1THXA

Thioredoxin-2
Total Genus 31
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The genus trace: a function that shows values of genus (vertical axis) for subchains spanned between the first residue, and all other residues (shown on horizontal axis). The number of the latter residue and the genus of a given subchain are shown interactively.

Total Genus
31
sequence length
108
structure length
108
Chain Sequence
SKGVITITDAEFESEVLKAEQPVLVYFWASWCGPCQLMSPLINLAANTYSDRLKVVKLEIDPNPTTVKKYKVEGVPALRLVKGEQILDSTEGVISKDKLLSFLDTHLN
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The genus matrix. At position (x,y) a genus value for a subchain spanned between x’th and y’th residue is shown. Values of the genus are represented by color, according to the scale given on the right.

Structure visualization

After clicking on a point (x,y) in the genus matrix above, a subchain from x to y is shown in color.


  Genus data interpretation
Chord Diagram
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publication title Crystal structure of thioredoxin-2 from Anabaena.
pubmed doi rcsb
molecule keywords THIOREDOXIN
source organism Nostoc sp.
molecule tags Electron transport
total genus 31
structure length 108
sequence length 108
ec nomenclature
pdb deposition date 1995-07-07

pfam database annotations

chain Pfam Accession Code Pfam Family Identifier Pfam Description
A PF00085 Thioredoxin Thioredoxin
Image from the rcsb pdb (www.rcsb.org)
cath code
ClassArchitectureTopologyHomologyDomain
3.40.30.10 Alpha Beta 3-Layer(aba) Sandwich Glutaredoxin Glutaredoxin 1thxA00
