A 1ZL1A 3N15A 1E0WA 4HA3A 3EBVA 3WDRA 1GOWA 3ARSA 4NRSA 3AYSA 5EFDA 3PTMA 3W25A 4AZIA 5E70A 1GQIA 3GBEA 3PZGA 3VX1A 3VO0A 1KCLA 1HJVA 1GVYA 1UZ4A 3MSGA 3ZR5A 3SUWA 4FLRA 3MANA 1UH2A 3L4WA 4TOQA 2ZWZA 2C7FA 2WC7A 1XRVA 3W26A 5BRQA 1K9DA 2XVPA 1GONA 3WDQA 3AIRA 1NWUA 4MNLA 4W7UA 2WK2A 1GVIA 2OSXA 2NSXA 3D5HA 4W8AA 1KB3A 3SURA 2ZXQA 2DSZA 3RCNA 2O92A 2D23A 3VGEA 1KGUA 3AIUA 2VR4A 1S46A 1W1YA 4IM4A 3VD3A 3CUIA 3ARPA 3FNDA 4OBRA 1LF1A 5FL1A 2ZUMA 5I23A 1W3LA 3CUHA 3EDKA 3TP4A 2WHMA 4S3JA 3LPPA 2VUYA 1UH4A 3OA5A 5I6SA 2ZIDA 1Q4NX 1R8LA 2WYSA 4MDOA 1DHKA 3W53A 3MMWA 5CLWA 2XIBA 1DP0A 2DSWA 3WF2A 1MXGA 1TG7A 3AFBA 2EJ1A 5E6ZA 3BMWA 1VBRA 3PZIA 4B15A 2WMKA 2D2OA 2XWDA 1VJZA 1DWHM 4HA1A 4U5IA 1XCWA 4H8VA 1R87A 5F7UA 4QLKA 1VF8A 4E8CA 1H49A 2W67A 4FLOA 3HJEA 2HVMA 1GJWA 3W38A 4AIEA 3W27A 4W86A 3K46A 3VD5A 2XJ7A 1OGGA 4PMXA 1CXKA 6CGTA 1W9PA 3VDHA 5CLTA 2E9MA 1JDCA 2XHYA 3T08A 2J7GA 1PX4A 4LX4A 3CGTA 2DSKA 3HMCA 1SMDA 1UOKA 2PWGA 1KR1A 2BS9A 5CXPA 3G6MA 2O9OA 2WVTA 3O2LA 1BYDA 2XYLA 1QI4A 2VTFA 1QNRA 1TCMA 6A3HA 1EO7A 2GUYA 2GK1A 1CLXA 2YDRA 4M24A 3SUSA 3DHUA 5A1AA 1E6QM 3WQ4A 3AIVA 1GOKA 1I1XA 1V0LA 1UR1A 2WVUA 1G01A 4L4PA 1NP2A 1JIBA 3VIJA 3ZJ6A 4C7DA 1V3MA 5AY7A 2UY4A 5AYIA 1C7TA 3BCFA 1MFVA 2WSKA 2WWCA 4MADA 2VX4A 3FW6A 3AHXA 3WD2A 2ZXDA 1DWIM 4AZ6A 4CGTA 2E3ZA 1NWTA 2XUCA 3BAYA 3HU7A 3G6LA 5M17A 1JNEA 2WMFA 1GHSA 3MU7A 5D8WA 3N11A 4LYRA 3CUJA 4D72A 4HPGA 5A8NA 1BYAA 2VC9A 4UZUA 3VIMA 1KGXA 5D9OA 4CU7A 1H1NA 3BXWA 5A8MA 4J3TA 3VIIA 2D0FA 1CXIA 5A8QA 4KRTA 5A6KA 4CN4A 2CKSA 1U2YA 4UNIA 1HKIA 3VD9A 1M7XA 1XSIA 4D6JA 2VL4A 4J28A 1JYWA 4H04A 1V3JA 2X2YA 1KBBA 3VKKA 2QPSA 1QI2A 4GPNA 4U2ZA 2WCAA 2XGIA 5I2UA 1E72M 4Z2JA 1W9DM 4WSJA 5BXTA 3WNOA 3WDHA 2DT3A 2WBGA 3POHA 1TZ7A 2V5CA 2ZX6A 3UCQA 1C93A 4DUXA 2VZOA 1K9TA 1E1EA 2EEXA 1V3IA 3UETA 1E4MM 3IJ9A 5A6BD 5GQBA 2PF0A 2CITA 5ABFB 1H09A 1ISYA 3PBGA 4DWSC 4UFMA 5A6JA 4D6CA 3K4DA 