5FT3A 2GQKA 1V9WA 3BOAA 5L71A 1M99A 4EO3A 3GV1A 4TKYA 5HR2A 5E59A 1DE1A 2JU5A 3P90A 1AUCA 2I9HA 1ST9A 2O85A 3KMNA 5KN3A 1FO5A 2C8UA 1SJIA 5DJMA 4IP1A 2V6KA 2PBJA 4N0ZA 1TRVA 3I9V2 4JR6A 4PQHA 4OFTA 1ERWA 4IKHA 3V1WA 2H0HA 2RM6A 2FWHA 3LXTA 5ECOB 1ZZYA 4OWYA 2VM1A 4KE3A 1WIKA 1Y6EA 1ZOFA 1BEDA 1WPIA 3HA9A 1G0TA 4BWQA 2YOIA 2A2SA 3M1GA 2KHPA 1W89A 1ZYQB 2R6KA 3MWHA 3ZFLA 4F03A 4F0BA 3F4RA 2P5QA 4N11A 4YQUA 1FB0A 4IHUA 3KM6A 2H1GA 1DE2A 4LA1A 4TR0A 4ID0A 1XWAA 1TRSA 1K0BA 3A2XA 4GLTA 1SK0A 18GSA 2VM2A 2EC4A 4V1Ag 1PL2A 2WB9A 3HKRA 1XVQA 2HI7A 1A0RP 3GNJA 5D9TA 2DMMA 1K0OA 3HJPA 3HVVA 3HJOA 1FVKA 5JWQB 3QFAC 3ZIJA 1PKZA 1G7OA 4BL7A 3TKRA 4POLA 4ZBAA 4IQAA 4WBRD 2OE3A 3RHCA 3C73A 1R4WA 4EKZA 2H70A 1EOGA 1HNBA 2LJAA 4TR3A 4WBJA 4PURA 4RI7A 5AN1A 3BCKA 1EOHA 4Q5QA 3GKXA 3G7YA 2WCIA 3GHAA 4MZWA 2E2MA 1YZXA 1BYEA 2I4AA 1GNEA 2DJ0A 2VCZA 2CAQA 1PSQA 1X5EA 3KMOA 3E9JB 4EUYA 4NHWA 2C4JA 1EP7A 2RUEA 4O92A 1IYIA 2H0IA 2DIZA 22GSA 1HYUA 1M9AA 1JZOA 1EV9A 3LXZA 2WJUA 3EMXA 5GZZB 1M0UA 1M2DA 2OBIA 4WETA 1BAYA 1JLWA 2L4QA 5IMAA 1GH2A 4FH8A 4ZB9A 3N5OA 2IMKA 3W8SA 2DSAA 2HYXA 1XWBA 1X9WB 3O3TA 4MJEA 1A2MA 1GSDA 2AUVA 4MJBA 2WULA 1SU9A 4I8BA 1Z7RA 1ZCPA 3FRCA 1GLQA 4ZILA 1A8YA 4YH2A 2VLTA 3QAWA 4L5OA 3IK7A 2YJ7A 1TK5B 1FVJA 5ECMB 1UA5A 3FW2A 4WR4A 2MBSA 4K9ZA 2AV4A 4JEDA 4N10A 1H75A 5F05A 3BBYA 1Q98A 1EEJA 2VCTA 4PGTA 3C71A 4F9ZA 1ZYEA 2YWNA 2HZFA 1GTIA 2FA8A 3HZ4A 4D73A 5DAKA 2IMDA 3QOUA 2ON5A 1SYXA 2GQMA 2YN1A 2BMXA 2VOCA 2VL9A 1XW6A 3KTBA 2YV7A 2B5YA 2LTKA 4HJ2A 4CDOA 2YZHA 17GSA 4WEYA 4POBA 5LCZA 2QKEA 3CBUA 6GSYA 2H74A 3VK9A 2IMFA 1XWGA 2FD3A 1F2EA 1F3BA 3I6AA 2DMLA 3CXGA 3KZQA 2PERA 5D93A 1M2AA 3GFKA 1GUKA 3UMAA 5INYA 1G6YA 2NTOA 3E3EA 5CREA 2FLSA 2O87A 3ZREA 3VI5A 3C1RA 5CYYA 1B4QA 2DLXA 4GTUA 3S9FA 1UVZA 3KD0A 1PN9A 3LSZA 3FHKA 3HVSA 4ILFA 1FW1A 1C72A 2XBIA 2CVBA 3IAM2 5KEJA 4ACSA 2FHEA 2B5XA 1K3YA 4OD7A 3EE2A 2HNLA 4ECCA 2DIYA 2X8HA 4OCEA 3L4NA 2H6XA 2CX4A 4KX4A 2O7KA 3M9JA 2H8LA 4V2NA 2K8SA 1EGOA 4BA7A 2M80A 4HU9A 1A2JA 3H4KA 4G10A 2PUKC 6GSUA 5IPGA 4NPBA 1X5DA 5J9BA 4Q5FA 2PN8A 4YAPA 2H75A 3SBCA 1GRXA 4JR4A 2BTOT 2V32A 1X0RA 2MMZA 3LG6A 1ILOA 3VWVA 2BJXA 4GXZA 2X64A 4MABA 2K9FA 4OCFA 2DC5A 1VF4A 2YCDA 3F3QA 5ELGA 1TP9A 5D73A 1MDKA 1R5AA 3KIJA 1B48A 5CP1A 1F3AA 1SKRB 3HXSA 3Q19A 2MBTA 3D6IA 5HQPA 5CRHA 3GRXA 2R2JA 1WE0A 3ZL5A 3KP9A 3F6FA 5F8BA 3IE3A 3EVIA 3CYNA 1EP8A 5IOXA 1N2AA 1FB6A 2DJ1A 1VF1A 2DJ2A 3F4TA 1OE7A 4JZQA 3LEFA 3TOTA 3GX8A 4IELA 3HHVA 3UOMA 4MJAA 4LLRA 1HQOA 2YWOA 4KCEA 1N8JA 2GDRA 3ZMKA 2ALBA 4KH7A 4RUVA 1Z9HA 5IQYA 3QDNA 4HI7A 2R37A 1O6JA 2LJRA 2LS5A 2VD1A 4K7OA 3WYWA 4KA0A 4H86A 5ECNB 1XW9A 1XWKA 4CHSA 1CQGA 3DGQA 4TRXA 3GUSA 2OA7A 4HZ2A 5JWOB 4ISDA 3IDVA 2C0DA 5ID2B 1EEMA 2GSSA 3FZAA 4G19A 2KUCA 2TIRA 3ERWA 2H71A 4Q5NA 2K18A 1TJDA 3KEBA 4XTSA 4O5RA 4EE0A 1X9SB 1Z6MA 1SKWB 5D96A 2HZEB 2WDUA 3QFBC 4JBBA 2YWIA 3CRTA 3CSIA 4KDUA 4WKWA 4GCIA 2R5GA 2FNOA 2IN3A 3GN3A 1FAAA 1SJZA 4ECBA 5EVOA 3GTUB 3ZVJA 2G0FA 2QC7A 3UARA 2F9SA 1NHYA 1RK4A 1YJ6A 5IO0A 3PINA 4IBPA 4FIWA 3F6DA 3IV4A 4XRDA 3TJJA 2B1LA 2RUFA 2AJQB 1TTZA 3KH7A 19GSA 2FWEA 1OKTA 2FGXA 4WXTA 4FYUA 4KNDA 3IK9A 2FWGA 3LGCA 1NHOA 2L57A 2V2GA 3TKSE 4LL4B 3WT1A 2LSTA 5ECRB 2DBCA 1EGRA 2GTUA 4I5QA 1HNCA 3FR6A 3GKNA 5HFKA 1VF3A 2ZCTA 3DIEA 4IJIA 3HDCA 4L5LA 2IMIA 4XS4B 1XVWA 2VAFA 1UC7A 3NIVA 4NWYA 1GSYA 3Q6OA 4MZCA 3US3A 2F8FA 2I81A 1CQHA 4F0CA 4I6XA 1GLPA 3C7MA 3UIWA 2VO4A 5H5RA 5IO2A 1OVNA 2GSQA 1T4YA 3ZIVA 4EVMA 1V40A 4IP6A 3WGDA 4HZ4A 3UJ1A 5J41A 4IJ3A 6GSSA 4ML6A 1ERUA 3CTFA 1JZWA 3F4SA 3UVHA 4NV5A 1DSBA 5G31A 1JZRA 4K0GA 2C1YA 1NSWA 4TOPA 2WRTA 2H1AA 4TN8A 1V57A 3NOFA 5DCHA 5J5NA 5A4UA 3TDGA 5JCUA 1A2LA 2IFQB 5CRDA 3DRNA 1QXHA 2L59A 5IIZA 1FHEA 3GKMA 2ZNMA 4DSRA 3EINA 4MPGA 1V2AA 5JWRB 4AF2A 3TKQA 1SK1A 2CVDA 3GKKA 3CSHA 5IOWA 3E0UA 3GYKA 5DALA 1AAZA 2PU9C 3L78A 3WT2A 1R7HA 2FY6A 2H19A 3ERFA 2DJ3A 2OJLA 2WZ9A 1GTBA 1PA3A 3VLNA 1RW1A 4MDCA 1AXDA 3TJKA 4K0NA 4HQSA 3KCMA 2MMNA 1BQ7A 3RDWA 3L9VA 