2PWEA 1GHRA 2CBVA 3F5JA 2CYGA 4H8UA 2YJQA 4PSPA 5JBDA 1JI2A 2OSWA 1WO2A 1HIZA 3AXHA 3VGFA 3WNLA 1G94A 1B3YA 3F4VA 1W91A 2AOSA 1KXQA 1QW8A 4Z2LA 4HOZA 1TA3A 1V02A 2B31A 1B30A 2CERA 4JL1A 1EIBA 3WDJA 4J27A 1E6ZA 2V3FA 4M80A 5BXPA 1WZLA 3AJ7A 5BXRA 1KCKA 3OGRA 5JIPA 2F2HA 4UFLA 2WBKA 2J47A 1Q6CA 2AMGA 3BLPX 3OZPA 4AZGA 3WNMA 3AHZA 1R86A 3NSNA 3W4RA 1VIWA 1JGIA 2CIPA 2J7DA 4B16A 1FP9A 1W2PA 3SCRA 7A3HA 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chains in the Genus database with same CATH topology
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chains in the Genus database with same CATH homology

  
#chains in the Genus database with same CATH superfamily
 4D6G A;  4IPL A;  3CIV A;  1V6Y A;  3BGA A;  4EKJ A;  4F9D A;  3QHM A;  3ZIZ A;  4DWS D;  4KGJ A;  2YL5 A;  4AD2 A;  2BY2 A;  3AS1 A;  3AHY A;  1JAE A;  4GZI A;  4JFU A;  1VFM A;  3SCU A;  4BQ5 A;  4JKL A;  1M53 A;  1E6P A;  4AEF A;  2EPL X;  2VO5 A;  3WQ5 A;  1R7A A;  3NSX A;  3VM7 A;  3SIM A;  1QHZ A;  3NDZ A;  3RO8 A;  5HOS A;  1AVA A;  5FD0 A;  2VZT A;  1GPF A;  3SCW A;  5DEZ A;  1AQM A;  1JI1 A;  4EK7 A;  4AZ5 A;  2WMH A;  1JZ6 A;  1H5V A;  2J75 A;  4AIS A;  1TE1 A;  3WSU A;  1E0V A;  1W1T A;  1XSJ A;  4NRR A;  4WF7 A;  3BAI A;  1LL6 A;  1TR1 A;  2FDM A;  3TTS A;  5GNY A;  1JND A;  3AIS A;  3VUP A;  3VDC A;  3UER A;  1WNO A;  2W5F A;  3AXX A;  4UQD A;  4CD4 A;  4TXE A;  4ATD A;  1FA2 A;  4UQA A;  3L4Z A;  3ALG A;  1HKK A;  3QGV A;  5BCA A;  2CEQ A;  4W8B A;  1CDG A;  1LJY A;  4P7N A;  5HPC A;  1UZ1 A;  5GNZ A;  1UR8 A;  3AI0 A;  1ZBV A;  4Z2K A;  4MB3 A;  4UOQ A;  5I3D A;  1QOX A;  5A95 A;  1EHA A;  3RIK A;  1W9B M;  4X0V A;  2OYK A;  3RPM A;  5M3W A;  2W91 A;  4XX6 A;  3NIY A;  1ITX A; 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#chains in the Genus database with same CATH topology
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