2HRFA 2JSYA 1YF0A 1XPVA 5H5QA 2FA4A 2GS3A 3VURA 4OO5A 1GP1A 1K0AA 3F8UA 3QPMA 4MZBA 1SKSB 3GX0A 1PQNA 3D0ZA 4MPFA 4OO4A 5DCGA 1AQWA 1ZL9A 1YF1A 2GT5A 2PVOC 3H79A 1E6BA 2IWTA 2L5LA 5CRWA 1VGLA 1ZGNA 3EYTA 4TR1B 4IVFA 2YJHA 2H73A 1M2BA 5ECLB 2YNXA 2GZYA 2P31A 1DBYA 2HRNA 4GWRA 5CAXA 4TW5A 4F82A 2GQLA 2V1MA 4MMMA 2B5EA 3W6GA 3QCPA 5DDLA 2IPAA 5KN1A 2V6OA 3IOSA 4KDXA 1M7TA 3FR3A 5ECPB 2H0GA 1PRXA 2VLVA 4HU7A 5G1KA 2H76A 1GTAA 3EC3A 1YKCA 5IMFA 3SWLA 4RI6A 4DEJA 4KGIA 5B6NA 3IR4A 5GAPD 5CRGA 2ES7A 3I69A 4DVCA 4QQ7A 4MF7A 4HS1A 4GQFA 5CO3A 2M72A 4OMVA 1J08A 1HNAA 2LNTA 5ENUA 2J23A 3ZYWA 1U3IA 3TJGA 1U87A 3MAKA 3K8NA 1AQXA 2LQOA 2WGRA 1PX6A 2H1BA 4TVEA 1S3DA 1R5PA 3OR5A 2GLRA 5J4UA 1USBA 2C0EA 4MK3A 3A3TA 3PH9A 2L6CA 3RPPA 4IN0A 1B8XA 1YKAA 3CMIA 1I9DA 1S3CA 4HQZA 3LFLA 3H1NA 3F3RA 1SD8A 1KEBA 2C3NA 3FKFA 1SENA 2LJKA 1T3BA 2OKAA 3C8EA 3ZTLA 4MP4A 2JADA 2XC2A 4FO5A 1TI3A 3TRXA 4L0WA 2JSZA 3LORA 1H4OA 3G9BA 1GULA 3TKSA 2LRTA 3ZZXA 3VWXA 4NMUA 4OFNA 4EXJA 3A5WA 2VL2C 1NW2A 1Z5YE 4AJ6A 4V1Ap 4ZL9A 4V2MA 3GA4A 4TXOB 1O8XA 2H6ZA 2V41A 3HZ8A 1A24A 1SK2A 1TI1A 2K8VA 4PXOA 4JRRA 5B8BA 3IHQA 2VLUA 4FYBA 4X1UA 4GRFA 3WGEA 2C80A 3DXBA 2E2GA 5ECHB 3W8JA 5ABRA 5G5EA 2LRCA 4O32A 1WRYA 5HR0A 3KJYA 10GSA 2LEGA 2AYTA 1V98A 2F8AA 1S3AA 4XCSA 2IMEA 3O6TA 5ECIB 3CRUA 5IM9A 1QQ2A 4KDYA 4NHZA 4DSSB 3LQ7A 5B6MA 4PUAA 2B3SA 1YY7A 3DVXA 3I43A 2C0GA 2RLIA 1PKWA 2NPBA 5E4WA 1TXXA 5FHIA 2VCWA 2GZPA 1RQMA 1JZDA 4OFMA 5G2ZA 1ABAA 1XFLA 3FZ4A 2QSIA 1SYRA 4XS1A 2N5AA 3FR9A 2XHFA 2YZUA 2PVQA 1O85A 1BJXA 3TRPA 3GL3A 1TK8B 5F07A 2VL3A 3TJBA 2NBSA 1Z3EA 1GSSA 1TRUA 3MDKA 1OC9B 3GL5A 1YQ1A 2O8VB 1THOA 1R26A 4ULXA 2VCQA 1A0FA 2ZUPA 1WJKA 1I5GA 5DVBA 3HVXA 4BWSA 3KH9A 3RHBA 5J3RA 4XHMA 4JE1A 1LBKA 3GSSA 3HJMA 5J9CA 2NDOA 16GSA 2REMA 1BG5A 2JACA 3FK8A 2L5OA 3HD5A 4HJMA 1GTUA 2F51A 1U88A 2JZRA 5IMVA 4KSMA 5CNWA 4IW9A 5G1LA 4K1FA 4KUNA 4K7IA 1XCCA 2FCHA 3TB2A 2NVLA 2PPTA 1X5CA 3LWAA 1XW5A 2A4VA 4HOJA 3ED3A 2P5RA 4Q5RA 1GUHA 2KLXA 2AB6A 4G2EA 4KCAA 4GSTA 3BD2A 2HE3A 1E2YA 1K3OA 1T1VA 4BPYA 2WFCA 4XRAA 4N30A 4EDYA 3TKSC 3KGKA 4K6XA 1T8EB 3GMFA 1YDKA 4J56E 3D21A 4QL7A 4NAXA 1Y25A 2RIIA 2I1UA 2H66A 2VCXA 4WF5A 1OC8A 3JCML 4GQCA 2GGTA 3J7Yb 1SD9A 4P3YB 2GT6A 5DJLA 1QUWA 5AIVA 5A4VA 5HR3A 1O7UA 1GNWA 1M9BA 1X9MB 1T4ZA 2C0FA 3DMLA 4MLYA 2VD0A 3CSJA 2N5FA 2K6VA 3NZNA 4PQIA 5EL8A 1FG4A 3FZ5A 1V58A 3APOA 2GSRA 3GH6A 2VUPA 1O81A 1XOAA 5COHA 3RBTA 2YV9A 4GF0A 5D9XA 1OAZA 1TRWA 1OYJA 4MJCA 3UBKA 5ID2A 6GSTA 4J2FA 2KP2A 3DWVA 2GZZA 4ZIJA 13GSA 5B7CA 4ZBBA 1PGTA 2CT6A 1PMTA 4TXVA 4BVYA 2B1KA 2O89A 6GSWA 2HZEA 2EIQA 1TU8A 3U5RE 1G7EA 2R4VA 1OC3A 1J9BA 2VL2A 4X43A 3TKPA 4ZB8A 2B7KA 2GVPA 5GAND 5F0GA 1QFNA 2YWMA 2N5BA 3TUEA 3PR8A 3GTUA 4O7HA 1DUGA 1W4VA 2OBKA 5H5SA 2EIOA 3ERGA 2HXKA 1KTEA 4POMA 4WF4A 5D9VA 1AW9A 4TR4A 4YQMA 5IMDA 5ECQB 2HSHA 2ON7A 3ZRDA 2XPEA 2Z9SA 4ML1A 2LV3A 1WWJA 2MMAA 2R3XA 2IJYA 1JFUA 3M9KA 4KB3A 3D4TA 1XIYA 2XPDA 3F0IA 1HD2A 1F9MA 4LMWA 3GURA 5DBQA 1XBSA 5D9WA 3H8QA 4XS4A 1B4PA 3L9SA 1GWCA 5AISA 1MD4A 3EURA 2KOKA 4D73B 5DAKB 5D8IA 3C1SA 2LUSA 2H72A 2OACA 5AGYA 1ACVA 3LJRA 3HCZA 3O76A 2QGVA 4PX1A 3M3MA 3N9JA 4ZB6A 1K0CA 2TRCP 1G6WA 3RPNA 3UVTA 2IFQA 3KTLA 2I3YA 1Z6NA 4YQVA 1EZKA 1PL1A 2CX3A 5JCGA 1Q4JA 3IC4A 2PMTA 2JZSA 2H30A 4YAVA 3EWLA 4PNGA 3R2QA 3D4MA 2KP1A 2TRXA 5HFIA 2HLSA 4E8EA 1K3LA 4IS0A 2B7JA 3APQA 3LYKA 2P0GA 3IA1A 4E8HA 3HY2A 1XXUA 4AJ7A 2WS2A 5G5FA 1SL0B 4I97A 1SJ6A 2H01A 4ECIA 1ERVA 4EDZA 8GSSA 1TDIA 4GSNA 3UAPA 5DQSA 3VWUA 4NXIA 2HFDA 1ML6A 2CZ2A 5KN0A 3IBHA 5IMZA 2C3QA 2AHEA 4K2DA 1GL8A 2LNSA 1SL2B 1VF2A 5ELAA 4MF5A 2PGTA 3GIXA 5AIXA 2H6YA 3LYPA 4J57E 1ON4A 4HDEA 2YPMA 4HUAA 1A23A 4PNFA 4GSSA 5ECSA 1T7PB 3ZLPA 3CTGA 3RAZA 5LNKe 3GH9A 3GSTA 3ISOA 3UEMA 4PQ1A 2AAWA 4HEA2 4K8MA 2JZTA 5GSSA 2DJJA 4V2LA 4TR1A 3VPQA 2OADA 3D22A 1PD21 3EU3A 4ZXGA 2B6MA 2E0QA 2FWFA 2MZCA 2MMOA 4L0UA 1K0NA 3F9UA 1GUMA 3ME8A 4MH3A 1SL1B 1MDIA 1XZOA 1QMVA 5ECKB 3MSZA 1OE8A 4N0VA 3L0HA 4EC0A 3ME7A 2CV4A 5G30A 1EV4A 20GSA 2VIMA 1THXA 1GSUA 2IL3A 4POKA 5B8AA 4MF6A 4KAEA 3VPTA 2A2RA 2HSYA 1MD3A 5F06A 5FWGA 3QAGA 4AJ8A 4MCUA 1GSQA 14GSA 3TRQA 1A8LA 2M46A 3ZITA 2L4CA 1ZMAA 2C3TA 4CW9A 1F37A 2F3MA 5A5KA 3G7IA 4KSOA 4G9HA 3M0FA 2LRNA 5C04A 3P7XA 4FYCA 4BVXA 11GSA 3Q74A 3QAVA 2X99A 5EY6A 1PX7A 1K0DA 4ZL8A 2EIRA 2YP6A 1TU7A 3WD6A 4LMVA 5EPFA 3WGXA 1XOBA 3TCOA 4EL1A 3DKSA 1XWCA 2YANA 2OE0A 1B9YC 6GSVA 2JL4A 1WOUA 3DYRA 2IIYA 3IRAA 3FZ9A 3IAS2 3APSA 3A2WA 5IPHA 3UBLA 5KN2A 2CQ9A 1MEKA 4IGJA 2CVKA 2E7PA 3QD9A 3P2AA 1KBNA 3IXRA 9GSSA 3BJ5A 4X0XA 2GSTA 3ZFBA 4F2IA 1O73A 4WR5A 4K7NA 2XBQA 3J7Yk 3DEXA 7GSSA 1YEXA 1AQVA 4Z7XA 4XS6A 5IMCA 3PGTA 1OKDA 2VCVA 4EF0A 2X8CA 4MH2A 3H93A 2RM5A 3KP8A 1O8WA 1TW9A 2MYGA 4MA9A 3UL3A 3HYPA 2FUG2 4RQRA 4ECJA 2LQQA 4TXOA 4QL9A 4LL1B 4KW6A 3VI7A 3FY7A 1GSFA 1Z7PA 1UN2A 4L8EA 1NM3A 3FYGA 3AY8A 3DD3A 1MTCA 4I2UA 1WMJA 4XIHA 5A4WA 1QGVA 1FOVA 3BCIA 3D5JA 3EU4A 1TKDB 6GSXA 2CZ3A 3VWWA 3P8WA 2L6DA 5HR1A 3U6VA 1YEPA 5DQYA 1KNGA 3A2VA 2J9HA 4I2TA 3MNGA 2HT9A 2X8GA 1IYHA 1U6TA 1ERTA 4DSQA 3TJFA 4DSSA 3F63A 1U3AA 2OE1A 2D2ZA 3M8NA 5GSTA 5JCWA 1J0FA 3TOUA 2H1DA 1EWXA 1LU4A 4JU5A 2DJKA 3Q18A 1JHBA 1VRSD 5HFGA 3IPZA 4PUFC 4IQ1A 1F6MC 2PWJA 2CAIA 5C00A 1B9XC 1T00A 1LJRA 3DVWA 1AIUA 3ZVJD 1QK8A 3TGZA 1BX9A 1AC1A 3G7JA 1K0MA 1OC9A 3KXOA 4ZBDA 1JLVA 3ZMLA 3QMXA 5DALB 2LKUA 1TOFA 3FEUA 1TK0B 4ZL7A 3VFIA 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#chains in the Genus database with same CATH superfamily
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#chains in the Genus database with same CATH topology
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